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        糯紅高粱苗期的內(nèi)生酵母菌多樣性分析

        2023-10-23 08:14:10劉雯雯胡連清周萬海琴馮瑞章蒙昌廷張淑瑤
        核農(nóng)學(xué)報 2023年11期
        關(guān)鍵詞:紅高粱高通量內(nèi)生

        劉雯雯 胡連清 周萬海 , 魏 琴馮瑞章 趙 鑫 蒙昌廷 張淑瑤

        (1宜賓學(xué)院,四川省油樟工程技術(shù)研究中心,四川 宜賓 644007;2宜賓學(xué)院,農(nóng)林與食品工程學(xué)部,四川 宜賓 644007)

        糯性高粱主要栽培于我國西南地區(qū)(四川、貴州和重慶)[1],其中四川宜賓的糯紅高梁屬國家地理標志保護農(nóng)產(chǎn)品,在釀酒逆反應(yīng)中具有易糊化和易發(fā)酵的優(yōu)勢,這一釀造原料品質(zhì)形成可能與其內(nèi)部微生物組成有著密不可分的關(guān)系[2]。但目前關(guān)于高粱的研究主要集中在營養(yǎng)成分分析和對白酒品質(zhì)的影響等,極少關(guān)注影響植株生長發(fā)育和品質(zhì)形成的內(nèi)生菌,特別是內(nèi)生酵母菌的組成和功能。

        近年來,在冰川[3]、湖泊[4]及昆蟲[5]等中相繼發(fā)現(xiàn)了內(nèi)生酵母新種,許多學(xué)者開始關(guān)注內(nèi)生酵母并開展相關(guān)研究。植物內(nèi)生酵母是定殖于健康植物組織細胞中,不會對宿主植物造成任何損害且形成互惠互利關(guān)系的微生物[6]。宿主植物為內(nèi)生酵母提供營養(yǎng)且穩(wěn)定的環(huán)境條件,而內(nèi)生酵母通過分泌代謝產(chǎn)物增強植物對不利條件的抵抗能力,保護植物免受病原體的侵襲、維持植株健康狀態(tài)[7]。同一植物中內(nèi)生酵母菌的數(shù)量和多樣性相對內(nèi)生細菌均較少,但酵母菌更易分離培養(yǎng)且長期儲存,在抵抗植物病原體、促進作物生長方面更具優(yōu)勢[8]。植物組織、品種和外部自然環(huán)境等是影響內(nèi)生酵母菌數(shù)量和菌屬組成的關(guān)鍵因素[9],且已有研究證明,內(nèi)生酵母可生產(chǎn)抗菌劑和生物催化劑等生物化學(xué)品,也影響著決定白酒風(fēng)味和特色的原料品質(zhì)[10]。因此,對植物內(nèi)生酵母展開研究具有較大應(yīng)用價值。雖然目前關(guān)于內(nèi)生微生物的研究呈熱門趨勢,但有關(guān)植物內(nèi)生酵母菌的相關(guān)報道仍較少,且在已有研究中,多為冬季小麥[11]、煙草植物[7]、奇異果[12]等物種的報道,而高粱微生物探究更多側(cè)重于環(huán)境、根際土和內(nèi)生細菌等[13-14]。微生物種類研究中的純培養(yǎng)法不能完整揭示內(nèi)部微生物群落組成,但可獲得純菌株用于微生物生理和代謝研究[15]。而高通量測序技術(shù)能更全面且準確地反映微生物群落構(gòu)成和多樣性,從而檢測到難以培養(yǎng)的微生物[16]。

        基于此,本試驗借助傳統(tǒng)純培養(yǎng)法和高通量測序技術(shù)對宜賓地區(qū)五糧濃香型白酒釀造專用糧—糯紅高粱(雜交種金糯粱1 號和地方種青殼洋)苗期不同組織內(nèi)生酵母菌種類、群落多樣性展開研究,并對分離菌株產(chǎn)酶功能進行初篩,旨在揭示糯紅高梁中內(nèi)生酵母菌群落組成,挖掘潛在具有較高生產(chǎn)價值的內(nèi)生菌株資源。

        1 材料與方法

        1.1 試驗材料

        糯紅高粱品種:雜交種金糯粱1號(A)和地方種青殼洋(B),種植于四川省宜賓市宜賓學(xué)院川茶學(xué)院試驗農(nóng)場(東經(jīng)104°36′33″,北緯28°47′41″),種植和栽培管理技術(shù)采用當?shù)嘏醇t高粱常規(guī)方法,待植株長出2 葉后(即苗期),分別采集2 個品種健康的根(R)、莖(S)、葉(L)組織于無菌自封袋中,冷鏈運至實驗室。在超凈工作臺將植物組織取出,根部按照下述步驟完成表面無菌化處理:流水60 min,無菌水2 次,75%乙醇1 min,無菌水1次,5% NaClO 3 min,75%乙醇1 min;莖部為:流水60 min,無菌水2次,75%乙醇0.5 min,無菌水1 次,4% NaClO 4 min,75%乙醇20 s;葉部為:流水60 min,無菌水2 次,75%乙醇20 s,無菌水1 次,3%NaClO 3 min,75%乙醇20 s。將材料分成2 等份,1 份4 ℃條件下保存,用于純培養(yǎng)法分離菌株;1份勻漿后置于-80 ℃超低溫冰箱中保存,用于基因組DNA 提取和高通量測序。

        1.2 試驗方法

        1.2.1 糯紅高梁可培養(yǎng)內(nèi)生酵母菌的分離與鑒定無菌條件下用手術(shù)刀分別將金糯粱1號和青殼洋的根、莖、葉組織切成長約1 cm 小段、1 cm 小段和0.5 cm×0.5 cm 小片,接種至酵母膏胨葡萄糖(yeast extract peptone dextrosem,YPD)瓊脂培養(yǎng)基上,每個平板5個樣品,置于28 ℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。待長出菌落后,挑選單菌落進行分離純化,直至獲得純凈菌株。同時采用顯微鏡檢法剔除部分菌株,記錄數(shù)量。

        形態(tài)學(xué)和生理生化特性鑒定參照《酵母菌的特征與鑒定手冊》[17],將純化菌株劃線接種于Wallerstein Laboratory 營養(yǎng)瓊脂(wallerstein laboratory nutrient,WLN)上,28 ℃倒置培養(yǎng)10 d。記錄酵母菌落在WLN平板上的顏色、形態(tài)、透明度、質(zhì)地、隆起狀態(tài),完成形態(tài)類型分類。根據(jù)《微生物分類學(xué)》[18]中酵母菌鑒定項目測定菌株的生理生化指標。

        26SrDNA D1/D2 區(qū)序列擴增分析:取50 μL Lysis Buffer for Microorganism to Direct PCR(TaKaRa,日本)裂解液于無菌離心管中,用接種環(huán)挑取少量單菌落到離心管中輕輕攪拌搖勻。80 ℃水浴加熱15 min,低速離心,取上清液進行基因序列PCR 擴增。引物為NL1(5′-GTAGTCATATGCTTGTCTC-3′)、NL4(5′-CTTCCGTC AATTCCTTTAAG-3′)。PCR體系為50 μL:10 mmol·L-1引物NL1 和NL4 各1 μL,DNA 模板5 μL,Premix Taq(Ex Taq Version 2.0) 25 μL,ddH2O 18 μL。PCR 程序:94 ℃預(yù)變性10 min,94 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸45 s,30 個循環(huán);72 ℃延伸10 min。1%瓊脂糖凝膠擴增目標產(chǎn)物后,送上海生工生物公司測序。在NCBI BLAST 數(shù)據(jù)庫中比對DNA 序列,選取同源性較高的相關(guān)菌株26S rDNA D1/D2 區(qū)域序列作為參比分析對象[19]。

        1.2.2 糯紅高梁可培養(yǎng)內(nèi)生酵母產(chǎn)酶特性測定 純化好的菌株接種于待測培養(yǎng)基上,28 ℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。淀粉酶篩選需用0.1%碘液染色,5 min 內(nèi)觀察菌落周圍透明圈情況;蛋白酶、脂肪酶篩選直接通過觀察菌落周圍是否存在透明圈;果膠酶篩選用10 g·L-1的十六烷基三甲基溴化銨(cetyltrimethylammonium bromide,CTAB)溶液淹沒培養(yǎng)皿,觀察菌落周圍的光暈;纖維素酶篩選用0.3 g·L-1剛果紅染色后觀察菌落周圍是否有透明圈;酯酶篩選通過觀察菌落周圍的沉淀物(不透明的暈);以上情況若存在透明圈或不透明暈則為陽性[20]。

        1.2.3 糯紅高梁內(nèi)生酵母DNA 提取與PCR 擴增、測序 內(nèi)生酵母總DNA 使用E.Z.N.A.@ Soil DNA Kit試劑盒(Omega Bio-Tek,Inc.,美國)進行提取,使用GeneAmp?9700 型PCR 儀(ABI,美國)進行DNA 擴增試驗。對酵母菌26S rDNA D1/D2 區(qū)進行擴增,引物為NL1F(5′-GCATATCAATAAGCGGAGGAAAAG-3′)、NL2R(5′-CTTGTTCGCTATCGGTCTC-3′)。體系共20 μL:5×FastPfu Buffer 4 μL,2.5 mmol·L-1dNTPs 2 μL,5 μmol·L-1正反引物各0.8 μL,F(xiàn)astPfu Polymerase 0.4 μL,BSA 0.2 μL,模板DNA 10 ng,ddH20 補至20 μL。PCR 程序:95 ℃預(yù)變性3 min,95 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸45 s,30個循環(huán);72 ℃終延伸10 min。2%瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR產(chǎn)物。PCR擴增及高通量測序工作由上海美吉公司完成。

        1.2.4 數(shù)據(jù)分析 基于上海美吉生物I-Sanger云平臺完成生物信息學(xué)分析。使用fastp(v 0.19.6)對原始序列進行質(zhì)控,F(xiàn)lash(v 1.2.11)通過重疊拼接樣品pairend 雙端序列。Uparse(v 11)根據(jù)97%相似度對序列進行OTU 聚類并剔除嵌合體。通過Mothur(v 1.30.2)和Qiime(v 1.9.1)計算Alpha 多樣性和Beta 多樣性距離矩陣,在ANOSIM 組間差異檢驗下進行非度量多維尺度(non-metric multidimensional scaling,NMDS)分析。使用LEfSe 分析確定引起微生物群落結(jié)構(gòu)組間差異的指示菌。利用FUNGuild(v 1.0)對內(nèi)生酵母菌分類進行注釋。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 糯紅高粱可培養(yǎng)內(nèi)生酵母菌的分離與鑒定

        2.1.1 內(nèi)生酵母菌的分離純化 從2 個糯紅高梁品種不同組織中共分離到36 株酵母菌(電子附表1),其中金糯粱1 號27 株,青殼洋9 株。按照組織劃分,根、莖、葉分別分離到6、7、23 株酵母菌。不同酵母菌在WLN培養(yǎng)基上的菌落形態(tài)差異明顯(圖1)。根據(jù)菌落差異性又可將36 株酵母菌初步分為9 類(Ⅰ~Ⅸ),菌落呈粉色、白色、黃色、綠色等(表1),Ⅲ類菌株數(shù)目最多。利用不同類型酵母菌對不同碳源分解能力的不同進行生理生化試驗,根據(jù)發(fā)酵產(chǎn)生氣體和菌液渾濁程度進行區(qū)別(電子附表2),可知GA6、GA7、GA8等22 株菌在有氧條件下可同化半乳糖、麥芽糖、蔗糖、棉籽糖、木糖醇、松三糖等碳源,而不能利用葡萄糖和乳糖。GA40和GA50表現(xiàn)的生理生化結(jié)果相同,GB95和GB105 菌株結(jié)果相同,其他菌株同化特征具有獨特性。Ⅲ和Ⅳ類酵母菌在WLN 培養(yǎng)基上顏色相同,形態(tài)略有差異,形態(tài)Ⅲ表面光滑,而形態(tài)Ⅳ表面褶皺,但屬于此2 類菌株的碳源同化試驗結(jié)果一致,可能為相同屬。

        圖1 內(nèi)生酵母菌在WLN培養(yǎng)基上的形態(tài)(標尺=5 mm)Fig.1 Colony morphology of endophytic yeasts isolated on WLN medium(Scale bar=5 mm)

        表2 內(nèi)生酵母菌的26S rDNA D1/D2序列分析結(jié)果Table 2 Analysis results of 26S rDNA D1/D2 sequence of the endophytic yeasts

        2.1.2 內(nèi)生酵母菌26S rDNA D1/D2區(qū)序列分析 通過對36 株內(nèi)生酵母菌26S rDNA D1/D2 序列測序比對及前期的菌株形態(tài)學(xué)、生理生化結(jié)果可知(表2),形態(tài)Ⅰ的分子鑒定結(jié)果為紅酵母菌屬(Rhodotorula)、Symmetrospora、囊擔(dān)菌屬(Cystobasidium),形態(tài)Ⅲ的分子鑒定結(jié)果為隱球菌屬(Cryptococcus)、漢納酵母菌屬(Hannaella),形態(tài)Ⅴ的分子鑒定結(jié)果為Naganishia和囊擔(dān)菌屬。鑒定為淺黃隱球酵母的形態(tài)分布于Ⅲ、Ⅳ、Ⅵ、Ⅶ、Ⅸ類。36株內(nèi)生酵母菌隸屬于1 門3 綱5 目6 科7 屬10 種,分別為紅酵母菌屬(2 種)、Symmetrospora(1 種)、囊擔(dān)菌屬(2 種)、擲孢酵母菌屬(Sporobolomyces)(1 種)、隱球菌屬(2 種)、漢納酵母菌屬(1 種)和Naganishia(1 種),其中優(yōu)勢門為擔(dān)子菌門,優(yōu)勢種為淺黃隱球酵母。金糯粱1 號27 株菌株隸屬于1 門3 綱3 目4 科5 屬,屬類包括隱球菌屬、漢納酵母菌屬、紅酵母菌屬、擲孢酵母菌屬、囊擔(dān)菌屬;青殼洋9 株菌株隸屬于1 門3 綱4 目4 科4 屬,屬類包括Symmetrospora、紅酵母菌屬、Naganishia、隱球菌屬,兩個品種共有屬為隱球菌屬、紅酵母屬。按照組織分類,高粱根部6 株酵母菌均為隱球菌屬;莖部7 株酵母菌隸屬于1 門3 綱4 目5 科6屬,屬類包括隱球菌屬、漢納酵母菌屬、Naganishia、囊擔(dān)菌屬、紅酵母屬、擲孢酵母菌屬;葉部23 株酵母菌隸屬于1門3綱4目5科5屬,屬類包括隱球菌屬、漢納酵母菌屬、紅酵母菌屬、囊擔(dān)菌屬、Symmetrospora,隱球菌屬為根莖葉共有屬。

        2.1.3 可培養(yǎng)內(nèi)生酵母菌產(chǎn)酶特性測定 36 株內(nèi)生酵母菌產(chǎn)淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶、果膠酶、纖維素酶和酯酶功能特性測定結(jié)果如表3 和電子附圖2 所示,GA1、GB4、GB13、GA21、GB46和GA78產(chǎn)酶功能最多,均能產(chǎn)生4種酶,前5株菌能產(chǎn)生蛋白酶、脂肪酶、果膠酶和纖維素酶,GA78能產(chǎn)生淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶和酯酶,隱球菌屬菌株在產(chǎn)酶功能菌株中占比最多,為58.82%。

        圖2 糯紅高粱不同品種和不同組織內(nèi)生酵母菌群Alpha多樣性分析Fig.2 Alpha diversity analysis of endophytic yeasts in different varieties and tissues of waxy sorghum

        表3 內(nèi)生酵母菌產(chǎn)功能酶特性Table 3 endophytic yeasts with functional enzyme activities

        2.2 糯紅高粱內(nèi)生酵母菌高通量測序結(jié)果

        2.2.1 樣品分類操作單元(operational taxonomic units,OTU)分析 對糯紅高粱不同品種和組織樣本進行高通量測序,原始序列經(jīng)序列質(zhì)量控制后共得到380 602條高質(zhì)量測序標簽(clean tags),序列平均長度269 bp。根據(jù)97%相似性聚類,共獲得111 個非重復(fù)OTU,隸屬于2門83屬。其中,金糯粱1號48個OTU,隸屬于2 門36屬,青殼洋99 個OTU,隸屬于2 門76 屬,兩者共有OTU 36 個,特有的OTU 分別為12 和63 個。按照組織分類,根、莖、葉各有OTU 數(shù)為59、75、29 個,其三者共有OTU 8個,特有OTU分別為30、34、3個。

        2.2.2 糯紅高粱內(nèi)生酵母菌Alpha 和Beta 多樣性分析 Alpha 多樣性分析表明,不同糯紅高粱品種和不同組織的酵母菌群落存在差異(圖2)。在品種方面,菌群豐富度Chao 指數(shù)、Sobs 指數(shù)及菌群多樣性Shannon指數(shù)、Simpson指數(shù)均無顯著性差異,且青殼洋Chao 指數(shù)和Sobs 指數(shù)大于金糯粱1 號,說明青殼洋物種總數(shù)相對較多。就組織而言,Chao 指數(shù)、Sobs 指數(shù)和Shannon 指數(shù)在根莖葉間無顯著性差異,但根部Simpson 指數(shù)顯著大于莖部(P=0.020)。Beta多樣性基于ANOSIM組間差異檢驗下的NMDS 分析(圖3),發(fā)現(xiàn)品種間內(nèi)生酵母菌菌群結(jié)構(gòu)存在差異(R=0.026 2,P=0.356),但不顯著,組織間內(nèi)生酵母菌菌群結(jié)構(gòu)存在顯著性差異(R=0.386 0,P=0.001)。品種分組和組織分組對內(nèi)生酵母菌菌群結(jié)構(gòu)的差異均具有一定的解釋意義(stress=0.146、0.149)。

        2.2.3 糯紅高粱內(nèi)生酵母菌群落結(jié)構(gòu)分析 通過圖4可知,在門分類水平上,金糯粱1 號中豐度最高門類為未分類菌門(93.71%),青殼洋中豐度最高門類為子囊菌門(Ascomycota,42.42%)和擔(dān)子菌門(26.82%)。從組織分析,根部豐度最高門類為未分類菌門(74.32%),莖部和葉部豐度最高門類分別為擔(dān)子菌門(52.50%)和子囊菌門(54.01%)。在屬分類水平上,金糯粱1號中相對豐度最高的屬為未分類菌屬(93.41%);青殼洋中相對豐度占比大于4%的菌屬依次為未分類菌屬(30.73%)、鐮刀菌屬(Fusarium,19.39%)、絲孢酵母菌屬(Trichosporon,14.43%)和籃狀菌屬(Talaromyces,4.50%);2個品種共有內(nèi)生酵母屬為29個。按照組織而言,根中優(yōu)勢屬為未分類菌屬(74.32%),絲孢酵母菌屬(27.62%)是莖部優(yōu)勢屬,刺盾炱目未分類屬(unclassified Chaetothyriales,27.27%)是葉部優(yōu)勢屬。3個組織共有內(nèi)生酵母屬為枝孢菌屬(Cladosporium)、Cutaneotrichosporon、Pseudozyma、小球腔菌屬(Leptosphaeria)、Microsphaeropsis、Plectosphaerella、鐮刀菌屬、子囊菌門未分類屬和未分類菌屬。因此,苗期糯紅高粱內(nèi)生酵母的群落組成和相對豐度在品種和組織間存在明顯差異。

        圖4 基于門(A、B)和屬(C、D)水平的糯紅高粱不同品種和不同組織內(nèi)生酵母菌群落結(jié)構(gòu)分析Fig.4 Endophytic yeasts community structure analysis in different varieties and tissues of waxy sorghum based on phylum(A,B) and genus(C,D) level

        2.2.4 糯紅高粱內(nèi)生酵母菌菌群差異分析 LEfSe多級物種層級分析結(jié)果顯示(圖5),刺盾炱目未分類科和屬在金糯粱1 號中占相對優(yōu)勢;微球黑粉菌綱(Microbotryomycetes)在青殼洋中具有相對優(yōu)勢。按照組織分類,根中糞殼菌綱(Sordariomycetes)、肉座菌目(Hypocreales)、Nectriaceae 等12 個菌類占相對優(yōu)勢;Pichiaceae、擔(dān)子菌門和Pichia等8個菌類在莖部樣本中占相對優(yōu)勢;Tremellales、Rhynchogastremataceae、囊擔(dān)菌屬等6 個菌類在葉部樣本中占相對優(yōu)勢,且這26 個菌類在不同組織間存在明顯差異。

        圖5 糯紅高粱不同品種(A)和不同組織(B)內(nèi)生酵母菌菌群差異分析Fig.5 Microbial community difference analysis of endophytic yeasts in different varieties(A)and tissues(B) of waxy sorghum

        2.2.5 糯紅高粱內(nèi)生酵母菌菌群功能差異分析 基于FUNGuild 數(shù)據(jù)庫解析高粱2個品種和3個組織內(nèi)生酵母菌的營養(yǎng)型和生態(tài)功能類別,僅選擇可信等級為“可能”和“極可能”的OTU 和分類單元進行分析。由表4 可知,內(nèi)生酵母菌營養(yǎng)模式可分為6 種,分別為病理型、腐生型、共生型、病理-腐生型、病理-共生型和腐生-共生型。同時可分為16 個生態(tài)功能群,金糯粱1 號和青殼洋共有營養(yǎng)型5 種,共有生態(tài)功能群5 種,其中青殼洋獨有功能群相對多。按照組織分類,根、莖、葉共有營養(yǎng)型2 個,共有生態(tài)功能群2 個。不同組織樣本獨有功能群存在差異,其中莖獨有功能群最多,葉獨有功能群最少,僅有“植物病理菌群”的Eballistra、“真菌寄生菌群”的囊擔(dān)菌屬。

        表4 糯紅高粱不同品種和不同組織內(nèi)生酵母菌菌群功能結(jié)構(gòu)Table 4 Functional structure of endophytic yeasts in different varieties and tissues of waxy sorghum

        3 討論

        本研究基于純培養(yǎng)方法和高通量測序技術(shù),首次對苗期的糯紅高粱內(nèi)生酵母菌群展開分析和鑒定,結(jié)果發(fā)現(xiàn),利用傳統(tǒng)純培養(yǎng)法僅分離到36株內(nèi)生酵母菌,優(yōu)勢屬為隱球菌屬,分離結(jié)果受品種和組織影響,相對高通量測序技術(shù),純培養(yǎng)方法具有一定局限性[21]。高通量測序雖檢測到隱球菌屬,但豐度較低,且發(fā)現(xiàn)存在大量未在純培養(yǎng)方法中獲得的內(nèi)生酵母菌。本研究通過2 種技術(shù)均顯示金糯粱1 號內(nèi)生酵母菌群落多樣性小于青殼洋,高粱莖部內(nèi)生酵母菌群落多樣性大于根部和葉部,莖部與根部差異顯著,但韓毅強等[14]研究表明寒區(qū)高粱根部的內(nèi)生真菌群落豐富度和多樣性最高,這可能與研究材料和生長環(huán)境差異有關(guān)。隸屬于擔(dān)子菌門和子囊菌門的酵母菌可棲居在多種極端環(huán)境中,許多純培養(yǎng)相關(guān)報道獲得的內(nèi)生酵母菌屬于這兩大門類[22],本研究也顯示類似結(jié)果。進一步分析發(fā)現(xiàn)不同組織擔(dān)子菌門和子囊菌門酵母菌數(shù)量存在差異,如葉部純培養(yǎng)內(nèi)生酵母中擔(dān)子菌門菌株數(shù)多于子囊菌門菌株,與Khunnamwong 等[23]和Into 等[24]研究一致,但高通量測序結(jié)果顯示,葉部擔(dān)子菌門酵母菌株數(shù)略低于子囊菌門,可能與分離培養(yǎng)設(shè)置條件較少有關(guān),后續(xù)還應(yīng)展開探討。糯紅高粱中還發(fā)現(xiàn)了隱球菌屬、擲孢酵母菌屬和紅酵母屬、Saccharomyces和Pichia等較為常見且研究相對多的內(nèi)生酵母屬[25],紅酵母屬能通過產(chǎn)生大量類胡蘿卜素抵抗外界不良環(huán)境[6]。Saccharomyces可直接影響酒類產(chǎn)量和風(fēng)味[26],被應(yīng)用于生物醫(yī)藥、食品、生物能源等領(lǐng)域。Pichia能利用葡萄糖代謝產(chǎn)生乙酸、乙酸乙酯及高級醇等風(fēng)味物質(zhì)[27]。羅方雯等[28]通過純培養(yǎng)法和高通量技術(shù)從茅臺鎮(zhèn)醬香白酒釀造大曲和環(huán)境中篩選到紅酵母屬、隱球菌屬、Saccharomyces和Pichia等酵母菌,與本研究獲得的菌株有相同之處。高通量測序分析菌群結(jié)構(gòu)可知,金糯粱1 號和根部未知類占比較大,說明該品種和根部有較多未知內(nèi)生酵母菌資源有待深入挖掘,部分未能清晰定性到屬種的酵母菌,將展開深入解析研究。

        FUNGuild 數(shù)據(jù)庫分析發(fā)現(xiàn),不同品種和不同組織間獨有功能群數(shù)差異較大。借助生物多樣性保險效應(yīng)理論[29],內(nèi)生酵母營養(yǎng)型功能為宿主適應(yīng)外界不良環(huán)境和形成特異品質(zhì)提供可能[30]。青殼洋獨有功能群多于金糯粱1 號,莖獨有功能群最多,這與被研究品種特征差異較大是相一致的,但相關(guān)機制還需深入探討。值得注意的是,F(xiàn)UNGuild 數(shù)據(jù)庫僅將絲孢酵母菌屬和Beauveria2 個屬定義為動物病原菌。已有研究顯示某些動物病原菌可跨界侵染不同生物寄主,如高通量分析測定的籃狀菌屬,它可引起人類出現(xiàn)暗色絲孢霉?。?1],因此該菌株應(yīng)被定義為動物病原菌群。擲孢酵母菌屬被定義為病原-腐生菌,存在于葉和莖中,部分研究表明擲孢酵母菌屬可從蘋果、葡萄等植株的葉片、花和果實中分離得到,造成植物出現(xiàn)病變,但又是促進生物體抗性增加的調(diào)控因子[32]。病理型功能群在高粱組織中菌株數(shù)排序為莖>葉>根,表明病理型功能群在生長旺盛的組織中菌株數(shù)較多,可能因莖和葉片具有較高營養(yǎng)物質(zhì)有關(guān)[33]。腐生型功能菌群在根部占比較高,推測可能由于土壤中腐生菌群種類繁多,根長期直接接觸土壤引起腐生型功能菌群的轉(zhuǎn)移[34],且腐生型真菌可產(chǎn)生一系列水解酶和氧化酶,有助于碳水化合物的分解,與有機物分解和養(yǎng)分循環(huán)相關(guān)密切,后續(xù)可隨著純培養(yǎng)功能菌株的深入發(fā)掘,進一步明確糯紅高粱內(nèi)生酵母菌的功能。

        內(nèi)生酵母主要依靠新陳代謝與分泌胞外酶等方式適應(yīng)宿主環(huán)境[35],同時胞外酶能穩(wěn)定存在于常溫環(huán)境中,具有較高催化能力。目前,已有研究對產(chǎn)不同胞外酶的內(nèi)生酵母菌進行分離純化并投入應(yīng)用[36]。本試驗中,36 株酵母菌有17 株至少產(chǎn)生1 種及1 種以上的胞外酶,其中金糯粱1 號株數(shù)明顯多于青殼洋株數(shù),具有產(chǎn)胞外脂肪酶功能的菌株最多,產(chǎn)淀粉酶、果膠酶和纖維素酶的菌株數(shù)最少。這與李治瀅等[37]對云南異龍湖中酵母菌篩選產(chǎn)胞外酶活性結(jié)果部分相似,該研究也發(fā)現(xiàn)82 株具有產(chǎn)胞外酶功能的菌株中產(chǎn)脂肪酶的最多,說明糯紅高粱中存在可水解脂類、淀粉、果膠、纖維素、蛋白質(zhì)等天然化合物的酵母菌,參與植株營養(yǎng)吸收和有機物循環(huán),具有重要的生態(tài)功能。

        4 結(jié)論

        采用傳統(tǒng)微生物純培養(yǎng)法和高通量測序法研究了宜賓地區(qū)釀酒專用糯紅高粱不同品種和不同組織中內(nèi)生酵母菌的群落結(jié)構(gòu)和多樣性,結(jié)果表明,不同品種和組織中蘊含豐富的內(nèi)生酵母菌資源,具有極大的功能多樣性。不同品種和不同組織的酵母菌群落多樣性和組成存在差異和共性,其中雜交種金糯粱1 號群落多樣性小于地方種青殼洋,莖部內(nèi)生酵母菌群落多樣性大于根部和葉部,但金糯粱1 號和根部存在更多未知和不可培養(yǎng)菌種。后續(xù)應(yīng)加大測序深度和優(yōu)化可培養(yǎng)條件獲得更多有利微生物資源,并對功能性菌株開展應(yīng)用研究。

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