劉良專 游曉星 徐磊 吳移謀
肺炎嗜衣原體Pmp21蛋白原核表達載體的構(gòu)建
劉良專 游曉星 徐磊 吳移謀
目的 PCR擴增肺炎嗜衣原體多形態(tài)膜蛋白Pmp21基因,構(gòu)建pGEX-6p-2/Pmp21原核表達載體。方法 篩選Pmp21優(yōu)勢抗原表位,PCR法擴增Pmp21目的基因;并亞克隆至pGEX6p-2原核表達載體;經(jīng)PCR與測序鑒定。結(jié)果 軟件分析選擇Pmp21優(yōu)勢抗原表位編碼基因的154bp~885bp位堿基序列,設(shè)計引物PCR法擴增得到目的片段;構(gòu)建重組質(zhì)粒經(jīng)測序鑒定, BLAST比對與Genbank上登錄序列完全一致。結(jié)論 成功構(gòu)建pGEX-6p-2/Pmp21載體,為研究Pmp21在Cpn感染中的作用奠定基礎(chǔ)。
肺炎嗜衣原體;Pmp21;載體
肺炎嗜衣原體多形態(tài)膜蛋白(polymorphic membrane proteins,Pmp)的發(fā)現(xiàn)是衣原體全基因序列分析的重大成果[1]。發(fā)現(xiàn)Cpn有21個基因編碼Pmp1~Pmp21[2-4],其中PmpD (Pmp21)引起了人們的廣泛重視[5]。為此,本研究克隆Pmp21優(yōu)勢抗原表位,為探討其在Cpn感染中的應(yīng)用奠定實驗基礎(chǔ)。
1.1 材料
1.1.1 菌株、載體 Cpn AR39株、pGEX-6p-2載體南華大學(xué)病原生物學(xué)研究所保存。
1.1.2 主要試劑與試驗動物 限制性內(nèi)切酶、DNA 聚合酶均為MBI產(chǎn)品、 DNA標(biāo)準(zhǔn)、蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)MBI公司。
1.2 方法
1.2.1 Pmp6和Pmp21基因序列的獲取 登陸互聯(lián)網(wǎng)登陸(http://stdgen.northwestern.edu/),獲取Pmp21堿基序列,其Gene ID為Cpn0963。
1.2.2 Pmp21蛋白優(yōu)勢抗原表位的預(yù)測 登陸互聯(lián)網(wǎng)登陸http://www.expasy.org/tools/protscale.html,輸入Pmp21的核苷酸序列,篩選Pmp21優(yōu)勢抗原表位。
1.2.3 原核表達載體pGEX-6p-2/ Pmp21的構(gòu)建與鑒定 prime 5設(shè)計 PCR引物, P1 序列為 5’-CGC GGATCC TCTGCTCATGTTGAAGAGGC -3’, P2序列為5’- TTTTCCTTTT GCGGCCGC CACAATGGGTCACAACAATG-3’,引入 BamHI和 NotI 酶切位點及保護性堿基。PCR反應(yīng)條件為:95℃ 3min預(yù)變性,95℃45s, 53℃ 30s,72℃2.5min,循環(huán)28次,72℃延伸8min 終止反應(yīng), 產(chǎn)物經(jīng) 1.5% 瓊脂糖凝膠電泳分析,純化后克隆到pGEX-6p-2上,并轉(zhuǎn)化入E.coli BL21中,經(jīng)PCR篩選和測序(上海生工公司)鑒定。
2.1 Pmp6、Pmp21優(yōu)勢抗原表位預(yù)測結(jié)果
經(jīng)Expasy軟件分析Pmp21基因的抗原表位結(jié)果顯示,其整個分子抗原性均較強,存在多個強抗原表位,其親水性和可及性參數(shù)結(jié)果如圖1、圖2。
圖1 親水性分析
圖2 可及性分析
2.2 Pmp21編碼基因的PCR擴增
以重組質(zhì)粒及Cpn AR-39株全基因組DNA為模板,PCR分別擴增Pmp21基因片段,1.0%的瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果顯示擴增出特異性目的基因與預(yù)期片段大小一致(圖3)。
圖3 PCR擴增Pmp6、Pmp21PCR產(chǎn)物1.5%瓊脂糖電泳分析(1) 陰性對照; (2)陽性對照(756bp); (3)DNA marker;(4) Pmp21 PCR 產(chǎn)物 (732bp); (5)PCR鑒定產(chǎn)物
2.3 基因測序結(jié)果與Blast分析
將原核表達載體進行測序鑒定,并用Blast軟件對測序結(jié)果與GenBank上登陸的目的序列進行比較分析,表明擴增的目的基因序列與GenBank公布的基因序列相同,且密碼子讀碼框無移位。
本實驗表明選用的Pmp蛋白有較強的免疫反應(yīng)性和抗原性,且軟件分析存在多個抗原優(yōu)勢表位;我們選取的基因片段高度保守,并與其他已知基因同源性低,在以后的實驗中可以避免抗原之間的交叉反應(yīng),從而有利于提高實驗方法的特異性和靈敏性;目前國內(nèi)外尚無這種蛋白在Cpn感染中的應(yīng)用研究報道[6]。為此,本研究克隆Pmp21優(yōu)勢抗原表位,為探討其在Cpn 感染中的應(yīng)用奠定實驗基礎(chǔ)。
本研究中所使用的克隆和表達載體pGEX-6P-2,其多克隆酶切位點含有BamHI/NotI,檢索發(fā)現(xiàn)在本研究預(yù)測基因的完整序列中沒有該酶切位點,從而選用該組限制性內(nèi)切酶作為該基因克隆的工具酶。此外,由于使用該載體進行轉(zhuǎn)化表達后的蛋白為GST融合蛋白,這為進一步分離純化目的蛋白提供了依據(jù)。我們依據(jù)基因庫提供的基因序列設(shè)計引物,且選擇了雙酶切方法,能使目的基因定向插入到pGEX-6P-2載體上。并使用不同的方法對重組體進行鑒定:起初通過PCR方法對轉(zhuǎn)化后在選擇培養(yǎng)基上生長的細(xì)菌克隆進行初步篩選,篩選到陽性克隆。再對篩選陽性克隆進一步培養(yǎng)后進行測序鑒定,并與基因庫提供的基因序列進行比對,最后進一步證實克隆到載體中目的基因序列的正確性,為該蛋白的后續(xù)研究奠定了基礎(chǔ)。
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10.3969/j.issn.1009-4393.2011.36.026
國家自然科學(xué)基金資助(No. 30870134/ c010902)
421001 南華大學(xué)病原生物研究所 (劉良專 游曉星 徐磊吳移謀)
吳移謀 E-mail:yimouwu@sina.com.cn