段惠生 張安盛 李麗莉 門(mén)興元 張思聰 周仙紅 于毅
摘要:西花薊馬是一種危險(xiǎn)性較強(qiáng)的外來(lái)入侵害蟲(chóng),對(duì)我國(guó)的農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)以及生物多樣性都造成了極大的損失和威脅。本文概述了分子標(biāo)記技術(shù)在西花薊馬的種類(lèi)鑒定、種群分化、原產(chǎn)地、傳播模式、檢測(cè)其捕食天敵的效能和攜帶番茄斑萎病毒(TSWV)等方面的應(yīng)用,并做了前景展望。
關(guān)鍵詞:西花薊馬;分子標(biāo)記;種類(lèi)鑒定;種群分化;傳播模式;TSWV
中圖分類(lèi)號(hào):S433.89文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)號(hào):A文章編號(hào):1001-4942(2012)01-0099-05
西花薊馬(Frankliniella occidentalis)屬纓翅目(Thysanoptera)、薊馬科(Thripidae),是一種世界性入侵害蟲(chóng)。該蟲(chóng)原產(chǎn)于美國(guó)西部地區(qū),自20世紀(jì)80年代后,迅速向外擴(kuò)散,2003年首次在北京發(fā)現(xiàn),目前該蟲(chóng)分布遍及全球各大洲。在我國(guó)。北京、云南、浙江、山東、貴州和江蘇等省市都已有分布和為害的相關(guān)報(bào)道。西花薊馬具有極端多食性,不僅本身對(duì)農(nóng)作物危害極大,并且還可以傳播番茄斑萎病毒屬(Tospovirus)等多屬的植物病毒,造成更嚴(yán)重的損失。西花薊馬不僅對(duì)世界經(jīng)濟(jì)造成了極大損失,而且對(duì)入侵地的生物多樣性構(gòu)成了巨大的威脅,因此各國(guó)學(xué)者對(duì)其早已展開(kāi)了多方面深入的研究。從20世紀(jì)80年代開(kāi)始,由于分子生物學(xué)的飛速發(fā)展,出現(xiàn)了多種多樣的分子標(biāo)記技術(shù)。分子遺傳標(biāo)記突破了表達(dá)型標(biāo)記的局限性,其變異只來(lái)源于基因DNA序列的差異,具有穩(wěn)定性高、受環(huán)境條件的影響較小、信息含量高、不同層次和類(lèi)群之間廣泛可比等優(yōu)越性,因而成為遺傳標(biāo)記中又一強(qiáng)有力的工具,在揭示物種的遺傳變異性研究中發(fā)揮著獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)。分子標(biāo)記的發(fā)展對(duì)西花薊馬的研究提供了強(qiáng)有力的技術(shù)支持。
分子標(biāo)記技術(shù)目前已出現(xiàn)了幾十種,新的分子標(biāo)記還會(huì)不斷涌現(xiàn)。昆蟲(chóng)研究常用的一些分子標(biāo)記方法有,以Southern雜交為基礎(chǔ)的限制性?xún)?nèi)切酶酶切片段長(zhǎng)度多態(tài)性(restriction fragmentlength polymorphism,RFLP)和DNA指紋譜;以PCR為基礎(chǔ)的隨機(jī)擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性(randomamplified polymorphic DNA,RAPD)、DNA擴(kuò)增指紋分析(DNA amplification fingerprinting,DAF)、重復(fù)序列引物擴(kuò)增(simple repeat sequence primer-PCR,SRSP-PCR)、擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性(ampli-fied fragmemt length polymorphism,AFLP)、單鏈構(gòu)象多態(tài)性PCR(single-strand conformation poly-morphism-PCR,SSCP-PCR);以重復(fù)序列為基礎(chǔ)的簡(jiǎn)單重復(fù)序列即微衛(wèi)星DNA標(biāo)記(simplesequence repeat,SSR);以mRNA為基礎(chǔ)的mRNA差別顯示反轉(zhuǎn)錄PCR(mRNA differential displayreverse transcription polymerase chain reaction,DDRT-PCR)、DNA測(cè)序(DNA sequencing)以及單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymor-phism,SNP)。本文概述了分子標(biāo)記技術(shù)在西花薊馬研究中的應(yīng)用情況,并對(duì)其應(yīng)用前景做了展望。
1.分子標(biāo)記在西花薊馬研究中的應(yīng)用
1.1西花薊馬分子鑒定的研究
西花薊馬是一種危險(xiǎn)性較強(qiáng)的外來(lái)人侵害蟲(chóng),對(duì)于它的鑒定和分類(lèi)工作顯得尤為重要。西花薊馬的成蟲(chóng)在形態(tài)上具有明顯的特征,在顯微鏡下可以將其與其它近似種區(qū)別,但對(duì)于一些殘?bào)w、幼蟲(chóng)以及無(wú)法從形態(tài)上辨別的蟲(chóng)體,利用分子標(biāo)記技術(shù)可以準(zhǔn)確、快速地鑒定。國(guó)內(nèi)外學(xué)者在這方面已經(jīng)做了大量的工作。Moritz等(2000)采用內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(internal transcribedspacer,ITS)——限制片段長(zhǎng)度多態(tài)性(ITS-RFLP)的方法,成功地將西花薊馬和美棘薊馬(Echinothrips americanus Morgan)區(qū)分開(kāi);Toda和Komazaki(2002)采用ITS2-RFLP法鑒別日本果樹(shù)上常見(jiàn)的9種薊馬(包括西花薊馬)的成蟲(chóng)和幼蟲(chóng);Brunner等(2002)根據(jù)mtCO I-433bp的擴(kuò)增產(chǎn)物,結(jié)合測(cè)序和擴(kuò)增產(chǎn)物RFLP分析,有效區(qū)分了西花薊馬、煙薊馬(Thrips tabaciLindeman)和棕櫚薊馬(Thrips palmi Karny);林峻賢等(2003)則基于28S rDNA和16S rDNA探討Multiplex-PCR及PCR-RFLP鑒定西花薊馬和煙薊馬的可行性。采用PCR產(chǎn)物直接測(cè)序法,游中華等(2007)對(duì)包括西花薊馬在內(nèi)的9種薊馬的mtDNA CO I基因片段(433bp)進(jìn)行了序列分析,準(zhǔn)確地檢測(cè)了各蟲(chóng)態(tài)的西花薊馬。
在田間的防治和檢驗(yàn)檢疫部門(mén)日常工作中時(shí)常會(huì)遇到有多種薊馬的樣本,這就需要用種特異PCR檢測(cè)(species-Specific PCR,SSP)。它是利用序列信息已知的DNA片段設(shè)計(jì)種特異引物進(jìn)而鑒定薊馬種類(lèi)。例如周力兵等(2007)利用Brunner等設(shè)計(jì)的簡(jiǎn)并引物mtDNA-7.2F和mtDNA-9.2R擴(kuò)增出了6種薊馬的mtDNA CO I基因片段,并且設(shè)計(jì)了西花薊馬特異性引物F.OL1/F.OR和F.OL2/F.OR,該兩對(duì)引物能夠?qū)⑽骰ㄋE馬的成蟲(chóng)、幼蟲(chóng)、蛹同花薊馬(Fran-kliniella intonsa)、黃胸薊馬(Thrips hawaiiensis)、八節(jié)黃薊馬(Thrips flavidulus)、煙薊馬(Thripstabaci Lindeman)和大薊馬(Megalurothrips distal-is)5種薊馬區(qū)分。游中華(2008)通過(guò)對(duì)西花薊馬近緣種的15種薊馬的ITS2序列分析對(duì)比,設(shè)計(jì)了一對(duì)西花薊馬特異性引物YW-ITS2-F和YW-ITS2-F,該引物可以準(zhǔn)確地將西花薊馬與其它十幾種薊馬區(qū)分。孟祥欽等(2010)采用特征序列擴(kuò)增區(qū)域(SCAR)標(biāo)記技術(shù)獲得了對(duì)西花薊馬具有特異擴(kuò)增效果的引物1對(duì)(FOMF/FOMR),該對(duì)引物不僅對(duì)不同蟲(chóng)態(tài)的西花薊馬具有擴(kuò)增能力,而且在西花薊馬發(fā)生地的寄主植物組織內(nèi)亦檢測(cè)到了其卵的存在。
由此可見(jiàn),mtDNA CO I和rDNA ITS2基因序列是國(guó)內(nèi)外學(xué)者常用于研究西花薊馬分子鑒定的兩種分子標(biāo)記,這兩種分子標(biāo)記都有一定的保守性,又具有適當(dāng)?shù)淖儺惗?,同時(shí)運(yùn)用這兩種標(biāo)記的分子鑒定技術(shù)已經(jīng)十分成熟,操作簡(jiǎn)單,鑒定速度快,而且準(zhǔn)確,因此得到廣泛的研究應(yīng)用。
1.2西花薊馬種群分化的研究
種群分化是指同一生物群體在不同的生存環(huán)境條件下,經(jīng)過(guò)長(zhǎng)期的進(jìn)化,彼此之間出現(xiàn)了形態(tài)
上、行為上和生理上甚至遺傳上不同程度的差異,這種差異或大或小,表現(xiàn)為彼此遺傳關(guān)系的遠(yuǎn)近。種群的分化,在更多的情況下,是潛在的遺傳差異,為進(jìn)一步的分化提供著遺傳多樣性的基礎(chǔ)。對(duì)于外來(lái)入侵害蟲(chóng)種群,如若在入侵地產(chǎn)生明顯的種群分化,那么將有可能導(dǎo)致該入侵害蟲(chóng)的大暴發(fā)。研究種群內(nèi)遺傳變異、種群間遺傳分化的過(guò)程及程度,對(duì)于理解物種的進(jìn)化趨勢(shì)以及種群動(dòng)態(tài)規(guī)律具有基礎(chǔ)性的意義,進(jìn)而對(duì)入侵害蟲(chóng)的治理起到重要指導(dǎo)作用。
目前,利用各種分子標(biāo)記技術(shù)來(lái)研究昆蟲(chóng)種群遺傳分化已經(jīng)成為昆蟲(chóng)生態(tài)學(xué)研究的熱點(diǎn)問(wèn)題之一。武曉云等(2009)利用PCR技術(shù)克隆并分析了西花薊馬的rDNA ITS2和mtCO I基因5'末端的部分序列。結(jié)果發(fā)現(xiàn),由于rDNA ITS2變異程度較mtCO I基因大,因此mtCO I基因較rDNA ITS2更適合于西花薊馬的種內(nèi)遺傳分析;入侵我國(guó)的西花薊馬可能是由兩個(gè)(或多個(gè))株系或隱存種組成的復(fù)合體,并推測(cè)入侵我國(guó)的西花薊馬以溫室系(greenhouse strain)為主體,也存在一定數(shù)量的羽扇豆系(lupin strain)。Brunner等(2010)利用mtCO I基因和微衛(wèi)星分子標(biāo)記(SSR)技術(shù)對(duì)美國(guó)西部地區(qū)西花薊馬種群進(jìn)行種群遺傳結(jié)構(gòu)分析,結(jié)果表明在起源地西花薊馬種群發(fā)生了分化,發(fā)現(xiàn)這種遺傳分化與形態(tài)上的分化并不一致,并且討論了該地區(qū)的種群分化是由棲息地的環(huán)境不同(地理隔離)造成的。
用于該方面研究的分子標(biāo)記技術(shù)從先前的用mtCO I、rDNA ITS1、rDNA ITS2基因序列分析,到目前廣泛使用的SSR技術(shù),兩種技術(shù)相互補(bǔ)充,能夠得到較為全面的結(jié)果。例如對(duì)我國(guó)的煙粉虱、美國(guó)白蛾以及蘋(píng)果綿蚜的研究。
1.3西花薊馬原產(chǎn)地及其傳播模式分析
西花薊馬原產(chǎn)于美國(guó)西部地區(qū),后來(lái)隨著各國(guó)花卉業(yè)不斷發(fā)展,國(guó)際間貿(mào)易的頻繁逐步擴(kuò)散到世界各國(guó)。2000年,在我國(guó)昆明國(guó)際花卉節(jié)參展的緬甸盆景上首次截獲西花薊馬。目前我國(guó)的多個(gè)省份已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了西花薊馬,對(duì)我國(guó)的經(jīng)濟(jì)造成了一定的損失,對(duì)我國(guó)本土的生物多樣性也產(chǎn)生了威脅。研究我國(guó)西花薊馬的原產(chǎn)地及其傳播模式,對(duì)于重新構(gòu)建西花薊馬的入侵過(guò)程,及時(shí)尋找并引進(jìn)天敵,了解入侵初始種群大小及頻率,闡明生物在入侵過(guò)程中或入侵后的生物學(xué)變化,預(yù)測(cè)入侵物種的生物學(xué)特性以及借鑒有效的防治措施等具有重要的意義。
對(duì)于入侵種的原產(chǎn)地及其傳播模式的研究,傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)無(wú)法做出準(zhǔn)確判斷,而利用先進(jìn)的分子生物學(xué)技術(shù),使這一入侵生態(tài)學(xué)問(wèn)題得到有效地解決。將我國(guó)的西花薊馬種群與國(guó)外各地區(qū)的種群進(jìn)行分子遺傳分化的對(duì)比分析,計(jì)算種群之間的遺傳距離,從而判斷親緣關(guān)系的遠(yuǎn)近。這方面運(yùn)用較多且研究較為成功的分子標(biāo)記技術(shù)是利用mtCO I基因和rDNA ITS2基因序列,例如,武曉云等(2009)采用mtCO I基因序列建樹(shù)分析云南、北京和哈爾濱的西花薊馬,推斷云南是西花薊馬最早入侵的地點(diǎn),并且推測(cè)3個(gè)地區(qū)的西花薊馬可能是有相似的入侵來(lái)源。國(guó)內(nèi)也有成功運(yùn)用mtCO I分析種群分化的例子,如褚棟等(2005)基于mtDNA CO I對(duì)我國(guó)煙粉虱種群與國(guó)外煙粉虱種群進(jìn)行序列分析和構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),結(jié)果表明,我國(guó)廣大地區(qū)暴發(fā)成災(zāi)的煙粉虱為B型煙粉虱,與美國(guó)西部地區(qū)以及以色列的煙粉虱具有極高的同源性;首次發(fā)現(xiàn)Q型煙粉虱入侵我國(guó),而發(fā)現(xiàn)的Q型煙粉虱與西班牙、摩洛哥的Q型煙粉虱有極高同源性。
目前對(duì)于西花薊馬種群遺傳分析,國(guó)內(nèi)外學(xué)者多采用,mtCO I和rDNA ITS2基因序列這兩種手段,但由于這兩種分子標(biāo)記相對(duì)保守,適合于分析遺傳分化較大的生物型或地理種群,對(duì)于研究更詳細(xì)的原產(chǎn)地分析則需要多態(tài)性更高的分子標(biāo)記,如SSR標(biāo)記。
1.4西花薊馬天敵的研究
目前西花薊馬僅在我國(guó)局部地區(qū)分布危害,而且由于其抗藥性強(qiáng),利用本土天敵進(jìn)行生物防治是一項(xiàng)有效的措施。目前,西花薊馬的捕食性天敵種類(lèi)有30余種。國(guó)外利用且取得顯著成效的主要包括半翅目的蝽科和捕食螨。捕食性天敵對(duì)西花薊馬的控制效能是不一樣的,選擇出控制效能高的捕食陛天敵對(duì)于今后生物防治將起到關(guān)鍵性作用。
對(duì)于捕食者—獵物關(guān)系的研究,傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)方法有多種,但卻有著部分捕食現(xiàn)象觀察難度大、室內(nèi)難以重建田間植被結(jié)構(gòu)和微環(huán)境、難以考慮多種因素的交互作用等局限性,隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展,這方面的研究技術(shù)也就從形態(tài)學(xué)水平發(fā)展到了分子水平。利用分子標(biāo)記技術(shù)能夠靈敏而特異地檢測(cè)捕食者體內(nèi)獵物殘?bào)w,從而準(zhǔn)確反映出捕食者對(duì)西花薊馬的捕食能力的大小。此方面研究應(yīng)用的分子生物學(xué)技術(shù)主要為兩類(lèi):一類(lèi)是以蛋白質(zhì)為研究對(duì)象的血清學(xué)抗體技術(shù),一類(lèi)是以DNA為研究對(duì)象的分子標(biāo)記技術(shù)。前者常用的分子技術(shù)有聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測(cè)、多克隆抗體免疫檢測(cè)、酶聯(lián)免疫吸附法、單克隆抗體技術(shù);,后者常用的有RAPD、RFLP、SCAR、微衛(wèi)星標(biāo)記技術(shù)、DNA序列中的mtCO I、mtCOⅡ、rDNA ITS2以及實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)。
實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)是在常規(guī)PCR的體系內(nèi)加入熒光染料或帶有熒光染料標(biāo)記的探針,熒光信號(hào)隨著目的DNA的擴(kuò)增而增強(qiáng),通過(guò)檢測(cè)信號(hào)判斷目的DNA的數(shù)量,進(jìn)而鑒定標(biāo)本是否為靶標(biāo)種類(lèi),如棕櫚薊馬、煙薊馬等。孟祥欽(2010)選取mtCO I為標(biāo)靶DNA,利用TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量PCR法檢測(cè)了9種西花薊馬的捕食性天敵,結(jié)果表明,捕食性天敵中東亞小花蝽的瞬時(shí)捕食能力最強(qiáng),而異色瓢蟲(chóng)的捕食能力最低,同時(shí)該實(shí)驗(yàn)利用CO I和SCAR分子標(biāo)記技術(shù)建立了本地天敵對(duì)西花薊馬捕食作用的定性檢測(cè)技術(shù)。
分子標(biāo)記在此方面的研究也是有缺陷的,它不能區(qū)分捕食與腐食、二級(jí)捕食,因此形態(tài)學(xué)方法同分子生物學(xué)方法應(yīng)結(jié)合運(yùn)用,發(fā)揮各自的優(yōu)點(diǎn),從而使得西花薊馬天敵的研究能夠得到長(zhǎng)足發(fā)展。
1.5西花薊馬體內(nèi)番茄斑萎病毒(TSWV)的檢測(cè)
番茄斑萎病毒((Tomato spotted wilt virus,TSWV)屬于布尼亞病毒科(Bunyaviridae),番茄斑萎病毒屬(Tospovirus)病毒,其傳播介體為薊馬。薊馬由若蟲(chóng)在病株上取食獲毒,成蟲(chóng)不能獲毒,但能夠?qū)R恍缘匾猿志眯缘姆绞絺鞑?,即薊馬一旦獲毒終身能夠傳毒。西花薊馬是番茄斑萎病毒最主要也是最有效的傳播介體。近年來(lái),隨著西花薊馬的不斷擴(kuò)散,番茄斑萎病毒也在全世界不斷地?cái)U(kuò)散傳播,造成世界農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)損失不斷加重。因此,各國(guó)學(xué)者逐步重視對(duì)西花薊馬攜帶的番茄斑萎病毒的研究。雖然西花薊馬是番茄斑萎病毒最主要的傳播介體,但并不是每個(gè)西花薊馬個(gè)體中都攜帶有番茄斑萎病毒,因此檢測(cè)某地區(qū)的西花薊馬體內(nèi)是否有番茄斑萎病毒顯得尤為關(guān)鍵。
檢測(cè)薊馬體內(nèi)的番茄斑萎病毒的方法有很多,像ELISA、電鏡觀察、核酸圓點(diǎn)印跡法以及免疫壓片印跡法。但這些方法在處理高通量的樣本時(shí)都存在不同的缺陷,電鏡觀察過(guò)于耗費(fèi)時(shí)間,ELISA因?yàn)闆](méi)有結(jié)構(gòu)性蛋白而靈敏度較差,免疫壓片印跡法在問(wèn)題的解釋上有一定的困難;除此之外,在ELISA和免疫壓片印跡法都會(huì)產(chǎn)生假陽(yáng)性現(xiàn)象。
TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量PCR(RT-PCR)是常用于檢測(cè)薊馬體內(nèi)病毒的分子標(biāo)記技術(shù),它免去了PCR后續(xù)的檢測(cè)步驟,縮短了操作時(shí)間,顯著降低了PCR后操作污染的可能性,而且靈敏度更高,可以更加快速、高通量的檢測(cè)樣品,同時(shí)由于它是定量的,能夠檢測(cè)病毒與薊馬間的交互作用。Boonham以西花薊馬的核RNA為標(biāo)靶,初步探討了利用實(shí)時(shí)熒光RT-PCR探針檢測(cè)西花薊馬體內(nèi)是否攜帶番茄斑萎病毒的可能性,結(jié)果表明,這種方法不僅可以檢測(cè)單頭的個(gè)體,同時(shí)也適合應(yīng)用于大通量的樣品檢測(cè)。
2.小結(jié)與展望
從上述事例來(lái)看,目前分子標(biāo)記技術(shù)以其靈敏、快速、準(zhǔn)確的特點(diǎn)廣泛應(yīng)用在西花薊馬的研究中,極大地?cái)U(kuò)展了西花薊馬研究領(lǐng)域,豐富了研究手段。分子標(biāo)記技術(shù)種類(lèi)繁多,而且每種技術(shù)本身都有優(yōu)缺點(diǎn),因此在應(yīng)用的同時(shí)應(yīng)該綜合利弊,選取合適的標(biāo)記技術(shù),以達(dá)到靈敏而準(zhǔn)確的目的,以免造成不必要的浪費(fèi)。
西花薊馬是一種危險(xiǎn)性外來(lái)入侵害蟲(chóng),它的入侵機(jī)制、傳播模式等人侵生態(tài)學(xué)問(wèn)題是需要我們重點(diǎn)關(guān)注的。利用分子生物學(xué)技術(shù)來(lái)研究西花薊馬的生物適應(yīng)、競(jìng)爭(zhēng)等成功入侵因素,成為未來(lái)我們研究西花薊馬的重點(diǎn)和難點(diǎn),也是一個(gè)重要的突破口。國(guó)外對(duì)西花薊馬的研究起步早,研究范圍廣,但我國(guó)對(duì)西花薊馬的研究起步較晚,最早的報(bào)道始于2000年。為防止西花薊馬對(duì)我國(guó)經(jīng)濟(jì)造成的損失不斷加劇,我們?cè)诶^續(xù)深入地研究西花薊馬的同時(shí),不斷地開(kāi)發(fā)新的技術(shù)手段,從而更好地為將來(lái)的研究服務(wù)。煙粉虱也是一種世界性的入侵害蟲(chóng),對(duì)全球經(jīng)濟(jì)造成過(guò)重大損失,目前各國(guó)對(duì)其研究已經(jīng)十分深入而卓有成效,從其生物學(xué)特性研究到入侵生態(tài)學(xué)研究,分子標(biāo)記技術(shù)起到了關(guān)鍵性作用。對(duì)于西花薊馬的研究,筆者認(rèn)為可以以煙粉虱研究為模板,結(jié)合西花薊馬本身特性以及相關(guān)的分子標(biāo)記,繼續(xù)深入展開(kāi)研究。