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        分室法不同網(wǎng)孔目數(shù)尼龍網(wǎng)對(duì)木薯根際的影響

        2024-12-05 00:00:00韋云東趙鑫鑫周時(shí)藝陳蕊蕊羅燕春徐釧馬崇熙盤歡李軍鄭華
        江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2024年23期
        關(guān)鍵詞:微生物群落高通量測(cè)序

        摘要:為探討木薯根際土壤采樣方法,選用不同網(wǎng)孔目數(shù)的尼龍網(wǎng)開展根袋試驗(yàn),設(shè)置如下9個(gè)處理:A100(根區(qū)土壤滅菌+非根區(qū)不滅菌,100目)、A200(根區(qū)土壤滅菌+非根區(qū)不滅菌,200目)、A300(根區(qū)土壤滅菌+非根區(qū)不滅菌,300目)、B100(根區(qū)不滅菌+非根區(qū)滅菌,100目)、B200(根區(qū)不滅菌+非根區(qū)滅菌,200目)、B300(根區(qū)不滅菌+非根區(qū)滅菌,300目)、C100(根區(qū)、非根區(qū)土壤均不滅菌,100目)、C200(根區(qū)、非根區(qū)土壤均不滅菌,200目)、C300(根區(qū)、非根區(qū)土壤均不滅菌,300目)。每個(gè)處理在根區(qū)采集1個(gè)樣品(Mid),在距離根區(qū)1 cm的上部根區(qū)(Top1和Top2)和下部根區(qū)(Bel1、Bel2)各采集2個(gè)樣品。結(jié)果表明,(1)C200處理根際的脲酶活性顯著高于A200處理,A200、A300、B200、B300、C200、C300處理的土壤生物學(xué)性質(zhì)指標(biāo)在同一處理內(nèi)差異顯著。(2)A200、B200、B300、C200、C300處理的細(xì)菌菌落相對(duì)豐度在不同處理間、同一處理內(nèi)均有顯著差異,其中疣微菌門的細(xì)菌相對(duì)豐度在Mid層表現(xiàn)為B300處理顯著高于B200處理。(3)C300處理根際的ACE、Chao1指數(shù)明顯大于C200處理。(4)各處理各土壤速效養(yǎng)分含量之間呈極顯著或顯著相關(guān)性,土壤速效養(yǎng)分含量與細(xì)菌菌門間的相對(duì)豐度也呈極顯著或顯著相關(guān)。(5)LEfSe分析結(jié)果表明,A200、B300和C300處理的細(xì)菌相對(duì)豐度在不同處理內(nèi)差異顯著??傊ㄟ^對(duì)處理B、處理C的進(jìn)行處理內(nèi)比較發(fā)現(xiàn),用200、300目尼龍網(wǎng)袋采集木薯根際土壤的生物學(xué)性質(zhì)指標(biāo)無(wú)顯著差異;用200、300目尼龍網(wǎng)采集木薯根際土壤的優(yōu)勢(shì)菌門的相對(duì)豐度無(wú)顯著差異,極少數(shù)菌門的相對(duì)豐度表現(xiàn)為300目顯著高于200目??梢?00目尼龍網(wǎng)袋更適用于采集木薯根際土壤,200目尼龍網(wǎng)袋既能阻止木薯根系穿透生長(zhǎng),也不會(huì)妨礙土壤水分、養(yǎng)分的運(yùn)移和微生物的穿透。

        關(guān)鍵詞:分室法;尼龍網(wǎng)目數(shù);木薯根際;微生物群落;高通量測(cè)序;相對(duì)豐度

        中圖分類號(hào):S154.3;S533.06" 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A

        文章編號(hào):1002-1302(2024)23-0263-13

        韋云東,趙鑫鑫,周時(shí)藝,等. 分室法不同網(wǎng)孔目數(shù)尼龍網(wǎng)對(duì)木薯根際的影響[J]. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué),2024,52(23):263-275.

        doi:10.15889/j.issn.1002-1302.2024.23.035

        收稿日期:2024-05-10

        基金項(xiàng)目:廣西自然科學(xué)基金(編號(hào):2021GXNSFBA196007);國(guó)家木薯產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)土肥水管理崗項(xiàng)目(編號(hào):CARS-11-GXLJ);廣西農(nóng)業(yè)科學(xué)院基本科研業(yè)務(wù)專項(xiàng)(編號(hào):桂農(nóng)科2021YT150)。

        作者簡(jiǎn)介:韋云東(1988—),男,廣西象州人,碩士,助理研究員,主要從事木薯栽培與施肥管理方面的研究。E-mail:wydxiaota1613@163.com。

        通信作者:鄭" 華,博士,正高級(jí)農(nóng)藝師,主要從事木薯高效栽培、根際微生態(tài)方面的研究。E-mail:zhenghua8305@yeah.net。

        根際是指受到根系分泌物影響,在緊鄰植物根面區(qū)域形成的物理、化學(xué)及生物學(xué)特性不同于土體土壤的微域[1]。根際范圍從1 mm以下到幾毫米,主要取決于根毛長(zhǎng)度[2]。根際土壤是植物根周圍土壤的微域環(huán)境,是在物理、化學(xué)和生物特性上不同于原土體的特殊區(qū)域。

        根際土壤的采集技術(shù)是研究根際營(yíng)養(yǎng)生態(tài)的基礎(chǔ),科學(xué)準(zhǔn)確的采樣方法是研究取得突破的前提條件。常用的根際土壤采樣方法有抖落法[3]、室內(nèi)模擬培育法[4]、根箱法[5]、根袋法[6]等。相對(duì)于其他根際土壤采樣方法,根袋法具有方法簡(jiǎn)單、室內(nèi)外均可使用、可采集相對(duì)大量土壤樣品的優(yōu)點(diǎn)。張新疆等利用自制的根袋(300目)進(jìn)行水稻根系取樣和根際土壤采集[7]。賀曉佳等采用根圓柱形尼龍網(wǎng)袋(400目)固定水稻根系的生長(zhǎng)范圍[8]。陳嘉欣等縫制了直徑為15 cm、高為20 cm的尼龍網(wǎng)根袋(400目),用于采集玉米根際土壤[9]。

        目前,研究者主要采用抖落法采集木薯根際土壤,例如姜舒雅等將木薯連根拔起后,收集附著于木薯塊根的土壤,去除雜根、石粒等雜質(zhì)后將其裝入無(wú)菌自封袋中[10];林洪鑫等輕輕將植株拔起,輕輕抖落根部的土壤后,用已經(jīng)消毒的羊毛刷刷下附著在塊根根際的土壤[11];Li等除去木薯表土后,小心取出包括塊根在內(nèi)的整個(gè)根系,除去大塊土壤后,用無(wú)菌刷和鑷子收集附著在根表面的土壤[12]。但是,由于木薯根毛少,采用傳統(tǒng)抖落法主要存在以下2個(gè)缺點(diǎn):一是采集根際土壤較困難;二是從某種程度上淡化了根際效應(yīng)[13]?;诖?,韋云東等采用根袋法獲取木薯根際土壤,發(fā)現(xiàn)根袋內(nèi)有100 g土壤時(shí)可視為根際土壤,且銨態(tài)氮、速效鉀含量可作為判斷是否為根際土壤的指示指標(biāo)[14-15]。

        本試驗(yàn)在對(duì)木薯根袋法獲取根際土壤研究的基礎(chǔ)上,利用木薯根毛少、根系水平伸展的特點(diǎn),設(shè)計(jì)分室法試驗(yàn),通過對(duì)比分析明確既能阻止木薯根系穿透生長(zhǎng),又不妨礙土壤水分、養(yǎng)分運(yùn)移和微生物穿透的網(wǎng)袋孔徑,進(jìn)行下一步研究。通過明確適合木薯根際土的采樣方法,為木薯根際的微生態(tài)研究提供參考。

        1" 材料與方法

        1.1" 試驗(yàn)材料

        供試土壤取自廣西壯族自治區(qū)南寧市武鳴區(qū),其黏粒(lt;0.002 mm)、沙粒(0.050~2.000 mm)、粉(沙)粒(0.002~0.050 mm)含量分別為58.49%、33.00%、8.51%。土壤基本理化性質(zhì):pH值5.7,全氮含量1.410 g/kg,全磷含量2.65 g/kg,全鉀含量4.39 g/kg,速效氮含量122.0 mg/kg,速效磷含量154 mg/kg,緩效鉀含量65.7 mg/kg。將土壤風(fēng)干后過2 mm篩。供試木薯品種為華南205(SC205),由南寧木薯種質(zhì)圃提供。根袋材質(zhì)為300、200、100目尼龍網(wǎng)。所用肥料為Osmocote 2號(hào)肥料(N、P2O5、K2O含量均為14%),肥效為2~3個(gè)月。塑料盆長(zhǎng)590 mm,寬440 mm,高310 mm。

        1.2" 試驗(yàn)方法

        1.2.1" 試驗(yàn)設(shè)計(jì)" 試驗(yàn)于2020年6—8月在廣西壯族自治區(qū)亞熱帶作物研究所木薯試驗(yàn)基地大棚內(nèi)開展。用尼龍網(wǎng)縫制成袋,組成3個(gè)“室”,上、中、下“室”分別為非根區(qū)、根區(qū)、非根區(qū)?!笆摇迸c“室”之間的尼龍網(wǎng)設(shè)置為100、200、300目等處理。其余部分材質(zhì)均為300目尼龍網(wǎng)。根區(qū)與上部非根區(qū)接觸處設(shè)置1個(gè)直徑5 cm、高15 cm的尼龍網(wǎng)凸起,并上下開口,用于將木薯種莖植入根區(qū)。試驗(yàn)共設(shè)置9個(gè)處理,包括3種滅菌狀態(tài)和3個(gè)尼龍網(wǎng)目數(shù)(100、200、300目),4個(gè)重復(fù),具體見表1。

        選取部分過篩后的參試土壤,用烘箱進(jìn)行滅菌處理后備用。每盆干土28 kg,分為上、中、下室,其重量分別為14.494、1.647、11.859 kg,土壤厚度約為8、1、8 cm。裝袋前拌入Osmocote 2號(hào)緩釋肥,施用量為100 mg/kg N+100 mg/kg P2O5+100 mg/kg K2O。

        于2020年6月10日種植木薯,種植時(shí)按處理要求裝填好土壤,并將根區(qū)土壤潤(rùn)濕,非根區(qū)表面也潤(rùn)濕,防止灰塵隔區(qū)傳遞。將成熟的木薯種莖切成長(zhǎng)20 cm的段,用無(wú)菌水浸泡60 min后用稀釋 1 000 倍的多菌靈懸液浸泡15 min,之后用無(wú)菌水漂洗,再將種莖基部植入根區(qū),用上部非根區(qū)的土壤固定好種莖,種植后澆透水(按40%含水量連續(xù)澆水3 d)。之后進(jìn)入日常管理,每2~3 d進(jìn)行稱重、澆水,使土壤含水量保持在60%~70%的田間持水量。

        1.2.2" 采樣與分析方法" 于2020年8月18日(植后69 d)進(jìn)行采樣。由于觀察到100目的尼龍網(wǎng)有細(xì)根穿透,因此未采集100目處理的所有土樣。其他處理每盆將上、下根區(qū)分別分為2個(gè)樣品進(jìn)行采集。上部根區(qū)以距離根區(qū)1 cm處為界限,上下分別取1個(gè)樣,分別命名為Top1、Top2;下部根區(qū)以距離根區(qū)1 cm處為界限,上下分別取1個(gè)樣,分別命名為Bel1、Bel2。根區(qū)采集1個(gè)樣,命名為Mid。

        所有土樣在采集時(shí)用四分法分為3份,第1份用液氮速凍后存儲(chǔ)于-40 ℃" 冰箱內(nèi),第2份于4 ℃保存,第3份于常溫風(fēng)干。樣品過篩后測(cè)定銨態(tài)氮(NH+4-N)含量、硝態(tài)氮(NO-3-N)含量、微生物生物量碳(MBC)含量、微生物生物量氮(MBN)含量、速效氮(AN)含量、速效磷(AP)含量、速效鉀(AK)含量、脲酶(SU)活性、蔗糖酶(SC)活性等。

        土壤中的NH+4-N、NO-3-N含量采用硫酸鉀浸提-流動(dòng)注射儀法測(cè)定,AN含量采用堿解擴(kuò)散法測(cè)定,AP含量采用碳酸氫鈉浸提-鉬銻抗比色法測(cè)定,AK含量采用乙酸銨浸提-火焰光度計(jì)法測(cè)定[16],MBC、MBN含量采用三氯甲烷熏蒸浸提法測(cè)定[17]。土壤中的SC、SU活性均采用活性試劑盒微量法進(jìn)行測(cè)定,試劑盒生產(chǎn)廠商為北京索萊寶(Solarbio)科技有限公司,商品編號(hào)分別為BC0245、BC0125。

        選擇A200、B200、B300處理的Bel1、Mid、Top2等3類土樣和C200、C300處理的所有5類土樣共76個(gè)樣品(4個(gè)重復(fù))進(jìn)行高通量細(xì)菌(16S)測(cè)序。細(xì)菌(16S)的高通量測(cè)序參照Z(yǔ)hao等的方法[18],包括DNA提取和PCR擴(kuò)增、測(cè)序、數(shù)據(jù)處理等過程,其中PCR擴(kuò)增用的引物對(duì)為338F (5′-ACTCCTACGGGAGGCAGCAG-3′)和806R (5′-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3′),對(duì)16S rRNA基因的V3~V4可變區(qū)進(jìn)行擴(kuò)增,測(cè)序使用Illumina公司的Miseq PE300平臺(tái)(上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司)。通過數(shù)據(jù)處理得到不同細(xì)菌分類層次的操作分類單元(OTU)數(shù)量和相對(duì)豐度。α-多樣性指標(biāo)的計(jì)算采用Mothur 1.30.2軟件進(jìn)行。

        數(shù)據(jù)分析是在RStudio Version 1.1.463這一集成開發(fā)環(huán)境中進(jìn)行分析,該環(huán)境基于R-4.0.5[19]進(jìn)行配置和運(yùn)行。不同處理間的細(xì)菌在門水平的相對(duì)豐度差異采用非參數(shù)秩和檢驗(yàn)(Kruskal-Wallis檢驗(yàn)),用R語(yǔ)言中的boxplerk.R程序計(jì)算并自動(dòng)標(biāo)記小寫字母(表示在0.05水平差異顯著,下同)。各土壤養(yǎng)分中蔗糖酶、脲酶活性,微生物生物量碳、氮含量以及細(xì)菌α-多樣性指標(biāo)的處理間多重比較采用SSR法,在R語(yǔ)言中的boxplert.R程序中計(jì)算并自動(dòng)標(biāo)記小寫字母,除了細(xì)菌α-多樣性指標(biāo)不進(jìn)行P值校正外,其他指標(biāo)采用Holm-Bonferroni方法對(duì)P值進(jìn)行校正。所有指標(biāo)在不同層次之間的比較采用配對(duì)t檢驗(yàn),用R語(yǔ)言自帶的函數(shù)t.test并結(jié)合apply函數(shù)進(jìn)行批量檢驗(yàn),根據(jù)兩兩檢驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行字母標(biāo)記。細(xì)菌門水平的Heatmap圖采用Pheatmap包繪制。

        在進(jìn)行相關(guān)性分析前,對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行正態(tài)檢驗(yàn),利用shapiro-wilk檢驗(yàn)(簡(jiǎn)稱W檢驗(yàn),Pgt;0.05表示正態(tài)分布),用R語(yǔ)言中的shapiro.test函數(shù)計(jì)算。對(duì)不符合正態(tài)分布的指標(biāo)進(jìn)行數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換,轉(zhuǎn)換方式包括對(duì)數(shù)、BOXCOX等。其中,BOXCOX轉(zhuǎn)化由R語(yǔ)言car package中的powerTransform函數(shù)求得最佳lambda值,之后用bcPower函數(shù)進(jìn)行轉(zhuǎn)換,可轉(zhuǎn)化為正態(tài)分布的指標(biāo)(除了蔗糖酶活性指標(biāo)外)在相關(guān)性分析中進(jìn)行Pearson相關(guān)分析。蔗糖酶活性經(jīng)過包括對(duì)數(shù)、三角函數(shù)、BOXCOX等多種轉(zhuǎn)換,依然無(wú)法轉(zhuǎn)化為正態(tài)分布,但經(jīng)過BOXCOX轉(zhuǎn)化后,W檢驗(yàn)的P值最高,該指標(biāo)在相關(guān)分析中采用Spearman指數(shù)相關(guān)。其中,AN、AP、AK和NH+4-N含量無(wú)需轉(zhuǎn)化,已符合正態(tài)分布(P值范圍為 0.112~0.625)。脲酶活性經(jīng)對(duì)數(shù)轉(zhuǎn)化后,W檢驗(yàn)的P值為0.678。MBC、MBN和NO-3-N含量經(jīng)BOXCOX轉(zhuǎn)化后符合正態(tài)分布,變換參數(shù)λ分別為0.26、0.26、0.33,W檢驗(yàn)的P值分別為0.901、0.904、0.699。

        在門水平對(duì)不同處理間的土壤細(xì)菌進(jìn)行比較時(shí)采用非參數(shù)秩和檢驗(yàn),在R語(yǔ)言中的boxplerk.R程序中計(jì)算并自動(dòng)標(biāo)記小寫字母。LEfSe(LDA EffectSize)使用非參數(shù)因子克魯斯卡爾-沃利斯和秩驗(yàn)檢[non-parametric factorial Kruskal-Wallis (KW) sum-rank test]檢測(cè),找到與相對(duì)豐度有顯著差異的類群。LEfSe采用線性判別分析(LDA)來(lái)估算每個(gè)組分(物種)相對(duì)豐度對(duì)差異效果的影響。在LDA值分布柱狀圖中展示了LDA值大于設(shè)定值(默認(rèn)設(shè)置為4)的物種,即組間具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異的biomarker。

        2" 結(jié)果與分析

        2.1" 土壤養(yǎng)分指標(biāo)

        由單變量多因素方差分析結(jié)果(表2)可知,土壤是否滅菌與SU活性和AN、AK、NH+4-N、NO-3-N含量呈極顯著正相關(guān);隔層尼龍網(wǎng)目數(shù)與SU活性和AN、NH+4-N含量呈極顯著正相關(guān);取樣層次與SC、SU活性和AN、AP、AK、NH+4-N、NO-3-N含量呈極顯著正相關(guān);土壤是否滅菌處理和隔層尼龍網(wǎng)目數(shù)的交互作用與AN、NH+4-N、NO-3-N含量呈極顯著正相關(guān),與SU活性、AK含量呈顯著正相關(guān);土壤是否滅菌處理和取樣層次的交互作用與SU活性呈極顯著正相關(guān)。

        2.2" 土壤生物學(xué)性質(zhì)指標(biāo)

        由圖1可知,NH+4-N含量在10.90~34.64 mg/kg之間,NO-3-N含量在1.13~13.53 mg/kg之間,AN含量在143.14~268.59 mg/kg之間,AP含量在66.73~82.23 mg/kg之間,AK含量在78.70~197.93 mg/kg之間,MBC含量在15.63~73.09 mg/kg 之間,MBN含量在12.50~82.11 mg/kg之間,SC活性在1.93~24.91 mg/(g·d)之間,SU活性在61.57~288.16 μg/(g·d)之間。

        不同處理間的土壤生物學(xué)性質(zhì)指標(biāo)存在顯著差異。在Mid土層,C200處理的SU活性顯著高于A200處理;在Top1土層,B300處理的NO-3-N含量明顯高于C200、C300處理;在Bel1土層,B300處理的 NO-3-N 含量顯著高于A300處理,C200處理的SU活性高于B200、B300處理;在Bel2土層,C200處理的SU活性顯著高于B200、B300處理,B300處理的NH+4-N含量顯著高于C200處理。

        在同一處理內(nèi),土壤的生物學(xué)性質(zhì)指標(biāo)存在顯著差異。在A200處理中,NH+4-N含量表現(xiàn)為Mid顯著高于Bel1;NO-3-N含量表現(xiàn)為Top1顯著高于其余4個(gè)土層;AP含量表現(xiàn)為Top1、Bel1、Bel2顯著高于Mid;AK含量表現(xiàn)為Top1、Bel2顯著高于Mid、Bel1;SC活性表現(xiàn)為Top1、Top2、Mid顯著高于Bel2;SU活性表現(xiàn)為Bel1、Bel2顯著高于Mid。在A300處理中,NO-3-N含量表現(xiàn)為Top2、Bel1明顯高于Top1、Mid、Bel2;AP含量表現(xiàn)為Top2顯著高于Top1、Mid、Bel2;MBC含量表現(xiàn)為Bel2顯著高于Mid;SC活性表現(xiàn)為Mid顯著高于Top2、Bel1、Bel2;SU活性表現(xiàn)為Bel1顯著高于Top1、Mid。在B200處理中,NO-3-N含量表現(xiàn)為Top1土層顯著高于Top2、Mid;AN含量表現(xiàn)為Top1顯著高于其余4個(gè)土層;AP含量表現(xiàn)為Mid顯著低于其余4個(gè)土層;AK含量表現(xiàn)為Bel2顯著高于Top2、Mid、Bel1;SC活性表現(xiàn)為Bel2顯著低于其余4個(gè)土層;SU活性表現(xiàn)為Mid顯著高于Top2。在B300處理中,AN含量表現(xiàn)為Top1土層顯著高于Mid、Bel1;SC活性為Mid顯著高于Top2、Bel1、Bel2;SU活性表現(xiàn)為Mid顯著高于Top1、Bel2。在C200處理中,AP含量表現(xiàn)為Top2、Bel2顯著高于Mid;MBN含量表現(xiàn)為Mid顯著高于Bel2。在C300處理中,AN含量表現(xiàn)為Top1顯著高于Top2、Mid、Bel1;AP含量表現(xiàn)為Top2、Bel1顯著高于Mid;AK含量表現(xiàn)為Bel1顯著高于Mid; MBC含量表現(xiàn)為 Top2 顯著高于Top1、

        Mid;MBN含量表現(xiàn)為Bel2顯著高于Mid;SU活性表現(xiàn)為Mid顯著高于Top1、Bel2。

        2.3" 細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和多樣性

        2.3.1" 細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)描述" 對(duì)76個(gè)樣品進(jìn)行高通量測(cè)序的結(jié)果表明,平均序列數(shù)為41 825.8個(gè),平均測(cè)序長(zhǎng)為417.7 bp,最短讀長(zhǎng)為270.6 bp,最長(zhǎng)讀長(zhǎng)為483.0 bp。在門分類水平上,前10個(gè)優(yōu)勢(shì)菌門包括厚壁菌門(Firmicutes,30.86%)、放線菌門(Actinobacteriota,29.92%)、變形菌門(Proteobacteria,18.81%)、綠彎菌門(Chloroflexi,6.58%)、酸桿菌門(Acidobacteriota,5.10%)、髕骨菌門(Patescibacteria,3.99%)、WPS-2(1.72%)、藍(lán)細(xì)菌(Cyanobacteria,0.72%)、浮霉菌門(Planctomycetota,0.64%)、芽單胞菌門(Gemmatimonadota,0.50%)(可根據(jù)圖2計(jì)算)。

        2.3.2" 細(xì)菌群落的差異分析" 由圖2可知,在不同處理間,細(xì)菌菌門(綱)在Mid層的相對(duì)豐度存在顯著差異。變形菌門、α-變形菌綱(Alphaproteobacteria)的相對(duì)豐度表現(xiàn)為A200處理顯著高于B200、B300、C200、C300處理;酸桿菌門、WPS-2的相對(duì)豐度表現(xiàn)為A200處理顯著高于C200、C300處理;藍(lán)細(xì)菌的相對(duì)豐度表現(xiàn)為A200處理顯著高于B200、B300、C300處理;芽單胞菌門的相對(duì)豐度表現(xiàn)為A200處理顯著高于B200、C300處理;黏菌門(Myxococcota)、蛭弧菌門(Bdellovibrionota)和擬桿菌門(Bacteroidota)的相對(duì)豐度表現(xiàn)為A200處理顯著高于B200處理;裝甲菌門(Armatimonadota)的相對(duì)豐度表現(xiàn)為A200處理顯著高于C300處理;γ-變形菌綱(Gammaproteobacteria)的相對(duì)豐度表現(xiàn)為A200處理顯著高于B200、C300、C200、C300處理;酸桿菌綱(Acidobacteriae)的相對(duì)豐度表現(xiàn)為A200處理顯著高于B300、C200、C300處理;厚壁菌門的相對(duì)豐度表現(xiàn)為B200處理顯著高于C300處理;浮霉菌門的相對(duì)豐度表現(xiàn)為B200處理顯著高于C200處理;疣微菌門(Verrucomicrobiota)的相對(duì)豐度表現(xiàn)為B300處理顯著高于B200、C200處理;裝甲菌門的相對(duì)豐度表現(xiàn)為B300處理顯著高于C300處理;放線菌綱(Actinobacteria)的相對(duì)豐度表現(xiàn)為B300處理顯著高于A200處理;纖線桿菌綱(Ktedonobacteria)的相對(duì)豐度表現(xiàn)為B300處理顯著高于A200處理;放線菌門、放線菌綱、纖線桿菌綱和綠彎菌綱(Chloroflexi)的相對(duì)豐度表現(xiàn)為C200處理顯著高于A200處理;綠彎菌門的相對(duì)豐度表現(xiàn)為C200處理顯著高于A200、B200、B300處理;髕骨菌門的相對(duì)豐度表現(xiàn)為C200處理顯著高于B200處理;嗜熱油菌綱(Thermoleophilia)的相對(duì)豐度表現(xiàn)為C200處理顯著高于A200、B300處理;厚壁菌門的相對(duì)豐度表現(xiàn)為C300處理顯著高于A200、B200、B300處理;綠彎菌門、放線菌綱、纖線桿菌綱、綠彎菌綱的相對(duì)豐度表現(xiàn)為C300處理顯著高于A200處理;擬桿菌門的相對(duì)豐度表現(xiàn)為C300處理顯著高于B200處理;嗜熱油菌綱的相對(duì)豐度表現(xiàn)為C300處理顯著高于A200、B300處理。

        細(xì)菌菌門(綱)的相對(duì)豐度在同一處理內(nèi)差異顯著。在A200處理中,放線菌門、綠彎菌門和綠彎菌綱的相對(duì)豐度表現(xiàn)為Top2、Bel1顯著高于Mid;變形菌門、放線菌綱、α-變形菌綱的相對(duì)豐度表現(xiàn)為Mid顯著高于Top2、Bel1;酸桿菌門、浮霉菌門、蛭弧菌門、藍(lán)細(xì)菌、γ‐變形菌綱、酸桿菌綱的相對(duì)豐度表現(xiàn)為Mid顯著高于Top2;嗜熱油菌綱在的相對(duì)豐度表現(xiàn)為Top2顯著高于Mid;纖線桿菌綱的相對(duì)豐度表現(xiàn)為Top2、Bel1顯著高于Mid。在B200處理中,黏菌門的相對(duì)豐度表現(xiàn)為Top2、Bel1顯著高于Mid;疣微菌門在B200處理中的相對(duì)豐度表現(xiàn)為Bel1顯著高于Mid。在B300處理中,酸桿菌門、髕骨菌門、WPS-2、藍(lán)細(xì)菌、蛭弧菌門、變形菌門、α-變形菌綱和酸桿菌綱的相對(duì)豐度表現(xiàn)為Top2、Bel1顯著高于Mid;放線菌門、放線菌綱的相對(duì)豐度表現(xiàn)為Mid顯著高于Top2、Bel1;芽單胞菌門、黏菌門的相對(duì)豐度表現(xiàn)為Top2顯著高于Mid;綠彎菌綱的相對(duì)豐度表現(xiàn)為Mid顯著高于Top2。綠彎菌門在C200處理中的相對(duì)豐度表現(xiàn)為Bel2顯著高于Mid。藍(lán)細(xì)菌在C300處理中的相對(duì)豐度表現(xiàn)為Top2顯著高于Top1。疣微菌門在C300處理中的相對(duì)豐度表現(xiàn)為Bel2顯著高于Top2。

        2.4" 細(xì)菌種水平α-多樣性

        由表3可知,Sobs、ACE、Chao1指數(shù)在A200處理中的Mid顯著小于Bel1、Top2,但在B300處理中的Mid顯著高于Bel1、Top2;ACE指數(shù)在B200處理中的Mid顯著高于Top2;C300處理在Mid層的Sobs指數(shù)顯著大于A200、B200處理。C300處理的ACE指數(shù)顯著大于A200、B200、C200處理;C300處理的Chao1指數(shù)明顯大于A200、B200、C200處理;C300處理的Shannon指數(shù)顯著大于B200、B300處理。C300處理的Simpson指數(shù)顯著小于B200、B300處理;A200處理在Mid層的Sobs指數(shù)顯著小于B300、C200處理;A200處理的ACE指數(shù)明顯大于B300處理;A200處理的Chao1指數(shù)明顯大于B200、B300,但明顯小于C200處理;A200處理的Simpson指數(shù)明顯小于B300處理。B200處理在Mid層的Shannon指數(shù)顯著小于A200處理;B200處理的Simpson指數(shù)明顯高于A200、C200處理。

        2.5" 微生物相對(duì)豐度(門水平)與土壤速效養(yǎng)分含量間的相關(guān)性

        由表4可知,厚壁菌門相對(duì)豐度與SC活性呈極顯著正相關(guān)(Plt;0.001),與AN、AK含量呈極顯著負(fù)相關(guān);放線菌門與SC活性和MBN、NH+4-N含量呈負(fù)相關(guān)(Plt;0.05),與SU活性、AK含量呈顯著正相關(guān)(Plt;0.01);變形菌門相對(duì)豐度與SC活性、AN含量呈正相關(guān),分別與NH+4-N含量、SU活性呈極顯著正、負(fù)相關(guān);綠彎菌門相對(duì)豐度與AK含量呈顯著正相關(guān),分別與SU、SC活性和NH+4-N含量呈極顯著正、負(fù)、負(fù)相關(guān);酸桿菌門相對(duì)豐度與MBN含量呈正相關(guān),分別與AN、NH+4-N含量和SU活性呈極顯著正、正、負(fù)相關(guān);髕骨菌門相對(duì)豐度與NO-3-N含量呈正相關(guān),分別與AN、AK含量和SC活性呈顯著正、正、負(fù)相關(guān);WPS-2分別與AN含量、SU活性呈顯著正、負(fù)相關(guān);浮霉菌門相對(duì)豐度與AN含量呈顯著正相關(guān),分別與NH+4-N含量、SU活性呈極顯著正、負(fù)相關(guān);芽單胞菌門相對(duì)豐度與AN含量呈正相關(guān),與NH+4-N含量呈顯著正相關(guān);黏菌門相對(duì)豐度分別與MBC含量、SU活性呈正、負(fù)相關(guān),與AN、NH+4-N 含量呈極顯著正相關(guān);蛭弧菌門相對(duì)豐度與SU活性呈顯著負(fù)相關(guān),與AN、

        NH+4-N含量呈極顯著正相關(guān);疣微菌門相對(duì)豐度與MBC、NH+4-N含量呈正相關(guān),與AN含量呈顯著正相關(guān);擬桿菌門相對(duì)豐度分別與AK含量、SC活性呈正、負(fù)相關(guān);FCPU426相對(duì)豐度與AK含量呈正相關(guān);Dependentiae相對(duì)豐度分別與AN含量、SU活性呈正、負(fù)相關(guān);未分類門與SU活性呈顯著正相關(guān);裝甲菌門相對(duì)豐度與NH+4-N含量呈極顯著正相關(guān);迷蹤菌門相對(duì)豐度分別與 NO-3-N 含量、SU活性呈正、負(fù)相關(guān),與NH+4-N含量呈顯著正相關(guān),與AN含量呈極顯著正相關(guān);脫硫桿菌門相對(duì)豐度與AK含量呈正相關(guān);RCP2.54相對(duì)豐度與SC活性呈顯著負(fù)相關(guān),與AN、AK含量呈極顯著正相關(guān)。

        2.6" 土壤速效養(yǎng)分之間的相關(guān)性

        由圖3可知,SC活性與AN、AP、AK含量呈極顯著負(fù)相關(guān)(Plt;0.001);SU活性分別與MBC、MBN含量呈負(fù)相關(guān)(Plt;0.05)、顯著負(fù)相關(guān)(Plt;0.01);SU活性與AN、NH+4-N、NO-3-N含量呈極顯著負(fù)相關(guān);AN含量與NO-3-N含量呈顯著正相關(guān),與AP、AK、NH+4-N含量呈極顯著正相關(guān);AP含量與NO-3-N含量呈正相關(guān),與AK含量呈極顯著正相關(guān);AK含量與NH+4-N含量呈正相關(guān),NH+4-N含量與NO-3-N含量呈顯著正相關(guān)。

        2.7" 土壤細(xì)菌LEfSe分析

        通過LEfSe分析,篩選出在各處理間存在顯著差異的細(xì)菌群落。由圖4可知,A200Bel1細(xì)菌的相對(duì)豐度顯著大于A200Mid、A200Top2分類水平的有1個(gè)門、2個(gè)綱、3個(gè)目、3個(gè)科、2個(gè)屬和4個(gè)種,包括綠彎菌門、放線菌綱、纖線桿菌綱、弗蘭克氏菌目(Frankiales)、假諾卡式菌目(Pseudonocardiales)、纖線桿菌目(Ktedonobacterales)、熱酸菌科(Acidothermaceae)、假諾卡氏菌科(Pseudonocardiaceae)、纖線桿菌科(Ktedonobacteraceae)、熱酸菌屬(Acidothermus)、假諾卡氏菌科未分類屬、假諾卡氏菌科未分類種、uncultured_Actinobacterium_g_Acidothermus種、熱酸菌屬未分類種、uncultured_bacterium_g_Acidothermus種。

        A200Mid細(xì)菌的相對(duì)豐度顯著大于A200Bel1、A200Top2的分類水平有2個(gè)門、3個(gè)綱、3個(gè)目、3個(gè)科、5個(gè)屬和3個(gè)種,包括變形菌門、酸桿菌門、γ-變形菌綱、α-變形菌綱、酸桿菌綱、黃色單胞菌目(Xanthomonadales)、酸桿菌目(Acidobacteriales)、根瘤菌目(Rhizobiales)、Rhodanobacteraceae科、Acidobacteriaceae_subgroup_1科、芽孢桿菌科(Bacillaceae)、Chujaibacter屬、Ammoniphilus屬、芽孢桿菌屬(Bacillus)、卡氏伯克霍爾德菌屬(Burkholderia-Caballeronia-Paraburkholderia屬)、norank_f_Acidobacteriaceae_subgroup_1屬、uncultured_bacterium_g_Chujaibacter種、uncultured_bacterium_g_Ammoniphilus種、芽孢桿菌屬未分類種(s_unclassified_g_Bacillus)。

        A200Top2細(xì)菌的相對(duì)豐度顯著大于A200Mid、A200Bel1分類水平有1個(gè)門、1個(gè)綱、2個(gè)目、3個(gè)科、3個(gè)屬和4個(gè)種,包括放線菌門、綠彎菌綱、熱微菌目(Thermomicrobiales)、Micromonosporales、JG30-KF-CM45科、弗蘭克氏菌科(Frankiaceae)、小單胞菌科(Micromonosporaceae)、類芽孢桿菌屬(Paenibacillus)、norank_f_JG30-KF-CM45屬、Jatrophihabitans、類芽孢桿菌屬未分類種、uncultured_bacterium_g_Conexibacter種、unclassified_g_norank_f_JG30-KF-CM45種、uncultured_bacterium_g_Jatrophihabitans種。

        由圖5可知,B300Bel1細(xì)菌的相對(duì)豐度顯著大于B300Mid、B300Top2,包括黃色單胞菌目(Xanthomonadales)、Rhodanobacteraceae、uncultured_bacterium_g_Chujaibacter種和Chujaibacter種。B300Mid細(xì)菌的相對(duì)豐度顯著大于B300Bel1、B300Top2分類水平的有2個(gè)門、1個(gè)綱、2個(gè)目、2個(gè)科、2個(gè)屬和5個(gè)種,包括放線菌門、綠彎菌門、放線菌綱、假諾卡氏菌目(Pseudonocardiales)、弗蘭克氏菌目(Frankiales)、假諾卡氏菌科(Pseudonocardiaceae)、熱酸菌科(Acidothermaceae)、假諾卡氏菌科未分類屬、熱酸菌屬(Acidothermus)、假諾卡氏菌科未分類種、uncultured_bacterium_g_Alicyclobacillus、unclassified_g_Acidothermus、uncultured_actinobacterium_g_Acidothermus、uncultured_bacterium_g_Alicyclobacillus。B300Top2細(xì)菌的相對(duì)豐度顯著大于B300Mid、B300Bel1分類水平的有3個(gè)門、3個(gè)綱、3個(gè)目、3個(gè)科、4個(gè)屬和6個(gè)種,包括變形菌門、酸桿菌門、WPS-2、酸桿菌綱、α-變形菌綱、norank_p_WPS-2綱、酸桿菌目(Acidobacteriales)、norank_c_norank_p_WPS-2目、Acetobacterales、Acidobacteriaceae_subgroup_1、norank_o_norank_c_norank_p_WPS-2、Acetobacteraceae、norank_f_Acidothermaceae_subgroup_1屬、Acidipila屬、norank_f_norank_o_norank_c_norank_p_WPS-2屬、norank_f_Acetobacteraceae屬、uncultured_forest_soil_bacterium_g_norank_f_Acidothermaceae_subgroup_1種、uncultured_bacterium_g_Acidipila種、uncultured_bacterium_g_norank_f_norank_o_norank_c_norank_p_WPS-2種、Alicyclobacillus_acidoterrestris種、uncultured_Alicyclobacillus_sp_g_Alicyclobacillus種、uncultured_soil_bacterium_g_norank_f_Acetobacteraceae種。

        由圖6可知,C300Top1細(xì)菌的相對(duì)豐度顯著大于C300Bel1、C300Bel2、C300Mid、C300Top2,包括假諾卡氏菌目(Pseudonocardiales)、假諾卡氏菌科、假諾卡氏菌科未分類屬和假諾卡氏菌科未分類種。對(duì)于用200目網(wǎng)袋采集的土壤,通過LEfSe分析沒有找到處理B(根區(qū)不滅菌+非根區(qū)滅菌)、處理C(根區(qū)不滅菌+非根區(qū)不滅菌)對(duì)應(yīng)的Biomarker。

        3" 討論

        3.1" 木薯根際土壤生物學(xué)性質(zhì)指標(biāo)分析

        脲酶是水解尿素肥料的唯一酶類,廣泛存在于土壤中,可以將酰胺態(tài)有機(jī)氮化物水解轉(zhuǎn)化為植物可以直接吸收利用的無(wú)機(jī)氮化物,其活性在某些方面反映了土壤的供氮能力與水平[20]。A200、A300處理(2個(gè)處理均為根區(qū)滅菌,非根區(qū)不滅菌)的脲酶活性表現(xiàn)為木薯非根區(qū)土層顯著高于根區(qū)土層,B200、B300處理(2個(gè)處理均為根區(qū)不滅菌,非根區(qū)滅菌)的脲酶活性表現(xiàn)為木薯根區(qū)土層顯著高于非根區(qū)土層,C200處理(根區(qū)、非根區(qū)都不滅菌)木薯根區(qū)中脲酶活性顯著高于A200處理樣品,C200處理的木薯非根區(qū)土層(Bel2土層)中脲酶活性顯著高于B200、B300處理的樣品。研究結(jié)果表明,土壤滅菌可能會(huì)降低木薯根區(qū)、非根區(qū)脲酶活性;單變量多因素方差分析結(jié)果也表明,土壤是否進(jìn)行滅菌處理與脲酶活性呈極顯著相關(guān)。C300處理的脲酶活性表現(xiàn)為根區(qū)土層顯著高于非根區(qū)土層,可能與根系能夠分泌酶類物質(zhì)進(jìn)入土壤有關(guān)[21]。在所有樣品中,根區(qū)土層的AP含量低于非根區(qū)土層,這與張學(xué)利等的研究結(jié)果[21]相似,這可能與植物可通過分泌低分子量有機(jī)酸、磷酸酶等利用土壤中活性磷組分含量增加的物質(zhì)有關(guān)[22]。

        處理B(根區(qū)不滅菌+非根區(qū)滅菌)的根際土壤生物學(xué)性質(zhì)指標(biāo)在不同處理間無(wú)顯著差異,對(duì)于B200、B300處理而言,相同處理在不同土層間均具有顯著差異;處理C(根區(qū)不滅菌+非根區(qū)不滅菌)的根際土壤生物學(xué)性質(zhì)指標(biāo)在處理間無(wú)顯著差異,對(duì)于C200、C300處理而言,相同處理在不同土層間均具有顯著差異。上述結(jié)果說(shuō)明,200、300目尼龍網(wǎng)對(duì)木薯根際土壤的生物學(xué)性質(zhì)指標(biāo)無(wú)顯著差異。

        3.2" 細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的差異分析

        木薯土壤的優(yōu)勢(shì)群落包括厚壁菌門、放線菌門、變形菌門、綠彎菌門、酸桿菌門、髕骨菌門、WPS-2、藍(lán)細(xì)菌、浮霉菌門和芽單胞菌門,這與韋云東等的研究結(jié)果[14]相似。放線菌能產(chǎn)生多種具有生物活性的代謝物,可協(xié)助植物抵御病原菌,對(duì)土壤中的碳氮循環(huán)及生態(tài)系統(tǒng)具有重要作用[23]。變形菌門、厚壁菌門具有固氮、土壤修復(fù)和物質(zhì)降解等功能,有助于提高植物的抗逆境能力[24]。厚壁菌門、放線菌門和變形菌門在木薯土壤中的富集可能參與了木薯的生長(zhǎng)發(fā)育和抗逆等。

        尼龍網(wǎng)袋目數(shù)會(huì)影響細(xì)菌群落的結(jié)構(gòu)分布。處理B在木薯根際土壤表現(xiàn)出顯著差異,僅B300處理的疣微菌門的相對(duì)豐度顯著高于B200處理。對(duì)于處理C而言,不同處理間無(wú)顯著差異。B200、B300、C200處理都表現(xiàn)出同一處理、不同土層間的顯著差異。

        Sobs、Chao1、ACE指數(shù)用于反映微生物的物種豐富度,而Shannon、Simpson指數(shù)則用于反映物種的多樣性[25]。對(duì)于木薯根際土壤而言,C300處理的ACE、Chao1指數(shù)顯著大于C200處理。在200目網(wǎng)袋處理下,通過LEfSe分析沒有找到對(duì)應(yīng)的Biomarker,但300目網(wǎng)袋處理可以找到較多的biomarker。結(jié)合細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)分布、α-多樣性分析和LEfSe分析的結(jié)果可知,用200、300目尼龍網(wǎng)采集木薯根際土壤的優(yōu)勢(shì)菌門的相對(duì)豐度無(wú)顯著差異,極少數(shù)菌門的相對(duì)豐度表現(xiàn)為300目顯著高于200目,這可能是因?yàn)?00目的孔徑尺寸較大,根際細(xì)菌比較容易通過。

        3.3" 土壤速效養(yǎng)分與微生物相對(duì)豐度、是否滅菌處理、隔層尼龍網(wǎng)目數(shù)之間的相關(guān)性分析

        土壤速效養(yǎng)分會(huì)引起土壤細(xì)菌、古菌群落發(fā)生變化,且氮、磷、鉀含量直接與植物根際土壤微生物量顯著相關(guān)[26-27]。本研究結(jié)果表明,蔗糖酶活性與速效氮、速效磷、速效鉀含量呈極顯著負(fù)相關(guān)(Plt;0.001);脲酶活性和速效氮、銨態(tài)氮、硝態(tài)氮含量呈極顯著負(fù)相關(guān)。而郜永博等研究發(fā)現(xiàn),脲酶活性與速效氮、速效磷、速效鉀含量呈極顯著正相關(guān),蔗糖酶活性與速效氮、速效磷、速效鉀含量相關(guān)性不顯著[28],與本研究結(jié)果不一致,這可能與施肥方式、種植方式不同有關(guān)。本研究結(jié)果表明,隔層尼龍網(wǎng)目數(shù)與脲酶呈極顯著正相關(guān),使用尼龍網(wǎng)種植木薯可能會(huì)影響脲酶活性。

        相關(guān)性分析結(jié)果表明,木薯根際土壤的優(yōu)勢(shì)菌門與土壤速效養(yǎng)分存在相關(guān)性。其中,厚壁菌門與速效氮、速效鉀含量呈極顯著負(fù)相關(guān)。吳東等研究發(fā)現(xiàn),厚壁菌門與堿解氮、速效磷、速效鉀含量呈負(fù)相關(guān)[29],本研究結(jié)果與其相似。本研究還發(fā)現(xiàn),氮、磷、鉀等速效養(yǎng)分含量之間存在顯著或極顯著正相關(guān)關(guān)系,與楊柳等的研究結(jié)果[30]相似,說(shuō)明在木薯根際也存在碳、氮、磷養(yǎng)分循環(huán)的耦合效應(yīng)。植物生長(zhǎng)過程中需要各種物質(zhì)的共同作用,而根系通過根際效應(yīng)加強(qiáng)了這種不同元素間的耦合效應(yīng),使得根際能夠?yàn)橹参锾峁└映浞智揖獾臓I(yíng)養(yǎng)[30]。

        4" 結(jié)論

        綜上所述,通過對(duì)處理B、處理C進(jìn)行處理內(nèi)的比較發(fā)現(xiàn),用200、300目尼龍網(wǎng)袋采集的木薯根際土壤生物學(xué)性質(zhì)指標(biāo)無(wú)顯著差異;用200、300目尼龍網(wǎng)采集的木薯根際土壤的優(yōu)勢(shì)菌門的相對(duì)豐度無(wú)顯著差異,極少數(shù)菌門的相對(duì)豐度表現(xiàn)為300目顯著高于200目。由此可見,200目尼龍網(wǎng)袋更適合用于采集木薯根際土壤,200目尼龍網(wǎng)袋既能阻止木薯根系穿透生長(zhǎng),又不妨礙土壤水分、養(yǎng)分運(yùn)移和微生物穿透。

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