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        代謝型谷氨酸受體5 的純化及納米抗體的篩選

        2023-11-02 14:01:52馬夢潔許劍鋒
        工業(yè)微生物 2023年5期
        關(guān)鍵詞:噬菌體稀釋液菌落

        王 輝,馬夢潔,許劍鋒*

        1.上海海洋大學(xué),上海 201306;2.中國科學(xué)院上海藥物研究所,上海 201203;3.食品科學(xué)與工程國家級實驗教學(xué)示范中心(上海海洋大學(xué)),上海 201306

        谷氨酸(Glutamate,Glu)主要是在Glu 受體(Glu receptor,GluR)介導(dǎo)下調(diào)節(jié)大腦神經(jīng)元興奮性和代謝活動的重要興奮性神經(jīng)遞質(zhì)之一,代謝型谷氨酸受體(Metabotropic glutamate receptors,mGluR)屬于谷氨酸受體的一種類型(另一類為離子型谷氨酸受體),該受體是GPCR 家族C 組成員[1]。mGluR5 主要以二聚體的形式分布在大腦皮質(zhì)、海馬和紋狀體等區(qū)域,通過激活信號通路,廣泛參與調(diào)控突觸傳遞、突觸可塑性、神經(jīng)興奮性/抑制性平衡等生理過程,對維系神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)至關(guān)重要[2]。在病理條件下,它是一種公認(rèn)的治療靶點,與多種腦疾病有關(guān)。盡管有可靠的臨床前數(shù)據(jù),但mGluR5 拮抗劑在幾項臨床試驗中都失敗了,這表明需要深入地了解mGluR5 功能背后的機(jī)制[3],其作為神經(jīng)和精神疾病的潛在藥物靶標(biāo)日益受到相關(guān)研究人員的關(guān)注。

        納米抗體只包括一個重鏈可變區(qū)(VHH)和兩個常規(guī)的CH2與CH3區(qū),不像經(jīng)過人工改造的單鏈抗體片段(scFv)那樣容易互相沾粘,甚至聚集成塊[4]。相反,其具備分子質(zhì)量小,能夠穿透血腦屏障,特異性和親和力高,表達(dá)量高和對人體的免疫原性較弱等優(yōu)勢。本文通過對駱駝免疫,篩選出與mGluR5特異性結(jié)合較高的納米抗體,然后以納米抗體為中間體進(jìn)行一系列改造,使mGluR5 靶向成藥成為可能[5]。

        1 材料與方法

        1.1 實驗材料

        DNA Polymerase、T4 DNA Ligase 從南京諾唯贊購入;淋巴細(xì)胞分離液從GE Healthcare 公司購入;RNeasy PlusMiniKit 從 QIAGEN 公司購入;TIANquick Midi Purification Kit、TIANgel Midi PurificationKit 均購自天根生化科技(北京)有限公司;293s 細(xì)胞、M13KO7 輔助噬菌體購自NEB 公司;Mouse Anti- HA-tag Antibody、HRP Goat Antimouse IgGH+L)Antibody 從上海翌圣生物科技有限公司購入;M2 親和層析柱;Ni-NTA His 結(jié)合樹脂從Sigma 公司購入。

        1.2 方法

        1.2.1 mGluR5 真核表達(dá)載體的構(gòu)建

        從NCBI 上查找編碼野生型人mGluR5 的21-835 位氨基酸殘基的堿基序列,將血凝素(HA)信號肽、標(biāo)志表位標(biāo)簽(DYKDDDDK)和3-丙氨酸連接物添加到N 端,然后在蘇州金唯智生物科技有限公司合成,設(shè)計上游引物、下游引物;將改造后的mGluR5 和CMV-Flag 載體進(jìn)行雙酶切,酶切后的產(chǎn)物提純后進(jìn)行連接,將連接好的產(chǎn)物用Top10 感受態(tài)細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)化,次日隨機(jī)挑取轉(zhuǎn)化出來的細(xì)菌,用上下游引物進(jìn)行菌落PCR,將菌落PCR 結(jié)果為陽性的進(jìn)行質(zhì)粒測序,和原始序列進(jìn)行對比[6]。

        1.2.2 mGluR5 的表達(dá)純化

        利用Bac-to-Bac 桿狀病毒表達(dá)系統(tǒng)(Invitgen)制備重組桿狀病毒[7]。800 mL 293 s 細(xì)胞,病毒比例1∶20,用10 mM 正丁酸鈉30 ℃和135RPM 誘導(dǎo)3 d,離心收集細(xì)胞,在含有10 mM Tris 和1 mM EDTA 的低滲緩沖液中(pH 為7.8)和1 mM EDTA中裂解,然后勻漿[8];用離心法收集細(xì)胞膜微球,分別用20 mM HEPES,10% Glycerol,10 mM NaCl,0.01% LMNG,1% Coaktail,10 μM FFMTEP,0.2%膽固醇琥珀酸半酯(CHS)(類固醇)和10 μM FFMTEB(化合物)在4 ℃冷庫旋轉(zhuǎn)孵育2 h。FFMTEB(3-fluoro-5-(2-(2-(fluoromethyl)thiazol-4-yl)ethynyl)benzonitrile)是F-MTEB 的氟化類似物,對mGluR5具有極高的親和力及選擇性;用20 mM HEPES,10% Glycerol,10 mM NaCl,0.01% LMNG,10 μM FFMTEP,2 mM CaCl2洗滌[9]。與M2 柱子結(jié)合的mGluR5 在20 mM HEPES pH 7.5,100 mM NaCl,0.005% (W/V)LMNG,10 μM FFMTEP,0.2 mg/mL flag 和5 mM EDTA 洗脫。蛋白經(jīng)50 kDa 截留的Vivaspin(微孔)濾膜濃縮,濃縮至500 μL 過Superose 6,10/300 GL 柱(GE Healthcare)進(jìn)行分離,測濃度計算質(zhì)量,在蛋白中稱取3 倍質(zhì)量的A835,混合均勻吸取蛋白體積1/2 活化的Bio-beads(500 uL),將蛋白加入其中,4 ℃旋轉(zhuǎn)過夜吸附Detergent后,換等量的活化Bio-beads 4 ℃旋轉(zhuǎn)吸附4 h,經(jīng)吸附A835 包裝后的蛋白過Superose 6 柱子進(jìn)行分離[10]。通過SDS-PAGE 凝膠電泳確認(rèn)蛋白。

        圖1 mGluR5-CMV-Flag 載體的構(gòu)建

        圖3 噬菌體展示抗體庫的構(gòu)建

        圖4 抗mGluR5 納米抗體的篩選

        1.2.3 mGluR5 蛋白免疫野生單峰駝

        將1 mg mGluR5 蛋白與GERBU Adjuvant FamaTM 佐劑按1∶1 混勻,注射于野生雙峰駝頸部的淋巴結(jié)處,總共需要對駱駝進(jìn)行7 次免疫,每次間隔時間為1 周,最后一次免疫1 周后抽取200 mL駱駝的外周血[11]。

        1.2.4 噬菌體展示抗體庫的構(gòu)建

        將150 mL 的駱駝外周血與等體積的0.9%氯化鈉溶液輕晃混勻,將稀釋的外周血按10 mL 每管慢慢注入15 mL 每管淋巴細(xì)胞分離液液面上,通過低速離心使外周血分為4 層,用移液槍小心吸出淋巴細(xì)胞層進(jìn)行總RNA 的提取,再逆轉(zhuǎn)錄為cDNA[12]。用表1 中的引物對cDNA 進(jìn)行巢式PCR 將VHH 片段進(jìn)行擴(kuò)增并與pMECS 噬菌粒載體進(jìn)行連接;用電轉(zhuǎn)化的方法轉(zhuǎn)化到TG1 大腸桿菌中(條件為:電壓1 800 V,電阻200 Ω,電容25 μF,時間恒定值在4.5~5.5 ms 之內(nèi));用SOC 培養(yǎng)基進(jìn)行復(fù)蘇1 h,吸出10 μL 細(xì)菌懸液加入到990 μL 37 ℃預(yù)熱的SOC 培養(yǎng)基中,混勻;取100 μL 涂布在含2%葡萄糖,氨芐抗性的9 cm 直徑LB 平板上(即稀釋103 倍,可進(jìn)一步梯度稀釋至104 倍、105 倍和106 倍),37 ℃倒置培養(yǎng)過夜后,統(tǒng)計菌落數(shù)用來測噬菌體抗體庫的庫容[13]。將剩下的細(xì)菌懸液每200 μL 涂布在1 塊含2%葡萄糖,氨芐抗性的15 cm 直徑LB 平板上,37℃倒置培養(yǎng)過夜;用6 mL LB 培養(yǎng)基潤濕15 cm 直徑LB 平板,用無菌細(xì)胞刮將細(xì)菌收集到一個100 mL 收菌瓶中;取10 μL 細(xì)菌,稀釋200 倍,測量并記錄OD600nm值(擴(kuò)增倍數(shù)為104 以上);向收菌瓶中加入1/3 體積的無菌80%甘油,混勻后在保存在-80 ℃; 隨機(jī)挑取20 個菌落,從9 cm 直徑LB 平板上,用MP57 引物和GIII 引物進(jìn)行菌落PCR(如果連接體系中每100 ng 載體的轉(zhuǎn)化效率低于5×105,或插入抗體片段的比例小于75%,則需要重新進(jìn)行酶切和連接)[14]。

        表1 VHH 片段PCR 擴(kuò)增引物

        1.2.5 mGluR5 特異性納米抗體的液相淘選

        將M13KO7 輔助噬菌體和文庫菌按20∶1 的量進(jìn)行混勻,在37 ℃的培養(yǎng)箱中孵育30 min,用3 200 g 離心10 min 棄去多余的噬菌體,再用2×YT/Amp/Kana 培養(yǎng)基,將菌重懸起來過夜培養(yǎng);次日3 200 g 離心取上清,用1/4 倍體積的PEG/NaCl 沉淀噬菌體0.5 h 后離心棄上清,用PBS 重懸噬菌體后測滴度備用[15]。用含5 μg/mL NeutrAvidin biotinbinding protein 的PBS 4 ℃過夜包被Maxisorp 96 孔板(每孔100 μL),棄去NeutrAvidin,用含1% BSA的Buffer(20 mM Tris-HCl pH 8.0,150 mM NaCl)洗5 次,加入2% BSA 封閉2 h,洗去BSA,實驗組加入5 μg/mL 抑制狀態(tài)的mGluR5 抗原稀釋液封閉30 min(對照組不加抗原),洗去抗原稀釋液,加入1×1012CFU/孔噬菌體稀釋液封閉2 h,洗去噬菌體封閉液,加入25 μg 胰酶消化30 min,加入1/20 體積的4 mg/mL AEBSF 來終止胰酶消化[16]。實驗組/對照組各取10 μL 洗脫噬菌體進(jìn)行10 倍梯度稀釋,測定Output 噬菌體的滴度。計算特異性結(jié)合的富集率,如需新一輪淘選,過程同上[17]。

        1.2.6 mGluR5 特異性納米抗體的鑒定

        從最后一輪淘選的TG1 大腸桿菌中隨機(jī)挑選單克隆制備母板,從制備的母板中吸取20 uL~1 mL的2×YT/Amp 刻培養(yǎng)基中,220 r/min、37 ℃培養(yǎng)5 h后加入IPTG 進(jìn)行過夜誘導(dǎo)表達(dá)納米抗體[18]。用含5 μg/mL NeutrAvidin biotin-binding protein 的PBS 4℃過夜包被Maxisorp 96 孔板(每孔100 μL),次日將菌液離心后棄去上清,每孔加入100 uL 的PBS進(jìn)行反復(fù)凍融裂解細(xì)菌,離心后取上清備用;用含1% BSA 的buffer(20 mM Tris-HCl pH 8.0,150 mM NaCl)將過夜包被的96 孔板洗5 次,加入2% BSA封閉2 h,洗去BSA,加入5 μg/mL 抑制狀態(tài)的mGluR5 抗原稀釋液封閉30 min;洗去未結(jié)合的抗原,加入備用的納米抗體孵育1 h,加入Mouse Anti-HA-tag Antibody 稀釋液孵育1 h;洗去一抗加入HRP Goat Anti-mouse IgG(H+L)稀釋液孵育1 h,洗去二抗采用ELISA-TMB 顯色試劑盒進(jìn)行顯色[19]。用SpectraMax M5 Microplate reader 在450 nm 處讀取光吸收值,將吸收值大于對照組3 倍以上的納米抗體進(jìn)行測序,用Vector NTI 軟件對堿基序列進(jìn)行分析[20]。

        2 結(jié)果討論

        2.1 mGluR5 真核表達(dá)載體的構(gòu)建

        mGluR5 片段大小為2 529 bp,將mGluR5 片段進(jìn)行PCR 擴(kuò)增后,用1%的凝膠進(jìn)行電泳驗證結(jié)果(圖1a)與目的條帶相符合,將mGluR5 片段構(gòu)建到CMV-Flag 載體中(圖1b),進(jìn)行菌落PCR 驗證的結(jié)果(圖1c)。

        2.2 mGluR5 的表達(dá)純化

        將蛋白表達(dá)后融膜進(jìn)行純化,用Superose 6,10/300 GL 柱進(jìn)行分離(圖2a),將鋒尖蛋白跑SDSPAGE 凝膠電泳確認(rèn)蛋白大小,確認(rèn)鋒尖蛋白為目的蛋白(圖2c),經(jīng)吸附過后A835 包裝后的蛋白過superose 6 柱子(圖2b)進(jìn)行分離,將鋒尖蛋白跑SDS-PAGE 凝膠電泳進(jìn)行確認(rèn)(圖2d),確認(rèn)鋒尖蛋白為目的蛋白收集峰尖蛋白,將濃縮至一定濃度,加甘油分裝凍存。

        2.3 噬菌體展示抗體庫的構(gòu)建及庫容的測定

        對分離后的淋巴細(xì)胞總RNA 進(jìn)行提取,RNA提取結(jié)果如圖3a,用巢式PCR 對250~500 bp 之間的VHH 片段進(jìn)行擴(kuò)增(圖3b),將擴(kuò)增后的片段插到pMECS 噬菌粒載體中,通過電轉(zhuǎn)化將構(gòu)建好的質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到TG1 電感受態(tài)細(xì)胞中,進(jìn)行噬菌體展示抗體庫的構(gòu)建;通過測量大腸桿菌轉(zhuǎn)化的效率對庫容進(jìn)行計算5.47×108CFU/mL,陽性率為95%(圖3c)。

        2.4 mGluR5 特異性納米抗體的液相淘選

        利用抑制狀態(tài)的mGluR5 對構(gòu)建的噬菌體展示抗體庫進(jìn)行液相淘選,經(jīng)過兩輪的富集淘選,實驗組比對照組的富集度達(dá)到了30 倍(圖4a),用最后一輪洗脫的噬菌體侵染TG1 大腸桿菌,按合適的倍數(shù)進(jìn)行稀釋,涂布到150 mm 的2×YT/Amp/Glu 平板上,隨機(jī)挑取190 個單克隆進(jìn)行納米抗體的粗表達(dá),通過Elisa 進(jìn)行驗證結(jié)合,淘選出12 個讀數(shù)較高的納米抗體,用Vector NTI 對納米抗體進(jìn)行序列分析(圖4b)。

        3 討論

        純化出抑制狀態(tài)的mGluR5,通過免疫雙峰駝構(gòu)建了庫容為5.47×108CFU/mL 陽性率為95%的噬菌體文庫,并通過噬菌體展示技術(shù),篩選出了12 個不同的陽性克隆。本研究獲得的高親和力納米抗體可以為研究mGluR5 蛋白的性質(zhì)和介導(dǎo)的信號通路提供很好的納米抗體工具,為mGluR5 的深層次研究奠定了基礎(chǔ)。

        mGluR5 是信號通路中的一個重要蛋白,調(diào)控著眾多信號傳導(dǎo),通過作用于它,可以治療很多相關(guān)疾病,順利構(gòu)建純化出人的抑制型mGluR5 蛋白;利用包裹A8-35 的方法對蛋白進(jìn)行生物素化,很好地避免了淘選時對蛋白表位的遮擋,通過多次液相淘選,可以篩選出各個表位、高親和力的納米抗體。傳統(tǒng)的抗體體積都比較大,納米抗體具有體積小特異性強(qiáng)等特點,可以更好地與mGluR5 蛋白結(jié)合并且減少對蛋白結(jié)構(gòu)性質(zhì)的影響;筆者成功免疫雙峰駝篩選出抑制型mGluR5 蛋白的納米抗體,為后續(xù)研究mGluR5 奠定了基礎(chǔ)。

        mGluR5 蛋白是一個很有潛力的靶點,直接作用于它是比較困難的,現(xiàn)有的一些激動劑或抑制劑都有一定的局限性,可以通過改造與mGluR5 蛋白特異性結(jié)合的納米抗體來間接作用于它,開發(fā)和運用一些具有高選擇性的激動劑和拮抗劑。這為研究mGluR5 蛋白的性質(zhì)和介導(dǎo)的信號通路提供了方法,可以推動mGluR5 與中樞神經(jīng)系統(tǒng)疾病的研究,為神經(jīng)系統(tǒng)疾病的治療提供新思路,最終能夠達(dá)到治療疾病的目的。

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