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        基因編輯技術(shù)改良玉米株型增加雜交種產(chǎn)量

        2023-09-01 10:41:28石佳鑫劉凱朱金潔祁顯濤謝傳曉劉昌林
        生物技術(shù)通報(bào) 2023年8期
        關(guān)鍵詞:中單雜交種株型

        石佳鑫 劉凱 朱金潔 祁顯濤 謝傳曉 劉昌林

        (1. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所,北京 100081;2. 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)玉米研究所,成都 611130)

        玉米(Zea mays L.)是遍布世界的重要農(nóng)作物之一。我國(guó)的玉米種植面積大,產(chǎn)量占比超過(guò)糧食總產(chǎn)量的40%,對(duì)保障我國(guó)的糧食安全至關(guān)重要[1]。作為天然的C4植物,玉米具有更高的光合潛力[2]。如何更好地發(fā)揮玉米的光合潛力,提高玉米產(chǎn)量是當(dāng)下研究的熱點(diǎn)之一。國(guó)內(nèi)外研究表明,密植能夠通過(guò)改善玉米群體冠層結(jié)構(gòu),協(xié)調(diào)單株與群體關(guān)系而有效地增加玉米單位面積的產(chǎn)量[3-5]。玉米群體的種植密度能否增加,受限于玉米株型結(jié)構(gòu)分布是否理想[6],超過(guò)適宜密度的栽培措施會(huì)造成玉米倒伏、空桿和禿尖增長(zhǎng)等負(fù)面性狀出現(xiàn)[7-8],最終影響產(chǎn)量。因此創(chuàng)制株型結(jié)構(gòu)分布合理的“理想株型”玉米,能夠通過(guò)增加栽培密度的上限實(shí)現(xiàn)增產(chǎn)。玉米的“理想株型”表現(xiàn)為上部葉片緊湊、節(jié)間長(zhǎng),且穗上平均葉面積指數(shù)較大等[6]。從個(gè)體來(lái)看,葉夾角小且緊湊的“理想株型”玉米,由于整株能夠更加均勻的接受光照,在高水平的光合光子通量密度下,其截獲輻照度的利用效率更高[9];從群體來(lái)看,“理想株型”玉米能通過(guò)優(yōu)化單株光合效率、穗三葉的葉向值與有效光合面積等方面提高光能利用率而促進(jìn)干物質(zhì)積累和轉(zhuǎn)運(yùn),最終提高產(chǎn)量[10-11]。為創(chuàng)制“理想株型”玉米,可通過(guò)雜交育種的方式對(duì)玉米雙親選擇和組配。玉米株型相關(guān)性狀的研究表明,在不同背景的雜交組合中,雜交種的葉夾角與雙親的葉夾角顯著正相關(guān)[12]。選擇葉夾角適當(dāng)?shù)挠H本能夠通過(guò)雜種優(yōu)勢(shì)創(chuàng)制株型和產(chǎn)量?jī)?yōu)于雙親的F1植株。例如在油菜中,Li等[13]利用生長(zhǎng)素信號(hào)基因BnaA3.IAA7配制雜合型突變體,獲得株型改良的雜交種,實(shí)現(xiàn)油菜的密植增產(chǎn)。傳統(tǒng)方法通過(guò)回交改良雜種親本,這一過(guò)程在導(dǎo)入目標(biāo)位點(diǎn)時(shí),因?yàn)檫B鎖累贅引入非目標(biāo)性狀[14]。為解決這一難題,基因編輯技術(shù)精確地靶向目的基因能夠打破基因連鎖,創(chuàng)制基因精確編輯的突變材料,這種策略被稱為DTM(desire targeted mutation)策略[15]。通過(guò)這種策略突變?nèi)~夾角大小調(diào)控基因,精確的改變玉米株型在理論上是可能的。在葉夾角的眾多調(diào)控基因中,ZmLG1(Zm00001d002005)可能通過(guò)參與葉發(fā)育早期葉片-葉鞘邊界線的形成,影響葉耳和葉舌的發(fā)育[16]調(diào)控葉夾角的大小。研究發(fā)現(xiàn)天然的Zmlg1隱性突變體表現(xiàn)為葉耳和葉舌的缺失,致使植株葉夾角減小。該基因的調(diào)控模式,先后在玉米[17]、水稻[18]、小麥[19]、大麥[20]等作物中被發(fā)現(xiàn),說(shuō)明LG1基因在作物中的功能具有保守性。對(duì)不同物種LG1結(jié)構(gòu)域的研究表明,該基因涉及的調(diào)控通路可能僅影響葉夾角和抗逆響應(yīng),而不參與到花期等其他性狀的調(diào)控過(guò)程[21],對(duì)葉夾角無(wú)關(guān)性狀影響較小。因此選取ZmLG1基因作為靶標(biāo),更傾向于獲得精準(zhǔn)減小葉夾角的植株。考慮到玉米Zmlg1純合突變有影響散粉的潛在風(fēng)險(xiǎn)[22],本研究編輯Zmlg1獲得Zmlg1純合基因型的母本,再與相應(yīng)的父本雜交獲得ZmLG1Zmlg1型的雜交種。通過(guò)觀察分析,選擇抗性較好且無(wú)明顯缺陷的中單88母本自交系CX1為改良對(duì)象。本研究以改良母本CX1為設(shè)計(jì)出發(fā)點(diǎn)開展了相關(guān)實(shí)驗(yàn)。將ZmLG1編輯為Zmlg1的CX1命名為CX1-lg1,評(píng)估了其制種效率,并配制基因型為ZmLG1Zmlg1的改良雜交種中單88M開展多環(huán)境下增密栽培試驗(yàn),評(píng)估了Zmlg1基因的應(yīng)用價(jià)值,也對(duì)基因編輯技術(shù)在雜交育種中的應(yīng)用進(jìn)行了探索。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        本次試驗(yàn)所用編輯誘導(dǎo)材料CF13-1[15]由中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所玉米基因編輯育種創(chuàng)新研究組提供,以改良材料中單88M和其母本CX1-lg1為試驗(yàn)材料,未改良中單88和其母本CX1為對(duì)照。

        1.2 方法

        1.2.1 改良母本CX1-lg1和中單88M的創(chuàng)制 分析親本自交系CX1的ZmLG1序列,挑選符合CRISPR/Cas9系統(tǒng)的sgRNA序列,構(gòu)建編輯載體遺傳轉(zhuǎn)化,獲得ZmLG1的編輯誘導(dǎo)材料CF13-1[15]。將CX1與CF13-1雜交,對(duì)F1進(jìn)行Cas9元件的PCR檢測(cè),所用引物為Cas9JC-F(5'-AGCTGGTTGTAGGTCTGCAC-3')和Cas9JC-R(5'-TTCAAGGTGCTGGGCAAC-3')。挑選編輯元件陽(yáng)性個(gè)體,用于回交。以后每一代以此方法挑選Cas9元件陽(yáng)性材料作為回交中間材料,作為父本,CX1為母本回交四代,獲得BC4F1代材料。對(duì)BC4F1個(gè)體以相同的方式檢測(cè),挑選編輯元件陰性個(gè)體自交獲得BC4F2,從中挑選到完全無(wú)葉舌葉耳個(gè)體3株,Sanger測(cè)序檢測(cè)ZmLG1靶點(diǎn)突變情況,所用引物為L(zhǎng)G1-F(5'-GCGTGGGAAGATGATGAACC-3')和LG1-R(5'-GTACGTGTAGCCTCCTCTGG-3')。3株材料均為同一類型編輯事件。我們將這一材料命名為CX1-lg1,對(duì)其擴(kuò)繁并與CX2組配,獲得改良的雜交種F1,命名為中單88M。

        1.2.2 田間管理 播種前撒施底肥復(fù)合肥(N∶P∶K=18∶12∶10),用量600 kg/hm2。翻耕整地后采用雙粒播種,確保出苗。株距為16-24 cm,行距為50 cm(順義、通遼、南口)或60 cm(海南)。播種后次日進(jìn)行鎮(zhèn)壓、灌溉;播種后3-4 d采用乙草胺作為封閉除草劑,每公頃用量2-2.5 kg。播種兩周后統(tǒng)計(jì)出苗情況,對(duì)缺苗穴位補(bǔ)苗。玉米4-6葉期降苗,每穴留壯苗一株。苗期根據(jù)天氣情況適當(dāng)澆水,拔節(jié)后期到抽穗期注意保證充足水分。根據(jù)實(shí)際情況噴施除草劑或殺蟲劑。拔節(jié)期追肥一次,采用高氮磷復(fù)合肥,用量為基肥的1/3。R6期以小區(qū)為單位收獲。

        1.2.3 制種試驗(yàn)設(shè)計(jì) 2020年在中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院海南南繁生物育種試驗(yàn)基地開展制種試驗(yàn)。試驗(yàn)采用完全隨機(jī)設(shè)計(jì),設(shè)置株距為24 cm,行距為50 cm,4 m為一行。制種行配比為母本∶父本=4∶1,5行為一組,每6個(gè)組為單個(gè)小區(qū)重復(fù),共設(shè)計(jì)兩個(gè)小區(qū)重復(fù)。其中,CX1(母本)與CX2(父本)組配獲得雜交種中單88,CX1-lg1(母本)與CX2(父本)組配獲得雜交種中單88M。田間管理增加母本人工去雄的操作,在拔節(jié)末期和抽穗前期進(jìn)行。

        1.2.4 改良雜交種密度試驗(yàn)設(shè)計(jì) 試驗(yàn)采用隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì),以改良雜交種中單88M為材料,中單88為對(duì)照,安排5000、6000、7000株/667 m23個(gè)密度水平,每個(gè)小區(qū)為4 m×48 m,兩組重復(fù)。2021年在通遼試驗(yàn)基地和中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所順義試驗(yàn)基地,2022年在中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院南口中試基地,3個(gè)環(huán)境條件下開展試驗(yàn)。

        1.2.5 表型測(cè)定 株高和穗位高用塔尺(量程0-300 cm,精確度1 cm)直接測(cè)量。葉夾角表型測(cè)量穗上葉夾角、穗位葉夾角、穗下葉夾角。其中,穗上葉夾角和穗下葉夾角是穗上和穗下三片葉的均值。通過(guò)測(cè)量葉片基部20 cm處葉中脈和莖稈距離(量程0.0-50.0 cm,精確度0.1 cm)的間接法換算為角度值。

        穗數(shù)以小區(qū)為統(tǒng)計(jì)單元,計(jì)有效穗(籽粒數(shù)>30粒)個(gè)數(shù)。含水量通過(guò)KETT牌谷物水分測(cè)量?jī)x(型號(hào)PM8188A),測(cè)量3次取平均值,記為小區(qū)籽粒含水量。收獲量為小區(qū)收獲所有穗重,用電子秤稱重(量程0.00-120.00 kg,精確度0.05 kg)。出籽率為小區(qū)脫粒前與脫粒后重量的比值,產(chǎn)量為小區(qū)以14%標(biāo)準(zhǔn)含水量折算每667 m2產(chǎn)量。禿尖長(zhǎng)用游標(biāo)卡尺(量程0.0-180.0 mm,精確度0.1 mm)測(cè)量。穗行數(shù)直接計(jì)數(shù),行粒數(shù)每穗隨機(jī)統(tǒng)計(jì)3行,取平均數(shù)。

        1.2.6 數(shù)據(jù)與圖形處理 通過(guò)IBMSPSS25對(duì)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行t檢驗(yàn)和雙因素方差分析,用R語(yǔ)言繪制統(tǒng)計(jì)圖。

        2 結(jié)果

        2.1 改良母本CX1-lg1基因序列與表型分析

        改良母本CX1-lg1具有明顯的緊湊表型(圖1-A)。靶點(diǎn)測(cè)序結(jié)果顯示CX1-lg1為純合“GTAG”四堿基缺失編輯類型(圖1-B)。對(duì)葉夾角進(jìn)行觀測(cè),CX1-lg1穗上(圖1-C)、穗下(圖1-D)葉夾角平均值分別為4.78°和11.73°,CX1穗上、穗下葉夾角平均值分別為15.84°和27.79°。統(tǒng)計(jì)分析表明CX1-lg1穗上(圖1-E)、穗下(圖1-F)葉夾角比CX1均極顯著的減小。

        圖1 CX1 和 CX1-lg1基因型與株型Fig. 1 Plant and genotype of CX1 and CX1-lg1

        2.2 改良母本CX1-lg1制種效率評(píng)估

        為了進(jìn)一步驗(yàn)證株型的改良是否影響雜交制種的效率,我們?cè)?000株/667 m2的密度條件下對(duì)CX1-lg1制種情況進(jìn)行評(píng)估(圖2-A、B)。結(jié)果表明改良母本CX1-lg1的小區(qū)平均有效穗數(shù)和折算平均產(chǎn)量分別為355穗和425.93 kg,CX1的平均有效穗數(shù)和折算平均產(chǎn)量為321.5穗和407.05 kg。與CX1相比,CX1-lg1具有更多有效穗(圖2-C)和更高產(chǎn)量(圖2-D)。

        圖2 改良母本的雜交制種產(chǎn)量Fig. 2 Seed production yield of improved maternal parent

        2.3 改良雜交種中單88M不同密度的株型表現(xiàn)

        我們分別對(duì)南口、順義、通遼3個(gè)環(huán)境中,不同密度水平下的雜交種進(jìn)行株型觀測(cè)發(fā)現(xiàn),中單88M在這3個(gè)環(huán)境下都表現(xiàn)出更緊湊的株型(圖3-A)。在南口5000、6000、7000株/667 m2水平下,中單88M穗上葉夾角平均值分別是21.35°、20.27°、20.98°,穗下葉夾角平均值分別是25.60°、25.63°、24.00°;對(duì)照中單88在5000、6000、7000株/667 m2三個(gè)密度水平下,穗上葉夾角平均值分別是26.39°、27.64°、27.13°,穗下葉夾角平均值分別是30.20°、30.47°、30.33°。在相應(yīng)密度水平下,中單88M穗上和穗下葉夾角均比中單88極顯著減小。順義和通遼兩個(gè)環(huán)境中情況類似,在不同栽培密度下,中單88M穗上(圖3-B)和穗下(圖3-C)葉夾角均小于中單88。

        圖3 改良母本使改良雜交種中單88M株型緊湊Fig. 3 Improved maternal parent grants a compact plant type for hybrid Zhongdan88M

        2.4 改良雜交種中單88M不同密度下的產(chǎn)量表現(xiàn)

        我們測(cè)量了南口、順義、通遼3個(gè)環(huán)境條件下不同密度水平的雜交種產(chǎn)量(圖4-A)。結(jié)果表明,在南口5000、6000、7000株/667 m2三個(gè)密度水平下,中單88M的平均折算畝產(chǎn)依次是592.10 kg、659.10 kg、689.10 kg,中單88的折算畝產(chǎn)依次是598.80 kg、704.60 kg、649.10 kg,中單88M在7000株/667 m2密度下增產(chǎn)(圖4-B)。在順義5000、6000、7000株/667 m2三個(gè)密度水平下,中單88M的平均折算畝產(chǎn)依次是689.80 kg、709.80 kg、787.50 kg,中單88的折算畝產(chǎn)依次是671.20 kg、696.70 kg、715.50 kg,前者在7000株/667 m2密度下增產(chǎn)最多(圖4-B)。在通遼5000、6000、7000株/667 m2三個(gè)密度水平下,中單88M的平均折算畝產(chǎn)依次是781.50 kg、896.40 kg、790.10 kg,中單88的折算畝產(chǎn)依次是852.00 kg、853.00 kg、710.30 kg,前者在6000和7000株/667 m2密度下有增產(chǎn)效應(yīng)(圖4-B)。

        圖4 改良雜交種中單88M在增密栽培條件下產(chǎn)量增加Fig. 4 Improved hybrid Zhongdan88M grants an increased yield in dense-planting cultivation

        2.5 株型和產(chǎn)量受密度、材料、環(huán)境及互作效應(yīng)影響

        對(duì)雜交種密度試驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行多因素方差分析,結(jié)果表明:(1)在葉夾角方面,穗上葉夾角、穗位葉夾角和穗下葉夾角在不同環(huán)境、材料之間F值均達(dá)到顯著水平,說(shuō)明葉夾角的大小受到環(huán)境和材料的影響。而在不同密度下,穗上葉夾角有極顯著差異,穗位葉夾角有顯著差異,穗下無(wú)顯著差異,說(shuō)明葉夾角不同層次受密度影響的情況不同,表現(xiàn)出從冠層到底層受到密度的影響逐漸減小。此外穗上葉夾角和穗下葉夾角在環(huán)境和材料互作下F值達(dá)到極顯著水平,穗位葉夾角達(dá)到顯著水平(表1)。方差分析表明,中單88M穗上葉夾角受環(huán)境影響較??;穗下葉夾角受環(huán)境材料互作影響較大。密度和材料的互作效應(yīng),僅影響穗上葉夾角的大?。ū?),中單88M受到密度材料互作效應(yīng)較小。(2)在產(chǎn)量方面,環(huán)境影響禿尖長(zhǎng)、收獲量、出籽率、有效穗數(shù)和產(chǎn)量等性狀,且均達(dá)到極顯著水平;密度極顯著影響禿尖長(zhǎng)、有效穗數(shù),顯著影響收獲量;環(huán)境和材料互作效應(yīng)極顯著影響禿尖長(zhǎng)和有效穗數(shù)(表2)。兩種材料受環(huán)境材料互作效應(yīng)影響不同:中單88M禿尖長(zhǎng)、收獲量、出籽率受環(huán)境材料互作效應(yīng)影響比中單88大,有效穗數(shù)和產(chǎn)量比中單88受影響小;密度材料互作效應(yīng)顯著影響禿尖長(zhǎng)(表2),中單88M受該互作效應(yīng)影響較小。

        表1 株型相關(guān)性狀方差分析 F 統(tǒng)計(jì)量Table 1 F statistic analysis of variance for plant type related traits

        表2 產(chǎn)量相關(guān)性狀方差分析 F 統(tǒng)計(jì)量Table 2 F statistic analysis of variance for yield related traits

        3 討論

        3.1 編輯ZmLG1基因?qū)X1株型與制種效率的影響

        ZmLG1基因減小玉米葉夾角的作用是明確和顯著的[17],并且通過(guò)基因編輯技術(shù)編輯不同作物的LG1均有類似的表型[18-20]。借助于DTM策略,通過(guò)雜交的方式將基因編輯元件導(dǎo)入目標(biāo)自交系是可以發(fā)揮功能的[15]。本次實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,我們獲得的改良材料CX1-lg1比CX1具有更小的上部和下部葉夾角,株型更緊湊。并且CX1-lg1在5000株/667 m2的密度下,有更高的制種產(chǎn)量。

        3.2 改良雜交種中單88M株型和產(chǎn)量的表現(xiàn)

        前人研究證明,對(duì)親本特定性狀的改良能夠通過(guò)遺傳在雜種一代表現(xiàn)[23]。為此我們通過(guò)改良母本獲得了ZmLG1Zmlg1的改良雜交種中單88M。在不同環(huán)境不同密度下,中單88M穗上與穗下葉夾角與對(duì)照中單88相比均顯著的減小,表現(xiàn)為緊湊的株型。3個(gè)環(huán)境中,在7000株/667 m2的密度水平下,中單88M與對(duì)照中單88相比有更高的產(chǎn)量,在較低密度水平下,并沒有明顯變化規(guī)律。因此株型改良的雜交種比原先更適應(yīng)密植栽培。

        3.3 基因編輯結(jié)合雜交育種技術(shù)改良雜交種株型

        綜合來(lái)看,改良雜交種中單88M和其改良母本中單88M-lg1在株型上具有相似表現(xiàn),其遺傳規(guī)律符合前人對(duì)葉夾角遺傳規(guī)律的解析[12,24]。我們的實(shí)驗(yàn)證明通過(guò)基因編輯精確的調(diào)控目標(biāo)性狀是可行的。結(jié)合傳統(tǒng)的雜交育種,通過(guò)對(duì)親本目標(biāo)性狀的改良,能夠提升雜交種的表現(xiàn),使其更好地發(fā)揮雜種優(yōu)勢(shì)。由于株型改良對(duì)作物增產(chǎn)的正向貢獻(xiàn)[6],未來(lái)創(chuàng)制理想株型的雜交種具有重要的現(xiàn)實(shí)意義。我們?cè)诟牧既~夾角的過(guò)程中,對(duì)非目標(biāo)性狀倒伏也產(chǎn)生了影響,可能由于LG1基因參與調(diào)控的未知通路受到影響,改變了雜種中相關(guān)通路的相互作用,需要進(jìn)一步研究。隨著株高、葉夾角、根系、花序等株型形成相關(guān)基因的克隆和更具體的功能解析,借助于精確的基因編輯工具,我們可以編輯基因編碼序列或調(diào)控元件的特定堿基,更精確地改變蛋白序列或更精細(xì)的調(diào)控表達(dá),實(shí)現(xiàn)更精準(zhǔn)的表型調(diào)控。

        4 結(jié)論

        通過(guò)基因編輯技術(shù)結(jié)合DTM策略成功改良了雜交種母本株型,提升其制種效率;并創(chuàng)制了株型緊湊的雜交種中單88M,不同栽培密度和試驗(yàn)環(huán)境與材料互作,但兩種材料不同性狀受材料密度和材料環(huán)境的兩種互作效應(yīng)影響的大小不同。綜合比較認(rèn)為,通過(guò)母本改良獲得的雜交種中單88M能在高密度(7000株/667 m2)下實(shí)現(xiàn)增產(chǎn)。

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