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        SciFinder Scholar 2007檢索的主要特點及其應(yīng)用

        2009-06-17 03:00:26陳克銘
        中國校外教育(下旬) 2009年6期
        關(guān)鍵詞:檢索物質(zhì)數(shù)據(jù)庫

        陳克銘

        [摘要] SciFinder Scholar是美國《化學(xué)文摘》網(wǎng)絡(luò)版專門提供學(xué)術(shù)研究機構(gòu)使用的桌面檢索平臺,本文主要介紹SciFinderScholar 2007的檢索主要特點并通過實例來說明具體的應(yīng)用。

        [關(guān)鍵詞] SciFinder Scholar 2007主要特點 應(yīng)用

        美國化學(xué)文摘社CAS(Chemical Abstract Service)自1907年成立以來,已經(jīng)走過了輝煌的百年。一百年來,CAS不僅致力于內(nèi)容的精心選擇和編輯,為世界范圍內(nèi)的科技與創(chuàng)新領(lǐng)域提供領(lǐng)先的、整合的、全面的信息,而且在技術(shù)上做到與時俱進(jìn),不斷革新,使用戶能更全面、準(zhǔn)確地從信息海洋中獲取有價值的信息。CAS的主要產(chǎn)品《化學(xué)文摘》自1907年問世以來,經(jīng)歷了印刷版、光盤版、網(wǎng)絡(luò)版,其網(wǎng)絡(luò)版檢索系統(tǒng)SciFinder Scholar,是專門供學(xué)術(shù)研究機構(gòu)使用的桌面檢索平臺。目前使用的是2007版,新增了多項功能,比如,文獻(xiàn)分類、組合答案集、在物質(zhì)顯示中進(jìn)行檢索等。SciFinder Scholar收錄6個數(shù)據(jù)庫,涵蓋了期刊論文、專利文獻(xiàn)、會議論文、化學(xué)物質(zhì)、化學(xué)反應(yīng)等信息,具體包括CA與Medline數(shù)據(jù)庫以及由CA數(shù)據(jù)庫派生的化學(xué)反應(yīng)數(shù)據(jù)庫(CASREACT)、物質(zhì)數(shù)據(jù)庫(CAS REGISTRY)、商業(yè)來源數(shù)據(jù)庫(CHEMCATS)、管制信息數(shù)據(jù)庫(CHENLIST)。SciFinder Scholar收錄的信息是海量的,但科研人員不必?fù)?dān)心在信息的海洋中無所適從,SciFinder Scholar提供了強大的分析、提煉信息的功能,幫助科研人員從海量的信息中發(fā)掘有創(chuàng)意的、有參考價值的信息。關(guān)于SciFinder Scholar的使用方法,已有文獻(xiàn)作過詳細(xì)介紹。本文將著重介紹SciFinder Scholar 2OO7檢索主要特點及對檢索結(jié)果的分析提煉功能。

        一、SciFinder Scholar的檢索特點

        我們平時常用的一些數(shù)據(jù)庫,不論中文數(shù)據(jù)庫還是外文數(shù)據(jù)庫,一般都會提供簡單檢索、高級檢索和專家檢索。一般用戶可以使用表單式的高級檢索,通過檢索字段間的邏輯組配,構(gòu)造檢索策略;專業(yè)級用戶可使用專家檢索,通過建立復(fù)雜的檢索表達(dá)式,來構(gòu)造檢索策略。盡管這樣的檢索方式減少了檢索步驟,節(jié)省了檢索時間,但不足之處在于,往往因用戶不能全面表達(dá)檢索要求,比如,遺漏了關(guān)鍵詞的同義詞、近義詞、縮寫等,而影響了查全率。而SciFinder Scholar數(shù)據(jù)庫和很多檢索系統(tǒng)的設(shè)計理念不同,SciFinder Scholar不提倡用戶從一開始就進(jìn)行精確的、設(shè)置很多限定的檢索,這樣會遺漏了用戶未知的重要信息,所以,SciFinder Scholar不提供表單式的高級檢索或?qū)<覚z索,其主題檢索類似于自然語言檢索。SciFinder Scholar提倡用戶從廣域的檢索開始,獲得大量比較相關(guān)的信息,然后利用文獻(xiàn)分析功能、物質(zhì)分析功能或反應(yīng)分析功能,逐步提煉檢索結(jié)果,獲得最佳的檢索效果。SciFinder Schlolar實現(xiàn)了6個數(shù)據(jù)庫之間無縫鏈接的跨庫檢索,用戶可從文獻(xiàn)、物質(zhì)或反應(yīng)3個入口進(jìn)行檢索,獲得的檢索結(jié)果也可以在文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫、物質(zhì)數(shù)據(jù)庫和反應(yīng)數(shù)據(jù)庫中相互鏈接。

        二、Scifinder Scholar的檢索方式

        SciFinder Scholar提供了豐富的檢索途徑,但可歸納為文獻(xiàn)檢索、物質(zhì)檢索、反應(yīng)檢索3種方式。

        1.文獻(xiàn)檢索

        SciFinderScholar的文獻(xiàn)檢索提供了多種檢索途徑,如文獻(xiàn)標(biāo)識符(即專利號、CA文摘號等)、書目信息、主題、作者、機構(gòu)名、瀏覽核心期刊等。在進(jìn)行主題(Research Topic)檢索時,以輸入2~3個關(guān)鍵詞為最佳。

        2.物質(zhì)檢索

        SciFinder Scholar的物質(zhì)檢索提供兩種檢索途徑:(1)通過物質(zhì)標(biāo)識符查找物質(zhì),如物質(zhì)名稱、CAS登記號、俗名、商品名;(2)通過結(jié)構(gòu)或分子式查找物質(zhì),結(jié)構(gòu)檢索又提供精確結(jié)構(gòu)檢索、亞結(jié)構(gòu)檢索和相似結(jié)構(gòu)檢索。精確結(jié)果檢索要求返回的結(jié)構(gòu)完全一致,可獲得物質(zhì)的、聚合物、混合物、配合物等;亞結(jié)構(gòu)檢索要求所繪制的結(jié)構(gòu)必須存在;相似結(jié)構(gòu)檢索要求獲得相似度在60分以上的結(jié)構(gòu)。

        3.反應(yīng)檢索

        通過繪制結(jié)構(gòu),指定反應(yīng)原子、反應(yīng)位置和反應(yīng)角色,即可進(jìn)行反應(yīng)檢索。這是Scifinder中最有創(chuàng)新的部分,讓使用者很直觀,并且這些結(jié)構(gòu)式還可以放到Chemdraw軟件中重新加工和使用,非常方便。

        三、SciFinder Scholar 的分析功能

        不論用戶進(jìn)行了上述何種方式的檢索,對返回的大量檢索結(jié)果,SciFinder Scholar提供征對不同類型檢索結(jié)果的特定分析、限定功能。

        1.文獻(xiàn)檢索的分析功能

        SciFinder Scholar的文獻(xiàn)檢索,對檢索結(jié)果可進(jìn)行多達(dá)11項的分析,不僅可對文獻(xiàn)的內(nèi)容進(jìn)行分析。還可對文獻(xiàn)的來源等進(jìn)行分析。比如,CAS登記號(CAS RegistrationNumber),可分析文獻(xiàn)中出現(xiàn)的物質(zhì);學(xué)科領(lǐng)域(CA Section Title)、索引詞(Index Term)和輔助索引詞(Supplementary Term),可分析文獻(xiàn)的學(xué)科分布情況;作者(Author Name)、機構(gòu)(Company/Organization)可了解該領(lǐng)域活躍的研究人員和研究機構(gòu);數(shù)據(jù)庫(Database)、期刊(Joumal Name)可分析文獻(xiàn)的來源;出版年(tkublication Year)可了解該領(lǐng)域的研究歷史和發(fā)展;還可對文獻(xiàn)類型(Document Type)、語種(Language)進(jìn)行分析。文獻(xiàn)檢索還可進(jìn)行7項限定,進(jìn)一步提煉檢索結(jié)果。選擇Research Topic限定項,可用其他的關(guān)鍵詞進(jìn)行二次檢索;選擇Company Name或Author Name,可對研究機構(gòu)、作者進(jìn)行限定,篩選出用戶感興趣的機構(gòu)或作者的研究論文。另外可對出(Publication Year)、文獻(xiàn)類型(DocumentType)、語種(Ian 1age)、來源數(shù)據(jù)庫(Database)進(jìn)行限定。

        2.物質(zhì)檢索的分析功能

        SciFinderScholar的物質(zhì)檢索,根據(jù)化學(xué)結(jié)構(gòu)的特性,提供6個分析項目,可分析某一特定原子上的修飾(Real atom attachments)、結(jié)構(gòu)定義中的某類基團(tuán)(Variable group A,Q,X,and W composition)、R基團(tuán)(R-group composition)、精確結(jié)構(gòu)(Precision)、環(huán)骨架(Ring skeletons)和結(jié)構(gòu)中存在構(gòu)象(conformation)。物質(zhì)檢索還可以進(jìn)行7項限定,可限定結(jié)構(gòu)(Chemical Structure)、包含的同位素(Isotope-Containing Substances)、包含的金屬(Meta1 Containing Substances)、必須提供物質(zhì)的理化性質(zhì)數(shù)據(jù)(Property Data)、可購買的物質(zhì)(Commercial Availability)、能提供物性數(shù)據(jù)(Property Availability)及可獲得參考文獻(xiàn)(Reference Availability)。

        3.反應(yīng)檢索的分析功能

        SciFinder Scholar的反應(yīng)檢索,對檢索結(jié)果可進(jìn)行10項分析,可分析反應(yīng)中出現(xiàn)的催化劑(Catalyst)、了解反應(yīng)中出現(xiàn)的溶劑(Solvent)、了解反應(yīng)的步數(shù)(Number of Steps in Reaction)、了解產(chǎn)物的產(chǎn)率(Product Yield)。這4個分析項目是反應(yīng)檢索特有的,其他6個分析項目,如Author、Journal Name等和文獻(xiàn)檢索的分析功能相同。反應(yīng)檢索還可限定反應(yīng)物、產(chǎn)物、催化劑等(Reaction Structure)、對反應(yīng)的產(chǎn)率(Product Yield)、反應(yīng)的步數(shù)(Number of Steps)、反應(yīng)的類型(Reaction Classification)也可進(jìn)行限定。

        四、檢索實例

        下面以實例詳細(xì)介紹從文獻(xiàn)檢索入口,通過文獻(xiàn)、物質(zhì)之間的相互鏈接。綜合利用SciFinder Scholar的文獻(xiàn)分析、結(jié)構(gòu)分析以及限定等功能,逐步接近檢索課題的要求,獲得最相關(guān)的文獻(xiàn)的過程。

        檢索例子(1):檢索關(guān)于金屬鈀催化交聯(lián)反應(yīng)。

        我們可以首先選擇鈀催化(Pd catalyst)作為主題詞來檢索,可以找到有4996條,通過去重(Remove Duplicates)可以除去86條,這樣所得的文獻(xiàn)還是很多,這時你可以采用分析/過濾(Analyze/Refine)功能輸入第二個關(guān)鍵詞如交聯(lián)反應(yīng)(Cross-coupling reaction)后只剩下115條,然后你可以逐條看,找到你所需要的文獻(xiàn)。

        檢索例子(2):檢索關(guān)于催化劑對Diels-Alder[4+2]環(huán)加成反應(yīng)的影響。

        先選擇Diels-Alder作為關(guān)鍵詞,可以檢索到非常多的文獻(xiàn),大約有3萬多,這時你沒法去重,所以,你需要輸入第二個關(guān)鍵詞環(huán)加成(Cycloaddition)來過濾,使之變成只有8千多條,其實這還是很多,我們可以用第三個關(guān)鍵詞來限定并去重后,即催化劑(Catalyst),實際剩下約1700條。最后可以用實際需要研究的反應(yīng)物或產(chǎn)物來進(jìn)一步過濾。

        參考文獻(xiàn):

        [1]路雅祺.CA 網(wǎng)絡(luò)版SciFinder Scholar數(shù)據(jù)庫檢索方法[J].情報探索,2006,(10):73-75.

        [2]李桂影.SciFinder Scholar數(shù)據(jù)庫及其檢索利用[J].醫(yī)學(xué)信息學(xué)雜志,2007,28(1):24-25.

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