肖夢榕,張梁,劉雙平,石貴陽
江南大學(xué) 工業(yè)生物技術(shù)教育部重點實驗室 糧食發(fā)酵工藝與技術(shù)國家工程實驗室,江蘇 無錫 214122
在大腸桿菌中,葡萄糖的主要吸收形式是通過磷酸烯醇式丙酮酸-糖磷酸轉(zhuǎn)移酶系統(tǒng)(Phosphoenolpyruvate:carbohydrate phosphotransferase system,簡稱PTS系統(tǒng))[1]以基團轉(zhuǎn)移方式進(jìn)行,此系統(tǒng)參與細(xì)胞發(fā)酵過程中葡萄糖吸收、運輸和磷酸化的過程,消耗大量芳香族氨基酸合成前體物質(zhì)磷酸烯醇式丙酮酸 (PEP),并導(dǎo)致乙酸生成,TCA循環(huán)與糖酵解循環(huán)之間碳流分配不均衡,副產(chǎn)物增多,主產(chǎn)物產(chǎn)率降低,菌體二次生長,碳源利用效率低等不良后果[2]。PTS系統(tǒng)由可溶性非底物特異性蛋白EⅠ (ptsH編碼)、磷酸組氨酸搬運蛋白HPr (ptsI編碼)和酶Ⅱ (EsⅡ)構(gòu)成[3-4]。EⅠ可將來自PEP的磷酰基團依次傳遞給HPr、EsⅡ和葡萄糖,從而完成葡萄糖磷酸化轉(zhuǎn)運。EsⅡ是一系列蛋白,可以特異性識別和轉(zhuǎn)運底物分子,大腸桿菌染色體中編碼約有20種EsⅡ,參與20多種不同碳水化合物的磷酸化轉(zhuǎn)運,其中 EⅡGlc和 EⅡMan主要參與葡萄糖的轉(zhuǎn)運。EⅡGlc主要由可溶性酶EAⅡGlc(crr編碼),以及膜透性酶ECBⅡGlc(ptsG編碼)構(gòu)成[5]。研究表明[5-8]PTS缺陷株能夠有效減小葡萄糖轉(zhuǎn)運速率,平衡胞內(nèi)糖酵解循環(huán)和三羧酸循環(huán)之間的碳流代謝,進(jìn)而減少乙酸分泌,有利于高密度發(fā)酵。但同時發(fā)現(xiàn)PTS缺陷株生長受到限制,延滯期較長,不利于工業(yè)化生產(chǎn)。來源于運動發(fā)酵單胞菌 Zymomonas mobilis中的葡萄糖易化體蛋白Glf是一種轉(zhuǎn)運蛋白,能夠促進(jìn)葡萄糖吸收[9-12],Km=4.1×103μmol/L。Ren等[13]研究顯示表達(dá) Glf蛋白能夠明顯減弱碳代謝阻遏效應(yīng) (CCR),提高碳源利用效率。Yi等[14]通過在 PTS?菌株中表達(dá)插入Glf蛋白和葡萄糖激酶蛋白Glk (glk編碼)的質(zhì)粒,改造后的菌株產(chǎn)率能夠達(dá)到與表達(dá)GalP-Glk途徑的菌株相似的效果,可見,Glf轉(zhuǎn)運系統(tǒng)是一種較為有效的葡萄糖活性磷酸化轉(zhuǎn)運系統(tǒng),然而目前少有關(guān)于Glf系統(tǒng)的染色體水平整合表達(dá)的報道。本研究利用 Red重組技術(shù)[15]構(gòu)建了大腸桿菌ptsG、ptsI敲除菌,在敲除ptsI基因的同時在染色體上插入了glf基因,測定了重組菌的生長性能,為后續(xù)構(gòu)建生產(chǎn)莽草酸及其他芳香族氨基酸工程菌株打下了基礎(chǔ)。
1.1.1 菌株與質(zhì)粒
E. coli W3110,Zymomonas mobilis (ATCC 31821)和同源重組的協(xié)助質(zhì)粒pKD46 (溫敏型復(fù)制子,帶有氨芐青霉素抗性,阿拉伯糖誘導(dǎo)后表達(dá)λ噬菌體重組酶 Gam,Bet和Exo)均為本實驗室保藏;同源重組抗性打靶片段質(zhì)粒PKD13和抗性消除質(zhì)粒pCP20均購于美國耶魯大學(xué)大腸桿菌菌株庫 (CGSC,E. coli Genetic Stock Center,New Haven,USA)[15]。重組菌株E. coli G1、I1、I2均為本研究中構(gòu)建,各菌株及質(zhì)粒見表1。
1.1.2 工具酶及試劑
實驗中各種DNA限制性內(nèi)切酶 EcoRⅠ和Hind Ⅲ、Taq DNA 聚合酶、dNTP Mixture、Rnase均為Fermentas公司產(chǎn)品;氨芐青霉素 (Amp)、氯霉素 (Cm)、卡那霉素 (Kan)購自上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司;L-阿拉伯糖購自Sigma-Aldrich西格瑪奧德里奇 (上海)貿(mào)易有限公司;pMD18-T Vector購自寶生物工程有限公司;Q5高保真聚合酶購自NEB (北京)有限公司;酵母粉、蛋白胨購自O(shè)XOID公司;本研究中使用的試劑盒:質(zhì)粒DNA小量提取試劑盒、純化試劑盒、膠回收試劑盒都來自北京博大泰克生物基因技術(shù)有限公司;其他試劑均為分析純。
1.1.3 培養(yǎng)基及培養(yǎng)條件
普通大腸桿菌培養(yǎng)采用LB液體培養(yǎng)基 (/L):10 g蛋白胨,5 g酵母粉,10 g NaCl,重組大腸桿菌構(gòu)建過程中均采用 SOB液體培養(yǎng)基 (/L):20 g蛋白胨,5 g 酵母粉,0.5 g NaCl,0.186 g KCl,0.95 g MgCl2,固體培養(yǎng)基需另加1.5%的瓊脂粉。
表1 菌株與質(zhì)粒Table 1 Strains and plasmids
培養(yǎng)運動發(fā)酵單胞菌采用T培養(yǎng)基 (/L):20 g 葡萄糖,10 g酵母粉,2 g KH2PO4,1 g (NH4)2SO4,1 g MgSO4·7H2O,28 ℃靜置,厭氧培養(yǎng)。
重組大腸桿菌發(fā)酵實驗使用 FM 培養(yǎng)基(/L):3 g MgSO4·7H2O,3 g KH2PO4,1 g NaCl,5 g (NH4)2SO4;另添加微量元素[(μmol/L):FeCl3·6H2O 8.88,CoCl2·6H2O 1.26,CuCl2·2H2O 0.88,ZnCl22.20,Na2MoO4·2H2O 1.24,H3BO31.21,MnCl2·4H2O22.5]。并根據(jù)需要加入適量葡萄糖。發(fā)酵實驗初始值為50 g/L。為了防止培養(yǎng)過程中菌體產(chǎn)酸影響菌體生長,在搖瓶培養(yǎng)過程中添加10 g/L碳酸鈣 (發(fā)酵罐中培養(yǎng)使用氨水)以中和pH[16]。
氨芐青霉素、氯霉素和卡那霉素在培養(yǎng)基中的工作濃度分別為100 μg/mL、25 μg/mL和50 μg/mL,大腸桿菌的培養(yǎng)溫度如無特殊說明均指37 ℃。
1.1.4 引物
本實驗中所用引物均由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成,具體序列見表2。
1.2.1 運動發(fā)酵單胞菌基因組DNA提取
具體方法參見文獻(xiàn)[17]。
1.2.2 glf基因的克隆
以運動發(fā)酵單胞菌 Zymomonas mobilis的glf基因 (GenBank Accession No. ATCC 31281)為模板設(shè)計引物IF1和IF2 (表2),其中下劃線為ptsI基因上下游同源臂。
表2 本研究中所用引物Table 2 Primers used in this research
以運動發(fā)酵單胞菌的染色體為模板,以 IF1、IF2為引物進(jìn)行PCR擴增。PCR擴增體系為:ddH2O 38.5 μL,10×Ex Taq 緩沖液 5 μL,dNTPs 4 μL,上下游引物各 1 μL,模板 1 μL,Ex Taq酶 0.5 μL。PCR擴增條件為:95 ℃預(yù)變性 5 min,94 ℃變性 30 s,55 ℃退火 30 s,72 ℃延伸90 s,30個循環(huán)后72 ℃延伸10 min。瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行結(jié)果分析,PCR產(chǎn)物純化后連接pMD18 T-Vector載體,轉(zhuǎn)化大腸桿菌JM109,篩選陽性克隆。挑取陽性克隆接種至氨芐青霉素抗性LB培養(yǎng)基中,提質(zhì)粒用Hind Ⅲ和EcoRⅠ酶切驗證。將驗證正確的克隆子送至上海生工生物工程技術(shù)有限公司進(jìn)行測序。
1.2.3 PCR打靶片段的制備
以PKD13質(zhì)粒為模板,以打靶基因上下游同源臂為引物,Q5高保真聚合酶進(jìn)行 PCR擴增。PCR 擴增體系為:ddH2O 33.5 μL,5×Q5緩沖液 10 μL,dNTPs 4 μL,上下游引物各 1 μL,模板1 μL,Q5高保真聚合酶 0.5 μL。PCR 擴增條件為:98 ℃預(yù)變性 30 s,98 ℃變性 10 s,60 ℃退火30 s,72 ℃延伸45 s,30個循環(huán)后72 ℃延伸2 min。瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行PCR產(chǎn)物割膠回收并純化。
1.2.4 目的基因的敲除、抗性片段的丟失及陽性轉(zhuǎn)化子鑒定
目的基因的敲除:首先制備帶有輔助質(zhì)粒PKD46的大腸桿菌電轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞;將10 μL打靶片段與100 μL感受態(tài)細(xì)胞混勻,冰浴后轉(zhuǎn)移至預(yù)冷的1 mm電轉(zhuǎn)杯中,1 800 V電擊轉(zhuǎn)化,立即加入1 mL SOB培養(yǎng)基,30 ℃培養(yǎng)2?4 h后涂布Kan抗性平板。
抗性片段丟失:敲除菌陽性菌落在抗性平板劃線分離純化后再次制備電轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞,以相同的方法電擊轉(zhuǎn)化入輔助質(zhì)粒pCP20,涂布Cm抗性平板。
陽性轉(zhuǎn)化子的鑒定:在抗性平板上篩選陽性轉(zhuǎn)化子,以驗證引物進(jìn)行PCR鑒定是否正確;劃線分離純化驗證正確的陽性菌落,37 ℃下傳代丟失溫敏輔助質(zhì)粒。
1.2.5 菌體生長曲線
分別挑取重組菌E. coli G1、I1、I2的單菌落于5 mL LB,37 ℃、200 r/min培養(yǎng)過夜后取等量菌體轉(zhuǎn)接至70 mL FM培養(yǎng)基,37 ℃、200 r/min繼續(xù)培養(yǎng),定時測定600 nm下菌體密度,同時保留部分樣品以測定發(fā)酵液中葡萄糖濃度及乙酸含量。
1.2.6 重組大腸桿菌在發(fā)酵罐中的發(fā)酵實驗
將重組菌株接種于SOB培養(yǎng)基中,37 ℃、200 r/min培養(yǎng)8 h,收集適量菌體,以LB培養(yǎng)基重懸后在37 ℃、200 r/min培養(yǎng)10 h,作為發(fā)酵罐的種子液。發(fā)酵罐裝液量為6 L,接種量為5 %,初始葡萄糖濃度 50 g/L。初始通氣量為1 L/min,攪拌轉(zhuǎn)速為200 r/min,菌體生長過程中適時調(diào)節(jié)空氣流量 (1?7 L/min)和攪拌轉(zhuǎn)速(200?1 000 r/min)使得溶解氧濃度大于30%,以10% (V/V)硫酸溶液和氨水控制pH值為7,37 ℃恒溫發(fā)酵60 h。
1.2.7 葡萄糖含量和乙酸含量的測定
發(fā)酵液中葡萄糖濃度檢測采用生物傳感儀SBA-40C (山東省微生物研究所研制),發(fā)酵液中乙酸濃度采用 HPLC檢測,泵為 SHIMADAZU LC-10AT,進(jìn)樣器為 Dionex UltiMate Autosampler 3000,色譜柱為Shodex SH1011,示差檢測器Shodex RI101,流動相為0.01 mol/L H2SO4,流速0.8 mL/min。
將打靶片段按電擊轉(zhuǎn)化方法敲除目的片段,通過PCR鑒定陽性轉(zhuǎn)化子。其中E. coli G1鑒定引物為YG1/YG2,E. coliⅠ1的鑒定引物為YI1/YI2。經(jīng)PCR驗證 (圖1),用YG1/YG2擴增,出發(fā)菌株獲得1 700 bp大小的電泳圖譜;轉(zhuǎn)化子 G1’ (△ptsG::kan)獲得 1 600 bp左右的電泳圖譜;其抗生素抗性基因丟失后,轉(zhuǎn)化子G1獲得650 bp大小電泳圖譜。即菌株G1的ptsG基因已經(jīng)被成功敲除。利用相似的策略進(jìn)行敲除ptsI基因的驗證。以引物YI1/YI2擴增,出發(fā)菌株獲得1 700 bp大小的電泳圖譜 (圖2);轉(zhuǎn)化子Ⅰ1’ (△ptsI::kan)PCR 擴增后電泳大小約為1 400 bp;經(jīng)FRT重組而刪除卡那霉素基因的轉(zhuǎn)化子Ⅰ1電泳圖譜大小為200 bp。表明菌株Ⅰ1的ptsI基因已被成功敲除。通過上海生工生物工程公司測序確認(rèn),成功敲除了ptsG和ptsI基因,獲得E. coli G1、Ⅰ1兩株重組大腸桿菌。
圖1 ptsG基因缺失菌株的PCR鑒定電泳圖譜Fig. 1 PCR identification of ptsG knockout mutant.M: 1 kb ladder marker; 1: W3110 PCR product; 2: G1’(△ptsG::kan)PCR product; 3: G1 (△ptsG)PCR product.
圖2 ptsI基因缺失菌株的PCR鑒定電泳圖譜Fig. 2 PCR identification of ptsI knockout mutant.M: 1 kb ladder marker; 1: W3110 PCR product; 2: I1’(△ptsI::kan)PCR product; 3: I1 (△ptsI)PCR product.
按圖3制備打靶片段ptsI’::kan-glf,為了最大限度降低外源基因染色體水平表達(dá)對原始菌株可能造成的影響,本研究并未對glf基因的啟動子和ORF進(jìn)行添加或刪除的改動,僅從ptsI基因的起始密碼子 ATG開始,完全替換為 glf基因,即glf基因完全利用ptsI基因所使用的啟動子、ORF及核糖結(jié)合位點。通過電擊轉(zhuǎn)化敲除目的片段并在染色體上插入外源基因,PCR鑒定陽性轉(zhuǎn)化子。E. coli I2鑒定引物為YI1/YI2。經(jīng)PCR驗證 (圖4),用YI1/YI2擴增,出發(fā)菌株獲得 1 800 bp大小的電泳圖譜;轉(zhuǎn)化子 I2’(△ptsI::glf::kan)獲得3 000 bp左右的電泳圖譜;刪除卡那霉素篩選標(biāo)記基因后,篩選得到陽性克隆I2經(jīng)PCR擴增電泳圖譜大小約為1 600 bp。結(jié)果表明菌株I2的ptsI基因已被成功替換為glf基因。通過上海生工生物工程公司測序確認(rèn),成功將ptsI基因替換為glf基因,獲得E. coli I2重組大腸桿菌。
圖3 同源重組打靶片段ptsI’::kan-glf的制備Fig. 3 Construction of ptsI’::kan-glf used for homologous recombination.
圖4 缺失 ptsI基因同時插入 glf基因菌株的 PCR鑒定電泳圖譜Fig. 4 PCR identification of ptsI knock-out and glf knock-in mutant. M: 1 kb ladder marker; 1: W3110 PCR product; 2: I2’ (△ptsI::glf::kan)PCR product; 3: I2(△ptsI::glf)PCR product.
2.3.1 FM發(fā)酵培養(yǎng)基中生長性能
從圖 5可以看出,在 FM發(fā)酵培養(yǎng)基中,G1重組大腸桿菌比生長速率為 0.37 g/(h·L),與W3110 (0.42 g/(h·L))相近,最終生物量 (2.74 g/L)略高于W3110 (2.34 g/L);而I1重組大腸桿菌的延滯期較長,前期生長緩慢,最高生長速率僅為 0.34 g/(h·L)(表 3),低于 W3110。但發(fā)酵后期生長顯著加快,對數(shù)生長期延長,發(fā)酵結(jié)束時生物量達(dá)到3.48 g/L,約為W3110的1.5倍,表明I1具有高密度發(fā)酵優(yōu)勢。將I1進(jìn)一步進(jìn)行分子改造,插入外源基因glf,在FM培養(yǎng)基中測定重組菌的生長性能。經(jīng)過分子手段改造之后,I2重組菌生長性能較I1重組菌明顯提高,改善了I1前期生長緩慢的缺陷,最高生長速率可達(dá)0.63 g/(h·L);同時保留了I2生長對數(shù)期較長和可進(jìn)行高密度發(fā)酵的優(yōu)勢,發(fā)酵結(jié)束菌體生物量可達(dá)4.68 g/L,約為I1的1.3倍。顯然,通過在染色體組上插入glf基因能夠顯著改善敲除菌的生長缺陷,具有高密度發(fā)酵的優(yōu)勢。
為進(jìn)一步探討重組菌的高密度發(fā)酵性能,對重組菌進(jìn)行了發(fā)酵罐放大實驗 (圖 6),生長曲線與搖瓶結(jié)果基本符合。重組菌E. coli I2最高生物量可達(dá)17.40 g/L (OD600=45.8),為野生型大腸桿菌 (OD600=25.1)的 1.82倍,充分說明了重組菌在生長方面具有的顯著優(yōu)勢。
2.3.2 FM培養(yǎng)基中重組菌生長代謝特征
圖5 重組大腸桿菌E. coli W3110、G1、I1、I2在搖瓶中的生長情況Fig. 5 The growth curve of recombinant strains E. coli W3110 and its mutants G1, I1, I2.
表3 搖瓶發(fā)酵參數(shù)比較Table 3 Comparison of parameters in shake-flask experiments
圖6 重組大腸桿菌E. co li W3110、I2在6 L發(fā)酵罐中的生長情況Fig. 6 The growth curve of recombinant strains E. coli W3110 and its mutants I2 in a 6 L bioreactor.
為了較為準(zhǔn)確地測定重組菌利用葡萄糖的能力,本研究中采用 FM 發(fā)酵培養(yǎng)基以消除其他碳源物質(zhì)對菌體生長的影響,初始添加葡萄糖為50 g/L。測得葡萄糖消耗曲線及乙酸生成曲線如圖 7所示。通過相關(guān)公式[18]計算得出表 3中數(shù)據(jù),其中消耗葡萄糖量分別為I2>W3110>G1>I1,葡萄糖比消耗速率分別為W3110>G1>I2>I1。表明ptsI基因的敲除對大腸桿菌吸收利用葡萄糖影響較大,而重新插入外源基因glf后重組菌吸收葡萄糖能力又得到恢復(fù)。此結(jié)果在發(fā)酵罐中也得到了進(jìn)一步驗證,在發(fā)酵罐中,葡萄糖消耗量為I2 (103.2 g)>W3110 (75.4 g),葡萄糖比消耗速率為 W3110 (7.03 g/(h·L))>I2 (4.75 g/(h·L))。
同時,本研究還考察了各重組菌株的乙酸生成情況。結(jié)果顯示,發(fā)酵培養(yǎng)結(jié)束時,乙酸產(chǎn)量W3110>G1>I1>I2,在發(fā)酵罐中經(jīng)過驗證結(jié)果相符,重組菌I2在整個發(fā)酵過程中消耗氨水為687 g,而W3110消耗氨水達(dá)1 156 g,是重組菌的近1.7倍??梢钥吹剑脑?PTS系統(tǒng)后重組菌產(chǎn)酸水平大幅度下降,而Glf蛋白在恢復(fù)菌體葡萄糖利用能力的同時并未造成乙酸的大量生成,有利于重組菌進(jìn)行高密度發(fā)酵。
圖7 重組大腸桿菌E. coli W3110、G1、I1、I2在搖瓶中的生長代謝情況Fig. 7 Acetic acid production and glucose consumption of strains E. coli W3110 and its mutants G1, I1, I2. ■, □: E. coli W3110; ●, ○: E. coli G1; ▲, △:E. coli I1; ▼, ▽: E. coli I2. Solid shape: consumption curve of glucose; Hollow shape: accumulation curve of acetic acid.
本研究利用 Red重組技術(shù)刪除了大腸桿菌中PTS系統(tǒng)關(guān)鍵組分ECBⅡGlc的編碼基因(ptsG)和磷酸組氨酸搬運蛋白 HPr的編碼基因(ptsI)。通過搖瓶發(fā)酵,并在6 L發(fā)酵罐中進(jìn)行了重組菌的進(jìn)一步驗證,結(jié)果表明:ptsG和ptsI基因的刪除均能夠?qū)Υ竽c桿菌的生長產(chǎn)生影響。刪除了PTS系統(tǒng)相關(guān)基因的重組菌株對葡萄糖的吸收速率降低,從而降低菌體生長速率,代謝產(chǎn)物乙酸生成減少,其中 ptsI基因刪除后效果更為顯著。同時,PTS系統(tǒng)的部分失活能夠解除分解物代謝阻遏效應(yīng),使菌株生長能夠獲得更高的菌密度。相比△ptsG重組菌 G1,△ptsI重組菌I1徹底阻斷了葡萄糖進(jìn)入細(xì)胞的轉(zhuǎn)運途徑,通過半乳糖透性酶 (GalP)介導(dǎo)的活性轉(zhuǎn)運系統(tǒng)磷酸化轉(zhuǎn)運葡萄糖至胞內(nèi)[19-21],不消耗 PEP,增加了產(chǎn)物合成前體,提高底物利用效率,有利于進(jìn)一步構(gòu)建高效合成芳香族氨基酸工程菌。但由于GalP轉(zhuǎn)運系統(tǒng)誘導(dǎo)發(fā)生作用需要 H+協(xié)同參與等一系列條件[19-21],使得△ptsI重組菌I1生長能力受到限制,生長緩慢,延滯期較長,并不適合工業(yè)化應(yīng)用。
由于重組菌 G1仍然能夠利用 PTS途徑中的EⅡMan等運輸體轉(zhuǎn)運葡萄糖[22],并利用PEP提供磷酸基團對其磷酸化,降低胞內(nèi)PEP水平,故在生長特性等方面與原始菌株并無顯著差異,因此不再進(jìn)行進(jìn)一步改造。本研究在E. coli W3110染色體上敲除ptsI基因的同時整合表達(dá)了來源于運動發(fā)酵單胞菌Zymononas Mobilis的Glf蛋白,構(gòu)建了重組菌I2。該重組菌葡萄糖利用效果顯著,表現(xiàn)出多種優(yōu)于I1的生長優(yōu)勢。這是因為 glf基因表達(dá)的葡萄糖易化體 Glf同GalP類似,也是一種轉(zhuǎn)運蛋白,能夠促進(jìn)葡萄糖吸收,但其與GalP蛋白相比不需要過多限制條件,減輕了膜孔蛋白向胞內(nèi)運輸?shù)膲毫Γ且环N較為有效的葡萄糖活性磷酸化轉(zhuǎn)運系統(tǒng)。通過整合表達(dá) glf基因,重組菌 I2能夠通過Glf-glk (葡萄糖易化體-葡萄糖激酶)途徑,利用ATP 將葡萄糖進(jìn)行磷酸化并轉(zhuǎn)運進(jìn)入細(xì)胞。本研究結(jié)果表明 Glf蛋白能夠在染色體上成功表達(dá)并介導(dǎo)葡萄糖的磷酸化轉(zhuǎn)運,顯著改善了PTS缺陷型菌株的生長劣勢。Glf系統(tǒng)相比較PTS系統(tǒng)減少了莽草酸合成途徑中重要前體磷酸烯醇式丙酮酸 (PEP)的損失,降低了副產(chǎn)物乙酸的生成,使TCA循環(huán)與糖酵解循環(huán)之間碳流分配趨向平衡,菌體恢復(fù)生長能力,從而實現(xiàn)菌體的高密度發(fā)酵。研究顯示[9-12]Glf蛋白能夠顯著減弱碳代謝阻遏效應(yīng),激活多個基因更有效利用復(fù)合培養(yǎng)基水解產(chǎn)物維持菌體生長,提高碳源的利用率,與本文結(jié)果一致。但是也有文獻(xiàn)報道[14],Glf蛋白雖然與GalP蛋白轉(zhuǎn)運效率相似,但從動力學(xué)參數(shù)顯示Glf所需的葡萄糖底物濃度較高,由此也說明在進(jìn)一步改造獲得發(fā)酵產(chǎn)物過程中需要對底物濃度進(jìn)行控制。
Chandran等[23]通過不同質(zhì)粒分別表達(dá) Glf和Glk蛋白使PTS?宿主菌重新獲得吸收葡萄糖的能力,結(jié)果顯示,未表達(dá)Glf蛋白的PTS型大腸桿菌莽草酸產(chǎn)率低于同時表達(dá) Glf和 Glk蛋白的菌株,可見Glf和Glk蛋白協(xié)同作用能夠?qū)ζ咸烟堑奈掌鸬酱龠M(jìn)效果。進(jìn)一步研究結(jié)果顯示,刪除了大腸桿菌PTS系統(tǒng)關(guān)鍵操縱子(ptsH-I-crr)后的菌株表現(xiàn)出了極高的莽草酸產(chǎn)率 (27%)和較低副產(chǎn)物水平,在添加15 g/L酵母提取物的10 L罐中效果更為顯著。由此可見,游離表達(dá) Glf蛋白能夠促進(jìn)甚至完全替代 PTS系統(tǒng)的功能,經(jīng)過改造后的大腸桿菌重組菌在莽草酸生產(chǎn)應(yīng)用方面具有顯著優(yōu)勢,此研究更進(jìn)一步提示我們可以將 Glf蛋白結(jié)合到大腸桿菌染色體上,以提高菌株的遺傳穩(wěn)定性。
Tang等[24]在大腸桿菌 ATCC 8739 PTS–菌株染色體上整合表達(dá)了Glf和Glk蛋白,考察了其在厭氧條件下的細(xì)胞生長和葡萄糖利用性能,并與 GalP轉(zhuǎn)運系統(tǒng)進(jìn)行了比較。結(jié)果表明表達(dá)Glf蛋白菌株的葡萄糖消耗速率為0.7 g/(h·L),高于GalP轉(zhuǎn)運系統(tǒng)30%,而同時表達(dá)Glf和Glk蛋白的重組菌葡萄糖消耗速率可達(dá)2.13 g/(h·L),對本研究后續(xù)進(jìn)一步修飾改造提供了思路,研究同時也指出Glf轉(zhuǎn)運系統(tǒng)在生產(chǎn)以PEP為前體的產(chǎn)物如琥珀酸等具有顯著優(yōu)勢。
目前對于PTS系統(tǒng)改造主要針對于表達(dá)大腸桿菌的GalP系統(tǒng)[8,23,25-26],Glf蛋白多見于游離表達(dá),而整合表達(dá)具有穩(wěn)定遺傳,避免抗生素的使用等優(yōu)點,但目前相關(guān)報道較少。本研究利用改造大腸桿菌中的PTS系統(tǒng)為基礎(chǔ),在染色體上整合表達(dá) Glf蛋白能夠構(gòu)建高密度發(fā)酵重組菌,重組菌具有葡萄糖利用率高,菌體最終生物量高,副產(chǎn)物乙酸產(chǎn)量少等優(yōu)勢,是一株具有較高改造價值的優(yōu)勢菌株,但仍存在延滯期較長等缺點,同時限于培養(yǎng)基條件,重組菌的生長還有一定的上升空間,有待進(jìn)一步對培養(yǎng)基以及培養(yǎng)條件等進(jìn)行優(yōu)化探究。我們將對該菌株進(jìn)行進(jìn)一步基因改造和完善,調(diào)控Glf蛋白的表達(dá)以改善菌體生長行為,進(jìn)一步優(yōu)化發(fā)酵培養(yǎng)基,以縮短重組菌延滯時間,提高生物量累積,為以后構(gòu)建高效合成芳香族氨基酸工程菌打下基礎(chǔ)。
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