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        端粒蛋白復(fù)合物shelterin的結(jié)構(gòu)及功能研究進(jìn)展

        2019-06-03 06:13:04薛京倫
        癌變·畸變·突變 2019年3期
        關(guān)鍵詞:端粒復(fù)合物結(jié)構(gòu)域

        王 晗,倪 娟,2,薛京倫,汪 旭,2,*

        (1.云南師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,云南 昆明 650500;2.云南師范大學(xué)生物能源持續(xù)開(kāi)發(fā)與利用教育部工程研究中心,云南昆明 650500;3.復(fù)旦大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,上海 200433)

        端粒(telomere)位于真核生物線性染色體末端,是穩(wěn)固真核生物染色體、保護(hù)遺傳信息完整的必要組分。端粒長(zhǎng)度的調(diào)節(jié)對(duì)維持端粒結(jié)構(gòu)及功能的穩(wěn)定至關(guān)重要,也在維護(hù)染色體末端的完整性及穩(wěn)定性方面起重要作用[1]。端??s短與衰老相關(guān),而當(dāng)細(xì)胞在端粒極短時(shí)繼續(xù)存活,則會(huì)引起端粒結(jié)構(gòu)和功能紊亂,導(dǎo)致基因組不穩(wěn)定性發(fā)生,增加疾病發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)[2]。目前,端粒長(zhǎng)度已成為退行性疾病如心血管疾病、阿爾茲海默癥、風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎等的重要生物指標(biāo)[3]。端粒酶(telomerase)、端粒蛋白復(fù)合物(shelterin)以及眾多與端粒相互作用的因子,均參與調(diào)控端粒長(zhǎng)度。任何端粒相關(guān)蛋白因子表達(dá)改變均與端粒功能失調(diào)、細(xì)胞衰老加速相關(guān),進(jìn)而導(dǎo)致基因組不穩(wěn)定性以及疾病的發(fā)生和發(fā)展[4]。

        其中,shelterin復(fù)合物對(duì)端粒結(jié)構(gòu)及功能的重要維護(hù)作用逐漸凸顯。近年來(lái)研究發(fā)現(xiàn),shelterin復(fù)合物表達(dá)異常、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)改變或發(fā)生基因突變,容易引起端粒脫帽、端粒長(zhǎng)度改變,對(duì)端粒結(jié)構(gòu)和功能產(chǎn)生嚴(yán)重影響,易引起染色體末端融合、基因組穩(wěn)定性下降等惡性事件的發(fā)展,與疾病發(fā)生密切相關(guān)。Shelterin復(fù)合物各組分的結(jié)構(gòu)及其端粒維護(hù)功能甚至非端粒功能的研究,對(duì)端粒生物學(xué)、端粒相關(guān)的退行性疾病研究均具有重要意義,也在癌癥早期診斷、干預(yù)和治療過(guò)程中具有潛在作用。本文對(duì)shelterin復(fù)合物的結(jié)構(gòu)和各組分的功能研究進(jìn)展進(jìn)行綜述。

        1 端粒蛋白復(fù)合物shelterin

        在結(jié)構(gòu)上,端粒序列由雙鏈DNA區(qū)和一個(gè)富含G的3′端懸突即單鏈DNA區(qū)組成。Shelterin復(fù)合物可通過(guò)與端粒特異性結(jié)合,使端粒末端類似DNA雙鏈斷裂(DNA double-strand break,DSB)結(jié)構(gòu)形成端粒環(huán)(telomere-loop,T-loop),幫助端粒成帽,保護(hù)染色體末端免遭DSB識(shí)別,抑制DNA損傷應(yīng)答(DNA damage response,DDR),維護(hù)端粒結(jié)構(gòu)和功能完整,保護(hù)染色體末端穩(wěn)定[5]。人的shelterin復(fù)合物由6種核心蛋白質(zhì)組成:端粒重復(fù)結(jié)合因子1和2(telomeric repeat-binding factors 1 and 2,TRF1,TRF2),TRF1相互作用蛋白 2(TERF 1-interacting protein 2,TIN2),TRF2相互作用蛋白1(TRF2-interacting protein 1,RAP1),端粒保護(hù)蛋白1(protection of telomeres 1,POT1)以及POT1結(jié)合蛋白1(telomere-binding protein POT1-interacting protein 1,TPP1)[6]。其中,TRF1 和TRF2與端粒雙鏈DNA結(jié)合;TPP1與POT1結(jié)合后募集POT1到端粒區(qū);POT1可特異性識(shí)別端粒單鏈DNA;RAP1通過(guò)與TRF2相互作用定位到端粒;最后,TIN2起到橋梁作用將POT1-TPP1與TRF1、TRF2連接,從而將整個(gè)shelterin復(fù)合物結(jié)合到一起,穩(wěn)定端粒結(jié)構(gòu)(圖1所示)。

        Shelterin復(fù)合物可抑制端粒區(qū)包括ATM和ATR信號(hào)傳導(dǎo)、非同源末端連接、同源重組等介導(dǎo)的DNA損傷信號(hào)通路及DNA修復(fù)途徑激活,并通過(guò)螯合端粒3′端懸突來(lái)阻止外切核酸酶對(duì)端粒區(qū)的降解,它還可通過(guò)影響端粒酶到達(dá)端粒區(qū)的進(jìn)程來(lái)調(diào)控端粒長(zhǎng)度[8]。Shelterin復(fù)合物完成對(duì)端粒穩(wěn)定維護(hù)的前提,必須是shelterin各組分的結(jié)構(gòu)和功能完整。

        2 TRF1和TRF2

        圖1 端粒與shelterin復(fù)合物[7]

        Shelterin的兩個(gè)亞基TRF1和TRF2均具有對(duì)端粒雙鏈DNA特異性結(jié)合的C端Myb-SANT DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域、鉸鏈結(jié)構(gòu)域和二聚化結(jié)構(gòu)域,TRF2還具有RAP1結(jié)合基序[9]。TRF1和TRF2必須先構(gòu)成同源二聚體,才能與端粒序列緊密結(jié)合。TRF2具有拓?fù)洚悩?gòu)酶活性,可幫助端粒3′端懸突插入雙鏈DNA中形成T-loop,有效隱藏了端粒末端,它還負(fù)責(zé)端粒成帽,對(duì)保護(hù)端粒完整性至關(guān)重要[10]。

        研究發(fā)現(xiàn),TRF1最主要的作用是負(fù)向調(diào)控端粒長(zhǎng)度[11],并參與端粒DNA復(fù)制[12]。TRF1刪除會(huì)阻止ATM-TRF1相互作用,阻礙P53和CHK2募集,使DNA損傷區(qū)域的復(fù)制叉繼續(xù)前進(jìn),最終導(dǎo)致細(xì)胞分裂異常和基因組不穩(wěn)定[13]。而TRF2可正向調(diào)控端粒長(zhǎng)度,TRF2同源二聚體結(jié)構(gòu)還可特異性抑制端粒區(qū)ATM依賴的DNA損傷信號(hào),這個(gè)結(jié)構(gòu)是許多修復(fù)蛋白如Apollo、SLX4、RTEL1的結(jié)合中心,TRF2的表達(dá)減少可激活端粒區(qū)ATM激酶通路,導(dǎo)致非同源末端連接引起的端粒融合[10,14-15]。端粒鋅指相關(guān)蛋白(telomeric zinc finger-associated protein,TZAP)可與TRF2競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合到端粒區(qū)來(lái)調(diào)控端粒長(zhǎng)度,開(kāi)啟并觸發(fā)端粒修剪(telomere trimming),設(shè)定端粒長(zhǎng)度上限,維護(hù)基因組穩(wěn)定,但在TRF2過(guò)表達(dá)的細(xì)胞中定位到端粒區(qū)的TZAP會(huì)大大降低,說(shuō)明TRF2過(guò)表達(dá)會(huì)取代TZAP的位置[16]。

        細(xì)胞中TRF1和TRF2表達(dá)改變?cè)诎┌Y發(fā)生、發(fā)展過(guò)程中出現(xiàn)。Diehl等[17]發(fā)現(xiàn),TRF2表達(dá)下降引起端粒縮短,促使乳腺癌惡化。Pal等[18]發(fā)現(xiàn),在腎細(xì)胞癌中,TRF1和TRF2的轉(zhuǎn)錄水平和蛋白水平均呈高表達(dá)狀態(tài),而沉默TRF1和TRF2可引起腎癌細(xì)胞A498細(xì)胞周期阻滯,凋亡發(fā)生。TRF1和TRF2的表達(dá)狀況可能在腫瘤早期診斷中成為指標(biāo)。

        3 POT1和TPP1

        POT1可高特異性、高親和性結(jié)合端粒單鏈DNA,在端粒區(qū),POT1與TPP1會(huì)形成異源二聚體,并依賴POT1的寡核苷酸結(jié)合折疊(OB-fold)結(jié)構(gòu)域結(jié)合到端粒3′端,阻止復(fù)制蛋白的募集,抑制端粒區(qū)類似DNA雙鏈損傷的激活[19]。人POT1有3個(gè)OB-fold結(jié)構(gòu)域,它們負(fù)責(zé)與端粒DNA結(jié)合,并對(duì)POT1與TPP1相互作用構(gòu)成緊密的異源二聚體非常重要。TPP1與POT1的結(jié)合,可提高POT1與單鏈DNA的緊密程度,促進(jìn)POT1與端粒區(qū)單鏈DNA結(jié)合,保護(hù)染色體末端穩(wěn)定[20]。TPP1的N端OB-fold結(jié)構(gòu)域還可與端粒酶重要組分TERT相互作用,將端粒酶募集到染色體末端,并且與POT1一起增加端粒酶延伸活性,調(diào)節(jié)端粒長(zhǎng)度[21]。

        POT1還是癌癥中最常見(jiàn)的突變型shelterin組分。由于POT1抑制DNA損傷信號(hào)傳導(dǎo)和修復(fù)激活的能力均需要OB-fold的參與,所以有研究認(rèn)為OB-fold突變促進(jìn)了基因組不穩(wěn)定性且可引發(fā)腫瘤[22]。Chen等[23]發(fā)現(xiàn)POT1 C端的A364E、P371T、E572K等突變位點(diǎn)可破壞POT1與TPP1結(jié)合,引起POT1蛋白改變,導(dǎo)致基因組不穩(wěn)定性增加。Rice等[19]也發(fā)現(xiàn)POT1 C端的P446Q、C591W、Q623H等位點(diǎn)突變可擾亂POT1的C端折疊,或破壞POT1-TPP1結(jié)合及POT1-TPP1與端粒的親和力,導(dǎo)致基因組不穩(wěn)定并促進(jìn)如黑色素瘤等癌癥發(fā)生。

        除基因突變外,POT1或TPP1刪除或表達(dá)改變,同樣與疾病產(chǎn)生相關(guān)。Qiang等[24]發(fā)現(xiàn)在利用ALT延長(zhǎng)端粒的U2OS細(xì)胞中,TPP1刪除導(dǎo)致端??s短、凋亡發(fā)生和細(xì)胞輻射敏感性增強(qiáng)。Ahmad等[25]在吸煙者、肺氣腫和慢阻肺病患者中發(fā)現(xiàn)TPP1表達(dá)降低,并伴隨持續(xù)的端粒DNA損傷和細(xì)胞衰老,他們發(fā)現(xiàn)吸煙會(huì)破壞TPP1與去乙酰化酶的相互作用,導(dǎo)致TPP1乙?;偷鞍捉到庠黾?。

        4 TIN2

        TIN2是POT1-TPP1復(fù)合物與TRF1、TRF2相連接的橋梁,也起到穩(wěn)定TRF1、TRF2與雙鏈DNA連接的作用。研究發(fā)現(xiàn),TIN2的異常會(huì)引起shelterin復(fù)合物不能完整組裝并緊密結(jié)合到端粒區(qū)。先天性角化不良(dyskeratosis congenita,DC)患者的統(tǒng)一特征是端粒異常縮短,F(xiàn)rescas等[26]研究證實(shí)攜帶TIN2突變的DC患者將具有更短的端粒且伴隨有疾病加重的現(xiàn)象。Chen等[27]在TIN2敲除的細(xì)胞中也觀察到TRF2功能的降低,在TIN2敲除的細(xì)胞中,過(guò)表達(dá)TRF2并不能完全抑制ATM激酶信號(hào)通路的激活,TRF2突變引起TIN2結(jié)合的改變也會(huì)引起ATM信號(hào)通路的部分激活。

        除TIN2的端粒功能外,近幾年有研究發(fā)現(xiàn)了TIN2的非端粒功能。Sullivan等[28]發(fā)現(xiàn),定位于線粒體的TIN2可減少ATP的產(chǎn)生并增加ROS的生成,而線粒體長(zhǎng)期缺失TIN2會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞代謝增殖加速,引起細(xì)胞增殖的異常,易誘導(dǎo)細(xì)胞癌變。

        5 RPA1

        抑制因子激活蛋白1(repressor/activator protein 1,RAP1),是shelterin中保守度最高的組分。人RAP1包含4個(gè)蛋白質(zhì)相互作用域:N末端的BRCT結(jié)構(gòu)域,兩個(gè)中心Myb結(jié)構(gòu)域以及C末端的RPA1蛋白相互作用即RCT結(jié)構(gòu)域,其中,RCT結(jié)構(gòu)域在RAP1與TRF2的相互作用中起關(guān)鍵作用[29]。RAP1通過(guò)與TRF2相互作用結(jié)合到端粒序列上,形成穩(wěn)定的復(fù)合物,但其對(duì)端粒成帽卻是一個(gè)非必須蛋白[30]。即使如此,RAP1和TRF2之間的相互作用對(duì)端粒功能和染色體末端維護(hù)仍然重要[29]。Kabir等[31]發(fā)現(xiàn)在沒(méi)有Ku 70/80的情況下,RAP1-TRF2復(fù)合物可有效抑制染色體末端的同源性修復(fù)。Benarroch等[32]也發(fā)現(xiàn)在端粒保護(hù)機(jī)制受損時(shí),端粒區(qū)RAP1可作為防止非同源末端連接的備用機(jī)制,保護(hù)端粒末端穩(wěn)定。RAP1表達(dá)還與腎細(xì)胞癌相關(guān)[33],RAP1通過(guò)其端粒相關(guān)作用穩(wěn)固端粒結(jié)構(gòu),RAP1表達(dá)改變同樣可導(dǎo)致疾病發(fā)生。

        6 展望

        端粒結(jié)構(gòu)和功能完整對(duì)基因組穩(wěn)定性維持起重要作用,端粒異常與基因組不穩(wěn)定性相關(guān),容易增加疾病風(fēng)險(xiǎn)。大量研究已證實(shí),shelterin復(fù)合物起到維持端粒穩(wěn)定和調(diào)控端粒酶進(jìn)程的重要作用,因shelterin復(fù)合物表達(dá)異?;蚪Y(jié)構(gòu)改變引起端粒功能失調(diào)可推動(dòng)癌癥發(fā)生、發(fā)展。目前,已發(fā)現(xiàn)通過(guò)抑制TRF1來(lái)誘導(dǎo)癌細(xì)胞端粒脫帽,進(jìn)而引起端粒損傷以及細(xì)胞死亡,可將TRF1作為肺癌治療潛在靶點(diǎn),同時(shí),多種腫瘤中均發(fā)現(xiàn)TRF2、TPP1表達(dá)上調(diào),也突出shelterin成員有希望作癌癥早期診斷、干預(yù)和治療的潛在靶點(diǎn)[34],而檢測(cè)POT1的N端及C端突變位點(diǎn)也可在預(yù)防和治療癌癥中起到關(guān)鍵作用。任何shelterin復(fù)合物組分發(fā)生表達(dá)、結(jié)構(gòu)改變,都將影響整個(gè)shelterin復(fù)合物與端粒區(qū)的穩(wěn)定結(jié)合,因此shelterin組分精細(xì)結(jié)構(gòu)及特定功能的全面深入研究,對(duì)清晰解讀端粒生物學(xué)、預(yù)防和治療癌癥等方面將有極大的促進(jìn)作用。

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