王燕妮
D-對(duì)羥基苯甘氨酸生物合成研究進(jìn)展
王燕妮
D-對(duì)羥基苯甘氨酸是β-內(nèi)酰胺類半合成抗生素藥物中間體,廣泛應(yīng)用在醫(yī)藥領(lǐng)域。傳統(tǒng)的D-對(duì)羥基苯甘氨酸的合成主要是化學(xué)合成和生物酶催化法。研究人員在天藍(lán)色鏈霉菌中發(fā)現(xiàn)羥基扁桃氧化酶基因(hmo)、羥基扁桃酸合酶基因(hmas)和對(duì)羥基苯甘氨酸轉(zhuǎn)移酶基因(hpgt)的基因簇。人們將來自不同菌種的hmo,hmas,hpgt基因整合到大腸桿菌中,實(shí)現(xiàn)了D-對(duì)羥基苯甘氨酸的生物全合成。
D-對(duì)羥基苯甘氨酸;生物全合成;基因改造;構(gòu)型反轉(zhuǎn)
D-對(duì)羥基苯甘氨酸(D-4-hydroxyphenylglycine),即D-HPG,是一種白色片狀固體, 微溶于水和甲醇,易溶于酸或堿溶液生成鹽。隨著科學(xué)技術(shù)的深入發(fā)展,D-HPG作為一種重要的化學(xué)、化工、醫(yī)藥等中間體,無論在用途上還是在用量上都發(fā)生了很大變化,在國民經(jīng)濟(jì)中占有重要的地位,尤其在合成青霉素、頭孢菌素等β-內(nèi)酰胺類半合成抗生素的生產(chǎn)中有著重要的應(yīng)用。[1]但是化學(xué)合成D-HPG的方法污染較大,會(huì)產(chǎn)生氰化物,而生物全合成的方法可以有效地避免氰化物污染,同時(shí)利用生物全合成可以提高原料的利用率,簡化生產(chǎn)過程,提高轉(zhuǎn)化效率,減低生產(chǎn)成本。所以研究D-HPG生物全合成具有重要的現(xiàn)實(shí)意義。
國內(nèi)從八十年代開始著手研究,到九十年代中期開始小規(guī)模生產(chǎn)。生產(chǎn)初期主要是化學(xué)合成方法, 對(duì)羥基苯甲醛法(Strecker 氨基酸合成法):[2]
圖一 Strecker 氨基酸合成法
這種方法的工藝成熟,收率較高,但由于對(duì)羥基苯甲酸的成本很高,生產(chǎn)過程中還有氰化物產(chǎn)生,毒性高,污染嚴(yán)重,污水處理復(fù)雜,這種方法現(xiàn)在已經(jīng)很少使用。
相比與化學(xué)合成,生物催化法的污染較小,反應(yīng)條件相對(duì)溫和,而且選擇性和轉(zhuǎn)化效率都有一定的優(yōu)勢。所以人們漸漸重視生物催化法的研究,主要集中在利用D, L-對(duì)羥基苯海因( D, L-HPH ) 為原料經(jīng)酶催化合成D-HPG 的方法上。首先,人們開始使用單酶法,單酶法的優(yōu)點(diǎn)是可以使底物的利用率達(dá)到100%,但還是有使用化學(xué)方法的步驟,污染嚴(yán)重問題仍是單酶法的首要限制。單酶法之后,人們相繼地研究出兩酶兩菌法,兩酶一菌法等,但都存在著生物菌種篩選困難、生物酶易失活、無法大規(guī)模生產(chǎn)等問題。
3.1 D-對(duì)羥基苯甘氨酸生物全合成的可能性。
2002年,Hojati等在天藍(lán)色鏈霉菌發(fā)現(xiàn)了羥基扁桃合酶基因(hmas)、羥基扁桃氧化酶基因(hmo)和對(duì)羥基苯甘氨酸轉(zhuǎn)移酶基因(hpgt)的基因簇。[3]通過研究,發(fā)現(xiàn)這三個(gè)基因轉(zhuǎn)錄得到的酶可以將對(duì)羥基苯丙酮酸轉(zhuǎn)化成L-對(duì)羥基苯甘氨酸。
圖二 L-對(duì)羥基苯甘氨酸生物合成路徑
通過上述途徑,我們可以推斷出hmas,hmo,hpgt這三個(gè)基因很可能組成了一個(gè)獨(dú)立的操縱子。這是人們首次在生物體發(fā)現(xiàn)對(duì)羥基苯甘氨酸的合成途徑,雖然構(gòu)型是左旋的,與目標(biāo)產(chǎn)物構(gòu)型相反,但這也為實(shí)現(xiàn)其生物全合成奠定基礎(chǔ)。在Hojati研究的基礎(chǔ)上,越來越多的人著手對(duì)hmas,hmo,hpgt這三個(gè)基因的組合進(jìn)行研究了。
3.2 羥基扁桃合酶基因(hmas)。
人們?cè)谘芯可锖铣扇f古霉素類抗生素(Vancomycin Group of Antibiotics)的途徑時(shí)曾經(jīng)用到過羥基扁桃酸合酶(HMAS),發(fā)現(xiàn)HMAS能將對(duì)羥基苯丙酮酸氧化成對(duì)羥基扁桃酸。研究發(fā)現(xiàn)HMAS與對(duì)羥基苯丙酮酸雙加氧酶(4-HPPD)在構(gòu)型和功能上有很大聯(lián)系。[4]HMAS與HPPD有43%的氨基酸堿基序列是相同的,而且還有相同的底物。當(dāng)對(duì)HPPD進(jìn)行突變時(shí),可以得到與HMAS相同活性的酶。
2004年,Borowski等人在對(duì)HMAS進(jìn)行的研究時(shí)發(fā)現(xiàn)HMAS具有與4-HPPD相同的鐵離子結(jié)合位點(diǎn),[5]所以應(yīng)用4-HPPD的催化循環(huán)反應(yīng)模式對(duì)HMAS進(jìn)行苯羥基化活性的實(shí)驗(yàn),結(jié)果顯示,靠近鐵結(jié)合位點(diǎn)的單個(gè)氨基酸突變點(diǎn)是會(huì)影響4-HPPD產(chǎn)物特異性的,因?yàn)镠MAS就是由4-HPPD點(diǎn)突變得到的。
3.3 羥基扁桃氧化酶基因(hmo)。
1976年,Santhoor等人在研究凸形假單胞菌(Pseudomonasconvexa)時(shí)發(fā)現(xiàn),[6]在扁桃酸代謝途徑上與其他微生物不同。在凸形假單胞菌中,芳香族扁桃酸在氧化降解的第一步是在對(duì)位上進(jìn)行羥基化,得到對(duì)羥基扁桃酸,對(duì)羥基扁桃酸又經(jīng)氧化最終得到對(duì)羥基苯甲醛。進(jìn)而發(fā)現(xiàn)了L-對(duì)羥基扁桃酸氧化酶(L-4-Hydroxymandelate Oxidase)。
Santhoor等人還將L-4-HMO從凸形假單胞菌中提純?cè)鋈?,并?duì)其反應(yīng)的最優(yōu)條件進(jìn)行測定:在pH是6.6,溫度為55℃時(shí),L-4-HMO活性最大。
L-4-HMO在催化作用時(shí)需要消耗FAD,如果用FMN代替FAD,L-4-HMO只能發(fā)揮75%的活性。阿的平(對(duì)黃素依賴酶有特異性抑制作用)對(duì)上述反應(yīng)有強(qiáng)烈抑制作用。在反應(yīng)中,L-4-HMO需要二價(jià)錳離子增加酶活性。錳離子在很多反應(yīng)中都有提高酶活性的作用,大部分這樣的反應(yīng)對(duì)陽離子的選擇都是沒有特異性的,錳離子可以被其他的二價(jià)金屬離子取代。但是在L-4-HMO的反應(yīng)中,沒有任何金屬離子可以代替二價(jià)錳離子。
3.4 對(duì)羥基苯甘氨酸轉(zhuǎn)移酶基因(hpgt)。
氨基酸在經(jīng)過氨基轉(zhuǎn)移酶的作用之后得出的產(chǎn)物是具有立體構(gòu)型保留性的,即左旋氨基酸轉(zhuǎn)氨基作用后還是左旋的。這種氨基轉(zhuǎn)移酶在植物和細(xì)菌中廣泛存在著。對(duì)于左旋與右旋氨基酸之間的相互轉(zhuǎn)化研究甚少。但是人們?cè)谑┦霞賳伟邪l(fā)現(xiàn)對(duì)羥基苯甘氨酸轉(zhuǎn)移酶(4-Hydroxyphenylglycine aminotransferase),[7]它可以完成L-谷氨酸到D-苯甘氨酸或D-對(duì)羥基苯甘氨酸的轉(zhuǎn)化。
從施氏假單胞菌中提純的HPGT與普通的轉(zhuǎn)氨酶一樣,在典型吡哆醛依賴酶抑制劑的環(huán)境下被抑制,在堿性環(huán)境中活性增強(qiáng)。它跟普通轉(zhuǎn)氨酶也有不同之處:左旋轉(zhuǎn)氨酶以左旋氨基酸為底物,產(chǎn)物為左旋氨基酸,右旋轉(zhuǎn)氨酶以右旋氨基酸為底物,產(chǎn)物為右旋氨基酸;而HPGT只將L-谷氨酸作為氨基供體,將苯乙醛酸或?qū)αu基苯乙醛酸作為氨基受體,最后得到D-苯甘氨酸或D-對(duì)羥基苯甘氨酸。在逆反應(yīng)中,HPGT只將D-苯甘氨酸或D-對(duì)羥基苯甘氨酸作為氨基供體,將α-酮戊二酸作為氨基受體,最后得到L-谷氨酸。這就是HPGT的特別之處,只有這三種底物。
圖三 HPGT的催化路徑
HPGT在反應(yīng)過程中會(huì)受到酸堿度和溫度的影響,有研究表明:[8]pH小于6時(shí),酶活性很低,隨著堿性增強(qiáng),酶活性越來越好,在pH為9-10之間,活性達(dá)到最大,當(dāng)pH大于10.5時(shí),酶活性迅速下降,pH大于12時(shí),酶失活;溫度在35到50之間,酶都具有較高的活性,溫度過高會(huì)導(dǎo)致酶失活,如果將其0度冷凍2個(gè)月,并不會(huì)對(duì)活性有太大的影響。
3.5 在大腸桿菌中實(shí)現(xiàn)D-對(duì)羥基苯甘氨酸生物合成。
天然的大腸桿菌是沒有hmas、hmo、hpgt這三個(gè)基因的,為了在大腸桿菌中實(shí)現(xiàn)D-對(duì)羥基苯甘氨酸的合成,人們把hmas,hmo,hpgt這三個(gè)不屬于大腸桿菌的基因整合到一個(gè)質(zhì)粒上,并轉(zhuǎn)到大腸里,實(shí)現(xiàn)了其合成。[9]這三個(gè)基因分類來自三個(gè)不同菌種:hpgt來自惡臭假單胞菌;hmo來自天藍(lán)色鏈霉菌;hmas來自東方擬無枝酸菌。
圖四 在大腸桿菌中構(gòu)建D-HPG的生物合成路徑
hmas、hmo兩個(gè)基因在東方擬無枝酸菌和天藍(lán)色鏈霉菌中都存在,Muller等人將兩個(gè)菌種的目標(biāo)片段進(jìn)行PCR擴(kuò)增,然后連接到阿拉伯糖誘導(dǎo)表達(dá)質(zhì)粒上,分別導(dǎo)入大腸桿菌中,對(duì)其粗提物進(jìn)行高效色譜分析,通過對(duì)比,天藍(lán)色鏈霉菌中的HMO,東方擬無枝酸菌HMAS的活性較高,所以在構(gòu)建反應(yīng)的前兩步的基因分別來自東方擬無枝酸菌和天藍(lán)色鏈霉菌。
選定好所用的基因后,將它們一次連接到載體上,導(dǎo)入大腸桿菌中。把苯乙醛酸和L-谷氨酸作為底物,對(duì)大腸桿菌的粗提物進(jìn)行高相色譜分析發(fā)現(xiàn),L-苯甘氨酸是不存在的。同樣,用對(duì)羥基苯乙醛酸做底物會(huì)得到D-對(duì)羥基苯甘氨酸。這說明改造后基因序列是可以表達(dá)的。
D-對(duì)羥基苯甘氨酸作為重要的抗生素藥物中間體在醫(yī)藥領(lǐng)域需求量與日俱增,傳統(tǒng)的化學(xué)合成和生物酶催化方法不能有效平衡生產(chǎn)效率和環(huán)境污染,人們的研究方向逐漸向生物全合成轉(zhuǎn)變。Muller已經(jīng)成功構(gòu)建了合成D-HPG的基因,并在大腸桿菌中能夠表達(dá)。
生物全合成D-對(duì)羥基苯甘氨酸中用到的三個(gè)基因(hmas,hmo,hpgt)都可以在進(jìn)一步的研究中進(jìn)行優(yōu)化。在上文中提到,HMAS和HPPD的堿基序列相似度很高,甚至可以通過突變HPPD得到與HMAS相同活性的酶。我們可以將上述途徑中第一步HMAS催化過程用HPPD點(diǎn)突變產(chǎn)物來代替。同時(shí),對(duì)比兩段基因在大腸桿菌中表達(dá)情況、兩個(gè)酶的活性、轉(zhuǎn)化效率、需要底物濃度等,可以更好地了解HMAS和HPPD的異同,以便進(jìn)一步優(yōu)化生物全合成D-對(duì)羥基苯甘氨酸途徑。
HPGT的發(fā)現(xiàn)無疑是整條生物全合成路徑中最關(guān)鍵的一步,HPGT不僅使合成路徑縮短,而且將其簡單化,D-對(duì)羥基苯甘氨酸生物全合成的可能性大大增強(qiáng)。不過HPGT對(duì)于底物的要求較高,只有三種物質(zhì)可以與其結(jié)合,這也多多少少限制一些需要構(gòu)型反轉(zhuǎn)的反應(yīng)。對(duì)于HPGT可以嘗試定點(diǎn)突變,嘗試改變底物結(jié)合位點(diǎn),擴(kuò)大底物的接受能力。如果能得到底物限制較少的HPGT,在生物全合成中實(shí)現(xiàn)構(gòu)型反轉(zhuǎn)將不再是難事。
在合成D-對(duì)羥基苯甘氨酸的路徑中有許多副產(chǎn)品。副產(chǎn)品比較多可能是受大腸桿菌中自身的氨基轉(zhuǎn)移酶和底物的影響,研究應(yīng)該嘗試敲出一些無用基因或干擾基因,提高D-苯甘氨酸的純度,這樣也可以簡化D-苯甘氨酸的提純步驟,這些也同樣可以應(yīng)用到研究開發(fā)D-對(duì)羥基苯甘氨酸的生物全合成中。
[1] 駢巖杰,趙繼全.D-對(duì)羥基苯甘氨酸合成的研究進(jìn)展[J],精細(xì)石油化工,2010,27:66—71.
[2] Degner Dieter, Pander Hans Joachim, Siegel Hardo. 4-tert- Butoxyphenylglycinnitril and methods for D-(-)-and L-(+)-4-hydroxyphenylglycine [P]. DE 3002543. 1981.
[3] Zohreh Hojati, Claire Milne, Barbara Harvey, Lyndsey Gordon, Matthew Borg, Fiona Flett, Barrie Wilkinson, Philip J. Sidebottom, Brian A.M. Rudd, Martin A. Hayes, Colin P. Smith, and Jason Micklefield. Structure, Biosynthetic Origin, and Engineered Biosynthesis of Calcium-Dependent Antibiotics from Streptomyces coelicolor. Chemistry & Biology, Vol. 9, 1175-1187, November, 2002.
[4] Gunsior, M., Ravel, J., Challis, G. L., and Townsend, C. A. (2004) Engineering p-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase to a p-hydroxymandelate synthase and evidence for the proposed benzene oxide intermediate in homogentisate formation, Biochemistry 43, 663-674
[5] Tomasz Borowski, Arianna Bassan, and Per E. M. Siegbahn.(2004) 4-Hydroxyphenylpyruvate Dioxygenase: A Hybrid Density Functional Study of the Catalytic Reaction Mechanism. Biochemistry 2004, 43, 12331-12342.
[6] Santhoor G. BHAT and Chelakara S. VAIDYANATHAN.(1976) Purification and Properties of L-4-Hydroxymandelate Oxidase from Pseudomonas convexa. Eur. J. Biochem. 68, 323-331 (1976).
[7] Beggs, J.D., Fewson, C.A., 1977. Regulation of synthesis of benzyl alcolhol dehydrogenase in Acinetobacter calcoaceticus NCIB8250. J. Gen. Microbiol. 103, 127-140.
[8] Suthep Wiyakrutta, Vithaya Meevootisom.1997. A stereo-inverting D-phenylglycine aminotransferase from Pseudomonas stutzeri ST-201: purification, characterization and application for D-phenylglycine synthesis. Journal of Biotechnology 55 (1997) 193-203
[9] Ulrike Muller,F(xiàn)riso van Assema, Michele Gunsior, Sonja Orf, Susanne Kremer, Dick Schipper, Anja Wagemans, Craig A. Townsend,Theo Sonke, Roel Bovenberg, Marcel Wubbolts. Metabolic engineering of the E. coli L-phenylalanine pathway for the production of D-phenylglycine (D-Phg). Metabolic Engineering 8 (2006) 196-208
ClassNo.:O625DocumentMark:A
(責(zé)任編輯:鄭英玲)
ProceedingsofD-4-hydroxyphenylglycineBiosynthesis
Wang Yanni
D-4-hydroxyphenylglycine is an important medicine intermediate of β-lactam semi-synthetic antibiotics such as penicillin and cephalosporin, and is widely used in the disease treatment. The traditional methods of D-4-hydroxyphenylglycine synthesis are chemical synthesis and enzyme catalysis. Previous researches proved that there is a gene cluster that contains hydroxymandelate synthase (hmas), hydroxymandelate oxidase (hmo), and the hydroxyphenylglycine aminotransferase(hpgt) in Streptomyces coelicolor. To produce D-HPG, these three genes were combined together in E. coli strains, which resulted in the first completely fermentative production of D-HPG.
D-4-hydroxyphenylglycine; synthetic biology; genetic modification; stereo invert
王燕妮,學(xué)生,天津大學(xué)化工學(xué)院制藥工程系,天津。郵政編碼:300072
1672-6758(2011)11-0061-2
O625
A