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        基于CiteSpace的“三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移”研究可視化分析

        2023-11-10 06:50:18徐佳偉徐思怡虞程棟余騰驊孫正魁
        實(shí)用癌癥雜志 2023年10期
        關(guān)鍵詞:圖譜可視化陰性

        徐佳偉 湯 雷 徐思怡 虞程棟 余騰驊 陳 雯 孫正魁

        乳腺癌是全球常見的癌癥,且發(fā)病人數(shù)不斷上升,其中三陰性乳腺癌(triple negative breast cancer,TNBC)占乳腺癌的10%~20%[1-2]。TNBC是一種難以控制的乳腺癌亞型,由于其缺乏雌激素、孕激素和人表皮生長因子受體2(HER-2)受體,臨床上缺乏有效的治療靶點(diǎn),因此TNBC預(yù)后較差[3]。遠(yuǎn)隔器官的轉(zhuǎn)移往往是TNBC不良預(yù)后的原因,而其轉(zhuǎn)移部位多見于淋巴結(jié)、骨骼、肺、肝和腦,研究顯示乳腺癌是轉(zhuǎn)移至大腦的第二常見實(shí)體瘤,因此對TNBC腦轉(zhuǎn)移進(jìn)行相關(guān)研究具有重大的臨床意義[4-5]。 目前,三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移相關(guān)的研究優(yōu)先級顯現(xiàn)出一定的先后順序,但在相關(guān)結(jié)論上卻尚存爭議,缺乏研究從計(jì)量分析角度梳理現(xiàn)有文獻(xiàn)[6-7]。同時(shí),許多學(xué)者對三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移的研究一般局限于對文獻(xiàn)的綜合閱讀和個(gè)人臨床經(jīng)驗(yàn)的總結(jié),缺乏必要的完整性和宏觀性[8]。

        文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)作為一種可視化分析研究成果的新方法,通過對已發(fā)表文獻(xiàn)的國家、作者、機(jī)構(gòu)和關(guān)鍵詞等進(jìn)行分析,為研究者提供文獻(xiàn)的定性和定量特征,從而描述某一領(lǐng)域當(dāng)前的發(fā)展趨勢,揭示該領(lǐng)域的前沿[9-10]。文獻(xiàn)計(jì)量學(xué)已經(jīng)在包括炎癥、遺傳學(xué)和癌癥等研究領(lǐng)域證明了其意義非凡[11-13]。并且,文獻(xiàn)計(jì)量分析為疾病研究做出了巨大貢獻(xiàn)[14]。然而,目前還沒有三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移領(lǐng)域的科學(xué)成果研究評估,因此對三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移的研究現(xiàn)狀進(jìn)行探究顯得意義重大。因此,本研究系統(tǒng)分析了2007-2021年12月31日期間三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移領(lǐng)域的相關(guān)科研成果,深入探討作者、機(jī)構(gòu)和國家之間的關(guān)系。此外,我們還全面分析了關(guān)鍵詞、引用參考文獻(xiàn),確定了本領(lǐng)域研究重點(diǎn)以及核心熱點(diǎn),以期為未來研究提供借鑒。

        1 材料與方法

        1.1 一般材料

        研究中與三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移相關(guān)的所有出版物均來自科學(xué)網(wǎng)核心館藏(Web of Science Core Collection,WOSCC),時(shí)間截至2021年12月31日。選擇高級檢索,在“主題”范圍內(nèi),以“三陰性乳腺癌”和“腦轉(zhuǎn)移”為檢索式,檢索時(shí)間自定義為2007年1月1日至2021年12月31日,最終獲取學(xué)術(shù)文獻(xiàn)510篇。排除綜述論文、會議摘要、信函、圖書等其它類型的文獻(xiàn),最終共獲得學(xué)術(shù)期刊文獻(xiàn)393篇。文獻(xiàn)由三位作者(徐思怡、虞程棟和湯雷)獨(dú)立檢索和篩選,如果三者檢索結(jié)果有區(qū)別,則發(fā)起組內(nèi)討論共同確認(rèn)。

        1.2 方法

        本研究以知識圖譜為基礎(chǔ),將符合篩選條件的393篇學(xué)術(shù)期刊文獻(xiàn),以純文件格式從科學(xué)網(wǎng)核心館藏(Web of Science Core Collection,WOSCC)導(dǎo)出,將數(shù)據(jù)導(dǎo)入 CiteSpace(V 6.1.R3 advance)中進(jìn)行數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換以進(jìn)行文獻(xiàn)可視化分析。自定義時(shí)間跨度(Time Slicing)為2007年1月至2021年12月,時(shí)間分區(qū)(Years Per Slice)為1年,分別選擇作者(Author)、機(jī)構(gòu)(institution)、國家(country)、關(guān)鍵詞(Key Words);剪裁方式選擇關(guān)鍵路徑法(pathfinder)、 精簡切片網(wǎng)絡(luò)(pruning sliced networks)和精簡合并網(wǎng)絡(luò)(pruning the merged network)以簡化網(wǎng)絡(luò)圖譜,降低網(wǎng)絡(luò)密度,增強(qiáng)網(wǎng)絡(luò)可讀性;其余設(shè)置為默認(rèn),繪制相應(yīng)的知識圖譜。

        2 結(jié)果

        2.1 三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移研究的時(shí)間發(fā)展趨勢

        研究在刪除了117條不合格篩選條件的文獻(xiàn)后,共獲得393篇文獻(xiàn)。本研究領(lǐng)域發(fā)文量在15年間呈階梯型上升趨勢,在研究早期,全球?qū)W者并未將三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移作為研究重點(diǎn)。2010年之前年度發(fā)文量不超過10篇,此后研究發(fā)文量呈現(xiàn)上升趨勢,2020年至2021年,三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移研究年度發(fā)文量達(dá)峰值60篇,較上一年度發(fā)文增長量達(dá)14篇(圖1)。由此可見三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移研究正引起越來越多學(xué)者的興趣。

        圖1 全球三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移相關(guān)文獻(xiàn)時(shí)間分布圖

        2.2 三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移研究的核心作者、作者合作網(wǎng)絡(luò)分析

        我們團(tuán)隊(duì)運(yùn)用 CiteSpace繪制作者合作網(wǎng)絡(luò)圖譜(圖2),以節(jié)點(diǎn)大小代表作者發(fā)文量多少,以連線的粗細(xì)代表作者之間合作的緊密程度。分析發(fā)現(xiàn)在全球三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移圖譜中,共有 424 個(gè)節(jié)點(diǎn),749條連線,可視化圖譜網(wǎng)絡(luò)密度為 0.0084,這說明鄰域內(nèi)各作者之間的合作關(guān)系較為松散,但仍然形成了具有一定內(nèi)部合作關(guān)系的代表性研究團(tuán)隊(duì)。

        圖2 全球三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移作者合作網(wǎng)絡(luò)圖譜

        2.3 三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移研究的國家、機(jī)構(gòu)分析

        自2007年以來,已有46個(gè)國家/地區(qū)發(fā)表了三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移研究的相關(guān)文章。根據(jù)CiteSpace創(chuàng)建的可視化圖譜(圖3)顯示了出版物的國家/地區(qū)的分布和數(shù)量。結(jié)果提示,在全球范圍內(nèi)參與三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移相關(guān)研究的國家不多,且各國文章產(chǎn)出較少,因此在本領(lǐng)域有很大的研究空間等待進(jìn)一步發(fā)掘。其中來自美國的出版物最多(n=155),其次是中國(n=61)、韓國(n=31)、和德國(n=30)。

        圖3 全球三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移國家合作網(wǎng)絡(luò)圖譜

        研究發(fā)現(xiàn),共有310個(gè)機(jī)構(gòu)參加三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移的研究。發(fā)文量最多的10所研究機(jī)構(gòu)中有9所機(jī)構(gòu)來自美國,另外一所來自中國,其中丹娜·法伯癌癥研究院(Dana-Farber Cancer Institute)發(fā)表的論文數(shù)量最多(n=20),其次是北卡羅來納大學(xué)(The University of North Carolina System)(n=11)。中國參與三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移研究的主要機(jī)構(gòu)有中山大學(xué)、四川大學(xué)和復(fù)旦大學(xué)等,且未與國外其他機(jī)構(gòu)形成緊密的合作(圖4)。

        圖4 全球三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移機(jī)構(gòu)合作網(wǎng)絡(luò)圖譜

        2.4 三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移研究的關(guān)鍵詞共現(xiàn)分析

        關(guān)鍵詞共現(xiàn)分析是通過統(tǒng)計(jì)關(guān)鍵詞在同一文獻(xiàn)中出現(xiàn)的頻率,分析關(guān)鍵詞之間的內(nèi)在關(guān)系和親密程度。作為可以體現(xiàn)文獻(xiàn)核心研究內(nèi)容的關(guān)鍵詞,研究利用CiteSpace 制作關(guān)鍵詞共現(xiàn)圖譜可視化展示關(guān)鍵詞的共現(xiàn)關(guān)系,可以發(fā)現(xiàn)本研究領(lǐng)域的核心內(nèi)容及研究熱點(diǎn)(圖5)。分析發(fā)現(xiàn)圖譜中共有 350個(gè)節(jié)點(diǎn),780條連線,網(wǎng)絡(luò)密度為 0.0128。關(guān)鍵詞共現(xiàn)圖譜中具有較高中介中心性的關(guān)鍵詞包括二期臨床研究(0.25)、卡培他濱(0.25)、血管生成(0.22)、新輔助化療(0.22)及屏障(0.16),說明三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移系統(tǒng)治療的臨床研究為目前研究領(lǐng)域的關(guān)注熱點(diǎn)。

        圖5 全球三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移關(guān)鍵詞共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)圖譜

        2.5 三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移研究的關(guān)鍵詞聚類分析

        在可視化圖譜中,對關(guān)鍵詞進(jìn)行聚類分析,可以進(jìn)一步研究本領(lǐng)域的研究類團(tuán)及結(jié)構(gòu)特征。降低網(wǎng)絡(luò)密度,增強(qiáng)網(wǎng)絡(luò)可讀性,裁剪選擇最小生成樹(Minimum Spanning Tree),另外使用LLR算法形成名詞短語標(biāo)簽,從聚類標(biāo)識詞的提示可以推出每一組模塊的主要研究方向以及相應(yīng)的熱點(diǎn)文獻(xiàn),從而依靠閱讀熱點(diǎn)文獻(xiàn)可以找到本研究領(lǐng)域的最新進(jìn)展。我們團(tuán)隊(duì)基于此理論繪制了全球三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移關(guān)鍵詞聚類可視化圖譜。通常認(rèn)為,關(guān)鍵詞聚類分析中Q 值大小與聚類效果呈正相關(guān),而S值的大小則與關(guān)鍵詞聚類的合理程度呈正相關(guān)。當(dāng)Q>0.3 則可認(rèn)為聚類社團(tuán)結(jié)構(gòu)顯著,在本圖譜中 Q=0.9002>0.3,因此,我們認(rèn)為本研究所產(chǎn)生的 知識聚類較清晰地反映了當(dāng)下全球在三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移領(lǐng)域的研究主題分布,通過對本知識圖譜的分析有助于我們深入了解目前研究方向的結(jié)構(gòu)及內(nèi)容。通過我們制作的知識圖譜可以發(fā)現(xiàn),全球三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移的研究方向依頻次由高到低分別集中在:乳腺腫瘤、腺癌、細(xì)胞、腫瘤轉(zhuǎn)移、化療、三陰性乳腺癌、循環(huán)腫瘤細(xì)胞、晚期乳腺癌、微環(huán)境、開放標(biāo)簽、立體定位放射外科等方面。

        2.6 三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移研究的關(guān)鍵詞時(shí)間線圖可視化分析

        構(gòu)建三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移研究的關(guān)鍵詞時(shí)間線圖可將本領(lǐng)域不同研究類團(tuán)的發(fā)展過程可視化呈現(xiàn)出來,我們團(tuán)隊(duì)以關(guān)鍵詞所在年份以及所屬聚類標(biāo)簽為基礎(chǔ),分別構(gòu)建可視化圖譜的X與Y軸。依據(jù)出現(xiàn)的時(shí)間順序?qū)⑼痪垲愔械年P(guān)鍵詞排布在時(shí)間線上,進(jìn)而將同一聚類中關(guān)鍵詞隨研究時(shí)期推移而改變的情況可視化呈現(xiàn)。通過對各聚類中關(guān)鍵詞的歷史跨度分布情況的分析我們發(fā)現(xiàn),在時(shí)間分布方面,聚類相對集中,主要包括#0三陰性乳腺癌,#2循環(huán)腫瘤細(xì)胞,#3三陰性,#6乳腺癌,#8腦轉(zhuǎn)移。顯而易見,這些相對集中的聚類主要出現(xiàn)在在2008~2013年之間,這表明這些聚集是全球三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移研究中最受歡迎的方向。

        2.7 三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移研究關(guān)鍵詞突現(xiàn)分析

        關(guān)鍵詞突現(xiàn)是指研究領(lǐng)域內(nèi)某關(guān)鍵詞運(yùn)用頻次在短時(shí)間內(nèi)顯著增加,通過對其的檢測、分析不僅可以反映某一時(shí)間段內(nèi)的研究前沿以及其隨時(shí)間發(fā)展的演變情況,還能揭示理論趨勢或是領(lǐng)域內(nèi)正在出現(xiàn)的新主題,以此預(yù)測未來可能的研究方向。我們以粗線表示在特定期間內(nèi)使用突然增加的關(guān)鍵字,細(xì)線則表示特定期間內(nèi)使用相對不受歡迎的關(guān)鍵詞(圖6)。我們團(tuán)隊(duì)通過關(guān)鍵詞突發(fā)檢測將增生、診斷、通路、沖突、位點(diǎn)、結(jié)局確定為近3年的熱門話題,反映了目前領(lǐng)域的研究人員越來越關(guān)注三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移的診斷以及患者治療相關(guān)問題。

        圖6 三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移研究關(guān)鍵詞突現(xiàn)可視化

        3 討論

        文獻(xiàn)計(jì)量分析根據(jù)已發(fā)表記錄可視化為我們的研究提供了本研究領(lǐng)域的當(dāng)前熱點(diǎn)和趨勢變化的可能性[17-18]。在本研究中,我們通過對Web of Science核心數(shù)據(jù)庫進(jìn)行系統(tǒng)的文獻(xiàn)檢索,累計(jì)查找了在2007~2021年期間全球范圍內(nèi)發(fā)表的有關(guān)三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移的393篇文章?;诖丝偨Y(jié)了全球三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移研究合作情況、發(fā)展趨勢以及出現(xiàn)的新主題。在本研究領(lǐng)域內(nèi),美國的絕對生產(chǎn)率排名最高,其次是中國和韓國和德國。在2010年之前,與三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移研究相關(guān)的出版物數(shù)量不足10篇,此后相關(guān)的出版物發(fā)表數(shù)量呈現(xiàn)上升趨勢。根據(jù)我們繪制的知識圖譜分析發(fā)現(xiàn),全球三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移的研究方向依頻次由高到低分別集中在:乳腺腫瘤、腺癌、細(xì)胞、腫瘤轉(zhuǎn)移、化療、三陰性乳腺癌、循環(huán)腫瘤細(xì)胞、晚期乳腺癌、微環(huán)境、開放標(biāo)簽、立體定位放射外科等方面。說明這些方向是全球三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移研究中最受歡迎的方向。另外,關(guān)鍵詞突現(xiàn)分析指明目前該領(lǐng)域的研究人員越來越關(guān)注三陰性乳腺癌腦轉(zhuǎn)移的診斷以及患者治療相關(guān)問題,這可能是未來的研究熱點(diǎn)。

        然而,我們的研究存在一些局限性。首先,我們只從WoS核心集合中檢索出版物,因此,本研究并未納入所有相關(guān)出版物。其次,雖然數(shù)據(jù)庫不斷更新,但我們只收錄了2007年1月至2021年12月的出版物,這可能會導(dǎo)致一些最新的研究成果被排除在外。

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