張志瑞,陳莉婭,任衛(wèi)萍,楊 芒
(1.蘭州大學(xué)第一醫(yī)院口腔科,甘肅 蘭州 730000;2.甘肅省人民醫(yī)院口腔科,甘肅 蘭州 730000)
甘肅省漢族、回族人非綜合征唇腭裂與轉(zhuǎn)化生長因子-α的基因多態(tài)性相關(guān)性研究
張志瑞1,陳莉婭1,任衛(wèi)萍2,楊 芒1
(1.蘭州大學(xué)第一醫(yī)院口腔科,甘肅 蘭州 730000;2.甘肅省人民醫(yī)院口腔科,甘肅 蘭州 730000)
目的研究甘肅省漢族和回族人非綜合征唇腭裂與轉(zhuǎn)化生長因子-α(Transforming Growth Fator-α,TGF-α)基因多態(tài)性的相關(guān)性。方法 采用聚合酶鏈反應(yīng)——限制性酶切片段長度多態(tài)(PCR-RFLP)的方法對50例漢族非綜合征唇腭裂患者與25例正常漢族人,50例回族非綜合征唇腭裂患者與18例正?;刈迦诉M行TGF-α基因檢測分析。結(jié)果甘肅省漢族、回族非綜合征唇腭裂(NSCL/P)患者的C2等位基因頻率較正常人明顯增高,2組比較有顯著性差異(P<0.05),漢族和回族人NSCL/P患者等位基因頻率、基因型均無顯著性差異。結(jié)論TGF-α基因多態(tài)性與甘肅省漢族、回族人群非綜合征唇腭裂的發(fā)生有關(guān)聯(lián)。
甘肅省漢族、回族人;非綜合征唇腭裂;轉(zhuǎn)化生長因子-α;基因多態(tài)性
唇腭裂是口腔顏面部最常見的發(fā)育畸形,常伴發(fā)牙頜系統(tǒng)畸形,是一種復(fù)雜的、由遺傳和環(huán)境因素相互作用所致的多基因、多因素遺傳病。而非綜合征唇腭裂(NSCL/P)是指不伴有全身其他疾病的單純的唇裂或腭裂與唇裂伴腭裂。國內(nèi)外研究證明,遺傳因素在非綜合征唇腭裂的發(fā)病因素中占有舉足輕重的地位。由于唇腭裂病因的復(fù)雜性、遺傳模式的不確定性、不同地區(qū)甚至不同表型NSCL/P的候選基因存在差異,有大量的研究數(shù)據(jù)表明,唇腭裂的發(fā)生存在人種、地域的差異。
本研究通過采用聚合酶鏈反應(yīng)——限制性酶切片段長度多態(tài)(PCR-RFLP)的方法,對甘肅省50例漢族非綜合征唇腭裂患者與25例漢族正常人,50例回族非綜合征唇腭裂患者與18例回族正常人進行TGF-α的研究,進一步探究TGF-α基因與甘肅省漢族、回族人群非綜合征唇腭裂發(fā)生的相關(guān)性。
1.1主要試劑和儀器
PCR擴增試劑盒(天根生物公司生產(chǎn)),限制性內(nèi)切酶、耐熱DNA多聚酶、DNA Marer、瓊脂糖為Promega公司產(chǎn)品,血液DNA提取試劑盒及淋巴細胞分離液(均購自上海生工生物公司),TGF-α基因TaqI限制性片段多態(tài)性特異性PCR擴增引物[1],上游引物為:5’-TCA CTTCCC CTT TTTCATCTG-T-3’,下游引物為:CGA GGA GGC TCTGAG GTG-3’。Gerpro凝膠自動分析和成像系統(tǒng)、ABI9700PCR擴增儀(美國制造),水平離心機(北京醫(yī)學(xué)離心機廠制造),Heraeus低溫高溫離心機(德國制造)。
1.2 病例選擇
非綜合征唇腭裂患者均為在甘肅省內(nèi)長期居住并參加了蘭州大學(xué)第一醫(yī)院口腔頜面外科“微笑行動”與“微笑列車”活動的患者。選取漢族、回族單純唇裂或單純腭裂或唇裂合并腭裂的非綜合征患者為實驗組,年齡3個月~18歲。對照組均為相應(yīng)民族正常人志愿者,參試者均在知情同意下進行,且無系統(tǒng)性疾病,近期未服用藥物。
1.3 方法
所有參試者抽取外周血3m l加EDTA抗凝后,嚴(yán)格按照純化試劑盒的操作說明提取DNA,用核酸分析儀進行DNA的定量,稀釋后備用。反應(yīng)體系:PCR總反應(yīng)體系25μl,其中含待測模板1μl,dNTP 2.5μl,TaqDNA聚合酶1μl及其相應(yīng)的10xbuffer2.5μl,上、下游引物各1μl,用去離子水補足14μl,2xTapPCR Mastermix(Mgcl2,dNTP,Taq 酶,緩沖液 )放入 PCR擴增儀內(nèi),93℃預(yù)變性 3min,93℃變性 30 s,54.5℃退火 30 s,72℃延伸 30 s,10 個循環(huán),然后 93℃變性 30 s,54.5℃退火 30 s,72℃延伸30 s,22個循環(huán),最后72℃延伸 10min。取PCR產(chǎn)物10μl,加TaqI限制性內(nèi)切酶8 U及相應(yīng)的10xbuffer 2μl,0.1%BSA 2μl,65℃水浴酶切6 h以上。電泳分析酶切產(chǎn)物,取15μl酶切產(chǎn)物上樣,在4%瓊脂糖凝膠上進行電泳,紫外燈下觀察結(jié)果,確定個體的基因型。
1.4 統(tǒng)計學(xué)分析
采用SPSS11.0統(tǒng)計軟件處理數(shù)據(jù),計數(shù)資料采用χ2檢驗。
2.1 TGF-α基因型分析
PCR擴增產(chǎn)物為一條178 bp(174 bp)片段,經(jīng)過TaqI酶切后可產(chǎn)生 2條片段(122 bp和 52 bp),3種基因型:(1)C1C1型(正常純合子),僅有178 bp一條片段且不能被酶切;(2)C1C2型(雜合子),酶切后產(chǎn)178 bp、122 bp和52 bp 3條片段;(3)C2C2型(突變純合子),產(chǎn)生122 bp及52 bp 2條片段。
2.2 TGF-α/Taq I基因多態(tài)性(見表1)
表1 實驗組與對照組TGF-α的等位基因與基因型的分布頻率
根據(jù)電泳結(jié)果確定被檢測人員的基因型及基因頻率,如表1所示,漢、回族實驗組與對照組的TGF-α等位基因C2頻率比較有顯著性差異(P<0.05),而漢、回族人群非綜合征唇腭裂組等位基因頻率無顯著性差異(P>0.05),C1C1、C1C2、C2C2 基因型頻率無顯著性差異(P>0.05)。
近年來研究表明,新生兒畸形率呈上升趨勢,而唇腭裂畸形發(fā)生率上升較為迅速,我國的發(fā)病率為0.182%[1]。盡管其發(fā)病因素不明確,但遺傳和孕期環(huán)境因素是目前公認(rèn)的發(fā)病原因,其中基因的多態(tài)性變異成為主要的致病因素。TGF-α是一種生長因子,屬于表皮生長因子家族,能刺激上皮細胞的增生并誘導(dǎo)其分化,對許多細胞的生長具有調(diào)節(jié)作用。在小鼠發(fā)育的腭突中,TGF-α得以廣泛表達,該基因可刺激腭突細胞合成細胞外基質(zhì),對腭突的生長、上抬和融合都有重要的作用[2]。1989年,Ardinger等[3]首次以高加索人群為研究對象,發(fā)現(xiàn)TGF-α基因多態(tài)性與非綜合征唇腭裂有顯著的關(guān)聯(lián),而Yasushi等[4]的研究也發(fā)現(xiàn),該基因的多態(tài)性與NSCL/P的發(fā)生存在相關(guān)性;Lidra等[5]對菲律賓人群的研究發(fā)現(xiàn),TGF-α與NSCL/P的發(fā)生無關(guān)聯(lián),國內(nèi)學(xué)者袁奎封[6]的研究表明,TGF-α可能與山東漢族人非綜合征唇腭裂的發(fā)生有關(guān),由此可見,TGF-α基因在非綜合征唇腭裂發(fā)生中的作用存在人群特異性。本研究采集漢族、回族非綜合征唇腭裂患者及相應(yīng)民族的健康人對照,分別抽取其外周血,通過分子生物學(xué)PCR的方法,分析位于2號染色體上的基因位點[7]——TGF-α與甘肅省漢族、回族人群非綜合征唇腭裂有顯著關(guān)聯(lián),而在甘肅省漢族、回族人群非綜合征唇腭裂患者之間無顯著性差異,這說明TGF-α可能是甘肅省漢族、回族人群非綜合征唇腭裂患者的候選基因,但在漢、回族之間并無特異性的選擇,這將為我們今后對唇腭裂發(fā)生的候選基因的探究提供參考依據(jù)。
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1671-1246(2011)16-0104-02
Vol.29 2011 No.16
蘭州大學(xué)青年基金資助項目(2010-1-12)