朱利蘭
(徐州工程學(xué)院體育學(xué)院,江蘇 徐州 221008)
在眾多衰老理論中,Harman 提出的自由基學(xué)說占有重要的地位。其觀點認(rèn)為生物機體內(nèi)發(fā)生的化學(xué)反應(yīng),尤其是酶促氧化還原反應(yīng)會產(chǎn)生具有未配對電子的自由基(如原子、原子團、分子和離子等),其過多會對生物機體造成一系列損害[1]。酚類化合物是具有酚羥基的一類還原性物質(zhì),可抑制自動氧化、清除羥基、DPPH自由基、超氧陰離子等表現(xiàn)出抗氧化作用,且對人類的毒害較小[2]。因此,酚類化合物具有降血脂、抗動脈硬化、降低膽固醇、抗腫瘤、抗炎等功能,對糖尿病、癌瘤、心血管疾病等具有顯著療效。酚類化合物廣泛存在于動植物體內(nèi)[3-6],使之成為藥食同源食品。
結(jié)構(gòu)-活性的定量研究是目前國際上相當(dāng)活躍的前沿研究領(lǐng)域之一,并在藥物化學(xué)、環(huán)境化學(xué)、浮選及冶金、藥劑分子設(shè)計等方面得到了成功的應(yīng)用[7-10]。有關(guān)食品添加劑的分子結(jié)構(gòu)與抗氧化活性的關(guān)系,已有較多的實驗研究,但對其進行定量構(gòu)效關(guān)系研究較少[11-12]。文獻[13]選擇密度泛函理論(DFT)的6-31G*基組對多酚物質(zhì)進行量子化學(xué)精度計算,篩選出與抗氧化活性最相關(guān)的5個參數(shù),應(yīng)用相關(guān)及回歸分析方法建立了這5個參數(shù)與抗氧化活性的4種參數(shù)的構(gòu)效方程,為設(shè)計高活性抗氧化多酚類化合物提供理論參考。本實驗對這些多酚化合物的抗氧化性進行深入的構(gòu)效關(guān)系研究,采用劉樹深等[14-16]的電性距離矢量(Mk),通過最佳變量子集回歸(leaps- and-bounds regression,LBR)方法建立這4種抗氧化活性參數(shù)的最佳五元數(shù)學(xué)模型,揭示影響多酚類化合物抗氧化活性的結(jié)構(gòu)因素,為生物合理設(shè)計此類高抗氧化活性化合物提供有益的啟示。
2005年,Soobrattee等[17]用TEAC方法(其數(shù)據(jù)以“Te”表示)、鐵還原能力(FRAP)方法(其數(shù)據(jù)以“Fr”表示)、HOCl清除能力測定法(其數(shù)據(jù)以“Hc”表示)和脫氧核糖分析法(·OH清除能力, 其數(shù)據(jù)以“r”表示)評價了多酚類化合物的抗氧化能力。由于脫氧核糖分析法所得的羥自由基清除速率(單位為mol/s)及Hc數(shù)值較大,為了便于建模,令:
式(1)中的Hc0=1μmol/dm3,式(2)中的r0=1mol/s。以上具體數(shù)據(jù)見表1。
表1 4種方法測定33種多酚類化合物抗氧化活性數(shù)據(jù)[17]Table1 Antioxidant effects of 33 kinds of polyphenols determined by 4 assay methods
化合物結(jié)構(gòu)參數(shù)化是建立定量構(gòu)效關(guān)系(QSAR)模型的最重要步驟。近年來,該種技術(shù)特別是拓?fù)渲笖?shù)方法取得較大進展,提出了許多指數(shù)并得到廣泛應(yīng)用。本實驗運用劉樹深等[14-16]提出的分子電性距離矢量(MEDV)來表征有機分子結(jié)構(gòu),其計算過程如下:
首先根據(jù)有機化合物中出現(xiàn)的非氫原子(如C、N、O、S、P、F、Cl等)所處的環(huán)境不同,將其劃分為13種類型,每一種類型規(guī)定一個識別號(IDi),識別號定義為:
式中Ziv為價電子層電子數(shù)。非氫原子i在分子中所處的局部環(huán)境可用其所連接的其他非氫原子的數(shù)目(Ji)表示。將IDi與Ji加和便為非氫原子i的原子類型號(ki):
如苯酚中的氧原子的vO=6,JO=1,其kO=9。MEDV給出13種原子類型。本實驗中所用到的原子類型見表2。
考慮分子中非氫原子表現(xiàn)出的性質(zhì)與其電負(fù)性、成鍵特性密切相關(guān),從而在原子類型的基礎(chǔ)上定義了43種原子屬性的固有狀態(tài)值(Ii):
式中:N為非氫原子i的電子層數(shù),δi及δiv的定義為:
式中:σi、πi為非氫原子i成σ鍵、π鍵所用的電子數(shù),hi為與其直接鍵合的氫原子數(shù)。如苯酚中的氧原子的N=2、σ=2、π=0、h=1,則:
表2 本研究有機物分子的原子類型及固有狀態(tài)值Table2 Atomic types and intrinsic state values of organic compounds
本研究中所用到的9種原子類型和固有狀態(tài)值見表2。
計算分子中其他非氫原子對固有狀態(tài)值Ii的影響,即求增量ΔIi,假設(shè)所有其他非氫原子(j)對非氫原子(i)的固有狀態(tài)影響或增量是兩原子固有狀態(tài)之差,即(Ii-Ij)的函數(shù),且與兩個原子之間最短距離的平方成反比,那么某原子(i)固有狀態(tài)值Ii在分子中受到其他原子(j)的影響而增量(△Ii):
式中:dij為非氫原子i、j之間的最短拓?fù)渚嚯x即其間直接相連的邊的數(shù)目。如苯酚中的氧原子的ΔIO:
如苯酚中的氧原子的Ei:EO=IO+△IO=3.5822。
為了進一步考慮不同原子類型的非氫原子之間的電性拓?fù)渥饔?,定義了電性距離矢量(MEDV,Mkl):
式中:k、l分別為非氫原子i、j所屬的原子類型號。這13種原子類型兩兩相互作用,構(gòu)成91個MEDV,以“Mf”表示。例如苯酚中,與氧原子相連的碳原子的k=3,氧原子的l=9,它們的組合有1種MEDV:M32(即M3-9):
本研究化合物分子中共有8種原子類型:k=1、2、3、4、6、8、9、1 0。它們兩兩組合理論上可以構(gòu)成36種MEDV,但由于分子中可能只有某原子類型的一個原子,而無法兩兩組合,其值為零,故只有30種MEDV。它們依次為:M1、M2、M3、M4、M6、M8、M9、M10、M14、M15、M16、M18、M20、M21、M22、M26、M27、M29、M31、M32、M33、M42、M43、M56、M58、M59、M72、M77、M78、M82。
將每種化合物的電性距離矢量作為自變量,相應(yīng)的4種抗氧化活性數(shù)據(jù)為因變量(Kj)構(gòu)建4個數(shù)據(jù)集,對每個數(shù)據(jù)集分別應(yīng)用最佳子集回歸(LBR)選擇最佳變量組合,建立它們的QSAR模型。用方差膨脹因子(variance inflation factors,VIF)[18]評價模型中各自變量的多重相關(guān)性,如VIF=1,表明各自變量間完全不相關(guān);當(dāng)VIF<5時,說明變量間沒有明顯的自相關(guān)性;當(dāng)VIF>5時,說明變量間存在明顯的共線性,所建模型不能用于估算與預(yù)測。VIF的定義式為:
式中:R2為自變量X中某一變量與余下自變量的相關(guān)系數(shù)。
將文獻[13]中多酚類化合物的4個數(shù)據(jù)集分別輸入MITALAB14.0統(tǒng)計軟件系統(tǒng),利用其最佳變量子集回歸法對其進行變量的提取和計算分析。從統(tǒng)計學(xué)的角度考慮,一般認(rèn)為N/m值不能太小(N為試樣總量,m為所選變量),一般認(rèn)為比值大于5所得到的數(shù)學(xué)模型才比較穩(wěn)定。由于4個數(shù)據(jù)集中因變量的數(shù)值最少為28個,故本研究均建立最佳五元數(shù)學(xué)模型。表3列出這4個最佳變量組合模型及其樣本容量(n)、相關(guān)系數(shù)(R)、Fischer檢驗值(F)和估計標(biāo)準(zhǔn)誤差(s)。
表3 Mf和Kj的最佳變量子集回歸結(jié)果Table3 Results of leaps-bounds regression of Mf and Kj
在α=0.05顯著水平下,F(xiàn)ischer檢驗的臨界值為:F0.05(5,20)=2.71、F0.05(5,30)=2.53、F0.05(5,40)=2.45。由表3可見,本研究的F值均大于其臨界值,說明這些方程反映了多酚類化合物抗氧化活性的變化關(guān)系。
表3中Te模型的5個自變量的VIF值依次為1.455、2.384、2.395、1.176、1.210;Fr模型的5個自變量的VIF值依次為4.950、5.117、2.263、2.887、2.606;H模型的5個自變量的VIF值依次為2.078、2.502、1.147、5.052、4.098;G模型的5個自變量的VIF值依次為1.245、2.326、3.490、1.802、2.746。由此可見,這些模型的共線性較低,具有良好的穩(wěn)定性。
使用M15、M21、M33、M78、M82分別與Te、Fr、H、G建立回歸方程,它們的相關(guān)系數(shù)依次為0.687、0.651、0.756、0.727。與表3相比,相關(guān)程度稍有下降。說明這5個拓?fù)渲笖?shù)所隱含的分子結(jié)構(gòu)信息基本上就是影響多酚類化合物抗氧化活性的主要因素。與這5個拓?fù)渲笖?shù)描述子變量相關(guān)的分子結(jié)構(gòu)基團分別為—CH2—、—CH 、—OH、—O—,前兩個說明化合物分子中的非極性基團對抗氧化活性的影響,后3個表明分子中極性基團的空間分布對抗氧化活性的貢獻,因此,這些基團的存在,對多酚類化合物的抗氧化活性將產(chǎn)生很大影響。
使用電性距離矢量對多酚類化合物抗氧化活性的表征具有有效性、合理性,揭示了分子內(nèi)—CH2—、—CH 、—OH、—O—等基團對其抗氧化活性具有很大影響,為設(shè)計此類高抗氧化活性化合物提供有益的啟示。
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