01 從生物演化到AI突破,E2VD模型革新病毒進化預(yù)測
近日,北京大學(xué)深圳研究生院信息工程學(xué)院田永鴻、陳杰團隊在AI"for"Science方面取得了新進展,團隊聯(lián)合廣州國家實驗室周鵬開展研究,他們通過定制化蛋白質(zhì)語言模型和創(chuàng)新性進化預(yù)測策略,實現(xiàn)了跨病毒類型的通用進化預(yù)測,極大展現(xiàn)了AI助力自然科學(xué)研究范式革新的潛力。
在自然界,物種多樣性與生物體內(nèi)承載功能的蛋白質(zhì)相互約束,這是因為蛋白質(zhì)作為功能的載體決定了生物的性狀,而這些性狀經(jīng)過選擇壓力篩選后形成了當下的物種多樣性分布結(jié)果。立足達爾文進化論及表觀遺傳學(xué)持續(xù)新研究的角度,生物演化與環(huán)境組成了復(fù)雜系統(tǒng),是與環(huán)境的協(xié)同演化。
受此啟發(fā),研究團隊基于進化論視角重新審視病毒進化預(yù)測難題,提出了解決病毒進化兩大本質(zhì)問題的跨病毒類型、跨毒株類型的通用進化預(yù)測模型E2VD,為疫苗、藥物的快速主動更新以及提高人類對于新發(fā)病毒感染的響應(yīng)速度提供了強大工具,支撐和加速對于物種復(fù)雜進化機制的探索。
02 引入超納后,超強韌合金誕生
近日,西安交通大學(xué)金屬材料強度國家重點實驗室、微納尺度材料行為研究中心吳戈、單智偉團隊和該校劉暢、劉思達,聯(lián)合香港城市大學(xué)先進結(jié)構(gòu)材料研究中心呂堅,在超強韌合金方面取得新突破。
2017年,吳戈教授與呂堅院士提出超納(Supra-nano)概念,意為結(jié)構(gòu)特征尺寸小于10"nm,他們通過在材料中引入超納結(jié)構(gòu)單元,整體材料展現(xiàn)出一些奇異性能。在此前研究基礎(chǔ)上,此次研究團隊通過晶粒內(nèi)部以及晶界附近的兩種有序結(jié)構(gòu)設(shè)計,實現(xiàn)了具有2.6"GPa抗拉強度和10%均勻延伸率的合金,為打造出兼具超高強度與卓越均勻延伸率的合金開辟了新道路。
他們巧妙利用短程序(SRO)與FCC基體的正界面作用能,調(diào)控短程序在晶界附近偏聚,形成短程有序界面。SRO在晶界附近的偏聚顯著提升了晶界抵抗位錯運動所需的應(yīng)力水平,屈服強度提升至2.2"GPa。同時,他們在FCC相的晶界附近和晶粒內(nèi)部引入兩種有序結(jié)構(gòu)(SRO和超納析出相),形成互補的強化和塑化機制,促進了高應(yīng)變硬化率和優(yōu)異延伸率。
03 植物抗病基因“層級式”演化規(guī)律:以退為進,攻守有道
植物在其整個生命周期和演化過程中,面臨各種病原體的持續(xù)威脅。為了應(yīng)對這些威脅,植物演化出了數(shù)量龐大的抗病基因(disease"resistance"gene,"R基因)。維持較多種類的R基因有利于植物應(yīng)對環(huán)境中復(fù)雜多變的病原,但因此也會影響植物的正常生長發(fā)育,即付出“適應(yīng)性代價”。那么,在這種“抗病或生長”的矛盾博弈中,植物R基因是如何演化,從而促進植物適應(yīng)環(huán)境得以繁衍至今的呢?
南京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院陳建群/邵珠卿團隊長期致力于解析植物免疫系統(tǒng)的演化。此前,該團隊聚焦于植物最大的抗病基因家族—NLR基因,發(fā)現(xiàn)生存環(huán)境中病原的增加(如植物登陸)驅(qū)動了植物基因組中NLR基因數(shù)量的明顯擴張。近期,研究團隊通過系統(tǒng)收集808個植物基因組,將NLR基因的“生態(tài)適應(yīng)性演化”推廣到了真菌異養(yǎng)等SLH物種,并通過比較研究SLH物種與其近緣non-SLH物種,清晰地展示了SLH物種NLR基因數(shù)量收縮的“來龍去脈”,有力地證實了NLR基因的“生態(tài)適應(yīng)性演化”這一科學(xué)假說的可靠性和普適性,系統(tǒng)論證了病原選擇壓力對植物R基因演化的驅(qū)動作用。
04 全球最小微型醫(yī)療機械人,突破現(xiàn)有技術(shù)“不可能三角”
香港科技大學(xué)(科大)電子及計算機工程學(xué)系申亞京帶領(lǐng)團隊成功研發(fā)出一款全球最小的多功能手術(shù)機械人。這款微型醫(yī)療手術(shù)機械人的直徑僅為0.95毫米,較現(xiàn)有的機械人小60%。該機械人集三大功能于一身,突破現(xiàn)有技術(shù)限制的“不可能三角”。它具備高清拍攝功能,有助延伸障礙物檢測距離至約9.4毫米,與理論極限相比,這是10倍提升。其移動精確度亦提升至小于30微米,達至更細小、更靈巧,并能大幅擴展其成像區(qū)域,超越中心傳像束的固有成像比例約25倍。該機器人可協(xié)助醫(yī)療人員在人體內(nèi)取樣、傳送藥物及進行激光熱療手術(shù),其障礙物檢測距離實現(xiàn)10倍提升,有助將微創(chuàng)手術(shù)應(yīng)用于人體內(nèi)支氣管末端、輸卵管等微小腔道分支,擴大其應(yīng)用范圍。
微型機械人具有多項優(yōu)點,能進入狹窄腔道,并有助于病人迅速康復(fù),感染風(fēng)險亦較低。當下,微型機械人已應(yīng)用在各種疾病的診療中,例如在心臟手術(shù)中協(xié)助置入冠狀動脈支架,在胃潰瘍和十二指腸潰瘍手術(shù)中進行腹腔鏡切除治療等。
05 電化學(xué)制備均一單層氧化石墨烯,工業(yè)化方法來了
氧化石墨烯(GO)是一類重要的石墨烯材料,具有多種不同于石墨烯的獨特性質(zhì),是目前應(yīng)用最為廣泛的二維材料,在熱管理、復(fù)合材料等領(lǐng)域已實現(xiàn)工業(yè)化應(yīng)用,在物質(zhì)分離、生物醫(yī)藥等領(lǐng)域也表現(xiàn)出良好的應(yīng)用前景。目前,GO的批量制備主要采用化學(xué)氧化方法(如Hummers法),即通過石墨與濃硫酸、濃硝酸、高錳酸鉀等強氧化劑的反應(yīng)來實現(xiàn)GO制備。該反應(yīng)迄今已有150多年的歷史,由于大量強氧化劑的使用,在制備過程中存在爆炸風(fēng)險、嚴重的環(huán)境污染、成本高等問題,已成為制約GO產(chǎn)業(yè)發(fā)展的瓶頸。
中國科學(xué)院金屬研究所沈陽材料科學(xué)國家研究中心先進炭材料研究部任文才團隊發(fā)明了微液膜電解(LME)方法精確控制水的擴散,實現(xiàn)了電解水氧化與水吸附脫插層的動態(tài)平衡,進而實現(xiàn)了均一單層GO的工業(yè)化連續(xù)制備。GO的單層率≥99%,產(chǎn)率可達~180"wt.%,而成本僅為Hummers方法的1/7。利用LME方法可以實現(xiàn)對GO氧化程度和尺寸的有效控制以及利用純水電解制備GO。該工作不僅為電化學(xué)制備GO提供了新的認識,而且提供了一種低成本、高產(chǎn)率、可持續(xù)制備均一單層GO的方法。
06 借鑒人腦提出“存內(nèi)稀疏”架構(gòu),二維半導(dǎo)體在AI領(lǐng)域潛力逐步釋放
稀疏性"(Sparsity)"是人腦中的神經(jīng)突觸的本征屬性。在大腦發(fā)育過程中,超過一半的突觸會以細粒度和非結(jié)構(gòu)化的方式被剪枝,這是人腦具有高能效的關(guān)鍵因素。受此啟發(fā),稀疏神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)早在20世紀90年代就被提出,已成為人工智能輕量化的主流路徑。雖然稀疏神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中90%的權(quán)重可以被剪枝,但剪枝過程中需要反復(fù)與外部存儲設(shè)備進行索引,消耗了整個系統(tǒng)90%以上的能耗和時延。類比于分離計算和存儲的馮·諾依曼瓶頸,索引過程成為稀疏神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)硬件的瓶頸。目前產(chǎn)業(yè)界主流方案為英偉達自A100芯片開始提出的大粒度、結(jié)構(gòu)化剪枝,其本質(zhì)是通過一定程度的精度犧牲來減輕索引開銷,并未在根本上解決索引瓶頸。為了解決稀疏神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)軟硬件不適配的問題,南京大學(xué)王欣然及合作團隊受人腦啟發(fā),借鑒了神經(jīng)生物學(xué)模型,他們發(fā)現(xiàn),稀疏性信息在位置上也需要盡可能接近權(quán)重信息,并直接參與稀疏運算。
團隊首次提出稀疏神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的“存內(nèi)稀疏”計算架構(gòu),并基于二維半導(dǎo)體鐵電晶體管技術(shù)進行了免索引單元開發(fā)和陣列級片上演示,打破了稀疏神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)硬件技術(shù)瓶頸。其工作也充分展示了二維半導(dǎo)體等新材料、新器件技術(shù)賦能人工智能硬件的潛力,二維材料具有低溫后道工藝兼容的特點,可以與成熟的硅基電路進行三維單片集成,突破先進封裝技術(shù)在互聯(lián)密度方面的局限,進一步提升近存、存算芯片的效能。