亚洲免费av电影一区二区三区,日韩爱爱视频,51精品视频一区二区三区,91视频爱爱,日韩欧美在线播放视频,中文字幕少妇AV,亚洲电影中文字幕,久久久久亚洲av成人网址,久久综合视频网站,国产在线不卡免费播放

        ?

        一例Kallmann綜合征患者雙基因突變分析

        2014-12-02 04:33:42謝榮榮楊金奎
        關(guān)鍵詞:基因突變結(jié)構(gòu)域位點(diǎn)

        曹 曦 謝榮榮 信 中 楊金奎*

        (1.首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京同仁醫(yī)院內(nèi)分泌科,北京100730;2.糖尿病防治研究北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京100730)

        特發(fā)性低促性腺激素型性腺功能減退綜合征又名Kallmann 綜合征(Kallmann syndrome,KS),其特點(diǎn)是性腺功能低下,部分患者合并嗅覺(jué)障礙,先天性瞼中線(xiàn)或肢體畸形,是一種罕見(jiàn)的先天性疾病,國(guó)內(nèi)報(bào)道較少。

        該疾病有家族性和散發(fā)性2種類(lèi)型,其中散發(fā)性占60%左右[1]。其遺傳方式可以是X染色體連鎖的隱性遺傳、常染色體顯性和隱性遺傳[2-3]。目前為止,6個(gè)不同的基因已被確定與KS相關(guān):Kallmann syndrome 1(KAL)[4],fibroblast growth factor receptor 1(FGFR1,也稱(chēng)為 KAL2)[5],F(xiàn)GF8[6],prokineticin(PROK2)[7],prokineticin receptor 2(PROKR2)[8]和 WDR11[9]。

        已有的研究[10]顯示KS絕大多數(shù)是X連鎖隱性遺傳。一些KAL1基因異常(錯(cuò)義突變,剪接位點(diǎn)突變,部分基因片段缺失和完整的基因缺失)已經(jīng)在大約10%的散發(fā)性患者和14%~50%的家族性患者中找到。KAL1基因組全長(zhǎng)210 000,含有14個(gè)外顯子,編碼一種680個(gè)氨基酸的細(xì)胞外基質(zhì)蛋白,名叫嗅因子(anosmin-1)。KAL1基因編碼蛋白具有調(diào)控神經(jīng)軸突向外生長(zhǎng)和識(shí)別靶組織或靶細(xì)胞的功能[4],并且參與促性腺激素釋放激素(GnRH)分泌神經(jīng)元和嗅覺(jué)神經(jīng)元的遷移[10]。

        PROK2是一個(gè)含81個(gè)氨基酸的分泌蛋白,而PROKR2是一個(gè)含384個(gè)氨基酸的G偶聯(lián)受體蛋白。這兩個(gè)基因敲除小鼠模型顯示,它們?cè)谛崆虻男螒B(tài)和性成熟方面發(fā)揮著重要的作用[7]。

        本研究利用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)和直接測(cè)序技術(shù)對(duì)一個(gè) 13歲 KS患者家系進(jìn)行 KAL1、PROK2和PROKR2 3個(gè)基因突變分析,同時(shí)對(duì)其突變位點(diǎn)進(jìn)行功能預(yù)測(cè)。

        1 材料與方法

        1.1 研究對(duì)象

        本研究獲得首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京同仁醫(yī)院倫理委員會(huì)批準(zhǔn),受試者充分了解研究?jī)?nèi)容并簽署知情同意書(shū)。通過(guò)問(wèn)卷調(diào)查獲得每個(gè)家庭成員一般基本情況和詳細(xì)的家族史。同時(shí)對(duì)內(nèi)分泌狀態(tài)、嗅覺(jué)功能和腎功能進(jìn)行了臨床評(píng)估。

        采用放射免疫分析法檢測(cè)激素水平,超聲掃描評(píng)估腹部結(jié)構(gòu),腦部磁共振成像檢測(cè)嗅球、腦溝和內(nèi)耳的結(jié)構(gòu)。

        1.2 基因突變分析

        本研究分別利用 SIFT[11]、Polyphen[12]和 Mutation Taster[13]3種生物信息學(xué)平臺(tái)進(jìn)行了錯(cuò)義位點(diǎn)和多態(tài)性位點(diǎn)的功能分析。

        1.3 基因突變分析

        抽取患者外周血2 mL,用血液基因組DNA提取試劑盒(北京天根生化科技有限公司)提取基因組DNA。PCR擴(kuò)增KAL1、PROK2和PROKR2 3個(gè)基因外顯子區(qū),引物見(jiàn)表1。

        表1 PCR引物序列及擴(kuò)增片段長(zhǎng)度Tab.1 Primer sequences and amplified fragment length

        PCR反應(yīng)體系為25 μL,含基因組DNA樣本200 ng、PCR mix 12.5 μL(北京天根生化科技有限公司)、10 μmol/L引物(北京諾賽基因合成)。在 PCR儀(BIO-RED)上完成擴(kuò)增,PCR擴(kuò)增循環(huán)條件如下:95℃預(yù)變性5 min;94℃變性45 s,55℃退火45 s,72℃延伸45 s,共35個(gè)循環(huán);最后于72℃延伸5 min,置于4℃保存。

        擴(kuò)增產(chǎn)物用1.2%瓊脂糖電泳檢測(cè)目的片段大小。PCR產(chǎn)物直接送北京諾賽基因測(cè)序,測(cè)序結(jié)果用NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中Blast軟件比對(duì)分析。每個(gè)突變點(diǎn)經(jīng)過(guò)兩端測(cè)序確認(rèn),同時(shí)做3次獨(dú)立的PCR擴(kuò)增驗(yàn)證突變結(jié)果。

        2 結(jié)果

        2.1 常規(guī)檢查結(jié)果

        患者為13歲的男孩,由于第二性征及外生殖器發(fā)育不良伴視力下降就診。與同齡人相比,患者身高和智力沒(méi)有明顯異常。11歲時(shí),由于青春期發(fā)育不良進(jìn)行了男性?xún)?nèi)分泌功能評(píng)估,睪丸體積分別為0.65和0.56 mL。氣味測(cè)試揭示嗅覺(jué)減退。腹部超聲掃描顯示,膽囊、胰腺、脾、腎正常。MRI顯示嗅球、嗅束發(fā)育不良(圖1A)。

        如表2所示,患者基礎(chǔ)血清雌激素(estradiol,E2)濃度,卵泡刺激素(follicle-stimulating hormone,F(xiàn)SH),黃體生成素(luteinizing hormone,LH),睪酮(testosterone,Testo)、皮質(zhì)醇(cortisol,F(xiàn))濃度顯著低于正常參考值。催乳素(prolactin,PRL)和孕酮(progesterone,PROG)濃度正常。

        患者的母親有正常的青春期發(fā)育和月經(jīng)周期規(guī)律,血清促性腺激素和雌二醇的濃度正常,同時(shí)MRI結(jié)果顯示嗅球發(fā)育正常(圖1B)。其父親男性化特征明顯,血清促性腺激素和睪酮的濃度正常。

        圖1 患者及其母親磁共振結(jié)果Fig.1 MRI findings of the patient and his mother

        表2 患者內(nèi)分泌檢測(cè)結(jié)果Tab.2 Endocrine test results of the patient

        2.2 基因突變篩查結(jié)果

        如表3所示,患者KAL1基因測(cè)序存在2個(gè)新突變,這2個(gè)突變處于KAL1第12個(gè)外顯子上(I565T和S570T)(圖2B,C),位于KAL1蛋白的第4個(gè)Ⅲ型纖連素樣(fibronectin typeⅢ domain,F(xiàn)nⅢ)重復(fù)序列結(jié)構(gòu)域(圖2A)。此外,測(cè)序還找到了5個(gè)KAL1基因單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn):V534I、V560F、G567S、K666M 和R668H。

        值得一提的是,PROKR2基因測(cè)序發(fā)現(xiàn)核苷酸337位置T突變?yōu)镃,導(dǎo)致113位氨基酸位點(diǎn)由酪氨酸轉(zhuǎn)變?yōu)榻M氨酸(p.Y113H)(圖2D)。同時(shí)在患者父母基因組中也找到該位點(diǎn)的雜合突變形式(圖2E)。

        圖2 KAL1和PROKR2突變位點(diǎn)突變及測(cè)序圖Fig.2 Mutation map and partial nucleotide sequence of KAL1 and PROKR2 gene

        2.3 功能缺失分析

        3種分析方法都顯示 KAL1的 I565T位點(diǎn)和PROKR2的Y113H位點(diǎn)可能是對(duì)蛋白功能產(chǎn)生危害的突變位點(diǎn)(表3)。

        表3 KAL1和PROKR2基因突變分析Tab.3 Summary of molecular analysis of the KAL1 and PROKR2 gene

        此外,兩兩分析發(fā)現(xiàn),Polyphen和Mutation Taster分析顯示G567S和S570T 2個(gè)位點(diǎn)也可能是對(duì)蛋白功能產(chǎn)生危害的突變位點(diǎn)??紤]到G567S是一個(gè)SNP位點(diǎn),S570T作為一個(gè)可能的致病位點(diǎn)的可能性比較大。最后總結(jié)3種分析方法和兩兩分析結(jié)果,I565T、S570T和Y113H(PROKR2)3個(gè)位點(diǎn)可能是該患者的致病基因位點(diǎn)。

        3 討論

        本研究在一個(gè)13歲KS患者KAL1基因中找到2個(gè)新的突變位點(diǎn)(I565T和S570T)和5個(gè)SNP位點(diǎn)(V534I、V560F、G567S、K666M 和 R668H),同時(shí)在PROKR2基因中找到一個(gè)純合的錯(cuò)義突變位點(diǎn)(Y113H)。這是在中國(guó)人群中發(fā)現(xiàn)的第1例KAL1和PROKR2 2個(gè)基因同時(shí)突變的KS患者。

        已有的研究[14]顯示KAL1基因突變位點(diǎn)大多數(shù)位于第4個(gè)FnⅢ重復(fù)序列結(jié)構(gòu)域。本研究的2個(gè)新突變位點(diǎn)就位于KAL1蛋白第4個(gè)FnⅢ結(jié)構(gòu)域。FnⅢ結(jié)構(gòu)域與細(xì)胞黏附分子(CAM)家族成員:纖連蛋白、神經(jīng)細(xì)胞黏附分子(NCAM)、L1和tenasin有著顯著的同源性[14]。這些分子通常與神經(jīng)元發(fā)育過(guò)程中細(xì)胞外和細(xì)胞間的相互黏附、增生和遷移作用相關(guān),這表明anosmin-1也與這些細(xì)胞活動(dòng)有關(guān)。此外,已有研究[14]顯示anosmin-1通過(guò)FnⅢ結(jié)構(gòu)域直接與FGFR1蛋白結(jié)合。綜合上述分析,KAL1的I565T和S570T 2個(gè)突變位點(diǎn)很可能是致病位點(diǎn)。

        此外,患者KAL1基因中的5個(gè)SNP位點(diǎn)也值得注意。正如在2型糖尿病、遺傳性橢圓形紅細(xì)胞增多癥、克雅病和類(lèi)風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎等研究[15-16]中已經(jīng)證實(shí),多個(gè)SNP位點(diǎn)增加了這些疾病的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。KAL1多個(gè)SNP位點(diǎn)在患者基因組中的同時(shí)存在,也有可能是增加其患病概率的一個(gè)重要因素。

        分析PROKR2的蛋白結(jié)構(gòu),Y113H突變位點(diǎn)位于其第一個(gè)細(xì)胞外環(huán)狀結(jié)構(gòu)區(qū)。本研究的功能預(yù)測(cè)分析顯示Y113H突變位點(diǎn)很可能為患者的致病位點(diǎn)。而已有研究[17]也證實(shí),含有Y113H突變位點(diǎn)的PROKR2蛋白,在Egr1-LUC基因轉(zhuǎn)錄分析和基于水母的Ca2+流分析實(shí)驗(yàn)中,其活性嚴(yán)重受損。這表明Y113H突變是PROKR2蛋白一個(gè)重要的功能缺失突變。

        KS最初被認(rèn)為是單基因遺傳性疾病,但是后來(lái)陸續(xù)被證實(shí)有多個(gè)基因起作用[18-19]。目前為止,報(bào)道有3例雙基因遺傳的KS患者,1例是FGFR1和NELF基因突變,另2例是KAL1和 PROKR2基因突變[20],本研究是第4例。KAL1編碼的anosmin-1蛋白被證實(shí)不僅能通過(guò)FGFR1提高了成纖維細(xì)胞生長(zhǎng)因子信號(hào)[21],而且能通過(guò) PROKR2在 prokineticin信號(hào)傳導(dǎo)過(guò)程中發(fā)揮作用。鑒于上述觀點(diǎn),本研究假設(shè)KAL1和PROKR2這2個(gè)突變體蛋白可在不同層次進(jìn)行同樣的細(xì)胞內(nèi)活動(dòng),并且這一過(guò)程可能有助于其漸進(jìn)性功能障礙,最終導(dǎo)致病變[20]。

        通常,一些主要的發(fā)育型疾病在純合體狀態(tài)下表現(xiàn)得更加嚴(yán)重。在本研究中,患者癥狀表現(xiàn)為青春期發(fā)育不良和嗅覺(jué)減退/嗅覺(jué)缺失。另一方面,患者父母都攜帶PROKR2基因相同位點(diǎn)的雜合突變,但是沒(méi)有任何臨床癥狀。這一結(jié)果與以前的研究數(shù)據(jù)[22]的一致性,同時(shí)也進(jìn)一步證實(shí)了之前其他幾項(xiàng)研究[23-25]的結(jié)果,即雙基因突變是一種全新的模式。

        本研究存在3點(diǎn)潛在的不足之處,首先,本研究只對(duì)KAL1、PROK2和PROKR2 3個(gè)基因進(jìn)行了測(cè)序,不能排除其他基因的突變情況,比如FGFR1。其次,只對(duì)基因的編碼區(qū)進(jìn)行了測(cè)序,在其他一些調(diào)控區(qū),比如啟動(dòng)子和內(nèi)含子區(qū)域,這些區(qū)域都有可能產(chǎn)生新的剪接位點(diǎn)。因此,需要進(jìn)一步研究排除以上的可能性。再次,3個(gè)預(yù)測(cè)結(jié)果顯示I565T(KAL1)和Y113H(PROKR2)可能為致病的突變位點(diǎn),但是只有2個(gè)預(yù)測(cè)結(jié)果顯示S570T(KAL1)為可能的致病位點(diǎn),筆者考慮到S570T為目前為止首次發(fā)現(xiàn)的一個(gè)突變位點(diǎn),且Polyphen和Mutation Taster這兩種預(yù)測(cè)方法準(zhǔn)確性都比較高,因此筆者推測(cè)S570T也很可能是一個(gè)致病位點(diǎn)。然而功能缺失分析都只是建立在生物信息學(xué)預(yù)測(cè)的基礎(chǔ)上,尚需要進(jìn)一步的基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)確認(rèn)驗(yàn)證。

        綜上所述,本研究擴(kuò)展了KAL1與PROKR2基因在KS患者中突變的多樣性,進(jìn)一步證實(shí)了這兩個(gè)基因在嗅球發(fā)育中的作用。此外,本研究進(jìn)一步證實(shí)了KS患者雙基因遺傳的可能性,為KS遺傳傳遞的復(fù)雜性提供了新的數(shù)據(jù)。

        [1] Hu Y,Tanriverdi F,MacColl G S,et al.Kallmann's syndrome:molecular pathogenesis[J].Int J Biochem Cell Biol,2003,35(8):1157-1162.

        [2] Fechner A,F(xiàn)ong S,McGovern P.A review of Kallmann syndrome:genetics,pathophysiology,and clinical management[J].Obstet Gynecol Surv,2008,63(3):189-194.

        [3] Ribeiro R S,Vieira T C,Abucham J.Reversible Kallmann syndrome:report of the first case with a KAL1 mutation and literature review[J].Eur J Endocrinol,2007,156(3):285-290.

        [4] Franco B,Guioli S,Pragliola A,et al.A gene deleted in Kallmann's syndrome shares homology with neural cell adhesion and axonal path-finding molecules[J].Nature,1991,353(6344):529-536.

        [5] Dode C,Levilliers J,Dupont J M,et al.Loss-of-function mutations in FGFR1 cause autosomal dominant Kallmann syndrome[J].Nat Genet,2003,33(4):463-465.

        [6] Falardeau J,Chung W C,Beenken A,et al.Decreased FGF8 signaling causes deficiency of gonadotropin-releasing hormone in humans and mice[J].J Clin Invest,2008,118(8):2822-2831.

        [7] Pitteloud N,Zhang C,Pignatelli D,et al.Loss-of-function mutation in the prokineticin 2 gene causes Kallmann syndrome and normosmic idiopathic hypogonadotropic hypogonadism[J].Proc Natl Acad Sci U S A,2007,104(44):17447-17452.

        [8] Dode C,Teixeira L,Levilliers J,et al.Kallmann syndrome:mutations in the genes encoding prokineticin-2 and prokineticin receptor-2[J].PLoS Genet,2006,2(10):e175.

        [9] Kim H G,Ahn J W,Kurth I,et al.WDR11,a WD protein that interacts with transcription factor EMX1,is mutated in idiopathic hypogonadotropic hypogonadism and Kallmann syndrome[J].Am J Hum Genet,2010,87(4):465-479.

        [10] Tsai P S,Gill J C.Mechanisms of disease:Insights into X-linked and autosomal-dominant Kallmann syndrome[J].Nat Clin Pract Endocrinol Metab,2006,2(3):160-171.

        [11] Ng P C,Henikoff S.SIFT:Predicting amino acid changes that affect protein function[J].Nucleic Acids Res,2003,31(13):3812-3814.

        [12] Adzhubei I A,Schmidt S,Peshkin L,et al.A method and server for predicting damaging missense mutations[J].Nat Methods,2010,7(4):248-249.

        [13]Schwarz J M,Rodelsperger C,Schuelke M,et al.MutationTaster evaluates disease-causing potential of sequence alterations[J].Nat Methods,2010,7(8):575-576.

        [14]Kim S H,Hu Y,Cadman S,et al.Diversity in fibroblast growth factor receptor 1 regulation:learning from the investigation of Kallmann syndrome[J].J Neuroendocrinol,2008,20(2):141-163.

        [15] Tsuge T,Shimokawa T,Horikoshi S,et al.Polymorphism in promoter region of Fcalpha receptor gene in patients with IgA nephropathy[J].Hum Genet,2001,108(2):128-133.

        [16] Yamada R,Tanaka T,Unoki M,et al.Association between a single-nucleotide polymorphism in the promoter of the human interleukin-3 gene and rheumatoid arthritis in Japanese patients,and maximum-likelihood estimation of combinatorial effect that two genetic loci have on susceptibility to the disease[J].Am J Hum Genet,2001,68(3):674-685.

        [17]Cole L W,Sidis Y,Zhang C,et al.Mutations in prokineticin 2 and prokineticin receptor 2 genes in human gonadotrophin-releasing hormone deficiency:molecular genetics and clinical spectrum[J].J Clin Endocrinol Metab,2008,93(9):3551-3559.

        [18] Badano J L,Katsanis N.Beyond Mendel:an evolving view of human genetic disease transmission[J].Nat Rev Genet,2002,3(10):779-789.

        [19] Carlton V E,Harris B Z,Puffenberger E G,et al.Complex inheritance of familial hypercholanemia with associated mutations in TJP2 and BAAT[J].Nat Genet,2003,34(1):91-96.

        [20] Pitteloud N,Quinton R,Pearce S,et al.Digenic mutations account for variable phenotypes in idiopathic hypogonadotropic hypogonadism[J].J Clin Invest,2007,117(2):457-463.

        [21]Gonzalez-Martinez D,Kim S H,Hu Y,et al.Anosmin-1 modulates fibroblast growth factor receptor 1 signaling in human gonadotropin-releasing hormone olfactory neuroblasts through a heparan sulfate-dependent mechanism[J].J Neurosci,2004,24(46):10384-10392.

        [22] Dode C,Hardelin J P.Kallmann syndrome:fibroblast growth factor signaling insufficiency?[J].J Mol Med(Berl),2004,82(11):725-734.

        [23]Gao Y Q,Danciger M,Ozgul R K,et al.Association of the Asn306Ser variant of the SP4 transcription factor and an intronic variant in the beta-subunit of transducin with digenic disease[J].Mol Vis,2007,13:287-292.

        [24]Muntoni F,Bonne G,Goldfarb L G,et al.Disease severity in dominant Emery Dreifuss is increased by mutations in both emerin and desmin proteins[J].Brain,2006,129(Pt 5):1260-1268.

        [25]Tosch V,Rohde H M,Tronchere H,et al.A novel PtdIns3P and PtdIns(3,5)P2 phosphatase with an inactivating variant in centronuclear myopathy[J].Hum Mol Genet,2006,15(21):3098-3106.

        猜你喜歡
        基因突變結(jié)構(gòu)域位點(diǎn)
        大狗,小狗——基因突變解釋體型大小
        鎳基單晶高溫合金多組元置換的第一性原理研究
        上海金屬(2021年6期)2021-12-02 10:47:20
        CLOCK基因rs4580704多態(tài)性位點(diǎn)與2型糖尿病和睡眠質(zhì)量的相關(guān)性
        管家基因突變導(dǎo)致面部特異性出生缺陷的原因
        蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域劃分方法及在線(xiàn)服務(wù)綜述
        二項(xiàng)式通項(xiàng)公式在遺傳學(xué)計(jì)算中的運(yùn)用*
        基因突變的“新物種”
        重組綠豆BBI(6-33)結(jié)構(gòu)域的抗腫瘤作用分析
        組蛋白甲基化酶Set2片段調(diào)控SET結(jié)構(gòu)域催化活性的探討
        泛素結(jié)合結(jié)構(gòu)域與泛素化信號(hào)的識(shí)別
        玩弄少妇高潮ⅹxxxyw| 国产精品一区av在线| 高清午夜福利电影在线| 亚洲av日韩专区在线观看| 成人xx免费无码| 日韩女同一区二区三区久久| 精品亚洲国产成人av色哟哟| 四虎影视永久在线观看| 中文字幕在线日韩| 中文字幕亚洲视频三区| 蜜芽亚洲av无码精品色午夜| 88久久精品无码一区二区毛片| 久热香蕉精品视频在线播放| 免费网站国产| 久久久精品亚洲懂色av| 日本一区二区三区亚洲| 18禁无遮拦无码国产在线播放| 这里只有久久精品| 玩弄放荡人妻一区二区三区| 日本区一区二区三视频 | 国产av综合影院| 免费毛片性天堂| 中文字幕精品久久一区二区三区| 亚洲av色欲色欲www| 国产精品亚洲综合色区韩国| 国产欧美久久久精品影院| 亚洲三级中文字幕乱码| 人妻夜夜爽天天爽三区麻豆av网站| 91在线精品老司机免费播放| 日韩少妇高潮在线视频| 97精品人妻一区二区三区蜜桃| 日本不卡一区二区三区在线| 欧美日韩一线| 一区二区高清视频免费在线观看| 国产伦人人人人人人性| 无码的精品免费不卡在线| 91精品国产综合久久久蜜臀九色| 亚洲综合网国产精品一区| 爽爽午夜影视窝窝看片| 久久久亚洲欧洲日产国产成人无码| 亚洲av毛片一区二区久久|