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        灰鶴大腸桿菌的分離鑒定與致病性

        2022-11-17 08:30:04陳文東陳耀年何玉鵬葉文斌蘇滿春徐永平
        中國獸醫(yī)雜志 2022年9期
        關鍵詞:灰鶴進化樹肺臟

        陳文東,陳耀年,何玉鵬,葉文斌,蘇滿春,徐永平

        (1.隴南師范高等??茖W校農林技術學院,甘肅 成縣 742500;2.甘肅農業(yè)大學動物醫(yī)學院,甘肅 蘭州 730000;3.西北農林科技大學動物醫(yī)學學院,陜西 楊凌 712100)

        灰鶴(Grusgrus)屬鶴形目鶴科,又稱千歲鶴、番薯鶴、玄鶴等,為棲息在近水區(qū)域和沼澤地的大型遷徙涉禽,其為雜食性動物,常選擇草洲、稻田、淺水區(qū)和泥灘生境作為棲息地,以植物根莖、植物嫩芽、草籽、蒲公英、農作物種子等為食[1]。我國境內灰鶴的分布廣泛,東起黑龍江撫遠縣,西至新疆喀什地區(qū),南到四川若爾蓋草原,北達內蒙古甘河流域,包括甘肅、吉林、內蒙古、青海、黑龍江、新疆和寧夏等,分布范圍在東經76°~135°,北緯32°20′~53°[2]。研究表明,甘肅地區(qū)灰鶴多為旅鳥或夏候鳥,少部分為冬候鳥,境內隴南山地、蘭州黃河、甘南高原、祁連山地、黃土高原和河西走廊的灰鶴為遷徙灰鶴[3]。

        本試驗從隴南受傷的灰鶴泄殖腔內分離出1株大腸桿菌(Escherichiacoli,E.coli),對其進行生化試驗、16S rRNA基因測序和遺傳進化樹分析,并通過藥敏試驗和小鼠致病試驗對其進行耐藥性和致病性分析,為大腸桿菌引起灰鶴腹瀉的防治提供科學依據。

        1 材料與方法

        1.1 主要試劑 麥康凱瓊脂培養(yǎng)基、伊紅美藍培養(yǎng)基(EMB)、鮮血瓊脂培養(yǎng)基、革蘭染液,均購自青島海博生物技術有限公司;BGI D2 000 Plus DNA Ladder、BGI 2×Super PCR Mix,均購自武漢華大基因科技有限公司;細菌基因組提取試劑盒,購自天根生化科技(北京)有限公司;瓊脂糖,購自廈門太陽馬生物工程有限公司;磁珠法PCR清潔試劑盒,購自上海碩美生物科技有限公司;18種藥敏紙片,購自湖南比克曼生物科技有限公司。PCR引物合成及測序由武漢華大基因科技有限公司完成。

        1.2 主要儀器 PCR儀,伯樂生命醫(yī)學產品(上海)有限公司產品;高速冷凍離心機,湖南湘儀實驗室儀器開發(fā)有限公司產品;凝膠成像系統,上海天能科技有限公司產品;超凈工作臺,浙江孚夏醫(yī)療科技有限公司產品;恒溫恒濕培養(yǎng)箱,上海躍進醫(yī)療器械有限公司產品;電熱式壓力蒸汽滅菌器,浙江新豐醫(yī)療器械有限公司產品。

        1.3 樣品采集及細菌分離純化 用無菌棉簽采集灰鶴泄殖腔內容物,置于裝有無菌生理鹽水的離心管內,充分混勻后,離心,將上清液接種于麥康凱瓊脂平板上,37 ℃恒溫培養(yǎng)18 h后,用接種環(huán)挑取紅色菌落接種于另一麥康凱瓊脂平板,繼續(xù)37 ℃恒溫培養(yǎng)18 h,如此反復純化細菌5次,最后1次將菌株分別接種于鮮血瓊脂培養(yǎng)基和伊紅美藍培養(yǎng)基,觀察2種培養(yǎng)基上的菌落形態(tài)特征,再挑取單菌落進行革蘭染色,顯微鏡下觀察細菌的染色特點和形態(tài)特征。

        1.4 生化鑒定 參照《獸醫(yī)微生物學實驗教程》[4]中生化試驗培養(yǎng)基配制方法、操作步驟和結果判定方法,對分離菌進行生化鑒定,觀察并記錄結果。

        1.5 16S rRNA基因PCR擴增及系統進化樹分析 常規(guī)提取分離菌株的基因組DNA,制備DNA模板并進行16S rRNA的PCR擴增,PCR所用引物序列見表1。PCR反應體系(30 μL):1 μL DNA模板,15 μL 2×GC Buffer Ⅰ,2 μL引物(上、下游各1 μL),最后加ddH2O至30 μL。PCR反應條件:96 ℃預變性5 min;96 ℃變性20 s,60 ℃退火20 s,72 ℃延伸30 s,共35個循環(huán);72 ℃終延伸10 min,于4 ℃保存。參照磁珠法PCR清潔試劑盒說明書純化PCR產物,純化后進行1.0%的瓊脂糖凝膠電泳檢測,觀察條帶大小,回收PCR產物后寄至武漢華大基因科技有限公司進行測序,測序結果進行NCBI-BLAST比對并用鄰接法(Neighbor-Joining algorithm,N-J)構建系統發(fā)育樹。

        表1 引物信息

        1.6 藥敏試驗 用紙片擴散法(Kirby-Bauer,K-B)[5]對分離菌進行藥物敏感性試驗,參照美國臨床和實驗室標準化協會(Clinical and Laboratory Standards Institute,CLSI)標準,調整菌液濃度至5×108CFU/mL,將菌液均勻涂布于普通瓊脂平板,靜置片刻后,用無菌鑷子將18種常用抗菌藥藥敏紙片貼于平板表面,37 ℃恒溫培養(yǎng)18 h,游標卡尺測量抑菌圈直徑,結果按耐藥(R)、敏感(S)和中介(I)判定。

        1.7 致病性試驗 將12只BALB/c小鼠(體重18~22 g,雌雄各半)隨機分成試驗組和對照組,每組6只。試驗組腹腔注射細菌懸液(生理鹽水將菌液調配至濃度為2.12×109CFU/mL),每只0.5 mL,對照組腹腔注射等量生理鹽水,觀察小鼠死亡情況,剖檢死亡小鼠,做剖檢記錄,并于病變明顯部位取樣分離病原菌。將剖檢小鼠的心臟、肝臟、脾臟、肺臟和腎臟固定于4%多聚甲醛內,制作病理組織切片,觀察各器官的組織形態(tài)學變化。

        2 結果

        2.1 細菌分離純化 分離菌株可在鮮血培養(yǎng)基上生長,無溶血環(huán);在麥康凱瓊脂培養(yǎng)基上生長為紅色菌落,菌落呈圓形、半透明,表面濕潤光滑,邊緣整齊;在伊紅美藍培養(yǎng)基上形成紫黑色菌落,菌落有金屬光澤,呈圓形,表面光滑濕潤,邊緣整齊。革蘭染色顯示菌體呈長短不一的短桿狀,兩端鈍圓,紅色,散在分布。

        2.2 生化鑒定 分離菌株可發(fā)酵葡萄糖、乳糖、蔗糖和麥芽糖,對甘露醇、MR試驗和吲哚試驗呈陽性反應,對硝酸鹽、尿素酶、硫化氫、V-P試驗、檸檬酸鹽反應呈陰性反應。上述結果與《伯杰細菌鑒定手冊》[6]比對,初步判定分離菌株為大腸桿菌,命名為HH1。

        2.3 16S rRNA基因PCR擴增及系統進化樹分析 將PCR產物進行1.0%的瓊脂糖凝膠電泳檢測,樣品均可得到明亮的大小為1 500 bp的電泳條帶(圖1),與預期大小相符,符合測序條件。測序結果進行NCBI-BLAST比對,結果顯示,HH1與大腸桿菌的同源性達99%。用MEGA 7.0軟件構建系統進化樹,結果顯示,HH1與大腸桿菌(MT424913.1.seq、MH111527.1.seq、MK729001.1.seq、OK325789.1.seq、MW175585.1.seq)聚為一簇,親緣關系最近(圖2)。PCR擴增、系統進化樹分析結果結合生化鑒定結果,判定HH1為大腸桿菌。

        圖1 分離菌16S rRNA的PCR擴增

        圖2 分離菌16S rRNA序列的系統進化樹(N-J法)

        2.4 藥敏試驗 HH1對青霉素、紅霉素、多西環(huán)素和四環(huán)素耐藥,對慶大霉素、頭孢氨芐、頭孢哌酮、頭孢唑林、頭孢曲松、頭孢他啶、頭孢呋辛、哌拉西林、氨芐西林、卡那霉素、鏈霉素、阿米卡星、米諾環(huán)素和多黏菌素敏感(表2)。

        表2 藥敏試驗結果

        2.5 致病性試驗 試驗組小鼠于腹腔接種細菌懸液8 h后開始出現死亡,至接種17 h后全部死亡,對照組小鼠未見異常。剖檢死亡小鼠,可見小鼠胃呈明顯臌氣狀,脾臟、腎臟出現輕微充血,肺臟有明顯淤血斑塊。從死亡小鼠的肺臟內分離病原菌,經鑒定為大腸桿菌,與攻毒菌株一致。病理組織切片觀察可見,死亡小鼠肺臟肺泡內有明顯的滲出,其余內臟組織未見明顯病理變化。

        死亡小鼠內臟病理切片結果顯示,心臟未見明顯異常,可見縱切心肌纖維及部分心肌纖維斷面,心肌細胞和結締組織細胞胞核清晰可見,心肌內毛細血管未見擴張;肝臟中央靜脈和肝血竇內見少量紅細胞,其他結構未見明顯異常,肝細胞胞質呈粉紅色,邊界清晰,胞核呈圓形,藍紫色,核仁清晰可見,肝細胞以中央靜脈為中心呈索狀排列,形成不規(guī)則的肝索;脾臟未見明顯異常,組織切片觀察可見明顯的白髓和紅髓區(qū),白髓內可見中央動脈及動脈周圍淋巴鞘,紅髓內含較多紅細胞,脾小梁清晰可見;肺臟切片可見呼吸性細支氣管和大部分肺泡內有明顯滲出,部分肺泡外周見少量炎性細胞,肺泡壁略增厚(圖3);腎小管部分管腔及管腔之間有紅細胞聚集,腎小球未見明顯異常。

        圖3 分離菌致死小鼠肺臟病理切片觀察(200×)

        3 討論

        灰鶴是國家二級保護野生動物,被列入《瀕危野生動植物種國際貿易公約》(CITES)附錄Ⅱ中[7],據報道,截至21世紀初,我國分布的灰鶴總數為21 632~22 401只[3]。張成林等[8]對我國鶴類疾病發(fā)生情況進行統計分析,發(fā)現引起鶴類發(fā)病的主要原因為細菌感染、寄生蟲感染和營養(yǎng)因素,細菌感染因素中大腸桿菌為引起鶴類發(fā)病的主要病原菌之一。張偉木等[9]證實,引起3例幼灰鶴死亡的致病性大腸桿菌血清型為O111B14。此外,在孔雀、蓑羽鶴和丹頂鶴等珍稀飛禽中均有因感染大腸桿菌而死亡的病例,因此,大腸桿菌正嚴重威脅著野生飛禽的生命健康[10-11],給保護珍稀野生飛禽工作帶來諸多挑戰(zhàn)。

        藥敏試驗結果顯示,HH1對青霉素、紅霉素、多西環(huán)素和四環(huán)素具有耐藥性。Dou等[12]報道,國內東部地區(qū)的243株禽致病性大腸桿菌中,有98%的菌株對四環(huán)素耐藥;胡紫萌等[13]分離鑒定的禽致病性大腸桿菌對四環(huán)素的耐藥率更是高達100%;郭長明等[14]分離的大腸桿菌對多西環(huán)素的耐藥率為100%;彭嚴嚴等[15]分離的9株鵝源大腸桿菌全部含β-內酰胺類耐藥基因;陳文靜等[16]研究表明,鴨源致病性大腸桿菌100%對紅霉素耐藥,上述研究結果與本試驗分離大腸桿菌的耐藥性結果一致,這可能是灰鶴在采食或遷徙的過程中與家禽接觸產生的相互感染。野生飛禽幾乎不使用抗菌藥,但其所攜帶致病菌卻表現多重耐藥性(對3種或3種以上抗菌藥耐藥),這可能會嚴重危害公共衛(wèi)生安全,值得高度重視[17]。本試驗為救治灰鶴的臨床用藥提供理論依據,并取得了較好的治療效果。

        本試驗16S rRNA基因測序結果顯示,分離菌株與大腸桿菌同源性最高,達99%。系統發(fā)育樹分析結果顯示,本試驗分離菌株與大腸桿菌(MT424913.1.seq、MH111527.1.seq、MK729001.1.seq、OK325789.1.seq、MW175585.1.seq)為同一聚類,親緣關系最近,而MH111527.1.seq和OK325789.1.seq均為來自于人類腸道內的大腸桿菌,表明該分離菌株有成為人獸共患病病原體的潛在性。

        本試驗小鼠致病性試驗結果顯示,分離菌株HH1主要引起小鼠肺泡腔內明顯滲出,而對其他器官(心、肝、脾、腎)無明顯致病作用。研究發(fā)現,禽類等多種動物的肺炎、敗血癥和腸炎等疾病多是因腸外致病性大腸桿菌引起的[18],近年來大腸桿菌引起動物呼吸系統病變死亡的報道較多,有學者分別從水貂肺臟[19]、狐貍肺臟[20]及因患呼吸系統疾病而死亡的水貂肺臟[21]內分離出致病性大腸桿菌。由此可見,本試驗分離到的大腸桿菌極有可能為禽腸外致病性大腸桿菌,且該菌具有一定的器官侵害傾向。

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