摘要
為明確云南省常見馬鈴薯品種對(duì)馬鈴薯金線蟲Globodera"rostochiensis抗性的差異,選擇云南省常見或生產(chǎn)上主要推廣的馬鈴薯品種25個(gè),參考Koroleva的評(píng)價(jià)方法,結(jié)合抗性分子標(biāo)記N146、N195、57R、TG432、Gro141和抗性基因H1的相對(duì)表達(dá)量,評(píng)價(jià)馬鈴薯品種對(duì)金線蟲的抗性,分析抗性與抗性基因H1表達(dá)量的相關(guān)性。結(jié)果顯示:供試的25個(gè)品種中,有7個(gè)品種根系上馬鈴薯金線蟲的孢囊或雌蟲≤5個(gè),表現(xiàn)抗性,其他品種根系上的孢囊或雌蟲大于5個(gè),表現(xiàn)為易感;抗性分子標(biāo)記檢測發(fā)現(xiàn),有10個(gè)品種含有抗馬鈴薯金線蟲基因H1;對(duì)這10個(gè)品種的H1基因相對(duì)表達(dá)量的檢測結(jié)果顯示,接種馬鈴薯金線蟲后‘V7’‘黃金薯’‘會(huì)薯19號(hào)’‘宣薯5號(hào)’‘云薯202’‘云薯304’‘云薯505’"7個(gè)品種的H1基因較未接種時(shí)上調(diào)表達(dá),而‘P14187’‘會(huì)薯15號(hào)’‘希森3號(hào)’3個(gè)品種的H1基因下調(diào)表達(dá),攜帶H1基因的馬鈴薯品種是否對(duì)金線蟲有抗性與抗性基因H1表達(dá)量呈正相關(guān)。研究結(jié)果為抗金線蟲馬鈴薯品種選育與應(yīng)用及進(jìn)一步闡明馬鈴薯抗金線蟲的分子機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。
關(guān)鍵詞
馬鈴薯品種;"馬鈴薯金線蟲;"H1基因;"抗性
中圖分類號(hào):
S"435.32
文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:"A
DOI:"10.16688/j.zwbh.2024175
The"correlations"between"the"resistance"of"common"potato"varieties"to"Globodera"rostochiensis"and"the"H1"gene"in"Yunnan"province
DUAN"Jinfeng,"YANG"Yanmei,"LIU"Yuzhu,"LI"Qiankun,"HU"Xianqi*
(State"Key"Laboratory"for"the"Conservation"and"Utilization"of"Biological"Resources"in"Yunnan,"
College"of"Plant"Protection,"Yunnan"Agricultural"University,"Kunming"650201,"China)
Abstract
To"identify"the"differences"in"resistance"among"common"potato"varieties"to"Globodera"rostochiensis"in"Yunnan"province,"25"varieties,"including"both"common"and"widely"cultivated"ones,"were"selected"for"evaluation"using"Koroleva’s"method."In"this"study"the"molecular"markers"N146,"N195,"57R,"TG432,"Gro141,"and"the"H1"resistance"gene"were"employed"to"evaluate"resistance"levels"and"analyze"the"correlation"between"resistance"and"H1"gene"expression."The"results"showed"that"among"the"25"varieties"tested,"seven"varieties"exhibited"resistance,"with"less"than"five"cysts"or"females"of"G.rostochiensis"on"their"root"systems,"while"the"remaining"varieties,"with"more"than"five"cysts"or"females,"were"susceptible."Molecular"marker"analysis"revealed"that"ten"varieties"containing"the"G.rostochiensis"resistance"gene"H1."Further"investigation"into"the"relative"expression"of"the"H1"gene"after"inoculation"with"G.rostochiensis"showed"that"in"seven"varieties,"namely"‘V7’"‘Huangjinshu’"‘Huishu"19’"‘Xuanshu"5’"‘Yunshu"202’"‘Yunshu"304’,"and"‘Yunshu"505’,"the"H1"gene"expression"was"upregulated"compared"to"uninoculated"controls."However,"in"three"varieties"‘P14187’"‘Huishu"15’"and"‘Xisen"3’,"the"H1"gene"expression"was"downregulated."The"study"concluded"that"the"resistance"of"potato"varieties"carrying"the"H1"gene"were"positively"correlated"with"H1"gene"expression."These"findings"provide"foundation"for"selecting"and"applying"potato"varieties"resistant"to"G.rostochiensis"and"for"further"elucidating"the"molecular"mechanisms"underlying"potato"resistance"to"G.rostochiensis.
Key"words
potato"varieties;"Globodera"rostochiensis;"H1"gene;"resistance
馬鈴薯Solanum"tuberosum是重要的糧食作物之一,在云南省種植面積僅次于玉米和水稻,云南省馬鈴薯在全國面積和總產(chǎn)量均居前4名,是中國馬鈴薯的主要生產(chǎn)地之一[12]。
馬鈴薯孢囊線蟲(potato"cyst"nematode,PCN)是為害馬鈴薯等茄科植物的病原線蟲[3],主要包括馬鈴薯金線蟲Globodera"rostochiensis和馬鈴薯白線蟲G.pallida,分別在全世界79個(gè)和55個(gè)國家有發(fā)生和分布,100多個(gè)國家將其列為重要的對(duì)外檢疫性有害生物,也是我國重要的進(jìn)境檢疫性有害生物[47],它們的為害可以造成馬鈴薯產(chǎn)量損失19%~80%[8]。2018年-2020年調(diào)查發(fā)現(xiàn),在中國貴州省、四川省和云南省7縣(區(qū))的局部馬鈴薯產(chǎn)區(qū)發(fā)現(xiàn)了馬鈴薯金線蟲[913]。
PCN的卵可以在孢囊內(nèi)休眠存活很多年,且它們的天敵很少見,這意味著一旦傳入、定殖就很難根除。面對(duì)PCN的為害,當(dāng)前的防控方法主要是植物檢疫、非寄主植物輪作、種植抗性品種、生物防治、化學(xué)防治等,種植抗性品種被認(rèn)為是保護(hù)馬鈴薯等茄科作物免受PCN侵害最經(jīng)濟(jì)、環(huán)保和有效的方法[14]。
研究表明,對(duì)于馬鈴薯金線蟲致病型Ro1~Ro5,最常見的是引入單一顯性基因H1控制[1516],H1基因座位于馬鈴薯Ⅴ號(hào)染色體長臂末端,通過激活馬鈴薯的過敏反應(yīng)使其對(duì)馬鈴薯金線蟲致病型Ro1和Ro4表現(xiàn)出抗性[1718]。Solanum"spegazzinii"Ⅶ號(hào)染色體上的Gro1基因?qū).rostochiensis有廣譜抗性[19],從S.spegazzinii的Ⅹ、Ⅺ和Ⅲ號(hào)染色體上鑒定到3個(gè)數(shù)量性狀基因座(quantitative"trait"loci,"QTL)Gro1.2、Gro1.3和Gro1.4也參與了對(duì)馬鈴薯金線蟲的抗性[20],位于Ⅴ號(hào)染色體的短臂上QTL"Grp1對(duì)馬鈴薯金線蟲和馬鈴薯白線蟲均具有抗性[21]。
本研究選用云南省生產(chǎn)上主要推廣的馬鈴薯品種25個(gè),在溫室接種進(jìn)行抗馬鈴薯金線蟲病評(píng)價(jià),開展相關(guān)抗性基因分子檢測,并以篩選出的具有H1抗性基因的馬鈴薯品種為研究材料,采用qPCR技術(shù),檢測受到馬鈴薯金線蟲侵染后,馬鈴薯品種中H1基因的表達(dá)情況及其對(duì)金線蟲的抗性與抗性基因H1表達(dá)量的相關(guān)性。旨在為抗金線蟲馬鈴薯品種選育、進(jìn)一步解析馬鈴薯抗金線蟲的分子機(jī)制、應(yīng)用抗病品種防治馬鈴薯金線蟲病提供科學(xué)依據(jù)。
1"材料與方法
1.1"供試材料
供試馬鈴薯金線蟲的孢囊分離自云南省昭通市昭陽區(qū)靖安鎮(zhèn)(27.59°N,103.69°E)采集的病土。
供試25個(gè)馬鈴薯品種收集于相關(guān)種薯生產(chǎn)基地,分別為:‘C米’‘P14187’‘V7’‘合作88’‘荷蘭15號(hào)’‘黃金薯’‘會(huì)薯2號(hào)’‘會(huì)薯15號(hào)’‘會(huì)薯16號(hào)’‘會(huì)薯19號(hào)’‘麗薯6號(hào)’‘青薯9號(hào)’‘希森3號(hào)’‘宣薯4號(hào)’‘宣薯5號(hào)’‘宣薯6號(hào)’‘宣薯8號(hào)’‘云薯108’‘云薯202’‘云薯304’‘云薯505’‘云薯901’‘云薯902’‘昭薯6號(hào)’‘專心烏’。
1.2"試驗(yàn)方法
1.2.1"馬鈴薯對(duì)馬鈴薯金線蟲病的抗性鑒定
從云南省昭通市靖安鎮(zhèn)松杉村西魁坪子采集病土,采用漂浮法[22]分離馬鈴薯金線蟲孢囊,在體視顯微鏡下將豐滿的孢囊挑出,用0.5%"NaClO表面消毒3~5"min,再用無菌水沖洗3~4次,放入4℃冰箱里保濕放置8~10周。
將馬鈴薯種植在體積為1"L的塑料盆中,每盆接種馬鈴薯金線蟲孢囊約100個(gè),合計(jì)每100"mL土壤接種2齡幼蟲(the"second"stage"juvenile,J2)和卵3"000~3"500個(gè)。接種量測算方法:隨機(jī)挑選50個(gè)孢囊,切開計(jì)數(shù)孢囊中有效卵和J2的數(shù)量,得出每個(gè)孢囊有效卵和J2的平均值為304.4。待接種馬鈴薯金線蟲孢囊后75"d(馬鈴薯出苗后約2個(gè)半月),拔出馬鈴薯并輕輕抖落根上的土壤,觀察附著在根上馬鈴薯金線蟲孢囊或雌蟲的數(shù)量,參考Koroleva[23]的評(píng)價(jià)方法調(diào)查發(fā)病情況:根上有0~5個(gè)孢囊或雌蟲為抗性;根上有6個(gè)及更多孢囊或雌蟲為易感。
1.2.2"抗病基因的分子檢測
馬鈴薯出苗后15"d,采集馬鈴薯葉片,使用廣譜植物基因組DNA快速提取試劑盒(購自北京博邁德生物技術(shù)有限公司)提取各品種葉片基因組DNA,置于-20℃保存?zhèn)溆?。抗病基因H1、Gro1、Grp1等相關(guān)引物[24](表1)由昆明擎科生物有限公司合成。PCR反應(yīng)體系(15"μL):2×Taq"PCR"Master"Mix"7.5"μL,10"μmol/L上、下游引物各0.25"μL,模板DNA"1"μL,超純水補(bǔ)足至15"μL。PCR擴(kuò)增程序見表2。1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測"PCR擴(kuò)增產(chǎn)物并在凝膠成像系統(tǒng)中觀察并拍照。
1.2.3"實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測H1基因的相對(duì)表達(dá)量
在"NCBI"數(shù)據(jù)庫下載馬鈴薯的actin基因(內(nèi)參基因)和H1基因標(biāo)記57R的等位基因57R887[26]的序列,根據(jù)抗病基因CDS序列,使用Primer"3"Plus設(shè)計(jì)特異性引物(表3),引物序列通過昆明擎科生物有限公司合成。
根據(jù)1.2.2的結(jié)果,選擇攜帶H1基因的馬鈴薯品種為供試材料,
待馬鈴薯出苗后65"d,采集各品種馬鈴薯的根系,DEPC處理后用于提取馬鈴薯根系總RNA。
采用AG"RNAex"Pro"RNA提取試劑(湖南艾克瑞生物工程有限公司)提取馬鈴薯根系總RNA。1%瓊脂糖凝膠電泳檢測RNA的完整性,核酸質(zhì)量分析儀對(duì)RNA的A260/A280、A260/A230以及濃度進(jìn)行測定。按照Evo"MMLV"RT"Mix"Kit"with"gDNA"Clean"for"qPCR"Ver.2"(湖南艾克瑞生物工程有限公司)的兩步法,先去除gDNA,再將RNA反轉(zhuǎn)錄合成第1鏈cDNA,產(chǎn)物于-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
采用SYBR"Green"Supermix"Pro"Taq"HS"qPCR"Kit(湖南艾克瑞生物工程有限公司)進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR。反應(yīng)體系為10"μL:2×SYBR"Green"Pro"Taq"HS"Supermix"5"μL,ROX"reference"Dye"0.2"μL,10"μmol/L"正、反向引物各0.4"μL,cDNA模板0.5"μL,RNase"free"water"3.5"μL,混勻離心后進(jìn)行qPCR反應(yīng)。反應(yīng)程序?yàn)椋?5℃預(yù)變性2"min;95℃變性45"s,60℃退火30"s,72℃延伸1"min,40個(gè)循環(huán)。根據(jù)各樣品的熔解曲線驗(yàn)證引物擴(kuò)增的特異性,每個(gè)樣品重復(fù)3次,以未接種金線蟲的品種中H1基因的表達(dá)量為對(duì)照。
采用2-ΔΔCT法[25]計(jì)算H1基因的相對(duì)表達(dá)量。
1.2.4"馬鈴薯金線蟲的抗性水平與H1的相對(duì)表達(dá)量的相關(guān)性分析
在IBM"SPSS"26中使用點(diǎn)二列相關(guān)系數(shù),對(duì)馬鈴薯金線蟲的抗性水平與抗性基因H1的相對(duì)表達(dá)量進(jìn)行相關(guān)性分析。共30個(gè)樣本(10個(gè)馬鈴薯品種3個(gè)重復(fù))參與了相關(guān)性分析,其中一列變量為H1基因的相對(duì)表達(dá)量,另一列變量為馬鈴薯金線蟲的抗性水平(對(duì)馬鈴薯金線蟲有無抗性),對(duì)馬鈴薯金線蟲有抗性賦值1,沒有抗性賦值0;相關(guān)系數(shù)的顯著性采用t檢驗(yàn),當(dāng)Plt;0.05,相關(guān)性顯著。
1.3"數(shù)據(jù)分析
使用Excel對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行整理和統(tǒng)計(jì),Graphpad"Prism"8.0.2進(jìn)行圖表繪制。
2"結(jié)果與分析
2.1"馬鈴薯品種的抗病性鑒定
接種馬鈴薯金線蟲后75"d,取樣觀察馬鈴薯根上的線蟲孢囊量。結(jié)果發(fā)現(xiàn),‘V7’‘黃金薯’‘宣薯5號(hào)’‘云薯202’‘云薯304’‘云薯505’‘會(huì)薯19號(hào)’等7個(gè)馬鈴薯品種在溫室盆栽試驗(yàn)中,根系上的孢囊或雌蟲≤5個(gè),表現(xiàn)出對(duì)馬鈴薯金線蟲有抗性;‘希森3號(hào)’‘P14187’‘會(huì)薯15號(hào)’‘C米’‘合作88’‘荷蘭15號(hào)’‘會(huì)薯2號(hào)’‘會(huì)薯16號(hào)’‘麗薯6號(hào)’‘青薯9號(hào)’‘宣薯4號(hào)’‘宣薯6號(hào)’‘宣薯8號(hào)’‘云薯108’‘云薯901’‘云薯902’‘昭薯6號(hào)’‘專心烏’等18個(gè)馬鈴薯品種在溫室盆栽試驗(yàn)中,根系上的孢囊或雌蟲gt;5個(gè)及更多,對(duì)馬鈴薯金線蟲表現(xiàn)為易感(表4)。
2.2"在馬鈴薯品種中抗性基因的檢測結(jié)果
利用6個(gè)分子標(biāo)記對(duì)供試的25個(gè)馬鈴薯品種進(jìn)行馬鈴薯金線蟲抗性基因檢測,檢測結(jié)果見表4和圖1。其中GBSS基因的分子標(biāo)記GBSS13為陽性對(duì)照。H1基因的3個(gè)分子標(biāo)記N146、N195和57R在‘V7’‘黃金薯’‘希森3號(hào)’‘宣薯5號(hào)’‘云薯202’‘云薯304’‘云薯505’‘P14187’‘會(huì)薯15號(hào)’‘會(huì)薯19號(hào)’等10個(gè)馬鈴薯品種中被檢測出來。Grp1基因的分子標(biāo)記TG432在25個(gè)馬鈴薯品種中均被檢測到,即在所有供試馬鈴薯品種全部含有Grp1基因,但是TG432的產(chǎn)物片段比文獻(xiàn)中所描述的大,超過了2"000"bp,重復(fù)試驗(yàn)得到了相同的結(jié)果。Gro1基因的分子標(biāo)記Gro141在25個(gè)馬鈴薯品種中都沒有檢測到,即所有供試馬鈴薯品種均不含Gro1基因的分子標(biāo)記。表明Grp1、Gro1的分子標(biāo)記不適合用于馬鈴薯金線蟲病抗性篩選。
2.3"攜帶抗性基因H1的馬鈴薯品種H1基因相對(duì)表達(dá)量
10個(gè)攜帶H1基因的馬鈴薯品種‘宣薯5號(hào)’‘云薯202’‘云薯304’‘會(huì)薯19號(hào)’‘黃金薯’‘V7’‘云薯505’‘希森3號(hào)’‘會(huì)薯15號(hào)’‘P14187’接種馬鈴薯金線蟲后H1基因相對(duì)表達(dá)量分別是未接種馬鈴薯金線蟲的34.47、3.11、2.25、5.50、3.55、2.61、8.16、0.31、0.22、0.93倍,其中‘希森3號(hào)’‘會(huì)薯15號(hào)’‘P14187’3個(gè)品種的H1基因相對(duì)表達(dá)量在接種馬鈴薯金線蟲后下調(diào)表達(dá),另外7個(gè)品種上調(diào)表達(dá)(圖2)。結(jié)合前述接種試驗(yàn)抗性實(shí)際表現(xiàn),H1基因相對(duì)表達(dá)量上調(diào)的品種表現(xiàn)抗性,而下調(diào)的品種表現(xiàn)易感。
2.4"馬鈴薯品種對(duì)金線蟲的抗性水平與抗性基因H1相對(duì)表達(dá)量的相關(guān)性
在IBM"SPSS"26中,采用點(diǎn)二列相關(guān)系數(shù)表示抗性基因H1相對(duì)表達(dá)量與馬鈴薯品種對(duì)金線蟲抗性的相關(guān)性,分析表明,攜帶H1基因的馬鈴薯品種是否對(duì)金線蟲表現(xiàn)抗性與抗性基因H1表達(dá)量的相關(guān)系數(shù)為0.378,呈正相關(guān),相關(guān)性顯著(Plt;0.05)。
3"結(jié)論與討論
本研究參考Koroleva的評(píng)價(jià)方法[23]評(píng)價(jià)云南常見馬鈴薯品種對(duì)馬鈴薯金線蟲的抗性,發(fā)現(xiàn)馬鈴薯品種是否含有抗性基因相關(guān)分子標(biāo)記與對(duì)馬鈴薯金線蟲是否有抗性存在一定的關(guān)系,但是對(duì)馬鈴薯金線蟲表現(xiàn)出抗性的原因是復(fù)雜的,分子標(biāo)記檢測結(jié)果表明,遺傳和表型數(shù)據(jù)并不總是一致的。本研究中供試的25個(gè)品種有10個(gè)攜帶抗性基因H1,其中‘V7’‘黃金薯’‘會(huì)薯19號(hào)’‘宣薯5號(hào)’‘云薯202’‘云薯304’‘云薯505’7個(gè)品種在試驗(yàn)中對(duì)馬鈴薯金線蟲表現(xiàn)出抗性,而‘P14187’‘會(huì)薯15號(hào)’‘希森3號(hào)’3個(gè)品種含有H1基因的分子標(biāo)記,卻在試驗(yàn)中對(duì)馬鈴薯金線蟲易感。Koroleva等[23]研究結(jié)果顯示,在供試的50個(gè)馬鈴薯品種中有46個(gè)品種含有抗性基因的分子標(biāo)記且對(duì)馬鈴薯金線蟲表現(xiàn)出抗性,4個(gè)品種在含有抗性基因分子標(biāo)記的情況下表現(xiàn)出易感,本研究結(jié)果與此類似。明會(huì)等[24]利用馬鈴薯孢囊線蟲抗性分子標(biāo)記對(duì)馬鈴薯種質(zhì)資源進(jìn)行馬鈴薯金線蟲的抗性基因檢測,篩選到含有馬鈴薯金線蟲抗性基因H1的馬鈴薯品種(種質(zhì)資源),本研究篩選到的含有抗性基因H1的馬鈴薯品種結(jié)果與其一致。李艷等[27]通過溫室和田間試驗(yàn),采用根球計(jì)數(shù)法、平均增殖率法和相對(duì)敏感性評(píng)價(jià)法及酸性品紅染色計(jì)數(shù)法,綜合評(píng)價(jià)馬鈴薯品種對(duì)金線蟲的抗性,評(píng)價(jià)出抗性表現(xiàn)穩(wěn)定的馬鈴薯品種‘宣薯5號(hào)’和‘云薯505’,本研究也得到類似結(jié)果。上述結(jié)果表明,僅僅依靠抗性基因分子標(biāo)記來判定馬鈴薯品種對(duì)金線蟲的抗性,存在一定局限,結(jié)合接種金線蟲的抗性鑒定試驗(yàn)結(jié)果,有利于獲得更為真實(shí)的抗性信息。
本研究測定攜帶H1基因的馬鈴薯品種的H1基因相對(duì)表達(dá)量,分析抗性基因H1相對(duì)表達(dá)量與對(duì)金線蟲抗性的相關(guān)性。發(fā)現(xiàn)‘V7’‘黃金薯’‘會(huì)薯19號(hào)’‘宣薯5號(hào)’‘云薯202’‘云薯304’‘云薯505’7個(gè)品種在接種了金線蟲后較未接種H1基因上調(diào)表達(dá),對(duì)馬鈴薯金線蟲表現(xiàn)出抗性,而‘P14187’‘會(huì)薯15號(hào)’‘希森3號(hào)’3個(gè)品種在接種了金線蟲后較未接種H1基因下調(diào)表達(dá),對(duì)馬鈴薯金線蟲易感;馬鈴薯品種對(duì)金線蟲的抗性與抗性基因H1相對(duì)表達(dá)量相關(guān)性顯著,呈正相關(guān)。王賢等[28]研究表明抗病基因表達(dá)量越高的番茄品種,抗病能力也越強(qiáng),并表現(xiàn)出正相關(guān)性,陳斌等[29]通過比較不同玉米品種接種紋枯病菌前后抗病相關(guān)基因表達(dá)量的變化,來鑒定抗病性,結(jié)果表明,抗病基因ZmPR1a的表達(dá)量變化與田間抗性結(jié)果相關(guān),抗病品種的ZmPR1a基因相對(duì)表達(dá)量高于對(duì)照,而感病品種的ZmPR1a基因相對(duì)表達(dá)量低于對(duì)照,本研究所得結(jié)果與其相似。這表明,攜帶抗性基因的品種其抗性是否表現(xiàn),與受到病原物侵害時(shí)抗性基因的表達(dá)量密切相關(guān),相對(duì)表達(dá)量高于對(duì)照可能就表現(xiàn)抗性,相對(duì)表達(dá)量低于對(duì)照則表現(xiàn)為易感,抗性基因相對(duì)表達(dá)量與品種的實(shí)際抗性表現(xiàn)呈正相關(guān)。
本研究將人工接種馬鈴薯金線蟲進(jìn)行抗性鑒定與分子標(biāo)記以及抗性基因的表達(dá)水平相結(jié)合,并分析馬鈴薯品種對(duì)金線蟲抗性與抗性基因H1的相對(duì)表達(dá)量的相關(guān)性,是一個(gè)新的抗性評(píng)價(jià)思路,下一步將擴(kuò)大供試品種的數(shù)量、構(gòu)建完善的評(píng)價(jià)體系。本研究結(jié)果對(duì)抗金線蟲馬鈴薯品種選育、深入揭示馬鈴薯抗金線蟲的分子機(jī)制、利用抗病品種防治馬鈴薯金線蟲病有一定指導(dǎo)作用。
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(責(zé)任編輯:楊明麗)