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        Pax-8基因敲除小鼠心肌細(xì)胞中差異表達(dá)的基因的研究

        2014-04-13 03:34:49高瞻施翔翔黃曉燕楊德業(yè)
        浙江醫(yī)學(xué) 2014年21期
        關(guān)鍵詞:基因芯片心肌細(xì)胞定量

        高瞻 施翔翔 黃曉燕 楊德業(yè)

        ●論 著

        Pax-8基因敲除小鼠心肌細(xì)胞中差異表達(dá)的基因的研究

        高瞻 施翔翔 黃曉燕 楊德業(yè)

        目的 研究Pax-8基因敲除小鼠心肌細(xì)胞中差異表達(dá)的基因。方法 利用基因芯片技術(shù)初篩在Pax-8基因敲除純合子小鼠(Pax-8-/-)和雜合子小鼠(Pax-8+/-)心肌組織中差異表達(dá)的基因,運(yùn)用半定量RT-PCR檢驗(yàn)初篩結(jié)果,并運(yùn)用熒光實(shí)時定量PCR確定初篩所得的差異表達(dá)的基因在Pax-8基因敲除純合子、雜合子以及野生型小鼠(Pax-8+/+)心肌組織中的表達(dá)情況。結(jié)果 基因Bcl2l14、Fgf-6、Lck、Nr4a1以及Tcf7在Pax-8-/-中的表達(dá)分別是其在Pax-8+/-中表達(dá)的2.07±0.08、1.13±0.01、1.30± 0.01、1.53±0.08及0.75±0.03倍(均P<0.01)。是在Pax-8+/+中表達(dá)的2.23±0.16、1.67±0.05、1.77±0.21、4.8±0.35及0.9± 0.04倍(P<0.01或0.05)。結(jié)論 Bcl2l14、Fgf-6、Lck、Nr4a1以及Tcf7上述5個基因在Pax-8基因敲除的心肌細(xì)胞中差異表達(dá),參與Pax-8基因敲除小鼠的一系列心臟病理生理變化。

        Pax-8 基因 小鼠 心肌細(xì)胞

        室間隔缺損(VSD)作為常見的先天性心臟病,至今病因及發(fā)病機(jī)制仍未明確,但通常認(rèn)為與胚胎時期原始心管發(fā)育異常有關(guān)。Pax-8基因特異性的表達(dá)于小鼠胚胎心臟與甲狀腺之中,參與了心臟的正常發(fā)育[1-2],并與胚胎心肌細(xì)胞的生長和凋亡有關(guān)[3],Pax-8-/-小鼠心臟解剖可見心臟呈球形,左心室壁肥厚,室間隔增厚,左心室乳頭肌肥大。免疫組化證實(shí)Pax-8-/-小鼠心臟左心室壁和室間隔心肌組織細(xì)胞凋亡增高,線粒體體積縮小、數(shù)量增多。在細(xì)胞實(shí)驗(yàn)中證實(shí)抑制Pax-8基因表達(dá)后顯著增加細(xì)胞凋亡,減弱細(xì)胞增值活性[4]。本文旨在探討Pax-8基因下調(diào)后引起心肌細(xì)胞凋亡增加的機(jī)制,并運(yùn)用基因芯片和PCR技術(shù)尋找Pax-8基因敲除后心肌細(xì)胞中差異表達(dá)的基因。

        1 材料和方法

        1.1 實(shí)驗(yàn)動物 Pax-8基因敲除小鼠由德國馬克斯·普朗克生物物理化學(xué)研究所惠贈。實(shí)驗(yàn)組為Pax-8基因敲除小鼠純合子(Pax-8-/-),對照組為Pax-8基因敲除小鼠雜合子(Pax-8+/-)和野生型(Pax-8+/+)。2只Pax-8+/-小鼠交配可獲得Pax-8-/-和Pax-8+/-以及Pax-8+/+小鼠。

        1.2 方法

        1.2.1 Pax-8-/-小鼠的基因型鑒定 新生小鼠剪取尾巴末端提取DNA經(jīng)PCR法鑒定基因型。引物為5'-GGATGTGGAATGTGTGCGAGG-3',5'-GCTAAGA-GAAGGTGGATGAGAG-3',和5'-GATGCTGCCAGTCTCGTAG-3'。PCR條件:94℃、5min,94℃、15s,60℃、15s,72℃、30s,94℃、15s,57℃、15s,72℃、30s,25個循環(huán),72℃、5min。

        1.2.2 芯片雜交 取Pax-8-/-組與Pax-8+/-組出生第1天(P0)小鼠各3只,TRIzol法常規(guī)提取心臟組織的總RNA,經(jīng)紫外吸收測定和變性瓊脂糖凝膠電泳鑒定RNA質(zhì)量,參照上海生物芯片有限公司試劑盒說明書反轉(zhuǎn)錄標(biāo)記cDNA探針并純化。Cy3-dUTP標(biāo)記Pax-8-/-cDNA,Cy5-dUTP標(biāo)記Pax-8+/-cDNA,將含31 802個小鼠基因的表達(dá)譜芯片(Mouse OneArrayTM,購自臺灣華聯(lián)生物科技)和探針雜交。結(jié)果采用Axon公司的Gene Pix4100掃描,Gene PixPro4.0軟件分析Cy3和Cy5兩種熒光信號的強(qiáng)度和比值。用看家基因進(jìn)行Cy3和Cy5均衡。Cy3和Cy5信號比值>2.0為表達(dá)上調(diào),<0.5為表達(dá)下調(diào),0.5~2.0為不存在顯著表達(dá)差異。

        1.2.3 半定量逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)法驗(yàn)證基因芯片篩查結(jié)果 取Pax-8-/-組與Pax-8+/-組P0小鼠各3只,TRIzol法常規(guī)提取心臟組織總RNA做逆轉(zhuǎn)錄,根據(jù)基因篩選結(jié)果,用RT-PCR引物進(jìn)行半定量PCR檢測。采用GAPDH基因作為內(nèi)部參照。基因、引物、反應(yīng)條件見表1。PCR產(chǎn)物每組取6μl用含Gold View的1.5%瓊脂糖凝膠電泳,用凝膠成像分析系統(tǒng)攝像分析。

        表1 半定量RT-PCR引物和反應(yīng)條件

        1.2.4 熒光實(shí)時定量RT-PCR 取Pax-8-/-組、Pax-8+/-組和Pax-8+/+組P0小鼠各3只,TRIzol法常規(guī)提取心臟組織總RNA做逆轉(zhuǎn)錄,根據(jù)基因芯片篩選和半定量RTPCR所得的上調(diào)和下調(diào)的候選基因設(shè)計引物,通過實(shí)時定量RT-PCR進(jìn)行熒光定量PCR檢測。采用Beta-actin作為內(nèi)部參照。基因、引物、反應(yīng)條件見表2。用ABI 7500 FAST型熒光定量PCR儀檢測,試驗(yàn)重復(fù)3次。通過比較ΔCt的方法進(jìn)行基因表達(dá)的定量分析,Ct為每個反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號到達(dá)設(shè)定的閾值時所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù),ΔCt為目的基因值與內(nèi)參Beta-actin Ct值之差。目的基因的相對表達(dá)量用2-ΔCt表示。ΔΔCt為兩目的基因ΔCt值之差。兩目的基因的相對表達(dá)量用2-ΔΔCt表示。

        表2 定量RT-PCR引物和反應(yīng)條件

        1.3 統(tǒng)計學(xué)處理 采用SPSS11.5.0統(tǒng)計軟件,經(jīng)過方差齊性檢驗(yàn),計量資料以表示,兩組比較采用t檢驗(yàn)。

        2 結(jié)果

        2.1 Pax-8基因敲除小鼠模型PCR鑒定結(jié)果 Pax-8-/-表現(xiàn)為約370bp的單一條帶,Pax-8+/+表現(xiàn)為約390bp的單一條帶,Pax-8+/-表現(xiàn)為390bp和370bp雙條帶(圖1)。

        圖1 PCR鑒定Pax-8基因敲除小鼠的基因型

        2.2 Pax-8基因敲除小鼠中差異表達(dá)的基因 見表3。

        由表3可見,通過基因芯片對31 802個已知基因進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)與Pax-8+/-組相比,在Pax-8-/-組中25個基因表達(dá)下調(diào),另外17個基因表達(dá)上調(diào),其中涉及細(xì)胞周期,直接參與代謝的酶,細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)及核轉(zhuǎn)錄因子等基因。

        2.3 半定量RT-PCR法驗(yàn)證基因芯片篩查結(jié)果 經(jīng)過對上述42個基因逐個進(jìn)行半定量RT-PCR驗(yàn)證,相當(dāng)部分基因RT-PCR結(jié)果未顯示差異性,最終初步篩選出5個差異表達(dá)的基因,見表4。

        由表4可見,差異表達(dá)的5個基因,Pax-8-/-總RNA在進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增時,F(xiàn)gf-6、NR4A1以及Lck的擴(kuò)增產(chǎn)物較Pax-8+/-提前4個循環(huán)被發(fā)現(xiàn),Tcf7的擴(kuò)增產(chǎn)物落后4個循環(huán)出現(xiàn),而BCL2l14基因只能在Pax-8-/-總RNA中獲得擴(kuò)增。

        2.4 熒光定量RT-PCR結(jié)果 見表5。

        由表5可見,Bcl2l14、Fgf-6、Lck、Nr4a1以及Tcf7在Pax-8-/-中的表達(dá)分別是其在Pax-8+/-中表達(dá)的2.07± 0.08、1.13±0.01、1.30±0.01、1.53±0.08及0.75±0.03倍(均P<0.01)。是在Pax-8+/+中表達(dá)的2.23±0.16、1.67±0.05、1.77±0.21、4.8±0.35及0.9±0.04倍(P<0.01或0.05)。

        3 討論

        即使在胚胎心臟發(fā)育過程中,細(xì)胞凋亡也在不停的發(fā)生,胚胎心臟各部位,如房室心內(nèi)膜墊、間隔、肌小梁和乳頭肌等,均具有立體的復(fù)雜的三維解剖結(jié)構(gòu)。他們的形成需要細(xì)胞增殖和細(xì)胞凋亡平衡進(jìn)行[5]。室間隔的形成同樣如此[6],若細(xì)胞凋亡與增殖失去平衡,凋亡增加而增殖減少,就可能導(dǎo)致VSD形成。

        通過以上研究我們可以發(fā)現(xiàn),Pax-8基因敲除后,可以導(dǎo)致Bcl2l14、Fgf-6、Lck、Nr4a1以及Tcf7等5個基因表達(dá)量發(fā)生改變,它們均是細(xì)胞凋亡、增殖相關(guān)的基因并且相互之間存在復(fù)雜的關(guān)系:Bcl2l14是Bcl-2基因家族成員,Bcl-2家族含有4個同源結(jié)構(gòu)域,而Bcl2l14編碼的蛋白含有其中的BH3及BH2 2個同源結(jié)構(gòu)域,當(dāng)Bcl2l14被激活,脫落BH2結(jié)構(gòu)域而只剩下BH3時,可以顯著增加細(xì)胞的凋亡。Lck在Th2細(xì)胞分化中有重要作用,參與CD8+細(xì)胞介導(dǎo)的細(xì)胞毒反應(yīng)并且可以調(diào)節(jié)體內(nèi)磷酸化過程。Bcl-2受NR4A1調(diào)節(jié),NR4A1在磷酸化后可與Bcl-2蛋白結(jié)合使其中的BH3暴露,從而激活Bcl-2蛋白。Fgf-6有高度的組織特異性,絕大部分表達(dá)肌源性細(xì)胞。他能夠誘導(dǎo)靜息的肌肉干細(xì)胞——肌衛(wèi)星細(xì)胞的活化、增殖、遷移,促進(jìn)肌母細(xì)胞增殖[7]。Fgf-6的受體Fgfr4本身也是同為Pax家族的Pax-3的下游基因,同時Pax-3還是MyoD的上游基因,而MyoD的表達(dá)是靜息的衛(wèi)星細(xì)胞活化的標(biāo)志。Pax-7因與Pax-3有相似的DNA結(jié)合特性與活性,也發(fā)揮了同樣的作用,顯示了Pax家族與Fgf家族之間的復(fù)雜關(guān)系。

        表3 Pax-8+/-與Pax-8-/-心肌細(xì)胞中差異表達(dá)的基因

        表4 P0 Pax-8-/-和Pax-8+/-小鼠心臟中5個差異表達(dá)的基因不同PCR擴(kuò)增周期的產(chǎn)量比較

        表5 5個差異表達(dá)的基因的定量RT-PCR結(jié)果

        我們可以大膽假設(shè):在Pax-8基因敲除小鼠心臟中,可能存在由Lck磷酸化NR4A1起始的,由NR4A1激活Bcl2l14使得細(xì)胞凋亡增加,乃至導(dǎo)致VSD形成。而Fgf-6的表達(dá)上調(diào),可能是機(jī)體對過度凋亡的心肌細(xì)胞的一種代償機(jī)制,也可能是Fgf-6本身即作為Pax-8基因的下游基因受其調(diào)控。但是基因及其表達(dá)的蛋白相互之間復(fù)雜的相互的直接或間接的影響,這種假設(shè)還缺乏直接依據(jù),還需要進(jìn)一步的試驗(yàn)驗(yàn)證。

        [1]楊德業(yè),張懷勤,黃嘵燕,等.室間隔缺損相關(guān)基因-BMPR下游基因的探討[J].溫州醫(yī)學(xué)院學(xué)報,2003,33(2):76-78.

        [2]楊德業(yè),宋后燕,張懷勤,等.心肌組織Pax8基因的研究[J].中華兒科雜志,2003,41(10):770-772

        [3] 章佳穎,來丹丹,褚茂平,等.Pax-8基因在胚胎心臟發(fā)育中的作用[J].中國病理生理雜志,2009,25(7):1292-1297.

        [4] 高瞻,來丹丹,張敏,等.Pax-8基因在大鼠心肌細(xì)胞凋亡中的作用[J].解放軍醫(yī)學(xué)雜志,2009,34(9):1082-1084.

        [5]Watanabe M,Choudhry A,Berlan M,et al.Developmental remodeling and shortening of the cardiac outflow tract involves myocyte programmed cell death[J].Development,1998,125(19): 3809-3820.

        [6]Abdelwahid E,Pelliniemi L J,Niinikoski H,et al.Apoptosis in the pattern formation of the ventricular wall during mouse heart organogenesis[J].TheAnatomicalRecord,1999,256(2):208-217.

        [7]黃曉燕,高瞻,來丹丹,等.Pax-8基因敲除小鼠心臟中Fgf-6基因表達(dá)的上調(diào)及其意義[J].浙江醫(yī)學(xué),2010,31(11):1591-1593.

        (致謝:此課題的完成得到德國Peter Gruss及Ahmed Mansouri教授的支持和幫助,尤其是惠贈實(shí)驗(yàn)動物,特此表示感謝?。?/p>

        Differentially expressed genes in myocardium of Pax-8 gene knockout mice

        Objective To investigate differentially expressed genes in myocardium of Pax-8 gene knockout mice.Methods Candidate Pax-8 downstream genes were screening by mouse genome DNA microarray with Pax-8-/-and Pax-8+/-cDNA,then tested by semi-quantitative RT PCR.Real time RT-PCR was performed to confirm the differentially expressed downstream genes.Results The expression of genes Bcl2l14,Fgf-6,Lck,Nr4a1 and Tcf7 in Pax-8-/-mice was 2.07±0.08,1.13± 0.01,1.3±0.01,1.53±0.08,0.75±0.03 times as expressed in Pax-8+/-mice(P<0.01),and 2.23±0.16,1.67±0.05,1.77±0.21, 4.8±0.35(P<0.01),0.9±0.04(P<0.05)times as expressed in Pax-8+/+mice,respectively.Conclusion Genes Bcl2l14,Fgf-6, Lck,Nr4a1 and Tcf7 were differentially expressed in myocardium of Pax-8 gene knockout mice,which might be involved in a series of pathophysiologic changes in the gene knockout myocardium.

        Pax-8 Gene Mouse Myocardium

        2014-01-06)

        (本文編輯:馬雯娜)

        國家自然科學(xué)基金資助項目(30571050);溫州市科技發(fā)展計劃資助項目(Y2006A017)

        325000 溫州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院心血管內(nèi)科(高瞻、施翔翔、黃曉燕);杭州師范大學(xué)附屬醫(yī)院心內(nèi)科(楊德業(yè))

        楊德業(yè),E-mail:deyeyang@126.com

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