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        ADAR1 p150和p110參與肝癌細胞增殖、遷移和侵襲

        2024-08-23 00:00:00鞏雪柳靜蹇文崔易紅涂增
        重慶醫(yī)科大學學報 2024年7期
        關鍵詞:增殖肝癌

        【關鍵詞】腺苷脫氨酶1;肝癌;增殖;遷移侵襲;Wnt/β-catenin信號通路

        【中圖分類號】R735.7 【文獻標志碼】A 【收稿日期】2024-01-25

        肝癌是全球最常見的惡性腫瘤之一,死亡率接近發(fā)病率[1]。肝細胞癌(liver hepatocellular carci?noma,LIHC)是最常見的肝癌形式,占90% 以上的病例[2]。LIHC的危險因素多種多樣,包括肝炎病毒感染、酒精、非酒精性脂肪肝炎、年齡、性別等因素[3-5]。目前肝癌治療靶向藥物主要有索拉菲尼、侖伐替尼和瑞戈非尼等[6],盡管取得了一些進展,但肝癌細胞具有高度遷移性和侵襲性[7],導致肝癌復發(fā)和轉移,治療效果不理想,其機制也尚未明了。因此,深入探討肝癌發(fā)生發(fā)展的機制對指導LIHC診斷預后具有重要意義。

        腺苷脫氨酶1(adenosine deaminases acting onRNA 1,ADAR1)是一種雙鏈RNA編輯酶[8-9],催化腺苷(A)的水解脫氨反應,產(chǎn)生肌苷(I)。先前的研究表明,ADAR1 的異常表達與LIHC 的進展密切相關[10-12],ADAR1通過編輯細胞周期蛋白依賴性激酶13(cyclin-dependent kinases 13,CDK13)、膠質瘤相關癌基因1(gliomaassociated oncogene 1,GLI1)和抗酶抑制因子(antizyme inhibitor 1,AZIN1)[13-15]進而促進細胞增殖和肝癌的發(fā)生發(fā)展。ADAR1具有2種亞型:組成性表達的p110(110 kD)和干擾素誘導表達的p150(150 kD)[16]。在LIHC 臨床樣本中,ADAR1 p110和p150處于高表達狀態(tài),且與患者不良預后相關[17]。有研究表明,ADAR1 p110 通過上調整合素α2(integrinα 2,ITGA2)表達增強肝細胞癌的增殖和侵襲能力[18],但ADAR1 p150和ADAR1p110的作用是否相同,在肝癌研究中鮮有報道。本研究基于ADAR1 的2 個亞型p150 和p110 展開研究,探究其對肝癌增殖、遷移和侵襲的影響。

        1 材料與方法

        1.1 組織標本、細胞系及主要試劑

        組織標本:人肝癌組織和癌旁組織來源于重慶醫(yī)科大學附屬第一醫(yī)院,本研究方案通過重慶醫(yī)科大學醫(yī)學研究倫理委員會審批同意。

        細胞系:人肝癌細胞系Huh7、HepG2均由重慶醫(yī)科大學基礎醫(yī)學院病原生物學教研室提供。

        主要試劑:DMEM和Opti-EME培養(yǎng)基(Gibco);胰酶(多沃生物);胎牛血清(ExCell);鼠尾Ⅰ型膠原(索萊寶);Trizol和LipofectamineTM3000(Invitrogen);DMSO(Sigma);CCK-8(APE×Bio);逆轉錄試劑盒(Takara);2×通用SYBR GreenFast qPCR Mix(Abcolnal);無內毒素質粒中提試劑盒Endo?Free Plasmid Midi Kit(康為生物);Transwell 細胞小室和Matrigel 基質膠(Coring);ADAR1 抗體(正能生物);GSK3β(proteintech);β-catenin(proteintech);p-β-catenin(protein?tech);GAPDH和兔二抗(proteintech)。

        質粒:ADAR1-p110 表達質粒由廣州復能基因公司將ADAR1-p110 的cDNA 序列(NM001025107.2)構建到EXZ3143-M07載體中;ADAR1-p150表達質粒由OriGene公司將ADAR1-p150 的cDNA 序列(NM 001111.4)構建到pCMV6-Entry 載體中。靶向ADAR1 的小干擾RNA(siA?DAR-1、siADAR-2和siADAR-3)購自湖州河馬生物科技有限公司。

        1.2 方法

        1.2.1 細胞培養(yǎng) 肝癌細胞株(HepG2和Huh7)復蘇后,置于含10%胎牛血清和1%青霉素/鏈霉素的DMEM完全培養(yǎng)基于5%二氧化碳,37 ℃的條件下培養(yǎng),待愈合度達90%后用胰酶消化傳代。其中,對HepG2開展實驗時,其細胞培養(yǎng)皿的表面需使用鼠尾Ⅰ型膠原提前處理促進細胞伸展。

        1.2.2 基因表達譜互動分析(GEPIA) 基因表達譜互動分析(http://gepia.cancer-pku.cn)選取來源于TCGA 和GTEx數(shù)據(jù)庫369例肝癌腫瘤樣本和160例正常肝臟組織樣本,使用RNA 測序處理后輸出可視化結果。最終得到ADAR1 和GSK3β在肝癌與正常肝臟組織中的表達,并分析ADAR1基因在肝癌不同疾病分期中的表達水平及其對肝癌患者預后的影響。

        1.2.3 細胞轉染 取生長狀態(tài)良好的細胞接種于6 cm細胞培養(yǎng)皿中,當細胞融合度達到60% 左右時,按照LipofectamineTM3000 說明書,將ADAR 過表達質?;騭iRNA(表1)分別配制成雞尾酒混合物轉染到細胞中。轉染后4~6 h,更換成完全培養(yǎng)基繼續(xù)培養(yǎng)48 h 收取細胞進行后續(xù)檢測。

        1.2.4 細胞活力測定 將處理好的HepG2和Huh7細胞分別以每孔2×103個細胞的密度接種在96孔板中,每組3個孔。培養(yǎng)至相應時間后,每孔中加入10 μL CCK-8 溶液,孵育1 h。使用酶標儀在450 nm處測定吸光度(absorbance,A)值。

        1.2.5 劃痕實驗 細胞被接種在6孔板中,培養(yǎng)到90%的融合度,利用槍頭進行劃痕,然后用磷酸鹽緩沖液(PBS)洗滌后,加入無血清的DMEM 培養(yǎng)基繼續(xù)培養(yǎng),使用顯微鏡分別在0 h和48 h定點拍照記錄,觀察細胞的邊緣運動。使用Image J軟件計算分析傷口相對遷移速度。

        1.2.6 Transwell 實驗 細胞遷移和侵襲試驗使用24孔Tran?swell 室和8 μm 聚碳酸酯膜(Coring,美國)進行。Transwell遷移實驗是細胞在無血清饑餓2 h后,將細胞消化離心,用無血清培養(yǎng)基重懸,計數(shù),稀釋至所需濃度,小室上層每孔接種2×104個細胞的懸液,下層加入完全培養(yǎng)基,于培養(yǎng)箱中孵育48 h。拿出小室用4%多聚甲醛固定,0.1%結晶紫染色。最后,用顯微鏡拍照觀察,計數(shù)穿膜細胞。Transwell侵襲實驗需提前將基質膠鋪被于小室中,其余步驟與Transwell遷移實驗相同。

        1.2.7 實時熒光定量PCR(qPCR) 采用TRizol試劑提取細胞總RNA,取1 μg RNA按照PrimeScript RT Reagent Kit withgDNA Eraser逆轉錄試劑盒操作手冊合成cDNA,使用2×通用SYBR Green Fast qPCR Mix 進行qPCR。反應條件如下:95 ℃循環(huán)3 min,95 ℃循環(huán)5 s,60 ℃循環(huán)30 s。所有qPCR引物均使用NCBI網(wǎng)站(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)在線設計(表2),由北京擎科生物技術有限公司合成。GAPDH基因作為內參,采用2-ΔΔCt方法計算相對表達量。

        1.2.8 Western blot檢測 使用RIPA 裂解液提取組織和細胞中的總蛋白并用BCA法定量。每個蛋白樣品經(jīng)SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳分離,并轉移到PVDF膜(0.45 μm)上。隨后用5%脫脂奶粉封閉膜后,與一抗(ADAR1,1∶2 000;GAPDH,1∶5000,GSK3β,1∶2000;β-catenin,1∶5000;p-β-catenin,1∶5 000)4 ℃孵育過夜,經(jīng)TBST緩沖液洗滌3次,與二抗在室溫下孵育1 h。TBST洗滌3次后使用增強型化學發(fā)光試劑盒(Beyotime Biotechnology)進行顯色檢測。

        1.2.9 蛋白-蛋白互作和富集分析 通過STRING在線網(wǎng)站(https://cn.string-db.org/)進行蛋白-蛋白互作(protein-proteininteraction,PPI)網(wǎng)絡分析,所得結果進行可視化分析;篩選與ADAR1直接作用的Hub gene,再通過生物學信息注釋數(shù)據(jù)庫DAVID(http://david.ncifcrf.gov)對基因進行GO和KEGG富集分析。

        1.3 統(tǒng)計學方法

        實驗結果均取3次重復實驗,數(shù)據(jù)用均數(shù)±標準差(x±s)表示,應用Graph Pad Prism(9.5.1)對數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計分析和繪圖,2組間比較采用t 檢驗,多組間比較采用單因素方差分析。檢驗水準α=0.05。

        2 結果

        2.1 ADAR1在肝癌組織中高表達,并與預后不良有關

        首先,本研究組通過生物信息學在線分析工具GEPIA對肝癌組織與癌旁組織中ADAR1的表達水平進行了分析,結果顯示,相較于癌旁組織,肝癌組織中ADAR1表達顯著上調(圖1A),這提示ADAR1在肝癌的進展中可能發(fā)揮促進作用。此外,ADAR1在肝癌不同分期中,ADAR1表達無統(tǒng)計學意義(P=0.508,圖1B),但高表達患者相較于低表達患者的預后較差(圖1C)。最后,本研究組采用Western blot對8例臨床肝癌組織和癌旁組織進行檢測,發(fā)現(xiàn)肝癌組織相較于癌旁組織,ADAR1 p150和p110兩個亞型的蛋白質表達水平均更高(圖1D)。這些結果表明,ADAR1 在肝癌中表達上調,且與預后不良密切相關。

        2.2 過表達ADAR1 p150和p110均能促進肝癌細胞的增殖、遷移和侵襲能力

        為驗證肝癌組織中得到的結果,本研究組在Huh7 和HepG2 細胞中轉染ADAR1 過表達質粒p150 和p110,通過Western blot和qPCR檢測細胞中ADAR1表達水平。結果表明,過表達組的ADAR1蛋白質和mRNA表達水平均明顯升高(圖2A、B)。通過CCK-8檢測過表達ADAR1對細胞增殖的影響,結果表明,過表達ADAR1 p150和p110后細胞增殖能力明顯高于對照組(Plt;0.01,圖2C)。劃痕實驗結果顯示,劃痕后48 h,過表達ADAR1 p150和p110組傷口愈合能力顯著強于對照組(Plt;0.001、Plt;0.01,圖3A、B)。此外,Transwell細胞遷移和侵襲實驗表明,過表達ADAR1 p150和p110組細胞穿孔數(shù)明顯多于對照組(Plt;0.05,圖3C、D)。以上結果表明過表達ADAR1 p150和p110均能促進肝癌細胞的增殖、遷移和侵襲。

        2.3 敲低ADAR1抑制肝癌細胞的增殖、遷移和侵襲能力

        為進一步分析ADAR1兩個亞型表達水平對肝癌細胞增殖、遷移和侵襲的影響,本研究設計了同時靶向2個亞型的siRNA序列,通過對肝癌Huh7和HepG2細胞轉染siRNA干擾ADAR1兩個亞型的表達。采用Western blot和qPCR檢測ADAR1的干擾效率。結果顯示,與對照siNC相比,siADAR組ADAR1兩個亞型的蛋白質和RNA表達水平均明顯降低(Plt;0.001,圖4A、B)。通過CCK-8實驗檢測細胞活力,結果顯示,與對照組siNC相比,siADAR1組的Huh7和HepG2細胞活力顯著降低,尤其是在96 h 時最為明顯(Plt;0.001,圖4C)。劃痕實驗結果顯示,siADAR1組細胞傷口愈合能力受到抑制(Plt;0.05,圖5A、B)。同時,Transwell細胞遷移和侵襲實驗表明,siADAR1 組細胞遷移和侵襲能力受到抑制(Plt;0.05,圖5C、D)。以上結果表明,敲低ADAR1可以抑制肝癌細胞的增殖、遷移和侵襲。

        2.4 ADAR1調控Wnt/β-catenin信號通路

        利用STRING 數(shù)據(jù)庫構建ADAR1蛋白質互作網(wǎng)絡,根據(jù)蛋白關聯(lián)性獲取了前10的相關蛋白,其中包括糖原合酶激酶3β(glycogen synthase kinase 3β,GSK3β)(圖6A)。通過DAVID數(shù)據(jù)庫對這些互作蛋白進行GO和KEGG富集分析,結果顯示主要參與的生物過程包括:細胞增殖、間充質上皮轉化、干擾素刺激基因(interferon stimulated gene factor 3,ISGF3)表達調控、核糖核酸酶Ⅲ活性調控、RNA 結合域調控、Wnt信號通路等(圖6B、C)。Wnt信號通路是經(jīng)典的腫瘤調控通路,在支架蛋白的輔助下,β-連環(huán)蛋白(β-catenin)與GSK3β、APC基因產(chǎn)物形成復合體。當激活Wnt信號之后,Wnt分子與跨膜受體Fzd結合,抑制GSK3β,使得β-catenin磷酸化程度降低,并抑制β-catenin降解,使其穩(wěn)定并聚集于細胞核內,經(jīng)過轉錄調控,參與腫瘤的調控。因此,本研究通過在肝癌細胞Huh7和HepG2里面過表達和敲低ADAR1 p150和p110,進行Western blot實驗分析Wnt信號通路相關蛋白的表達情況,結果發(fā)現(xiàn),過表達ADAR1 p150和p110后減少了GSK3β 含量,降低了β-catenin 的磷酸化水平,而對β-catenin 水平無明顯影響(圖6D);相反,敲低ADAR1 p150和p110后GSK3β的含量升高,磷酸化β-catenin水平升高,同樣對β-catenin無明顯影響(圖6E)。綜上,這些數(shù)據(jù)表明ADAR1對肝癌細胞的影響可能是通過Wnt/β-catenin 信號通路發(fā)揮作用的。

        3 討論

        肝細胞癌嚴重威脅人類健康,是世界范圍內的重要公共衛(wèi)生問題。近年來,肝細胞癌的研究持續(xù)受到關注[19]。因高度復制性和異質性,其致病分子機制未完全解析[20]。因此,肝細胞癌的有效預防和治療面臨巨大挑戰(zhàn)。

        ADAR1是一種多功能蛋白,在炎癥損傷[21]、細胞應激[22]和免疫調控[23]等方面發(fā)揮重要作用。研究表明,ADAR1異常表達與卵巢癌[24]、乳腺癌[16]等多種惡性腫瘤的發(fā)生發(fā)展密切相關。ADAR1有2種亞型:p150 和p110。p150 由干擾素誘導表達,主要定位于細胞質;p110因缺乏核輸出信號(nuclearexport signal,NES)而定位于細胞核。在肝癌中,ADAR1 p110通過編輯一種RNA結合蛋白DDX1促進細胞增殖和轉移[25],此外,ADAR1 p110還可以促進肝癌細胞的增殖和侵襲[18]。目前尚未有研究報道p150對肝癌細胞惡性增殖的影響?;诖耍狙芯客瑫r探討了ADAR1兩種亞型對肝癌Huh7和HepG2細胞增殖、遷移和侵襲的影響,并對機制進行初步研究。GEPIA在線網(wǎng)站分析結果顯示,與正常肝臟組織相比,ADAR1在肝癌組織中高表達,盡管在肝癌的不同分期中其表達量差異無統(tǒng)計學意義,但高表達ADAR1 的患者預后不良。此外,Western blot檢測臨床肝癌和癌旁組織表達,結果顯示,ADAR1p150和ADAR1 p110在肝癌組織中表達量均異常增高,這與在線分析數(shù)據(jù)是一致的。在肝癌Huh7和HepG2細胞中轉染ADAR1過表達質粒,CCK-8、劃痕及Transwell實驗證明ADAR1兩個亞型均能促進肝癌細胞的增殖、遷移和侵襲。然后,通過轉染ADAR1小干擾質粒,發(fā)現(xiàn)在ADAR1兩個亞型的表達量降低后,肝癌Huh7和HepG2細胞的增殖、遷移和侵襲能力均受到明顯抑制。這些結果說明ADAR1與肝癌細胞的增殖和存活密切相關。

        Wnt/β-catenin信號通路是一種復雜的蛋白網(wǎng)絡調控系統(tǒng),參與炎癥[26]、腫瘤[27]等多種疾病過程。GSK3β是Wnt/β-catenin信號通路中的負調控因子,β-catenin 是GSK3β 的下游底物。激活狀態(tài)下的GSK3β能夠磷酸化β-catenin并誘導其在蛋白酶體中的降解。既往研究表明,Wnt/β-catenin通路抑制劑可促進胃癌細胞的增殖和遷移,沉默ADAR1后β-catenin表達水平受到抑制,并逆轉由Wnt/β-catenin通路抑制劑導致的胃癌發(fā)生發(fā)展。此外,在乳腺癌細胞系中,ADAR1 p110過表達降低了GSK3β的表達,同時增加了β-catenin的活性,ADAR1敲除具有相反的效果。ADAR1 通過抑制GSK3β 活性,使β-catenin積累和核易位減少,從而介導ADAR1誘導的細胞侵襲和新生血管形成。目前尚未有ADAR1靶向Wnt/β-catenin信號通路在肝癌中的研究。本研究通過生物信息學和Western blot實驗驗證,在肝癌中,ADAR1 和Wnt/β-catenin 信號通路存在相關性。結果顯示,過表達ADAR1 p150和p110均能抑制GSK3β 表達,降低β-catenin 磷酸化水平,而對β-catenin無明顯影響;敲低ADAR1后GSK3β含量增加,并激活磷酸化β-catenin水平,β-catenin表達無顯著差異。這些數(shù)據(jù)提示,肝癌細胞中異常升高的ADAR1可能通過激活Wnt/β-catenin信號通路,從而促進肝癌的增殖、遷移和侵襲。

        綜上所述,ADAR1在LIHC中高表達,并與不良預后相關。ADAR1 p150 和p110 均能促進肝癌Huh7和HepG2細胞的增殖、遷移以及侵襲能力,其作用機制與Wnt/β-catenin信號通路存在一定相關性。但仍需更多的實驗來進一步探索ADAR1 與Wnt/β-catenin在LIHC發(fā)生發(fā)展過程中的作用和機制,為LIHC診斷和預后提供新的方向和途徑。

        (責任編輯:李青穎)

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