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        巴美肉羊、小尾寒羊Myf6基因多態(tài)性及其與肉質(zhì)的相關(guān)性研究

        2014-05-10 06:03:54郭月英任霆張靜李婧袁倩程海星王樂靳燁
        食品工業(yè)科技 2014年5期
        關(guān)鍵詞:AB型小尾寒羊肉質(zhì)

        郭月英,任霆,張靜,李婧,袁倩,程海星,王樂,靳燁*

        (1.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學食品科學與工程學院,內(nèi)蒙古呼和浩特 010018;2. 包頭市東河區(qū)食品藥品監(jiān)督管理局,內(nèi)蒙古包頭市 014000)

        巴美肉羊是內(nèi)蒙古巴彥淖爾市廣大畜牧科技人員和農(nóng)牧民經(jīng)過40多年的不懈努力和精心培育而成的肉羊新品種。該品種2007年通過國家畜禽資源委員會審定驗收,正式命名為巴美肉羊,是國內(nèi)第一個具有自主知識產(chǎn)權(quán)的肉羊雜交育成品種[1-3]。巴美肉羊生長發(fā)育速度較快,產(chǎn)肉性能高。適合舍飼圈養(yǎng)、耐粗飼、采食能力強,適合農(nóng)牧區(qū)舍飼半舍飼飼養(yǎng)。繁殖率較高,性成熟早。搞逆性強、羔羊育肥快,是生產(chǎn)高檔羊肉產(chǎn)品的優(yōu)質(zhì)羔羊[1,2]。近年來,巴美肉羊以其生長及屠宰性能好,肉質(zhì)鮮嫩、無膻味等優(yōu)點深受養(yǎng)殖企業(yè)、加工企業(yè)和消費者的喜愛。

        小尾寒羊是我國寶貴的地方優(yōu)良品種,屬于蒙古羊的一個亞系,是世界著名的綿羊多胎品種之一,肉毛兼用。小尾寒羊生長發(fā)育快、早熟、繁殖率高,肉用性能好[4-7]。在1986年出版的《中國綿、山羊品種志》中,小尾寒羊被列為地方優(yōu)良品種。1987年小尾寒羊被納入國家良種基因庫[5]。

        生肌決定基因(myogenic determination gene, MyoD)也稱肌肉調(diào)節(jié)因子(myogenic regulatory factor ,MRFs),該基因編碼特異的骨骼肌轉(zhuǎn)錄因子[8-9]。目前在哺乳動物中發(fā)現(xiàn)的生肌調(diào)節(jié)因子有 4種: MyoD、MYOG、Myf5和Myf6,這四個基因共同稱為MyoD基因家族,是影響肉品質(zhì)和產(chǎn)量性狀的關(guān)鍵基因,已經(jīng)被認定為影響肉質(zhì)性狀的候選基因[9-13]。本試驗對 MyoD基因家族的成員之一Myf6 基因多態(tài)性與巴美肉羊、小尾寒羊肉質(zhì)性狀的進行相關(guān)性研究,為Myf6基因?qū)Π兔廊庋?、小尾寒羊肉質(zhì)的影響提供有效理論依據(jù)。

        1.材料與方法

        1.1 試驗材料與儀器

        試驗用102只巴美肉羊、56只小尾寒羊選至內(nèi)蒙古巴彥淖爾市五原縣巴美肉羊養(yǎng)殖示范基地,試驗個體在相同飼養(yǎng)管理條件下飼養(yǎng)。用5mL EDTA真空采血管頸靜脈采血,干冰帶回,-70℃保存,用于提取全血基因組DNA。

        TC-P2A 全自動測色色差計 上海生物生化試驗儀器公司;多孔恒溫水浴鍋 余姚遠東數(shù)控儀器廠;CL-M 嫩度儀 上海精密科學儀器有限公司;PCR儀 Biometra;凝膠成像系統(tǒng) Bio-rad, USA ;Eppendorf 5417R低溫臺式冷凍離心機 德國Eppendorf生物公司;BG-power 3500型穩(wěn)壓穩(wěn)流電泳儀北京百晶生物技術(shù)有限公司;水平電泳槽 北京百晶生物技術(shù)有限公司;核酸蛋白分析儀 Bio-rad,USA。

        Takara Premix Taq ?Version 2.0(Loading dye mix )。

        1.2 試驗方法

        1.2.1 DNA提取

        全血基因組DNA使用天根血液/細胞/組織基因組DNA提取試劑盒(離心柱型)進行提取。用0.8%瓊脂糖凝膠電泳檢測和紫外分光光度計測定濃度,DNA 樣品稀釋至約100 ng/ μL 分裝后于 - 20℃冷凍保存。

        1.2.2 肉質(zhì)指標測定

        試驗用羊在內(nèi)蒙古漁蒙家食品有限公司進行肉質(zhì)性狀指標測定。

        肉質(zhì)指標測定包括pH、肉色(色差 )、嫩度(剪切力)、眼肌面積。羊胴體沿脊柱左右劈半,左半胴體宰后45 min測pH ,記做pH1,然后在4℃冷庫中懸掛排酸,24 h再次測pH ,記做pH2。取右半胴體的背最長肌、股二頭肌、臂三頭肌,按參考文獻方法[14-15],測定肉色、嫩度。

        1.2.3 引物合成和PCR 條件

        Myf6基因的引物參照NCBI公布的序列,上游引物:5’- GTGTTTCGGATCATTCCAGG-3’,下游引物:5’ - GAGGAAATGCTGTCCACGAT -3’,由北京三博遠志生物技術(shù)有限責任公司合成。

        PCR 擴增反應總體積為25μL, 其中Taqmix12.5μL,上游引物0.5μL,下游引物0.5μL,滅菌雙蒸水 10.5μL,50 ng/ μLDNA 模板 1μL。

        反應條件為:94℃預變性3min,94 ℃變性30s,58℃退火30s,72 ℃延伸30s; 35 個循環(huán), 最后72 ℃ 延伸10min,4℃保存。PCR 產(chǎn)物用1% 瓊脂糖凝膠電泳檢測。

        1.2.4 單鏈構(gòu)象多態(tài)性(SSCP)分析

        取 2μL PCR 產(chǎn)物,加入 5μL變性緩沖液(98%去離子甲酰胺、10mmol/L EDTA(pH8.0)、0.025g/100mL 溴酚藍、0.025g/100mL 二甲苯氰)于PCR管中,混勻,在PCR儀中98℃變性10min。迅速取出PCR管,立即插入冰中,放置10min。120V,12% 非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳5h,銀染顯色。凝膠成像系統(tǒng)( Bio-rad, USA )拍照分析, 判讀基因型。

        1.2.5 統(tǒng)計分析

        利用SPSS 11.5軟件統(tǒng)計各種基因型的分布情況,分析巴美肉羊、小尾寒羊Myf6基因不同基因型與肉質(zhì)性狀的相關(guān)性。

        2.結(jié)果與分析

        2.1 Myf6 基因PCR結(jié)果

        PCR擴增巴美肉羊Myf6基因, 所得PCR 產(chǎn)物用1% 瓊脂糖凝膠電泳檢測,電泳結(jié)果如圖1所示。

        圖1 Myf6 PCR擴增結(jié)果Fig.1 PCR products of Myf6 gene

        由圖1可以看出,擴增得到的片段與目的片段大小一致,為300bp左右,擴增條帶清晰,特異性良好, 可以進行SSCP分析。

        2.2 PCR-SSCP 檢測結(jié)果

        Myf6基因PCR-SSCP 電泳結(jié)果如圖2所示。

        圖2 Myf6基因的SSCP電泳圖Fig.2 PCR-SSCP of the Myf6 gene

        對102 只巴美肉羊、56只小尾寒羊Myf6的擴增產(chǎn)物進行PCR-SSCP檢測,結(jié)果如圖2 ,從圖2可以看出,在兩個品種的 Myf6基因擴增片段存在多態(tài)性。發(fā)現(xiàn)有2種不同基因型,根據(jù)條帶差異,分別命名為AA和AB型。

        2.3 等位基因頻率和基因型頻率的統(tǒng)計

        巴美肉羊、小尾寒羊Myf6基因的基因型及頻率及等位基因頻率、多態(tài)信息含量如表1、2所示。

        表1 Myf6基因在巴美肉羊中的基因型頻率、等位基因頻率和多態(tài)信息含量Table 1 Genotype and allelic frequencies and PIC of Myf6 in Bamei sheep

        表2 Myf6基因在小尾寒羊中的基因型頻率、等位基因頻率和多態(tài)信息含量Table 2 Genotype and allelic frequencies and PIC of Myf6 in Small fat- tail sheep

        從表1 和表2可以看出,在巴美肉羊、小尾寒羊群體中發(fā)現(xiàn)了AA和AB 兩種基因型,均沒有發(fā)現(xiàn)BB純合子基因型。在巴美肉羊群體中,AA 基因型個體占多數(shù),在小尾寒羊群體中,AB基因型型個體占多數(shù),呈偏態(tài)分布。在兩個品種群體中,A等位基因的分布頻率遠高于B,故A等位基因為絕對優(yōu)勢基因。B 等位基因均以雜合子的形式和較小的頻率存在于群體中。多態(tài)信息含量是指在連鎖分析中一個遺傳標記多態(tài)性可提供的信息量的度量。巴美肉羊、小尾寒羊的多態(tài)信息含量分別為0.26和0.34,均屬于中度多態(tài)(PIC > 0. 5為高度多態(tài), 0. 25 < PIC < 0. 5為中度多態(tài), PIC < 0. 25為低度多態(tài))[16]。

        2.4. Myf6不同基因型與巴美肉羊肉質(zhì)相關(guān)性的分析

        巴美肉羊Myf6的基因型與肉質(zhì)指標的相關(guān)性如表3所示。

        表3 Myf6不同基因型對巴美肉羊肉質(zhì)的影響Table 3 Effects of genotypes on meat quality traits in Bamei sheep

        由表3可以看出,巴美肉羊AA型與AB間各項肉質(zhì)指標均無顯著性差異,但AA型在背最長肌、股二頭肌處有嫩度優(yōu)于AB型的趨勢,而在股二頭肌處,兩者的嫩度基本沒有差別。AA型的臂三頭肌的紅度值、亮度值均優(yōu)于AB型, AA型的眼肌面積大于AB型。

        表4 Myf6不同基因型與小尾寒羊肉質(zhì)的影響Table 4 Effects of genotypes on meat quality traits in Small fat- tail sheep

        由表4可知,在背最長肌處,小尾寒羊 Myf6基因的AA型與AB型的的紅度值有顯著性差異(p<0.05),AA基因型顯著優(yōu)于AB型。其余肉質(zhì)指標無顯著差異,但AA型的背最長肌和臂三頭肌的嫩度有優(yōu)于AB型的趨勢,在紅度值方面,股二頭肌的AA型的紅度值優(yōu)于AB型,但在臂三頭肌處,AB型的紅度值較好。在黃度值方面,AA型的背最長肌處和股二頭肌處的黃度值均次于AB型,但在臂三頭肌處,AA型略優(yōu)于AB型。在小尾寒羊的三個測定肉質(zhì)部位,AA型的亮度值均略好于AB型。兩個基因型在pH1和pH2兩個指標方面基本相同。AA的眼肌面積有大于AB型的趨勢。

        由表3 、表4可知, 盡管肉質(zhì)指標無顯著差異, 但從Myf-6 基因的不同基因型個體表現(xiàn)來看,A A總體優(yōu)于AB型,且在試驗群體中Myf-6 基因的A等位基因可以改善羊的眼肌面積。

        3.結(jié)論與討論

        從實驗結(jié)果可以看出, Myf6 基因?qū)僦卸榷鄳B(tài)性。在檢測的兩個群體中均沒有發(fā)現(xiàn)BB 純合子,B 等位基因以雜合子的形式存在,且頻率較小。Myf6基因?qū)θ赓|(zhì)性狀的影響作用總體不顯著, 但在小尾寒羊的背最長肌處, Myf6基因的AA型與AB型的的紅度值有顯著性差異(p<0.05),AA基因型肉色顯著優(yōu)于AB型。盡管Myf6 基因的不同基因型對肉質(zhì)指標的影響無顯著差異, 但從Myf6 基因的不同基因型個體表現(xiàn)來看,AA基因型的眼肌面積大于AB基因型。A等位基因可以改善羊的胴體品質(zhì)。另外,在兩個群體的三個肉質(zhì)檢測部位,有AA型優(yōu)于AB型的趨勢。

        2008年孫文浩等在對雞的Myf6 基因遺傳多態(tài)性的研究中發(fā)現(xiàn)了3種基因型,AA、AB 和BB型,并推斷Myf6基因的多態(tài)性位點與雞的肌纖維密度和直徑以及部分胴體性狀有一定的相關(guān)性[17]。2005年朱礪等對12個品種豬的Myf6 基因研究中發(fā)現(xiàn)了AA和AB 兩種基因型,并發(fā)現(xiàn)B等位基因有增加實驗群體胴體瘦肉率和眼肌面積, 降低皮脂含量的作用。在該項研究的各個群體中,均未檢測到BB基因型[18]。2006年Kapelanski等在豬的研究中發(fā)現(xiàn),Myf6 基因在啟動子區(qū)和第一外顯子處的變異均顯著影響滴水損失[19]。

        本實驗目前未檢測到BB基因型,因此Myf6 基因是否存在BB基因型及其對羊肉質(zhì)的影響作用還有待進一步擴大試驗樣本后深入研究。

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