陶菊紅,李亞娟,季向東,張 濤
(1.常熟市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所,江蘇 常熟 215500; 2.常熟理工學(xué)院端木銀熙水稻育種研究推廣中心,江蘇 常熟 215500; 3.常熟市農(nóng)業(yè)技術(shù)推廣中心,江蘇 常熟 215500)
水稻是世界上最重要的糧食作物之一,然而,水稻生產(chǎn)受到稻瘟病(rice blast)、紋章枯萎病(sheath blight)、白葉枯病(bacterial blight)和病毒性疾病等各種疾病的制約[1],其中稻瘟菌引起的稻瘟病是影響水稻可持續(xù)生產(chǎn)最致命的疾病之一[2]。全世界超過85個(gè)國家發(fā)現(xiàn)有稻瘟病菌危害,每年因稻瘟病而造成了全球約30%的水稻產(chǎn)量損失,相當(dāng)于可以養(yǎng)活6000萬人[3-4]。
稻瘟菌是一種子囊菌真菌,病變主要發(fā)生在葉領(lǐng)、莖稈、莖稈節(jié)、穗頸節(jié),嚴(yán)重影響水稻產(chǎn)量和品質(zhì)[5-7]。對孟加拉國3個(gè)芳香水稻品種穗頸瘟感染的研究顯示籽粒不育率提高,籽粒大小和產(chǎn)量下降,而且種子產(chǎn)量和質(zhì)量的下降程度與感染病菌的嚴(yán)重程度呈正相關(guān)[8]。育種過程中,抗性水稻品種的選育和栽培是控制稻瘟病菌感染和穩(wěn)定產(chǎn)量最有效方法[9],比如中國水稻研究所應(yīng)用分子標(biāo)記輔助篩選技術(shù)將Pita、Pib和Pid2導(dǎo)入高感品種鹽豐47中,選育出高抗品種鹽粳144,其產(chǎn)量和外觀品質(zhì)明顯提高[10]。盡管稻瘟病菌感染會危害水稻產(chǎn)量已經(jīng)成為共識,且科學(xué)家們利用現(xiàn)代分子育種手段導(dǎo)入稻瘟病抗性基因改良優(yōu)良水稻種質(zhì)資源的經(jīng)驗(yàn)逐漸成熟,但稻瘟病菌對大米品質(zhì)尤其是食味品質(zhì)的影響報(bào)道較少。
常香粳1813是優(yōu)良食味中熟晚粳,是常熟市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所2020年通過江蘇省審定品種,具有良好的應(yīng)用前景。本研究通過對常香粳1813基因組稻瘟病抗性基因鑒定,并對其孕穗期幼穗進(jìn)行稻瘟病菌接種試驗(yàn),檢測成熟期種子千粒重、長寬比,以及大米加工品質(zhì)、食味品質(zhì)各參數(shù)變化情況,分析稻瘟病菌感染對種子生產(chǎn)和大米品質(zhì)的影響,進(jìn)而為抗病育種和優(yōu)質(zhì)稻米品種的選育和推廣提供數(shù)據(jù)參考。
本研究所用的種質(zhì)材料為常香粳1813,是常熟市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所選育品種,對照組和試驗(yàn)組于2022年種植于常熟市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所水稻育種創(chuàng)新基地,統(tǒng)一水肥管理。
為了研究稻瘟病菌感染后對種子產(chǎn)量和大米品質(zhì)的影響,對孕穗期的常香粳1813進(jìn)行了稻瘟病菌(江蘇省內(nèi)稻瘟病菌優(yōu)勢小種的代表菌株混合液)接種試驗(yàn)。接種后50 d,空白對照組種子成熟。收取試驗(yàn)組(接種稻瘟病菌)和空白對照組葉片、稻穗進(jìn)行觀察以及種子千粒重、長、寬等參數(shù)分析;隨后對試驗(yàn)組和對照組谷粒進(jìn)行了糙米、精米加工,對兩者糙米率、整精米率、堊白率、堊白度等相關(guān)參數(shù)進(jìn)行了分析;最后檢測了試驗(yàn)組和對照組大米的總蛋白、總脂肪、總淀粉和直鏈淀粉的含量,探索稻瘟病感染對常香粳1813大米食味的影響。
用常香粳1813的幼苗進(jìn)行了全基因組測序(安諾基因,北京),開展了生物信息學(xué)分析,對其所有基因進(jìn)行了組裝和基因注釋(烈冰生物,上海)。
常香粳1813試驗(yàn)組和對照組稻瘟病菌接種和抗性評價(jià)方法參考文獻(xiàn)[11]。
谷粒千粒重、長、寬、長寬比均通過SC-G型考種及千粒重自動分析儀(萬深,杭州)進(jìn)行測定,每個(gè)測定重復(fù)5組。
利用大米外觀品質(zhì)檢測分析儀(萬深,杭州)分析大米的外觀品質(zhì)和加工品質(zhì),包括長寬比、堊白粒率、堊白度、糙米率、精米率。糙米率和精米率的分析參照國家標(biāo)準(zhǔn)GB/T5495-2008《稻谷出糙率檢驗(yàn)》和GB/T 21719-2008《稻谷整精米率檢驗(yàn)法》。
稱取精米粉沫(60目篩)試樣0.2 g左右,置于100 mL消煮管中(勿將樣品黏附在瓶頸上)。加入5 mL濃硫酸,輕輕搖勻并放置數(shù)小時(shí)。加入適量雙氧水,在管口放一彎頸小漏斗,在消煮爐上380℃消煮。1 h取下稍冷,加雙氧水 1 mL,重復(fù)2~3次,消煮到溶液呈無色或清亮后,再加熱5~10 min,以除盡剩余的雙氧水。將消煮管取下至冷卻,并用少量水沖洗彎頸漏斗,洗液流入消煮管。將消煮液無損的洗入50 mL容量瓶中,混勻待測。另外做3個(gè)空白。
蒸餾前配制好氫氧化鈉、硫酸標(biāo)準(zhǔn)液、混合指示劑,對定氮儀進(jìn)行充分預(yù)熱,進(jìn)行空蒸餾清洗管道,直至讀數(shù)穩(wěn)定。吸取上述待測液5.00 mL,注入凱氏定氮儀(沛歐,上海)蒸餾管中,參數(shù)設(shè)置后,對待測液進(jìn)行測定。
樣品中蛋白質(zhì)含量可根據(jù)公式計(jì)算:
注:V1為滴定體積(mL);V2為空白滴定體積(mL);V3為消解定容體積(mL);6.25為氮換算成蛋白質(zhì)的平均系數(shù);0.01為硫酸標(biāo)準(zhǔn)溶液濃度(mol·L-1);0.01401為每毫克當(dāng)量氮的克數(shù);V4為取液體積(mL);M為樣品質(zhì)量(g)。
稱取精米粉末(60目篩)試樣2~5 g,準(zhǔn)確至0.001 g,全部移入濾紙筒內(nèi)。將濾紙筒放入索氏抽提器(菲躍,杭州)的抽提筒內(nèi),連接已干燥至恒重的接收瓶,由抽提器冷凝管上端加入無水乙醚或石油醚至瓶內(nèi)容積的2/3處,于水浴上加熱,使無水乙醚或石油醚不斷回流抽提(6~8次·h-1),一般抽提6~10 h。提取結(jié)束時(shí),用磨砂玻璃棒接取1滴提取液,磨砂玻璃棒上無油斑表明提取完畢。稱量取下接收瓶,回收無水乙醚或石油醚,待接收瓶內(nèi)溶劑剩余1~2 mL時(shí)在水浴上蒸干,再于(100±5)℃干燥1 h,放干燥器內(nèi)冷卻0.5 h后稱量。重復(fù)以上操作直至恒重(直至兩次稱量的差不超過2 mg)。
樣品中粗脂肪含量可根據(jù)公式計(jì)算:
注:M1為烘干后總質(zhì)量(g);M2為空瓶質(zhì)量(g);M3為樣品質(zhì)量(g)。
取干凈的15 mL離心管,稱約50 mg干樣(60目),準(zhǔn)確至0.001 g,加2 mL 80%乙醇,混勻,70℃放置2 h,其間渦旋混勻,取出冷卻至室溫。加2 mL去離子水,混勻,12000 r·min-1離心10 min,棄上清。加4 mL 80%乙醇,混勻,12000 r·min-1離心10 min,棄上清,重復(fù)2次。加入2 mL 2 mol·L-1氫氧化鉀,用手將離心管上下顛倒混勻,置于冰上搖20 min。加入8 mL 1.2 mol·L-1的醋酸鈉緩沖溶液(pH=3.8),渦旋均勻。加入0.1 mL耐熱α-淀粉酶,再加入0.1 mL淀粉葡糖苷酶,渦旋均勻,置于50℃水浴鍋中,孵育30 min,其間間斷渦旋均勻。用蒸餾水將0.1 mL樣品稀釋至1 mL,取液體0.05 mL至新的EP管中,加入1.5 mL GOPOD試劑,渦旋混勻,于50℃下孵育20 min。同時(shí)取0.05 mL葡萄糖標(biāo)準(zhǔn)溶液,加入1.5 mL GOPOD試劑,50℃反應(yīng)20 min,510 nm處測定吸光度。
樣品中總淀粉含量可根據(jù)以下公式計(jì)算:
注:ΔA為樣品OD值減去空白OD值;F為葡萄糖的OD值;M為樣品質(zhì)量;90為換算系數(shù)。
取干凈的15 mL離心管,稱取適量樣本(約10 mg)。加入100 μL 95%酒精,900 μL NaOH溶液,渦旋混勻。沸水煮13 min,待冷卻后定容至10 mL,搖勻后靜置10 min。取干凈的15 mL離心管,依次加入0.5 mL上清,0.1 mL乙酸和0.2 mL碘化鉀溶液,定容至10 mL,室溫避光放置10 min,620 nm處測定吸光值。
標(biāo)準(zhǔn)曲線制定:稱取直鏈淀粉和支鏈淀粉標(biāo)樣各10 mg,加入0.1 mL酒精和0.9 mL NaOH,沸水煮10 min,冷卻后定容至10 mL。按如下比例混勻(表1),取混樣0.5 mL加入離心管,按測定方法同樣品一起測定。
表1 淀粉標(biāo)準(zhǔn)溶液配方
所有數(shù)據(jù)用SigmaPlot 12.0分析,用GraphPad Prism 6.05進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。不同組之間的顯著性差異用Student′st和one-way ANOVA檢驗(yàn)。所有數(shù)據(jù)以平均值±標(biāo)準(zhǔn)差表示。P<0.05視作差異顯著。
根據(jù)序列比對結(jié)果和現(xiàn)有稻瘟病抗性基因功能位點(diǎn)報(bào)道,常香粳1813中Pid2(LOC_Os06g29810)、Pid3(LOC_Os06g22460)和Pib(LOC_Os02g57305)基因?qū)儆诘疚敛】剐曰?,而Bsr-d1(LOC_Os03g32230)、Pita(LOC_Os12g18360)、Pit(LOC_Os01g05620)、Pi21(LOC_Os04g32850)、Pi37(LOC_Os01g57310)、Pi36(LOC_Os08g05440)、Pita2(LOC_Os12g18729)、Pish(LOC_Os01g57340)則對稻瘟病菌無抗性。
由圖1可知,試驗(yàn)組劍葉表面有明顯的褐色病斑,且葉片頂部干枯面積較對照組明顯大(圖1A)。試驗(yàn)組稻穗頂部一些谷粒明顯干秕,而中下部灌漿的谷粒外稃表面有明顯的褐色斑點(diǎn)(圖1B和1C)。同時(shí),對這些灌漿的谷粒進(jìn)行了千粒重和長寬比分析,結(jié)果顯示試驗(yàn)組和對照組谷粒的千粒重分別約為19.98 g和23.42 g,且顯著性分析顯示試驗(yàn)組較對照組顯著下降;而兩者長寬比分別約為2.27和2.23,試驗(yàn)組較對照組顯著上升(P<0.05)(圖2)。
注:(A)稻瘟病菌感染后葉片出現(xiàn)銹斑和干枯現(xiàn)象。(B)稻瘟病菌感染后稻穗頂部有明顯的秕谷,稻谷外稃有明顯的銹斑。箭頭指示秕谷。(C)稻瘟病菌感染后谷粒外觀比較。A和C中標(biāo)尺為3.5 cm,B中標(biāo)尺為3 cm
注:數(shù)據(jù)為平均值±標(biāo)準(zhǔn)差,n≥3,圖中不同小寫字母表示不同處理間差異達(dá)顯著水平(P<0.05)
由圖3可知,和對照組比較,試驗(yàn)組加工后的精米色澤稍發(fā)黃。由圖4可知,試驗(yàn)組大米的出糙率和整精米率分別約為0.80和0.68,而對照組分別為0.84和0.70,顯著性分析試驗(yàn)組出糙率和整精米率都顯著低于對照組;且同谷粒長寬比情況相似,試驗(yàn)組大米長寬比同樣顯著高于對照組(P<0.05)。由圖5可知,試驗(yàn)組和對照組加工整精米的堊白度分別約為5.51和2.14,且兩者差異顯著(P<0.05),但兩者堊白率無顯著差別。
注:圖中標(biāo)尺為3 cm。
注:數(shù)據(jù)為平均值±標(biāo)準(zhǔn)差,n≥3,圖中不同小寫字母表示不同處理間差異達(dá)顯著水平(P<0.05)
注:數(shù)據(jù)為平均值±標(biāo)準(zhǔn)差,n≥3,圖中不同小寫字母表示不同處理間差異達(dá)顯著水平(P<0.05)
由圖6可知,常香粳1813試驗(yàn)組和對照組總脂肪含量分別約為0.38%和0.80%(圖6A),而兩者總蛋白含量分別約為88.11 g·kg-1和66.03 g·kg-1(圖6B),總淀粉含量分別約為75.98%和80.76%(圖6C),而兩者直鏈淀粉含量分別約為7.93%和9.15%(圖6C),顯著性分析發(fā)現(xiàn)兩者這些參數(shù)差異均達(dá)顯著水平(P<0.05)。
注:數(shù)據(jù)為平均值±標(biāo)準(zhǔn)差,n≥3,圖中不同小寫字母表示不同處理間差異達(dá)顯著水平(P<0.05)
稻瘟病是最嚴(yán)重的水稻病害之一,由于稻瘟病菌的不穩(wěn)定性,全球水稻生產(chǎn)受到稻瘟病的威脅一直沒有解除[12]。利用經(jīng)典的植物育種技術(shù),育種家已經(jīng)開發(fā)出了許多適應(yīng)全球不同水稻種植地區(qū)的抗稻瘟病品種。常香粳1813是適宜江蘇省沿江和蘇南稻區(qū)種植的香軟米水稻品種,根據(jù)試驗(yàn)結(jié)果顯示,常香粳1813基因組含有Pid2、Pid3和Pib稻瘟病抗性基因。其中Pib基因?qū)|南亞稻瘟病菌小種具有廣譜抗性[13-14],Pid2和Pid3則對特異性稻瘟病菌小種有抗性[15-17]。因此,常香粳1813基因組中多個(gè)稻瘟病抗性基因的存在,使常香粳1813對稻瘟病菌具備一定免疫抗性,并順利通過江蘇省品種審定。
水稻穗瘟對糧食生產(chǎn)造成的損失最為嚴(yán)重[18-19]。對常香粳1813孕穗期幼穗接種稻瘟病菌后,雖然常香粳1813表現(xiàn)出明顯的抗性,但其穗頂部仍有一小部分癟粒,且中下部谷粒外稃表面有明顯的褐色病斑,千粒重下降,谷粒長寬比上升,說明稻瘟病菌感染對其灌漿過程有明顯的影響,谷粒不夠飽滿。這進(jìn)一步證實(shí)稻瘟病會造成種子產(chǎn)量和質(zhì)量的下降[8,20]。
本研究中,試驗(yàn)組大米色澤變暗黃,出糙率和精米率顯著下降,而堊白度和長寬比顯著上升,說明常香粳1813感染稻瘟病菌后大米的加工品質(zhì)明顯下降。蛋白質(zhì)含量、淀粉含量和結(jié)構(gòu)有顯著的功能特征,能夠很好地指示大米食味性能[21],本研究中試驗(yàn)組大米的總蛋白含量顯著增加,總淀粉含量、直鏈淀粉含量和總脂肪含量卻都顯著減少。因?yàn)楦呖诟兄档拇竺淄哂休^高的直鏈淀粉含量以及較低的蛋白質(zhì)含量[22],所以這些結(jié)果說明稻瘟病菌的感染明顯影響了常香粳1813的食味品質(zhì)。而且大麥的研究也表明蛋白質(zhì)含量的增加與直鏈淀粉含量顯著負(fù)相關(guān)[21],本試驗(yàn)結(jié)果進(jìn)一步驗(yàn)證了該觀點(diǎn)。
本研究證明常香粳1813品種中存在多個(gè)抗病性基因,因此具備了對稻瘟病菌的一定抗性,但是稻瘟病菌感染對軟香米常香粳1813的種子、大米產(chǎn)量和品質(zhì)還有顯著的影響,因此優(yōu)質(zhì)、高產(chǎn)、抗病品種的選育需要結(jié)合分子標(biāo)記、產(chǎn)量、品質(zhì)相關(guān)指標(biāo)參數(shù)的結(jié)合驗(yàn)證,這也是今后育種過程中需要關(guān)注的方面。