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        137個(gè)遺傳性聾小家系的聾病分子流行病學(xué)研究

        2010-01-25 01:16:38鮑曉林郭玉芬劉曉雯徐百成郭家亮孫薔
        關(guān)鍵詞:檢測(cè)

        鮑曉林 郭玉芬 劉曉雯 徐百成 郭家亮 孫薔

        1 天津市泰達(dá)醫(yī)院耳鼻咽喉頭頸外科(天津 300457); 2 蘭州大學(xué)第二醫(yī)院耳鼻咽喉頭頸外科

        目前普遍認(rèn)為GJB2基因、線粒體DNA 12SrRNA A1555G和SLC26A4基因是最常見(jiàn)的遺傳性致聾因素,本研究對(duì)西北地區(qū)137個(gè)小家系中的耳聾患者進(jìn)行了這三種基因的突變檢測(cè),旨在探索其耳聾的發(fā)病機(jī)制,為預(yù)防和治療耳聾提供依據(jù),報(bào)告如下。

        1 資料與方法

        1.1 研究對(duì)象 中國(guó)西北地區(qū)有明確遺傳家族史的137個(gè)核心家系的170例耳聾患者,其中男112例,女58例,年齡6~24歲。其中單一患者家系106個(gè),雙患者家系29個(gè),三患者家系2個(gè)。

        1.2 調(diào)查方法

        1.2.1 填寫問(wèn)卷調(diào)查表 根據(jù)王秋菊等[1]提出的遺傳性聾資源的收集、保存的方法進(jìn)行聾病流行病學(xué)調(diào)查,主要包括患者耳聾的發(fā)生年齡、發(fā)病方式、耳聾的程度、感染史、發(fā)育史、母親的妊娠及分娩史、有無(wú)耳毒性藥物用藥史、有無(wú)耳聾高危新生兒疾病史以及有無(wú)其他系統(tǒng)疾病等[1~3]。詳細(xì)了解家系中有無(wú)耳聾及聾啞患者與先證者的關(guān)系。

        1.2.2 全身及耳鼻咽喉科常規(guī)檢查[3]在進(jìn)行全身及耳鼻咽喉科檢查時(shí),特別注意全身發(fā)育、眼部及甲狀腺的檢查以初步排除綜合征型聾,排除因中耳炎、腦膜炎、病毒性腦炎、腮腺炎及全身感染等因素所致的耳聾。

        1.2.3 繪制家系譜圖 采集家系成員的親緣關(guān)系背景資料,從先證者出發(fā),追溯家庭成員的親緣關(guān)系,結(jié)合病史資料和臨床聽(tīng)力學(xué)檢測(cè),應(yīng)用Cyrillic軟件繪制家系譜圖,確定遺傳方式。

        1.2.4 聽(tīng)力學(xué)檢測(cè)與評(píng)估 按照WHO(1997年)聽(tīng)力損失分級(jí)標(biāo)準(zhǔn)分級(jí):25~40 dB HL為輕度聾,41~60 dB HL為中度聾,61~80 dB HL為重度聾,>81 dB HL為極重度聾。應(yīng)用Madsen901(丹麥)聲導(dǎo)抗檢測(cè)儀進(jìn)行鼓室壓力及鐙骨肌反射的檢測(cè),應(yīng)用美國(guó)智聽(tīng)公司Smart EP 3.X聽(tīng)覺(jué)誘發(fā)電位儀進(jìn)行聽(tīng)性腦干反應(yīng)檢測(cè),測(cè)定閾值及判斷是否存在蝸后病變,在此基礎(chǔ)上進(jìn)行耳聾表型的分類。

        1.2.5 血樣采集 所有聾啞學(xué)生及家系成員簽寫知情同意書后,抽取靜脈血5~10 ml,用酚氯仿法提取白細(xì)胞DNA。

        1.3 基因擴(kuò)增 采用王秋菊課題組[4]針對(duì)GJB2基因和SLC26A4基因的編碼區(qū)、線粒體DNA12SrRNA設(shè)計(jì)的共22對(duì)引物序列、反應(yīng)條件和反應(yīng)體系。PCR反應(yīng)體系在ABI公司9700熱循環(huán)儀完成。PCR反應(yīng)結(jié)束后,取每種PCR產(chǎn)物和標(biāo)準(zhǔn)Marker各2 μl,分別加入6 μl溴酚藍(lán),用1.1%瓊脂糖凝膠進(jìn)行產(chǎn)物純度和濃度的檢測(cè)。

        針對(duì)線粒體DNA12SrRNA1555位點(diǎn)的擴(kuò)增產(chǎn)物,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳驗(yàn)證后分別取6 μl,加入Alw26l限制性內(nèi)切酶0.2 μl,6×Buffer 2 μl,加水至20 μl,在37℃水浴箱中溫育消化3小時(shí),經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳驗(yàn)證,酶切切開(kāi)者為300 bp和500 bp兩個(gè)條帶,而不能切開(kāi)的則為800 bp的一個(gè)條帶,不能切開(kāi)的或是酶切顯示不清的送測(cè)序驗(yàn)證。

        按照Coyle等[5]和趙亞麗等[6]設(shè)計(jì)的20對(duì)引物對(duì)SLC26A4基因21個(gè)外顯子進(jìn)行擴(kuò)增,用瓊脂糖凝膠進(jìn)行檢測(cè)。

        1.4 PCR產(chǎn)物測(cè)序分析 PCR產(chǎn)物經(jīng)過(guò)純化后直接應(yīng)用ABI公司3730型DNA分析儀測(cè)序。測(cè)序引物與PCR擴(kuò)增引物相同;測(cè)序結(jié)果應(yīng)用DNA Star5.0、Bioedit等軟件包進(jìn)行分析,通過(guò)ClustalX、BLAST軟件進(jìn)行序列比對(duì)、多物種蛋白的進(jìn)化研究和結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)。

        2 結(jié)果

        2.1 發(fā)病年齡 在170例聾啞學(xué)生中,以2歲為分界線,語(yǔ)前聾患者119例,語(yǔ)后聾患者21例,其余30例患者不能明確其發(fā)病年齡。

        2.2 聽(tīng)力檢測(cè)結(jié)果 170例(340耳)中,重度聽(tīng)力損失46耳,極重度聽(tīng)力損失294耳,均為雙側(cè)感音神經(jīng)性聾。

        2.3 遺傳方式 137個(gè)家系中,常染色體隱性遺傳方式102個(gè)(74.45%,102/137),母系遺傳方式13個(gè),其余22個(gè)家系不能明確遺傳方式。

        2.4 單一患者家系基因檢測(cè)結(jié)果 106個(gè)單一患者家系中,GJB2基因檢測(cè)發(fā)現(xiàn)純合突變5例(235delC 4例、416G>A 1例),1例235delC與299-300delAT復(fù)合雜合突變,雜合突變4例(235delC 3例、299-300delAT 1例)。只檢測(cè)到79G>A 、109G>A、341A>G、368C>A和608T>C等遺傳多態(tài)改變的有49例,無(wú)突變的47例。線粒體DNA12SrRNA1555位點(diǎn)同質(zhì)型突變的有14例。SLC26A4基因共發(fā)現(xiàn)純合突變6例,基因型為IVS7-2A>G/IVS7-2A>G 5例,1181InsG/1181InsG 1例;復(fù)合雜合突變3例,分別為1229C>T/wt與1982A>G/wt雜合突變2例,基因型分別為IVS7-2A>G與2027T>A/wt和2027T>A/wt(典型測(cè)序圖見(jiàn)圖1~3)。

        圖1 299-300delAT純合突變(上)、野生型(中)、雜合突變(下)

        圖2 mtDNA12SrRNA1555異質(zhì)型突變(上)、同質(zhì)型(中)、正常測(cè)序圖(下)

        圖3 SLC26A4第8內(nèi)含子剪接點(diǎn)正常(上)、雜合(中)IVS7-2A>G突變純合(下)

        2.5 雙患者及三患者家系基因檢測(cè)結(jié)果 31個(gè)家系共64個(gè)患者中,GJB2基因235delC純合突變5例、235delC雜合突變5例;299-300delAT純合突變4例,17例為良性多態(tài)改變,33個(gè)未檢測(cè)到突變。線粒體DNA12SrRNA1555位點(diǎn)同質(zhì)型突變的2例。SLC26A4基因僅檢測(cè)到5例雜合突變,基因型分別為 IVS7-2A>G/wt 3例,2162C>T/wt(T721M)和2168A>G/wt(H723R)各1例?;蛐屯耆嗤膬H有3個(gè),有16個(gè)家系三種基因都未檢測(cè)到突變。

        GJB2基因、線粒體DNA12SrRNA 1555位點(diǎn)和SLC26A4基因的突變率分別為14.11%(24/170)、9.41%(16/170)和8.82%(15/170)。

        2.6 對(duì)單一患者家系和雙患者家系GJB2基因、線粒體DNA12SrRNA1555位點(diǎn)和SLC26A4基因三種常見(jiàn)致病基因突變率比較 單一患者家系和雙患者家系之間的線粒體DNA12SrRNA和SLC26A4基因突變率的差別有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2分別為1.689、4.758和10.780,P值分別為0.430、0.029和0.000),證實(shí)聾病基因存在遺傳聚集和遺傳易感的特性。

        3 討論

        家系資源能夠帶來(lái)比散發(fā)病例更集中的遺傳信息,而且很大程度上減少了環(huán)境因素、遺傳異質(zhì)性因素的影響。通過(guò)對(duì)家系的研究,不僅能夠進(jìn)行基因定位、基因診斷,還可以獲得更多的有關(guān)基因調(diào)控等基因功能和基因互作方面的信息,解釋發(fā)病機(jī)制,最終達(dá)到疾病預(yù)防和基因治療的目的。

        本研究137個(gè)小家系中GJB2基因突變發(fā)生率最高,占所有致病突變的43.64%(24/55),證實(shí)GJB2基因也是西北地區(qū)遺傳性聾人群中最常見(jiàn)的致病基因。線粒體DNA12SrRNA A1555G和SLC26A4基因突變率分別為29.09%(16/55)和27.27%(15/55)。而線粒體DNA12SrRNA的1555位點(diǎn)的突變占所有突變的29.09%(16/55),是發(fā)生純合突變最多的位點(diǎn),體現(xiàn)了藥物性聾仍然是西北地區(qū)最常見(jiàn)的致聾病因,說(shuō)明當(dāng)前濫用耳毒性藥物的問(wèn)題依舊非常嚴(yán)重。GJB2基因的235delC純合突變占16.36%(9/55),與大前庭水管綜合征相關(guān)的IVS7-2A>G純合突變占9.09%(5/55),而GJB2基因299-300delAT純合突變占7.27%(4/55),依次排在第2位到第4位。在31個(gè)雙患者或三患者的家系中,有9個(gè)家系GJB2基因檢測(cè)到雙等位基因突變,4個(gè)家系檢測(cè)到了SLC26A4的雜合突變,2個(gè)mtDNA12SrRNA 1555位點(diǎn)的同質(zhì)型突變,所有家系中基因型完全相同的僅有3個(gè),有16個(gè)家系三種基因都未檢測(cè)到突變。本研究有74.45%的家系明確為隱性遺傳,并且為23.53%(40/170)的患者明確了耳聾的分子病因(純合和復(fù)合雜合突變),體現(xiàn)了基因診斷的意義所在。然而還有8.82%(15/170)的患者僅檢測(cè)到單一位點(diǎn)的基因突變,67.65%(115/170)的患者未檢測(cè)到任何突變,這些耳聾患者通過(guò)現(xiàn)有的研究水平還無(wú)法做出分子診斷,需要不斷的探索和研究。

        耳聾遺傳學(xué)相關(guān)研究的不斷深入,是為了探索耳聾的發(fā)病機(jī)制,實(shí)現(xiàn)預(yù)防和治療耳聾的最終目的。通過(guò)遺傳咨詢和婚配指導(dǎo)可以有效的避免兩個(gè)攜帶相同致病基因突變的人婚配,從而降低子代遺傳性聾的風(fēng)險(xiǎn),應(yīng)該是目前最經(jīng)濟(jì)、有效而且容易推廣的手段[7]。氨基糖苷類藥物性聾與線粒體DNA 12SrRNA A1555G 突變密切相關(guān)[8~10],避免應(yīng)用氨基糖苷類藥物可以為子孫后代帶來(lái)福音。SLC26A4基因突變與前庭導(dǎo)水管擴(kuò)大密切相關(guān),通過(guò)避免外傷震蕩、預(yù)防病毒感染等手段完全可以延緩耳聾的進(jìn)展。對(duì)學(xué)語(yǔ)前的嬰幼兒可以早期發(fā)現(xiàn)聾病危險(xiǎn)因素,采取必要的預(yù)防措施,從而保證言語(yǔ)語(yǔ)言功能的發(fā)育,實(shí)現(xiàn)聾而不啞。

        1 王秋菊,楊偉炎,韓東一,等.遺傳性耳聾資源的收集、保存及利用——綜合系統(tǒng)的建立[J].中華耳科學(xué)雜志,2003,1:65.

        2 Stephens D, Lewis P, Davis A. The epidemiology of hearing problem: How should we investigate it[J].Acta Otolaryngol, 2004, 522(suppl):13.

        3 謝鼎華,楊偉炎.耳聾的基礎(chǔ)與臨床[M].長(zhǎng)沙:湖南科學(xué)技術(shù)出版社,2003.344~355.

        4 李慶忠,王秋菊,遲放魯,等.中國(guó)散發(fā)聽(tīng)力損失患者中GJB2基因突變分子流行病學(xué)研究[J]. 中國(guó)眼耳鼻喉科雜志,2006,5:310.

        5 Coyle B,Reardon W,Herbrick JA, et al, Molecular analysis of the SLC26A4 gene in Pendred syndrome[J]. Hum Mol Genet, 1998,7:1 105.

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        7 劉曉霞,郭玉芬,韓東一,等.非綜合征型聾患者線粒體DNAA1555G突變頻率分析[J].中華耳鼻咽喉頭頸外科雜志,2007,39:739.

        8 Li XM,Guan MX.A human mitochondrial GTP binding protein related to tRNA modification may modulate phenotypic expression of the deafness—associated mitochondrial 12S rRNA mutation[J].Molecular and Cellular Biology,2002,22:7 701.

        9 趙立東,王秋菊,郭維維,等.與線粒體DNAA1555G突變有關(guān)的非綜合征型耳聾[J].中華耳科學(xué)雜志,2004,2:136.

        10 11 趙蘇瑛,張海軍,徐春宏,等.核基因參與人類線粒體12S rRNA突變相關(guān)非綜合征耳聾的臨床表型[J].分子細(xì)胞生物學(xué)報(bào),2006,1:39.

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