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        基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)探討清通袋泡茶治療阿片類藥物所致便秘的作用機制 *

        2023-08-12 07:23:32李夢萍
        關(guān)鍵詞:袋泡茶網(wǎng)絡(luò)圖癌痛

        李夢萍 鄧 力

        (1.廣州醫(yī)科大學(xué)附屬中醫(yī)醫(yī)院腫瘤科,廣東 廣州 510130;2.廣州中醫(yī)藥大學(xué)第一臨床醫(yī)學(xué)院,廣東 廣州 510006)

        美國國家綜合癌癥網(wǎng)絡(luò)(NCCN)成人癌痛指南[1]指出,癌痛發(fā)病率為57.4%,晚期患者的癌痛程度和發(fā)病率更高。阿片類藥物是癌痛的常用藥物,能改善癌痛癥狀,提高患者的生活質(zhì)量。經(jīng)橫斷面調(diào)查發(fā)現(xiàn),阿片類藥物的不良反應(yīng)是影響患者不能堅持服藥的第2位原因,其中阿片類藥物所致便秘(Opioid-induced constipation,OIC)的發(fā)生率達95%[2]。OIC 的一線治療為傳統(tǒng)瀉藥,如大便軟化劑、滲透劑、刺激性瀉藥和潤滑劑等,在開始使用阿片類藥物時便建議開始服用瀉藥以預(yù)防OIC 的發(fā)生[1]。清通袋泡茶為廣州醫(yī)科大學(xué)附屬中醫(yī)醫(yī)院院內(nèi)制劑,廣州醫(yī)科大學(xué)附屬中醫(yī)醫(yī)院腫瘤科長期用于治療腫瘤相關(guān)性便秘,臨床效果顯著,但藥理學(xué)機制尚不明確。本研究將通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)技術(shù),探討清通袋泡茶治療OIC的作用機制。

        1 方法

        1.1 清通袋泡茶的化合物獲取和靶基因網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建利用中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫與分析平臺(TCMSP)[3]數(shù)據(jù)庫(https://old.tcmsp-e.com/tcmsp.php),獲得清通袋泡茶主要成分“大黃”“番瀉葉”“枳實”的化合物,采用口服生物利用度(OB)≥30%和藥物相似度(DL)≥0.18的臨界值進行篩選,得出藥物對應(yīng)的化合物及靶蛋白。使用UniProt數(shù)據(jù)庫[4](https://www.uniprot.org)將靶蛋白轉(zhuǎn)化為相應(yīng)基因的名稱,搜索條件設(shè)定為“Reviewed”和“Human”。使用Cytoscape V3.6.1 軟件建立清通袋泡茶主要藥物成分的靶基因可視化網(wǎng)絡(luò)圖。

        1.2 OIC靶點的篩選及相關(guān)靶基因通過在線數(shù)據(jù)庫GeneCards[5](http://www.genecards.org/)搜 索 關(guān) 鍵 詞“Opioid-induced constipation”的相關(guān)靶點,下載后與清通袋泡茶主要藥物成分的靶基因形成交集并構(gòu)建韋恩圖。由此得到清通袋泡茶治療OIC的相關(guān)靶基因。

        1.3 構(gòu)建蛋白相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)把清通袋泡茶治療OIC 的靶點導(dǎo)入STRING 網(wǎng)絡(luò)平臺[6](http://string-db.org/),物種選擇“Homo sapiens”,構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)。

        1.4 基因本體論(GO)功能富集和基因組百科全書(KEGG)通路富集分析使用R 語言進行分析,首先運用org.Hs.eg.db 包把靶基因進行靶蛋白的ID 轉(zhuǎn)換,再使用clusterProfiler 包進行GO/KEGG 富集分析,最后使用ggplot2包進行結(jié)果的可視化轉(zhuǎn)化。

        2 結(jié)果

        2.1 清通袋泡茶的活性化合物、靶基因以及網(wǎng)絡(luò)圖通過TCMSP 數(shù)據(jù)庫檢索,并利用UniProt 數(shù)據(jù)庫轉(zhuǎn)化靶基因,篩選出大黃的活性化合物10 個、靶基因109 個,番瀉葉的活性化合物6 個、靶基因106 個,枳實的活性化合物22 個、靶基因306 個。三者去重后得到清通袋泡茶活性化合物43 個、對應(yīng)靶基因共164 個,并構(gòu)建清通袋泡茶“中藥-活性化合物-靶點”網(wǎng)絡(luò)圖。見圖1。

        圖1 清通袋泡茶中藥-活性化合物-靶點網(wǎng)絡(luò)圖

        2.2 清通袋泡茶治療OIC靶基因在GeneCards 數(shù)據(jù)庫中搜索關(guān)鍵詞“Opioid-induced constipation”,得出OIC相關(guān)疾病靶基因51 個,與藥物的164 個靶基因映射篩選出共同靶點22個。見圖2。

        圖2 清通袋泡茶成分靶點與OIC靶點的韋恩圖

        2.3 潛在靶基因的PPI分析把交集的22個潛在靶基因?qū)隨TRING 數(shù)據(jù)庫[6],構(gòu)建出PPI 互助網(wǎng)絡(luò)圖,得出節(jié)點數(shù)22 個,邊數(shù)102 條,邊數(shù)顯著高于預(yù)期的31 條,P<1.0e-16。網(wǎng)絡(luò)的平均節(jié)點度為9.27,局部聚類系數(shù)0.755。見圖3。

        圖3 清通袋泡茶治療OIC靶點的PPI互助網(wǎng)絡(luò)圖

        2.4 靶點的GO/KEGG分析經(jīng)過R 語言分析后,在滿足p.adj<0.05 & qvalue<0.2 的條件下,GO 共有1588 條,其中生物過程(Biological process,BP)共有1536 條、細胞組分(Cellular component,CC)共有28 條、分子功能(Molecular function,MF)共有24條,KEGG 共有142條。篩選靠前的5 條GO 條目和通路,繪制成氣泡圖。GO 功能富集分析顯示,BP 包括脂多糖(Lipopolysaccharide,LPS)的反應(yīng)、對細菌來源分子的反應(yīng)、LPS 介導(dǎo)的信號通路、肽基-絲氨酸磷酸化、細胞對LPS 的反應(yīng)等。CC 包括膜筏、膜微區(qū)、膜區(qū)、小凹、質(zhì)膜筏等。MF 包括絲裂原活化蛋白激酶(MAP)、蛋白質(zhì)絲氨酸/蘇氨酸/酪氨酸激酶活性、蛋白質(zhì)絲氨酸/蘇氨酸激酶活性、MAP 激酶活性、細胞因子受體結(jié)合等。KEGG 分析結(jié)果包括糖尿病并發(fā)癥中的AGE-RAGE 信號通路、恰加斯病、弓形蟲病、結(jié)核病、CLRs信號通路等。見圖4。

        圖4 靶點的GO功能富集和KEGG通路分析

        3 討論

        OIC 在腫瘤患者中的發(fā)生率為51%~87%[7],是阿片類藥物誘導(dǎo)的腸功能障礙中最常見的亞型。OIC的癥狀不會隨著治療的持續(xù)而消退,除了使腫瘤患者遭受痛苦,影響患者的生活質(zhì)量,還會影響患者的工作效率、增加患者的就診次數(shù)和治療費用,甚至使阿片類藥物治療停止[8,9]。對患者及其家屬或護理人員進行腸道功能管理的宣教是預(yù)防OIC的第一步。瀉藥為非處方用藥,而且價格便宜,被推薦成為預(yù)防和治療OIC的首選藥物[1]。

        清通袋泡茶(粵藥制字Z06022707,規(guī)格:每盒12袋,每袋2 g)由廣州市中醫(yī)中藥研究所、廣州醫(yī)科大學(xué)附屬中醫(yī)醫(yī)院研制,主要成分包括大黃、枳實、番瀉葉等,能清熱瀉火、通便寧神,用于臟腑郁火、大便秘結(jié)、腹肋脹痛、口苦苔黃、頭脹目赤、狂躁失性等,符合成人癌痛NCCN 指南中阿片類藥物所致便秘的一線推薦用藥標準。在動物實驗中發(fā)現(xiàn),清通袋泡茶能使大鼠進食量、體質(zhì)量和免疫器官質(zhì)量增加,大鼠血清溶血素顯示動物體內(nèi)有抗體增強的趨勢,腹腔巨噬細胞、單核吞噬細胞吞噬指數(shù)上升[10]。

        GO 功能富集發(fā)現(xiàn)BP 涉及多個與LPS 相關(guān)的生物過程,而LPS 是存在于細菌外膜中的細菌脂質(zhì)。CC 主要集中在膜的相關(guān)部位。KEGG 分析的通路多數(shù)與感染性疾病有關(guān)。因此,清通袋泡茶對OIC 的治療作用機制可能集中于對腸道菌群的調(diào)節(jié)。研究[11]發(fā)現(xiàn),便秘患者腸黏膜菌群豐度下降,菌群的組成表現(xiàn)為變形菌門、腸桿菌的減少,擬桿菌的增加,引起菌群代謝產(chǎn)物的改變。而中醫(yī)藥在調(diào)節(jié)腸道菌群結(jié)構(gòu)時,不僅調(diào)節(jié)腸道菌群的數(shù)量,同時增加和保護益生菌種類,抑制和減少致病菌,調(diào)整菌群平衡,保護腸道黏膜屏障。此外,中醫(yī)藥可以有效阻止腸道菌群移位,防止疾病蔓延[12]。

        綜上所述,清通袋泡茶可能通過作用于細菌膜上的LPS,使細胞膜發(fā)生破壞,以抑制和減少致病菌,改善腸道菌群失調(diào),從而改善OIC。本文以網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究為基礎(chǔ),為清通袋泡茶治療OIC 作用機制的進一步實驗驗證提供研究方向。

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