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最佳卵巢癌模型的識別
Nikolaus Schultz和他的研究團隊分析了癌癥基因組圖譜(確定臨床卵巢癌樣本的基因組特征)以及癌細胞系百科全書(包含用于研究工作的大約1000個癌細胞系的相似數(shù)據(jù)),對這些數(shù)據(jù)彼此之間進行了匹配,并根據(jù)大約50個卵巢癌細胞系與來自“高級別漿液性卵巢癌(High grade serous ovarian carcinoma,HGSOC)”患者的臨床樣本的基因組相似性對它們進行了排序。該團隊發(fā)現(xiàn),兩個最流行的卵巢癌細胞系(占所有已發(fā)表的關于HGSOC的研究論文的60%)并不是非常像HGSOC,而12個最適合的卵巢癌細胞系僅用在1%的已發(fā)表研究論文中。
該研究成果最近刊登在國際雜志Nature Communications上,為“一些最流行的卵巢癌細胞系可能并非卵巢癌的最好模型”的說法提供了證據(jù),同時也提供了一個方法論框架,這個框架也許還可應用于其他細胞系和不同類型的癌癥,以便評估它們作為研究工具是否合適。
參考資料
[1]Domcke S,Sinha R,Levine DA,et al.Evaluating cell lines as tumour models by comparison of genomic profiles[J].2013,9 July,doi:10.1038/ ncomms3126
(陳農(nóng))