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        糖尿病腎病患者NTN4、MTHFR、FZD2、AKR1B1基因DNA甲基化水平與危險(xiǎn)因素分析

        2022-12-02 07:09:56劉愷遠(yuǎn)牟新
        浙江醫(yī)學(xué) 2022年21期
        關(guān)鍵詞:甲基化引物基因

        劉愷遠(yuǎn) 牟新

        糖尿病腎病(diabetic kidney disease,DKD)作為糖尿病常見的微血管并發(fā)癥之一,以持續(xù)尿蛋白及腎功能下降為主要臨床表現(xiàn),是導(dǎo)致終末期腎臟疾?。╡nd stage renal disease,ESRD)的最主要病因之一[1]。DKD的病因及發(fā)病機(jī)制錯(cuò)綜復(fù)雜,包括表觀遺傳(主要包括DNA甲基化)、終末糖基化產(chǎn)物形成、血流動(dòng)力學(xué)異常、炎癥反應(yīng)和細(xì)胞因子、氧化應(yīng)激及腎小球足細(xì)胞損傷、腸道菌群改變等[2-5]。越來越多的證據(jù)提示表觀遺傳在DKD發(fā)病過程中起重要作用,內(nèi)外環(huán)境因素改變引起表觀遺傳變化,例如長(zhǎng)期高糖環(huán)境引起的DNA甲基化與DKD的發(fā)生密切相關(guān)[6]。本研究采用甲基化特異性PCR法(methylation-specific PCR,MS-PCR)及非甲基化特異性PCR法(non-methylation-specific PCR,UMS-PCR)檢測(cè) NTN4、MTHFR、FZD2、AKR1B1基因DNA甲基化水平,探討甲基化水平與危險(xiǎn)因素的相關(guān)性,現(xiàn)將結(jié)果報(bào)道如下。

        1 對(duì)象和方法

        1.1 對(duì)象 選擇2016年10月至2017年10月杭州市紅十字會(huì)醫(yī)院收治的單純糖尿病(diabetes mellitus,DM)患者(DM組)及DKD患者(DKD組)各20例。另?yè)裢隗w檢健康者20名作為對(duì)照組。DM組男10例,女 10例,年齡 38~83(62.6±11.15)歲;DKD 組男 14例,女 6例,年齡37~80(64.15±11.86)歲;對(duì)照組男10例,女10例,年齡47~69(60.40±5.64)歲。3組對(duì)象性別、年齡比較差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P>0.05)。納入標(biāo)準(zhǔn):對(duì)照組既往身體健康,無糖尿病等慢性病;DM組符合1999年WHO糖尿病診斷及分型標(biāo)準(zhǔn)中糖尿病診斷且非DKD患者;DKD組有明確的糖尿病病史,尿白蛋白排出率在6個(gè)月內(nèi)連續(xù)2次>20 μg/min(或>30 mg/24 h),或蛋白尿(>0.5 g/24 h),或腎臟穿刺證實(shí)符合DKD診斷[7]。排除標(biāo)準(zhǔn):原發(fā)性腎臟病及其他腎臟病,腎動(dòng)脈狹窄性高血壓;半年內(nèi)惡性高血壓、心腦血管意外、高血糖高滲性昏迷等急危重癥病史者;合并有心、肝、肺、腦和造血系統(tǒng)等嚴(yán)重原發(fā)性疾病,精神病者;癌癥、妊娠及哺乳期者。本研究經(jīng)本院醫(yī)學(xué)倫理委員會(huì)審核通過[批準(zhǔn)文號(hào):(2020)快審第(198)號(hào)],患者及家屬均簽署知情同意書。

        1.2 方法

        1.2.1 臨床資料收集 收集所有對(duì)象血壓、身高、體重等一般資料。采用自動(dòng)血生化分析儀(寧波瑞源生物科技有限公司)檢測(cè)血肌酐、尿素氮、FPG等指標(biāo)。采用全自動(dòng)糖化血紅蛋白分析儀(深圳邁瑞生物醫(yī)療電子股份有限公司)、高壓液相色譜法檢測(cè)糖化血紅蛋白(hemoglobin A1C,HbA1C)。采用全自動(dòng)尿生化分析儀(深圳邁瑞生物醫(yī)療電子股份有限公司)、免疫透射比濁法和苦味酸法檢測(cè)尿微量白蛋白與肌酐比值(urinary albumin creatinine ratio,UACR)。

        1.2.2 全血DNA提取及亞硫酸氫鈉修飾 收集所有對(duì)象肘靜脈血2 ml,用DNA提取試劑盒提取靜脈血中的DNA,用微量紫外分光光度計(jì)測(cè)定260 nm和280 nm吸光值(A),計(jì)算DNA含量,-80℃冰箱保存?zhèn)溆谩?yīng)用甲基化試劑盒按照說明書進(jìn)行DNA亞硫酸氫鈉修飾處理。

        1.2.3 NTN4、MTHFR、FZD2、AKR1B1基因 DNA甲基化水平檢測(cè) 采用MS-PCR和UMS-PCR法。將亞硫酸氫鈉處理過的DNA用甲基化引物及非甲基化引物分別進(jìn)行擴(kuò)增。引物由Methyl Primer Express v1.0設(shè)計(jì),由上海捷瑞生物工程有限公司合成。PCR反應(yīng)體系 為 50 μl,其 中 H2O 34.8 μl,5×buffer GC 10 μl,dNTP 1 μl;Primer 1 μl,Primer 1 μl,Template 2 μl,Taq 0.2 μl。PCR條件及設(shè)定反應(yīng)程序:95℃預(yù)變性3 min,94 ℃變性 30 s,52 ℃退火 30 s,72 ℃延伸1 min,運(yùn)行40個(gè)循環(huán),72℃修復(fù)延伸7 min結(jié)束反應(yīng)。由于直接用甲基化引物擴(kuò)增不理想,先用巢式引物擴(kuò)增后,稀釋40倍作為模板擴(kuò)增甲基化和非甲基化引物。使用180 V、50 min、1.2%的瓊脂糖電泳,置于凝膠成像儀(上海天能科技有限公司)上拍照保存?zhèn)錂z。采用Image J軟件分析MS-PCR條帶灰度值(M)和UMS-PCR條帶灰度值(U),甲基化率=M/(M+U)。PCR引物序列、產(chǎn)物大小見表1。

        1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用SPSS 23.0統(tǒng)計(jì)軟件。符合正態(tài)分布的計(jì)量資料以表示,多組比較采用單因素方差分析,組間兩兩比較采用LSD-t檢驗(yàn);不符合正態(tài)分布的計(jì)量資料以M(P25,P75)表示,組間比較采用非參數(shù)檢驗(yàn)。計(jì)數(shù)資料組間比較采用χ2檢驗(yàn)。血清AKR1B1基因DNA甲基化相關(guān)因素分析采用線性相關(guān)性檢驗(yàn)和多元線性回歸法。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 各組臨床指標(biāo)比較 DM組、DKD組FPG、HbA1C均高于對(duì)照組(均P<0.01)。DKD組BMI高于對(duì)照組(P<0.05),血尿素氮水平高于對(duì)照組及DM組(均P<0.05),UACR高于DM組(均P<0.01)。見表2。

        表2 各組臨床指標(biāo)比較

        2.2 各組 NTN4、MTHFR、FZD2、AKR1B1基因DNA甲基化率比較 DKD組FZD2、AKR1B1基因DNA甲基化率較DM組升高,DM組甲基化率均較對(duì)照組升高,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P<0.05)。3組NTN4、MTHFR甲基化率比較差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P>0.05)。見表3。3組對(duì)象 NTN4、MTHFR、FZD2、AKR1B1 DNA基因的MS-PCR及UMS-PCR擴(kuò)增電泳圖見圖1。

        圖1 3組對(duì)象NTN4、MTHFR、FZD2、AKR1B1基因的MS-PCR及UMS-PCR擴(kuò)展產(chǎn)物電泳圖

        表3 各組 NTN4、MTHFR、FZD2、AKR1B1基因DNA甲基化率比較(%)

        2.3 DKD患者AKR1B1甲基化率的危險(xiǎn)因素分析對(duì)DKD患者的AKR1B1基因危險(xiǎn)因素進(jìn)行分析,包括年齡、BMI、血肌酐、LDL-C、糖尿病病程、HbA1C、UACR等指標(biāo),結(jié)果顯示,AKR1B1基因DNA甲基化率與HbA1C、UACR 均呈負(fù)相關(guān)(r=-0.593、-0.564,均 P<0.05),見表4。將HbA1C、UACR納入多元回歸分析,結(jié)果顯示,HbA1C、UACR與AKR1B1基因DNA甲基化率相關(guān)(β=-0.517、-0.471,均P<0.05),HbA1C、UACR越高,AKR1B1基因DNA甲基化率越低,見表5。

        表4 DKD患者AKR1B1基因DNA甲基化率的危險(xiǎn)因素分析

        表5 DKD患者AKR1B1基因DNA甲基化率危險(xiǎn)因素的多元回歸分析

        3 討論

        表觀遺傳學(xué)是不涉及DNA結(jié)構(gòu)變化的可遺傳性改變,其中DNA甲基化是最主要表觀遺傳方式之一[8]。DNA甲基化的是在二核苷酸胞嘧啶上添加一個(gè)甲基的化學(xué)修飾過程。研究發(fā)現(xiàn),高糖等異常環(huán)境因素影響下,DNA甲基化狀態(tài)發(fā)生改變,會(huì)使基因表達(dá)發(fā)生上調(diào)與下調(diào),最終損傷腎臟,DNA甲基化參與了DKD的發(fā)病過程[9]。Sapienza等[10]通過西班牙和非洲裔美國(guó)ESRD及單純DM兩組患者的唾液樣本,比較了14 000個(gè)DNA甲基化的差異基因,得出 NTN4、MTHFR、FZD2、AKR1B1等 39個(gè)基因與DKD進(jìn)展密切相關(guān)。本研究未采用上述研究的唾液樣本,采用外周血樣本為對(duì)象研究DNA甲基化情況,結(jié)果提示DKD患者血液中FZD2及AKR1B1基因DNA甲基化水平顯著高于DM組和對(duì)照組;在NTN4、MTHFR基因DNA甲基化中未觀察到差異。提示FZD2、AKR1B1基因血中的甲基化率升高可能參與了DKD的發(fā)病過程。

        卷曲蛋白2(frizzled2,FZD2)屬于卷曲蛋白家族系統(tǒng),是WNT信號(hào)通路的重要配體之一,對(duì)于FZD2目前研究集中在癌癥細(xì)胞生長(zhǎng)與侵襲上,F(xiàn)ZD2蛋白能通過肝細(xì)胞、乳腺上皮細(xì)胞上皮到間充質(zhì)改變,使乳腺癌、肝癌等癌癥侵襲性增強(qiáng)[11-12],但FZD2基因DNA甲基化對(duì)DKD影響是否同樣通過上皮細(xì)胞EMT改變達(dá)成尚不明確。

        有研究證實(shí),AKR1B1基因通過全基因組關(guān)聯(lián),是目前已發(fā)現(xiàn)的幾個(gè)DKD的遺傳因子之一[13],足以證明其在DKD發(fā)病中的重要作用,AKR1B1是編碼醛糖還原酶(aldose reductase,AR)的基因,AR參與了經(jīng)典的多元醇通路,是該通路極為關(guān)鍵的限速酶,會(huì)導(dǎo)致山梨醇堆積,增加了氧化應(yīng)激,使細(xì)胞內(nèi)呈高滲狀態(tài)、細(xì)胞水腫、缺氧,從而導(dǎo)致腎臟、眼底及周圍神經(jīng)的損傷[14-15],在臨床上AR抑制劑如依帕司他治療DKD、糖尿病視網(wǎng)膜病變及周圍神經(jīng)病變效果顯著[16]。本研究結(jié)果提示,在DKD組中AKR1B1基因DNA的低甲基化水平與HbA1C及UACR增高有關(guān),提示在DKD患者中AKR1B1基因DNA的甲基化水平越低,血糖及尿蛋白水平越高,與Ademir等[17]的研究結(jié)果相似。由此推斷AKR1B1基因可能有潛力成為DKD的早期生物標(biāo)志物,AKR1B1基因DNA甲基化可能通過多元醇途徑影響DKD的進(jìn)展。

        NTN4、MTHFR基因DNA甲基化率無明顯變化,可能此兩個(gè)基因發(fā)生的甲基化改變主要集中在唾液樣本中,而非血液中,也證實(shí)相同一個(gè)基因在人體不同組織中甲基化率也存在差異[9]。

        綜上所述,F(xiàn)ZD2、AKR1B1基因DNA甲基化可能參與了DKD的發(fā)生、發(fā)展過程,AKR1B1基因DNA甲基化程度與HbA1C及UACR之間呈負(fù)相關(guān)。但本研究有一定局限性,未測(cè)定24 h尿蛋白量,在DKD早期,UACR準(zhǔn)確性與24 h尿蛋白基本等同,但在大量蛋白尿期仍需測(cè)定24 h尿蛋白量,有待后續(xù)進(jìn)一步研究證實(shí)。

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