中圖分類號：S917.4 文獻(xiàn)標(biāo)識碼：A 文章編號：1000-4440（2025）06-1197-10

Abstract：In this study，samples were collected and mitochondrial DNA sequences were measured from Acrossocheilus jishouensis，A. parallens，A. spiniferand A iridescens.The complete mtDNA sequencesof four species were obtained through DNAstar Lasergene 7.Oand MEGA7.O softwares. The protein-coding genes were located

by MITOSWebServer online software，and the transfer RNA （tRNA）genes were identified and analyzed by tRNAscan-SE 2.0.The ribosomal RNA（rRNA）genesand control regions were identifiedby BLASThomologyanalysis.Incorporating otherAcrossocheliusspeciesandselectedrepresentativesof thesubfamilyBarbinaeavailablein GenBank，phylogenetictrees were constructed toanalyze the phylogenetic relationshipsof the four Acrossochelius species.The nucleotide componentsof mtDNAof thefour species were similar.Thesequences were16585-16 595bp inlength，including 37coding genes and one non-coding region（control region）.Eight tRNA genes（ tRNA^Gln ，tRNA ^Ala ， tRNA^Asn ！ tRNA^Cys ， tRNA^′′′ ，tRNA ， （2 tRNA^Glu ， tRNA^Pro ）and NDθ were located on the light strand（L strand），and the remaining genes were located on the heavy strand（H strand）：Among the 13 protein-coding genes，the ND2 gene of A .spinifer used ATC as the start codon， which was different from the other three species.The start codons of ND3 genes of A .parallens and A . spinifer were GTG， whiletheother twospecies usedATGas the startcodon，and the start codonsof theremaining genes were ATGor GTG. There were four types of stop codons （TAA，TAG，TA and T）.All22 tRNA genes encoded tRNAs that possessd the typical cloverleaf secondary structure，except for the tRNA encoded by the tRNA^ser gene，which lacked the DHU arm. The variationof controlregion was obvious，butthecorrsponding terminationsequenceregion，centralconservedregionandconserved sequenceregionwere identified incontrolregion.PhylogeneticanalysisshowedthattheAcrosocheilusspeciescould be divided into two clades.A. parallens was most closely related to A .jishouensis and most distantly related to A .iridescens. Bysystematicallyanalyzing thecomplete mitochondrialDNA（mtDNA）sequences offourAcrosochelius species，this study elucidates their genome structure，characteristics，and taxonomic status.Thesefindings provideatheoretical foundation for the phylogenetic analysis of the genus Acrossochelius and the conservation of its germplasm resources.

Key words：Acrosscheilus jishouensis；Acrossocheilus parallens；Acrossocheilus spinifer；Acrossocheilus iridescens; mitogenome；phylogenetic analysis

光唇魚屬（Acrossocheilus）隸屬于鯉形目（Cypri-niformes）鯉科（Cyprinidae）鮑亞科（Barbinae）。到目前為止，光唇魚屬共鑒定了26個種或亞種，主要分布于中國南部（上海、江蘇、安徽、浙江、福建、臺灣等地）、越南和老撾，其體色鮮艷，營養(yǎng)價值高，是一類名優(yōu)的經(jīng)濟(jì)魚類[1-3]。對光唇魚屬魚類的分類鑒定，傳統(tǒng)方法主要依據(jù)口唇結(jié)構(gòu)形態(tài)、體色和背鰭等的差異進(jìn)行[4]?！吨袊鴦游镏尽び补囚~綱·鯉形目（下卷）》記錄了分布于中國南部地區(qū)的光唇魚屬的19個種和亞種[1]。而Kottelat等[5]通過對光唇魚屬魚類成體體側(cè)條紋的觀察，將光唇魚屬魚類分為兩大類：無垂直條紋類群和有垂直條紋類群。袁樂洋4通過對光唇魚屬魚類形態(tài)特征的比較及統(tǒng)計分析，基本認(rèn)同Kottelat的觀點(diǎn)，并認(rèn)為體側(cè)無垂直條紋類型可能不屬于光唇魚屬魚類。伍律[6]所記錄的厚唇光唇魚（A.labiatus）應(yīng)為吉首光唇魚（A.jishouensis）。形態(tài)分類可能會受到雌雄差異、幼魚與成魚差異等因素的影響，因此需要借助分子手段，進(jìn)一步厘清種群間、物種間的關(guān)系。線粒體DNA（mtDNA）是一種細(xì)胞質(zhì)遺傳的環(huán)狀雙鏈分子，其堿基序列組成和結(jié)構(gòu)較為保守，長度一般為16＼～20kb ，包含了13個蛋白質(zhì)的編碼基因、2個核糖體RNA（rRNA）基因和22個轉(zhuǎn)運(yùn)RNA（tRNA）基因以及1個非編碼控制區(qū)[7]。線粒體DNA具有相對分子量小、編碼效率高、拷貝數(shù)多、進(jìn)化速度快等特征，在群體遺傳學(xué)、種群分化等研究中被廣泛應(yīng)用[]線粒體DNA作為分子標(biāo)記在魚類群體遺傳變異研究中被大量運(yùn)用。以線粒體細(xì)胞色素氧化酶I（COI）基因作為分子標(biāo)記，分析了分布于中國臺灣的臺灣光唇魚（A.paradoxus）和分布于福建閩江的武夷光唇魚（A.wuyiensis）2個物種，結(jié)果表明這2種光唇魚為同一物種[8;薛艷潔等通過線粒體細(xì)胞色素氧化酶II（COI）基因和D-loop 控制區(qū)序列2種分子標(biāo)記的系統(tǒng)發(fā)育分析，可以較準(zhǔn)確地判定在江西贛州采集的光唇魚屬于半刺光唇魚（A.hemispinus）;基于線粒體細(xì)胞色素b基因?qū)π掳步饔驕刂莨獯紧~（A.wenchowensis）群體遺傳特征進(jìn)行分析，結(jié)果表明溫州光唇魚的不同地理群體遺傳分化較明顯，而且遺傳多樣性水平較低[10]。因此，了解清楚光唇魚屬魚類的線粒體DNA特征，對研究光唇魚的分類和種群特征分析具有重大意義。近年來對光唇魚屬魚類的研究主要集中在人工繁殖[11-13]形態(tài)特征[14-15]、性腺胚胎發(fā)育[16-17]基因克隆與表達(dá)[18-19]線粒體分子標(biāo)記[20-22]等方面。而專門針對吉首光唇魚（A.jishouensis）、厚刺光唇魚（A.spinifer）側(cè)條光唇魚（A.parallens）和虹彩光唇魚（A.iridescens）線粒體基因組系統(tǒng)分析的研究較少。針對此現(xiàn)狀，本研究擬對4種光唇魚屬魚類mtDNA進(jìn)行特征分析和系統(tǒng)發(fā)育分析，從而進(jìn)一步研究光唇魚屬魚類與其他亞科魚類的親緣關(guān)系及其分類，為光唇魚屬魚類的系統(tǒng)進(jìn)化分析及其種質(zhì)資源保護(hù)與管理提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

1 材料與方法

1.1 試驗(yàn)材料

本研究的吉首光唇魚樣品采集于湖南省吉首市L ^′N：28^°15^′44^′′ ;E： 109^°42^′30\" ），厚刺光唇魚樣品采集于廣東省潮州市（ N：23^°27^′22^′′ ！ ），虹彩光唇魚樣品采集于廣西壯族自治區(qū)河池市（N：

24^°29^′50^′′ ： E：108^°38^′23^′′; ，側(cè)條光唇魚樣品采集于廣東省韶關(guān)市 N_：25^°19^′30^′′;E_：113^°55^′13^′′） 。每個群體隨機(jī)選取10尾體長 10cm 的樣本，共計40尾。標(biāo)本采用 95% 乙醇進(jìn)行固定與保存，標(biāo)本見圖1。

1.2 DNA的提取和擴(kuò)增

采用動物基因組提取試劑盒「天根生化科技（北京）有限公司產(chǎn)品]分別提取4種光唇魚的總DNA。采用 Primer5.0 軟件設(shè)計并獲得4種光唇屬魚類線粒體DNA序列的26對擴(kuò)增引物（表1），分段擴(kuò)增其線粒體DNA序列。電泳檢驗(yàn)合格的PCR產(chǎn)物委托生工生物工程（上海）股份有限公司進(jìn)行純化并測序。

1.3 數(shù)據(jù)處理與分析

所測序列采用DNAstarLasergene7.0（SeqMan）程序包[23]進(jìn)行拼接，通過MEGA7.0軟件[24]比對近源物種線粒體基因組序列，并輔以人工校正，最終獲得4種光唇魚屬魚類完整mtDNA序列。mtDNA序列中編碼基因通過MITOSWebServer（http：//mitos2.bioinf.uni-leipzig.de/index.py）在線軟件定位分析[25]。采用tRNAscan-SE2.0軟件對4種光唇魚屬魚類的tRNA基因進(jìn)行定位和二級結(jié)構(gòu)分析[26]利用BLAST同源性分析確定rRNA基因和控制區(qū)。然后通過MEGA7.0軟件對4種光唇魚屬魚類線粒體DNA序列結(jié)構(gòu)特點(diǎn)進(jìn)行分析，計算序列的堿基組成。

從GenBank數(shù)據(jù)庫下載得到23種亞科魚類線粒體DNA全序列，基于線粒體DNA的13種蛋白質(zhì)的編碼基因序列以鄰接法（Neighbor-joiningMeth-od，NJ）構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹[27]，用于探究4種光唇魚屬魚類的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系。

2 結(jié)果與分析

2.14種光唇魚線粒體DNA的組成

4種光唇魚屬魚類線粒體DNA全序列長度為16585～16595bp（ （吉首光唇魚 16585bp 、側(cè)條光唇魚 16591bp 、厚刺光唇魚16594bp、虹彩光唇魚16595bp ），均包含13個編碼蛋白質(zhì)基因、2個編碼rRNA基因、22個編碼tRNA基因和1個非編碼控制區(qū)等。4種光唇魚屬魚類線粒體DNA序列堿基排列順序、長度、密碼子使用情況都比較相似。整個基因排列緊湊，各片段間存在11＼～12處間隔，其長度為 1～33bp ;其中 tRNA^cys 與 tRNA^Asn 之間存在最大間隔區(qū)，可構(gòu)成莖環(huán)二級結(jié)構(gòu)，輕鏈由此處開始復(fù)制，最大間隔區(qū)被稱為輕鏈復(fù)制起始區(qū)（ 0_L） 。除8個tRNA 基因（ tRNA^Gln 、 tRNA^Ala 、 tRNA^Asn 、tRNA^Cys 、 tRNA^Tyr 、 tRNA^Ser ！ tRNA^Glu ！ tRNA^Pro ）和 ND6分布于輕鏈（L鏈）外，其余各基因均位于重鏈（H鏈）上（圖1表2）。

4種光唇魚屬魚類線粒體DNA的位點(diǎn)變異分析結(jié)果顯示，全序列共有2712個變異位點(diǎn)，其中簡約變異位點(diǎn)有594個，占總數(shù)的 21.90% ，非簡約變異位點(diǎn)有2115個，占總數(shù)的 77.99% 。

2.24種光唇魚線粒體中編碼蛋白質(zhì)的基因

4種光唇魚屬魚類線粒體中編碼蛋白質(zhì)的基因均包含了3802個密碼子，編碼20 種氨基酸（表3）。其中編碼亮氨酸（Leu）的密碼子使用頻率最高（ 12.14% ），包括UUA、UUG、CUU、CUC、CUA和CUG6種密碼子，而色氨酸（ Trp ）的密碼子使用頻率最低 （1.05%） ，僅包括UGG這一種密碼子（圖2、表3）。表3中粗體字顯示同義密碼子中編碼同種氨基酸的偏好密碼子，其同義密碼子相對使用度（RSCU）均大于或等于1，表明所有編碼蛋白質(zhì)的基因密碼子的使用都存在著偏好性。并且，第三位為A的密碼子的RSCU幾乎都大于1.00，表明這種密碼子的使用頻率較高。

對4種光唇魚屬魚類線粒體中編碼蛋白質(zhì)的基因進(jìn)行比較分析，結(jié)果表明，4種光唇魚屬魚類的COI基因均以GTG為起始密碼子，厚刺光唇魚的ND2基因以ATC為起始密碼子，側(cè)條光唇魚和厚刺光唇魚的ND3基因以GTG為起始密碼子，其余基因均以ATG為起始密碼子。4種光唇魚屬魚類線粒體中編碼蛋白質(zhì)的基因終止密碼子一致，其中7種編碼蛋白質(zhì)的基因終止密碼子為不完整的終止密碼子（終止密碼子為T的基因：ND2、COI、ND3、ND4、Cytb；終止密碼子為TA的基因：ATPase6、COII），另外6種為完整終止密碼子（ATPase8的終止密碼子為TAG，其余終止密碼子為TAA）。

2.34種光唇魚屬魚類線粒體中編碼RNA的基因

4種光唇魚屬魚類線粒體中有22個編碼tRNA的基因，長度為 67～77bp ；除厚刺光唇魚的 tRNA^Leu 基因長度（UUA）與其他3種光唇魚不同，4種光唇魚的其余tRNA基因序列和長度基本一致，相似度較高。通過tRNAsacn-SE2.0軟件預(yù)測4種光唇魚編碼的tRNA的二級結(jié)構(gòu)，除 tRNA^ser （AGC）基因編碼的tRNA的DHU臂丟失外，其余的tRNA均具有典型三葉草結(jié)構(gòu)[28]。4種光唇魚屬魚類 I2SrRNA 基因長度為 954～961bp ，其中吉首光唇魚和側(cè)條光唇魚的 基因長度均為 956bp ，16S rRNA 基因長度為 1673～1679bp ，厚刺光唇魚和虹彩光唇魚的 I6SrRNA 基因長度均為 1679bp 。

2.44種光唇魚線粒體DNA中控制區(qū)序列

吉首光唇魚和側(cè)條光唇魚線粒體DNA控制區(qū)長度均為 940bp ，虹彩光唇魚線粒體DNA控制區(qū)長度為 934bp ，厚刺光唇魚線粒體DNA控制區(qū)長度為927bp 。分析4種光唇魚屬魚類線粒體DNA控制區(qū)的堿基組成，發(fā)現(xiàn)其呈現(xiàn)出較高的 A+T 含量（ 66.8% ）。對比4種光唇魚屬魚類線粒體DNA控制區(qū)序列結(jié)構(gòu)，該區(qū)域均包括終止序列區(qū)（ETAS）、中央保守區(qū)（CSB-F、CSB-E、CSB-D）、保守序列區(qū)（CSB-1、CSB-2、CSB-3）；保守序列區(qū)還包含了2個TATA框（TATATATATATATATATATATATA和TTT-TTTTATTTT）。

12SrRNA：12S核糖體RNA;16SrRNA：16S核糖體RNA;tRNA;轉(zhuǎn)運(yùn)RNA;Phe：苯丙氨酸;Val;氨酸;Leu：亮氨酸;Ie：異亮氨酸;Gln：谷氨酰胺； Met ：甲硫氨酸； Trp ：色氨酸；Ala：丙氨酸；Asn：天冬酰胺；Cys：半胱氨酸；Tyr：酪氨酸；Ser：絲氨酸； Asp ：天冬氨酸；Lys：賴氨酸;ND1＼～ND6：還原型煙酰胺腺嘌呤二核苷酸（NADH）脫氫酶亞基1～NADH脫氫酶亞基 ：細(xì)胞色素b;COI：細(xì)胞色素c氧化酶亞基I；COⅡ：細(xì)胞色素c氧化酶亞基I;COII：細(xì)胞色素c氧化酶亞基ⅢI;ATPase6、ATPase 8：ATP 合成酶亞基6、ATP合成酶亞基8。圖中的刻度表示線粒體DNA的堿基對位置。A：吉首光唇魚;B：側(cè)條光唇魚;C：厚刺光唇魚;D：虹彩光唇魚。

Ala：丙氨酸；Arg：精氨酸； Asn ：天冬酰胺；Asp：天冬氨酸；Cys：半胱氨酸；Glu：谷氨酸； Gln ：谷氨酰胺；Gly：甘氨酸；His：組氨酸；Ile：異亮氨酸； Leu ：亮氨酸；Lys：賴氨酸； Met ：甲硫氨酸;Phe：苯丙氨酸； Pro ：脯氨酸； Ser ：絲氨酸； Thr ：蘇氨酸； Trp ：色氨酸； Tyr ：酪氨酸； ΔVal ：氨酸。

2.5 鮑亞科魚類系統(tǒng)發(fā)育分析

基于23種亞科魚類線粒體DNA的13種編碼蛋白質(zhì)的基因序列，采用NJ法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹，圖3顯示，所有物種可以大致劃分為2個支系，其中支系I又可以劃分為包含光唇魚屬魚類的A、C亞支系和包含白甲魚屬魚類的B亞支系。支系Ⅱ包括其他屬的魚類。本研究4種光唇魚均分布于A亞支系，其中側(cè)條光唇魚先與半刺光唇魚聚成一支，再與吉首光唇魚聚為一個小分支；厚刺光唇魚先與窄條光唇魚聚成一支，再依次與北江光唇魚、武夷光唇魚聚為一個小分支；虹彩光唇魚則先與長鰭光唇魚聚為一支，再與臺灣光唇魚聚為一個分支，所有支持率均為 100% 。結(jié)果表明，側(cè)條光唇魚與半刺光唇魚、吉首光唇魚的親緣關(guān)系較近，厚刺光唇魚與窄條光唇魚的親緣關(guān)系較近，虹彩光唇魚則與長鰭光唇魚的親緣關(guān)系較近。本研究4種光唇魚中，與側(cè)條光唇魚的親緣關(guān)系由近到遠(yuǎn)依次為吉首光唇魚、 厚刺光唇魚和虹彩光唇魚。

3討論

本研究測定了4種光唇魚屬魚類線粒體DNA全序列，從其組成特征、編碼蛋白質(zhì)基因、堿基偏好性、變異位點(diǎn)及系統(tǒng)發(fā)育情況等方面進(jìn)行全面對比分析。

結(jié)果顯示，4種光唇魚屬魚類線粒體DNA全序列的基因組成和結(jié)構(gòu)高度保守，包含13個編碼蛋白質(zhì)基因、22個編碼tRNA基因、1個編碼12SrRNA基因、1個編碼16SrRNA基因，并且這些基因的排序都相同，與其他硬骨魚的研究結(jié)果[29]一致。4種光唇魚屬魚類的線粒體DNA全序列之間存在 1～10bp 的差異，與其他光唇魚屬魚類序列長度非常接近[29-31]。堿基排列順序一致，大多數(shù)編碼基因的序列長度基本相等，長度差異最大的片段為控制區(qū)。這是由于在魚類中，控制區(qū)受到的選擇壓力較大，進(jìn)化速度較快，使其成為線粒體DNA中長度變化最大的區(qū)域[32]。魚類線粒體基因組排列緊密，僅存在少量的重疊區(qū)和間隔區(qū)。在編碼蛋白質(zhì)的基因序列中，ATPase8和ATPase6基因之間以及ND4L和ND4基因之間都存在 7bp 的重疊，ND5和ND6基因之間存在 4bp 的重疊，這是脊椎動物的普遍特征，只是在重疊堿基的數(shù)量上有所區(qū)別。并且在溫州光唇魚、克氏光唇魚和墨脫新光唇魚上也有同樣的重疊區(qū)特征[29-31]，基本確定光唇魚屬魚類的線粒體DNA在編碼蛋白質(zhì)的基因序列上的重疊區(qū)特征，因此這部分序列信息可用于物種鑒定和進(jìn)化趨勢分析[33]

在線粒體DNA編碼蛋白質(zhì)的基因起始密碼子和終止密碼子方面，相較于大多數(shù)硬骨魚類有較為恒定的起始密碼子ATG，這4種光唇魚屬魚類中存在起始密碼子發(fā)生同義替換的演化現(xiàn)象，ND2基因有ATC和ATG2種起始密碼子，ND3基因有GTG和ATG2種起始密碼子，這是在硬骨魚中很少見的情況。在呂氏小鯢（Mertensiellaluschani）中發(fā)現(xiàn)了ND3 起始密碼子為GTG 的情況[34]。此外，COI基因的起始密碼子為GTC，這是魚類中COI基因的基本特征[35]。而4種光唇魚屬魚類的各個編碼蛋白質(zhì)的基因終止密碼子完全一致，包括了完整終止密碼子TAA/TAG和不完整終止密碼子T/TA2類，與其他魚類線粒體DNA[32]基本一致。ND2、ND3、ND4，Cytb，ATPase6，COII 和COⅡ這7個基因的終正密碼子為不完整終止密碼子，可在轉(zhuǎn)錄后期通過聚腺昔酸化作用形成完整的密碼子TAA，從而終止轉(zhuǎn)錄[36]

4種光唇魚屬魚類的22個tRNA基因中，除了tRNA^Gln 、 tRNA^Ala 、tRNAAsn、 tRNA^Cys ！ tRNA^Tr ！ tRNA^ser 、tRNA^Glu 和 tRNA^Pro 位于L鏈外，其余14個tRNA基因均位于H鏈上，這與硬骨魚類線粒體DNA分析結(jié)果[37]一致。此外，這些tRNA基因中，存在一定量的G-U堿基錯配，這種現(xiàn)象在多數(shù)物種中都有存在，可通過RNA編輯被修復(fù)，并不影響氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)，因此這樣的堿基錯配情況也可能是線粒體DNA中tRNA基因的獨(dú)特堿基配對情況[31]。4種光唇魚屬魚類的rRNA基因在線粒體DNA上的起始位置一致，但存在長度差異。吉首光唇魚和側(cè)條光唇魚的I2SrRNA 基因長度相等，與厚刺光唇魚和虹彩光唇魚分別相差 2bp 和 5bp ;厚刺光唇魚和虹彩光唇魚的 I6SrRNA 基因長度相等，與吉首光唇魚和側(cè)條光唇魚分別相差 6bp 和 3bp 。這可能是4種光唇魚自身進(jìn)化演變形成的特性，其位置和長度與溫州光唇魚、克氏光唇魚、墨脫新光唇魚基本一致，體現(xiàn)出rRNA基因的保守性[29-31]

控制區(qū)受進(jìn)化選擇壓力較大，其進(jìn)化速率明顯大于線粒體DNA其他組分，在不同魚類中的差異程度較大，因此被廣泛用于探討種內(nèi)及種間的物種進(jìn)化分析[38]。4種光唇魚屬魚類的線粒體控制區(qū)位于 tRNA^Phe 基因和 tRNA^Pro 基因之間，是線粒體DNA中差異最大的區(qū)域，其堿基組成表現(xiàn)出明顯的A、T傾向性，有利于控制區(qū)基因變異和進(jìn)化。并且，4種光唇魚屬魚類均識別出符合劉煥章提出的ETAS序列通式，還識別出中央保守區(qū)和保守序列區(qū)。中央保守區(qū)包括3段序列（CSB-F、CSB-E、CSB-D），其中CSB-D序列最保守，在4種光唇魚屬魚類中基本一致。在保守序列區(qū)中，除CSB-2序列在4種光唇魚屬魚類中保持一致之外，CSB-1序列和CSB-3序列在4種光唇魚屬魚類之間均存在一定的差異?？刂茀^(qū)序列的差異，可以體現(xiàn)出種群的演化情況，因此適合于群體進(jìn)化趨勢研究[40]

基于線粒體DNA13種編碼蛋白質(zhì)基因構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹，光唇魚屬不是一個單系類群，其中體側(cè)具有垂直條紋的光唇魚聚成一個分支（亞支系A(chǔ)），體側(cè)無垂直條紋的寬口光唇魚和云南光唇魚聚成另一分支（亞支系C），兩個小分支與白甲魚屬的亞支B共同聚成支系Ⅰ，這與薛艷潔等利用線粒體

COⅡ基因和D-loop區(qū)堿基序列所獲得的結(jié)果基本一致，符合Kottelat[5]提出的狹義光唇魚分類的觀點(diǎn)。本研究的4種光唇魚屬魚類中，側(cè)條光唇魚與吉首光唇魚的親緣關(guān)系最近，虹彩光唇魚與其他3種光唇魚親緣關(guān)系最遠(yuǎn)，這與楊楊等[30的研究結(jié)果基本一致。厚刺光唇魚曾被鑒定為溫州光唇魚，本研究中，厚刺光唇魚與溫州光唇魚處于不同的分支，表明2種光唇魚不是同一物種，符合袁樂洋[4]將厚刺光唇魚作為一個新種的觀點(diǎn)。

4結(jié)論

本研究測定了4種光唇魚屬魚類線粒體基因組，其線粒體DNA序列全長16585＼～16595bp，包含13個編碼蛋白質(zhì)基因、2個編碼rRNA基因、22個編碼tRNA基因和1個非編碼控制區(qū)。8個tRNA基因和ND6基因位于輕鏈，其余基因位于重鏈；在13種編碼蛋白質(zhì)基因中，厚刺光唇魚的ND2基因的起始密碼子為ATC，側(cè)條光唇魚和厚刺光唇魚的ND3基因的起始密碼子為GTG，4種光唇魚的其余基因起始密碼子均為ATG，而終止密碼子共有4種類型（TAA、TAG、TA和T）;22種tRNA基因中， tRNA^Ser 缺少DHU臂，其余具有典型三葉草結(jié)構(gòu)?？刂茀^(qū)變異較大，可識別出終止序列區(qū)、中央保守區(qū)和保守序列區(qū)。系統(tǒng)發(fā)育樹分析結(jié)果顯示，光唇魚屬魚類分為2個分支；側(cè)條光唇魚與吉首光唇魚親緣關(guān)系最近，與虹彩光唇魚親緣關(guān)系最遠(yuǎn)。

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（責(zé)任編輯：陳海霞）