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        基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)與分子對(duì)接探討黃芪桂枝五物湯治療大動(dòng)脈炎的作用機(jī)制

        2023-12-08 07:28:24汪佳麗徐少華
        中國(guó)醫(yī)藥科學(xué) 2023年21期
        關(guān)鍵詞:五物桂枝靶點(diǎn)

        汪佳麗 徐少華 付 琦 劉 濤

        廣西中醫(yī)藥大學(xué)附屬?lài)?guó)際壯醫(yī)醫(yī)院心胸血管外科,廣西南寧 530201

        大動(dòng)脈炎(takayasu arteritis,TA)是一種慢性肉芽腫性血管炎,主要累及主動(dòng)脈及其主要分支,如頸動(dòng)脈、椎動(dòng)脈、頭臂動(dòng)脈、鎖骨下動(dòng)脈等動(dòng)脈[1],主要癥狀包括關(guān)節(jié)和肌肉疼痛、全身不適、發(fā)燒、盜汗。約10%患者表現(xiàn)為血管炎癥狀,如胸背部、頸部疼痛、腹痛等[2]。其治療方法包括藥物和手術(shù)治療,藥物治療分為誘導(dǎo)緩解期和維持期,治療藥物主要包括糖皮質(zhì)激素(glucocorticoid,GC)以及非GC類(lèi)免疫抑制劑。在誘導(dǎo)緩解期,主要的治療方法是將GC與免疫抑制劑聯(lián)合使用;在維持期,將GC逐漸減量維持,但未詳細(xì)說(shuō)明具體劑量[3]。

        中醫(yī)將TA歸于“血痹”“瘀證”“無(wú)脈癥”等范圍,黃芪桂枝五物湯出于《金匱要略》,為東漢醫(yī)家張仲景所著[4];《金匱要略·血痹虛勞病脈證并治第六》篇述:“血痹陰陽(yáng)俱微,寸口關(guān)上微,尺中小緊,外證身體不仁,如風(fēng)痹狀,黃芪桂枝五物湯主之。”其病機(jī)為氣血虛弱,腠理不固,外受風(fēng)寒,陽(yáng)氣受阻,血行不暢[5]。臨床研究表明,黃芪桂枝五物湯對(duì)于緩解TA的相關(guān)癥狀具備獨(dú)特效用[6],但其作用機(jī)制暫不明確。本研究探討了黃芪桂枝五物湯治療TA的作用機(jī)制,為黃芪桂枝五物湯的應(yīng)用提供了參考依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 方劑靶點(diǎn) 用TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)黃芪桂枝五物湯中組成進(jìn)行檢索,以口服利用度(oral bioavailability,OB)≥30%、藥物相似性(drug likeness,DL)≥0.18為條件,獲得活性成分預(yù)測(cè)其靶點(diǎn),再利于UniProt數(shù)據(jù)庫(kù),獲得黃芪桂枝五物湯藥物基因集。

        1.1.2 TA疾病靶點(diǎn) 利用GeneCards數(shù)據(jù)庫(kù)搜索TA疾病相關(guān)靶點(diǎn),得到疾病相關(guān)基因集。

        1.2 方法

        1.2.1 “藥物-成分-靶點(diǎn)”可視化網(wǎng)絡(luò) 將1.1.1和1.1.2中數(shù)據(jù)導(dǎo)入CytoScape軟件,通過(guò)“藥物-成分-靶點(diǎn)”可視化展示。

        1.2.2 蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò) STRING數(shù)據(jù)庫(kù)由交集基因?qū)?,得到蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(proteinprotein interaction,PPI)網(wǎng)絡(luò)并利用CytoScape軟件可視化展示。

        1.2.3 基因本體(gene ontology,GO)和京都基因與基因組百科全書(shū)(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析 將交集基因?qū)隓AVID數(shù)據(jù)庫(kù)行GO與KEGG富集分析,選取前20個(gè)條目使用微生信氣泡圖展示。

        1.2.4 分子對(duì)接 以度中心性(degree centrality,DC)值排列,選取排名前4的活性成分和基因行分子對(duì)接,計(jì)算結(jié)合能;運(yùn)用AutoDockTools將兩者對(duì)接,利用PyMol軟件對(duì)結(jié)果可視化。

        2 結(jié)果

        2.1 活性成分

        黃芪桂枝五物湯共76個(gè)活性化學(xué)成分,部分見(jiàn)表1。

        表1 黃芪桂枝五物湯活性藥物成分

        2.2 交集基因

        UniProt數(shù)據(jù)庫(kù)由464個(gè)黃芪桂枝五物湯藥效靶點(diǎn)導(dǎo)入,得到160個(gè)預(yù)測(cè)靶點(diǎn)對(duì)應(yīng)基因,GeneCards數(shù)據(jù)庫(kù)搜索TA共726個(gè)靶點(diǎn)基因,運(yùn)用Venny取交集基因,得到44個(gè)黃芪桂枝五物湯治療TA的預(yù)測(cè)靶點(diǎn),見(jiàn)圖1。

        圖1 黃芪桂枝五物湯治療TA預(yù)測(cè)靶點(diǎn)圖

        2.3 藥物-成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)

        利用CytoScape軟件構(gòu)建“藥物-成分-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)可視化,見(jiàn)圖2。根據(jù)DC值排序,排列較前為quercetin、kaempferol、beta-sitosterol等,數(shù)值各為208、69、59。證明上述為黃芪桂枝五物湯治療TA的主要活性成分,發(fā)揮著重要作用。

        2.4 PPI網(wǎng)絡(luò)

        將交集基因?qū)隨TRING數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)圖,見(jiàn)圖3。將STRING數(shù)據(jù)庫(kù)得到的文件導(dǎo)入CytoScape軟件,篩選核心蛋白,見(jiàn)圖4。白細(xì)胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、腫瘤壞死因子(tumor necrosis factor,TNF)、白蛋白(albumin,ALB)、血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子A(vascular endothelial growth factor A,VEGFA)等為篩選出的核心蛋白,在整個(gè)網(wǎng)絡(luò)中起著關(guān)鍵作用。

        圖3 PPI網(wǎng)絡(luò)

        圖4 PPI可視化

        2.5 GO與KEGG富集分析

        使用DAVID數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)交集基因行富集分析,GO富集分析得到GO條目共402個(gè),其中340個(gè)生物過(guò)程(biological process,BP);28個(gè)細(xì)胞組分(cellular component,CC);34個(gè)分子功能(molecular function,MF)。KEGG通路富集得出105條通路。利用P值排序,選取前20個(gè)條目運(yùn)用微生信工具以氣泡圖可視化,見(jiàn)圖5。結(jié)果顯示,黃芪桂枝五物湯對(duì)TA的治療主要涉及白介素-17(interleukin-17,IL-17)信號(hào)通路、腫瘤壞死因子(tumor necrosis factor,TNF)信號(hào)通路、核因子κB(nuclear factor κB,NF-κB)信號(hào)通路等,可能通過(guò)對(duì)炎癥反應(yīng)、細(xì)胞凋亡過(guò)程的負(fù)調(diào)節(jié)、脂多糖的反應(yīng)等發(fā)揮治療作用。

        圖5 GO、KEGG富集分析圖

        2.6 分子對(duì)接

        選取排名前四的關(guān)鍵活性成分和靶點(diǎn)進(jìn)行分子對(duì)接,見(jiàn)表2。表中關(guān)鍵活性成分和關(guān)鍵靶點(diǎn)中結(jié)合能≤-5 kJ/mol占比93.8%,預(yù)測(cè)該活性成分與靶點(diǎn)具有較好的結(jié)合活性,證明黃芪桂枝五物湯關(guān)鍵活性成分可對(duì)關(guān)鍵靶點(diǎn)的調(diào)控發(fā)揮作用。見(jiàn)圖6。

        圖6 關(guān)鍵活性成分與關(guān)鍵靶點(diǎn)對(duì)接可視化

        表2 關(guān)鍵活性成分與關(guān)鍵靶點(diǎn)對(duì)接的結(jié)合能

        3 討論

        網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)作為一門(mén)新興學(xué)科,是藥理學(xué)、分子生物學(xué)、醫(yī)學(xué)、生物信息學(xué)以及統(tǒng)計(jì)學(xué)綜合運(yùn)用的結(jié)果[7]。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是一種新方法,通過(guò)了解中藥配伍多成分、多通路和治療多靶點(diǎn)[8],能夠證明中藥對(duì)疾病的治療作用。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的發(fā)展始終與中醫(yī)藥研究息息相關(guān)[9],并為中醫(yī)藥發(fā)展帶來(lái)新生機(jī)。

        目前臨床對(duì)于TA的治療,主要以GC以及非GC類(lèi)免疫抑制劑等藥物及手術(shù)治療為主,但其存在耐藥及其他副作用,而新興的靶向治療仍缺乏足夠的證據(jù)支持[10]。不同的是,中醫(yī)講究整體和辨證施治,在治療TA上展現(xiàn)了獨(dú)特的優(yōu)勢(shì),如龐鶴教授[11]應(yīng)用黃芪桂枝五物湯治療周?chē)芗膊 ?/p>

        本研究表明槲皮素、山奈酚、β-谷甾醇、毛蕊異黃酮可能是黃芪桂枝五物湯治療TA的關(guān)鍵活性成分。槲皮素治療炎癥性疾病機(jī)制是通過(guò)抑制炎癥因子的生成和細(xì)胞基質(zhì)的降解,其抗炎作用是通過(guò)調(diào)控相關(guān)炎癥信號(hào)等通路[12]。山奈酚是一種黃酮醇,被證實(shí)屬天然抗炎化合物之一,在關(guān)節(jié)炎、癌癥、心血管疾病和其他疾病的發(fā)病過(guò)程中都發(fā)揮著重要作用,并與降低炎癥相關(guān)疾病的風(fēng)險(xiǎn)密切相關(guān)[13]。β-谷甾醇可以通過(guò)降低血管內(nèi)皮細(xì)胞表面的血管細(xì)胞黏附分子-1、細(xì)胞間黏附分子-1以及E-選擇素的表達(dá)水平,阻止炎性中性粒細(xì)胞的移行、浸潤(rùn)從而減輕細(xì)胞炎性反應(yīng)[14]。毛蕊異黃酮為一種異黃酮植物雌激素,是從中藥黃芪中提取的有效活性成分之一[15]。毛蕊異黃酮有促進(jìn)血管新生、抗氧化等作用,通過(guò)轉(zhuǎn)錄學(xué)和實(shí)時(shí)定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)法,發(fā)現(xiàn)毛蕊異黃酮通過(guò)VEGF和FGF信號(hào)通路實(shí)現(xiàn)其中Src,Raf,絲裂原活化蛋白激酶激酶1/2(protein kinase 1/2,MEK1/2)和磷脂酰肌醇3酶(phosphoinositide 3-kinase,PI3K)起著不可代替的作用[16]。

        IL-6調(diào)節(jié)多種細(xì)胞的生長(zhǎng)和分化,調(diào)節(jié)免疫反應(yīng)、急性期和造血,并通過(guò)機(jī)體對(duì)感染的免疫反應(yīng)發(fā)揮重要作用;TNF具有抗感染、促進(jìn)機(jī)體免疫功能調(diào)節(jié)等重要作用;VEGFA的體外活性是促進(jìn)動(dòng)脈、靜脈和淋巴管內(nèi)皮細(xì)胞的生長(zhǎng)。

        KEGG通路富集結(jié)果主要有IL-17信號(hào)通路、TNF信號(hào)通路、NF-κB信號(hào)通路等,涉及脂多糖的反應(yīng)、炎癥反應(yīng)、細(xì)胞凋亡過(guò)程的負(fù)調(diào)節(jié)等功能發(fā)揮治療作用。NF-κB在細(xì)胞的炎癥反應(yīng)、免疫應(yīng)答等過(guò)程中起著關(guān)鍵作用;IL-17是T細(xì)胞誘導(dǎo)的炎癥反應(yīng)的早期觸發(fā)因子,并通過(guò)促進(jìn)促炎細(xì)胞因子的釋放來(lái)增強(qiáng)炎癥反應(yīng);IL-17結(jié)合受體后,可通過(guò)MAP激酶途徑和NF-κB發(fā)揮生物效應(yīng)。所以黃芪桂枝五物湯治療TA的機(jī)制可能是通過(guò)減輕血管炎癥,疏通血管,恢復(fù)血流速度,也就是“溫經(jīng)益氣,和血通痹”的作用,充分闡明了中醫(yī)理論中“通則不痛”。

        分子對(duì)接結(jié)果顯示結(jié)合能≤-5 kJ/mol占93.8%,證實(shí)了山奈酚、β-谷甾醇、槲皮素、毛蕊異黃酮在治療TA中的重要作用。

        綜上所述,本研究借助網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)及分子對(duì)接技術(shù),闡述了黃芪桂枝五物湯對(duì)TA的治療是通過(guò)槲皮素 、山奈酚、β-谷甾醇、毛蕊異黃酮等成分作用于IL-6、TNF、ALB、VEGFA等基因靶點(diǎn),從而影響“IL-17信號(hào)通路、TNF信號(hào)通路、NF-κB信號(hào)通路”等通路發(fā)揮作用,為進(jìn)一步研究中藥治療TA提供參考。但此課題只對(duì)其作用機(jī)制進(jìn)行了初步驗(yàn)證,由于數(shù)據(jù)庫(kù)收錄信息的不完整、相關(guān)數(shù)據(jù)更新滯后等因素影響,該研究存在一定的局限性,故開(kāi)展實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證應(yīng)是下一步研究的重點(diǎn)。

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