劉 甜 龐井雪 石連欣 劉 淞 于 妍
長(zhǎng)春科技學(xué)院,吉林 長(zhǎng)春 130600
大豆在我國(guó)距今已有5 000多年的栽培歷史,是重要的糧油兼用作物之一。據(jù)統(tǒng)計(jì),目前全球范圍內(nèi)遭受鹽漬化脅迫的耕地約占30%,對(duì)糧食生產(chǎn)和經(jīng)濟(jì)發(fā)展造成嚴(yán)重影響[1]。土地鹽漬化同樣會(huì)導(dǎo)致大豆產(chǎn)量降低,所以選育耐鹽大豆品種意義重大。大豆耐鹽性是一個(gè)受多基因控制的數(shù)量性狀,采用傳統(tǒng)育種手段很難實(shí)現(xiàn)耐鹽性大豆選育,但數(shù)量性狀基因座(Quantitative Trait Locus,QTL)定位的廣泛應(yīng)用大大加速了耐鹽性大豆品種的選育進(jìn)程。
QTL 定位是利用單基因定位的方式,將QTL 定位在遺傳圖譜上,并確定QTL 與遺傳標(biāo)記之間的距離(表示為重組率)。該方法常用于F2群體、回交世代群體、重組自交系群體、雙單倍體群體等。其主要有3 種作圖方法,分別為區(qū)間作圖法(IM)、復(fù)合區(qū)間作圖法(CIM)及基于混合線(xiàn)性模型的復(fù)合區(qū)間作圖法(MCIM)。目前,作物QTL定位方法分為兩大類(lèi),分別是傳統(tǒng)QTL 定位方法(基于遺傳連鎖圖譜)和全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)(基于連鎖不平衡原理)。
由于農(nóng)作物的多數(shù)性狀(如大豆的百粒質(zhì)量、營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)含量、植株高度及耐鹽性等)均由QTL 控制,因而采用QTL 定位有利于加快作物育種進(jìn)度,提高作物產(chǎn)量及品質(zhì),增強(qiáng)作物抗逆性等。隨著分子標(biāo)記技術(shù)的迅速發(fā)展,RFLP、SSR、RAPD 等分子標(biāo)記手段被越來(lái)越多地應(yīng)用于QTL 定位,但此類(lèi)分子標(biāo)記手段容易受到作圖群體、遺傳圖譜及環(huán)境條件的限制而應(yīng)用效果不佳。近年來(lái),GWAS 在植物復(fù)雜數(shù)量性狀研究上表現(xiàn)出巨大的優(yōu)勢(shì)。應(yīng)用GWAS 定位QTL 因具有效率高、構(gòu)建群體所需時(shí)間短等優(yōu)點(diǎn)而備受研究者青睞。借助高密度分子圖譜,GWAS 已成為定位大豆耐鹽性QTL、獲得耐鹽基因的有效手段。
大豆屬于對(duì)鹽類(lèi)中度敏感的植物,如果土壤中的鹽含量超過(guò)5 dS/m,大豆生長(zhǎng)就會(huì)受到影響[2]。郝雪峰等[3]研究發(fā)現(xiàn),不同鹽濃度對(duì)大豆萌發(fā)期有不同的影響,低濃度可以促進(jìn)種子萌發(fā),而高濃度則會(huì)抑制種子萌發(fā),且抑制程度隨著鹽濃度的升高而顯著增加,同時(shí)大豆種子的發(fā)芽率、發(fā)芽指數(shù)、活力指數(shù)等隨著鹽濃度的增加均呈先上升后下降的趨勢(shì)。徐芬芬等[4]用不同濃度的鹽溶液對(duì)2 個(gè)大豆品種進(jìn)行鹽脅迫處理,結(jié)果表明高濃度的鹽脅迫會(huì)明顯減弱大豆種子的吸收速率和營(yíng)養(yǎng)元素的活化效果,并對(duì)種子的吸脹功能形成抑制,進(jìn)而導(dǎo)致大豆種子發(fā)芽率降低。滕衛(wèi)麗等[5]研究發(fā)現(xiàn),鹽脅迫對(duì)大豆芽期的影響極大。Luo 等[6]研究發(fā)現(xiàn),在鹽脅迫的影響下,苗期大豆葉片枯黃、莖節(jié)數(shù)減少、株高和生物量積累均顯著降低。李新崗[7]研究發(fā)現(xiàn),在大豆苗期,鹽脅迫會(huì)對(duì)大豆幼苗的光合作用產(chǎn)生影響,造成植株生長(zhǎng)緩慢、株高和鮮質(zhì)量降低,甚至植株葉片萎黃壞死;在大豆成熟期,鹽脅迫會(huì)對(duì)植株開(kāi)花、結(jié)莢、鼓粒等過(guò)程造成影響,并最終影響大豆的產(chǎn)量和品質(zhì)。Chang 等[8]研究表明,在鹽脅迫條件下,大豆株高、單株粒數(shù)和粒質(zhì)量均呈降低趨勢(shì),并由此造成產(chǎn)量降低,而且鹽敏感性品種較耐鹽品種受鹽脅迫的負(fù)面影響更大。Weil等[9]研究發(fā)現(xiàn),遭受鹽脅迫后,大豆產(chǎn)量下降了30%,百粒質(zhì)量下降了23%;除對(duì)大豆產(chǎn)量造成影響外,鹽脅迫還會(huì)影響大豆籽粒的品質(zhì)。
Kan 等[10]以196 個(gè)大豆地方品種組成的自然群體和包括184 家系的重組自交系作為研究材料,發(fā)現(xiàn)22個(gè)與大豆萌發(fā)期耐鹽性緊密連鎖的SSR 標(biāo)記及11 個(gè)相關(guān)的QTL位點(diǎn),分別定位在2、7、8、10、17、18號(hào)染色體上。Zhang 等[11]利用耐鹽大豆品種科豐1 號(hào)和鹽敏感材料南農(nóng)1138-2,以雜交構(gòu)建的包含184 家系重組自交系為材料,在8 號(hào)染色體定位到一個(gè)與大豆萌發(fā)期耐鹽性相關(guān)的QTL 位點(diǎn),且該QTL 與標(biāo)記Sat_162緊密連鎖,并將其命名為qST-8。
Lee 等[12]對(duì)耐鹽大豆品種S-100 與TO-KYO 雜交組成的F2:5群體進(jìn)行QTL定位,在大豆3號(hào)染色體上發(fā)現(xiàn)一個(gè)大豆苗期耐鹽性相關(guān)主效QTL,標(biāo)記范圍為SAT_091~SAT_237。Chen 等[13]在大豆苗期進(jìn)行了耐鹽性相關(guān)QTL 定位研究,以包含184 個(gè)家系組成的重組自交系群體為材料,定位到分布于2、3、7、9、11、14、18 號(hào) 染 色 體 上 的8 個(gè)QTL 位 點(diǎn)。Tuyen 等[14]利 用JWS-156-1(耐鹽)和Jackson(PI548657)(鹽敏感)雜交構(gòu)建重組自交系群體,包含112個(gè)F6系別和149個(gè)F2系別,以大豆苗期的耐鹽分級(jí)和葉片葉綠素含量為耐鹽指標(biāo),定位到17 號(hào)染色體上的1 個(gè)QTL 位點(diǎn)。Zeng等[15]通過(guò)全基因組關(guān)聯(lián)分析,利用283 個(gè)來(lái)自世界各地種質(zhì)資源組成的自然群體和33 009 個(gè)SNP 標(biāo)記,不僅在3號(hào)染色體上定位到耐鹽性QTL,還在2、7、8、10、13、14、16、20 號(hào)染色體上檢測(cè)到8 個(gè)苗期耐鹽性QTL位點(diǎn)。Tuyen 等[16]通過(guò)Fiskeby(耐鹽)和Williams(鹽敏感)雜交,構(gòu)建包含132個(gè)F2∶3家系的重組自交系,以大豆苗期葉片葉綠素含量、鈉含量、氯離子含量和萎黃分級(jí)4 個(gè)性狀為耐鹽指標(biāo),定位到位于3、13 號(hào)染色體上的耐鹽相關(guān)QTL位點(diǎn)。Lopez等[17]通過(guò)鹽敏感材料Ozark 與耐鹽材料Jake 雜交,構(gòu)建了包含269 個(gè)F2∶3家系的重組自交系和5 402 個(gè)SNP 標(biāo)記,以大豆苗期葉片萎黃分級(jí)、植株枯死比例和葉綠素含量為耐鹽指標(biāo),在19 號(hào)染色體上檢測(cè)到一個(gè)新的耐鹽QTL 位點(diǎn)。李新崗[7]利用桂早1號(hào)和巴西13雜交構(gòu)建重組自交系群體對(duì)大豆苗期耐鹽QTL 定位進(jìn)行研究,新獲得位于9條染色體上的17 個(gè)耐鹽QTL 位點(diǎn),其中有10 個(gè)QTL位點(diǎn)與前人定位結(jié)果不同,有7 個(gè)QTL 位點(diǎn)與前人定位結(jié)果相似,均位于相同染色體上且位置接近。
邱鵬程等[18]將紅豐11號(hào)與Harosoy構(gòu)建的回交導(dǎo)入系群體作為試驗(yàn)材料,利用兩種遺傳分析方法在大豆芽期共定位到耐鹽相關(guān)QTL 位點(diǎn)22 個(gè)。李亞凱[19]對(duì)大豆重組自交系進(jìn)行大豆芽期耐鹽QTL 檢測(cè),定位到21 個(gè)QTL 位點(diǎn),分別位于3、4、8、11、18 號(hào)染色體上。闞貴珍等[20]對(duì)113 份野生大豆采用分子標(biāo)記和全基因組關(guān)聯(lián)分析技術(shù)進(jìn)行芽期耐鹽性狀鑒定,共定位到26 個(gè)與野生大豆芽期耐鹽相關(guān)的QTL 位點(diǎn)。滕衛(wèi)麗等[5]通過(guò)127 份大豆重組自交系,檢測(cè)大豆芽期耐鹽性狀的QTL 位點(diǎn),最終定位到21 個(gè)QTL 位點(diǎn),其中與相對(duì)發(fā)芽率相關(guān)的QTL 位點(diǎn)有4 個(gè),與相對(duì)吸脹率相關(guān)的QTL 位點(diǎn)有8 個(gè),與相對(duì)發(fā)芽指數(shù)相關(guān)的QTL位點(diǎn)有9個(gè)。
大豆耐鹽性是多基因控制的數(shù)量性狀,目前已公布的大豆耐鹽性QTLs 大都分布在第3 染色體上[21-22],但隨著研究的深入,其他染色體上也定位到一些耐鹽性QTL位點(diǎn)[23]。
另外,基于大豆基因組測(cè)序的完成,在進(jìn)行大豆耐鹽性QTL 定位的同時(shí),相關(guān)候選基因被克隆并鑒定。同時(shí),隨著大豆轉(zhuǎn)基因技術(shù)的逐步完善,大部分基因的功能均可在大豆中得以驗(yàn)證,從而有利于進(jìn)一步揭示大豆耐鹽機(jī)制,培育耐鹽性更加優(yōu)良的大豆新品種。