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        用基因測序“治未病”

        2014-08-07 10:46:01倪偉杰
        支點 2014年7期
        關(guān)鍵詞:華大基因治未病基因組

        核心提示:不論是基因測序設(shè)備供應(yīng)商還是基因測序服務(wù)提供商,都在加緊布局基因測序產(chǎn)業(yè)。不過目前在中國,沒有多少人能讀懂全基因組數(shù)據(jù)。

        《支點》記者 倪偉杰

        在中國兩部委(食品藥品監(jiān)督管理局、國家衛(wèi)生計生委)用一紙禁令將基因測序打入“冷宮”僅兩個月,世界最大的基因測序儀器制造商Illumina的掌門人Jay Flatley先生就急沖沖跑來中國,并高調(diào)表示:“我十分看好中國基因測序市場。”

        可能有人會懷疑Jay Flatley這一逆風(fēng)言論,但沒有人會懷疑Illumina在基因測序行業(yè)的霸主地位。這家總部位于美國加利福尼亞圣迭戈市的上市公司,被麻省理工學(xué)院主辦的《技術(shù)評論》雜志評為全球最聰明的50家公司之首,其身后站著的可是特斯拉和谷歌。

        這家全世界最聰明的公司在今年初宣布,可在24小時內(nèi)將個人全基因組測序完畢,而費用僅需1000美元。能夠完成這一壯舉的機器叫Hiseq X Ten,每套由10臺機器組成,每臺售價100萬美元。當(dāng)Hiseq X Ten在全球售出9套以后,Illumina驕傲地宣布:我不賣了。

        基因測序,簡單說,就是檢測四種堿基排列順序。在遺傳物質(zhì)的層面上,人與人之間的差別就表現(xiàn)在堿基排列順序的差別?;驕y序通過解碼生命這本天書,有助于人類生老病死規(guī)律的揭秘和人類患病基因的掌握,對人類疾病的預(yù)防和診斷起到輔助性的作用。

        隨著基因測序技術(shù)的飛速發(fā)展以及測序成本的大幅降低,原本一直躲在實驗室中的基因測序技術(shù)開始走出實驗室,走向大眾,改變大眾生活。這種改變正在醫(yī)療領(lǐng)域醞釀,有可能會顛覆整個醫(yī)藥行業(yè)。

        “上醫(yī)治未病”

        《黃帝內(nèi)經(jīng)》有云:“上醫(yī)治未病?!闭f的是最高明的醫(yī)生擅長采取相關(guān)措施,防止疾病發(fā)生和發(fā)展?,F(xiàn)在,基因測序技術(shù)正在踐行中醫(yī)“治未病”的智慧。

        國內(nèi)基因測序“領(lǐng)頭羊”華大基因的創(chuàng)始人汪建在2014年黑馬運動會醫(yī)療健康分會春季論壇上講述的幾個數(shù)字讓人觸目驚心:中國每30秒就有一位缺陷嬰兒出生,每10秒鐘就有一位心腦血管患者死亡……

        汪建不相信藥,他相信健康,相信健身,其實就是相信預(yù)防。華大基因旗下的華大健康依托其強大的基因測序能力構(gòu)建了一個臨床醫(yī)學(xué)平臺,通過對遺傳疾病、腫瘤等人類重大疾病相關(guān)基因的測序,提供個性化健康管理服務(wù),以降低疾病對人類健康的危害。比如華大基因跟許多醫(yī)院合作開展的無創(chuàng)產(chǎn)前診斷,通過對母親外周血中的胎兒游離DNA進行測序,以判斷胎兒患唐氏綜合癥的風(fēng)險。與傳統(tǒng)的羊水穿刺產(chǎn)前診斷技術(shù)相比,基于基因測序技術(shù)的無創(chuàng)產(chǎn)前診斷準(zhǔn)確度更高而無流產(chǎn)風(fēng)險。

        以前,基因測序技術(shù)一直服務(wù)于高校、研究所等機構(gòu)而鮮為大眾所知,直到好萊塢知名影星安吉麗娜·朱莉的一次壯舉才讓基因測序為全球所知,并徹底催熱了基因測序產(chǎn)業(yè)。2013年,朱莉在麥利亞德基因公司接受了基因測序疾病篩查,結(jié)果顯示她攜帶了家族遺傳的缺陷基因,因此她有87%的可能性會罹患乳腺癌。朱莉毅然接受了雙側(cè)乳腺切除術(shù)。

        朱莉在給《紐約時報》的信中寫到:“我自身攜帶了一個‘錯誤基因,這讓我有87%的幾率患乳腺癌,50%的可能患卵巢癌。完成切除乳腺的手術(shù)后,我的乳腺癌患病風(fēng)險從87%降到了5%,我的孩子們不必再擔(dān)心因為乳腺癌而失去他們的媽媽?!比蛟跓嶙h朱莉這一壯舉的同時也對基因測序技術(shù)產(chǎn)生了濃厚的興趣,人們發(fā)現(xiàn)基因測序技術(shù)確實有用,尤其是在個人健康管理上。

        21世紀什么最貴?不是人才,是健康。在日益忙碌的世界中,許多人都用自己的青春和身體在賭美好的明天。而當(dāng)癌癥等重大疾病突然降臨,他們往往發(fā)出這樣的疑問:“為什么是我?”這以后就是漫長而又痛苦的治療,甚至是死亡。現(xiàn)在以基因測序技術(shù)為依托的個性化健康管理和個性化醫(yī)療有可能改變這種局面,一個龐大的基因測序市場正在悄然形成。

        “大魚吃中魚”

        正因市場前景看好,全球范圍內(nèi)的基因測序商業(yè)競爭日益加劇。不論是產(chǎn)業(yè)鏈上游的設(shè)備制造商還是下游的服務(wù)提供商,都在加緊布局基因測序產(chǎn)業(yè),爭食這塊大蛋糕。這些公司想到的最快捷布局策略就是并購。

        有傳奇創(chuàng)業(yè)經(jīng)歷的喬納森·羅斯伯格博士在1999年創(chuàng)辦了454生命科學(xué)公司,推出454測序儀,該公司最后被制藥巨頭羅氏公司收購。2007年,喬納森又推出了Ion Torrent測序儀,后被Life Tech收購。

        有數(shù)據(jù)顯示,美國基因測序龍頭Illumina公司在全球基因測序設(shè)備供應(yīng)市場的份額占到了三分之二,在市場上還能跟Illumina抗衡的只有Life Tech公司。這兩家公司顯然并不滿足于其業(yè)務(wù)只限于基因測序設(shè)備供應(yīng),開始通過并購將業(yè)務(wù)滲透到下游的基因測序服務(wù)。比如Illumina通過收購產(chǎn)前診斷公司Verinata Health,加速進入產(chǎn)前診斷市場。Life Tech公司收購了Navigenics公司,該公司是一家基因產(chǎn)品和服務(wù)提供商,主要提供個人基因組測序服務(wù)。

        基因測序“蛋糕”惹得制藥業(yè)巨頭都想咬幾口。當(dāng)羅氏的454測序儀被市場淘汰以后,他又打起了Illumina的主意。2012年以來,羅氏先后三次向Illumina發(fā)起收購要約,但最終未能如愿。不過,不死心的羅氏在6月2日發(fā)表聲明稱以3.5億美金收購了基因測序公司Genia Technologies,該公司正在開發(fā)一個基因測序平臺。相比于Illumina這塊難啃的骨頭,美國人類基因組科學(xué)公司則好啃多了。制藥業(yè)巨頭葛蘭素史克在2012年7月以30億美元收購美國人類基因組科學(xué)公司,高調(diào)插足基因測序。

        國內(nèi)的華大基因早在1999年就參與“國際人類基因組1%項目”,經(jīng)過十幾年的發(fā)展,已經(jīng)成長為全球最大的基因組研究中心,但它卻沒有自己的測序平臺,只能向產(chǎn)業(yè)鏈上游的Illumina公司和Life Tech公司購買。為了降低進口依賴,2013年,華大基因成功收購美國一家在人類全基因組精準(zhǔn)測序和分析領(lǐng)域處于領(lǐng)先地位的公司Complete Genomics。后者擁有自己的測序平臺、試劑和分析軟件,但不對外出售。endprint

        就像美國阿拉巴馬州哈森阿爾法生物技術(shù)研究院研究員韓健所說的,收購和被收購在生物技術(shù)領(lǐng)域是家常便飯,“無非是大魚吃中魚罷了?!被驕y序市場中大魚吃中魚,中魚吃小魚極為普遍,最終要達到的目的就是通吃整個產(chǎn)業(yè)鏈。

        數(shù)據(jù)分析是難題

        不過,整體來看,中國的基因測序產(chǎn)業(yè)才剛剛起步,企業(yè)均處于產(chǎn)業(yè)鏈的中下游,開展測序服務(wù)所使用的測序儀均從國外進口,在測序技術(shù)上嚴重依賴國外。那么中國的基因測序產(chǎn)業(yè)會不會受制于人呢?武漢錦奧生物科技有限公司負責(zé)人侯玉彬語出驚人:“現(xiàn)在中國整個基因測序產(chǎn)業(yè)最主要的問題,不是測序服務(wù)產(chǎn)品的豐富度問題,也不是測序平臺是不是國外進口的問題,而是后期數(shù)據(jù)分析搞不定的問題?!?/p>

        人類基因組有30億個堿基對,用基因測序儀器得到的數(shù)據(jù)是四種堿基的排列。在普通人看來,基因測序數(shù)據(jù)只是A、C、G、T四個字母無意義的排列。但在專家眼里,這些字母卻蘊含著生命的奧秘。某個地方多一個字母或者少一個字母,意味著你很可能會患某種疾病。只是這些數(shù)據(jù)異常龐大,光靠人力解讀是不現(xiàn)實的。因此,現(xiàn)在對基因數(shù)據(jù)的分析和解讀需要專門的數(shù)據(jù)分析軟件。比如在臨床上,分析軟件將測序平臺上測得的病人基因數(shù)據(jù)導(dǎo)成可視化數(shù)據(jù),臨床醫(yī)生用軟件得到自己需要的數(shù)據(jù)結(jié)果,依靠這些結(jié)果,并憑借自己的臨床經(jīng)驗,形成臨床報告,診斷病情并采取相關(guān)治療措施。

        既然許多醫(yī)院都有基因測序平臺,但是為什么基因測序技術(shù)還沒有大規(guī)模的臨床應(yīng)用呢?侯玉彬認為不是這項技術(shù)有多難,而是臨床推廣很難。難在哪里,難在解讀,沒有幾個醫(yī)生能讀懂。

        華中農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院教授李國亮也認為數(shù)據(jù)分析是個難題:“如何解讀基因測序數(shù)據(jù)從而判斷某人得某種病的概率,現(xiàn)在是一個科學(xué)研究熱點。大家公認,更多的疾病是基因和我們的環(huán)境(包括飲食、生活習(xí)慣等)相互作用的結(jié)果,僅僅依靠基因組測序,是難以判斷這些疾病的概率的。所以,我們現(xiàn)在要積累測序以及病人的數(shù)據(jù),在達到一定的數(shù)據(jù)量后,對基因組的重組、小片段DNA序列的缺失或插入等進行分析,并與病人的生活習(xí)慣等環(huán)境因素相關(guān)聯(lián),從而得出測序數(shù)據(jù)與疾病之間的關(guān)系?!?/p>

        李國亮的同事陳玲玲教授也表達了相同觀點:“目前全基因組測序數(shù)據(jù)解析的確是個很大的問題。我認為現(xiàn)在的解析水平還不能用于臨床研究,當(dāng)然個體測序和醫(yī)療是大家夢寐以求的,也是基因組學(xué)的發(fā)展方向。”

        不容忽視的風(fēng)險

        在中國,基因測序產(chǎn)業(yè)面臨的困難,不僅來自于技術(shù),還有可能來自于政策。

        就在華大基因同許多醫(yī)院合作開展的無創(chuàng)產(chǎn)前診斷正在逐步催熱基因測序市場之際,國家相關(guān)部門冷不丁地給這個火熱的市場澆了一盆冷水。2014年2月9日,中國食品藥品監(jiān)督管理局和國家衛(wèi)生計生委下發(fā)了《關(guān)于加強臨床使用基因測序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)的通知》。該通知將基因測序診斷產(chǎn)品(包括基因測序儀及相關(guān)診斷試劑和軟件)歸為醫(yī)療器械類,而按照《醫(yī)療機械監(jiān)督管理條例》等規(guī)定,醫(yī)療器械應(yīng)向國家申請注冊,未經(jīng)注冊的不得生產(chǎn)、進口、銷售和使用?,F(xiàn)在的問題是:國內(nèi)所有的基因測序診斷產(chǎn)品均未注冊。

        難道華大基因就沒想過注冊嗎?汪建在公開場合不止一次地抱怨:“華大基因并不是沒有試圖注冊,而是按照現(xiàn)行的政策法規(guī),注冊程序是一個無法完成的死結(jié)?!?/p>

        原來,中國現(xiàn)在使用的基因測序診斷產(chǎn)品都是國外進口,而《醫(yī)療器械注冊管理辦法》中明文規(guī)定,境外醫(yī)療器械在國內(nèi)注冊需滿足這一條件:“境外醫(yī)療器械已經(jīng)通過境外政府醫(yī)療器械主管部門的上市批準(zhǔn)?!笨蓡栴}是這些基因測序診斷產(chǎn)品在原產(chǎn)國也沒有注冊。比如華大基因從Illumina大批購置的型號為Hiseq 2000的測序儀就沒有獲得美國FDA批準(zhǔn)上市。于是,中國的基因測序服務(wù)公司就陷入了一個尷尬境地:想注冊而不得。

        難道中國的基因測序產(chǎn)業(yè)會因政策難題而停止不前嗎?在“叫?!币粋€月以后,國家又以試點的形式支持基因測序產(chǎn)業(yè)發(fā)展。侯玉彬認為此舉有點像國外的實驗室認證機制。認證是對實驗室實力和信譽的認可。在美國,實驗室取得認證以后,即使其所使用的基因測序診斷產(chǎn)品沒有注冊,實驗室仍有資質(zhì)發(fā)布臨床診斷報告。現(xiàn)在國家通過給試點單位以基因測序資質(zhì),凈化了基因測序市場,保證了基因測序的健康發(fā)展。

        除了上述政策風(fēng)險,基因測序還會產(chǎn)生基因歧視和宿命論的風(fēng)險。如果有一天,基因測序在臨床上廣泛應(yīng)用,每個人一出生就會做一次全基因組測序,測序數(shù)據(jù)顯示你有哪些缺陷基因,你患某種疾病的概率是多少,好似你的基因已經(jīng)決定了你的命運。當(dāng)一個人整天背負宿命論的壓力,生命還有意義嗎?當(dāng)你的全基因組信息流通以后,你可能在就業(yè)和購買保險等方面遭遇歧視和不公,就像電影《千鈞一發(fā)》中所講述的故事一樣。

        侯玉彬因此認為,在未來,個人基因信息極有可能被保密,只有個別機構(gòu)可以查看。上海復(fù)鑒生物科技有限公司的一個科研團隊正在為湖北建設(shè)個人基因數(shù)據(jù)庫,其項目負責(zé)人安海甲表示,基因數(shù)據(jù)庫會處于保密狀態(tài),只限特殊機構(gòu)查詢。(支點雜志2014年7月刊)endprint

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