李 牧 龔東亮 徐黎明 彭 榮
(1.復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院青浦分院檢驗(yàn)科,上海 201700;2.復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院青浦分院骨科,上海 201700)
乳腺癌是女性常見(jiàn)的惡性腫瘤之一,尋找乳腺癌的危險(xiǎn)因素和誘發(fā)因素,并加以控制,將對(duì)乳腺癌的防治起積極作用[1]。有研究發(fā)現(xiàn),病變細(xì)胞必須以特異性的修復(fù)機(jī)制來(lái)進(jìn)行修復(fù)[2],而著色性干皮病基因組C(xeroderma pigmentosum group C,XPC)編碼的蛋白在早期DNA損傷修復(fù)中起關(guān)鍵作用[3]。為進(jìn)一步探討XPCrs2228000(Ala499Val)位點(diǎn)多態(tài)性在乳腺癌中的作用,本研究擬采用聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)-限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)檢測(cè)XPC基因,并分析XPCrs2228000位點(diǎn)多態(tài)性與乳腺癌發(fā)病的相關(guān)性。
選取2015年3月—2020年3月復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院青浦分院女性乳腺癌患者562例(乳腺癌組),年齡(43.0±9.4)歲。納入標(biāo)準(zhǔn):經(jīng)組織病理學(xué)檢查明確診斷為原發(fā)性乳腺癌。排除標(biāo)準(zhǔn):1)合并其他腫瘤;2)不愿意參加本研究。另選取同期復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院青浦分院體檢健康女性572名(正常對(duì)照組),年齡(45.0±10.2)歲。納入標(biāo)準(zhǔn):1)與病例無(wú)親緣關(guān)系;2)體格檢查和實(shí)驗(yàn)室常規(guī)項(xiàng)目(血常規(guī)、肝功能、腎功能等)檢測(cè)均正常。本研究經(jīng)復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院青浦分院倫理委員會(huì)批準(zhǔn)(青醫(yī)2022-59),所有研究對(duì)象均簽署知情同意書(shū),自愿完成流行病學(xué)調(diào)查。所有患者自愿提供術(shù)前、術(shù)后、化療后的外周血樣本。
1.2.1 問(wèn)卷調(diào)查
采用自主設(shè)計(jì)的問(wèn)卷進(jìn)行調(diào)查,收集所有研究對(duì)象的年齡、妊娠次數(shù)、分娩次數(shù)、婚姻狀況等一般資料,收集乳腺癌患者的絕經(jīng)情況、腫瘤類(lèi)型、雌激素受體(estrogen receptor,ER)、孕激素受體(progesterone receptor,PR)、BRCA1基因表達(dá)情況等臨床病理資料。
1.2.2 樣本采集
采集正常對(duì)照者體檢當(dāng)日和乳腺癌患者術(shù)前1周、術(shù)后(化療后)6周的空腹靜脈血樣本5 mL,-80 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.3 儀器和試劑
全血DNA提取試劑盒、10×PCR Buffer、dNTP mixture、rTaqDNA聚合酶、10×T Buffer、限制性?xún)?nèi)切酶SacⅡ均購(gòu)自日本TaKaRa公司。引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。DNA marker購(gòu)自天根生化科技(北京)有限公司。TOne 96 G PCR擴(kuò)增儀(德國(guó)Biometra公司)。MF-ChemiBIS 3.2電泳凝膠成像分析系統(tǒng)(以色列DNR公司)。
1.2.4XPCrs2228000(Ala499Val)位點(diǎn)多態(tài)性檢測(cè)
采用全血DNA提取試劑盒提取DNA。采用Primer 3.0軟件設(shè)計(jì)DNA引物,由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。上游引物為5'-TAAGGACCCAAGCTTGCCCG-3',下游引物為5'-CCCACTTTTCCTCCTGCTCACAG-3'。以提取的基因組DNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增。PCR反應(yīng)體系:10×PCR Buffer 2.0 μL,2.5 mmol/L dNTP 0.8 μL,10.0 μmol/L上、下游引物各1.0 μL,rTaq DNA聚合酶0.2 μL,DNA模版4.0 μL,ddH2O 11.0 μL。反應(yīng)條件:95 ℃5 min;95 ℃ 30 s,63.3 ℃ 40 s,72 ℃ 40 s,35個(gè)循環(huán);72 ℃ 10 min。PCR-RFLP酶切反應(yīng)體系:10×T Buffer 1 μL,0.1%牛血清白蛋白1 μL,限制性?xún)?nèi)切酶SacⅡ 0.5 μL,PCR 產(chǎn)物3 μL,ddH2O 4.5 μL。采用BeadXpress數(shù)碼微珠芯片系統(tǒng)(美國(guó)Illumina公司)進(jìn)行批量單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)位點(diǎn)檢測(cè),通過(guò)Sequenom Typer4.0軟件(美國(guó)Sequenom公司)確定基因型。
采用SPSS 17.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。呈正態(tài)分布的計(jì)量資料以x±s表示,2個(gè)組之間比較采用獨(dú)立樣本t檢驗(yàn)。計(jì)數(shù)資料以例或率表示,組間比較采用χ2檢驗(yàn)。采用Logistic回歸分析評(píng)估XPCrs2228000位點(diǎn)多態(tài)性與乳腺癌發(fā)病的關(guān)系。以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
乳腺癌組和正常對(duì)照組年齡、妊娠次數(shù)、分娩次數(shù)、婚姻狀況差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。見(jiàn)表1。
表1 乳腺癌組與正常對(duì)照組一般資料比較
PCR酶切產(chǎn)物經(jīng)消化后在150 bp處產(chǎn)生特異性片段,見(jiàn)圖1。
圖1 PCR產(chǎn)物電泳圖
采用限制性?xún)?nèi)切酶鑒定基因型,結(jié)果顯示,CC基因型在131 bp處有特異性條帶,TT基因型在150 bp處有特異性條帶。見(jiàn)圖2。
圖2 限制性?xún)?nèi)切酶酶切產(chǎn)物電泳結(jié)果
所有研究對(duì)象的基因型頻率分布均符合Hardy-Weinberg遺傳平衡定律(乳腺癌組:χ2=0.038,P=0.781;正常對(duì)照組:χ2=1.512,P=0.237),具有群體代表性。
乳腺癌組和正常對(duì)照組CC基因型(野生型)、CT基因型(雜合型)、TT基因型(純合型)和等位基因(C、T)的分布頻率差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.01)。見(jiàn)表2。
表2 乳腺癌組與正常對(duì)照組XPC rs2228000位點(diǎn)基因型和等位基因分布頻率比較
Logistic回歸分析結(jié)果顯示,以CC基因型為對(duì)照,CT和TT基因型個(gè)體乳腺癌的發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)顯著增高[比值比(odds ratio,OR)值分別為1.36、2.44,95%可信區(qū)間(confidence interval,CI)分別為1.06~1.75、1.64~3.65];以C等位基因?yàn)閷?duì)照,攜帶T等位基因的個(gè)體乳腺癌的發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)顯著增高(OR=1.52,95%CI為1.37~1.94)。
ER陽(yáng)性、病理類(lèi)型為浸潤(rùn)性導(dǎo)管癌的乳腺癌患者XPCrs2228000位點(diǎn)基因型分布分別與ER陰性、其他病理類(lèi)型(浸潤(rùn)性小葉癌、原位癌等)的患者比較,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);不同年齡、絕經(jīng)狀態(tài)、PR表達(dá)、BRCA1基因表達(dá)的乳腺癌患者之間XPCrs2228000位點(diǎn)基因型分布差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。以其他病理類(lèi)型(浸潤(rùn)性小葉癌、原位癌等)為對(duì)照,CT+TT基因型的乳腺癌患者病理類(lèi)型為浸潤(rùn)性導(dǎo)管癌的風(fēng)險(xiǎn)增高(OR=2.3,95%CI為1.3~4.0)。以CC基因型為對(duì)照,CT+TT基因型的乳腺癌患者ER陽(yáng)性的風(fēng)險(xiǎn)顯著增高(OR=1.9,95%CI為0.8~2.5)。見(jiàn)表3。
表3 不同臨床病理參數(shù)乳腺癌患者XPC rs2228000位點(diǎn)基因型分布比較
XPC蛋白可與紫外切除修復(fù)蛋白R(shí)AD23B形成異二聚體復(fù)合物[4],在核苷酸切除修復(fù)(nucleotide excision repair,NER)的早期發(fā)揮作用,是核苷酸切除修復(fù)系統(tǒng)的重要組成部分[5]。有研究結(jié)果顯示,XPC可與人源RAD23B重組蛋白相互作用,形成XPC-RAD23B復(fù)合物,激活p53抑癌基因,導(dǎo)致細(xì)胞周期阻滯,并在DNA識(shí)別和NER機(jī)制的啟動(dòng)中發(fā)揮重要作用[6-7]。XPC基因結(jié)構(gòu)功能障礙可導(dǎo)致DNA修復(fù)能力降低,目前已被證實(shí)與肝癌、食管癌、胃癌、乳腺癌等多種惡性腫瘤的易感性相關(guān)[8-9]。
本研究結(jié)果顯示,乳腺癌組與正常對(duì)照組基因型(CC、CT、TT)和等位基因(C、T)的分布頻率差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.01);攜帶T等位基因的個(gè)體(CT+TT基因型)乳腺癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)是攜帶C等位基因個(gè)體的1.52倍(OR=1.52,95%CI為1.37~1.94),攜帶CT和TT基因型的個(gè)體乳腺癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)分別是攜帶CC基因型個(gè)體的1.36和2.44倍(OR值分別為1.36、2.44,95%CI分別為1.06~1.75、1.64~3.65)。提示XPCrs2228000(Ala499Val)位點(diǎn)多態(tài)性→T變異與乳腺癌發(fā)病有關(guān)。吳茵茵等[10]發(fā)現(xiàn),XPCrs2228000位點(diǎn)多態(tài)性與乳腺癌發(fā)生無(wú)關(guān),與本研究結(jié)果不一致。原因可能與地區(qū)、樣本數(shù)量、基因之間遺傳連鎖不平衡和缺少其他腫瘤患者XPCrs2228000位點(diǎn)多態(tài)性研究等有關(guān)。
有研究結(jié)果顯示,XPC基因會(huì)影響不同個(gè)體對(duì)DNA損傷的修復(fù)能力,從而影響患者惡性腫瘤的發(fā)生、激素水平和預(yù)后[11-12]。本研究結(jié)果顯示,XPCrs2228000位點(diǎn)基因型分布與ER陽(yáng)性和病理分型有關(guān);以其他病理類(lèi)型(浸潤(rùn)性小葉癌、原位癌等)為對(duì)照,CT+TT基因型個(gè)體發(fā)生浸潤(rùn)性導(dǎo)管癌的風(fēng)險(xiǎn)增高(OR=2.3,95%CI為1.3~4.0),且含等位基因T的個(gè)體所占比例較高(71.7%)。浸潤(rùn)性導(dǎo)管癌是乳腺癌的常見(jiàn)類(lèi)型,表現(xiàn)為分化程度低,預(yù)后較差[13]。本研究結(jié)果還顯示,XPCrs2228000位點(diǎn)多態(tài)性與年齡、絕經(jīng)狀態(tài)、PR、BRCA1等均無(wú)關(guān)(P>0.05),與文獻(xiàn)報(bào)道[14-15]一致。但因隨訪時(shí)間較短,人群地域分布較集中,可能存在與其他未知功能性SNP之間連鎖不平衡的偏差,本研究結(jié)果可能具有一定的局限性。
綜上所述,XPCrs2228000位點(diǎn)多態(tài)性與乳腺癌發(fā)病有一定關(guān)系。