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        肝癌病人癌組織與血漿p16及APC基因甲基化檢測及意義

        2013-12-25 00:45:02,,,
        精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)雜志 2013年3期
        關(guān)鍵詞:甲基化血漿標(biāo)本

        ,,,

        (青島大學(xué)醫(yī)學(xué)院營養(yǎng)研究所,山東 青島 266021)

        原發(fā)性肝癌是世界上最常見的惡性腫瘤之一,而在臨床上80%~90%的肝癌病例為肝細(xì)胞性肝癌(HCC)。HCC的發(fā)生是一個多因素、多階段的復(fù)雜過程,其發(fā)病的分子機(jī)制尚不清楚。研究表明,HCC的發(fā)生不僅與基因突變有關(guān),抑癌基因啟動子區(qū)CpG序列異常甲基化導(dǎo)致的基因失活也是肝癌發(fā)生的一個重要途徑[1-3]。多腫瘤抑制因子p16和結(jié)腸腺瘤樣息肉基因(APC)是兩個重要的腫瘤抑制基因,其中p16基因是細(xì)胞周期的負(fù)調(diào)控因子[1],APC基因可控制細(xì)胞分裂過程中起關(guān)鍵作用的基因的表達(dá)[4]。已有研究結(jié)果顯示,肝癌、胃癌等多種腫瘤組織及血漿標(biāo)本中p16、APC基因的啟動子區(qū)域CpG島常發(fā)生異常甲基化[2,5-6],但不同研究者報道的p16、APC基因甲基化在肝癌組織及血漿標(biāo)本的檢出率有一定差異,特別是基因甲基化在癌組織與對應(yīng)血漿標(biāo)本表達(dá)的情況存在較大差異。本研究采用實時熒光PCR技術(shù)測定86例病人HCC組織及相應(yīng)癌旁正常組織、血漿中p16、APC基因啟動子區(qū)CpG島甲基化情況,分析p16、APC基因甲基化在癌組織與血漿標(biāo)本檢出情況及其與HCC病人臨床特征關(guān)系,并探討其臨床意義。

        1 材料與方法

        1.1 材料來源

        選取2008年6月—2009年6月于青島大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院行外科切除術(shù)的HCC病人標(biāo)本86例,男69例,女17例;以24例正常人及良性肝病病人正常肝組織作為對照。全部病例均經(jīng)組織病理學(xué)檢查證實,根據(jù)國際抗癌聯(lián)盟(UICC)分期標(biāo)準(zhǔn)對HCC進(jìn)行分期。

        1.2 標(biāo)本的獲取

        術(shù)前采集受檢者外周靜脈血5 mL,2 h內(nèi)離心分別取血漿和血細(xì)胞置于1.5 mL塑料離心管中;病人手術(shù)時收集HCC組織及相應(yīng)的癌旁正常組織(取自距癌灶邊緣3~5 cm外觀正常的組織,均避開壞死、炎癥部位,編號與外周血標(biāo)本對應(yīng))標(biāo)本。所有標(biāo)本獲取經(jīng)青島大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院倫理委員會批準(zhǔn),病人或家屬知情同意。

        1.3 肝癌組織、癌旁正常組織和血漿標(biāo)本DNA的抽提

        使用組織基因組DNA提取試劑盒(QIAamp DNA Blood Mini Kit)按照試劑盒說明,進(jìn)行組織DNA的抽提;采用酚氯仿法進(jìn)行外周血標(biāo)本DNA的抽提。

        1.4 p16、APC甲基化檢測

        1.4.1DNA修飾 取15 μL DNA,加入5 μL M-2Dilution Buffer混勻,去離子水補足50 μL,37 ℃水浴15 min。根據(jù)試劑盒說明的要求,將DNA進(jìn)行亞硫酸氫鈉修飾及純化,最終溶于40 μL TE溶液,-20 ℃保存。

        1.4.2PCR檢測p16、APC甲基化狀態(tài) 引物序列見表1。PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系10 μL:包括亞硫酸氫鈉修飾的模板1 μL(25 ng),200 nmol/L的引物各0.5 μL, 2× Epitect HRM Master Mix(HotStarTaq 酶、DNA 聚合酶、EpiTect HRM PCR Buffer)5 μL,以去離子水補足至10 μL。擴(kuò)增條件:95 ℃預(yù)變性 20 s,然后以適宜的溫度退火30 s,72 ℃退火40 s、95 ℃退火1 min,進(jìn)行50個循環(huán),再95 ℃延伸1 min,最后20 ℃終止反應(yīng)。PCR 擴(kuò)增結(jié)束后,在PCR儀上直接進(jìn)行高分辨熔解。對PCR產(chǎn)物以0.2 ℃/s的速度行55~90 ℃熔解曲線分析,通過分析熔解曲線直接判定甲基化情況。

        1.5 統(tǒng)計分析

        應(yīng)用SPSS 17.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析,癌組織、癌旁正常組織和對應(yīng)血漿之間甲基化率比較采用χ2檢驗。

        2 結(jié) 果

        2.1 p16和APC基因甲基化情況比較

        本文24例正常肝組織未檢出p16和APC基因的異常甲基化。癌組織p16基因甲基化率明顯高于癌旁正常組織和對應(yīng)的血漿標(biāo)本(χ2=67.48、6.72,P<0.05)。癌組織中APC基因甲基化率也均明顯高于癌旁正常組織和對應(yīng)的血漿標(biāo)本(χ2=18.03、29.16,P<0.05)。肝癌組織及對應(yīng)血漿標(biāo)本p16、APC基因甲基化的一致率分別為65.4%、43.3%。見表2。

        表1 甲基化特異性引物序列

        表2 癌組織、癌旁組織及血漿標(biāo)本中基因甲基化率的比較(例(χ%))

        2.2 癌組織及對應(yīng)血漿標(biāo)本基因甲基化率與臨床特征的關(guān)系

        癌組織及對應(yīng)血漿標(biāo)本p16和APC基因甲基化率與病人年齡、性別、吸煙狀況、飲酒狀況、TNM分期、腫瘤大小以及甲胎蛋白(AFP)水平無相關(guān)性(P>0.05)。HBsAg陽性組病人肝癌組織及對應(yīng)血漿標(biāo)本p16基因甲基化率顯著高于HBsAg陰性組(χ2=5.60、5.67,P<0.05)。見表3。

        3 討 論

        DNA甲基化是一種常見的表觀遺傳修飾形式,在調(diào)節(jié)基因表達(dá)及維持細(xì)胞正常分化中起著重要作用,并與腫瘤的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)[7]。已有研究結(jié)果顯示,人類腫瘤組織和腫瘤細(xì)胞中眾多癌相關(guān)基因啟動子區(qū)CpG島存在高甲基化現(xiàn)象,如抑癌基因、腫瘤轉(zhuǎn)移抑制基因、DNA修復(fù)基因等[1,4,7]。

        p16和APC基因是兩個重要的多腫瘤抑制基因,其中p16基因產(chǎn)物是細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶的抑制因子[1],APC基因產(chǎn)物是Wnt信號傳導(dǎo)途徑的重要組成部分,可控制細(xì)胞分裂過程中起關(guān)鍵作用的基因的表達(dá)[4]。目前,國內(nèi)外已有大量有關(guān)p16和APC基因在腫瘤組織及血漿中異常甲基化檢測的研究報道,但結(jié)果仍存在一定差異。LOU等[8]研究結(jié)果顯示,肝癌組織p16基因啟動子區(qū)甲基化頻率顯著高于癌旁組織,而蔣磊等[9]研究結(jié)果則顯示,肝癌組織中p16基因異常甲基化率僅為30%(12/40)。同樣吳龍等[10]的研究結(jié)果顯示,肝癌組織APC基因甲基化率顯著高于癌旁及正常對照肝組織,認(rèn)為是APC基因甲基化參與了肝癌的形成。而YU等[11]報道,在肝癌組織、癌旁組織和正常肝組織中均未檢測到APC基因甲基化,進(jìn)而推測APC基因甲基化可能在肝癌形成過程中不發(fā)揮作用。不同研究者結(jié)論不一致的原因可能與研究對象的例數(shù)、甲基化的檢測方法不同等有關(guān)。本研究結(jié)果顯示,86例HCC組織p16和APC基因的甲基化頻率顯著高于相應(yīng)癌旁組織和血漿標(biāo)本,且差異有顯著性,這與LOU等[8]和吳龍等[10]的研究結(jié)果一致,提示抑癌基因甲基化可能是肝癌發(fā)生、發(fā)展的一個重要因素。

        表3 肝癌病人p16、APC啟動子區(qū)甲基化與臨床特征的關(guān)系(例(χ%))

        肝癌的發(fā)生是一個多因素、多步驟的過程,與多種致病因素有關(guān),因此我們分析了癌組織與對應(yīng)血漿標(biāo)本中p16、APC基因甲基化狀態(tài)與年齡、性別、HBV感染、TNM分期、腫瘤大小等臨床特征的關(guān)系,結(jié)果顯示,HBsAg陽性者肝癌組織及其對應(yīng)血漿p16基因啟動子區(qū)甲基化頻率分別為66.2%和46.5%,顯著高于HBsAg陰性者,提示基因甲基化與HBV感染關(guān)系密切,其可能是導(dǎo)致HCC發(fā)生的一個重要因素[12]。另外,本研究結(jié)果還顯示,p16、APC基因甲基化狀態(tài)與TNM分期、腫瘤大小無關(guān),提示兩種基因的失活可能均發(fā)生于癌變的初始階段。

        由于癌組織的檢測在取材和檢測等方面存在操作不方便、難度較大、易給病人造成痛苦和創(chuàng)傷等問題,所以本研究同時檢測了血漿中p16、APC基因啟動子區(qū)的甲基化狀態(tài)。結(jié)果顯示,癌組織和血漿標(biāo)本p16基因啟動子區(qū)甲基化的一致率為65.4%,血漿p16基因啟動子區(qū)甲基化頻率顯著高于癌旁組織,提示檢測血漿p16基因啟動子區(qū)甲基化在肝癌早期診斷方面可能具有輔助價值。然而,血漿標(biāo)本中APC基因啟動子區(qū)甲基化頻率與癌旁正常組織差異無顯著性,其在肝癌早期診斷方面能否作為非侵入性腫瘤診斷輔助方法有待進(jìn)一步研究。

        總之,肝癌組織中p16、APC基因處于高甲基化狀態(tài),此種狀態(tài)可能是肝癌發(fā)生過程中一個重要因素。研究肝癌病人特異性基因甲基化的狀態(tài),有助于我們更深入地認(rèn)識基因甲基化在肝癌發(fā)生發(fā)展中所起的作用,為肝癌的預(yù)防、早期診斷及治療提供科學(xué)的理論依據(jù)。

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