麻文青 連福治 汪金泉 楊 磊,△
SYBR Green實(shí)時(shí)定量端粒重復(fù)序列擴(kuò)增法檢測(cè)端粒酶活性
麻文青1連福治2汪金泉3楊 磊1,2△
目的 采用實(shí)時(shí)定量端粒重復(fù)序列擴(kuò)增法(RQ-TRAP法)檢測(cè)不同細(xì)胞端粒酶活性。方法用RQTRAP和TRAP-ELISA兩種方法同時(shí)檢測(cè)12種細(xì)胞的端粒酶活性,并比較兩種方法的檢測(cè)結(jié)果。結(jié)果RQ-TRAP方法能準(zhǔn)確特異地檢測(cè)系列稀釋的293T細(xì)胞蛋白提取液的端粒酶活性,靈敏度可達(dá)8個(gè)細(xì)胞,擴(kuò)增效率為98.92%。陰性對(duì)照組則未檢測(cè)到端粒酶活性。RQ-TRAP方法測(cè)得12個(gè)細(xì)胞系中端粒酶的活性與TRAP-ELISA方法結(jié)果有較強(qiáng)相關(guān)性(r2=0.762 5)。兩種方法檢測(cè)腫瘤細(xì)胞端粒酶活性均高于正常細(xì)胞。結(jié)論RQ-TRAP方法檢測(cè)端粒酶可行,比TRAP-ELISA方法成本低、時(shí)間短,且支持高通量,是一種新的可快速可靠定量端粒酶活性的方法。
端粒;基因擴(kuò)增;酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定;端粒酶活性;端粒重復(fù)序列擴(kuò)增;TRAP-ELISA
端粒酶是一種核糖核蛋白復(fù)合體[1]。在絕大多數(shù)永生化細(xì)胞系和腫瘤細(xì)胞中端粒酶活性較高[2]。因此,端粒酶可能為腫瘤的診斷和治療提供新的方向[3]。目前端粒酶活性的檢測(cè)主要采用TRAP-ELISA 法[4]。但是該法存在檢測(cè)時(shí)間長(zhǎng)、成本相對(duì)較高等缺點(diǎn)。近年來(lái),有研究將定量PCR與TRAP法結(jié)合起來(lái),采用熒光染料SYBR Green,建立了SYBR Green實(shí)時(shí)定量端粒重復(fù)序列擴(kuò)增法(RQ-TRAP法)[5]。本實(shí)驗(yàn)采用RQ-TRAP和TRAP-ELISA法檢測(cè)不同細(xì)胞端粒酶活性,旨在證實(shí)RQ-TRAP法的優(yōu)勢(shì)。
1.1 主要材料和試劑 細(xì)胞由本室保存及其他實(shí)驗(yàn)室惠贈(zèng),RPMI-1640培養(yǎng)基、DMEM培養(yǎng)基和新生胎牛血清均為Hy-Clone產(chǎn)品,TRAP-ELISA端粒酶檢測(cè)試劑盒TeloTAGGG Telomerase PCR ELISAPLUS購(gòu)于Roche公司;RQ-TRAP引物參照文獻(xiàn)序列如下:TS 5′-AATCCGTCGAGCAGAGTT-3′,ACX 5′-GCGCGGCTTACCCTTACCCTTACCCTAACC-3′,由上海桑尼生物科技有限公司合成。SYBR Green實(shí)時(shí)定量試劑盒購(gòu)于TaKaRa公司,所用定量PCR儀為Applied Biosystems 7300 Real-Time PCR System(Applied Biosystems)。
1.2 細(xì)胞培養(yǎng) 所選細(xì)胞包括人腎上皮細(xì)胞系293T細(xì)胞、人肝癌細(xì)胞系HepG2細(xì)胞、人乳腺癌細(xì)胞系MCF7細(xì)胞、人宮頸癌細(xì)胞系HeLa細(xì)胞、人腎上腺嗜鉻細(xì)胞瘤細(xì)胞系PC-12細(xì)胞、人結(jié)腸腺癌細(xì)胞系RKO細(xì)胞、人急性T細(xì)胞白血病細(xì)胞系Jurkat細(xì)胞、人淋巴瘤細(xì)胞系U937細(xì)胞和人卡巴式肉瘤相關(guān)皰癥病毒感染細(xì)胞系BCBL-1細(xì)胞,以及人肝細(xì)胞系L-02細(xì)胞、人視網(wǎng)膜色素上皮細(xì)胞系D407細(xì)胞和鼠成纖維細(xì)胞系L929細(xì)胞。Jurkat細(xì)胞、U937細(xì)胞、BCBL-1細(xì)胞培養(yǎng)在含10%新生胎牛血清、100 U/mL青霉素、100 mg/L鏈霉素溶液的RPMI-1640培養(yǎng)基中,其他細(xì)胞均常規(guī)培養(yǎng)在含10%新生胎牛血清、100 U/mL青霉素、100 mg/L鏈霉素的DMEM培養(yǎng)液中,所有細(xì)胞均在37℃、5%CO2和95%相對(duì)濕度條件下孵育培養(yǎng)。每2~3 d傳代1次。
1.3 細(xì)胞蛋白提取液的制備 RQ-TRAP用細(xì)胞蛋白提取液按Kim法制備:收集細(xì)胞,PBS沖洗1次,10 000×g4℃離心1 min收集細(xì)胞,沉淀細(xì)胞用預(yù)冷的洗液[10 mmol/L 4-羥乙基哌嗪乙磺酸氫氧化鉀(Hepes-KOH,pH 7.5),1.5 mmol/L MgCl2,10 mmol/L KCl,1 mmol/L二硫蘇糖醇(DTT)]重懸,再離心,重懸1×104~1×106個(gè)細(xì)胞在20 μL預(yù)冷的細(xì)胞裂解液里[10 mmol/L三羥甲基氨基甲烷鹽酸Tris-HCl(pH 7.5),1 mmol/L MgCl2,1 mmol/L乙二醇-雙-(2-氨基乙醚)四乙酸(EGTA),0.1 mmol/L苯甲基磺酰氟(PMSF),5 mmol/L β-巰基乙醇,0.5%3-[(3-膽固醇氨丙基)二甲基氨基]-1-丙磺酸(CHAPS),10%甘油]。冰上孵育30 min,16 000×g4℃離心20 min,收集上清,迅速冷凍,-80℃保存。TRAP-ELISA用細(xì)胞蛋白提取液制備方法按照TeloTAGGG Telomerase PCR ELISAPLUS(Roche Molecular Biochemicals)試劑盒說(shuō)明制備。取5 μL的細(xì)胞提取液加入2 μL DNase-free RNase(0.5 g/L),37℃孵育20 min以滅活端粒酶,作為實(shí)驗(yàn)陰性對(duì)照。
1.4 RQ-TRAP檢測(cè)端粒酶活性 依照參考文獻(xiàn)[5]檢測(cè)RQTRAP端粒酶活性,定量PCR采用Takara SYBR PremixEx TaqTM實(shí)時(shí)定量試劑盒(Takara DRR041A)。取5倍系列稀釋的端粒酶陽(yáng)性的293T細(xì)胞提取液(1 000、200、40、8個(gè)細(xì)胞),以及2種陰性對(duì)照樣本分別作為PCR模板同時(shí)進(jìn)行定量PCR反應(yīng)。2種陰性對(duì)照按照如下方法設(shè)立。(1)以裂解液替代細(xì)胞提取液,用以監(jiān)測(cè)PCR過(guò)程是否有污染。(2)RNase處理后,端粒酶RNA模板被降解,作為檢測(cè)樣本的自身對(duì)照。定量PCR反應(yīng)體系(20μL)為:SYBR Premix Ex Taq(2×)10 μL,PCR Forward Prime TS(10μmol/L)0.8μL,PCR Reverse Prime ACX(10μmol/L)0.4μL,ROX Reference Dye(50×)0.4 μL,模板(細(xì)胞提取液)1μL。PCR反應(yīng)程序包括:(1)端粒延長(zhǎng),25℃孵育20 min。(2)端粒酶滅活,95℃5 min。(3)擴(kuò)增循環(huán),95℃變性5 s,60℃退火/延伸31 s,共40個(gè)循環(huán)。運(yùn)用ABI7300軟件采集和分析數(shù)據(jù),通過(guò)軟件可以計(jì)算出標(biāo)準(zhǔn)品和所有樣品達(dá)到熒光閾值的循環(huán)數(shù)(Ct),以細(xì)胞數(shù)為橫坐標(biāo)軸,Ct值為縱坐標(biāo)軸做標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)。取1 000個(gè)細(xì)胞制備的細(xì)胞提取液進(jìn)行樣品檢測(cè),評(píng)價(jià)方法為每個(gè)樣品相對(duì)于同樣細(xì)胞數(shù)293T細(xì)胞的端粒酶活性的比值。每個(gè)樣本重復(fù)3次。
1.5 TRAP-ELISA法檢測(cè)端粒酶活性 參照Roche公司的TeloTAGGG Telomerase PCR ELISAPLUS試劑盒及文獻(xiàn)操作說(shuō)明進(jìn)行操作。收集培養(yǎng)的活力良好的細(xì)胞并計(jì)數(shù)2×105個(gè)細(xì)胞,冷PBS洗2次,加裂解液200μL,冰上裂解30 min, 16 000×g低溫離心20 min,取上清3μL加入TRAP反應(yīng)液并加無(wú)核酸酶的水補(bǔ)足50μL進(jìn)行PCR擴(kuò)增,平行對(duì)照組于檢測(cè)前經(jīng)RNase處理。反應(yīng)條件為:引物延長(zhǎng)25℃30 min;端粒酶滅活94℃5 min;擴(kuò)增條件:變性94℃30 s;退火50℃30 s;延伸72℃90 s循環(huán)30次。取2.5μL擴(kuò)增產(chǎn)物,每個(gè)樣品加10μL變性液,室溫反應(yīng)10 min,加雜交液100μL,充分混勻,將上述混合液體加入到鏈霉親和素包被的微量反應(yīng)板中,300 r/min 37℃孵育2 h;棄去雜交液,輕輕地用沖洗緩沖液清洗3次,向每孔中加入100μL抗地高辛過(guò)氧化物酶,300 r/min搖床室溫30 min;棄去液體,用沖洗緩沖液清洗5次,加100μL TMB底物液,室溫下觀察顏色反應(yīng)。端粒酶陽(yáng)性時(shí),液體由無(wú)色透明逐漸變藍(lán),加入終止液,顏色由藍(lán)變黃。加入終止液后30 min,在酶標(biāo)儀上測(cè)450 nm處吸光度值,參考波長(zhǎng)為690 nm。每個(gè)樣本重復(fù)3次。
1.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 采用SPSS 17.0軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。計(jì)量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(±s)表示;RQ-TRAP和TRAP-ELISA方法的關(guān)聯(lián)性用線(xiàn)性回歸模型分析,以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 RQ-TRAP標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn) 4個(gè)濃度的293T細(xì)胞提取液均檢測(cè)到擴(kuò)增產(chǎn)物,而2種陰性對(duì)照均沒(méi)有檢測(cè)到擴(kuò)增產(chǎn)物。隨著模板濃度的降低,Ct值隨著增大,但在8個(gè)細(xì)胞的裂解液中也能有效地檢測(cè)出擴(kuò)增產(chǎn)物,見(jiàn)圖1A。PCR產(chǎn)物的熔解曲線(xiàn)顯示為單峰,沒(méi)有引物二聚體的形成,見(jiàn)圖1B。PCR結(jié)果做標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)顯示擴(kuò)增斜率為-3.34,決定系數(shù)(R2)達(dá)到0.997,擴(kuò)增效率為98.92%。
Fig.1 The standard curve of telomerase activity measured by RQ-TRAP圖1 RQ-TRAP測(cè)定端粒酶活性標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)
2.2 RQ-TRAP與TRAP-ELISA檢測(cè)端粒酶活性結(jié)果比較 兩種方法測(cè)得12種細(xì)胞的相對(duì)端粒酶活性,見(jiàn)表1。兩種方法測(cè)得的端粒酶活性存在相關(guān)性(r2=0.762 5,P<0.05)。端粒酶活性結(jié)果還顯示,兩種方法測(cè)得的腫瘤細(xì)胞端粒酶活性均高于正常細(xì)胞。
Tab.1 Comparison of telomerase activity measured by RQ-TRAP and TRAP-ELISA表1 RQ-TRAP和TRAP-ELISA測(cè)得相對(duì)端粒酶活性比較
本實(shí)驗(yàn)是采用端粒重復(fù)序列擴(kuò)增和SYBR Green熒光定量PCR相結(jié)合的SYBR Green實(shí)時(shí)定量端粒重復(fù)序列擴(kuò)增(RQ-TRAP)方法檢測(cè)端粒酶活性,以縮短操作時(shí)間、減少繁瑣的擴(kuò)增后操作步驟(如聚丙烯酰胺凝膠電泳或ELISA等)。實(shí)驗(yàn)采用Kim等[6]文獻(xiàn)報(bào)道的TS和ACX引物,無(wú)引物二聚體的形成。同時(shí)RQ-TRAP方法能準(zhǔn)確特異地檢測(cè)12種細(xì)胞的端粒酶活性,且在8個(gè)細(xì)胞濃度時(shí)仍能有效地檢測(cè),顯示該方法具有較高靈敏度。同時(shí),擴(kuò)增效率達(dá)98.92%,可高效率地檢測(cè)端粒酶活性。
目前,TRAP-ELISA檢測(cè)端粒酶活性方法較為常用,它具有靈敏、特異及可定量人端粒酶活性等優(yōu)點(diǎn),但是仍存在擴(kuò)增后處理時(shí)間較長(zhǎng),成本相對(duì)較高等問(wèn)題。近年來(lái),有研究將定量PCR與TRAP法結(jié)合起來(lái),采用熒光染料SYBR Green建立了一種新的端粒酶活性檢測(cè)方法,即RQ-TRAP法。Wege等[5]研究認(rèn)為T(mén)RAP-ELISA與RQ-TRAP有相關(guān)性,且RQ-TRAP有耗時(shí)短、線(xiàn)性結(jié)果可靠等優(yōu)點(diǎn)。另外Hou等[7]的研究也表明RQ-TRAP方法是一種新的可快速可靠定量端粒酶活性的方法。本實(shí)驗(yàn)將研究樣本增加到12個(gè)細(xì)胞系,包括腫瘤細(xì)胞系和正常細(xì)胞系。利用RQ-TRAP和TRAP-ELISA方法同時(shí)檢測(cè)端粒酶活性,并對(duì)兩種方法進(jìn)行相關(guān)性分析,實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示:9個(gè)腫瘤細(xì)胞系的相對(duì)端粒酶活性均高于3個(gè)正常細(xì)胞系,這一結(jié)果與普遍認(rèn)為的腫瘤細(xì)胞有較高的端粒酶活性相一致。用RQ-TRAP方法測(cè)得12個(gè)細(xì)胞系中端粒酶的活性與TRAP-ELISA結(jié)果相關(guān)性為r2=0.762 5,表明RQ-TRAP方法可以作為一種檢測(cè)端粒酶活性的方法,與TRAP-ELISA方法比較,它消除了擴(kuò)增后復(fù)雜的ELISA過(guò)程,縮減了時(shí)間和繁瑣的操作步驟,降低了成本,可以高通量進(jìn)行,提高了檢測(cè)效率,是一種可靠、能快速定量端粒酶活性的方法。
端粒酶在腫瘤組織中的檢出率為85%~95%,而在非腫瘤組織和各種正常組織中其檢出率為4%~6%[8]。本研究中3種正常細(xì)胞系的端粒酶活性均低于其他9個(gè)腫瘤細(xì)胞系,此結(jié)果符合目前研究成果,所以RQ-TRAP法是一種可靠地檢測(cè)端粒酶活性的方法。
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(2014-02-21收稿 2014-03-31修回)
(本文編輯 魏杰)
Combined SYBR Green Real-Time with Telomeric Repeat Amplification Protocol(RQ-TRAP) to Detect Telomerase Activity
MA Wenqing1,LIAN Fuzhi2,WANG Jinquan3,YANG Lei1,2
1 Medical College,Shihezi University,Shihezi 832000,China;2 Medical College,Hangzhou University;3 College of Life and Environmental Sciences,Shihezi University YANG Lei,E-mail:yanglei62@hznu.edu.cn
ObjectiveTo establish methodology to detect telomerase activity based on real-time quantitative PCR technique combined with telomeric repeat amplification protocol(TRAP).MethodsRQ-TRAP system was developed by combining real-time quantitative PCR technique with conventional TRAP method.Telomerase activity was assessed and compared by RQ-TRAP assay and TRAP connected with enzyme-linked immunosorbent assay(TRAP-ELISA)respectively in 12 kinds of cells.ResultsThe RQ-TRAP method was both accurate and specified in measuring telomerase activity in a series dilution of protein extracts from 293T cells.The sensitivity of this method was 8 cells and the amplification efficiency was 98.92%.Telomerase activity was not detected in negative control group.Statistical analysis revealed a strong correlation between the two assays(r2=0.762 5).ConclusionThe feasibility of RQ-TRAP was proved in this article.Compared with TRAP-ELISA,RQ-TRAP has many advantages.Apart from sample extraction and real-time PCR cycling,no other extra time-consuming steps are needed for telomerase quantification;RQ-TRAP is less costly and more rapid and reliable than TRAP-ELISA for quantification of telomerase activity and it also support high throughput.
telomere;gene amplification;enzyme-linked immunosorbent assay;telomerase activity;telomeric repeat amplification protocol;TRAP-ELISA
R34
A
10.3969/j.issn.0253-9896.2014.08.003
國(guó)家重大科學(xué)研究計(jì)劃項(xiàng)目(2012CB911200)
1石河子大學(xué)醫(yī)學(xué)院(郵編832000);2杭州師范大學(xué)醫(yī)學(xué)院;3石河子大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院
△通訊作者 E-mail:yanglei62@hznu.edu.cn