郭凱,趙曉燕,周紅姿,陳凱,李紀(jì)順,陳泉,楊合同
(山東省科學(xué)院中日友好生物技術(shù)研究中心,山東省應(yīng)用微生物重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,山東 濟(jì)南 250014)
導(dǎo)向治療是一種有望代替化療的新的治療手段,應(yīng)用免疫毒素或?qū)蚨舅厥菍?shí)現(xiàn)導(dǎo)向治療的一個(gè)重要的發(fā)展方向,通過特異性抗體或細(xì)胞因子、激素等與毒素連接,前者作為導(dǎo)向部分即配體,可以引導(dǎo)分子到達(dá)腫瘤部位并與腫瘤細(xì)胞表面過量表達(dá)的該種受體結(jié)合;后者作為毒素部分,即殺滅腫瘤細(xì)胞的部分。部分免疫毒素,如 OVB3-PE、IgG-HD37-dgA、IgG-RFB4-dgA、B3-PE40、LHRH-PE40 等已進(jìn)入臨床觀察,DAB389-IL-2(商品名為ONTAC)已通過FDA批準(zhǔn)上市,顯示出良好的療效[1]。
綠膿桿菌外毒素A屬于單轉(zhuǎn)移酶家族,將NAD+的ADP-核糖基轉(zhuǎn)移至底物使其ADP-核糖化[2-3]。綠膿桿菌外毒素A(PEA)的分子量為66.0 kD,主要功能結(jié)構(gòu)域包括:Domain Ia(AA 1-252),與受體識(shí)別的結(jié)合的結(jié)構(gòu)域;Domain Ib(AA 365-484);Domain II(AA 253-364),Domain II與毒素從細(xì)胞膜外到細(xì)胞內(nèi)的跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān);Domain III(AA 405-613),Domain III和Ib共同組成催化ADP-核糖化的催化結(jié)構(gòu)域。在真核細(xì)胞內(nèi),綠膿桿菌外毒素A催化蛋白質(zhì)延長(zhǎng)因子eEF-2ADP,使其發(fā)生核糖基化作用從而喪失活性,最終阻斷細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)合成,導(dǎo)致細(xì)胞的死亡[2-3]。
人促性腺激素釋放激素(GnRH)做為重組蛋白的導(dǎo)向部分,能夠和癌細(xì)胞表面表達(dá)的GnRH受體特異性結(jié)合。大量實(shí)驗(yàn)表明,GnRH受體在某些癌細(xì)胞表面高度表達(dá),而相應(yīng)的正常細(xì)胞表面該受體幾乎不表達(dá)[4-5]。
有文獻(xiàn)報(bào)道PE毒素的AA 359-365缺失后,PE的活性會(huì)大幅度提高[6];此外,將PE末端5個(gè)氨基酸REDLK突變?yōu)镵DEL后,也會(huì)使其活性大幅度提高[7]。所以本文選取PEA衍生物PE39KDEL作為靶向抗腫瘤蛋白的毒素部分。
目前文獻(xiàn)報(bào)道的PEA衍生物的相關(guān)基因工程蛋白中,都是以包涵體形式表達(dá)[8-9],純化后需要進(jìn)行蛋白質(zhì)復(fù)性操作,然而蛋白質(zhì)的復(fù)性過程較為繁瑣,且無法保證蛋白質(zhì)的天然活性構(gòu)象[10-11]。本文通過表達(dá)載體的構(gòu)建和后期表達(dá)優(yōu)化,最終得到可溶性表達(dá)的蛋白GnRH-PE39KDEL前體,經(jīng)一步純化后蛋白純度達(dá)到95%以上,蛋白最終得率在2.6 mg/g菌體,解決了GnRH-PE39KDEL重組蛋白無法可溶表達(dá)的難題,為進(jìn)一步工業(yè)化生產(chǎn)奠定了基礎(chǔ)。
1.1.1 質(zhì)粒和菌株
大腸桿菌DH5α、BL21(DE3)和BL21(DE3)plysS為本實(shí)驗(yàn)室保存菌種,質(zhì)粒pET-24b購(gòu)自Navogen公司,基因GnRH-PE39KDEL和相關(guān)引物由北京鼎國(guó)昌盛生物技術(shù)有限責(zé)任公司合成。
1.1.2 試劑
Pfu Taq DNA聚合酶購(gòu)自天為時(shí)代;限制性核酸內(nèi)切酶、T4 DNA連接酶及DNA Marker購(gòu)自TaKaRa公司;IPTG購(gòu)自羅氏;蛋白質(zhì)中等分子量marker、卡那霉素、凝膠電泳回收試劑盒購(gòu)自生工生物工程(上海)有限公司;HisTrap HP(通用電器生命科學(xué)部);其它為國(guó)產(chǎn)分析純?cè)噭?/p>
1.1.3 儀器
PCR儀:Bio-Rad MyCycler溫度梯度PCR儀。
電泳及成像:Bio-Rad和G-BOX紫外凝膠成像系統(tǒng)。
蛋白質(zhì)純化及電泳:GE公司的AKTA purifier親和層析系統(tǒng),Bio-Rad SDS-PAGE垂直電泳系統(tǒng)。
1.2.1 GnRH-PE39KDEL 基因的獲得
依據(jù)大腸桿菌密碼子偏好性優(yōu)化GnRH-PE39KDEL核酸序列,通過基因合成的方法,獲得全長(zhǎng)序列,由上海鼎國(guó)生物技術(shù)有限公司合成。
1.2.2 pET-24b-GnRH-PE39KDEL 載體的構(gòu)建和鑒定
含GnRH-PE39KDEL全長(zhǎng)的Puc57的DH5α大腸桿菌經(jīng)質(zhì)?;厥赵噭┖刑崛⊥暾|(zhì)粒作為PCR模板。設(shè)計(jì)的正向引物含有蛋氨酸起始密碼子及 NdeI酶切位點(diǎn),pET-24bForward:5′-ggaattc CATATGGAACACTGGTCTTACGGTC;反相引物中引入Factor Xa蛋白酶切割位點(diǎn)及EcoR I酶切位點(diǎn),pET-24b Reverse:5″-ccgGAATTCGCGACCTTCCACCAGTTCGTCTTTCGGCGG。用Nde I和EcoR I限制性內(nèi)切酶雙酶切PCR-GnRH-PE39KDEL回收產(chǎn)物和質(zhì)粒pET-24b,兩者按摩爾比5:1混勻,使用T4 DNA連接酶4℃連接過夜。連接產(chǎn)物1 μL轉(zhuǎn)化到大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞中,涂布于含卡那霉素的瓊脂糖平板上,37℃培養(yǎng)過夜,挑取單克隆搖菌,提取質(zhì)粒比較重組DNA分子量大小,限制性內(nèi)切酶、PCR鑒定后進(jìn)行重組質(zhì)粒的測(cè)序,將陽性克隆命名為 pET-24b-GnRH-PE39KDEL-DH5α。
1.2.3 pET-24b-GnRH-PE39KDEL表達(dá)載體轉(zhuǎn)化及在不同大腸桿菌中誘導(dǎo)表達(dá)條件的優(yōu)化
將鑒定后的 pET-24b-GnRH-PE39KDEL表達(dá)載體轉(zhuǎn)入制備好的感受態(tài)細(xì)胞株 BL21(DE3)和 BL21(DE3)plysS 中,分別記為 pET-24b-GnRH-PE39KDEL-DE3 和 pET-24b-GnRH-PE39KDEL-plysS。
誘導(dǎo)溫度、誘導(dǎo)劑濃度及誘導(dǎo)時(shí)間:挑取 pET-24b-GnRH-PE39KDEL-DE3單菌落于 20mL含有100 μmol/L卡那霉素的LB+0.2 mg/mL葡萄糖液體培養(yǎng)基,37℃ 180 r/min過夜培養(yǎng),按4%的接菌量轉(zhuǎn)接至50mL含有100 μmol/L卡那霉素的LB+0.2 mg/mL葡萄糖培養(yǎng)基中,37℃ 180 r/min,繼續(xù)培養(yǎng)3 h至 OD600為 0.6,加入異丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)至終濃度 0、0.1、0.2、0.4、0.8mmol/L,分成 2 組,分別于30℃、37℃ 180 r/min培養(yǎng)5 h,每1 h取樣一次。菌液12000 g離心2 min,使用1×loading buffer重懸菌體,99℃保溫4 min,12000g離心2 min后-20℃保存待用。
宿主菌優(yōu)化:挑取 pET-24b-GnRH-PE39KDEL-DE3 和 pET-24b-GnRH-PE39KDEL-plysS 單菌落于 20mL含有100 μmol/L卡那霉素的LB+0.2% 葡萄糖液體培養(yǎng)基,37℃ 180 r/min過夜培養(yǎng),按4%的接菌量轉(zhuǎn)接至50mL含有100μmol/L卡那霉素的LB+0.2 mg/mL葡萄糖培養(yǎng)基中,37℃ 180 r/min,繼續(xù)培養(yǎng)3 h至OD600為0.6,IPTG至終濃度0.2 mmol/L,分成2組,于30℃ 180 r/min培養(yǎng)5 h,每 1 h取樣一次。菌液12000 g離心2 min,使用1×loading buffer重懸菌體,99℃保溫4 min,12000g離心2 min后-20℃保存待用。
1.2.4 變性 SDS-PAGE 電泳分析
配制12 mg/mL的分離膠和5 mg/mL濃縮膠,進(jìn)行SDS-PAGE電泳分析蛋白表達(dá)。
1.2.5 GnRH-PE39KDEL融合蛋白的大量表達(dá)和初純品的制備
接種單克隆 pET-24b-GnRH-PE39KDEL-plysS 含有100 μmol/L 卡那霉素的 LB+0.2 mg/mL 葡萄糖液體培養(yǎng)基中37℃ 180 r/min過夜培養(yǎng),按5(V/V)接菌量接種種子液至500mL含有100 μmol/L卡那霉素的LB+0.2 mg/mL葡萄糖液體培養(yǎng)基中,約2.5 h OD600升為0.6時(shí),降溫至30℃ 加入IPTG至終濃度0.2 mmol/L,誘導(dǎo)重組蛋白表達(dá)2 h,高速離心收集菌體,按照菌體和破碎緩沖液(50mmol/L Tris pH=8.0,0.5 mol/L NaCl,5%Glycerol,20mmol/L Imidazole)1:5(V/V)的比例重懸菌體,超聲波破碎,高速離心后收集上清。加入1 μg/mL DNase和RNase及1 mmol/L MgCl2,經(jīng)0.22 μm 過濾膜過濾。
利用GE AKTA purifier系統(tǒng)平衡層析柱后,使用上樣泵將樣品加載入親和層析柱上(流速≤4 mL/min,柱壓≤0.3 MPa)。使用上樣緩沖液(50mmol/L Tris pH=8.0,0.5 mol/L NaCl)沖洗層析柱至 UV280達(dá)到平衡。調(diào)節(jié)洗脫緩沖液(50mmol/L Tris pH=8.0,0.5 mol/L NaCl,500mmol/L Imidazole)的體積至 10%(50mmol/L Imidazole),洗脫結(jié)合在層析柱中的雜蛋白,設(shè)定UV280≥100收集。提高洗脫緩沖液體積比至50%(250mmol/L Imidazole),最后使用100%(V/V)洗脫緩沖液清洗層析柱[12-13]。層析柱平衡后保存至緩沖液中,將各組分進(jìn)行SDS電泳分析。
1.2.6 活性檢測(cè)
收集對(duì)數(shù)期細(xì)胞A549,調(diào)整細(xì)胞懸液濃度,每孔加入200 μL,鋪板使待測(cè)細(xì)胞調(diào)密度至103~104個(gè)/孔。體積分?jǐn)?shù)為5%的CO2,37℃孵育,至細(xì)胞單層鋪滿孔底(96孔平底板),加入濃度梯度的藥物,孵育16~48 h。每孔加入20 μL 5 mg/mL的MTT溶液,繼續(xù)培養(yǎng)4 h。終止培養(yǎng),小心吸去孔內(nèi)培養(yǎng)液。每孔加入150 μL二甲基亞砜(DMSO),置搖床上低速振蕩10min。在酶聯(lián)免疫檢測(cè)儀490 nm處測(cè)量各孔的吸光值。
使用單克隆菌落回收的質(zhì)粒經(jīng) PCR、單酶切、雙酶切結(jié)果證實(shí)(圖1),在pET-24b-GnRH-PE39KDEL載體中含有正確插入的重組蛋白核酸序列。
瓊脂糖電泳結(jié)果顯示在1.2 kb處有特異目的條帶,提取重組質(zhì)粒后使用BamHI、EcoRI進(jìn)行雙酶切,在5.3 kb和1.2 kb處獲得2個(gè)片段。經(jīng)生工生物工程(上海)有限公司正反向測(cè)序后,核酸序列與合成的重組蛋白核酸序列一致。
圖1 重組質(zhì)粒pET-24b-GnRH-PE39KDEL構(gòu)建的瓊脂糖凝膠電泳圖Fig.1 Electrophoretic analysis of colony PCR products enzymatic digestion
融合蛋白表達(dá)含有395個(gè)氨基酸殘基,理論分子量為42.8 kD。重組菌株中總蛋白經(jīng)SDS-PAGE電泳顯示在35~45 kD處有一明顯的目的條帶,同時(shí)在0.2 mmol/L IPTG誘導(dǎo)濃度下,蛋白表達(dá)達(dá)到最大值,增加IPTG并未增加誘導(dǎo)蛋白表達(dá)量(數(shù)據(jù)未列出)。在溫度誘導(dǎo)條件下,37℃蛋白表達(dá)量較30℃明顯增高,但是為包涵體表達(dá)形式,30℃時(shí)蛋白以可溶形式表達(dá)。故使用30℃進(jìn)行重組蛋白大量生產(chǎn)。在IPTG誘導(dǎo)下,重組蛋白在BL21(DE3)plysS中2 h達(dá)到最大表達(dá)量,而在BL21(DE3)此過程需要4 h(圖2)。BL21(DE3)plysS帶有的pLysS質(zhì)粒編碼T7噬菌體溶菌酶,可以極大或完全抑制誘導(dǎo)劑(IPTG)加入前的重組蛋白的非誘導(dǎo)表達(dá),而重組蛋白在菌體生長(zhǎng)中的痕量表達(dá)有可能對(duì)IPTG誘導(dǎo)的蛋白過程起到一定的反饋抑制作用,這可能是BL21(DE3)plysS表達(dá)重組蛋白速度更快的原因。
使用Image Pro Plus對(duì)SDS-PAGE的結(jié)果分析顯示,重組蛋白表達(dá)量占總蛋白的30%(w/w)左右,占可溶蛋白的40%(w/w)以上。
圖2 pET-24b-GnRH-PE39KDEL 在 E.coli BL21(DE3)和 E.coli BL21(DE3)plysS 重組 SDS-PAGE電泳圖Fig.2 SDS-PAGE analysis of recombinant protein of pET-24b-GnRH-PE39KDEL in E.coli BL21(DE3)and E.coli BL21(DE3)plysS
經(jīng)過HisTrap親和層析柱純化得到的蛋白純度約為90%,使用脫鹽柱緩沖液置換后,去除了小分子量的蛋白和一些線性蛋白,蛋白純度達(dá)到95%以上,見圖3。蛋白純化過程中存在一些可以和鎳柱親和吸附的宿主菌蛋白,在圖3中可見在25~30 kD有宿主蛋白條帶。在后續(xù)的純化過程中,這些非特異性吸附蛋白被去除掉(數(shù)據(jù)未列出)。
圖3 重組蛋白純化過程與SDS-PAGE電泳結(jié)果Fig.3 Purification of recombinant protein GnRH-PE39KDEL
取蛋白樣品 200 μg,溶于 50 μL 含有 8mol/L urea、10mmol/L DTT、50mmol/L NH4HCO3的溶液中,置37°C水浴中還原4 h,然后加入5 μL 0.5 mol/L碘乙酰胺放置暗處1 h進(jìn)行烷基化,加250 μL 50mmol/L NH4HCO3溶液將尿素稀釋到1 mol/L以下,最后加入5 μg的胰蛋白酶37℃保溫反應(yīng)16 h,取出后冷凍干燥成粉末,用流動(dòng)相(體積分?jǐn)?shù)0.1%的甲酸水溶液)復(fù)溶至200 μL待測(cè)。
使用Agilent串聯(lián)快速分離液相-6520型四極桿飛行時(shí)間質(zhì)譜(RRLC-Q-TOF)鑒定,肽段和數(shù)據(jù)庫比較得出,此蛋白含有正確的PEA66蛋白序列。由于重組蛋白是一種毒性蛋白,在大腸桿菌中是否表達(dá),是否表達(dá)全長(zhǎng)序列需要檢測(cè)。通過質(zhì)譜分析并結(jié)合SDS電泳分析發(fā)現(xiàn),在宿主菌中重組蛋白得以表達(dá)并且可以全長(zhǎng)正確表達(dá),結(jié)果圖4所示。
本實(shí)驗(yàn)室前期得到的包涵體蛋白復(fù)性后的活性檢測(cè)結(jié)果表明,包涵體復(fù)性蛋白活性明顯低于可溶性表達(dá)的重組蛋白。同時(shí)包涵體復(fù)性過程不僅增加了操作步驟和生產(chǎn)成本,同時(shí)由于操作步驟過多降低了蛋白的得率。
實(shí)驗(yàn)結(jié)果(圖5)顯示可溶性表達(dá)重組蛋白對(duì)于肺癌細(xì)胞株A549的增殖有很好的抑制作用,經(jīng)計(jì)算IC50所需要的重組蛋白濃度為 20.70 μg/mL,相對(duì)應(yīng)的包涵體復(fù)性蛋白濃度為192.42 μg/mL。由此可見可溶性表達(dá)的重組蛋白具有很好的抑制腫瘤細(xì)胞增殖的作用。
目前以GnRH或其衍生物為導(dǎo)向部分,以綠膿桿菌外毒素A(PE)的截短形式及其衍生物為毒素部分的靶向治療劑已經(jīng)有報(bào)道[14]。這種靶向治療劑是利用GnRH受體在某些腫瘤細(xì)胞表面過量表達(dá)的現(xiàn)象,用融合蛋白中的GnRH部分與過度表達(dá)GnRH受體的腫瘤細(xì)胞表面的LHRH受體產(chǎn)生特異性的結(jié)合,然后將其毒素部分PE衍生物導(dǎo)入腫瘤細(xì)胞,同時(shí)對(duì)正常細(xì)胞作用較少或無影響。與傳統(tǒng)的腫瘤治療方法相比GnRH-PE衍生物的靶向性治療以其特異性和高效性而占有無可爭(zhēng)辯的優(yōu)勢(shì)[15-17]。
在已有的PE類衍生物的重組蛋白報(bào)道中,重組蛋白以包涵體形式表達(dá),這為后期蛋白復(fù)性和工業(yè)化生產(chǎn)帶來很多問題。本研究構(gòu)建的pET-24b-GnRH-PE39KDEL-BL21(DE3)plysS能夠?qū)崿F(xiàn)重組蛋白的可溶性表達(dá),在對(duì)重組蛋白表達(dá)條件進(jìn)行初步優(yōu)化后,利用AKTA purifier系統(tǒng)可以獲得純度達(dá)95%以上的目的蛋白,蛋白最終得率在2.6 mg/g菌體。并且通過IC50檢測(cè),證實(shí)了前體蛋白良好的毒殺腫瘤細(xì)胞活性。
本實(shí)驗(yàn)通過工程菌株的篩選和優(yōu)化表達(dá)純化工藝,得到了一套較為成熟和簡(jiǎn)便的GnRH-PE39KDEL純化流程,為后續(xù)工業(yè)放大生產(chǎn)奠定了可靠的基礎(chǔ)。
[1]AQEILAN R,KEDAR R,BEN-YEHUDAH A ,et al.Mechanism of action of interleukin-2(IL-2)-Bax,an apoptosis-inducing chimaeric protein targeted against cells expressing the IL-2 receptor[J].Biochem J,2003,370(Pt 1):129 -140.
[2]YATES S P,MERRILL A R.A catalytic loop within Pseudomonas aeruginosa exotoxin A modulates its transferase activity[J].J Biol Chem,2001,276(37):35029-35036.
[3]ARMSTRONG S ,YATES S P,MERRILL A R.Insight into the catalytic mechanism of pseudomonas aeruginosa exotoxin A[J].Biochem,2002,277(48):46669-46675.
[4]PATI D,HABIBI H R.Inhibition of human hepatocarcinoma cell pro-liferation by mammalian and fish gonadotrop in-releasing hormones[J].Endocrinology,1995,136(1):75 -84.
[5]羅海波,朱平,李蘭娟.細(xì)菌毒素與臨床[M].北京:人民衛(wèi)生出版社,1999:91-99.
[6]TAUPIAC M P,BEBIEN M,ALAMI M,et al.A deletion within the translocation domain of Pseudomonas exotoxin A enhances translocation efficiency and cytotoxicity concomitantly[J].Mol Microbiol,1999,31(5):1385 -93.
[7]PASTAN I H,F(xiàn)ITZGERALD D J.Recombinant pseudomonas exotoxin with increased activity:US,5602095[P].1997 -02 -11.
[8]朱海兵,黃軼,曾昭淳.F3重組毒素的克隆表達(dá)及純化[J].科技導(dǎo)報(bào),2009,27(12):19-22.
[9]朱海兵,黃軼,曾昭淳.F3-PE40基因的克隆、表達(dá)及純化[J].生物學(xué)雜志,2010,27(4):49-52.
[10]鐘曉力,黃華梁.假單孢菌外毒素A的介紹[J].生物學(xué)通報(bào),2000,35(9):10-13.
[11]祁志榮.PE類重組免疫毒素的研究進(jìn)展[J].微生物學(xué)免疫學(xué)進(jìn)展,2006,34(1):50-53.
[12]BORNHORST J A,F(xiàn)ALKE J J.Purification of proteins using polyhistidine affinity tags[J].Methods Enzymol,2000,326:245 -254.
[13]CROWE J,MASONE B S,Ribbe J.One-step purification of recombinant proteins with the 6xHis tag and Ni-NTA resin[J].Mol Biotechnol,1995,4(3):247 -258.
[14]李樹民,李詠梅,馮書章,等.EGF-PE35KDEL嵌合毒素對(duì)Hela細(xì)胞的毒性作用[J].中國(guó)腫瘤生物治療雜志,2005,12(02):120-123.
[15]H羅爾伯布姆-加爾斯基 ,A本-耶胡達(dá),A內(nèi)楚施坦,等.應(yīng)用嵌合毒素診斷癌癥的方法:中國(guó),99806580.3[P].1999-09-30.
[16]聶李亞,馬素永,文美玉.一種能特異殺死腫瘤細(xì)胞的基因工程重組蛋白:中國(guó),03137587.1[P].2003-06-18.
[17]聶李亞,馬素永,金美玉.高效低毒的系列功能蛋白:中國(guó),200410033621.6[P].2004-04-13.