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        結締組織生長因子基因RNA干擾復制缺陷型腺病毒載體的構建及鑒定

        2013-10-29 09:37:00郝春秋彭梅娟謝玉梅周云魏欣馬力王素娜李瑞娟張巖白雪帆賈戰(zhàn)生
        生物技術通訊 2013年1期
        關鍵詞:寡核苷酸腺病毒質粒

        郝春秋,彭梅娟,謝玉梅,周云,魏欣,馬力,王素娜,李瑞娟,張巖,白雪帆,賈戰(zhàn)生

        第四軍醫(yī)大學 唐都醫(yī)院感染病診療中心,陜西 西安 710038

        腺病毒具有宿主范圍廣、感染率高、包裝容量大、繁殖滴度高、安全性好、性質穩(wěn)定、載體制備較容易等特點[1],已成為應用最廣泛的載體系統(tǒng)之一。結締組織生長因子(connective tissue growth factor,CTGF)是重要的促組織纖維化蛋白,與肝、肺、腎等許多器官的纖維化密切相關[2],是促進膠原沉積致肝纖維化的主要細胞因子。RNA干擾(RNA interfer?ence,RNAi)可以在轉錄后水平阻斷基因表達,使靶基因沉默,是研究特定基因功能的可靠技術[3]。我們試圖利用RNAi原理,構建能介導CTGF基因沉默的復制缺陷型腺病毒載體,為肝纖維化的防治提供一個有用的工具。

        1 材料和方法

        1.1 材料

        腺病毒載體系統(tǒng)(穿梭質粒pShuttle-H1、骨架質粒pAdEasy-1及包裝細胞AD-293)由德國學者Reske教授惠贈;大鼠肝星狀細胞系HSC-T6購自ATCC;大腸桿菌BJ-5183和DH5α由本實驗室保存。

        限制性內切酶、T4DNA連接酶、Taq DNA聚合酶、dNTP、PCR產物回收試劑盒及Plasmid Purifica?tion Kit均為Promega公司產品;脂質體Lipo?fectAMINE2000、DMEM、RPMI1640及胎牛血清均為Gibco公司產品;抗CTGF單克隆抗體、抗β-actin抗體購自Abcam公司;山羊抗鼠IgG-HRP抗體購自Santa Cruz公司。

        1.2 靶向CTGF短發(fā)夾RNA的設計

        根據(jù)小干擾 RNA(siRNA)設計原則[4-5],參考GenBank公布的大鼠 CTGF(NM-022266)核苷酸序列,利用Ambion公司在線(http://www.ambion.com)設計工具,設計4對針對CTGF基因的siRNA序列(TS1~TS4)和1對無關陰性對照序列(TS5),并進行BLAST同源性分析,保證序列的惟一性。為方便克隆與鑒定,在其5'和3'端分別引入BglⅡ和HindⅢ酶切位點,反義片段以后接終止信號TTTTTT以終止轉錄,形成BglⅡ酶切位點+19nt正義靶序列+9nt loop接頭序列+19nt反義靶序列+終止信號+HindⅢ酶切位點的結構(寡核苷酸由上海吉凱基因技術有限公司合成)。見表1。

        1.3 腺病毒穿梭質粒p-shuttle-CTGF的構建及鑒定

        將合成的單鏈寡核苷酸退火形成雙鏈DNA并檢測無誤。用HindⅢ、BglⅡ雙酶切穿梭質粒pShut?tle-H1(圖1),酶切產物純化后,用T4噬菌體DNA連接酶于16℃連接線性化的pShuttle-H1及退火后的雙鏈DNA 12 h,轉化DH5α感受態(tài)細菌,在卡那霉素抗性LB平板上于37℃培養(yǎng)過夜,篩選擴增轉化的陽性菌落,提取質粒并純化后獲得腺病毒穿梭質粒p-shuttle-CTGF,用EcoRⅠ酶切鑒定,并將酶切后獲得的小片段回收進行測序分析。

        1.4 復制缺陷型腺病毒載體Ad.H1-CTGF的包裝和滴定

        培養(yǎng)腺病毒包裝細胞AD-293,達80%~90%匯合時加入1 μg鑒定無誤的腺病毒穿梭質粒p-shut?tle-CTGF 與 4 μg 骨 架 質 粒 pAdEasy-1,用 Lipo?fectAMINE2000脂質體轉染,使之進行同源重組,第2 d傳代;轉染7~10 d后,75%~80%的細胞出現(xiàn)CPE時收集細胞,-80℃和37℃反復凍融3次釋毒,離心凍融液收集上清,即為第一代腺病毒載體Ad.H1-CTGF毒種,作為隨后大量病毒擴增的原液,3次擴增后獲得病毒保存液。同法獲得無關陰性對照病毒Ad.H1-Con原液及保存液,均于-80℃保存。病毒滴定采用TCID50法,即將病毒原液梯度稀釋至1/10-6~1/10-12,分別接種生長于96孔培養(yǎng)皿中的AD-293細胞,37℃培養(yǎng)72 h,用X-gal染色,計算病毒滴度。

        1.5 空斑實驗檢測腺病毒載體的感染性

        將肝星狀細胞系HSC-T6細胞低密度鋪于6孔板中,培養(yǎng)1 d后達60%~70%融合,用感染復數(shù)(MOI)為100的腺病毒載體Ad.H1-CTGF和陰性對照病毒Ad.H1-Con感染細胞,未感染病毒的細胞為對照,加甲基纖維素覆蓋液后37℃培養(yǎng)7 d,吸除覆蓋液加結晶紫染色,清洗后觀察空斑形成情況。

        1.6 Western印跡檢測病毒載體對CTGF基因的沉默效果

        圖1 腺病毒穿梭質粒pShuttle-H1圖譜及構建示意圖

        表1 編碼siRNA的DNA雙鏈

        HSC-T6細胞于6孔板中培養(yǎng)1 d達60%~70%融合后,用MOI為100的腺病毒載體Ad.H1-CTGF和陰性對照病毒Ad.H1-Con感染細胞,37℃培養(yǎng)48 h后裂解細胞、提取蛋白,進行SDS-PAGE,然后將蛋白條帶電轉移到硝酸纖維素膜上,以抗CTGF單克隆抗體為一抗(1∶10)、山羊抗鼠IgG-HRP抗體為二抗(1∶100)進行 Western印跡,檢測腺病毒載體對CTGF基因的沉默效果。

        2 結果

        2.1 含靶序列的單鏈寡核苷酸退火產物檢測

        將合成的4對含靶序列、1對陰性對照序列的單鏈寡核苷酸于90℃溫育4 min、70℃溫育10 min,緩慢冷卻至室溫進行退火,用12%非變性PAGE檢測退火形成雙鏈DNA的效率,均達90%以上(圖2),提示退火產物合格,可用來構建腺病毒穿梭質粒。

        2.2 腺病毒穿梭質粒p-shuttle-CTGF的鑒定

        由腺病毒穿梭質粒pShuttle-H1圖譜(圖1)可看出,MCS中含有2個EcoRⅠ酶切位點,EcoRⅠ酶切后形成2個片段,大片段6600 bp,小片段為300 bp的H1啟動子序列。在BglⅡ和HindⅢ位點間插入合成的寡核苷酸靶序列后,小片段長度則變?yōu)?60 bp。電泳結果(圖3)顯示,陰性對照質粒p-shut?tle-H1酶切小片段為300 bp,陽性克隆質粒p-shut?tle-CTGF酶切小片段為360 bp,大片段均為6600 bp,初步證明重組腺病毒穿梭質粒構建正確?;厥?60 bp小片段進行測序,證實序列完全正確(基因序列略)。

        圖2 退火產物電泳圖譜

        圖3 重組腺病毒穿梭質粒p-shuttle-CTGF的酶切鑒定

        2.3 腺病毒載體的滴定和感染性鑒定

        采用TCID50法對病毒進行滴定,測出病毒保存液滴度為4×1010PFU/mL。用MOI為100的目標病毒Ad.H1-CTGF和陰性對照病毒Ad.H1-Con感染HSC-T6細胞,7 d后目標病毒Ad.H1-CTGF組和陰性對照病毒組Ad.H1-Con均有大量空斑形成,未感染病毒的HSC-T6細胞未見空斑形成,說明構建的目標病毒和陰性無關對照病毒均具有較好的感染性(圖4)。

        2.4 腺病毒載體對CTGF基因沉默效果的Western印跡鑒定

        Western印跡檢測發(fā)現(xiàn),內參照蛋白β-actin的表達水平在6組之間無明顯差異;而CTGF蛋白表達在包裝的4組目標病毒感染HSC-T6細胞后均有不同程度降低,其中含靶序列TS3的病毒感染組降低最顯著;無關序列陰性對照病毒感染組CTGF蛋白表達與未感染細胞組一樣,未見降低(圖5)。提示構建的含TS3靶序列的腺病毒載體具有較好的沉默CTGF基因的效果,將其命名為Ad.H1-CTGF,可作為以后抗纖維化研究的工具。

        3 討論

        我國是肝病大國,隨著慢性肝病病程的延續(xù),其纖維化的進程也一直持續(xù),由于目前缺乏行之有效的根治辦法,這些人都面臨著肝硬化的潛在威脅,這已成了嚴峻的社會問題。因此,尋找有效的抗纖維化方法,阻止慢性肝病患者的肝硬化趨勢,已成為我國乃至全球亟待解決的問題。

        圖4 包裝的腺病毒感染滴定

        圖5 各組病毒對CTGF表達的影響

        肝纖維化的成因,普遍認為與肝星狀細胞(HSC)的活化有關[6],轉化生長因子β(TGF-β)是目前公認的致纖維化最強的細胞因子之一,其促纖維化作用主要是通過誘導其下游因子CTGF的表達,活化HSC來完成。業(yè)已證明,CTGF與肝、肺、腎等器官的纖維化、皮膚瘢痕形成、創(chuàng)傷修復及動脈粥樣硬化密切相關[7]。由于CTGF的生物學效應相對單一,主要介導TGF-β的促細胞增殖和細胞外基質(ECM)合成等作用,因此,阻斷CTGF表達或抑制其活性,可能是一種更特異、更有效的防止肝纖維化的手段。

        RNAi技術具有高效性和高特異性,作為關閉基因的新技術,已被廣泛應用[8]。RNAi的產生需要向細胞內導入siRNA或在細胞內表達siRNA,前者是將體外合成的siRNA直接導入細胞,雖簡單,但導入的siRNA易降解,且以瞬時表達為主,目前已較少使用;后者通過表達siRNA的質?;虿《据d體在靶細胞內轉錄siRNA,發(fā)揮RNAi作用,因方便、穩(wěn)定和高效而成為主流方法。腺病毒載體可以直接、高效、穩(wěn)定地感染細胞,避免了質粒轉染效率低而帶來的不便,逐漸成為該領域的研究熱點[9-13]。

        我們根據(jù)siRNA設計原則[4-5],設計了4對針對CTGF基因的siRNA序列和1對無關陰性對照序列,退火形成雙鏈DNA后定向克隆至pShuttle-H1的H1啟動子下游,獲得腺病毒穿梭質粒p-shuttle-CTGF1-5,經酶切、測序鑒定無誤后與骨架質粒pAdEasy-1共轉染AD-293細胞,同源重組后獲得4株腺病毒載體和1株陰性對照病毒,空斑實驗證實它們均具有較好的感染性,Western印跡檢測發(fā)現(xiàn)4組目標病毒對HSC-T6細胞CTGF的表達均有不同程度的抑制,其中Ad.H1-CTGF3的抑制效果最好,抑制率達85%,達到了設計要求。該腺病毒載體的構建成功,將為抗纖維化的研究提供可行的工具,為肝纖維化和肝硬化的防治奠定基礎。

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