朱東平 ,李海峰 ,馮俊飛 ,湯秋恒 ,冷 靜
(1)大理大學(xué)臨床醫(yī)學(xué)院,云南 大理 671003;2)云南省第三人民醫(yī)院呼吸與危重癥醫(yī)學(xué)科,云南 昆明 650011)
目前,肺癌已成為我國(guó)發(fā)病率、死亡率最高的腫瘤之一。我國(guó)健康體檢者每年通過影像檢查出肺部結(jié)節(jié)檢出率約為31%,良性結(jié)節(jié)約占96.4%,6 mm 以上肺結(jié)節(jié)惡性程度明顯增大風(fēng)險(xiǎn)超過1%[1]。早期惡性肺部結(jié)節(jié)診斷的檢出率極低,僅為腫瘤結(jié)節(jié)的2%。DNA 甲基化是表觀遺傳學(xué)領(lǐng)域中的1 個(gè)關(guān)鍵研究方向,它在原位肺部惡性腫瘤的發(fā)生和發(fā)展過程中扮演著重要的角色[2]。隨著實(shí)時(shí)熒光PCR(real-time PCR,RT-PCR)技術(shù)的發(fā)展,人們發(fā)現(xiàn)SHOX2 和RASSF1A 基因甲基化與肺癌密切相關(guān)[3-4]。
本研究通過RT-PCR 對(duì)支氣管肺泡灌洗液(bronchoalveolar lavage fluid,BALF)SHOX2 和RASSF1A 基因甲基化單獨(dú)與聯(lián)合對(duì)肺部結(jié)節(jié)或腫塊性質(zhì)進(jìn)行檢測(cè),以確定其診斷效能,為影像學(xué)和細(xì)胞學(xué)診斷不明時(shí),提高肺癌的檢出率,便于肺部良惡性疾病鑒別診斷及輔助肺癌早期診斷。
研究對(duì)象均來自云南省第三人民醫(yī)院呼吸內(nèi)科住院患者,該方案通過了云南省第三人民醫(yī)院倫理委員會(huì)審查(2024KY001),在研究過程中詳細(xì)告知患者研究細(xì)則,并簽署知情同意書。收集2019 年3 月至2020 年3 月經(jīng)云南省第三人民醫(yī)院胸部影像學(xué)發(fā)現(xiàn)結(jié)節(jié)、腫塊的患者99 例。納入標(biāo)準(zhǔn):(1)胸部CT 提示肺部結(jié)節(jié)、腫塊患者根據(jù)《中國(guó)肺部結(jié)節(jié)分類、診斷和治療指南2016 版》診斷[5],經(jīng)臨床排外感染病灶者;(2)年齡14~80 歲患者;排除標(biāo)準(zhǔn):(1)不適宜進(jìn)行纖維支氣管鏡檢查者;(2)已明確診斷肺癌和肺部炎癥患者;(3)病情垂危者及失訪者。并在1a 內(nèi)進(jìn)行定期隨訪、肺活檢及手術(shù)后病檢,50 例患者最后確診為原發(fā)性肺癌,病理類型為腺癌23 例、鱗癌14 例、腺鱗癌2 例、小細(xì)胞癌1 例、大細(xì)胞癌1 例、其它肺部惡性腫瘤9 例。
對(duì)99 例患者進(jìn)行纖維支氣管鏡檢查,操作均由云南省第三人民醫(yī)院呼吸內(nèi)科副主任及以上醫(yī)師取樣,參照2013 年英國(guó)胸科學(xué)會(huì)成人纖維支氣管鏡檢查標(biāo)準(zhǔn)[6],分3 次將滅菌生理鹽水20 mL注入病變肺段,共60 mL,負(fù)壓抽吸前停留20 s,回收量不少于30 mL,取20 mL 離心,10 000 r/min離心5 min。記錄回收的BALF 總量,然后進(jìn)行刷檢,采集組織標(biāo)本。
1.3.1 DNA 提取將提取的20 mL 肺泡灌洗液進(jìn)行離心,10 000 r/min 離心5 min,經(jīng)過沉淀后,使用移液槍去除上清液后提取肺泡細(xì)胞,然后將肺泡細(xì)胞中DNA 提取出來。
1.3.2 DNA 甲基化的PCR 檢測(cè)SHOX2 和RASSF1A 基因檢測(cè)試劑盒、引物和探針均由上海透景生命科技股份有限公司提供。本研究采用亞硫酸鹽修飾和Real-time PCR(Taqman 探針法)2種方法處理離心后提取的DNA。首先,亞硫酸鹽修飾:利用亞硫酸鹽將未甲基化堿基替換后進(jìn)行PCR 擴(kuò)增。通過觀察免疫熒光染色,可以區(qū)分甲基化和未甲基化的C 堿基。Taqman 探針法:通過采用Taqman 探針檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物,在實(shí)時(shí)PCR平臺(tái)上實(shí)現(xiàn)對(duì)肺泡組織中甲基化DNA 的特異性檢測(cè),最后使用通用實(shí)時(shí)熒光PCR 儀循環(huán)階段收集FAM、VIC 及 CY5 的信號(hào)。FAM 用于檢測(cè)RASSF-1A 基因甲基化狀態(tài),VIC 用于檢測(cè)SHOX2 基因的DNA 甲基化狀態(tài),CY5 用于檢測(cè)內(nèi)標(biāo)基因βactin 的水平,(VIC 通道 Ct <32 為陽(yáng)性;FAM 通道 Ct <35 為陽(yáng)性;CY5 通道18≤ Ct ≤23 提示內(nèi)參有效,若超出需計(jì)算△Ct 值)。
1.4.1 經(jīng)皮肺活檢應(yīng)用320 排螺旋CT 掃描,確定穿刺點(diǎn)后利用2%利多卡因針局部浸潤(rùn)麻醉,應(yīng)用11.8 cm 的穿刺針分布進(jìn)針方法一次穿刺至胸膜、靶病變邊緣及病變內(nèi),4%甲醛固定后進(jìn)行組織病理及細(xì)胞學(xué)檢測(cè)。
1.4.2 手術(shù)切除病檢經(jīng)螺旋CT 診斷結(jié)節(jié)、腫塊部位,經(jīng)手術(shù)切除后進(jìn)行相應(yīng)染色處理,行組織病理及細(xì)胞學(xué)檢測(cè),由該機(jī)構(gòu)資深病檢學(xué)家出具診斷報(bào)告。
使用統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件SPSS 20.0 進(jìn)行數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析。正態(tài)分布的連續(xù)變量(表示為平均值±標(biāo)準(zhǔn)差),使用兩獨(dú)立樣本t檢驗(yàn)比較;采用χ2分析臨床病理結(jié)果中SHOX2、RASSF1A 甲基化的陽(yáng)性率;應(yīng)用ROC 曲線評(píng)價(jià)SHOX2 和RASSF1A 基因甲基化對(duì)肺癌診斷的效力,并獲得最佳約登指數(shù)(靈敏度+特異度-1),P<0.05 為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
共納入99 例患者,其中病理檢測(cè)明確診斷為肺癌患者50 例,良性疾病組49 例,99 例患者的平均年齡為61.79 歲,其中肺癌組平均年齡(62.64±9.71)歲,較良性疾病組年齡(60.48±13.69)歲大,2 組年齡差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.032),吸煙史增加患肺部惡性腫瘤風(fēng)險(xiǎn)(P<0.001)。性別、胸部CT 提示結(jié)節(jié)大小均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.132,P=0.177 和P=0.065),見表1。
表1 臨床病例特征[(n)%/()]Tab.1 Clinical case characteristics[(n)%/()]
*P <0.05。
在2 組SHOX2 和RASSF1A 2 基因甲基化PCR檢測(cè)中,單基因、雙基因聯(lián)合或任意基因甲基化對(duì)肺癌檢測(cè)差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),肺癌組任意基因陽(yáng)性較對(duì)照組有明顯差異(χ2=54.046,P<0.001),見表2;對(duì)肺部惡性腫瘤進(jìn)行分類,發(fā)現(xiàn)在2 基因甲基化PCR 任一陽(yáng)性對(duì)肺腺癌、肺鱗癌檢出率均高,分別為91.3%、85.71%,見表3。
表2 2 組SHOX2 和RASSF1A 基因組甲基化PCR 檢測(cè)結(jié)果 [n(%)]Tab.2 PCR results of SHOX2 and RASSF1A genome methylation in two groups [n(%)]
表3 不同類型肺癌患者基因甲基化檢測(cè) [n(%)]Tab.3 Gene methylation in patients with different types of lung cancer [n(%)]
將單因素差異性分析中P<0.05 變量直接納入多因素回歸分析,將SHOX2 陰性、RASSF1A 陰性和不吸煙作為參考類別,發(fā)現(xiàn)SHOX2、RASSF1A及吸煙是肺癌診斷的獨(dú)立危險(xiǎn)因素(P<0.05),2組年齡比較,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.469);肺泡灌洗液SHOX2 基因甲基化陽(yáng)性患者比SHOX2陰性患者患癌風(fēng)險(xiǎn)增加13.675 倍(P=0.009,95%CI:2.146~20.451),RASSF1A 基因甲基化陽(yáng)性患者比RASSF1A 陰性患者患癌風(fēng)險(xiǎn)增加3.644 倍(P=0.014,95%CI:1.245~8.245),此外,吸煙患者比不吸煙患者患癌風(fēng)險(xiǎn)增加,見表4。
表4 多因素Logistics 回歸分析Tab.4 Multi-factor Logistics regression analysis
進(jìn)一步評(píng)估了2 基因甲基化檢測(cè)99 例肺部結(jié)節(jié)和腫塊患者預(yù)測(cè)價(jià)值,生成了受試者工作曲線,SHOX2 和RASSF1A 檢測(cè)肺癌曲線下面積、靈敏度和特異度,見表5、圖1。SHOX2、RASSF1A和2 基因聯(lián)合檢測(cè)曲線下面積分別為0.829、0.770 和0.869,SHOX2+RASSF1A 聯(lián)合高于單一檢測(cè),靈敏度和特異度為0.84,0.898。
圖1 SHOX2 和RASSF1A 基因ROC 曲線Fig.1 SHOX2 and RASSF1A were detected by the ROC curve
表5 單一指標(biāo)和雙指標(biāo)聯(lián)合檢測(cè)結(jié)果Tab.5 Combined detection results of single index and double index
對(duì)起始拒絕行肺穿刺活檢及手術(shù)病檢的2 例患者,每1、3、6 個(gè)月進(jìn)行電話隨訪、約定隨訪復(fù)查,詢問相關(guān)肺部疾病癥狀演變,是否在外院進(jìn)行相關(guān)治療,復(fù)查后經(jīng)由該院資深影像學(xué)家閱片,有1 例患者病情惡化,經(jīng)病理檢測(cè)診斷為肺癌,另1 例患者肺部結(jié)節(jié)消失,考慮為肺部炎癥。
隨著我國(guó)的工業(yè)化和城市化不斷發(fā)展、老年基數(shù)增大及長(zhǎng)期吸煙等危險(xiǎn)因素影響導(dǎo)致我國(guó)體檢人群中肺結(jié)節(jié)檢出率為31%[1],而歐美國(guó)家,體檢發(fā)現(xiàn)肺結(jié)節(jié)的概率更高,達(dá)到了41%~51%[7]。此外,肺部長(zhǎng)期存在磨玻璃結(jié)節(jié)的患者,最后診斷惡性腫瘤概率超過了10%。根據(jù)最新研究結(jié)果[8]顯示,肺癌在我國(guó)以及全世界已成為發(fā)病率和死亡率最高的惡性腫瘤之一,對(duì)人類健康造成了嚴(yán)重的威脅。
據(jù)我國(guó)腫瘤登記報(bào)告顯示,云南省的肺癌發(fā)病率平均為每10 萬人中的44 例,是全國(guó)平均水平的2~3 倍。而云南宣威肺癌發(fā)病率高達(dá)93/10萬人,位居全國(guó)第一[9],因此提升肺癌的診斷率變得迫切和必要。2011 年美國(guó)進(jìn)行國(guó)家肺癌篩查實(shí)驗(yàn)(national lung screening trial,NLST),采用隨機(jī)對(duì)照研究對(duì)高危肺結(jié)節(jié)患者進(jìn)行低劑量胸部CT(常規(guī)CT1/5 輻射劑量)篩查,這一措施比單獨(dú)X 胸片降低了20%肺癌患者病死率[10],因此為提高肺部腫瘤早期發(fā)現(xiàn),我國(guó)建議高危肺結(jié)節(jié)人群每年進(jìn)行低劑量胸部CT 篩查[11]。但有研究顯示[12],通過低劑量螺旋CT(low-dosespiral computed tomography,LDCT)能檢測(cè)出患者的非鈣化結(jié)節(jié)中實(shí)際僅為腫瘤結(jié)節(jié)的2%,很大程度影響了患者早期肺癌檢出。在高肺癌發(fā)病率的云南地區(qū),對(duì)沒有明顯呼吸道癥狀及早期結(jié)節(jié)直徑小于1 cm 的肺癌患者,由于腫瘤標(biāo)記物、細(xì)胞學(xué)檢查、影像學(xué)檢查和支氣管鏡檢對(duì)肺癌檢出率相對(duì)較低,而且難以取得活體組織進(jìn)行病檢,所以多數(shù)患者被診斷為惡性腫瘤時(shí)已進(jìn)展到晚期,從而錯(cuò)過最佳手術(shù)及放化療治療時(shí)期,致肺癌整體5 a生存率低,僅為16%左右[13]。因此對(duì)高危肺癌患者的篩查、早期診斷、及時(shí)干預(yù)治療尤為重要。
研究表明DNA 甲基化被廣泛應(yīng)用于癌癥的輔助診斷,特別是在BALF 和胸腔積液等微創(chuàng)檢測(cè)中[14]。矮小同源盒基因(short stature homobox 2,SHOX2)是同源盒基因家族的一員,參與癌癥早期病變。劉瑩等[3]研究發(fā)現(xiàn),SHOX2 基因在實(shí)體腫瘤中表達(dá)異常,如肺癌、乳腺癌和腎癌等,在肺癌組織中高表達(dá),可能與甲基化后染色體穩(wěn)定性受損、促癌基因的表達(dá)、腫瘤微環(huán)境調(diào)節(jié)和遺傳穩(wěn)定性失去平衡等,導(dǎo)致細(xì)胞增值失控。RASSF1A基因,Ras 相關(guān)區(qū)域家族蛋白1A(ras-association donmain family,RASSF1A)是1 種新型的腫瘤抑制基因,在腫瘤生長(zhǎng)過程中起著很重要抑制作用,參與了許多靶基因的調(diào)控,如基因轉(zhuǎn)錄、信號(hào)轉(zhuǎn)錄、細(xì)胞骨架、細(xì)胞周期和凋亡。研究發(fā)現(xiàn)細(xì)胞癌變是由于啟動(dòng)子區(qū)異常高甲基化、雜合性缺失及染色體缺失等導(dǎo)致了RASSF1A 基因失活[4],從而導(dǎo)致腫瘤細(xì)胞增值。SHOX2 甲基化能較好的區(qū)分肺部良、惡性病變[15]。本研究通過收集肺部結(jié)節(jié)或腫塊患者肺泡灌洗液,進(jìn)行SHOX2 及RASSF1A 基因甲基化PCR 檢測(cè),通過病檢得到肺結(jié)節(jié)性質(zhì)對(duì)2 基因結(jié)果統(tǒng)計(jì)分析,結(jié)果顯示SHOX2、RASSF1A 基因聯(lián)合對(duì)肺癌診斷的靈敏度為84%,特異度為89.8%,進(jìn)一步進(jìn)行多因素回歸分析發(fā)現(xiàn)在排除吸煙及年齡影響后,2 基因甲基化陽(yáng)性對(duì)早期肺癌仍有較高的診斷效能,可以作為肺癌獨(dú)立危險(xiǎn)因素,與肺泡灌洗液細(xì)胞學(xué)檢測(cè)相比,可為臨床上提供有效補(bǔ)充工具,避免了患者不必要的精神、身體損害。
此外,國(guó)內(nèi)研究表明[16],肺癌的病理類型與基因甲基化陽(yáng)性檢出率有顯著相關(guān)性;此外Schmidt 等[17]對(duì)肺癌患者的血液和肺組織進(jìn)行SHOX2 甲基化研究,發(fā)現(xiàn)SHOX2 基因甲基化對(duì)癌癥有很高檢出率,可以作為早期檢測(cè)指標(biāo),還可以獨(dú)立的預(yù)測(cè)非小細(xì)胞肺癌臨床預(yù)后。在本研究中,SHOX2、RASSF1A 基因甲基化在肺癌分類中發(fā)現(xiàn)肺腺癌(23 例)、肺鱗癌(14 例)、肺腺鱗癌(2)任意陽(yáng)性檢出率分別為91%、86%、50%,說明在肺癌早期的肺結(jié)節(jié)、腫塊時(shí),2 基因?qū)Ψ蜗?、鱗癌檢出敏感性極高(由于肺大、小細(xì)胞癌病例數(shù)少,僅1 例,不具有統(tǒng)計(jì)意義),對(duì)比了相關(guān)研究[18]結(jié)果,在NSCLC 中,腺癌中RASSF1A 的甲基化頻率高于鱗狀細(xì)胞癌,與本研究結(jié)果是一致的。這種現(xiàn)象可能與SHOX2 和RASSF1A 基因甲基化在肺腺癌和肺鱗狀細(xì)胞癌中的高表達(dá)增高了肺惡性腫瘤的檢出。
對(duì)開始拒絕行肺穿刺活檢及手術(shù)病檢的2 例患者,在1 a 內(nèi)行電話隨訪、約定隨訪復(fù)查,復(fù)查胸部CT 后有1 例患者病情惡化,經(jīng)病理檢測(cè)診斷為肺癌;另1 例肺結(jié)節(jié)患者中,BALF 中SHOX2 和RASSF1A 基因甲基化均陽(yáng)性,經(jīng)治療后肺部結(jié)節(jié)吸收,考慮為肺部炎癥,該例是否因其它疾病導(dǎo)致基因發(fā)生了甲基化,進(jìn)一步查閱大量資料對(duì)導(dǎo)致該現(xiàn)象進(jìn)行分析并對(duì)該患者持續(xù)進(jìn)行隨訪中。
本研究不足之處:(1)于周圍型肺小結(jié)節(jié)患者在留取BALF 時(shí),有發(fā)生灌洗液中難以對(duì)結(jié)節(jié)部位進(jìn)行基因標(biāo)本獲取,從而導(dǎo)致一定假陰性結(jié)果可能性,這對(duì)操作者的支氣管鏡檢查技術(shù)帶來考驗(yàn),且在一定程度取決于患者配合程度;(2)不能短時(shí)間內(nèi)獲取全部肺結(jié)節(jié)、腫塊患者的全部臨床病理數(shù)據(jù),導(dǎo)致部分失聯(lián)患者數(shù)據(jù)缺失,影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
綜上所述,對(duì)肺癌早期對(duì)肺部結(jié)節(jié)、腫塊性質(zhì)不能有效診斷時(shí),SHOX2 和RASSF1A 基因甲基化可以作為有效的補(bǔ)充工具,提高早期肺癌的檢出,并且對(duì)肺腺癌、肺鱗癌診斷提供一定診斷依據(jù)。
昆明醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)2024年3期