亚洲免费av电影一区二区三区,日韩爱爱视频,51精品视频一区二区三区,91视频爱爱,日韩欧美在线播放视频,中文字幕少妇AV,亚洲电影中文字幕,久久久久亚洲av成人网址,久久综合视频网站,国产在线不卡免费播放

        ?

        三種花色黃芩花青素合成酶基因(ANS)的克隆及表達分析

        2025-04-16 00:00:00尹鑫管仁偉張翠翠趙一伍冉志芳趙秋晨孫新茹王淑林慧彬郭鳳丹
        山東農(nóng)業(yè)科學 2025年3期
        關鍵詞:表達分析基因克隆花色

        摘要:花青素合成酶(anthocyanidin synthase,ANS)在花青素合成途徑中將無色花青素催化合成有色花青素。本研究通過RT-PCR方法,從藍紫花、玫紅花、白花黃芩中克隆得到ANS基因的全長cDNA序列,分別命名為SbANS-b、SbANS-r、SbANS-w。經(jīng)序列比對,SbANS-b、SbANS-r和SbANS-w在第16、194、242、331、875、945、947 bp處存在堿基差異,其編碼的SbANS-B、SbANS-R和SbANS-W蛋白存在3個氨基酸差異。生物信息學分析顯示,三個SbANS蛋白均屬于無色花青素雙加氧酶樣蛋白超家族,定位在細胞質(zhì)中,具有典型20G-Fe Il_Oxy蛋白保守結(jié)構(gòu)域,還含有DHQ-2結(jié)合位點、MES/抗壞血酸結(jié)合位點、鐵離子結(jié)合位點、20G結(jié)合位點、DHQ-1結(jié)合位點等。ANS系統(tǒng)發(fā)育樹顯示,黃芩與芡歐鼠尾草的ANS聚在一個分支,親緣關系最近,與大豆、擬南芥等物種的ANS親緣關系次之?;虮磉_結(jié)果顯示,SbANS基因在藍紫花黃芩中整體表達水平最高。隨著花的發(fā)育,藍紫花黃芩SbANS基因表達量呈現(xiàn)先降低后升高的趨勢,玫紅花黃芩SbANS基因表達量呈現(xiàn)逐步升高的趨勢,白花黃芩SbANS基因表達量呈現(xiàn)先升高后降低的趨勢。藍紫花和玫紅花黃芩各花發(fā)育階段間SbANS的表達量差異極顯著。本研究結(jié)果可為進一步研究不同花色黃芩中SbANS基因功能差異、揭示黃芩花色變異的分子機理提供重要指導。

        關鍵詞:黃芩;花色;花青素合成酶;基因克??;表達分析

        中圖分類號:S567.239:Q78 文獻標識號:A 文章編號:1001-4942(2025) 03-0019-08

        黃芩(Scutellaria baicalensis Georgi)屬于唇形科黃芩屬植物,多以根入藥?,F(xiàn)代臨床研究表明,黃芩具有抗腫瘤、抗菌、抑制心腦血管疾病、抗氧化及抗炎等作用。黃芩與其他中藥聯(lián)合使用可用于多種疾病的臨床治療,如:黃芩與蒲公英聯(lián)用可以治療扁桃體發(fā)炎、肺炎:黃芩與連翹聯(lián)用能夠消腫止痛,清熱瀉火:黃芩與穿心蓮聯(lián)用可以治療瘡癤膿瘍,皮膚化膿性感染;黃芩與甘草、白芍聯(lián)用可以治療腹瀉、腸胃積熱。

        世界上共有360種唇形科黃芩屬植物,其中中國有98種及48個變種,在黃芩種內(nèi)也出現(xiàn)了不同花色的變異?;ò曛饕噬镔|(zhì)為花青素,花青素屬于黃酮類化合物,植物中花青素的合成共分為三步:①以丙二酰輔酶A和對香豆酰輔酶A為前體,經(jīng)過查爾酮合酶(CHS)和查爾酮異構(gòu)酶(CHI)的催化合成二氫山奈酚(DHK);②DHK被類黃酮3’-羥化酶(F3'H)羥基化以產(chǎn)生二氫槲皮素(DHQ)或被類黃酮3',5'-羥化酶(F3'5'H)羥基化以產(chǎn)生二氫楊梅素(DHM);③二氫黃酮醇還原酶(DFR)和花青素合成酶(ANS)將無色二氫黃酮醇(DHK、DHQ和DHM)催化生成呈色的花青素類物質(zhì)。其中ANS作為花青素合成的最后一步關鍵酶,能夠催化無色花青素合成有色花青素。有報道指出,ANS基因的突變是導致樹莓黃果表型的原因。目前,已在黑加侖、洋蔥、油菜、東方百合、藍莓等植物中克隆到ANS基因。但關于黃芩ANS基因的研究尚未見報道。

        藍紫色是黃芩常見的花色,山東省中醫(yī)藥研究院中藥資源研究所前期篩選得到了玫紅花和白花的黃芩變異材料,并通過花青素生物合成的代謝組和轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析得到了參與黃芩花顏色分化的關鍵候選基因ANS。本研究利用RT -PCR(reverse transcription PCR)技術(shù)從三種花色黃芩的花中克隆得到SbANS基因,對其進行生物信息學分析,并采用qRT-PCR(real-time quantita-tive PCR)技術(shù)分析SbANS基因在不同花色黃芩不同花發(fā)育階段的表達模式,以期為研究黃芩花色變異原理奠定基礎,并為進一步運用分子育種技術(shù)改良黃芩品質(zhì)提供技術(shù)支撐。

        1 材料與方法

        1.1 植物材料

        本研究所用黃芩材料均種植于山東省中醫(yī)藥研究院中藥資源研究所(下稱本單位)苗圃內(nèi),將花期劃分為三個發(fā)育階段,即F1幼蕾期、F2中蕾期、F3盛花期(花期狀態(tài)參考文獻[12]),于2023年6月分別采集藍紫花(SB)、玫紅花(SR)、白花(SW)黃芩三個時期的花材料,置于液氮中速凍,-80℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2 SbANS基因克隆

        通過Primer Primier 5.0軟件,以轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)得到的SbANS基因序列為模板設計SbANS基因全長引物(表1)。分別提取3種花色黃芩花的RNA并反轉(zhuǎn)錄成cDNA。根據(jù)PCR試劑盒(寶生物)說明書配制PCR反應體系進行PCR擴增。PCR擴增條件:95 0C預變性5 min;95℃30 s,52℃30 s,72℃1.5 min,35個循環(huán);72℃延伸7 min。

        利用1%的瓊脂糖凝膠對PCR產(chǎn)物進行瓊脂糖凝膠電泳,采用天根生化科技(北京)有限公司的膠回收試劑盒回收目的片段,將回收的目的片段連接到pMD18-T載體(寶生物)后轉(zhuǎn)化大腸桿菌感受態(tài)細胞,挑取單克隆,通過菌液PCR檢測,將陽性單克隆送至北京擎科生物科技股份有限公司測序。

        1.3 SbANS基因生物信息學分析

        利用DNAMAN軟件對克隆得到的SbANS序列進行核苷酸比對;采用ORF(開放閱讀框)在線分析工具ORF finder預測SbANS的ORF,并利用Gene Tool軟件將ORF翻譯成氨基酸序列:利用DNAMAN軟件對SbANS蛋白進行氨基酸比對。利用ExPASy網(wǎng)站(https://web. expasy. org/prot-param/)的在線分析軟件進行SbANS蛋白的理化性質(zhì)分析。

        利用SOPMA、NCBI的CD - search功能、TM-HMM、SignalP 5.0、NetPhos 3.1、NetOGlyc 4.0和NetNGlyc 1.0等在線工具分別預測SbANS的二級結(jié)構(gòu)、蛋白保守結(jié)構(gòu)域、跨膜結(jié)構(gòu)域、信號肽、磷酸化位點、0型和N型糖基化位點;用Plant - mPLoc和SWISS - MODEL(https://swissmodel. expasy.org/)對SbANS蛋白進行亞細胞定位和同源建模分析。

        利用DNAMAN軟件進行ANS蛋白多重序列比對,通過ClustalX和MEGA 6.0軟件采用鄰接法(neighbor-joining,NJ)對不同物種ANS構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,Bootstrap值設為1 000。

        1.4 RNA提取及SbANS基因表達分析

        根據(jù)RNA提取試劑盒(天根)方法分別提取三種花色黃芩不同發(fā)育階段花的總RNA,通過1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測RNA質(zhì)量后利用反轉(zhuǎn)錄試劑盒(寶生物)反轉(zhuǎn)錄為cDNA。根據(jù)SbANS基因序列設計熒光定量引物(表1),并通過TBtools軟件檢測引物特異性。以黃芩18SrRNA為內(nèi)參基因,以稀釋5倍的cDNA作為熒光定量PCR(qRT-PCR)的模板,根據(jù)實時定量試劑盒(寶生物)的方法進行基因表達分析。每種模板均進行3次技術(shù)重復,每種花色的3個花期都設計3次生物學重復。用2-ΔΔCt方法計算基因的相對表達量,用GraphPad Prism 9.0進行差異顯著性分析。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 SbANS基因的克隆

        以三種花色黃芩花cDNA為模板進行PCR擴增,瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果如圖1所示。經(jīng)單克隆測序,三種花色黃芩的SbANS基因cDNA全長均為1137 bp,分別命名為SbANS-6、SbANS -r、SbANS-w,三者在第16、194、242、33 1、875、945、947 bp處存在堿基差異(圖2),這與本單位前期的轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果一致。

        2.2 SbANS理化性質(zhì)

        Gene Tool軟件預測結(jié)果顯示SbANS -b、SbANS-r、SbFANS -w均編碼377個氨基酸,且SbANS-B、SbANS-R、SbANS-W蛋白的第6、111、316位氨基酸存在差異(圖3)。理化性質(zhì)分析結(jié)果(表2)表明,SbFANS-B、SbANS-R、SbANS -W蛋白分子量分別為43.16、43.19、43.13 kDa,理論等電點分別為5.92、6.08、5.92,平均親水系數(shù)均為負值,說明這三個蛋白均為親水性蛋白:Sb-FANS-B、SbANS -R、SbANS -W蛋白的不穩(wěn)定系數(shù)分別為40. 39、41. 09、39. 66,說明白花黃芩的ANS蛋白與藍紫花和玫紅花黃芩相比更為穩(wěn)定。

        2.3 SbANS蛋白結(jié)構(gòu)分析

        二級結(jié)構(gòu)預測結(jié)果(表3)顯示,SbANS -B、SbANS-R、SbANS-W均由α-螺旋、無規(guī)則卷曲、延伸鏈、β-轉(zhuǎn)角組成,但各組分比例存在差異,均以無規(guī)則卷曲占比最高,其次為α-螺旋。

        保守結(jié)構(gòu)域分析結(jié)果顯示,SbANS蛋白屬于無色花青素雙加氧酶樣蛋白超家族,含有異青霉素N合成酶及其相關的雙加氧酶保守結(jié)構(gòu)域和2-氧戊二酸/Fe(Ⅱ)依賴性雙加氧酶活性的蛋白質(zhì)N-末端高度保守區(qū)域(圖4)。

        跨膜結(jié)構(gòu)域和信號肽預測結(jié)果顯示,SbANS蛋白不含有跨膜結(jié)構(gòu)域,不含信號肽。亞細胞定位預測結(jié)果顯示三個蛋白均定位在細胞質(zhì)中。

        SbANS蛋白磷酸化預測結(jié)果(圖5a、b)顯不,SbANS-B/R存在19個絲氨酸(Ser)、5個蘇氨酸(Thr)、6個酪氨酸(Tyr)磷酸化位點,SbANS-W存在20個絲氨酸(Ser)、5個蘇氨酸(Thr)、6個酪氨酸(Tyr)磷酸化位點。糖基化位點預測結(jié)果表明,SbANS-B、SbANS-R和SbANS-W均含有3個N型糖基化位點(圖Sc)及6個0型糖基化位點。

        同源建模結(jié)果{圖6)顯示,SbANS的蛋白模型與松蒿(Phtheirospermum japonicum) AOA830C745.I.A Pro-tein的一致性較高,序列一致性為75. 35070,模型質(zhì)量評估(GMQE)值為0.87,模型可信度較高。

        2.4 SbANS蛋白多序列比對及系統(tǒng)發(fā)育分析

        將SbANS-B、SbANS-W、SbANS-R蛋白與相近物種同源蛋白序列進行多重比對分析,結(jié)果(圖7)顯示,SbANS具有20G-FeⅡ_Oxy蛋白保守結(jié)構(gòu)域,還含有DHQ-2結(jié)合位點、MES/抗壞血酸結(jié)合位點、鐵離子結(jié)合位點、20G結(jié)合位點、DHQ-1結(jié)合位點。

        基于ANS蛋白序列的系統(tǒng)進化分析結(jié)果(圖8),黃芩與同為唇形科的芡歐鼠尾草親緣關系最近,與大豆、擬南芥等物種的親緣關系次之。

        2.5 SbANS基因不同花發(fā)育時期的表達分析

        對藍紫花、玫紅花和白花黃芩不同發(fā)育階段花中ANS基因的表達情況進行分析,以藍紫花F1時期的表達量為對照,結(jié)果(圖9)顯示,在花發(fā)育過程中,藍紫花黃芩的SbANS基因表達量呈現(xiàn)先降低后升高的趨勢,在F1幼蕾時期表達量最高,其次是F3盛花期,F(xiàn)2中蕾期表達量最低:玫紅花黃芩的SbANS基因表達量呈現(xiàn)逐步升高的趨勢,在F3盛花期表達量達到最高:白花黃芩的SbANS基因表達量呈現(xiàn)先升高后降低的趨勢,F(xiàn)2中蕾期的表達量最高,其次是F3盛花期,F(xiàn)1幼蕾期的表達量最低。藍紫花和玫紅花黃芩ANS表達量在不同花發(fā)育階段間差異極顯著,白花黃芩ANS基因只在F1和F2階段間差異極顯著。不同材料間比較,藍紫花黃芩各發(fā)育階段花中的SbANS基因表達量最高。

        ANS是花青素合成途徑中的關鍵酶之一,作為花青素合成最后一步的關鍵酶,能夠催化無色花青素合成有色花青素。本研究在前期轉(zhuǎn)錄組分析的基礎上,通過RT-PCR方法克隆獲得三種花色黃芩ANS基因全長1137 bp的cDNA序列。通過序列比對發(fā)現(xiàn),SbANS-b、SbFANS-r和SbANS -w在第16、194、242、331、875、945、947 bp處存在堿基差異。生物信息學分析結(jié)果表明,三個SbANS蛋白均屬于無色花青素雙加氧酶樣蛋白超家族,不含有跨膜結(jié)構(gòu),定位在細胞質(zhì)中,二級結(jié)構(gòu)以無規(guī)則卷曲為主,不含信號肽,與之前報道的ANS蛋白分析結(jié)果一致:SbANS-B和SbANS -R均存在19個絲氨酸(Ser)、5個蘇氨酸(Thr)、6個酪氨酸(Tyr)磷酸化位點,而SbANS-W存在20個絲氨酸(Ser)、5個蘇氨酸(Thr)、6個酪氨酸(Tyr)磷酸化位點。

        三種花色黃芩不同發(fā)育階段花中SbANS基因的表達分析結(jié)果顯示,SbANS基因在花發(fā)育過程中的表達量變化因花色而異,在藍紫色花中表現(xiàn)為先降低后升高,在玫紅花中表現(xiàn)為逐漸升高,而在白花中表現(xiàn)為先升高后降低:不同花色間比較,白花和玫紅花的SbANS基因表達量明顯低于藍紫花。

        綜合本研究結(jié)果,藍紫花、玫紅花和白花黃芩的SbANS基因存在堿基差異,導致其氨基酸序列存在差異,推測這可能導致三種花色黃芩ANS蛋白功能差異,進而使其呈現(xiàn)出不同的花色。另外,白花黃芩與藍紫花、玫紅花黃芩ANS蛋白的磷酸化位點存在差異,而蛋白磷酸化在調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)的活性和穩(wěn)定性中起到重要作用,因此推測ANS蛋白磷酸化位點的差異也可能是導致黃芩呈現(xiàn)不同花色的原因之一。玫紅花和白花中SbANS基因的表達量明顯低于藍紫花,可能是玫紅花和白花中花青素含量低的緣故。SbANS基因在黃芩花發(fā)育過程中的表達變化因花色不同而不同,推測SbANS基因的表達可能還受其他轉(zhuǎn)錄因子或外界環(huán)境的影響,具體原因有待進一步研究。本研究結(jié)果可為進一步研究不同花色黃芩中SbANS基因功能差異、揭示黃芩花色變異的分子機理提供一定的研究基礎。

        基金項目:山東省中醫(yī)藥科技發(fā)展計劃項目(Q-2022083);山東省中醫(yī)藥研究院科研孵化基金項目(2022SACM-4);國家中醫(yī)藥管理 局中藥資源保障能力提升工程項目(E2023]19號);中央本級重大增減支項目(2060302);山東省科技型中小企業(yè)創(chuàng)新能力提升工程項目(2022TSGC1059,2023TSGC0444);濟南市農(nóng)業(yè)應用技術(shù)創(chuàng)新計劃項目(CX202112)

        猜你喜歡
        表達分析基因克隆花色
        猜猜這是哪張牌?
        三個小麥防御素基因的克隆及序列分析
        紅花生育酚環(huán)化酶基因的克隆及表達分析
        哪種花色是王牌
        玉米紋枯病病菌y—谷氨酰轉(zhuǎn)肽酶基因克隆與表達分析
        信號分子與葉銹菌誘導下小麥病程相關蛋白1基因的表達分析
        水稻OsCATA基因相互作用蛋白的篩選和表達分析
        山桃醇腈酶基因PdHNL1的克隆、序列分析與原核表達
        初夏花色
        紅花低分子量油體蛋白基因的克隆與系統(tǒng)進化分析
        久久亚洲精品成人综合| 免费人成再在线观看视频| 婷婷成人基地| 亚洲黄色性生活一级片| 日本精品少妇一区二区| 亚洲av成人无码久久精品老人| 国产xxxx99真实实拍| 亚洲AV无码秘 蜜桃1区| 国产情侣自拍偷拍精品| 无码精品一区二区三区在线| 少妇高潮尖叫黑人激情在线 | 女同在线视频一区二区 | 少妇被粗大的猛烈进出69影院一| 日本黄页网站免费大全| 蜜桃成人永久免费av大| 加勒比日韩视频在线观看| 亚洲成a人无码| a毛片全部免费播放| 精品国产一区二区三区男人吃奶| 三级国产精品久久久99| 无码一区二区三区在线| 日韩欧美第一区二区三区| 水蜜桃在线观看一区二区国产| 亚洲国产精品成人精品无码区在线| 毛片在线播放a| 精品高清国产乱子伦| 国产精品人伦一区二区三| 国模无码一区二区三区不卡| 久久AV中文一区二区三区 | 99热免费观看| 国产精品一级黄色大片| 日本无遮挡真人祼交视频| 丰满人妻av无码一区二区三区| 久久一日本道色综合久久大香| 国产自拍视频免费在线观看| 狠狠躁日日躁夜夜躁2020| 国产在线一91区免费国产91| 久久精品一区二区三区不卡牛牛| 国产亚洲欧美精品永久| 欧美丰满大屁股ass| 国产精品自拍首页在线观看|