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        生物信息材料學再探

        2024-02-24 00:00:00董福田
        現(xiàn)代鹽化工 2024年3期
        關(guān)鍵詞:全集子集扶正

        摘要:通過建立數(shù)學公式來描述結(jié)構(gòu)信息與所調(diào)節(jié)基因表達合成的結(jié)構(gòu)之間的關(guān)系,即信息與物質(zhì)通過生物自身結(jié)構(gòu)系統(tǒng)的轉(zhuǎn)化關(guān)系,從而研發(fā)用于治療疾病的藥物、預(yù)防保健的功能食品,維護健康的化妝品、日用品等領(lǐng)域的生物信息材料。研發(fā)的生物信息材料在治療漸凍癥這種病因不明的致死性罕見病上已經(jīng)得到應(yīng)用,改善了NfL指標和漸凍癥的典型癥狀。

        關(guān)鍵詞:生物信息材料學;物質(zhì)與信息轉(zhuǎn)化;扶正;全集;子集;中醫(yī)食療;漸凍癥

        生物信息材料學是融合醫(yī)學、信息學、材料學等多個學科的一門交叉學科,筆者在“生物信息材料學初探”一文中提出了生物通過識別設(shè)計加工而成的材料中的結(jié)構(gòu)信息[1],從而調(diào)節(jié)基因表達的理論和方法。如何在病因不明的情況下進行有效治療,是罕見病以及各種疑難雜癥患者面臨的非常急迫的問題。研發(fā)通過調(diào)動人體自身的調(diào)節(jié)功能,定向調(diào)節(jié)人體某個組織、器官恢復(fù)平衡,實現(xiàn)自愈的生物信息材料,是解決該問題的關(guān)鍵?;窘鉀Q思路是:首先研制能實現(xiàn)對人體單個結(jié)構(gòu)進行精準調(diào)節(jié)從而恢復(fù)平衡的生物信息材料,然后在此基礎(chǔ)上開發(fā)出調(diào)節(jié)人體組織、器官所包含的各種結(jié)構(gòu)使之恢復(fù)平衡的生物信息材料。

        1信息與物質(zhì)之間的轉(zhuǎn)化

        宇宙由物質(zhì)、能量、信息構(gòu)成。物質(zhì)屬于具體結(jié)構(gòu),能量則屬于抽象結(jié)構(gòu),而信息屬于更加抽象的結(jié)構(gòu)。結(jié)構(gòu)系統(tǒng)的演化就是在動態(tài)平衡的基礎(chǔ)上構(gòu)建新的動態(tài)平衡,具體結(jié)構(gòu)和抽象結(jié)構(gòu)相互作用,構(gòu)成了動態(tài)平衡的結(jié)構(gòu)系統(tǒng),具有了自適應(yīng)、自組織、保持自身動態(tài)平衡的功能[2]。生物信息材料學的目標是研究通過生物自身的自適應(yīng)、自組織、構(gòu)建動態(tài)平衡的功能,調(diào)節(jié)自身結(jié)構(gòu)的理論和方法,進而研制可以恢復(fù)和維持生物健康的功能性材料。實現(xiàn)該目標的第一步是研制出能對人體單個結(jié)構(gòu)進行調(diào)節(jié)的生物信息材料。

        生物學認為,生物是一種可以保持動態(tài)平衡的化學系統(tǒng),不但體內(nèi)自有的所有結(jié)構(gòu)可以動態(tài)調(diào)節(jié),而且還能生成調(diào)節(jié)外部結(jié)構(gòu)的物質(zhì)。在生物自身的結(jié)構(gòu)系統(tǒng)中,每個結(jié)構(gòu)的量是可以調(diào)節(jié)的,既可以升高也可以降低,具體是升高還是降低,要根據(jù)生物結(jié)構(gòu)系統(tǒng)維護動態(tài)平衡的需要來決定。假設(shè)某個結(jié)構(gòu)a是生物結(jié)構(gòu)系統(tǒng)自身的結(jié)構(gòu),那么就存在促進它的結(jié)構(gòu)和制約它的結(jié)構(gòu),a如果過高就需要制約的結(jié)構(gòu)來降低它,如果過低就需要促進的結(jié)構(gòu)來提高它;而當a是生物自身結(jié)構(gòu)系統(tǒng)之外的結(jié)構(gòu)時,在生物識別了該結(jié)構(gòu)的信息后,如果生物自身并沒有制約它的結(jié)構(gòu),那么為了維持其結(jié)構(gòu)系統(tǒng)的動態(tài)平衡,就會生成制約它的結(jié)構(gòu)。因此當人體識別滅活疫苗的結(jié)構(gòu)信息后,雖然滅活疫苗并不會攻擊人體,但因為機體不需要滅活疫苗這種結(jié)構(gòu),就會生成相應(yīng)的制約性結(jié)構(gòu)——抗體,此后一旦這種結(jié)構(gòu)進入人體,就可以通過抗體將其調(diào)節(jié)到最低,以維護機體的動態(tài)平衡??梢杂脭?shù)學公式來描述信息與物質(zhì)之間的轉(zhuǎn)化關(guān)系:r=f(ai)。其中f為基因表達,ai為結(jié)構(gòu)a的結(jié)構(gòu)信息,r是基因表達f合成的結(jié)構(gòu),而f這個基因表達是由生物結(jié)構(gòu)系統(tǒng)所具有的自適應(yīng)、自組織、保持動態(tài)平衡的特性所決定,r與a的結(jié)構(gòu)相互作用而調(diào)節(jié)a的結(jié)構(gòu),有助于保持機體的動態(tài)平衡。因此,當生物識別了大量a的結(jié)構(gòu)信息后,為了保持生物自身結(jié)構(gòu)系統(tǒng)的動態(tài)平衡,就需要調(diào)高制約a結(jié)構(gòu)的基因表達,合成足夠可以制約a的結(jié)構(gòu)。在這種情況下,在公式r=f(ai)中,r就是制約a的結(jié)構(gòu)。

        a的結(jié)構(gòu)信息ai可以向物質(zhì)r轉(zhuǎn)化,而r的結(jié)構(gòu)信息也可以調(diào)節(jié)與r相互作用的其他結(jié)構(gòu)的合成,即信息與物質(zhì)之間可以相互轉(zhuǎn)化,也就是抽象結(jié)構(gòu)與具體結(jié)構(gòu)之間的轉(zhuǎn)化。因為生物具有自適應(yīng)、自組織、保持動態(tài)平衡的功能,所以能夠通過生物的結(jié)構(gòu)系統(tǒng)實現(xiàn)信息與物質(zhì)的轉(zhuǎn)化,達到生物信息材料的設(shè)計目標,同時生物本身也是在抽象結(jié)構(gòu)與具體結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)化的過程中,具有了自適應(yīng)、自組織、保持動態(tài)平衡的特性。

        2生物信息材料

        根據(jù)不同的情況和用途,可以通過r=f(ai)揭示的信息與物質(zhì)轉(zhuǎn)化的原理,研制不同的生物信息材料。

        2.1從疾病的角度研制生物信息材料

        當明確引起生物疾病的結(jié)構(gòu)x,而且只是研制治療x所引起疾病的生物信息材料時,如果x所引起的疾病是因為x過多造成的,而且制約x的結(jié)構(gòu)是生物基因表達能夠合成的,則可以用x作為原料加工治療x所引起疾病的生物信息材料,這種情況下的x等同于r=f(ai)公式中的a;如果x所引起的疾病是因為x過低造成的,而且x是可以由生物的基因表達合成,則用x所制約的結(jié)構(gòu)作為原料加工治療x所引起疾病的生物信息材料,這種情況下的x等同于r=f(ai)公式中的r。

        下面以乳糖不耐受為例,來論述上述兩種情況下如何研制治療乳糖不耐受的生物信息材料。乳糖不耐受是由于乳糖酶分泌少,不能完全消化分解母乳或牛乳中的乳糖所引起的非感染性腹瀉,又稱乳糖酶缺乏癥[3]。乳糖酶缺乏是廣泛存在的世界性問題,以乳汁為主要飲食的新生兒及嬰幼兒中常發(fā)生腹瀉等癥狀。母乳和牛乳中的糖類主要是乳糖,如果小腸尤其是空腸黏膜表面絨毛的頂端乳糖酶分泌量減少,就不能完全消化和分解乳汁中的乳糖,未被消化的乳糖進入結(jié)腸后被腸菌群酵解成氫氣、甲烷和二氧化碳,以及短鏈脂肪酸等,大量氣體引起腹脹等癥狀,而未被消化的乳糖及其發(fā)酵產(chǎn)物使得腸道內(nèi)滲透壓升高,流入腸道的水分增加,引起腹瀉癥狀,稱為乳糖不耐受[45]。

        如果從結(jié)構(gòu)過多引起生物結(jié)構(gòu)系統(tǒng)失衡形成疾病的角度分析,生物體內(nèi)乳糖過多引起的生物結(jié)構(gòu)系統(tǒng)失衡,形成了乳糖不耐受癥狀。如果讓人體的結(jié)構(gòu)系統(tǒng)識別大量的乳糖結(jié)構(gòu)信息,人體結(jié)構(gòu)系統(tǒng)為了保持動態(tài)平衡,就需要更多能降低乳糖含量的結(jié)構(gòu),也就是提高能降低乳糖含量結(jié)構(gòu)的基因表達,達到治療乳糖不耐受的目的,因此就用乳糖來加工治療乳糖不耐受的生物信息材料。

        如果從結(jié)構(gòu)過低引起生物結(jié)構(gòu)系統(tǒng)失衡形成疾病的角度分析,是生物體內(nèi)乳糖酶缺乏不能將攝入人體的乳糖完全消化和分解,從而形成了乳糖不耐受。乳糖酶所制約的結(jié)構(gòu)是乳糖,那么就讓人體的結(jié)構(gòu)系統(tǒng)識別大量的乳糖酶所制約的結(jié)構(gòu)信息,也就是乳糖的結(jié)構(gòu)信息,人體結(jié)構(gòu)系統(tǒng)為了保持動態(tài)平衡,就會調(diào)高制約乳糖結(jié)構(gòu)的基因表達,也就是合成乳糖酶的基因表達,達到治療乳糖不耐受的目的,因此就用乳糖來加工治療乳糖不耐受的生物信息材料。

        綜上所述,公式r=f(ai)中r與a的關(guān)系是r制約a,對于生物而言,a過多引起生物結(jié)構(gòu)系統(tǒng)失衡,是由于生物自身r不足造成的,解決方法是提高合成r的基因表達,即讓生物識別一定量a的結(jié)構(gòu)信息ai。

        2.2從健康的角度研制生物信息材料

        如果一個結(jié)構(gòu)系統(tǒng)中存在多種結(jié)構(gòu)會引起生物結(jié)構(gòu)系統(tǒng)的失衡,比如牛奶中既包含可以引起消化系統(tǒng)疾?。ㄈ樘遣荒褪埽┑娜樘?,也包含幾十種可以引起免疫系統(tǒng)疾?。ㄟ^敏)的蛋白質(zhì),而具體會引起哪種疾病又因人而異;再比如人體器官的結(jié)構(gòu)系統(tǒng),不同的結(jié)構(gòu)失衡會產(chǎn)生不同的疾病,那么如何在不知道結(jié)構(gòu)系統(tǒng)中具體哪些結(jié)構(gòu)引起失衡的情況下,研究出可以調(diào)節(jié)這個結(jié)構(gòu)系統(tǒng)恢復(fù)平衡的生物信息材料?

        如果把一個結(jié)構(gòu)系統(tǒng)稱之為全集,則這個結(jié)構(gòu)系統(tǒng)中引起疾病的結(jié)構(gòu)就是全集的子集,從全集的角度研制生物信息材料,就是從健康的角度研制生物信息材料。

        針對人體外部結(jié)構(gòu)引起的疾病,仍以牛奶為例,不區(qū)分到底是牛奶中的什么具體結(jié)構(gòu)引起了人體失衡,而是讓人體識別牛奶所有結(jié)構(gòu)的結(jié)構(gòu)信息構(gòu)建平衡,即把全集作為機體識別結(jié)構(gòu)信息的對象,就不需要確定具體是牛奶的哪種結(jié)構(gòu)引起何種疾病了,也就無須考慮個體差異,使維護健康變得更加簡單。

        針對人體內(nèi)部結(jié)構(gòu)失衡引起的疾病,比如高血壓、糖尿病,甚至不清楚病因的各種疑難雜癥,如何在不清楚病因的前提下也能研制出恢復(fù)健康的生物信息材料?這首先需要利用中醫(yī)相生相克的理論結(jié)合數(shù)學為人體的各個組織、器官建立動態(tài)平衡的健康模型。假設(shè)健康的組織或者器官所包含的結(jié)構(gòu)為全集,用R來表示,R包括的結(jié)構(gòu)用R(y1,y2,…,ym)來表示。將與全集R所包含的結(jié)構(gòu)具有生、克關(guān)系的結(jié)構(gòu)分析計算出來,計算得到的這些結(jié)構(gòu)用Q來表示,Q包括的結(jié)構(gòu)用Q(x1,x2,…,xn)來表示,Q的特異性結(jié)構(gòu)信息為Qs。通過人體的自我調(diào)節(jié)功能調(diào)節(jié)相應(yīng)的組織或者器官恢復(fù)平衡,則公式r=f(ai)轉(zhuǎn)化為R=F(Qs),F(xiàn)代表合成R的一組基因的表達。一個組織或者器官不同的結(jié)構(gòu)失衡,會產(chǎn)生不同的疾病,但所有失衡的結(jié)構(gòu)都是其全集的子集,從全集的角度研制生物信息材料,并用這種生物信息材料對機體進行調(diào)節(jié),可以在不知道病因的情況下進行有效治療,這就是從健康的角度恢復(fù)健康,從而建立研制用于大健康領(lǐng)域的生物信息材料的理論和方法。

        3實踐應(yīng)用及總結(jié)

        為了驗證上述理論和方法的有效性,筆者針對肌萎縮側(cè)索硬化癥(Amyotrophic Lateral Sclerosis,ALS),使用從健康角度研制的生物信息材料,觀測該病患者神經(jīng)絲輕鏈蛋白(NfL)和臨床癥狀的改善效果。ALS是一類運動神經(jīng)元受到損害,進行性出現(xiàn)變性壞死,從而造成人體運動功能喪失的疾病,包括說話困難、吞咽困難、嗆咳、呼吸困難等典型癥狀[6]。該疾病異質(zhì)性強,發(fā)病機制不明確,缺乏有效的治療藥物,患者通常在起病3~5年后死于呼吸肌麻痹、呼吸衰竭[7]。醫(yī)學研究表明,漸凍癥患者的神經(jīng)元生存環(huán)境惡化,導(dǎo)致神經(jīng)元失去正常死亡與修復(fù)的平衡,而正常的神經(jīng)細胞需要良好的環(huán)境才能存活[8]。NfL是評估神經(jīng)元損害的關(guān)鍵生物標志物,其水平升高可反映神經(jīng)元的損傷和死亡,在肌萎縮側(cè)索硬化癥、阿爾茨海默病、帕金森病以及多發(fā)性硬化等神經(jīng)系統(tǒng)變性疾病患者的外周血及腦脊液標本中,該指標水平均異常升高[910]。

        南京師范大學國家健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)研究院成立了“漸凍癥中醫(yī)食療”課題組,從健康的角度研制中樞神經(jīng)系統(tǒng)、免疫系統(tǒng)、心、肝、脾、肺、腎、肌肉、腸、胃“以正扶正”的生物信息材料,對患者進行綜合調(diào)理。課題組自2023年10月開始,第一批收集ALS患者28例;自2024年1月開始,第二批收集ALS患者54例并隨機分為兩組,其中免疫+中樞調(diào)理組26人,綜合調(diào)理組28人。課題組對兩批患者采用自身前后對照法,觀察食療扶正后,患者NfL指標的變化和癥狀改善情況。結(jié)果表明:①第一批患者調(diào)理前NfL水平為(66.88±42.41)pg/mL,第1期綜合調(diào)理后NfL水平為(56.78±33.51)pg/mL,指標顯著下降(Plt;0.05)。第2、3期停止調(diào)理中樞神經(jīng)系統(tǒng)與免疫系統(tǒng)后,癥狀出現(xiàn)反復(fù),但NfL水平為(51.31±28.02)pg/mL,持續(xù)下降(Plt;0.05)。第4期重新調(diào)理中樞神經(jīng)系統(tǒng)與免疫系統(tǒng),患者癥狀繼續(xù)改善。②第二批患者中,免疫+中樞調(diào)理組調(diào)理前NfL水平為(63.66±30.42)pg/mL,第1期調(diào)理后的NfL水平為(66.27±42.65)pg/mL,無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。綜合調(diào)理組調(diào)理前NfL水平為(55.67±33.90)pg/mL,第1期調(diào)理后的NfL水平46.44±27.29為pg/mL,指標顯著降低(Plt;0.05)。兩組患者在典型癥狀改善方面沒有明顯差異。

        由此可得出結(jié)論,NfL水平與神經(jīng)元細胞的生存環(huán)境有關(guān),綜合調(diào)理可以改善神經(jīng)元細胞的生存環(huán)境,降低中樞神經(jīng)系統(tǒng)軸突損傷,有效改善NfL指標;漸凍癥典型癥狀和神經(jīng)元本身變性有關(guān),通過針對中樞神經(jīng)研制的生物信息材料調(diào)理中樞神經(jīng),可以改善漸凍癥典型癥狀。

        以上概述了生物信息材料學的理論、方法和初步實踐應(yīng)用。生物信息材料可以用于醫(yī)藥、功能食品、化妝品等領(lǐng)域,未來還可以延伸至日用品方面,涉及人類生活的方方面面,可以有效地維護生命健康,從而為醫(yī)藥健康事業(yè)做出更大貢獻。

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