王 鶴(綜述),王朝霞(審校)
南京醫(yī)科大學(xué)第二附屬醫(yī)院腫瘤科,江蘇 南京 210011
MicroRNA(簡稱miRNA)是非編碼小RNA家族的成員之一,長度為18~25個(gè)堿基,通過堿基互補(bǔ)原理結(jié)合到靶基因mRNA的3'端非編碼區(qū)(3'UTR),抑制mRNA的翻譯或誘導(dǎo)其降解從而改變靶蛋白的表達(dá)水平。
miRNA在許多腫瘤中存在異常表達(dá)或突變現(xiàn)象,它們可能起到原癌基因和抑癌基因的作用,可以為腫瘤的診斷和生物治療提供新的靶標(biāo)。1993年,Lee等[1]首先在秀麗新小桿線蟲發(fā)現(xiàn)miRNA這一家族的第一個(gè)成員lin-4。lin-14基因的突變使得線蟲能夠蛻皮,但只能停留在L1階段,不能發(fā)育為成蟲。lin-14編碼一個(gè)核內(nèi)蛋白,負(fù)責(zé)幼蟲從L1階段到L2階段的細(xì)胞分裂。lin-4通過堿基配對的方式結(jié)合到靶基因lin-14的mRNA的3'UTR,抑制lin-14的翻譯。2000年Reinhart等[2]發(fā)現(xiàn)了另一個(gè)類似的具有轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié)功能的小分子RNA:let-7。隨后,在多種生物物種中鑒別出上千種miRNAs。
miRNA體內(nèi)的形成過程大致如下:在細(xì)胞核內(nèi),首先由聚合酶Ⅱ或聚合酶Ⅲ轉(zhuǎn)錄合成pri-miRNA,由RNaseⅢ內(nèi)切酶Drosha剪切得到約70個(gè)核苷酸的莖環(huán)型中間物premiRNA,在Ran-GTP和運(yùn)輸受體Exportin-5的共同作用下,pre-miRNA出核轉(zhuǎn)運(yùn)到胞漿,由另一種RNaseⅢ內(nèi)切酶Dicer剪切加工,將莖環(huán)結(jié)構(gòu)的pre-miRNA加工為雙螺旋結(jié)構(gòu)miRNA-miRNA。雙鏈解開后,成熟的單鏈miRNA隨后進(jìn)入RNA介導(dǎo)的沉默復(fù)合物(RNA induced silencing complex,RISC)中。單鏈miRNA與RISC結(jié)合形成miRNP復(fù)合體后,miRNA通過與靶基因的3′UTR區(qū)互補(bǔ)配對,指導(dǎo)miRNP復(fù)合體對靶基因mRNA進(jìn)行切割或者翻譯抑制從而在轉(zhuǎn)錄后沉默基因,并通過細(xì)胞內(nèi)復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)狀調(diào)控體系,對生物體的發(fā)育、分化、增殖、凋亡、免疫調(diào)控等生理活動(dòng)進(jìn)行精確調(diào)節(jié)。
miRNA在許多腫瘤中存在異常表達(dá)或突變現(xiàn)象,推測它們可能起到原癌基因和抑癌基因的作用。且有研究表明,50%以上的miRNA定位在腫瘤相關(guān)基因組區(qū)域,包括LOH區(qū)、染色體擴(kuò)增區(qū)及脆性位點(diǎn)等。通過對人肺癌、乳腺癌、胃腸癌、胰腺癌、肝癌等腫瘤組織miRNA表達(dá)譜的分析,發(fā)現(xiàn)每一種腫瘤都有眾多特定的miRNA表達(dá)相對于正常組織發(fā)生變化,讓越來越多的科研人員將研究重點(diǎn)轉(zhuǎn)移到miRNA與腫瘤發(fā)生的密切關(guān)系上。
肺癌是癌癥相關(guān)性死亡的頭號殺手,總的5年生存率不到15%,其中非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)占所有肺癌病例的80%以上,由于大多數(shù)患者在患病早期沒有明顯的癥狀,確診時(shí)多已進(jìn)入中晚期階段,治療效果及預(yù)后較差。但研究顯示Ⅰ期NSCLC患者術(shù)后5年生存率達(dá)到83%,所以早發(fā)現(xiàn),早診斷仍是肺癌治療的關(guān)鍵。miRNA的表達(dá)具有時(shí)空特異性。在不同組織、不同發(fā)育階段中miRNA的水平有顯著差異,這種miRNAs表達(dá)模式具有分化的位相性和時(shí)序性。miRNA的表達(dá)譜,不僅指miRNA的種類,也指各種miRNA的豐度,直接反映了細(xì)胞組織的分化發(fā)育狀態(tài)。miRNA在不同腫瘤中具有特定的表達(dá)模式,這為腫瘤的基因診斷提供了一種新方法。
Jiang等[3]在52例非小細(xì)胞肺癌病例中發(fā)現(xiàn)has-miR-125a-3p和has-miR-125a-5p(分別位于pre-miR-125a的3′端和5′端的兩種成熟MicroRNA)在癌組織中均比周圍正常組織表達(dá)低。本課題組利用miRNA芯片技術(shù),獲得了NSCLC的miRNA表達(dá)圖譜,并通過熒光實(shí)時(shí)定量PCR鑒定了40個(gè)差異表達(dá)的miRNAs[4]。結(jié)果發(fā)現(xiàn),與正常組織相比較,在非小細(xì)胞肺癌組織中miR-451表達(dá)顯著降低。Yu等[5]利用RT-PCR分析 112例非小細(xì)胞肺癌患者組織 miR-21、let-7a、miR-137、miR-182和miR-372的表達(dá)情況,發(fā)現(xiàn)可以利用這些microRNA的綜合表達(dá)情況來對患者進(jìn)行診斷。
單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)主要是指在基因組水平上由單個(gè)核苷酸的變異所引起的DNA序列多態(tài)性。SNP在人類基因組中廣泛存在,平均每500~1000個(gè)堿基對中就有1個(gè),SNP自身的特性決定了它在遺傳性疾病研究中具有重要意義。Tian等[6]在中國1058例肺癌患者和1035例正常對照組檢測miR-196a2 SNP rs11614913發(fā)現(xiàn),突變型純合子CC較雜合子TC及野生型純合子TT的肺癌易感性提高了約25%。Chin等[7]發(fā)現(xiàn)在每年吸煙少于40包的非小細(xì)胞肺癌患者中,miR-let-7與其靶基因KRAS的3′UTR的完全匹配區(qū)的第6位點(diǎn)(LCS6)等位基因突變率為18.1%~20.3%,而正常人僅為5.8%;另外,體外研究發(fā)現(xiàn)LCS6發(fā)生突變的miR-let-7,相應(yīng)地出現(xiàn)KRAS表達(dá)增高,提示miR-let-7 LCS6突變可以作為此類非小細(xì)胞肺癌診斷的易感指標(biāo)。Xiong等[8]對666例小細(xì)胞肺癌與758例正常對照組比較發(fā)現(xiàn),miR-18273′UTR的rs3134615的基因型與小細(xì)胞肺癌的易感性相關(guān),相對于GG基因型,GT、TT基因型的優(yōu)勢比為2.08。
隨著肺癌生物靶向治療的發(fā)展,對于非小細(xì)胞肺癌的精確分型顯得尤為重要。對122例非小細(xì)胞肺癌標(biāo)本(62例鱗癌,60例腺癌)進(jìn)行表達(dá)譜分析及qRT-PCR驗(yàn)證的方法發(fā)現(xiàn)has-miR-205在非小細(xì)胞肺癌的腺、鱗癌分型中,對鱗癌的敏感性達(dá)96%,特異性達(dá)90%[9]。Raponi等[10]運(yùn)用交叉驗(yàn)證分析,證明了miR-146b診斷鱗癌具有很高的精確性。Yu等[11]對肺腺癌痰液的miRNA表達(dá)譜分析及驗(yàn)證發(fā)現(xiàn),miR-21、miR-486、miR-375、miR-200b對于區(qū)分肺腺癌與正常人的敏感性及特異性分別達(dá)到80.6%、91.7%。
外周血液循環(huán)中miRNA表達(dá)譜的變化作為有前景的診斷工具已經(jīng)越來越受到人們的關(guān)注。Heegaard等[12]對220例早期非小細(xì)胞肺癌與對應(yīng)的正常組的血清及血漿miRNA檢測發(fā)現(xiàn), 血清中 miR-146b、miR-221、let-7a、miR-155、miR-17-5p、miR-27a和 miR-106a較正常組表達(dá)顯著下降而miR-29c顯著增高;血漿中miR-let7b與不良預(yù)后存在密切關(guān)系,miR-223特異性表達(dá)于NSCLC IA/B期。對肺癌不同時(shí)期的904個(gè)血清miRNA分析發(fā)現(xiàn),伴隨肺癌的發(fā)生發(fā)展,存在不同時(shí)期的特異miRNA譜。對400例NSCLC患者與220例正常對照組血清miRNA進(jìn)行qRT-PCR及危險(xiǎn)評分提示,10個(gè)血清miRNA可高特異性、高敏感性診斷早期非小細(xì)胞肺癌[13]。Foss等[14]發(fā)現(xiàn) miR-1254、miR-574-5P 作為早期肺癌的診斷指標(biāo),敏感性與特異性分別達(dá)82%、77%。
生物體通過多層次、精確的內(nèi)部調(diào)節(jié)機(jī)制,完成發(fā)育、分化、代謝等各項(xiàng)正常的生理活動(dòng)。一旦這些調(diào)控系統(tǒng)出現(xiàn)紊亂,細(xì)胞失去對分化、增殖、凋亡等過程正確及時(shí)的調(diào)控,正常的組織形態(tài)就會(huì)出現(xiàn)惡性轉(zhuǎn)化,導(dǎo)致腫瘤發(fā)生。miRNA作為原癌基因或抑癌基因,參與上述過程的調(diào)控,與腫瘤的靶向生物治療存在密切關(guān)系。
在香港女性中,非吸煙肺腺癌患者中70%的患者存在EGFR突變。研究發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)染has-miR-145可抑制存在EGFR突變的肺腺癌細(xì)胞株HCC4006、NCI-H1975、NCI-H1734的增殖。miR-192通過調(diào)控靶基因RB1可增強(qiáng)肺癌細(xì)胞增殖[15]。miR-182通過靶作用于CTTN能抑制A549肺癌細(xì)胞株增殖[16]。miR-145可通過下調(diào)EGFR、NUDT1和c-myc的表達(dá)抑制肺癌細(xì)胞增殖[17-19]。 miR-93、miR-98、miR-197 通過下調(diào)抑癌基因FUS1的表達(dá)而起到抑制肺癌生長、發(fā)展的作用且與肺癌患者總體生存率密切相關(guān)。miR-let-7a可通過靶作用于NIRF上調(diào)P21WAF1的表達(dá)而抑制肺腺癌A549細(xì)胞增殖。體內(nèi)研究發(fā)現(xiàn),miR-let-7a通過抑制KRAS和c-myc的表達(dá)來抑制裸鼠肺癌生長[19]。
Liu等[20]發(fā)現(xiàn),肺癌中在細(xì)胞水平過表達(dá)miR-126通過靶作用VEGF使A549、Y-90與SPC-A1等細(xì)胞株細(xì)胞周期停滯在G1期,抑制腫瘤細(xì)胞的生長;在活體水平,慢病毒轉(zhuǎn)染miR-126的A549細(xì)胞株接種的裸鼠體重較對照組下降22.4%。Bandi等[21]發(fā)現(xiàn),在非小細(xì)胞肺癌中,生理濃度的miR-15a、miR-16以 Rb依賴的方式靶作用于 CCND1,CCND2,CCNE1而使細(xì)胞周期停滯在G1期。另一項(xiàng)研究[22]顯示miR-107、miR-185同樣具有使細(xì)胞周期停滯在G1期的能力,尤其是miR-107;PCR及免疫印跡的方法證實(shí)CDK6為miR-107、miR-185 靶基因。 下調(diào) miR-21、miR-16、miR-181a表達(dá)使A549細(xì)胞株細(xì)胞周期停滯在S期從而抑制其生長。
Liu等[23]發(fā)現(xiàn)過表達(dá)的miR-494下調(diào)anti-BPDE誘導(dǎo)的肺癌細(xì)胞株16HBE中PTEN的表達(dá);過表達(dá)的miR-494抑制caspase3/7的活力,而低表達(dá)miR-494則可降低肺癌細(xì)胞的惡性程度。Crawford等[24]通過表達(dá)譜分析發(fā)現(xiàn)肺癌與肺癌周圍正常組織比較,miR-133B下調(diào)程度最大 (28.62倍);通過熒光素酶報(bào)告實(shí)驗(yàn)證實(shí)miR-133B的下游靶基因?yàn)镸CL-1、BCL2L2/BCL-W(兩者均為BCL-2家族抗凋亡蛋白)。過表達(dá)miR-133B沉默MCL-1和BCL2L2的表達(dá)聯(lián)合吉西他濱(非小細(xì)胞肺癌一線化療藥物且可通過BCL-2家族誘導(dǎo)凋亡)可誘導(dǎo)肺癌細(xì)胞株H2009的凋亡。另一項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)[25],無論是否吸煙、EGFR是否突變(突變型對EGFR-TKI敏感),低表達(dá)miR-21聯(lián)合EGFR-TKI都可誘導(dǎo)肺癌細(xì)胞的凋亡,提示miR-21可能成為肺癌靶向治療的有效靶點(diǎn)。過表達(dá)miR-192通過靶作用于RB1,激活caspase-7、PARP誘導(dǎo)肺癌細(xì)胞凋亡[15]。
近年來,腫瘤耐藥的問題逐漸成為人們關(guān)注的熱點(diǎn)。PC9/AB11細(xì)胞株(起源于PC9細(xì)胞株的耐吉西他濱肺腺癌細(xì)胞株)與PC9細(xì)胞株比較發(fā)現(xiàn),兩者的細(xì)胞倍增時(shí)間、細(xì)胞周期分布、半數(shù)抑制濃度(IC50)存在顯著性差異;miRNA表達(dá)譜分析比較發(fā)現(xiàn)miRNA同樣存在差異性表達(dá)[26]。體內(nèi)外研究發(fā)現(xiàn),肺癌中過表達(dá)miR-135a可導(dǎo)致紫杉醇耐藥,部分通過下調(diào)APC實(shí)現(xiàn)。研究發(fā)現(xiàn),過表達(dá)的miR-451通過AKT通路作用可使肺癌細(xì)胞株A549對順鉑(cisplatin,DDP)的敏感性增加[27]。 Garofalo等[28]發(fā)現(xiàn),在肺癌中,miR-221/222通過抑制靶基因PTEN和TIMP3的表達(dá)導(dǎo)致TRAIL耐藥。上調(diào)miR-7的表達(dá)可通過下調(diào)EGFR通路蛋白的表達(dá),增強(qiáng)喉鱗癌細(xì)胞株SQ20B、乳腺癌細(xì)胞株MDA-MD-468、肺癌細(xì)胞株A549、惡性膠質(zhì)瘤細(xì)胞株U251和U87的放療敏感性;相反下調(diào)miR-7的表達(dá)可通過上調(diào)EGFR及其下游分子的表達(dá),降低惡性膠質(zhì)瘤細(xì)胞株U251的放療敏感性[29]。受LIN28B調(diào)控的miR-let-7g通過下調(diào)KRAS可增強(qiáng)肺癌對電離輻射的敏感性。
肺癌治療的一大難點(diǎn)就是難以防治肺癌全身多處轉(zhuǎn)移。對肺正常組織、肺癌組織、肺正常支氣管上皮細(xì)胞株、肺癌細(xì)胞株的miR-206的real time PCR發(fā)現(xiàn),miR-206的表達(dá)與肺癌的侵襲性呈負(fù)相關(guān)[30]。miR-328、miR-330-3P可用于鑒別非小細(xì)胞肺癌是否發(fā)生腦轉(zhuǎn)移;而且,miR-328部分通過上調(diào)PRKCA表達(dá)使非小細(xì)胞肺癌具有侵襲、轉(zhuǎn)移能力[31]。Garofalo等[28]發(fā)現(xiàn),miR-200通過抑制EMT過程從而抑制肺癌侵襲、轉(zhuǎn)移。miR-221/222通過靶作用于PTEN和TIMP3,誘導(dǎo)肺癌轉(zhuǎn)移。miR-182通過靶作用CTTN抑制肺腺癌A549細(xì)胞侵襲[16]。miR-let-7g通過靶作用HMGA2下調(diào)E2F1抑制肺癌細(xì)胞株A549轉(zhuǎn)移[32]。miR-125a-5p通過EGFR通路負(fù)性調(diào)控肺癌細(xì)胞侵襲、轉(zhuǎn)移。
在肺癌領(lǐng)域中miRNA的研究尚處于起步階段,利用miRNA進(jìn)行肺癌診斷和治療還有許多尚未解決的問題。區(qū)別正常組織與腫瘤組織、有利于腫瘤的分期及分型的特征性miRNA譜有待于進(jìn)一步研究。miRNA可起抑癌或致癌作用,如何針對致癌miRNA設(shè)計(jì)反義分子,進(jìn)而導(dǎo)入高效特異表達(dá)致癌miRNA反義分子及抑癌miRNA并解決免疫排斥等安全性要求是我們需要思考的問題。基礎(chǔ)研究中很多miRNA的功能及其靶基因還沒被認(rèn)識(shí);大多數(shù)研究關(guān)注的是miRNA對靶基因的調(diào)控作用,而忽視了對miRNA基因表達(dá)的調(diào)控機(jī)制以及不同的miRNA之間是否有相互作用等的研究。筆者相信,隨著上述問題的解決,不久的將來miRNA將會(huì)為肺癌的診治帶來革命性的進(jìn)展。
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