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        去泛素化酶USP7在細(xì)胞中的功能作用及其研究進(jìn)展*

        2014-06-14 04:35:44閃,陳松,葉茂*
        激光生物學(xué)報(bào) 2014年1期

        姚 閃,陳 松,葉 茂*

        (1.湖南大學(xué)生物學(xué)院分子科學(xué)與分子醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室,湖南 長沙 410082;2.湖南師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,湖南 長沙 410006)

        泛素-蛋白酶體系統(tǒng)(Ubiquitin-proteasome system,UPS)是細(xì)胞內(nèi)80%以上蛋白質(zhì)降解的主要途徑,蛋白質(zhì)在接受泛素化信號(hào)如磷酸化、損傷等后,在一系列泛素化酶(泛素激活酶E1,泛素結(jié)合酶E2,泛素連接酶E3)的作用下,靶蛋白被泛素鏈標(biāo)記,隨后被運(yùn)輸?shù)降鞍酌阁w降解,泛素被釋放重新利用。細(xì)胞通過這種高度特異性的方式對(duì)不需要的蛋白進(jìn)行降解[1]。近年來研究表明,泛素化是一個(gè)可逆的過程,去泛素化酶能夠水解泛素和蛋白質(zhì)間的硫酯鍵,移除泛素分子,逆轉(zhuǎn)泛素化過程,保護(hù)底物不被蛋白酶體水解或者調(diào)控底物的亞細(xì)胞定位和活化。人類基因組至少編碼98種去泛素化酶,這些去泛素化酶根據(jù)序列和結(jié)構(gòu)的相似性可以被分為六大家族,分別是:泛素特異性蛋白酶家族(Ubiquitin-specific proteaases,USPs),泛素C末端水解酶家族(Ubiquitin carboxy-terminal hydrolases,UCHs),卵巢瘤蛋白酶家族(Ovarian-tumor proteases,OTUs),Machado-Joseph disease protein domain proteases家族(MJDs),JAMM/MPN結(jié)構(gòu)域相關(guān)的金屬肽酶家族(JAMM/MPN domain-associated metallopeptidases,JAMMs)和單細(xì)胞趨化蛋白誘導(dǎo)蛋白家族(Monocyte chemotactic protein-induced protein,MCPIP)[2]。其中泛素特異性蛋白酶(USPs)是迄今最大的去泛素化酶(Deubiquitinases,DUBs)家族,包含成員超過50個(gè)。

        Ubiquitin-specific protease7(USP7)屬于半胱氨酸蛋白酶,是泛素特異性蛋白酶家族的重要成員之一。USP7作為目前研究最為廣泛的一個(gè)泛素特異性蛋白酶,最初是被認(rèn)為是與單純皰疹病毒ICP0蛋白(Herpes simplex viral protein infected cell protein 0)相關(guān)的分子,因此也被稱為Herpes virus-associated ubiquitin-specific protease,HAUSP[3]。近年來研究表明USP7能調(diào)節(jié)細(xì)胞內(nèi)眾多蛋白底物的活性和功能,包括抑瘤蛋白、DNA修復(fù)蛋白、免疫應(yīng)答蛋白、病毒蛋白、表觀遺傳調(diào)節(jié)子等,在疾病的發(fā)生發(fā)展中起著重要的作用[4,5]。

        1 USP7的分子結(jié)構(gòu)

        人USP7基因位于16號(hào)染色體短臂1區(qū)3帶2亞帶,全長4013 bp,包含31個(gè)外顯子。USP7蛋白含1102個(gè)氨基酸殘基,分子量135 kDa,主要定位在細(xì)胞核,細(xì)胞質(zhì)中也有少量的分布。USP7在哺乳動(dòng)物中是一種非常保守的蛋白,人和小鼠以及大鼠的氨基酸序列有98.6%的一致性。USP7蛋白包含四個(gè)結(jié)構(gòu)域:一個(gè)N末端(N terminal domain,NTD),一個(gè)酶催化活性中心(aa208-560)和兩個(gè)C末端蛋白酶抵抗結(jié)構(gòu)域(C terminal domain,CTD),NTD和CTD是USP7與其它蛋白結(jié)合的重要部位[6]。

        USP7蛋白分子結(jié)構(gòu)示意圖,the schematic molecular structrue of USP7

        USP7通過 NTD aa1-208結(jié)合 TSPYL5、p53、HDM2、HDMX 和 EBNA1[7-9],也能通過 CTD aa801-1150結(jié)合p53和HDM2,而ICP0蛋白通過aa620-626與 USP7 的 CTD aa622-801 結(jié)合[12,13]。對(duì)比 EBNA1和p53結(jié)合USP7前后的核磁共振頻率變化,發(fā)現(xiàn)EBNA1與USP7有更大范圍的結(jié)合[7],且EBNA1與USP7的親和力要比 p53與USP7的親和力高出10倍[10],因此,EBNA1 能在體內(nèi)和體外干擾 p53 與USP7 的相互結(jié)合和 p53 的穩(wěn)定性[11,14,15]。

        2007 年,Amaury[16]通過區(qū)段缺失的方法對(duì)USP7的生化特征進(jìn)行了表征,發(fā)現(xiàn)USP7 NTD缺失體(NTD-USP7)和全長USP7(FL-USP7)酶活相差不大,CTD-/NTD-USP7與CTD-USP7酶活相差也不大,但比FL-USP7的酶活卻降低超過一百倍,由此可知NTD對(duì)USP7的酶活性幾乎沒有影響,CTD對(duì)USP7的酶活影響則較大。通過構(gòu)建USP7的不同缺失突變體發(fā)現(xiàn),只有TRAF樣區(qū)域aa70-205能成功定位到細(xì)胞核中[16]。生物信息學(xué)分析表明USP7蛋白分子上并沒有核定位序列,推測USP7的入核可能還需要其他分子的協(xié)助,而協(xié)助其入核的分子目前還不清楚。

        2 USP7的功能

        2.1 細(xì)胞存活

        近來發(fā)現(xiàn)USP7與幾種重要的存活相關(guān)的調(diào)控蛋白相關(guān),分別是 DNMT1、RAE1、Bub3 和 Nup98,它們的穩(wěn)定性和功能都潛在地受到USP7的調(diào)控[17-19]。DNMT1(DNA methyltransferase 1,DNA甲基轉(zhuǎn)移酶1),是人體內(nèi)最早發(fā)現(xiàn)甲基轉(zhuǎn)移酶,在多種腫瘤中高表達(dá)。大量研究表明,其與許多抑癌基因啟動(dòng)子區(qū)域CpG島的過度甲基化直接相關(guān)。在體內(nèi),Dnmt1能與USP7和UHRF1形成一個(gè)三元復(fù)合物,結(jié)合到染色質(zhì)上,調(diào)節(jié)DNA的甲基化[20]。在Dnmt1-USP7-UHRF1三元復(fù)合物中,USP7對(duì)Dnmt1的調(diào)控主要表現(xiàn)在兩個(gè)方面:第一靶向并去泛素化UHRF1,調(diào)控UHRF1的泛素化和穩(wěn)定性,進(jìn)而影響Dnmt1;第二,直接刺激Dnmt1的DNA甲基化活性[20-22]。在體外,USP7也能顯著刺激Dnmt1的DNA甲基化酶活性的維持和全新甲基化的酶活性[23]。

        FOXO是FOX基因(即Forkhead)家族中的一個(gè)亞族,人類有4個(gè)FOXO同源基因,正常情況下抑制細(xì)胞增殖,誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡。HDM2介導(dǎo)FOXO4的單泛素化,而USP7又可以去泛素化并穩(wěn)定HDM2,并進(jìn)一步促進(jìn)FOXO4的單泛素化,導(dǎo)致FOXO4的核輸入,激活其下游信號(hào)通路,抑制細(xì)胞增殖,誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡,從而影響細(xì)胞的存活[24,25]。

        2.2 細(xì)胞周期調(diào)控

        細(xì)胞周期是連續(xù)分裂的細(xì)胞從上一次有絲分裂結(jié)束到下一次有絲分裂完成所經(jīng)歷的整個(gè)過程,包含G1期、S期、G2期、M期四個(gè)階段。UHRF1(泛素樣,帶有PHD和RING指環(huán)結(jié)構(gòu)域1,也被稱為Np95和ECBP90)通過結(jié)合半甲基化的CpG島,并招募DNMT1在DNA復(fù)制過程中確保DNA甲基化的忠實(shí)傳遞[26,27]。它的缺失與細(xì)胞周期G1期和G2/M期的失調(diào)有關(guān)[28]。USP7能通過與UHRF1相互作用并介導(dǎo)其穩(wěn)定,參與對(duì)細(xì)胞周期的調(diào)控[22]。通過質(zhì)譜分析和特異性的抗體檢測發(fā)現(xiàn)在有絲分裂細(xì)胞M期,特異性激酶CDK1-cyclin B能使UHRF1與USP7相互作用的絲氨酸(S)652位點(diǎn)發(fā)生了磷酸化,顯著抑制UHRF1與USP7的相互作用,導(dǎo)致UHRF1的穩(wěn)定性降低,這與UHRF1在細(xì)胞周期M期活性降低密切相關(guān)。基于以上實(shí)驗(yàn)證據(jù),研究人員提出了一個(gè)模型:即在G1和S期,USP7與UHRF1相互作用并穩(wěn)定UHRF1,而一旦進(jìn)入M期,活化的CDK1-cyclin-B磷酸化UHRF1的S652,抑制了其與USP7的結(jié)合能力,導(dǎo)致UHRF1隨后被蛋白酶體降解,從而促進(jìn)細(xì)胞周期的運(yùn)行[22]。

        2.3 染色質(zhì)重組

        核小體是染色體的基本結(jié)構(gòu)單位,由一個(gè)組蛋白八聚體(H2A、H2B、H3、H4)及圍繞在其周圍的一段147 bp的DNA構(gòu)成。組蛋白的翻譯后修飾包括乙酰化、磷酸化、甲基化、泛素化和糖基化等,改變?nèi)旧|(zhì)的動(dòng)態(tài)結(jié)構(gòu),影響基因轉(zhuǎn)錄和基因抑制,而這兩個(gè)過程在癌癥中通常是異常的。目前研究表明,至少有 7 種 DUBs(USP3、USP7、USP16、USP21、USP22、MYSM1和BRCC36)可以結(jié)合并去泛素化組蛋白,主要是H2A和H2B[29-32]。USP7可以直接結(jié)合并去泛素化組蛋白H2A參與細(xì)胞轉(zhuǎn)錄調(diào)控,同時(shí),USP7還可以通過間接調(diào)控H2B的E3連接酶HDM2來進(jìn)一步調(diào)控 H2B[33,34]。研究發(fā)現(xiàn) USP7在體外可以去泛素化單泛素的H2B[35-37]。然而隨后研究表明在人類纖維原細(xì)胞中抑制或過表達(dá)USP7并不能改變H2B和H2A的總體泛素化水平,但在Hela細(xì)胞中抑制USP7表達(dá)后,H2B的泛素化水平則表現(xiàn)出持續(xù)的上升[38]。USP7活性的細(xì)胞類型差異可能源于鳥苷酸合成酶(GMPS)的存在與否,GMPS被認(rèn)為是 USP7的催化輔因子[36-38]。GMPS結(jié)合到 USP7上后能引起USP7構(gòu)型發(fā)生改變,增強(qiáng)USP7的催化活性[36]。與非轉(zhuǎn)化、無增生的細(xì)胞相比,GMPS在致瘤的和轉(zhuǎn)化的細(xì)胞中是過表達(dá)的[38-40]。

        2.4 信號(hào)通路

        2.4.1 p53-HDM2 通路 p53 是一種抑瘤蛋白,在保持細(xì)胞內(nèi)穩(wěn)態(tài)方面發(fā)揮關(guān)鍵作用,在超過50%的腫瘤中均有突變[41]。E3泛素連接酶HDM2是參與p53泛素化修飾,負(fù)調(diào)控p53的最重要的分子之一,通過將多泛素鏈裝配到p53上,使p53能被識(shí)別而通過蛋白酶體途徑降解,而當(dāng)HDM2單泛素化p53時(shí),能誘導(dǎo)p53的核輸出。同時(shí),HDM2也是p53轉(zhuǎn)錄因子的靶分子,其轉(zhuǎn)錄水平受到p53的直接調(diào)控,形成p53-HDM2自反饋環(huán)通路。迄今為止,已經(jīng)發(fā)現(xiàn) USP2、USP4、USP5、USP7、USP10 和 USP29 都能參與對(duì)p53的調(diào)控[42-47]。其中,USP7通過調(diào)控HDM2和p53兩者的穩(wěn)定性,而參與到p53-HDM2通路的動(dòng)態(tài)調(diào)控過程中[48,49]。USP7是第一個(gè)被確認(rèn)的 p53的底物特異性去泛素化蛋白酶,USP7在體內(nèi)和體外都能直接結(jié)合p53并去泛素化p53。過表達(dá)USP7能穩(wěn)定p53,促進(jìn)p53依賴的的凋亡和細(xì)胞生長停滯,抑制細(xì)胞的增殖。然而,令人不可思議的是在敲除USP7的細(xì)胞中并非如預(yù)料的一樣,通過增加p53的泛素化而下調(diào)p53,USP7的缺乏反而通過p53的泛素化導(dǎo)致p53的積累。隨后的研究發(fā)現(xiàn),USP7不僅是p53的去泛素化酶,而且還能結(jié)合和去泛素化p53的負(fù)調(diào)控子HDM2。結(jié)構(gòu)和生化研究揭示p53和HDM2相互排斥地競爭性結(jié)合USP7 N端TRAF樣的結(jié)構(gòu)域中同一位點(diǎn),但是USP7結(jié)合HDM2的親和力明顯高于p53數(shù)倍,這提示在正常細(xì)胞的穩(wěn)態(tài)條件下,HDM2很可能是USP7優(yōu)先結(jié)合的底物,而一旦DNA發(fā)生損傷,ATM介導(dǎo)HDM2發(fā)生磷酸化,降低它與USP7的親和力,從而減弱它的穩(wěn)定性,導(dǎo)致應(yīng)激誘導(dǎo)的HDM2降解,釋放出游離的USP7,因此,在應(yīng)激條件下,p53轉(zhuǎn)變?yōu)閁SP7主要的底物,并被迅速穩(wěn)定。最近的研究發(fā)現(xiàn),USP7不僅能分別結(jié)合p53和Mdm2形成二元復(fù)合物,而且還存在p53-HDM2-USP7的三元復(fù)合物,USP7不僅能直接結(jié)合并去泛素化Mdm2,而且還能以Mdm2作為橋梁,以in trans的方式去泛素化 p53,導(dǎo)致 p53和 Mdm2的穩(wěn)定[50-52]。

        2.4.2 NF-κB 通路 轉(zhuǎn)錄因子 NF-κB(nuclear factor-κB)是一類普遍存在的、控制著各種基因轉(zhuǎn)錄的重要轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子,在靜息狀態(tài)下,NF-κB二聚體與其抑制蛋白 I-κB結(jié)合,NLS被覆蓋,NFκB以無活性的三體形式存在于細(xì)胞質(zhì)中。在外界的刺激下,首先引起NF-κB誘導(dǎo)激酶(NFκB inducing kinase,NIK)的活化,繼而激活I(lǐng)κB 激酶(IκB kinase,IKK),使IκB-α與含72個(gè)氨基酸的泛素蛋白相連,加快IκB-α 的降解速度,迅速降解的 IκB 使結(jié)合體中NFκB的NLS暴露,經(jīng)核孔進(jìn)入細(xì)胞核內(nèi),與特定的DNA序列(κB序列)結(jié)合,發(fā)揮其對(duì)基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控作用[53-56]。研究發(fā)現(xiàn) USP7能結(jié)合在 NF-κB靶基因的啟動(dòng)子上,通過直接去泛素化 NF-κB,逆轉(zhuǎn) NF-κB泛素化及蛋白酶體降解過程,促進(jìn)NF-κB的轉(zhuǎn)錄活性增強(qiáng)[57,58]。USP7 缺失后,NF-κB 泛素 化水平升高,轉(zhuǎn)錄活性降低,靶基因表達(dá)水平下調(diào),因此,USP7對(duì)NF-κB的去泛素化作用在其靶基因的表達(dá)過程中發(fā)揮關(guān)鍵作用[57]。

        3 與USP7有關(guān)的疾病

        3.1 單純性皰疹

        單純性皰疹是由單純皰疹病毒(Herpes simplex virus,HSV)引起的一種傳染病。HSV是一種雙鏈DNA病毒,基因組152 kb,按表達(dá)時(shí)序分為α,β,r 3類,分別表達(dá)立即早期(Immediate-early,IE)基因、早期(Early,E)基因、晚期(Late,L)基因[59]。病毒IE基因編碼的蛋白包括:ICP0,ICP4,ICP22,ICP27和ICP44,它們對(duì)激活后續(xù)E和L基因表達(dá)有重要作用[60]。感染性細(xì)胞多肽 0(Infected cell protein0,ICP0)是一種多功能調(diào)控蛋白,它具有E3泛素連接酶的活性,不僅可調(diào)控病毒基因組的表達(dá),激活病毒后期基因的轉(zhuǎn)錄,還可以與宿主細(xì)胞內(nèi)的多種蛋白相互作用,激活細(xì)胞相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄并且可以調(diào)控裂解性與潛伏性之間的平衡,對(duì)HSV-1的存活至關(guān)重要[31,61]。

        USP7能夠與ICP0結(jié)合,并且USP7主要通過兩種方式影響ICP0:第一,USP7直接與 ICP0結(jié)合[46],ICP0介導(dǎo)USP7的泛素化,促進(jìn)USP7的蛋白酶體降解[46]。同時(shí),USP7又可以去泛素化 ICP0,保護(hù) ICP0不進(jìn)行自身泛素化并降解[62]。這兩個(gè)反應(yīng)的終結(jié)果是,USP7對(duì)ICP0的去泛素化作用占主要,即USP7穩(wěn)定ICP0;第二,ICP0的表達(dá)會(huì)引起USP7從細(xì)胞核輸出到細(xì)胞質(zhì),USP7在細(xì)胞質(zhì)與NF-κB和JNK途徑上的TRAF6和IKKγ結(jié)合并去泛素化,從而終止TLR(Toll like receptor,TLR)介導(dǎo)的免疫反應(yīng)[32,33]。USP7通過這兩種方式促進(jìn)了HSV-1病毒在宿主細(xì)胞中的存活,增大了單純性皰疹的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。

        3.2 鼻咽癌

        Epstein-Bar virus(EBV)是一種γ皰疹病毒,在全球范圍內(nèi),有90%以上的人感染過EBV。EBV的潛伏感染能夠誘導(dǎo)鼻咽癌發(fā)生[63]。Epstein-Barr nuclear antigen 1(EBNA1)是EBV編碼的一種DNA結(jié)合蛋白,在所有與EBV相關(guān)類型的腫瘤細(xì)胞內(nèi)表達(dá),是病毒潛伏期DNA復(fù)制、游離基因維持和永生化初級(jí) B淋巴細(xì)胞必不可少的蛋白[64,65]。USP7具有去泛素化酶活性,能穩(wěn)定抑瘤蛋白p53并調(diào)控其活性[49],但 EBNA1會(huì)和 p53競爭與 USP7結(jié)合的位置,進(jìn)而降低p53的穩(wěn)定性,阻止p53的抑瘤功能,促進(jìn)鼻咽癌的發(fā)生[66]。

        3.3 肺癌

        肺癌根據(jù)生物學(xué)特性,可分為非小細(xì)胞肺癌和小細(xì)胞肺癌兩大類,非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)占所有肺癌病例的80%~85%。非小細(xì)胞肺癌包括:鱗癌,腺癌,大細(xì)胞癌,鱗腺癌等。在NSCLC患者的樣本中,45%的患者USP7表達(dá)水平降低,44.3%的患者p53發(fā)生突變,且在p53突變或USP7表達(dá)降低的患者中,p53的下游靶基因p21和bax的表達(dá)比在p53野生型或USP7陽性表達(dá)的樣本中明顯降低[67,68]。雖然p53基因的表達(dá)情況與USP7的表達(dá)沒有明顯相關(guān)性,但USP7與p53下游靶基因p21和bax的表達(dá)呈現(xiàn)明顯相關(guān)性,提示USP7是通過p53依賴的途徑來參與非小細(xì)胞肺癌的發(fā)生發(fā)展過程,即USP7通過穩(wěn)定p53發(fā)揮腫瘤抑制的功能作用[67]。另外,同時(shí)有野生型p53和陽性USP7表達(dá)的NSCLC患者的生存期明顯長于USP7表達(dá)減少或p53突變的NSCLC患者。USP7表達(dá)減少的腫瘤患者對(duì)化療和放療耐受,推測USP7基因的下調(diào)可能在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展中起到重要作用[69-71]。

        3.4 宮頸癌

        宮頸癌是女性常見惡性腫瘤之一,原位癌高發(fā)年齡為30~35歲,浸潤癌為45~55歲,近年來其發(fā)病有年輕化的趨勢(shì),發(fā)病原因目前尚不清楚。Rolen等人2006年通過化學(xué)功能蛋白質(zhì)組學(xué),研究攜帶人乳頭瘤病毒的宮頸癌組織和癌旁組織,發(fā)現(xiàn)在宮頸癌細(xì)胞中USP7表達(dá)頻率較低(19%),而在宮頸癌衍生細(xì)胞系和E6/E7永生化的角質(zhì)細(xì)胞中表達(dá)頻率較高(88%),推斷USP7可能在宮頸癌惡性轉(zhuǎn)化過程中發(fā)揮一定的作用[72]。

        4 USP7作為抗腫瘤的分子靶標(biāo)

        USP7作為一種重要的去泛素化酶,通過去泛素化多種重要的腫瘤調(diào)節(jié)分子,在腫瘤發(fā)生和演進(jìn)過程中發(fā)揮重要作用,因此以其作為抗腫瘤的分子靶標(biāo)近年來成為研究的熱點(diǎn)。通過小分子化合物庫高通量篩選,已明確多個(gè)USP7的特異性小分子抑制劑。小分子化合物HBX 19818能共價(jià)結(jié)合USP7催化活性位點(diǎn)的Cys223,引發(fā)USP7構(gòu)象改變,顯著抑制USP7的去泛素化酶活性[73]。在體內(nèi),HBX 19818引起MDM2蛋白表達(dá)水平下降,p53表達(dá)水平上升,導(dǎo)致細(xì)胞周期G1期阻滯。HBX19818能抑制多種腫瘤細(xì)胞系的生長,包括結(jié)腸癌細(xì)胞HCT116、前列腺癌細(xì)胞DU145、宮頸癌細(xì)胞HeLa等。小分子化合物P5091為三取代噻吩類衍生物,能高度特異性抑制USP7酶的活性,而對(duì)去泛素化酶家族其它成員沒有影響[74]。P5091能抑制多發(fā)性骨髓瘤細(xì)胞的生長并誘導(dǎo)其發(fā)生凋亡。由于P5091誘導(dǎo)多發(fā)性骨髓瘤細(xì)胞發(fā)生凋亡并不依賴于p53,因此,具有非常重要的臨床價(jià)值,有助于p53突變或缺失的多發(fā)性骨髓瘤患者的治療[75]。同時(shí),P5091也能抑制對(duì)萬珂、Dexamethasone,Doxorubicin或 Melphalan耐藥的多發(fā)性骨髓瘤細(xì)胞的生長。

        5 總結(jié)和展望

        USP7能調(diào)節(jié)細(xì)胞內(nèi)眾多蛋白底物的活性和功能,包括抑瘤蛋白、瘤蛋白、DNA修復(fù)蛋白、免疫應(yīng)答蛋白、病毒蛋白、表觀遺傳調(diào)節(jié)子等,在疾病的發(fā)生和演進(jìn)過程中起著非常重要的作用,特別是腫瘤和病毒性疾病,因此,以USP7作為分子靶標(biāo)的疾病治療策略將會(huì)有更加廣闊的開發(fā)價(jià)值和臨床應(yīng)用前景。

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