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        金黃色葡萄球菌臨床分離株spa分型和耐藥特征研究

        2014-08-23 03:01:42鄒自英盧中一孟祥兆張雨龍趙靜雅韓雪琳田曙光
        中國(guó)感染與化療雜志 2014年2期
        關(guān)鍵詞:葡菌西林葡萄球菌

        鄒自英,韓 黎,熊 杰,盧中一,孟祥兆,張雨龍,趙靜雅,韓雪琳,田曙光,陳 勇

        2.解放軍疾病預(yù)防控制所醫(yī)院感染監(jiān)控中心;

        3.山東農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科學(xué)與工程學(xué)院;

        4.哈爾濱醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院。

        金葡菌是一種重要的人類(lèi)病原菌,可引起血流感染、皮膚軟組織感染、肺炎、心內(nèi)膜炎等。醫(yī)院和社區(qū)獲得性耐甲氧西林金葡菌(MRSA)感染的流行和傳播,以及導(dǎo)致的患者高病死率,已在全世界范圍引起廣泛關(guān)注。spa分型技術(shù)是基于葡萄球菌蛋白A基因多態(tài)性發(fā)展的分型技術(shù),只需對(duì)單個(gè)基因片段測(cè)序,適用于研究由金葡菌感染引起的短期暴發(fā)流行、醫(yī)院內(nèi)傳播及長(zhǎng)期監(jiān)測(cè)。本研究主要采用spa分型方法,對(duì)金葡菌臨床分離菌株進(jìn)行分型分析,旨在獲取金葡菌的流行菌株和耐藥信息,從而為控制MRSA和甲氧西林敏感金葡菌(MSSA)的傳播提供科學(xué)依據(jù)。

        材料與方法

        一、菌株來(lái)源

        2011年5—11月成都某醫(yī)院臨床分離的非重復(fù)金葡菌56株,標(biāo)本來(lái)源傷口拭子18株、痰液15株、血液9株、膿液5株、其他來(lái)源9株(包括尿液、胸水、腹水、關(guān)節(jié)液等)。所有菌株采用珠海貝索生物技術(shù)有限公司生產(chǎn)的菌種凍存管-80℃留存。

        二、菌株的鑒定和藥敏試驗(yàn)

        采用法國(guó)生物梅里埃公司的BacT/Alert3D全自動(dòng)血液培養(yǎng)儀進(jìn)行血培養(yǎng),VITEK2 compact全自動(dòng)微生物分析儀及GP鑒定卡對(duì)細(xì)菌進(jìn)行鑒定,AST-GP67藥敏卡檢測(cè)菌株的藥物敏感性,結(jié)果按2012年 CLSI M100-S22[1]判斷。AST-GP67檢測(cè)的抗菌藥物有青霉素、苯唑西林、克林霉素、紅霉素、慶大霉素、四環(huán)素、利福平、甲氧芐啶-磺胺甲口惡唑、呋喃妥因、環(huán)丙沙星、莫西沙星、左氧氟沙星、喹奴普?。_(dá)福普汀、利奈唑胺、萬(wàn)古霉素、替加環(huán)素。質(zhì)控菌株為金葡菌ATCC29213和ATCC25923,購(gòu)自衛(wèi)生部臨床檢驗(yàn)中心。

        三、DNA提取

        按照細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒[A1120,普洛麥格(北京)生物技術(shù)有限公司]的說(shuō)明書(shū)提取所有金葡菌的DNA。取2μL DNA作為以下PCR反應(yīng)的模板。

        四、mecA基因和pvl基因檢測(cè)

        mecA基因和pvl基因的檢測(cè)參照文獻(xiàn)中的報(bào)道[2-3],mecA 基因擴(kuò)增引物序列為:mecA_F:5’-AAAATCGATGGTAAAGGTTGGC-3’mecA_R:5’-AGTTCTGCAGTACCGGATTTGC-3’,產(chǎn)物長(zhǎng)度532 bp;pvl基因引物序列為:PVL_F:5’-ATCATTAGGTAAAATGTCTGGACATGATCCA-3’,PVL_R:5’-GCATCAASTGTATTGGATAGCAAAAGC-3’,產(chǎn)物長(zhǎng)度433 bp。PCR反應(yīng)體系50μL,10μmol/L上下游引物各2μL,按照試劑說(shuō)明書(shū)(DR001B,大連寶生物工程有限公司)加入dNTP mix、rTaq酶和10×PCR Buffer,補(bǔ)充滅菌雙蒸水至50μL。擴(kuò)增參數(shù)均為:94℃預(yù)變性5 min,94℃變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸60 s,30個(gè)循環(huán),最后72℃延伸5 min。1%瓊脂糖凝膠電泳40 min,出現(xiàn)特異性條帶鑒定為mecA基因或pvl基因陽(yáng)性。

        五、spa分型

        spa分型PCR擴(kuò)增引物和反應(yīng)體系參照http://www.seqnet.org網(wǎng)站,引物序列為:spa-1113F: 5’-TAAAGACGATCCTTCGGTGAGC-3’,spa-1514R:5’-CGGCAGTAGTGCCGTTTGCTT-3’。PCR反應(yīng)體系與前面一致。擴(kuò)增參數(shù):80℃預(yù)熱5 min,94 ℃變性45 s,55 ℃退火45 s,72℃延伸90 s,30個(gè)循環(huán),然后72℃延伸10 min。按照DNA純化回收試劑盒說(shuō)明書(shū)(DP214,北京天根生物技術(shù)有限公司)對(duì)PCR陽(yáng)性產(chǎn)物進(jìn)行純化和回收,送軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院生物工程研究所生物信息分析室進(jìn)行測(cè)序,測(cè)序儀器為3730XL型。使用Bionumerics 6.6軟件對(duì)spa基因測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,根據(jù)串聯(lián)重復(fù)序列的排列方式確定型別。根據(jù)http://www.seqnet.org網(wǎng)站提供的spa分型與多位點(diǎn)序列分型(MLST)和所屬克隆群(clone complex,CC)的對(duì)應(yīng)關(guān)系,確定主要spa型別菌株可能關(guān)聯(lián)的ST型和所屬CC。

        六、統(tǒng)計(jì)學(xué)分析

        利用頻數(shù)、構(gòu)成比、百分比對(duì)分類(lèi)變量資料進(jìn)行描述性統(tǒng)計(jì)。應(yīng)用χ2檢驗(yàn)或精確概率法對(duì)分類(lèi)變量資料進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)比較。分析軟件為SPSS 16.0。P<0.05為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        結(jié) 果

        一、藥敏試驗(yàn)和mecA基因檢測(cè)

        根據(jù)苯唑西林藥敏試驗(yàn)結(jié)果發(fā)現(xiàn),56株金葡菌中包括21株 MRSA(37.5%)和35株 MSSA(62.5%)。56株金葡菌對(duì)萬(wàn)古霉素、替加環(huán)素、利奈唑胺、喹奴普丁-達(dá)福普汀、呋喃妥因全部敏感,只有1株MSSA對(duì)青霉素敏感。MRSA對(duì)利福平、左氧氟沙星、莫西沙星、環(huán)丙沙星、慶大霉素和四環(huán)素等抗菌藥物的敏感率低于 MSSA,見(jiàn)表1。21株MRSA中mecA 基因陽(yáng)性20株 (95.2%),35株MSSA均為mecA基因陰性。

        二、spa分型

        21株MRSA的spa型別數(shù)有6種,以t030(66.7%)為主,標(biāo)本來(lái)源主要為痰液和血液。35株MSSA的型別數(shù)有18種,以t189、t377和t034列前3,分別占14.3%、14.3%和11.4%,標(biāo)本來(lái)源以傷口分泌物為主,見(jiàn)表2。發(fā)現(xiàn)MSSA中包括一種新的spa分型new1,其重復(fù)序列為26-12-21-17-13-13-34-34-34-33-13,分離自1例男性患者的膿液標(biāo)本。未發(fā)現(xiàn)具有相同spa分型的MRSA和MSSA菌株。

        三、殺白細(xì)胞毒素(PVL)檢測(cè)

        65株金葡菌中pvl基因陽(yáng)性5株(7.7%),包括1株MRSA和4株MSSA,其中來(lái)自患者組織、尿液和鼻拭子各1株,傷口拭子2株。5株P(guān)VL陽(yáng)性菌株spa分型為 MSSA-t189(3株)、MRSA-t287(1株)和 MSSA-t796(1株)。

        表1 56株金葡菌對(duì)抗菌藥物的敏感率(%)Table 1 Susceptibility of 56 clinical isolates of Staphylococcus aureus to selected antimicrobial agents(%)

        表2 MRSA和MSSA的spa分型及標(biāo)本來(lái)源情況Table 2 spatyping and specimen source of methicillin-resistant and methicillin-susceptible Staphylococcus aureus strains

        討 論

        金葡菌尤其是MRSA具有多部位感染和多藥耐藥性質(zhì),是醫(yī)院感染重要病原菌之一,與HBV及AIDS并列世界三大難解決的感染性疾病。mecA基因的存在是MRSA耐β內(nèi)酰胺類(lèi)抗菌藥物的主要原因之一[4]。本研究1株 MRSA mecA基因陰性,但苯唑西林MIC≥4 mg/L,原因可能為非mecA介導(dǎo)的苯唑西林耐藥。與MSSA相比,MRSA對(duì)利福平、氟喹諾酮類(lèi)、四環(huán)素和慶大霉素的敏感率顯著降低(P<0.05),文獻(xiàn)報(bào)道與mecA基因的表達(dá)有關(guān)[5]。MRSA的高耐藥率仍是臨床面臨的嚴(yán)峻挑戰(zhàn)。本研究結(jié)果顯示,萬(wàn)古霉素、利奈唑烷、替加環(huán)素、喹奴普?。_(dá)福普汀和呋喃妥因?qū)RSA的抗菌活性最高,未檢出耐藥株,但已有文獻(xiàn)報(bào)道異質(zhì)性萬(wàn)古霉素中介金葡菌(hVISA)[6],實(shí)驗(yàn)室要加強(qiáng)對(duì)金葡菌糖肽類(lèi)抗菌藥物耐藥性的檢測(cè)。

        金葡菌蛋白A是細(xì)胞壁的組成成分之一,編碼蛋白A的基因長(zhǎng)約2 150 bp,包括Fc結(jié)合區(qū)、X區(qū)和C末端,X區(qū)含有2~15個(gè)長(zhǎng)21~27 bp的重復(fù)序列,X區(qū)由于重復(fù)序列數(shù)目、特征和排列順序不同而具有高度的多態(tài)性,利用這種基因的多態(tài)性建立的分型方法為spa分型,具有快速、易于操作、重復(fù)性好的特點(diǎn),適用于金葡菌感染的常規(guī)調(diào)查。本研究發(fā)現(xiàn)臨床MRSA的主要型別是t030,與文獻(xiàn)報(bào)道的t030為我國(guó)主要的流行克隆型之一結(jié)果一致[7],t030不僅在我國(guó)廣泛分布,也是挪威、德國(guó)、荷蘭、瑞士、瑞典等國(guó)家的主要流行克隆型。MRSA-t030對(duì)應(yīng)的ST型有ST239和ST246,其對(duì)各種臨床常用抗菌藥物的耐藥性高,對(duì)喹諾酮類(lèi)3種抗菌藥物和氨基糖苷類(lèi)慶大霉素全部耐藥,可能是其能廣泛傳播的原因之一,但所有MRSA-t030菌株均對(duì)甲氧芐啶-磺胺甲口惡唑敏感。文獻(xiàn)報(bào)道的我國(guó)另一主要流行克隆型t037[7],本研究只檢出1株。本研究檢出2株t437,屬于典型的社區(qū)獲得性MRSA,但均為PVL陰性。本地區(qū)除t030和t037外,還報(bào)道過(guò)t008[8]。

        有關(guān)MSSA基因分型的研究報(bào)道較少,李克誠(chéng)等[9]對(duì)3株MSSA的分型結(jié)果顯示,分別為t377和t304。本研究結(jié)果顯示,MSSA的克隆型分布較分散,共檢出18個(gè)克隆型,以t189、t377和t034列前3,主要來(lái)自傷口感染。3株MSSA-t189為pvl陽(yáng)性,與既往報(bào)道的社區(qū)獲得性菌株表現(xiàn)一致[10],而MSSA-t034為與牲畜相關(guān)CC398存在相關(guān)性的菌株[11]。由此提示部分社區(qū)獲得性MSSA存在克隆傳播,并成為醫(yī)院和社區(qū)人群出現(xiàn)皮膚與軟組織感染的重要原因。本研究檢出1個(gè)spa重復(fù)序列和分型數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.ridom.de/spaserver)未命名的新克隆型,暫時(shí)稱(chēng)作new1。

        明確流行環(huán)節(jié)、切斷傳播途徑、終止耐藥菌株在醫(yī)院和社區(qū)中的傳播是感染控制的重要策略之一,而掌握金葡菌的分子特征對(duì)于有效控制感染和鑒別菌株之間是否存在相關(guān)性至關(guān)重要。本研究的MRSA呈現(xiàn)高度的克隆一致性,提示MRSA在醫(yī)院內(nèi)的傳播流行,而spa分型技術(shù)是監(jiān)控金葡菌感染的方便快速的手段。本研究雖然僅部分代表了成都地區(qū)金葡菌的分子流行病學(xué)情況,但是為金葡菌的臨床治療、感染控制和暴發(fā)流行監(jiān)測(cè)提供了重要參考。

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