周 延,王 芳,王 琳
(1 北京化工大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院制藥工程系,北京100029;2 中國(guó)水利水電科學(xué)研究院水資源研究所,北京100044)
“柴達(dá)木”是蒙古語(yǔ) “鹽澤”之意,現(xiàn)有湖泊33個(gè)。各國(guó)學(xué)者對(duì)鹽環(huán)境微生物尤其是嗜鹽菌的各個(gè)方面進(jìn)行了大量的研究,發(fā)現(xiàn)了許多新的微生物類群。近年來(lái)證實(shí)了鹽環(huán)境中獨(dú)特微生物群系的存在,且大多群系是依賴于鹽環(huán)境且只有不到0.01%~10%的微生物可以得到純培養(yǎng)[1-3],其中大部分微生物在鹽環(huán)境破壞后將無(wú)法生存[4]。
與淡水湖相比,鹽湖生態(tài)系統(tǒng)組成相對(duì)簡(jiǎn)單和單一,以微生物為主要生物類群,特別是其特有的微生物系統(tǒng)對(duì)鹽湖湖水的物理化學(xué)環(huán)境有著非常強(qiáng)的依賴關(guān)系,湖水組成一旦變化,必然引起微生物系統(tǒng)的變化,其中不能適應(yīng)這種變化的微生物將面臨消失的危險(xiǎn)。另一方面,鹽湖受到來(lái)自人類活動(dòng)和自然環(huán)境因素變化的雙重威脅,這些威脅甚至大于對(duì)淡水湖泊的威脅,因?yàn)槿藗兺ǔUJ(rèn)為鹽湖沒(méi)有內(nèi)陸的各種淡水水體那么重要和有價(jià)值,可以不采取保護(hù)措施,以至于不少鹽湖在過(guò)去的開發(fā)中,水位大幅下降和鹽度上升,甚至有些湖泊,如團(tuán)結(jié)湖,已經(jīng)成為排放鹽田老鹵的地方。鹽湖如何保護(hù),保護(hù)什么?這一問(wèn)題現(xiàn)在仍沒(méi)有被重視。
對(duì)我國(guó)西北部鹽環(huán)境微生物進(jìn)行的大量研究工作充分證明了青海鹽環(huán)境中存在豐富的微生物多樣性、存在較多的新的微生物類群,并且潛藏著能產(chǎn)生較強(qiáng)生物活性的微生物資源[5-9]。在此基礎(chǔ)上,本研究應(yīng)用PCR-DGGE、普通PCR和培養(yǎng)法結(jié)合對(duì)柴達(dá)木盆地中的7個(gè)鹽湖、3個(gè)咸水湖、2個(gè)淡水湖及鹽田的湖水細(xì)菌多樣性進(jìn)行了調(diào)查,旨在總結(jié)其微生物類群的分布規(guī)律,并試圖就鹽度對(duì)細(xì)菌種群的影響進(jìn)行深入探討,以期對(duì)鹽湖生態(tài)資源的保護(hù)有所參考。
湖水樣品采自青海省柴達(dá)木盆地淡水湖:可魯克湖和小蘇干湖;咸水湖:尕海湖、托素湖、大蘇干湖;鹽湖:都蘭湖,柯柯鹽湖,大柴旦湖,南霍布遜湖,小柴旦湖,東臺(tái)吉乃爾湖,達(dá)布遜湖,察爾汗鹽田,南霍布遜鹽田。
500 m L湖水樣品經(jīng)0.22μ濾膜過(guò)濾,濾膜加入純水震蕩均勻,離心后用天根細(xì)菌基因組提取試劑盒提取DNA。
PCR-DGGE 16S r DNA引物[10-11]:
樣品DNA經(jīng)PCR擴(kuò)增后濃縮進(jìn)行DGGE電泳,用以比較不同樣品中菌群分布和差異。
普通PCR 16S r DNA擴(kuò)增引物[12-15]:
普通PCR擴(kuò)增得到的16S r DNA擴(kuò)增片段用瓊脂糖凝膠電泳純化后連接p MD19-T載體,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化為E.coli DH5α,每個(gè)樣品隨機(jī)選取40個(gè)轉(zhuǎn)化菌落進(jìn)行測(cè)序,用以了解樣品中主要菌群類型。
培養(yǎng)基[16]:①CM培養(yǎng)基(/L):Casamino acids 7.50 g,Yeast extract 10.00 g,Na3-citrate 3.00 g,KCl 2.00 g,MgSO4·7H2O 20.00 g,F(xiàn)eSO4·7 H2O 0.05 g,NaCl 200.00 g,p H=7.2;②HM培養(yǎng)基(/L):NaCl 100.0 g,KCl 2.0,MgSO4·7H2O 1.0 g,CaCl2·2H2O 0.36 g,Na HCO30.06 g,Yeast extract 10.0 g,Glucose 1.0 g,p H=7.2~7.4;③APA培養(yǎng)基(/L):NaCl 20.0 g,KH2PO42.0 g,MgSO4·7 H2O 1.0 g,Na2CO310.0 g,Yeast extract 5.0 g,Glucose 1.0 g,p H=9~10。
采用3種基礎(chǔ)培養(yǎng)基在用于相應(yīng)樣品時(shí)進(jìn)行適當(dāng)鹽度調(diào)整。水樣經(jīng)經(jīng)0.22μ濾膜過(guò)濾,將濾膜加入液體培養(yǎng)基震蕩均勻后,梯度稀釋涂布平板。37℃培養(yǎng)3~15 d,劃線至獲得單菌落。菌株用甘油管法保存[16]。
應(yīng)用PCR-DGGE法測(cè)試了淡水湖(可魯克湖,小蘇干湖)、咸淡水湖 (尕海,托素湖,大蘇干湖)、鹽湖 (都蘭湖,柯柯鹽湖,大柴旦湖,南霍布遜湖,小柴旦湖,東臺(tái)吉乃爾湖,達(dá)布遜湖)和察爾汗鹽田、南霍布遜鹽田的樣品。共得到不同位置的譜帶32個(gè),根據(jù)DGGE原理,表明在所測(cè)樣本中至少存在32個(gè)不同種屬的微生物。各鹽湖的PCR-DGGE電泳譜圖見圖1。培養(yǎng)法和普通PCR轉(zhuǎn)化后測(cè)得的菌屬代表了柴達(dá)木各湖泊的主要細(xì)菌種屬,鑒定出的各樣點(diǎn)細(xì)菌可大致歸屬于12個(gè)屬的105個(gè)物種 (已另具文 “柴達(dá)木盆地鹽環(huán)境湖泊中鹽度對(duì)細(xì)菌多樣性影響的研究”,文章在投),其中包括了稀有的放線菌類群,如Kocuria等,這些菌屬在以往的研究中曾被報(bào)道[5-9]。其中Brevibacillus,Paenibacillus,Bacillus,Streptomyces屬中檢到的菌種數(shù)占所有檢出菌種數(shù)的84%,是鹽湖中存在的主要菌屬。對(duì)湖水的培養(yǎng)法和普通PCR法的研究結(jié)果顯示,柴達(dá)木盆地鹽湖內(nèi)存在豐富的微生物群系。
從東臺(tái)吉乃爾湖和南霍布遜湖的周邊鹽田和鹽廠樣品的細(xì)菌菌群分布 (表1)可以看到,在所檢鹽田只得到5個(gè)屬的細(xì)菌,鹽田細(xì)菌群屬種比鹽湖少50%以上。DGGE譜圖上,鹽田樣品的譜帶數(shù)(表2)也顯示鹽田微生物種群的減少。從主要菌屬的缺失來(lái)看,鹽田菌群與鹽湖已經(jīng)發(fā)生明顯變化,鹽田微生物種群的分布狹窄。
為了進(jìn)一步了解湖水中細(xì)菌多樣性與湖水特征的關(guān)系,在托素湖與大蘇干湖分別選取了4個(gè)取樣點(diǎn)進(jìn)行了實(shí)驗(yàn)。托素湖與大蘇干湖的共同點(diǎn)是二者均通過(guò)地表徑流與淡水湖相連,因而從淡水入口到遠(yuǎn)端形成了不同的湖水鹽度 (圖2),如果4個(gè)樣品中微生物存在差異,則這個(gè)差異只可能是由于湖水差異造成的。
圖1 PCR-DGGE電泳譜帶示意圖
表1 鹽湖周邊鹽田的菌群變化
表2 鹽田DGGE譜帶結(jié)果
圖2 大蘇干湖和托素湖取樣點(diǎn)示意圖
表3 局部環(huán)境對(duì)湖泊微生物群落的影響
從樣品的DGGE結(jié)果(表3)來(lái)看,湖中取自遠(yuǎn)離淡水入口處的樣品 (大蘇干湖1#樣與2#樣,托素湖3#樣與4#樣)的DGGE譜帶顯示更明顯的咸水湖特征。兩湖的1#與2#、3#與4#取樣點(diǎn)的鹽度相近,其DGGE譜圖也幾乎相同。鹽度不同的樣品(如1#,3#樣)DGGE譜帶則有一定差異。托素湖和大蘇干湖4個(gè)湖水樣品的DGGE譜帶差異的主要原因應(yīng)該是湖水差異導(dǎo)致的,更確切地說(shuō),在這里是湖水鹽度的變化帶來(lái)的。
由于鹽度對(duì)菌群分布的決定作用造成了在湖中依鹽度變化,形成了微生物的過(guò)渡形分布,帶來(lái)了托素湖和大蘇干湖不同位置取得樣品的DGGE譜圖的差異性。這說(shuō)明湖水特性,尤其是湖水的鹽度,對(duì)細(xì)菌種屬的分布有較大影響。
在本次研究所調(diào)查的鹽湖中,大柴旦湖、小柴旦湖、柯柯鹽湖、東臺(tái)吉乃爾湖、達(dá)布遜湖均為硫酸鎂亞型鹽湖,其水中主體礦物組成特性相近。在這幾個(gè)鹽湖中,湖水的物理化學(xué)因子的影響,尤其是礦化度 (鹽分濃度)和p H值,是湖水中微生物的種類和數(shù)量不同的主因。而礦化度和p H值呈現(xiàn)一定的相關(guān)性,即礦化度高的湖泊一般為酸性或微酸性湖泊,礦化度較低的湖泊為堿性或微堿性湖泊。
表4 硫酸鎂亞型鹽湖比較
同為硫酸鎂亞型的大柴旦鹽湖、柯柯鹽湖、東臺(tái)吉乃爾湖、小柴旦湖和達(dá)布遜湖,其礦化度、p H值和菌種個(gè)數(shù)和主菌數(shù)見表4和圖3。尕海的礦化度較低,菌種數(shù)為26,主菌屬數(shù)為4——即Brevibacillus,Paenibacillus,Bacillus,Streptomyces屬的菌株。這些硫酸鎂亞型湖泊與低礦化度的尕海相比,隨著水體的礦化度升高,優(yōu)勢(shì)細(xì)菌種數(shù)變化不大。但是,當(dāng)?shù)V化度從大柴旦湖的274.438 g/L升高到小柴旦湖的339.074 g/L,鑒定得到的菌種數(shù)從13變?yōu)?;當(dāng)?shù)V化度到達(dá)布遜湖的470.18 g/L后,菌種數(shù)為5,低于尕海菌種數(shù)的20%,且主菌屬數(shù)變?yōu)?,有兩個(gè)屬的菌消失了。因此,礦化度在350~450 g/L可能為鹽濃度影響較大的過(guò)渡區(qū),一旦礦化度高于450 g/L,鹽湖微生物一些主要菌屬開始消失,鹽湖生態(tài)將發(fā)生質(zhì)的變化。
圖3 鹽湖鑒定結(jié)果比較
對(duì)于礦化度在270~350 g/L內(nèi)的鹽湖,330 g/L的東臺(tái)吉乃爾湖與339 g/L的小柴旦湖DGGE譜帶數(shù)驟減引起我們的關(guān)注。表明在這里存在引起微生物某些變化的突出因素。據(jù)文獻(xiàn)[17]報(bào)道,硫酸鎂亞行鹵水在330~360 g/L嚴(yán)重結(jié)鹽,且Na+/Mg2+比高于0.5時(shí)結(jié)鹽嚴(yán)重,研究涉及的幾個(gè)湖此系數(shù)均高于0.5。因此認(rèn)為鹽湖鹵水結(jié)鹽可能是引起湖水中微生物種群減少的重要因素。考慮到鹽湖供水流量的變化,可以考慮以330 g/L作為硫酸鎂亞行鹽湖生態(tài)穩(wěn)定的閥值。
綜上所述,鹽湖和咸淡水湖中的研究表明,在鹽湖生態(tài)系統(tǒng)中,鹽度和p H值是決定生物物種多樣性及其個(gè)體豐度的關(guān)鍵因素。認(rèn)為330 g/L可以考慮作為硫酸鎂亞型鹽湖生態(tài)變化控制的參考臨界值。
本文應(yīng)用PCR-DGGE法測(cè)試了柴達(dá)木盆地的12個(gè)湖泊和察爾汗鹽田、南霍布遜鹽田的樣品,結(jié)果顯示鹽田細(xì)菌屬種比鹽湖少50%以上。鹽田菌群與鹽湖已經(jīng)發(fā)生明顯變化,鹽田開采如果不加以控制,勢(shì)必造成鹽湖生態(tài)的不可逆變化。
托素湖和大蘇干湖不同位置取得樣品的DGGE譜圖的差異性證明了湖水特性,尤其是湖水的鹽分濃度,對(duì)細(xì)菌種屬的分布有較大影響。該結(jié)果提示,鹽度可以作為對(duì)鹽湖菌群保護(hù)的重要指標(biāo)之一。對(duì)同為硫酸鎂亞型的鹽湖和咸淡水湖中的研究表明,在鹽湖生態(tài)系統(tǒng)中,鹽度和p H值是決定生物物種多樣性的關(guān)鍵因素。并提出將330 g/L作為硫酸鎂亞型鹽湖生態(tài)變化控制的參考臨界值。
[1] 柴麗紅,崔曉龍,彭謙,等.青海兩鹽湖細(xì)菌多樣性研究[J].微生物學(xué)報(bào),2004,44(3):271-275.
[2]Whitman W B,Coleman D C,Wiebe W J.Prokaryotes:The unseen majority[J].Proceedings of the National Academy of Sciences,1998,93:6578-6583.
[3]Dunber J,Barns S M,Ticknor L O,et al.Empirical and theoretical bacterial diversity infour Arizona soil[J].Applied &Environmental Microbiology,2002,68:3035-3045.
[4]Torsvik V,Ovreas T F.Prokaryotic diversity magnitude,dynamics,and controlling factors[J].Science,2002,296:1064-1066.
[5] 柴麗紅,王濤,李沁元,等.應(yīng)用DGGE法對(duì)青海相鄰兩鹽湖中細(xì)菌多樣性的快速檢測(cè)[J].生物學(xué)雜志,2003,20(1):13-15.
[6] 李文均,徐平,徐麗華,等.極端環(huán)境中的放線菌資源 [J].微生物學(xué)通報(bào),2003,30(4):125-127.
[7] 蔡艷,薛泉宏,陳占全,等.青海湖水及湖濱鹽化土壤放線菌的分類及耐鹽性[J].微生物學(xué)雜志,2005,25(4):100-101.
[8] 米琴,張玉琴,陳義光,等.青海鹽環(huán)境下革蘭氏陽(yáng)性中度嗜鹽細(xì)菌的分離及其生物學(xué)特性 [J].陜西師范大學(xué)學(xué)報(bào):自然科學(xué)版,2005,33(3):87-90.
[9] 葉央芳,嚴(yán)小軍,黃曉春,等.青海鹽湖嗜鹽微生物類群及F16菌株生長(zhǎng)特性和抗菌、抗腫瘤活性 [J].應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào),2006,17(10):1996-1998.
[10]Weisburg W G,Barns S M,Pelletier D A,et al.16S ribosomal DNA amplification for phylogenetic study[J].Journal of Bacteriology,1991,173:697-703.
[11]Baker G C,Smith J J,Cowan D A.Review and re-analysis of Domain-specific 16S primers[J].Journal of Microbiological Methods,2003,55(3):541-555.
[12]Amann R I,Ludwig W,Sehleifer K H.Phylogenetie identification and in situ detection of individual microbial cells without cultivation[J].Microbiological Reviews,1995,59:143-169.
[13]Muyzer G,Waal E D De,Uitterlinden A G.Profiling ofcomplex microbial populations by denaturing gradient gel electrophoresis analysis of polymerase chain reaction—amplified genes coding for 16S r RNA[J].Applied Environmental Microbiology,1993,59:695-700.
[14]Ferris M J,Muyzer G,Ward D M.Denaturing gradient gel electrophoresis profiles of 16S r RNA·defined populations inhabiting a hot spring microbial mat community[J].Applied Environmental Microbiology,1996,62(2):340-346.
[15] 薩姆布魯克J,弗里奇E F,曼尼阿蒂斯S.分子克隆實(shí)驗(yàn)指南[M].北京:科學(xué)出版社,1992.
[16] 顧曉穎,李冠,吳敏.巴里坤湖和馬納斯湖嗜鹽菌的分離及功能酶的篩選[J].生物技術(shù),2007,17(26):26-30.
[17] 于升松.察爾汗鹽湖首采區(qū)鉀鹵水動(dòng)態(tài)及其預(yù)測(cè) [M].北京:科學(xué)出版社,2000.