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        從江香豬與長白豬血清代謝組學比較分析

        2024-02-09 00:00:00楊家大張歡陳慶羅洪亞楊康
        凱里學院學報 2024年6期
        關鍵詞:血清差異分析

        摘 要:

        本研究采用非靶向代謝組學技術,分析了從江香豬與長白豬的血清代謝組學差異,以探討代謝差異對其肉質特性和生理功能的影響.通過主成分分析和正交偏最小二乘法,揭示了兩者在代謝物組成上的顯著差異,發(fā)現(xiàn)遺傳背景和飼養(yǎng)條件對代謝活動的影響顯著.通過對篩選出的163種差異代謝物的富集分析,發(fā)現(xiàn)與長白豬相比從江香豬在脂質代謝(亞油酸代謝和初級膽汁酸生物合成)等關鍵通路中表現(xiàn)出亞油酸、13-L-過氧化氫亞油酸的上調和3α,7α-二羥基丙烷酸、糞甾烷酸的下調.研究結果可為了解豬肉品質差異提供代謝基礎,并為提高豬肉品質和制定精準飼養(yǎng)策略提供科學依據(jù).

        關鍵詞:

        從江香豬;長白豬;代謝組學;脂質代謝

        中圖分類號:Q95 "文獻標識碼:A "文章編號:1673-9329(2024)06-0010-05

        在畜牧養(yǎng)殖業(yè)中,豬肉的品質會受到遺傳背景、飼養(yǎng)環(huán)境以及代謝活動等多種因素的影響[1].近年來,隨著消費者對高品質豬肉的需求日益增加,研究不同豬種的代謝差異及其對肉質特性的影響成為改善豬肉品質和優(yōu)化飼養(yǎng)策略的重要手段[2].

        代謝組學作為系統(tǒng)生物學的一部分,通過分析生物體內小分子代謝產物的整體變化,能夠深入揭示不同基因型個體間的生理和病理差異[3].在豬的營養(yǎng)與代謝研究中,血液代謝組學被廣泛用于探索不同飼養(yǎng)條件、遺傳背景及環(huán)境因素對豬體內代謝過程的影響[4-6].

        從江香豬以其細膩的肌肉纖維、獨特的風味和較高的脂肪含量而著稱[7-8],長白豬則以瘦肉率高和生長迅速為特點[9].通過對這兩種豬的血清代謝組學進行比較分析,可以揭示其代謝活動的差異,并進一步探討這些代謝差異對肉質形成及生理功能的潛在影響.

        本研究利用非靶向代謝組學方法,分析從江香豬與長白豬的血清代謝物組成,探討兩者在代謝路徑和差異代謝物上的具體表現(xiàn),為豬肉品質的改善和制定精準飼養(yǎng)策略提供科學依據(jù).

        1 實驗材料、儀器與試劑

        1.1實驗材料

        本實驗選取12月齡的長白豬(LAN組)和從江香豬(CX組)各10頭作為實驗動物,各組內動物性別均為公豬,體重相近,均飼喂熟食(熟食以玉米、米糠、瓜果蔬菜等為主).所有采樣的豬個體均攝食正常,處于健康狀態(tài).

        1.2實驗儀器與試劑

        實驗儀器包括超純水純化系統(tǒng)(Flex3,ELGA LabWater)、4℃醫(yī)用低溫冰箱(HYC-290,海爾)、-80℃超低溫冰箱(902,Thermo Fisher Scientific)、超高效液相色譜-質譜聯(lián)用儀(UltiMate 3000 Q-Exactive Focus,Thermo Fisher Scientific)、電子分析天平(CP224C,上海奧豪斯儀器)、高速低溫離心機(5810R,Eppendorf)、渦旋儀(SCI-VS,賽洛捷克)、冰浴超聲機(JP-L70C,上海繼譜電子)、氮吹儀(BYN100-3,上海秉越電子儀器)和移液器(2.5-5000 μL,Eppendorf).實驗試劑為甲醇(色譜級,Thermo Fisher Scientific公司).

        2實驗方法

        2.1血清的采集和處理

        用采血管采集血樣后顛倒搖勻,傾斜靜置1 h后,3500 r/min離心15 min,使用移液槍分裝300 μL血清于1.5 mL無菌無酶EP中,置于液氮中速凍淬滅,轉移至-80℃冰箱中保存.

        2.2血清樣品提取

        收集的20個血清樣本按照文獻[10]描述的方法并稍作修改進行處理.具體步驟如下:樣品解凍后,渦旋2 min使其充分均質,每組血清樣本取200 μL于無菌無酶EP管中,加入800 μL甲醇除去蛋白,渦旋2 min,14 500 rpm,4℃,離心15 min.取上清液1 000 μL,真空離心3 h,后面常溫下氮氣吹干.吹干后再加入200 μL甲醇(色譜級)∶超純水=1∶1復溶,渦旋2 min,冰浴超聲15 min,隨后14 500 rpm,4℃,離心15 min.轉移溶液用0.22 μm濾膜過濾置于進樣瓶(帶有內襯管)中,-80℃儲藏,待測.

        2.3質控(QC)樣本制備

        為了獲得可靠的數(shù)據(jù),在實驗過程中需利用QC樣本來評估儀器系統(tǒng)的穩(wěn)定性.每個血清樣本取50 μL于1.5 mL無菌無酶EP中,混合均勻后經上步處理過程提取,得到QC樣本.每4個樣本中插入1個QC樣本,以確保結果的重復性.

        2.4上機檢測

        使用賽默飛(Thermo Fisher Scientific)的UPLC-Orbitrap-MS/MS系統(tǒng)(Q-Exactive Focus, 美國)作為非靶向代謝組學檢測方法,檢測血清樣本的代謝譜[11].

        2.5數(shù)據(jù)分析

        原始數(shù)據(jù)通過Compound Discoverer 2.1軟件(賽默飛,美國)進行處理,以生成包含保留時間(RT)、質荷比(m/z)和峰強度的數(shù)據(jù)矩陣.相對標準偏差(RSD)大于30%的代謝特征被排除在分析之外.隨后,在mzCloud和mzVault數(shù)據(jù)庫中搜索以識別代謝物.使用SIMCA-P 14.1軟件(Umetrics,Umea,Sweden)進行主成分分析(PCA)和正交偏最小二乘判別分析(OPLS-DA).執(zhí)行響應置換檢驗(RPT),以評估OPLS-DA模型的準確性.此外,在OPLS-DA模型中計算了變量投影重要性(VIP)值,P值則采用獨立樣本t檢驗計算.以VIPgt;1和Plt;0.05及差異倍數(shù)FCgt;2或FClt;0.5的標準篩選差異代謝物.使用KEGG數(shù)據(jù)庫對差異代謝物進行功能注釋,并利用MetaboAnalyst 6.0(https://www.metaboanalyst.ca)將其映射到KEGG數(shù)據(jù)庫中查找差異代謝通路.

        3實驗結果與分析

        3.1 從江香豬與長白豬血清代謝物多元變量分析

        采用非靶向代謝組學技術在血清樣本中檢測到684種代謝產物,使用主成分分析PCA圖評估了QC樣品的聚類(圖1).PCA圖顯示QC聚類緊密,表明檢測過程中分析條件穩(wěn)定,重復性好.圖1顯示從江香豬(CX)和長白豬(LAN)分別在坐標軸的兩側,兩者明顯分開,說明兩組之間代謝物存在明顯的不同.

        為了進一步將兩者更好地區(qū)分開來,找到潛在的差異代謝物,又采用了正交偏最小二乘法(OPLS-DA)將樣本歸類分析,由圖2a可知,CX和LAN組內代謝物存在明顯差異.R2Y和Q2的累積值分別為0.999和0.902,說明了模型的穩(wěn)定性和可靠性.此外,使用Permutation測試(RPT)方法評估模型的準確度.如圖2b所示,R2=(0.0,0.973)和Q2=(0.0,-0.156)的值表明OPLS-DA模型具有良好的準確性.

        3.2 差異代謝物篩選

        如圖3所示,使用VIPgt;1(277種代謝物)和Plt;0.05(169種代謝物)及FCgt;2或FClt;0.5(182種代謝物)的標準篩選出CX和LAN組之間的差異代謝物,共確認了163種血清代謝物有明顯差異.

        3.3 差異代謝物代謝通路的分析

        根據(jù)以上差異代謝物映射到KEGG數(shù)據(jù)庫中進行代謝富集分析,將差異代謝通路選出來,對這些代謝通路和差異代謝物進行相關性分析.如圖4所示,主要參與了4種代謝通路,亞油酸代謝、初級膽汁酸生物合成、酪氨酸代謝和嘌呤代謝,其中影響最明顯的是脂質代謝中的亞油酸代謝和初級膽汁酸生物合成.

        與LAN組相比,CX組在這兩條代謝通路檢測到血清亞油酸、13-L-過氧化氫亞油酸和甘氨酸脫氧膽酸上調,3α,7α-二羥基丙烷酸和糞甾烷酸下調(表1).

        4 討論

        本研究通過比較從江香豬與長白豬的血清代謝組學,揭示了兩者在代謝物組成上的顯著差異,進一步闡明了這些差異在其肉質特性和生理功能上的潛在影響.隨著消費者對高品質和健康豬肉需求的增加,這一研究不僅具有理論價值,還為養(yǎng)殖業(yè)提高豬肉品質提供了科學依據(jù).

        PCA和OPLS-DA模型均顯示了兩組豬之間明顯的代謝差異,這表明基于遺傳背景和飼養(yǎng)環(huán)境的差異導致了其體內代謝活動的不同[6].從江香豬以其優(yōu)質的肉質和獨特的風味著稱,而長白豬則以生長速度快和瘦肉率高為優(yōu)勢,本研究結果對這些表型特征背后的代謝基礎進行了探討.

        代謝通路的富集分析表明,從江香豬和長白豬的差異主要集中在脂質代謝和氨基酸代謝等關鍵生理過程.例如,在亞油酸代謝和初級膽汁酸生物合成中,從江香豬表現(xiàn)出亞油酸、13-L-過氧化氫亞油酸等關鍵代謝物的上調,這可能與其較高的肉質風味及脂肪含量相關[12];而長白豬則顯示出更高的3α,7α-二羥基丙烷酸和糞甾烷酸,這可能與其較高的瘦肉率和較快的生長速度相關[13].通過代謝物的調控,可以有針對性地開發(fā)具有特殊風味的豬肉產品以滿足不同消費者的需求,亞油酸和膽汁酸代謝的調控可為設計更健康的豬肉產品提供新的營養(yǎng)策略.

        綜上所述,本研究通過比較從江香豬與長白豬的血清代謝組學,揭示了兩者在脂質代謝方面的顯著差異,進一步的研究可以結合基因組學和蛋白質組學數(shù)據(jù),全面解析其肉質特性形成的分子機制,從而為豬肉產業(yè)的高效生產和品質提升提供更多的科學支持.

        參考文獻:

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        [責任編輯:劉紅霞]

        Comparative Analysis of Serum Metabolomics between Congjiang Xiang and Landrace Pigs

        YANG Jiada, ZHANG Huan, CHEN Qing, LUO Hongya, YANG Kang

        (Kaili University, Kaili, Guizhou, 556011, China)

        Abstract:

        The study used untargeted metabolomics technology to compare the serum metabolomics differences between Congjiang Xiang (CX) and Landrace (LAN) pigs, aiming to explore the impact of metabolic differences onmeat quality and physiological functions. Principal Component Analysis and Orthogonal Partial Least Squares-Discriminant Analysis revealed significant differences in metabolite composition, indicating a notable influence of genetic background and feeding conditions on metabolic activity. Enrichment analysis of 163 significantly different metabolites showed that compared to LAN, CX exhibited upregulation in key pathways such as lipid metabolism (linoleic acid metabolism and primary bile acid biosynthesis), including linoleic acid and 13-L-hydroperoxy linoleic acid, with downregulation of 3α,7α-dihydroxypropanoic acid and coprostanic acid. These findings provide a metabolic basis for understanding differences in pork quality and offer scientific evidence for improving pork quality and developing precise feeding strategies.

        Key words:

        Congjiang Xiang pig; Landrace pig; metabolomics; lipid metabolism

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