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        建立檢測樹鼩葡萄糖轉(zhuǎn)運蛋白GLUT9 mRNA相對表達水平的實時熒光定量PCR方法?

        2022-11-22 08:12:20龍維虎王陳蕓李哲麗葉尤松施紅進唐東紅
        生物學(xué)通報 2022年1期
        關(guān)鍵詞:肌苷核苷酸高尿酸

        龍維虎 王陳蕓 李哲麗 葉尤松 施紅進 李 濤 肖 涵 唐東紅??

        (1 中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院/北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院,醫(yī)學(xué)生物學(xué)研究所 云南昆明 650118 2 云南中醫(yī)藥大學(xué) 云南昆明 650200)

        近年來,隨著生活水平的提高,營養(yǎng)物質(zhì)豐富,食物攝入過量,血清高尿酸呈上升趨勢[1]。我國高尿酸血癥人群數(shù)量達1 億多,發(fā)病年齡逐漸縮小。高尿酸血癥人群主要表現(xiàn)為血清尿酸鹽濃度過高,女性血尿酸濃度高于6.0 mg/dL,男性血尿酸濃度高于7.0 mg/dL,臨床診斷為高尿酸血癥[2]。血清尿酸水平的升高會增加痛風(fēng)、高血壓、心臟病、糖尿病的發(fā)病風(fēng)險,控制血清高尿酸水平,已成為治療代謝綜合征相關(guān)疾病的有效手段[3-7]。體內(nèi)尿酸的產(chǎn)生及代謝包括肝臟尿酸產(chǎn)生的調(diào)節(jié),腎臟、小腸的重吸收及調(diào)節(jié)等復(fù)雜過程[8],通過尿酸轉(zhuǎn)運蛋白完成腎臟和小腸的尿酸分泌及重吸收,保持著血尿酸的平衡[9]。

        葡萄糖轉(zhuǎn)運蛋白(glucose transporters,GLUT)是將細胞外葡萄糖轉(zhuǎn)運至細胞內(nèi)的一個跨膜蛋白家族,參與葡萄糖代謝、免疫反應(yīng)和炎癥反應(yīng)。到目前為止,已發(fā)現(xiàn)10 多種參與葡萄糖運輸?shù)牡鞍踪|(zhì),分布在不同組織,功能也不完全相同,其中GLUT9 由SLC2A9基因編碼,發(fā)揮著將尿酸轉(zhuǎn)運到細胞外,維持機體血清尿酸平衡的作用[10]。研究發(fā)現(xiàn),敲除SLC2A9基因的小鼠表現(xiàn)出尿酸濃度偏高,易發(fā)生腎結(jié)石及腎臟纖維炎癥等疾病[11]。遺傳學(xué)研究表明,影響尿酸的排泄原因約90%認為是基因多態(tài)性遺傳缺陷使近端腎小管對尿酸鹽重吸收的轉(zhuǎn)運蛋白GLUT9 功能發(fā)生異常所致[12],可見GLUT9 對調(diào)節(jié)尿酸鹽水平起著重要影響。

        樹鼩(Tupaia belangeri chinensis)屬攀鼩目,樹鼩科,云南是野生樹鼩主要分布區(qū)域之一,其具有生殖和發(fā)育周期短、方便飼養(yǎng)、進化程度高等特征,研究證明樹鼩與靈長類動物具有較近的親緣關(guān)系[13]。在神經(jīng)系統(tǒng)、免疫系統(tǒng)、代謝系統(tǒng)等方面更適合用于人類的生物學(xué)和疾病機理研究[14],目前與人類代謝疾病相關(guān)的機理研究主要有糖代謝、脂代謝、骨質(zhì)疏松癥等[15]。近年來利用樹鼩作為動物模型開展高尿酸致病機理研究也有報道,肌苷作為合成尿酸的原材料,經(jīng)過PNP 酶的水解作用后生成尿酸,Tang 等[16-17]和楊旭娟等[18]利用肌苷成功誘導(dǎo)高尿酸血癥獼猴動物模型,以及利用氧嗪酸鉀成功誘導(dǎo)樹鼩的高尿酸血癥。可見,樹鼩也是高尿酸血癥動物模型研究中一種重要的實驗動物。本研究建立了實時熒光定量檢測樹鼩動物葡萄糖轉(zhuǎn)運蛋白相關(guān)轉(zhuǎn)錄水平變化的方法,旨在為進一步研究高尿酸疾病的發(fā)病機制和藥物治療奠定基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        實驗動物:普通環(huán)境下(溫度20~25℃,濕度40%~70%)飼養(yǎng)的滇西樹鼩6 只,雌、雄各3 只,體重約120 g,2 周齡左右。由中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)生物學(xué)研究所提供,實驗動物生產(chǎn)許可證號為SCXK(滇)K2013-0001。使用許可證號為SYXK(滇)K2013-0001。動物實驗由中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)生物研究所動物實驗倫理委員會審批,批準(zhǔn)編號為DWS2017058,實驗程序符合動物實驗倫理委員會的要求,并遵守國際慣例,根據(jù)實驗動物使用的3R 原則給予人文關(guān)懷。

        主要試劑:逆轉(zhuǎn)錄試劑盒PrimeScriptTMRT Reagent Kit(Perfect Real Time)、RT-PCR 酶GoTaq?GreenMaster Mix 2、實時熒光酶SYBR Premix Ex Taq、DL2000 及DL1000 DNA marker(TaKaRa 公司)、RNA 提取液Tripure(Roche 公司)、別嘌醇(純度≥98%,南京都萊生物)、GelRed 染料(Biotium 公司)、肌苷(Sigma 公司)。

        主要儀器:高速離心機(美國Sigma 公司)、高通量組織研磨器(寧波新芝公司)、酶標(biāo)儀MQX200R(Bio-tek 公司)、ND-1000 超微量核酸測定儀(美國DanoDrop 公司)、CFX 96TMReal-Time System C1000TMThermal Cycler(美國Bio-rad 公司)。

        1.2 實驗方法

        1)引物設(shè)計與合成:引物參照人類、獼猴、小鼠目的基因SLC2A9序列設(shè)計引物:人類NM_020041.2和NM_001001290.1,獼猴XM_015137992.1,小鼠NM_001102414.1、NM_001012363.2、NM_001102415.1和 NM_145559.2。內(nèi)參GAPDH參照獼猴NM_001195426.1 的核苷酸序列,利用引物設(shè)計軟件Pimer Express 5.0 分別設(shè)計引物。其中SLC2A9上游引物5′-ACAATGAAGCAGGAGCGACA-3′,下游引物5′-ACTCAGGGTGATGTACGGGA-3′,產(chǎn)物大小210 bp;內(nèi)參GAPDH,上游引物5′-AGCCCCATCACCATCTTCC-3′,下游引物5′-AATGAGCCCCAGCCTTCTC-3′,產(chǎn)物大小121 bp;大連寶生物工程有限公司合成。

        2)組織取樣及總RNA 提?。河?.5%戊巴比妥鈉(50 mg/kg)腹腔注射樹鼩,安樂處死動物,迅速采集新鮮腎臟約100 mg,加入1 mL Tripure,加入適合大小的鋼珠,放入高速組織研磨器中徹底研磨;放入1.5 mL EP 管中靜置5 min,加入氯仿200 μL 充分渦旋,靜置15 min;12 000 r/min 離心25 min 后取450 μL 上清液于EP 管中,加450 μL異丙醇,混勻后靜置10 min 后離心;管內(nèi)壁稍干后加入1 mL 75%乙醇洗滌沉淀,離心棄上清液,加入30 μL DEPC 水溶解,水浴10 min。取總RNA 樣品1 μL,測量濃度后,加入DEPC 水稀釋。

        3)RNA 完整性檢測:將上述所提取的總RNA樣品各2 μL,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳后觀察5S、18S 和28S 條帶,再取1 μL 于ND-1000 超微量核酸測定儀測定RNA 濃度。

        4)RNA 逆轉(zhuǎn)錄:按照逆轉(zhuǎn)錄試劑盒說明操作,分別加入0.5 μL PrimeScript RT Enzyme Mix、2 μL 5×PrimeScript Buffer、0.5 μL Random 6 mers、0.5 μL Oligo dT Primer、1 μL RNA(1 000 ng/μL)、RNase Free dd H2O 5.5 μL,總體積10 μL。程序設(shè)置為:37℃15 min,85℃5 s,4℃10 min 條件下獲得cDNA。

        5)建立SLC2A9及GAPDHmRNA 實時熒光定量PCR 反應(yīng)熔解曲線及標(biāo)準(zhǔn)曲線:以Esidilution梯度稀釋逆轉(zhuǎn)錄合成的樹鼩cDNA 第1 鏈,分別稀釋為10-1、10-2、10-3、10-4倍濃度,以原始cDNA第1 鏈及稀釋后的cDNA 為模板,各做2 個平行樣進行實時熒光定量檢測。目的基因和內(nèi)參基因反應(yīng)體系如下:1 μL cDNA 模板,各1 μL 的上、下游引物,9.5 μL 去離子水,12.5 μL Taq II 酶;反應(yīng)條件:94℃30 s,94℃5 s、60℃30 s,35 個循環(huán),獲得Ct值,建立SLC2A9及內(nèi)參GAPDH的相關(guān)熔解曲線及標(biāo)準(zhǔn)曲線、斜率及R2值、擴增效率。

        6)PCR 產(chǎn)物測序驗證:SLC2A9及GAPDH的PCR 擴增產(chǎn)物分別通過昆明鉑尚生物公司測序,測序所得到的核苷酸序列通過DNAMAN 軟件與NCBI 所報道的人類的SLC2A9mRNA 的核苷酸片段序列(NM_020041.2)及GAPDHmRNA 的核苷酸片段序列(NM_001289745.3)進行同源性比對。

        7)肌苷致樹鼩高尿酸血癥動物模型樹鼩腎臟組織中SLC2A9mRNA 相對表達量變化檢測:選取6 只空腹樹鼩,每組2 只分3 組。第1 組腹腔注射300 mg/kg 肌苷(inosine)和30 mg/kg 別嘌醇(allopurinol,ALLO)、第2 組腹腔注射300 mg/kg肌苷、第3 組0.9%的生理鹽水。注射1 h 后安樂處死實驗動物,取腎臟組織100 mg,加入1 mL Tripure 后提取RNA 逆轉(zhuǎn)錄為cDNA,用cDNA 的第1 條鏈作為模板,每個檢測樣品做復(fù)孔。CFX Manager 軟件處理分析結(jié)果,得到對應(yīng)的Ct值,以樣品Ct值,通過軟件分析獲得ΔΔCt值,得到組織中SLC2A9mRNA 表達量變化。

        2 結(jié)果

        2.1 RNA 純度和完整性 樹鼩總RNA 樣品經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳,觀察到3 條帶亮度如圖1所示。說明提取的RNA 沒有發(fā)生降解,經(jīng)ND-1000 超微量核酸測定儀測定結(jié)果顯示A260/A280位于1.8~2.0之間,可用于后續(xù)實驗。

        圖1 樹鼩組織總RNA 凝膠電泳

        2.2 目的基因SLC2A9和內(nèi)參GAPDHPCR 產(chǎn)物測序及序列比對 將目的基因及內(nèi)參基因PCR擴增產(chǎn)物送至昆明鉑尚生物公司測序后,用DNAMAN軟件分別對與NCBI 報道的人類SLC2A9(NM_020041.2)和GAPDH(NM_001289745.3)核苷酸片段序列的同源性進行比對(圖2、圖3),結(jié)果顯示樹鼩腎臟組織中擴增出的SLC2A9mRNA 的核苷酸片段序列與人類的同源性為81%,GAPDHmRNA 的核苷酸片段序列與人類的同源性為95.1%。進一步說明擴增出的目的片段為樹鼩的GAPDH的核苷酸片段及SLC2A9mRNA 核苷酸片段。

        圖2 樹鼩目的片段SLC2A9核苷酸序列與人類核苷酸序列比對圖

        圖3 樹鼩GAPDH 的核苷酸序列與人類核苷酸序列比對圖

        2.3 樹鼩腎臟組織SLC2A9和GAPDHmRNA實時熒光定量PCR 熔解曲線和標(biāo)準(zhǔn)曲線 通過進行實時熒光定量PCR 反應(yīng),繪制出樹鼩腎臟組織SLC2A9mRNA 和GAPDHmRNA 實時熒光定量PCR 熔解曲線和擴增曲線(圖4),顯示樹鼩SLC2A9mRNA 和GAPDHmRNA 實時熒光定量PCR 反應(yīng)熔解曲線單峰,特異性好。根據(jù)Ct值,CFX Manager 軟件制作出GAPDHmRNA 和SLC2A9mRNA 擴增曲線及標(biāo)準(zhǔn)曲線(圖5),GAPDHmRNA 擴增效率為125.4%,斜率為-2.833,R2=0.997;SLC2A9mRNA 擴增效率達到107.7%,斜率為-3.151,R2=0.996。

        圖4 SLC2A9(a)和GAPDH(b)mRNA 實時熒光定量PCR 反應(yīng)擴增曲線和熔解曲線

        圖5 GAPDH(a、b)和SLC2A9(c、d)mRNA 實時熒光定量PCR 反應(yīng)的擴增曲線及標(biāo)準(zhǔn)曲線

        2.4 肌苷所致的高尿酸血癥樹鼩SLC2A9mRNA表達水平的變化 樹鼩被安樂死后,從其新鮮的腎臟組織中提取RNA,經(jīng)實時熒光定量PCR 檢測,以GAPDH為內(nèi)參基因,SLC2A9mRNA 相對表達變化如圖6所示。在腎臟組織中,肌苷組相對于對照組的表達顯著上調(diào),肌苷加別嘌醇組相對于對照組表達顯著下調(diào),說明所建立的方法能靈敏地檢測樹鼩高尿酸動物模型SLC2A9mRNA 表達水平的變化。

        圖6 樹鼩腎臟組織SLC2A9 mRNA 相對表達變化

        3 討論

        樹鼩作為一種近年來開發(fā)的實驗動物,NCBI未能檢索到樹鼩SLC2A9mRNA 的核苷酸序列。本實驗通過參考NCBI 數(shù)據(jù)庫的人、小鼠、獼猴核苷酸序列,設(shè)計引物,合適的退火溫度,篩選擴增效果較好的引物。序列比對分析了所獲得的內(nèi)參GAPDH片段及SLC2A9片段,發(fā)現(xiàn)與人類的核苷酸片段序列同源性高達80%以上,說明所擴增的基因片段分別為內(nèi)參基因GAPDH核苷酸片段及目的基因SLC2A9核苷酸片段。同時可見SLC2A9及GAPDH實時熒光定量PCR 擴增特異性較好,熔解曲線為單峰,無雜峰。為保證熒光定量技術(shù)分析結(jié)果的可信度,以10 倍為稀釋因子稀釋不同濃度梯度的cDNA,得到目的基因及內(nèi)參基因表達的標(biāo)準(zhǔn)曲線。擴增效率分別為107.7%和125.4%,R2分別為0.996 和0.997,達到熒光定量要求[19]。說明本研究所建立的實時熒光定量PCR方法可應(yīng)用于定量檢測樹鼩葡萄糖轉(zhuǎn)運蛋白GLUT9 mRNA 轉(zhuǎn)錄水平。

        肌苷,也稱次黃嘌呤核苷,常用于誘導(dǎo)高尿酸動物模型的藥物[20]。本實驗采用腹腔注射300 mg/kg 肌苷構(gòu)建急性高尿酸樹鼩模型,利用建立的實時熒光定量PCR 方法對高尿酸血癥樹鼩進行SLC2A9mRNA 相對表達量檢測,結(jié)果顯示肌苷給藥組相對于其他組別表達量顯著上調(diào),與實驗預(yù)期相符。本實驗利用實時熒光定量PCR 方法對樹鼩SLC2A9mRNA 轉(zhuǎn)錄水平的變化實現(xiàn)定量檢測,穩(wěn)定重復(fù)性高、可操作性強等優(yōu)點。雖然樹鼩數(shù)量來源有限,但實驗數(shù)據(jù)和結(jié)果仍具有一定的參考性,建立的檢測樹鼩葡萄糖轉(zhuǎn)運蛋白GLUT9 mRNA 相對表達水平的實時熒光定量方法可應(yīng)用于高尿酸血癥的發(fā)病機理、新藥研究等方面的研究。

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