劉水 孫建飛
摘要:目的 探討多重?zé)晒舛縋CR試劑盒在食物中毒病原菌檢測中的應(yīng)用效果,為食物中毒患者爭取治療時間,確保飲食安全。方法 選取2020年5月~2022年5月期間在本市懷柔區(qū)疾病預(yù)防控制中心進行食物中毒病原菌檢測的54例患者為對象,對其提供的嘔吐物、糞便等60份樣本進行病原菌檢驗,通過對主要致病菌研究,建立PCR檢測體系,分析與比較常規(guī)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)與多重?zé)晒舛縋CR試劑盒在食物中毒中檢測應(yīng)用價值。結(jié)果 檢出54例患者為食源性食物中毒,引發(fā)食物中毒的致病菌有沙門氏菌、變形桿菌、金黃色葡萄球菌及蠟樣芽胞桿菌。沙門氏菌感染食物中毒22例(占40.74%),變形桿菌感染食物中毒9例(占16.67%),金黃色葡萄球菌感染食物中毒12例(占22.22%),蠟樣芽胞桿菌感染食物中毒11例(占20.37%)。從感染病菌類型看,感染型細(xì)菌引起的中毒人數(shù)明顯高于毒素型細(xì)菌中毒人數(shù)(P<0.05);所有患者致病菌經(jīng)常規(guī)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)檢測與多重?zé)晒舛縋CR試劑盒檢測,兩種檢測結(jié)果均一致,檢出率為100%。多重?zé)晒舛縋CR的基因組DNA檢測靈敏度只有2×10-6 ng/?l,常規(guī)PCR檢測敏感度為2×10-7 ng/?l,常規(guī)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)檢測能更為準(zhǔn)確地檢測患者食物中的多種致病菌,但需消耗大量的試劑且所需的檢測時間長,多重?zé)晒舛縋CR檢測所需試劑少且所需檢測時間短,但其檢測靈敏度較低。結(jié)論 多重?zé)晒舛縋CR試劑盒在食物中毒中應(yīng)用價值明顯,4種食物致病菌可以在一次檢測種被查出,但其靈敏度低于常規(guī)PCR檢測,可將兩者取長補短,在食物中毒致病菌檢測工作中推廣應(yīng)用,保證人們食品食用安全。
關(guān)鍵詞:多重?zé)晒舛縋CR;常規(guī)PCR;致病菌;食物中毒
食物中毒是指健康人食用被細(xì)菌、毒素及有毒物質(zhì)污染的食物所致的急性感染疾病。在臨床上,該病患者多表現(xiàn)為惡心、嘔吐、腹瀉及腹痛等癥狀,嚴(yán)重者還可出現(xiàn)肢體無力、神經(jīng)麻木,甚至休克昏迷等,若不及時給予患者針對性干預(yù)治療,會對其生命安全造成嚴(yán)重威脅[1~2]。食物中毒事件事發(fā)突然,發(fā)病者通常涉及群體且影響較大,需要快速準(zhǔn)確找出病癥根源,以便及時對患者干預(yù)治療。目前,對食物中毒檢測方法很多,包括血常規(guī)檢查、糞便檢查及病原學(xué)檢查等。常規(guī)檢測方法需對樣本進行分離培養(yǎng),不僅操作復(fù)雜,還需要花費大量的時間,且檢測過程中樣本易受到污染,難以保證檢測結(jié)果的準(zhǔn)確性。熒光定量PCR技術(shù)的出現(xiàn)與發(fā)展,彌補了傳統(tǒng)檢測方法的不足,特別是多重PCR檢測技術(shù)的應(yīng)用,是在原有PCR基礎(chǔ)上加以改進,實現(xiàn)了多種食源性致病菌的同時檢測。有研究顯示,多重?zé)晒舛縋CR檢測應(yīng)用于食物中毒中,提高了檢測效率[3]。本研究旨在探討多重?zé)晒舛縋CR試劑盒在食物中毒病原菌檢測中的應(yīng)用效果。
1材料與方法
1.1 材料
1.1.1 儀器設(shè)備
2720 Thermal Cycler熱循環(huán)儀(由美國Life Technologies提供)、DYY-6C電泳儀(由北京六一儀器廠提供)、Centri-Fuge FRESCO 17 低溫高速離心機(由美國Therrmo提供)、HDLⅡ生物安全柜(由北京東聯(lián)提供)、SPX-250B-Z生化培養(yǎng)箱(由上海博迅提供)、Image Quant 300凝膠成像系統(tǒng)及超純水系統(tǒng)(由美國Millipore提供)。
1.1.2 試劑
實驗試劑有Tap酶、PCR及Mg2+細(xì)胞裂解緩沖液(均為Promega公司提供)、瓊脂糖DNA 純化試劑盒(由青島生工生物科技有限公司提供)、DL2000TM DNA Marker與100bp DNA Ladder Marker(均由大連寶生物工程TaKaRa有限公司提供)及溴化乙錠(由美國Gibco公司提供)。
1.1.3 菌株
實驗室所使用的標(biāo)準(zhǔn)菌株均為本疾控中心提供,并保存于本實驗室。
1.2 方法
1.2.1 菌株培養(yǎng)
參照GB/T4789.1-2008對現(xiàn)場采集的食物中毒的樣本中細(xì)菌進行培養(yǎng)。
1.2.2 PCR引物設(shè)計
對細(xì)菌基因組的DNA提取,主要采用相關(guān)試劑盒提取,按照試劑盒操作說明書嚴(yán)格執(zhí)行,保存于-20℃?zhèn)溆?。之后以?xì)菌的基因組DNA為模板,根據(jù)GenBank中6種食源性致病菌的序列,分析液體序列后篩選出靶序列,然后根據(jù)靶序列利用設(shè)計的引物對目的基因片段擴增。常規(guī)PCR反應(yīng)體系為:10×PCR Buffer solution 2.5 ?l,2?lDNA模板,引物1?l,dNTP為0.5 ?l,Taq DNA 聚合酶為0.5?l,ddH2O為17.5 ?l。PCR反應(yīng)單循環(huán)條件參數(shù):預(yù)變性95℃ 3 min,反應(yīng)35個循環(huán),每個循環(huán)變性94℃ 30 s,退火58℃ 1 min,延伸72℃ 1 min;循環(huán)結(jié)束后延伸72℃ 10 min,直到冷卻為16℃,產(chǎn)物4℃保存后備用。取5 ?l PCR產(chǎn)物進行瓊脂糖凝膠電泳(3%)與紫外凝膠成像系統(tǒng)觀察最后的結(jié)果,PCR反應(yīng)的退火溫度為50℃~62℃,根據(jù)電泳圖帶的亮度選擇合適的退火溫度,其余PCR其余置入4℃保存留用。
1.2.3 多重?zé)晒釶CR反應(yīng)
基于單一PCR反應(yīng)后,對多重?zé)晒舛縋CR反應(yīng),其相關(guān)體系中除了引物0.5 ?l外,其余均一樣。多重PCR反應(yīng)單循環(huán)參數(shù):預(yù)變性95℃ 3 min,反應(yīng)40個循環(huán),每個循環(huán)變性94℃ 30 s,退火62℃ 1 min,延伸72℃ 1 min;循環(huán)結(jié)束后延伸72℃ 10 min,直到冷卻為16℃,產(chǎn)物4℃保存后備用。取5 ?l PCR產(chǎn)物進行瓊脂糖凝膠電泳(3%)與紫外凝膠成像系統(tǒng)觀察最后的結(jié)果,PCR反應(yīng)的退火溫度為48℃~72℃,根據(jù)電泳圖帶的亮度選擇合適的退火溫度,其余PCR產(chǎn)物置入4℃保存留用。在此檢測過程中嚴(yán)格遵守?zé)o菌操作與標(biāo)準(zhǔn)化采集方式,按照儀器與試劑盒操作說明執(zhí)行。
1.2.4 常規(guī)PCR與多重?zé)晒釶CR反應(yīng)靈敏度比較
測定樣品中致病菌菌株基因組DNA的濃度,將其調(diào)整到20 ng/?l,按照10被梯度稀釋,靈敏度的試驗的DNA濃度為2×10-2×10-10 ng/?l,每個濃度的DNA各取2 ?l后進行常規(guī)PCR與多重?zé)晒釶CR反應(yīng)靈敏度的比較實驗,以此獲得結(jié)果。
1.3 統(tǒng)計學(xué)處理
數(shù)據(jù)處理采用SPSS 22.0統(tǒng)計學(xué)軟件,計量資料以(±s)表示,采用t檢驗,計數(shù)資料用率表示,采用χ2檢驗,(P<0.05)為差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。
2結(jié)果
2.1 食物中毒致病菌檢出情況
54例患者均為食源性食物中毒,引發(fā)食物中毒的致病菌有沙門氏菌、變形桿菌、金黃色葡萄球菌及蠟樣芽胞桿菌4種。沙門氏菌感染食物中毒者最多,其次為變形桿菌感染食物中毒者。感染型細(xì)菌引起的中毒人數(shù)明顯高于毒素型細(xì)菌中毒人數(shù)(P<0.05)。見表1。
2.2 常規(guī)PCR與多重?zé)晒釶CR反應(yīng)靈敏度比較
用兩種PCR同時擴增進10倍稀釋的標(biāo)準(zhǔn)菌株基因組DNA,常規(guī)PCR在DNA的量低至2×10-7 ng/?l時可擴增出清晰特異性的目的條帶,多重?zé)晒舛縋CR在2×10-1 ng/?l可擴增出金黃色葡萄球菌、蠟樣要胞桿菌,在2×10-3 ng/?l時只能擴增出前者金黃色葡萄球菌,后者則不能擴增出,當(dāng)基因組DNA濃度達(dá)到最大濃度時金黃色葡萄球菌 擴增不出來,以此確定出常規(guī)PCR檢測敏感度為2×10-7 ng/?l,而多重?zé)晒舛縋CR靈敏度只有2×10-6 ng/?l。所有患者致病菌經(jīng)常規(guī)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)檢測與多重?zé)晒舛縋CR試劑盒檢測,兩種檢測結(jié)果均一致,檢出率為100%。
3討論
食品安全關(guān)系到人們身體康健與基本社會生產(chǎn)活動的正常開展,一直以來受到各界人士的廣泛關(guān)注[4]。近年來,隨著社會經(jīng)濟發(fā)展水平的提高,一些企業(yè)與商家為了自身利益,在食品原料生產(chǎn)加工過程中被細(xì)菌污染的風(fēng)險提高,而這些致病菌種類較多,不但會給企業(yè)造成重大的經(jīng)濟損失,還會危害人們的生命安全。據(jù)世界衛(wèi)生組織調(diào)查報告顯示[5],全球每年因食物中毒而死亡的約有42萬人,約5500萬人因食源性因素造成腹瀉,其中因腹瀉死亡約23萬人。目前,引起食源性致病菌種類達(dá)300種,對這些致病菌的檢測,是保障食品安全的最基本的要求,而如何快速準(zhǔn)確檢測出致病菌是當(dāng)前相關(guān)結(jié)構(gòu)開展工作的難點[6]。
現(xiàn)階段,對食物中毒人員病原菌的檢測方法有許多,傳統(tǒng)的診斷辦法是對患者糞便、嘔吐物等進行細(xì)菌學(xué)培養(yǎng)觀察,最后得出檢測結(jié)果。該檢測方法耗時較長,且所使用的實驗檢測資源耗費量大,加上在檢測過程中容易受到污染,易造成結(jié)果不準(zhǔn)確等問題,在一定程度耽誤了患者最佳治療時機。而實施熒光定量PCR是在定性PCR基礎(chǔ)上發(fā)展而來的核酸定量技術(shù),通過利用熒光信號積累實時監(jiān)測整個PCR過程,最后通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知模板進行定量分析,該檢測方法具有靈敏度高、準(zhǔn)確性高、特異性強、操作簡便及快速等特點,在食源性致病菌監(jiān)測中應(yīng)用效果良好[7~9]。
本研究結(jié)果顯示,54例患者均為食源性食物中毒,引發(fā)食物中毒的致病菌有4種,分別為沙門氏菌、變形桿菌、金黃色葡萄球菌及蠟樣芽胞桿菌。從感染病菌類型看,感染型細(xì)菌引起的中毒人數(shù)明顯高于毒素型細(xì)菌中毒人數(shù)(P<0.05)。對所有患者進行致病菌經(jīng)常規(guī)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)檢測與多重?zé)晒舛縋CR試劑盒檢測,兩種檢測結(jié)果均一致,檢出率為100%。多重?zé)晒舛縋CR的基因組DNA檢測靈敏度只有2×10-6 ng/?l,常規(guī)PCR檢測敏感度為2×10-7 ng/?l,常規(guī)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)檢測能更為準(zhǔn)確的檢測患者食物中的多種致病菌,但需消耗大量的試劑且所需的檢測時間長,多重?zé)晒舛縋CR檢測所需試劑少且所需的檢測時間短,但其檢測靈敏度較低。這是由于多種熒光定量PCR監(jiān)測是基于常規(guī)PCR基礎(chǔ)上衍生出的多種分子生物學(xué)方法,通過利用兩對或兩對以上的引物及熒光標(biāo)記探針對多個目標(biāo)序列同時監(jiān)測,該方法克服了常規(guī)PCR的不足,可縮短檢測周期,減少成本,提高效率,在食物中毒中應(yīng)用價值明顯。
綜上所述,多重?zé)晒舛縋CR試劑盒在食物中毒中應(yīng)用價值明顯,4種食物致病菌可以在一次檢測種被查出,但其靈敏度低于常規(guī)PCR檢測,可將兩者取長補短,在食物中毒致病菌檢測工作中推廣應(yīng)用,保證人們食品食用安全。
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