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        農(nóng)藥廠廢水排放對淤泥微生物群落的影響

        2024-06-03 00:00:00許鴻翔何揚(yáng)建謝克勤陳德鑫何平謝建平

        摘要:農(nóng)藥生產(chǎn)廢水毒性大、濃度高、組分復(fù)雜,其處理工藝主要依賴于微生物降解,然而經(jīng)降解后的達(dá)標(biāo)廢水對生態(tài)環(huán)境和抗生素抗性基因分布格局的影響仍不清楚.為探究重慶市某農(nóng)藥生產(chǎn)廠產(chǎn)生的廢水經(jīng)處理后排放對微生物群落及其抗性基因水平影響,采集農(nóng)藥生產(chǎn)過程中廢水處理前和排污口溪流的相關(guān)淤泥樣品,通過16SrRNA高通量測序技術(shù)及抗生素抗性基因的檢測,研究農(nóng)藥生產(chǎn)廢水處理環(huán)境下細(xì)菌群落的結(jié)構(gòu)功能變化.處理池淤泥樣品(poolsludgesample,PSS)α多樣性顯著低于小溪底泥樣品(brooksludgesample,BSS),但BSS中菌群結(jié)構(gòu)隨排污口距離增加仍保持相對穩(wěn)定.PSS中富含大量農(nóng)藥降解相關(guān)微生物,并顯著富集農(nóng)藥降解相關(guān)代謝通路,表現(xiàn)出對多種農(nóng)藥的降解能力.氨基糖苷類、β內(nèi)酰胺類、氯霉素類、氟喹諾酮類抗生素抗性基因的豐度在排污口較高,但多數(shù)高豐度菌屬并未與抗生素抗性基因豐度顯著相關(guān).PSS中農(nóng)藥降解相關(guān)細(xì)菌豐富,并與BSS菌群組成差異明顯.研究范圍內(nèi)BSS微生物群落并未明顯產(chǎn)生響應(yīng)排污口距離的梯度變化.BSS抗生素抗性水平并非由單一菌屬?zèng)Q定,可能由多個(gè)菌屬共同介導(dǎo).

        關(guān)鍵詞:農(nóng)藥;抗生素抗性基因;排污;微生物群落

        中圖分類號(hào):Q93 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A 文章編號(hào):1001-8395(2024)04-0498-09

        doi:10.3969/j.issn.1001-8395.2024.04.007

        農(nóng)藥是全球農(nóng)業(yè)系統(tǒng)的重要成分,然而農(nóng)藥工業(yè)生產(chǎn)過程中產(chǎn)生的廢水中含有大量有毒有害物質(zhì)和殘留的農(nóng)藥,會(huì)對環(huán)境造成巨大的破壞.農(nóng)藥及其降解殘余物能夠增強(qiáng)微生物對特定抗生素的耐受性[12].通過增加細(xì)胞膜通透性和增加細(xì)菌可移動(dòng)基因元件的比例,農(nóng)藥殘留能夠促進(jìn)抗生素抗性基因的轉(zhuǎn)移,從而誘導(dǎo)受污染的環(huán)境中抗生素耐藥水平的提升[3].由于抗生素抗性基因具有水平轉(zhuǎn)移的特性,環(huán)境中的抗生素抗性基因被視為一種新型污染[3].此外,農(nóng)藥也能誘導(dǎo)微生物產(chǎn)生基因突變,并導(dǎo)致抗生素耐藥性相關(guān)基因突變的正選擇[45].在群體水平上,農(nóng)藥還能夠改變微生物群落結(jié)構(gòu)和多樣性,并導(dǎo)致抗生素耐藥微生物的富集,最終對生態(tài)健康構(gòu)成風(fēng)險(xiǎn)[6].因此,農(nóng)藥廠廢水必須經(jīng)過適當(dāng)處理達(dá)標(biāo)后才能排放,確保排放的廢水對自然環(huán)境的影響在其自凈能力范圍之內(nèi).

        微生物能夠直接降解特定農(nóng)藥[7],在有利的條件下,微生物使用農(nóng)藥作為碳、氮、硫和電子供體的來源[8].利用酶促反應(yīng)等生理過程,微生物能夠?qū)⑥r(nóng)藥降解為低分子的無毒或低毒化合物.許多種類的農(nóng)藥已有報(bào)道可降解的微生物,如異丙隆可被Sphingomonas、Arthrobacter、Methylopila及Sphingobium等屬的菌株降解[9],敵敵畏可被Cunninghamella、Bacillus等屬細(xì)菌降解[10].

        常見農(nóng)藥的分子式、結(jié)構(gòu)式及對應(yīng)的降解微生物如表1所示.活性污泥是全世界廢水處理中廣泛采用的方法,它利用微生物的降解功能,可以去除廢水中大部分化學(xué)物質(zhì),從而起到凈化廢水的作用[8].然而,經(jīng)過微生物凈化后的農(nóng)藥工業(yè)廢水,其排放后對水生微生物群落結(jié)構(gòu)和功能的影響尚不清楚,且凈化后的廢水是否仍會(huì)改變環(huán)境抗生素耐藥水平尚不明確.

        本研究采用高通量測序技術(shù),對從重慶市永川區(qū)某農(nóng)藥廠污水處理池采集的活性污泥樣品和廢水流入的小溪中的底泥樣品進(jìn)行16S擴(kuò)增子測序,以評(píng)估農(nóng)藥生產(chǎn)廢水周期性排放對菌群結(jié)構(gòu)和抗生素耐藥性的變化,為實(shí)際生產(chǎn)過程中農(nóng)藥廢水處理后對水環(huán)境的影響提供依據(jù).

        1 材料與方法

        1.1 樣品采集及預(yù)處理

        樣品采集于2016年8月.處理池淤泥樣品采集自重慶市永川區(qū)某農(nóng)藥生產(chǎn)廠生產(chǎn)廢水厭氧發(fā)酵處理池,每隔7d采集一次,共采集4個(gè)樣品,編號(hào)為P01~P04.經(jīng)過處理后的達(dá)標(biāo)廢水排入一條小溪,從廢水排出口下游50m處開始,每隔50m采集一次小溪底泥樣品,共采集20個(gè)樣品,編號(hào)為B01~B20.樣品保存于-80℃冰箱.

        1.2 16SrRNA測序

        用土壤基因組DNA快速提取試劑盒(TIANNAMPSoilDNAKit)提取樣品中細(xì)菌DNA,具體步驟參照操作說明書.提取后的DNA置于-80℃ 保存.選用16SrRNA V4區(qū)引物(520F5′-AYTGGGYDTAAAGNG-3′ 和802R-5′TACNVGGGTATCTAATCC-3′)對細(xì)菌DNA進(jìn)行擴(kuò)增.PCR擴(kuò)增體系:98℃預(yù)變性3min;98℃ 15s,50℃ 30s,72℃ 30s,共26個(gè)循環(huán);72℃延伸5min;12℃結(jié)束反應(yīng),采用2%瓊脂糖凝膠電泳檢測.將檢測合格的DNA送至微基生物科技(上海)有限公司進(jìn)行PCR擴(kuò)增及高通量測序.

        1.3 抗生素抗性基因的測定

        采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR對抗生素抗性基因進(jìn)行檢測.根據(jù)預(yù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果,選取豐度相對較高的耐藥基因進(jìn)行檢測,包括AADA1、BLATEM、INTI1、MEXF、OPRJ、SUL1、SUL2、TET(34)、TNPA-04、VANSC-02(表2).按以下反應(yīng)體系進(jìn)行:5μLTBGreenPremixExTaqⅡ(TliRNaseHPlus)(2×),上、下游引物各0.4μL,0.2μLROXReferenceDye(50×),1μL模板,加ddH2O補(bǔ)至10μL.反應(yīng)條件:95℃變性30s;95℃5s,退火溫度30s,72℃ 30s,共40個(gè)循環(huán);熒光采集72℃;熔點(diǎn)曲線溫度設(shè)定范圍為60~95℃.

        1.4 數(shù)據(jù)分析

        使用Trimmomatic軟件[18]對原始測序數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)量控制.利用軟件USEARCH把拼接好的序列聚類為OTUs(operationaltaxonomicunits).用Mothur軟件[19]與SILVA數(shù)據(jù)庫對OTUs代表序列進(jìn)行物種注釋分析,獲得對應(yīng)物種信息及在各個(gè)分類水平物種豐度情況.群落功能預(yù)測由PICRUSt2[20]軟件進(jìn)行.?dāng)?shù)據(jù)的可視化在Rstudio中使用R4.1.0版本完成.

        2 結(jié)果與分析

        2.1 細(xì)菌群落物種組成

        在門水平上,Proteobac-teria為優(yōu)勢菌群,在PSS和BSS中相對豐度最高,僅在P02中低于Firmicutes,見圖1(a).Bacteroidetes在BBS中的相對豐度高于PSS,而Firmi-cutes和Cyanobacteria在BSS的相對豐度低于PSS,而其他門水平的細(xì)菌相對豐度較低.利用線性判別式分析(lineardiscriminantanalysis,LDA),對BSS和PSS樣本屬水平細(xì)菌進(jìn)行差異分析,共發(fā)現(xiàn)24個(gè)存在顯著差異的菌屬.其中,Methylotenera、Ferribacterium、Thiobacillus等在BSS中具有更高豐度,而Paracoccus、Acidovorax、Atopostipes等在PSS中豐度更高,見圖1(b).

        2.2 菌群多樣性分析

        淤泥樣品的主成分分析(圖2)表明,PSS與BSS的樣本具有顯著差異(PERMANOVA,P=0.001,R=0.56);然而,空間距離并非是驅(qū)動(dòng)BSS各樣品菌群β多樣性變化的顯著性因素.對BSS和PSS中的菌群計(jì)算豐富度指數(shù)、香農(nóng)指數(shù)、辛普森指數(shù)、Chao1指數(shù),如表3所示,結(jié)果表明PSS各項(xiàng)α多樣性指數(shù)均顯著高于BSS.對BSS的α多樣性指數(shù)與農(nóng)藥廠相對距離進(jìn)行相關(guān)性分析,如圖3可知,隨著距離廢水排出口的空間距離增加,豐富度和Chao1指數(shù)呈現(xiàn)顯著的下降趨勢(P<0.05),而香農(nóng)和辛普森指數(shù)未與距離產(chǎn)生顯著相關(guān)性.

        2.3 菌群潛在功能差異

        通過PICRUSt2對群落功能進(jìn)行預(yù)測,共得到21條在BSS和PSS樣本豐度產(chǎn)生顯著差異的KEGG通路(圖4).其中,7條通路在BSS樣本中顯著下調(diào),14條通路在BSS樣本中顯著上調(diào).PSS菌群具有顯著上調(diào)的二英、乙苯、氟苯甲酸鹽等降解通路,提示活躍的農(nóng)藥降解能力;而BSS菌群對氯代烷和氯代烯烴、氨基苯甲酸甲酯具有更強(qiáng)的降解能力.此外,BSS菌群也具有顯著更高的氮代謝、煙酸和煙酰胺代謝、卟啉代謝等多種代謝活動(dòng).

        2.4 細(xì)菌群落與抗生素抗性基因相關(guān)性分析

        AADA1、BLATEM、INTI1、MEXF、OPRJ、SUL1、SUL2、TET(34)、TNPA-04和VANSC-02為主要的抗生素抗性基因.通過Spearman相關(guān)分析比較了相對豐度最高的前20個(gè)菌屬和這些抗生素抗性基因之間的相關(guān)性(圖5).結(jié)果表明,除SUL1和TET(34)外,其余抗生素抗性基因并未與任何菌屬產(chǎn)生顯著的相關(guān)性.SUL1與Ferribacterium的相對豐度顯著正相關(guān)(P<0.05,R=0.69),而TET(34)與Aeromonas的相對豐度顯著正相關(guān)(P<0.05,R=0.66),而與Acidovorax的相對豐度顯著負(fù)相關(guān)(P<0.05,R =-0.64).

        3 討論與結(jié)論

        農(nóng)藥對細(xì)菌抗生素耐藥性的演變具有重要的推動(dòng)作用[8].因此,利用微生物降解等方式處理農(nóng)藥生產(chǎn)過程中的廢水對阻止抗生素耐藥性傳播具有重要意義.未經(jīng)處理的農(nóng)藥廢水直接排放會(huì)擾動(dòng)菌群多樣性[21];然而,菌群結(jié)構(gòu)是否會(huì)受凈化后廢水的影響尚不清楚.本研究中PSS和BSS菌群結(jié)構(gòu)產(chǎn)生顯著差異.PSS菌群不同α多樣性指數(shù)與BSS相比均顯著下降,這可能是活性污泥中高度的微生物選擇性所致.香農(nóng)指數(shù)和辛普森指數(shù)并未隨排污口距離顯著變化,提示綜合考慮物種均勻度和數(shù)量后BSS樣本菌群結(jié)構(gòu)相對穩(wěn)定,也表明凈化后的廢水對微生物群落結(jié)構(gòu)的有限影響,這可能是由于凈化后的農(nóng)藥生產(chǎn)廢水去除了大部分殘留農(nóng)藥及原料,減輕了廢水對菌群的選擇壓力.

        活性污泥能夠通過吸附和微生物降解等方式去除污水中的抗生素[21].本研究中,PSS顯著富集農(nóng)藥降解相關(guān)通路,這符合其作為農(nóng)藥降解池的預(yù)期.Methylotenera是BSS中相對豐度最高的屬,平均相對豐度達(dá)6.45%.該屬是革蘭氏陰性菌,可利用甲胺作為唯一碳源、氮源,而甲胺是農(nóng)藥生產(chǎn)的重要原料,具有急性毒性,是農(nóng)藥廢水中主要的有毒物質(zhì)之一[22].Methylotenera已被報(bào)道可以降解一種農(nóng)藥生產(chǎn)原料(甲胺)[22].然而該屬在PSS中相對豐度僅0.13%,顯然難以對甲胺進(jìn)行快速有效降解.相反,Paracoccus在PSS中豐度顯著上升.Para-coccus不僅可以利用甲胺,還可以利用N,N-二甲基甲酰胺,后者是一種用途極廣的化工原料[23].這提示Paracoccus而非Methylotenera是PSS中甲胺降解的主要細(xì)菌.此外,LDA分析鑒定的顯著差異菌屬中,Stenotrophomonas在PSS中顯著升高.在PSS中,該細(xì)菌的平均相對豐度高達(dá)3.72%,而在BSS中不到0.02%.Stenotrophomonas屬主要由Stenotroph-omonasacidaminiphila物種構(gòu)成.該種已被報(bào)道可降解多種農(nóng)藥,包括百菌清[2425]、氟蟲腈[26]、丁草胺[27],另外該菌可以降解農(nóng)藥生產(chǎn)原料丙烯酰胺[28].在PSS中,該細(xì)菌的平均相對豐度高達(dá)3.72%,而在BSS中不到0.02%.此外,PICRUSt2細(xì)菌群落功能預(yù)測結(jié)果表明,纈氨酸、亮氨酸和異亮氨酸的生物合成在PSS和BSS中均具有較高功能豐度,而磺酰脲類除草劑氯磺隆、甲基磺嘧啶,咪唑啉酮除草劑AC243997與該代謝途徑有重要關(guān)聯(lián)[26,29],進(jìn)一步提示細(xì)菌群落可能通過該對農(nóng)藥廢水環(huán)境的適應(yīng)性.由于通過16S擴(kuò)增子數(shù)據(jù)預(yù)測菌群代謝通路具有一定的偏差,對該結(jié)果的解釋應(yīng)持謹(jǐn)慎態(tài)度[30].

        農(nóng)藥廢水污染是抗生素抗性基因富集的重要因素之一[31].在BSS中檢測出多種不同的抗生素抗性基因,其中氨基糖苷類、β內(nèi)酰胺類、氯霉素類、氟喹諾酮類等抗生素抗性基因具有較高的相對豐度.抗生素抗性基因和高豐度菌屬的相關(guān)性分析表明,多數(shù)菌屬并未與抗生素抗性基因的豐度產(chǎn)生顯著的關(guān)聯(lián)性,提示多數(shù)抗生素抗性基因的豐度并非由單一菌屬?zèng)Q定.先前的研究表明Aeromonas是常見的含有TET抗性基因的細(xì)菌,并在高四環(huán)素類抗生素壓力下占優(yōu)勢[32];與其相一致,我們也發(fā)現(xiàn)BSS中Aeromonas的豐度與TET高度相關(guān),提示該屬可能主導(dǎo)BSS四環(huán)素類抗生素抗性水平變化.然而,仍需進(jìn)一步研究評(píng)估處理后廢水周期性排放下抗生素抗性水平的波動(dòng)性.

        農(nóng)藥生產(chǎn)過程中會(huì)周期性排放大量廢水,這些工業(yè)廢水會(huì)影響環(huán)境微生物群落結(jié)構(gòu)及抗生素抗性水平,影響人類健康.我們的研究評(píng)估了活性淤泥處理后的廢水對排污口水生微生物群落的影響,并檢測了排污口抗生素抗性基因的豐度,進(jìn)一步證實(shí)了活性淤泥降解農(nóng)藥的合理性.

        4 數(shù)據(jù)可用性

        16S測序原始數(shù)據(jù)已提交至國家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心,編號(hào)為NMDC10018521.

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        (編輯 陶志寧)

        基金項(xiàng)目:國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目(2016YFC0502304)

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