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        烏魯木齊人群藥物性耳聾患者M(jìn)T-RNR1基因突變頻譜分析

        2014-08-03 06:52:40
        中國(guó)優(yōu)生優(yōu)育 2014年5期
        關(guān)鍵詞:糖苷耳聾氨基

        王 校

        (上海中優(yōu)醫(yī)藥高科技有限公司,上海 200433)

        耳聾是最常見的殘疾之一,據(jù)WHO估計(jì),2005年全球有2.78億人患有中度以上聽力損失,其中2/3在發(fā)展中國(guó)家。中國(guó)有13億人口,據(jù)2006年第二次殘疾人抽樣調(diào)查顯示,我國(guó)聽力和言語(yǔ)殘疾患者高達(dá)2 780萬(wàn)人,其中7歲以下聾兒高達(dá)80多萬(wàn),其中30多萬(wàn)是由于抗生素使用不當(dāng)所導(dǎo)致,占總體聾啞兒童的30%~40%[1]。氨基糖苷類抗生素(aminoglycoside antibiotics,AmAn)主要是通過損害前庭蝸神經(jīng)(包括前庭和耳蝸),從而對(duì)患者聽力損失。氨基糖苷類藥物是通過與細(xì)菌核糖體結(jié)合,干擾細(xì)菌蛋白合成而發(fā)揮抗菌活性的。人類線粒體DNA的基因變異使其更類似于細(xì)菌核糖體,更易與氨基糖苷類藥物結(jié)合。由于氨基糖苷類藥物在內(nèi)耳聽細(xì)胞中半衰期較長(zhǎng)(數(shù)月),因此,一旦內(nèi)耳聽細(xì)胞線粒體核糖體與藥物結(jié)合,將引起持久、嚴(yán)重的耳毒性[2]。目前,研究得較多的具有代表性的線粒體DNA突變包括12SrRNA基因上的961insC、961delT/T961G、T1095C、C1494T、A1555G等的突變[3]。這些突變可以是遺傳的,也可以是獲得性的,可以是同質(zhì)的也可以是異質(zhì)的。12S rRNA 1555A>G和1494C>T突變只在部分聽力損失的人群中檢測(cè)到[4],推測(cè)存在其他與耳聾相關(guān)的基因突變位點(diǎn)。鑒于目前鮮見我國(guó)少數(shù)民族人群耳聾相關(guān)基因突變位點(diǎn)的報(bào)道,本研究對(duì)新疆烏魯木齊少數(shù)民族集聚地區(qū)開展MT-RNR1基因的篩查,旨在為繪制少數(shù)民族人群非綜合征型耳聾患者的線粒體MT-RNR1基因突變頻譜提供可靠信息。

        1 對(duì)象與方法

        1.1 對(duì)象和聽力學(xué)檢查 我們?cè)?012年1月至2012年12月對(duì)999例來自中國(guó)新疆烏魯木齊地區(qū)的人群進(jìn)行了詳細(xì)的病史調(diào)查和體檢,以確定是否有耳聾或聽力下降的臨床表現(xiàn)、是否有氨基糖苷類抗生素的接觸史以及是否有MT-RNR1基因上的堿基突變。研究對(duì)象全部按照中國(guó)優(yōu)生優(yōu)育協(xié)會(huì)倫理委員會(huì)管理規(guī)定簽署了知情同意書。將聽力損失的嚴(yán)重程度根據(jù)臨床診斷標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行分類:① 聽力正常:≤25 dB;② 輕度聽力損失:26~40 dB;③ 中度聽力損失:41~70 dB;④ 重度聽力損失:71~90 dB;⑤ 極重度聽力損失:>90 dB。

        1.2 線粒體MT-RNR1基因突變檢測(cè)

        1.2.1 硅膠吸附法提取基因組DNA 首先收集研究對(duì)象的口腔黏膜細(xì)胞,冷凍保存;實(shí)驗(yàn)室取出裝有口腔拭子離心管解凍,旋渦震蕩器上震蕩10~20 s,離心12 000 rmp 2 min;去上清,加入1 ml DNA裂解液,混勻;加入50 μl硅膠制劑,混勻,離心10 000 rmp,10 s;去上清及拭子頭,加入1 ml DNA裂洗液,混勻,離心10 000 rmp,10 s;去上清,加入1ml DNA裂解液,混勻,離心10 000 rmp,10 s;去上清,加75%乙醇洗滌兩遍,離心;去上清,加入丙酮,干燥硅膠顆粒;加入純水溶解,離心12 000 rmp 3 min,取上清液50 μl用于后續(xù)檢測(cè)。取5 μl樣本1% 瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),根據(jù)檢測(cè)結(jié)果標(biāo)化樣本到10 ng/μl。

        1.2.2 PCR擴(kuò)增 采用在線軟件Primer 3設(shè)計(jì)PCR引物用于擴(kuò)增線粒體DNA MTRNR1上包含961-1555位點(diǎn)的片段。引物序列如下:正向引物:5’-AAAACGCTTAGCCTAGCCACA-3’反向引物:5’-GGTTTAGCTCAGAGCGGTCAA-3’反應(yīng)體系(15 μl)包含1x HotStar Taq buffer,3.0 mM Mg2+,0.3 mM dNTP,1 U HotStarTaq polymerase,2 μl樣本DNA和正、反向引物各0.5 μl(濃度為10 μM);在ABI 2720型PCR擴(kuò)增儀上進(jìn)行。5 μl PCR與1 μl 6×loading buffer混勻,1%瓊脂糖凝膠,1×TAE電泳緩沖液,120 V電泳20 min,marker為DL2000,目的條帶在898 bp左右。

        1.2.3 PCR產(chǎn)物純化 反應(yīng)體系包含1U SAP酶、1U Exo I酶和3ul PCR產(chǎn)物組成;反應(yīng)條件為:37℃ 60min,80℃ 15min,4℃恒溫保存;

        1.2.4 測(cè)序反應(yīng) 反應(yīng)體系(5μl)包含1μl BigDye、1μl 測(cè)序引物(5’-GGTTTAGCTCAGA GCGGTCAA-3’)(濃度為3 μM)、1 μl PCR純化產(chǎn)物和2 μl去離子水組成;反應(yīng)條件為預(yù)熱96℃、2 min;再進(jìn)行25個(gè)循環(huán)的96℃ 10 s、50℃ 5 s、60℃、4 min; 4℃恒溫保存;反應(yīng)結(jié)束后每孔加入1 μl 125 mM乙二胺四乙酸EDTA和無(wú)水乙醇15 μl,室溫沉淀15min;3 650 rmp/min,4℃離心30 min,輕輕倒去上清液;每孔加30 μl 70%乙醇,3 650 rmp/min,4℃離心15 min,倒去上清液;室溫放置20 min后加入8 μl 95%甲酰胺與ddH2O混合物,95℃變性5 min后上ABI3130XL測(cè)序儀,用軟件Chromas查閱測(cè)序檢測(cè)結(jié)果。

        2 結(jié) 果

        2.1 研究對(duì)象的人口學(xué)特征 999例中,漢族人有529人,維吾爾族人有295人,回族有123人,哈薩克族44人,蒙古族4人,俄羅斯族2人,東鄉(xiāng)族和土族各1人。男性425例, 女性574例;最小年齡1歲,最大年齡79歲,平均18歲。73人(7.3%)有氨基糖苷類藥物接觸史,537人(53.8%)未接觸氨基糖苷類藥物,389人(38.9%)不清楚自己的藥物接觸史。經(jīng)過聽力學(xué)檢測(cè),共有508人患有耳聾(占50.9%),491人沒有患病。耳聾患者分別表現(xiàn)不同程度的聽力損失:186人(18.6%)為極重度聽力損失,111人(11.1%)為重度聽力損失,62人(6.2%)為中度聽力損失,17人(1.7%)為輕度聽力損失,132人(13.2%)的頭顱損失情況不明。

        2.2 線粒體DNA MTRNR1基因突變分析 共有109例樣本的MT-RNR1基因上共發(fā)現(xiàn)11個(gè)位點(diǎn)發(fā)生堿基改變,即:961 delT/insC、C1494T、A1555G、T1095C、A1116G、T1005C、G1007A、T1107C、A1047G、A1585G、T1520C,攜帶率為10.91%。位點(diǎn)檢測(cè)結(jié)果詳見圖1-12,突變位點(diǎn)及人數(shù)情況詳見表1。

        圖1 MTRNR1(正常)

        圖2 MTRNR1 961 delT/insC

        圖3a MTRNR1 T1095C T

        圖3b MTRNR1 T1095C C

        圖4a MTRNR1 C1494T C

        圖4b MTRNR1 C1494T T

        圖5a MTRNR1 A1555G A

        圖5b MTRNR1 A1555G G

        圖6a MTRNR1 A1585G A

        圖6b MTRNR1 A1585G G

        圖7a MTRNR1 A1047G A

        圖7b MTRNR1 A1047G G

        圖8a MTRNR1 A1116G A

        圖8b MTRNR1 A1116G G

        圖9a MTRNR1 T1520C T

        圖9b MTRNR1 T1520C C

        圖10a MTRNR1 G1007A G

        圖10b MTRNR1 G1007A A

        圖11a MTRNR1 T1107C T

        圖11b MTRNR1 T1107C C

        圖12a MTRNR1 T1005C T

        圖12b MTRNR1 T1005C C

        表1MT-RNR1基因的11個(gè)突變位點(diǎn)及人數(shù)情況

        位點(diǎn)受累人數(shù)重度/極重度人數(shù)接觸AmAn且重度/或極重度耳聾人數(shù)少數(shù)民族人數(shù)961 delT/insC11316C1494T2110A1555G221152T1095C3002A1116G2001T1005C21618G1007A1111T1107C4310316A1047G1000A1585G2002T1520C1000

        3 討 論

        A1555G突變被認(rèn)為是世界上跟耳聾相關(guān)的最顯著線粒體DNA突變,并已在白種人和亞洲人等不同人群中得以確定,且跟線粒體單倍型類群相關(guān)[4-5]。這種突變?cè)趤喼奕巳褐械陌l(fā)生更加普遍,在亞裔人群藥物性耳聾患者中,1555A>G突變頻率為5%~33%[6],而國(guó)內(nèi)報(bào)道的mtDNA A1555G突變陽(yáng)性率是3.43%[7],但在我國(guó)西北地區(qū)線粒體DNA 12SrRNA A1555G突變檢出率顯著高于東北地區(qū)[8]。本次研究的1555A>G基因突變頻率為4.33%,與國(guó)內(nèi)報(bào)道相似。

        C1494T突變的發(fā)生率遠(yuǎn)低于A1555G突變對(duì)線粒體。有研究顯示,在621例耳聾患者中共篩查出2例mtDNA C1494T突變個(gè)體,頻率為0.32%[9]。1494C>T突變頻率在本研究的研究對(duì)象者中占0.39%,與以往研究結(jié)果相似。位于12SrRNA高度保守的解碼區(qū)的同質(zhì)性的C1494T突變與耳聾相關(guān)。12SrRNA基因功能有影響的核修飾基因可能會(huì)使C1494T突變的生化缺陷增強(qiáng),使該突變攜帶者聽力下降,而這種核修飾基因也可以抑制該突變的作用而使該成員聽力正常[10]。

        本研究顯示961 delT/insC基因突變頻率達(dá)2.17%。Bacino等[11]首次報(bào)道m(xù)tDNA 961delT/insC與藥物性耳聾相關(guān),并指出線粒體12SrRNA基因的第961位堿基附近的異質(zhì)性的缺失,插入突變以及該基因中兩個(gè)同質(zhì)性的突變,可導(dǎo)致產(chǎn)生氨基糖苷類藥物耳毒易感性。但近年來有研究并不支持mtDNA961delT/insC突變是氨基糖苷類抗生素誘發(fā)性耳聾的遺傳基礎(chǔ)[12-13]。李建忠等[14]認(rèn)為mtDNA 961位點(diǎn)附近可能是一個(gè)多變異的區(qū)域,mtDNA 961delT/insC可能是一個(gè)與氨基甙類藥物性耳聾不明確相關(guān)的多態(tài)。同時(shí)也有研究表明mtDNA G1007A和A1313G點(diǎn)突變、mtDNA G7444A突變可能分別參與了A1555G導(dǎo)致的聽力損害的過程[15]。Li等[16]報(bào)道線粒體12SrRNA基因的A827G,T1005C和A1116G突變可能參與AAID的發(fā)病機(jī)制。

        根據(jù)本研究數(shù)據(jù)提示,與MT-RNR1基因上的961delT/insC、A1555G、C1494T一樣,T1005C、T1107C突變或許也是一個(gè)在中國(guó)人群中常見的藥物敏感致聾靶點(diǎn),尤其是在新疆的少數(shù)民族聚集地區(qū)。對(duì)于部分突變頻率低的位點(diǎn),我們希望日后能展開更多更詳盡的研究。本研究將有助于更進(jìn)一步揭示氨基糖苷類藥物中毒性耳聾的病因,以及臨床表現(xiàn)的遺傳基礎(chǔ)和本質(zhì),是實(shí)現(xiàn)臨床大規(guī)?;蛟\斷的基礎(chǔ),對(duì)于耳聾基因的個(gè)體治療也有著重要意義。

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