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        血液腫瘤T淋巴細胞免疫功能相關ncRNAs的研究進展

        2022-12-31 11:52:34練佳儀綜述査顯豐審校
        海南醫(yī)學 2022年3期
        關鍵詞:功能

        練佳儀 綜述 査顯豐 審校

        暨南大學附屬第一醫(yī)院臨床檢驗中心,廣東 廣州 510000

        血液腫瘤是起源于造血系統(tǒng)的一大類惡性腫瘤的統(tǒng)稱,主要包括白血病、淋巴瘤和骨髓瘤等,其傳統(tǒng)治療手段通過放療、化療及干細胞移植進行,但這些疾病的復發(fā)率及死亡率仍然很高。隨著對血液腫瘤分子學及免疫學研究的深入,流式細胞分析、染色體核型分析和基因分析結合細胞形態(tài)學等多種方法提高了診斷血液腫瘤的準確性[1]。而且基因分析對疾病的診斷、預后評估及指導治療具有重要意義,如NPM1突變和雙等位基因CEBPA突變的AML被診斷為AML亞型;KIT突變的t(8;21)或inv(16)/t(16;16)AML患者預后具有不良影響[2]。主要運用RNASeq、單細胞測序技術以及單分子測序技術等檢測方法進行基因分析[3]。另外發(fā)現血液腫瘤發(fā)生發(fā)展以及預后與機體的免疫系統(tǒng)功能密切相關[4],T細胞耗竭是導致血液系統(tǒng)惡性腫瘤免疫逃逸原因之一,嵌合抗原受體T(CAR-T)細胞過繼細胞療法(ACT)可通過重編程恢復衰竭T細胞的活性,對治療復發(fā)/難治性血液系統(tǒng)惡性腫瘤具有顯著效果[5]。然而CAR-T細胞存在有效性和持久性低以及治療后不良反應[6]。最近在血液腫瘤中發(fā)現非編碼RNA(noncoding RNA,ncRNA)參與了T淋巴細胞免疫功能的調控,本文將總結近期與血液腫瘤T細胞免疫功能相關非編碼RNA的研究進展,為深入理解血液腫瘤T細胞免疫功能缺陷提供參考。

        1 血液腫瘤T細胞免疫功能

        T淋巴細胞在機體抗腫瘤免疫過程中發(fā)揮中心作用。T淋巴細胞主要分為輔助性T淋巴細胞(CD4+T淋巴細胞)和細胞毒性T淋巴細胞(CTL)(CD8+T淋巴細胞)兩群,其中CTL是抗腫瘤免疫核心細胞,它通過其表面表達的腫瘤抗原特異性T細胞受體(TCR)特異性識別殺傷腫瘤細胞,CD4+T淋巴細胞則通過多種機制激活CD8+T細胞,使其分化為CTL,同時還能維持并加強CTL的抗腫瘤反應[7]。機體免疫系統(tǒng)與腫瘤細胞對抗是一個動態(tài)的博弈過程,在機體持續(xù)免疫壓力下腫瘤細胞也會出現逃避免疫監(jiān)視,其中T淋巴細胞免疫功能缺陷是腫瘤細胞免疫逃避的主要機制之一。

        在多數血液腫瘤患者中都發(fā)現T淋巴細胞存在不同程度的免疫功能缺陷,腫瘤誘導的T淋巴細胞無能和T淋巴細胞耗竭是引起T細胞免疫功能缺陷的主要原因[8]。腫瘤誘導的T淋巴細胞無能和T淋巴細胞耗竭主要跟一些免疫抑制性分子如PD-1等有關,T淋巴細胞過表達或缺失一些免疫抑制性分子,這些抑制性受體與腫瘤細胞上的配體結合導致T淋巴細胞無能或凋亡,例如,ZELLE-RIESER等[9]發(fā)現骨髓瘤患者骨髓CD8+T細胞上抑制受體PD-1及CTLA-4表達升高,引起了骨髓瘤患者TME中T細胞的增殖和細胞毒性能力受損,提示了T細胞衰竭;KONG等[10]發(fā)現在急性髓性白血病患者中CD8+T細胞上抑制性受體TIGIT表達顯著升高,使得CD8+T細胞表現出衰竭和功能狀態(tài)受損的特征;在霍奇金淋巴瘤(HL)患者中也發(fā)現RS細胞過表達Galectin-1(Gal1),Gal1能選擇性殺死Th1和Th17細胞和CTL細胞,從而導致Th1、Th17和CTL耗竭,TMETreg細胞的擴增[11]。

        2 血液腫瘤中T細胞免疫相關ncRNA

        ncRNA是一類不翻譯成蛋白質的功能性RNA分子[12]。根據功能和大小大致將非編碼RNA分為3類:“管家”非編碼RNA(housekeeping noncoding RNA)、小RNA(small RNA,sRNA)和長非編碼RNA(long noncoding RNA,lncRNA)。LncRNA為轉錄長度>200個堿基對,其特征在于低蛋白質編碼潛力[13]。sRNA包括miRNAs、piRNAs和siRNAs等,其中miRNA是一類內源性的非編碼短小RNA,通過與靶mRNA的3'非翻譯區(qū)(3'untranslated regions,3'UTR)特異性結合從而在轉錄后水平調控靶基因的表達[14]。另外,最近發(fā)現了一類新型的非編碼RNA—CircRNA,通過典型的5'至3'-磷酸二酯鍵的環(huán)狀構型組成,不包含5'或3'游離末端,在細胞中更加穩(wěn)定,并在真核生物中廣泛表達[15]。非編碼RNA通過與蛋白、DNA和RNA相互作用,參與細胞的增殖、分化及凋亡等生物過程的調控[16]。目前,大量研究證實非編碼RNA例如micro RNA、lnc RNA、circRNA等參與了T細胞發(fā)育的不同步驟并調控T細胞的生殖和凋亡[17],且非編碼RNA的失控有助于血液腫瘤的發(fā)展和進展[18]。

        2.1 miR-363 miR-17-92家族編碼miR-17-92簇(miR-17、miR-18a、miR-19a、miR-20a、miR-19b-1、miR-92a)和兩個旁系同源物(miR-106b-25、miR-106a-363),其定位于人類13號染色體(13q31.3)[19]。miR-363來源于miR-17-92家族,其表達促進了細胞增殖,誘導腫瘤血管生成,并抑制癌細胞的凋亡,具有促癌作用[20]。細胞間的接觸和可溶性因子的交換是腫瘤微環(huán)境(TME)中細胞間通訊的關鍵介體,但最近研究發(fā)現細胞外囊泡(EV)脫落也成為另一種模式的細胞間信號傳遞[21]。在慢性淋巴細胞白血病(CLL)患者中,B細胞受體(BCR)的活化加強了CLL-EVs的分泌,CLLEVs及其內容物主動轉移到基質細胞中,從而誘導細胞內信號傳導[22]。SMALLWOOD等[23]通過分析CD40和白介素4(IL-4)刺激后CLL細胞釋放的EV的microRNAs譜,發(fā)現miR-363在CD40/IL-4刺激的CLL細胞衍生的EV高度富集,并且證實其主要靶標是T細胞免疫調節(jié)受體CD69。表明攜帶miR-363的CD40/IL-4刺激的CLL細胞釋放的EV可以在功能上轉移至靶CD4+T細胞,從而直接調控mRNA靶CD69,進而增強CD4+T細胞的遷移、免疫突觸信號傳導、與自體腫瘤細胞的相互作用以及促進自體腫瘤細胞增殖。

        2.2 miR-34a miR-34a編碼在1p36染色體上,在正常人的組織中普遍表達。在各種癌癥組織如乳腺癌、前列腺癌、肝癌和肺癌等均可發(fā)現miR-34a的失調[24],主要通過調節(jié)與腫瘤發(fā)生和癌癥進程有關的多個靶標(例如MYC、MET、CDK4/6、NOTCH1、BCL2、CD44)和許多其他分子[25]。PD-1及其配體PD-L1作為抑制性免疫檢查點,能使T細胞的活化、成熟和擴增均受到抑制,并誘導其凋亡[26]。在急性髓性白血病(AML)中,CD8+T細胞上PD-1表達的增加可能是導致CTL功能障礙和在AML發(fā)展過程中抑制免疫反應的因素之一。WANG等[27]發(fā)現PD-L1在人類急性髓系白血病樣本中過度表達,并且表達水平與miR-34a表達呈負相關。轉染miR-34a降低PD-L1表達,降低IFN-γ誘導的PD-L1表達;而使用miR-34a抑制劑則誘導的PD-L1表達增加。其機制是由于miR-34a與PD-L1的3'UTR特異性結合導致PD-L1翻譯抑制,另外miR-34a還可以有效減少細胞因子IL-10下游PDL1的產生,減少PDL1特異性T細胞凋亡。

        2.3 miR-15a/16 miR-15a/16位于人染色體13 q14.3,參與抗腫瘤細胞增殖和促進凋亡活動,在多種腫瘤例如CLL、前列腺癌、垂體腺瘤中均發(fā)現其下調[28],另外50%以上的多發(fā)性骨髓瘤(MM)患者有該染色體的缺失。LI等[29]研究發(fā)現MM患者細胞中miR-15a/16的表達顯著降低,而miR-15a/16通過抑制抗凋亡蛋白Bcl-2的表達增加骨髓瘤細胞的凋亡率從而抑制骨髓瘤細胞增殖;另外還發(fā)現miR-15a/16可以降低骨髓瘤細胞上清液中血管內皮生長因子-A和白細胞介素-17的水平。Th17細胞是腫瘤免疫中重要的免疫細胞,可分泌促炎細胞因子如IL-17,其在多發(fā)性骨髓瘤患者中明顯上調具有促進骨髓瘤細胞的生長,表明了miR-15a/16可能通過抑制血管生成或增強多發(fā)性骨髓瘤的抗腫瘤免疫來發(fā)揮抑制腫瘤進展的重要抗腫瘤作用,但白細胞介素-17和血管內皮生長因子-A的相關性尚未明確。

        2.4 LncHOTAIR HOTAIR是具有2 158個核苷酸和6個外顯子的反式lncRNA,是從HOXC基因簇的反義鏈轉錄而來的,該簇特別位于12q13.13號染色體上的HoxC11和HoxC12之間[30]。許多研究證明HOTAIR的異常表達存在于多種類型的癌癥中,包括乳腺癌、膀胱癌和肺癌,以及HOTAIR的過度表達與乳腺癌、胃癌和結腸癌的增強有關[31]。在白血病中LI等[32]通過小鼠白血病模型探討lncRNA HOTAIR通過Wnt/βcatenin對小鼠免疫排斥反應的影響,結果發(fā)現HOTAIR的表達在白血病小鼠中顯著增加,HOTAIR的過度表達通過Wnt/β-catenin信號通路激活參與白血病細胞的免疫排斥。此外,HOTAIR升高導致外周血中轉化生長因子-β、干擾素-γ、白介素10和腫瘤壞死因子-α的水平降低,促進了T淋巴細胞的增殖并抑制了免疫球蛋白的產生、NK細胞的活性和使CD4/CD8 T細胞亞群的比例降低。

        2.5 Lnc INSR 人胰島素受體基因(INSR)跨度約180 kb,由22個外顯子組成。前11個外顯子編碼細胞外α亞基,其余11個外顯子編碼細胞內β亞基。與T-ALL免疫細胞中相關的lncRNA稱為lnc-INSR,詳細的轉錄本名稱注釋為enst0000504928.1或TCONS_00011506,位于19p13.3號染色體上,大小482 bp[33]。在白血病患者中,Tregs可以被白血病細胞招募和利用,以逃避免疫監(jiān)視[34]。WANG等[35]通過對兒童TALL患者和健康志愿者的T細胞浸潤BM進行轉錄組高通量測序,發(fā)現lnc-INSR表達存在顯著性差異,隨后通過膜和細胞質定位以及與INSR和前叉箱P3的共定位證實lnc-INSR的表達與Treg分布呈正相關,lnc-INSR通過結合INSR蛋白來阻斷INSR的泛素化位點以增強Treg中PI3K/AKT途徑的活化,從而增強Treg細胞的分化,進而促進免疫抑制。這一過程導致BM中免疫抑制性微環(huán)境的促進并降低了細胞毒性T淋巴細胞的百分比,從而誘導腫瘤生長。這種環(huán)境能夠在白血病細胞中誘導更具侵略性的腫瘤生長。

        2.6 Lnc SNHG14 小核仁RNA宿主基因14(SNHG14)也被稱為泛素蛋白連接酶E3A反義序列(UBE3A-ATS),是一個19.2 kb的轉錄本,位于15q11.2號染色體上。在其反義方向上重疊了整個UBE3A基因和啟動子,SNHG14最初被發(fā)現是UBE3A表達的沉默子[36]。SNHG14已被證明可通過調節(jié)多種惡性腫瘤(例如胃癌、透明細胞腎細胞癌和乳腺癌)的增殖、遷移、侵襲并賦予化學抗性來引發(fā)致癌功能。ZHAO等[37]發(fā)現SNHG14在彌漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)細胞中明顯上調,具有促使癌細胞增殖、遷移和上皮-間充質轉化(EMT),促進DLBCL進展和免疫逃逸的作用。其免疫逃逸機制主要是SNHG14/miR-5590-3p通過上調鋅指E-box結合同源異型盒1(ZEB1),而ZEB1轉錄激活SNHG14和PD-1/PD-L1免疫檢查點誘導DLBCL細胞與CD8+T細胞相互作用,并觸發(fā)CD8+T細胞凋亡從而有助于DLBCL細胞的免疫逃逸。

        2.7 circPVT1 人漿細胞瘤變易位1(PVT1)基因位于染色體8q24.21條帶,與c-Myc基因相鄰,它同時編碼環(huán)狀RNA和線性ncRNA亞型,以及6個microRNAs[38]。臨床前和臨床數據表明,PVT1和/或circPVT1在骨髓和淋巴系中具有潛在的作用。峰值PVT1變體處于中等連鎖不平衡狀態(tài),具有四個可能具有調控作用的變體(rs1499364、rs7001706、rs35135218、rs10601187),這些變體可能會影響轉錄因子結合位點。尤其是,rs1499364位于開放染色質區(qū)域和組蛋白標記中,作用于Treg細胞中進行主動轉錄。此外,內含子變體rs7001706位于Treg細胞中的H3K4me1組蛋白標記中,并位于FOXP3轉錄因子結合基序中。表明circPVT1在髓系和淋巴樣細胞亞群中表現出免疫抑制特性[39]。另外,HU等[40]研究發(fā)現與正常骨髓相比,在急性淋巴細胞白血病(ALL)患者中circPVT1均高表達,研究進一步發(fā)現circPVT1通過作用于其鄰近基因c-Myc和抗凋亡Bcl-2蛋白,促進細胞增殖,抑制細胞凋亡。但是,MYC作為PVT1的下游靶標與其參與調節(jié)免疫抑制功能之間的機制尚未明確,其中可能涉及ROS產生和ARG1活性[41]。

        3 結語

        ncRNAs占真核基因轉錄基因的絕大多數,數量龐大,參與細胞增殖、分化和凋亡等各種生物過程的調控。在血液腫瘤T淋巴細胞免疫功能的調控中,ncRNAs也發(fā)揮一定的作用,但是,目前相關ncRNAs的報道還是不多,同時它們調控T淋巴細胞機制也尚不清晰,因此需要通過更多更深入的研究。有理由相信通過不斷地研究,會有越來越多與血液腫瘤T細胞免疫相關的ncRNAs被發(fā)現。這些ncRNAs不僅有望成為潛在的腫瘤免疫治療的靶點,還可以成為臨床監(jiān)測機體免疫狀態(tài)的生物標志物。

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