楊戎戈李梓薇黃林源王晶晶趙林林尹景偉羊曄王靜文張艷
(1.江蘇省水文水資源勘測局揚州分局,江蘇 揚州 225000;2.揚州大學/江蘇省作物遺傳生理重點實驗室/江蘇省作物栽培生理重點實驗室/江蘇省糧食作物現(xiàn)代產(chǎn)業(yè)技術(shù)協(xié)同創(chuàng)新中心,江蘇 揚州 225009;3.揚州文水科技咨詢有限公司,江蘇 揚州 225000)
草莓為薔薇科(Rosaceae)草莓屬(Fragaria)多年生常綠草本植物,草莓因外觀美觀,口感鮮嫩多汁,有“水果皇后”“水果牛奶”之美譽[1],其含有豐富的蛋白質(zhì)、維生素B1、維生素B2、維生素C,每100g新鮮果實里約含有60mg維生素C,以及有機酸如水楊酸、檸檬酸。草莓還含有草莓胺,具有很好的藥用價值。中國的草莓野生資源豐富程度世界排行第1,生產(chǎn)面積最大[2]。本試驗選用“紅顏”草莓品種,由日本引進,果實形狀為長圓錐形,此品種休眠淺,產(chǎn)量相對較大。
灰霉病是草莓生長成熟及采收貯藏中極易發(fā)生病害之一。草莓灰霉病是由灰葡萄孢菌(Botrytis cinerea.)引起的病害,主要為害草莓葉片、莖、花以及果實部分,也對年產(chǎn)量和草莓的外觀品質(zhì)影響嚴重[3]?;移咸焰呔哂猩L繁殖迅速,易抗藥,在0℃以下依然繁殖的特點[4,5]。本試驗過程中,感染灰霉病的草莓果實果肉變軟逐漸腐爛,果實表面生出灰褐色霉狀斑點,未成熟的果實病變時,草莓果實會顯現(xiàn)出淡褐色干枯病斑,轉(zhuǎn)至呈干腐狀[6]。草莓生產(chǎn)過程中,此病菌普遍發(fā)生于果實轉(zhuǎn)色期到果實成熟期,12個月可危害30%~80%,病情逐漸嚴重[7],后期為害嚴重會導(dǎo)致草莓減產(chǎn)10%~50%[6-8]。此病菌不經(jīng)控制會對草莓栽培造成極大的經(jīng)濟損失。
本試驗分析旨在于防治灰霉病的方法,篩選優(yōu)良抗病的草莓品種,為未來抗病基因研究鋪設(shè)道路。
草莓的品種豐富,本試驗挑選八倍體草莓品種“紅顏”(Fragaria×ananassa Duch.‘Benihoppe’)作為試驗材料。2016年11月27日—12月24日,于江蘇農(nóng)林職業(yè)技術(shù)學院北校區(qū)連棟溫室大棚內(nèi)進行試驗,大棚內(nèi)白天溫度在13~21℃,夜間溫度在9~15℃。此期間,草莓生長狀態(tài)良好,無病蟲危害。
灰霉菌的培養(yǎng)方法:所用灰霉菌(Botrytis cinerea)由江蘇農(nóng)林職業(yè)技術(shù)學院農(nóng)學園藝系試驗田所得。使用馬鈴薯葡萄糖瓊脂培養(yǎng)基(PDA培養(yǎng)基)為病菌培養(yǎng)基。
在PDA培養(yǎng)基上接種用常規(guī)方法純化后的灰霉菌,放入恒溫箱培養(yǎng)14d(25℃)。處理果實,應(yīng)將培養(yǎng)基在超凈工作臺上切下并放入裝有至少100mL無菌水的錐形瓶中,打開2個灰霉病培養(yǎng)基,將錐形瓶中的無菌水分別均勻倒入2個培養(yǎng)基中。用玻璃棒輕輕刮蹭培養(yǎng)基表面的灰霉菌核。將菌液倒入錐形瓶中。將培養(yǎng)基戳碎,倒入錐形瓶中。用干凈的塑料紙封住瓶口,皮筋扣住。將菌液放在震蕩器搖床上震蕩10min。用4層紗布過濾,顯微鏡鏡檢調(diào)整,制備懸浮液(孢子懸浮濃度為1×105cfu·mL-1),用于接種果實。
1.2.1 灰霉菌處理對不同發(fā)育時期草莓果實的影響
2016年12月26日于植物組織培養(yǎng)母液配制室內(nèi)做試驗,每組分別有紅、白、青3種顏色的草莓。器材:紙,玻璃瓶或培養(yǎng)皿,針,酒精燈,菌液(灰霉病),刷子,噴壺。在每個玻璃瓶底部墊上大小合適的紙,用噴壺將紙噴濕,不要過濕。將針在酒精燈上滅菌后,在每個草莓的不同部位上戳2個洞(不用刺穿)。此時選用不同發(fā)育時期的草莓果實,果實表皮顏色分別紅、白、青3種。每個草莓戳洞后刷上灰霉病菌液,放入玻璃瓶中。做完4組后,加1組沒有刷菌液與戳洞的對照實驗。每組草莓中各有1個紅、白、青草莓果實。放置在植物組織培養(yǎng)母液配制室內(nèi),每天觀察是否發(fā)病,相同時間段刷一次菌液,等待發(fā)病取照。
2016年12月31日發(fā)現(xiàn)草莓發(fā)病,給草莓拍照,照片清晰,分組明確。在凝膠成像系統(tǒng)實驗室內(nèi)進行試驗。佩戴好一次性手套,用小刀將草莓表面的籽粒和表皮仔細清除,剪裁大小正好的錫紙,將去了籽粒的草莓用刀片切成薄片狀,用錫紙把草莓薄片包裹好。倒出部分液氮在泡沫盒內(nèi),把錫紙包裹的草莓切片放入液氮(1個草莓用1個錫紙包裹,完成后立即放入液氮)。標好姓名、組數(shù)、班級。從液氮中取出草莓錫紙,放入塑料袋中,放進超低溫冰箱。
1.2.2 草莓果實RNA的提取
洗刷研缽研杵后放入滅菌鍋滅菌2h,在研缽中倒入適量液氮進行預(yù)冷,從-80℃冰箱中取出植物組織樣品,在確保樣品不潮濕的狀態(tài)下,把其加入預(yù)冷好的研缽中研磨,考慮到不徹底的研磨會影響RNA的質(zhì)量和收率,應(yīng)該把組織樣品研磨至無明顯可見顆粒的粉末狀(期間應(yīng)持續(xù)加入液氮)。取出1.5mL的滅菌小管子,加入450μL的Buffer PE,再往其中加入20~50mg研磨后的粉末狀樣品。為更好地裂解液中無明顯沉淀,可使用移液器反復(fù)吹打。
將上述裂解液置入離心機,12000rpm,4℃離心8min。
新取1個1.5mL滅菌小管子,用移液槍提取350μL上清液,小心加入其中。加入體積為上清液1/10(35μL)的Buffer NB,Vortex震蕩搖勻。
將所得液體置入離心機,低溫離心,12000rpm,4℃離心5min,以下離心機均設(shè)為4℃。
將上清液吸取至新的1.5mL滅菌小管子中,此時槍量程為300μL。加入450μL的Buffer RL(使用前請確認已加入50倍DTT Solution),使用移液槍將溶液吹打混勻。
按照“Total RNA的提取”流程進行以下步驟。
加入375μL C2H5OH,得到1125μL混合液。出現(xiàn)沉淀時使用移液槍將溶液吹打混勻。
第1次用移液槍吸600μL轉(zhuǎn)入柱子,離心1min,12000rpm。棄濾液。第2次將剩余525μL混合液轉(zhuǎn)入柱子中,離心1min,12000rpm。棄濾液。
在柱子中加入500μL 的Buffer RWA,12000rpm,離心1min,棄濾液。
在柱子中加入600μL的Buffer RWB,12000rpm,離心1min,棄濾液。(確認Buffer RWB中已經(jīng)加入了指定體積的100%乙醇)沿柱子管壁四周加入Buffer RWB,有助于沖洗粘附在壁管上的鹽分。
(1)管,將配制好的酶液加入50μL至柱子中,此時槍頭一定要伸到柱子中間,放置15min。(2)管,向柱子中央加入500μL的Buffer RWB,盡量在邊上繞一圈,離心1min,12000rpm,棄濾液。
在柱子中加入600μL的Buffer RWB,12000 rpm,離心1min,棄濾液。(確認Buffer RWB中已經(jīng)加入了指定體積的100%乙醇)沿柱子管壁四周加入Buffer RWB,有助于沖洗粘附在壁管上的鹽分。
將濾液倒掉,再將管子空轉(zhuǎn)1min。換管子,留中柱。將RNase Free dH2O放在金屬浴上設(shè)置60℃,預(yù)熱5min。此時將蓋子打開揮發(fā)酒精。每個中央加入50μL的RNase FreedH2O。加入后放置1~2min,離心2min,12000rpm,此時有2個蓋子,扔掉中柱,保留小管子。
配膠:往錐形瓶倒入40mL 1倍的TAE,稱取0.40g瓊脂,將二者混合均勻。用微波爐加熱1~2min,直至藥品呈透明狀。向錐形瓶中加入1滴Eb,混合均勻。準備做1塊中等大小的膠。使用中梳,將小管子里的RNA用loading Buffer標記,依次注入膠孔以及5μL的marker。跑膠時間大致為30min。
1.2.3 灰霉菌處理對草莓果實中轉(zhuǎn)錄因子的影響
表1 灰霉病處理草莓果實后相關(guān)抗病轉(zhuǎn)錄因子的表達量分析
2017年4月24日在凝膠成像系統(tǒng)實驗室,(1)管8μL打到每個小管子里,放小離心機上離心。每個吸取2μL上次試驗的RNA打到管底。將每個小管子置于金屬浴顯示65℃,預(yù)熱5min。小管子插到制冰機上,4~5min直至冷卻。將(2)管加入至小管子,每個為10μL(移液速度要快,加在管壁上),放在小離心機上離心。如果放置時間長,應(yīng)儲存在冰上。第2天,用移液槍加23μL PCR mix進入每個小管子,將每個草莓的cDNA吸2μL分別加入小管子。放置在小離心機上離心。放置在PCR儀上進行PCR檢測。此時做膠,用大梳(孔數(shù)要夠)將每個小管子的25μL溶液全部點進去,此時不需用loading Buffer標記。點入marker 5μL。
2016年12月26日將草莓刺傷并接種灰霉菌,同年12月31日肉眼觀察部分草莓病變。從試驗結(jié)果分析,不同發(fā)育階段的草莓果實對灰霉病表現(xiàn)出不同程度的病變,5d時間中未用病菌處理的草莓對照組肉眼觀察暫未發(fā)病,見圖1。本試驗過程中即將成熟的草莓果實最先病變,表明灰霉病主要危害果實,在即將成熟的果實上最易發(fā)病[1]。
圖1 草莓果實經(jīng)過5d灰霉菌液處理
利用Protocl-I流程從100mg的草莓果實中提取RNA,從圖2可知,得到了濃度高低將近相同的RNA。
泳道1:綠果;泳道2:綠果對照;泳道3:白果;泳道4:白果對照;泳道5:紅果;泳道6:紅果對照;泳道7:marker
從圖3可知,圖片亮度大致相同,使用PCR技術(shù)擴增得到的內(nèi)參基因,此為得到的RNA濃度基本相同,可以進行以下試驗,見圖4。
泳道1:綠果;泳道2:綠果對照;泳道3:白果;泳道4:白果對照;泳道5:紅果;泳道6:紅果對照;泳道7:marker
圖4 抗病相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子基因相對表達量
栽培作物的過程中,會有多種多樣的病菌微生物侵害植物,本試驗主要分析灰霉病處理草莓果實后相關(guān)抗病轉(zhuǎn)錄因子的表達量。試驗分析結(jié)果發(fā)現(xiàn),不同發(fā)育階段的草莓果實灰霉病發(fā)病時間和發(fā)病狀態(tài)不同。4個抗病相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子WRKY1、WRKY70、ERF3以及NAC1在受到灰霉病侵染后,基因表達量均有不同程度上調(diào)。本試驗過程中,PCR擴增得到的RNA量大致相等,試驗較為順利。現(xiàn)今已有大量關(guān)于草莓灰霉病的分子實驗,Rigotti等[9]對灰霉病菌處理過的草莓進行了分子實驗[10]。本試驗材料為八倍體“紅顏”品種,查閱草莓灰霉病相關(guān)抗病轉(zhuǎn)錄因子文獻,了解到這方面的研究相對二倍體草莓較少,因此將繼續(xù)在分析基因表達的研究上,對草莓灰霉病的相關(guān)抗病轉(zhuǎn)錄因子進行更深層次的試驗分析。