陶焱煬 王哲 孫晝 考慶君 馮爽 賀兆鍇 孔慶鑫
杭州市疾病預(yù)防控制中心傳染病防制所,杭州 310021
新型冠狀病毒(以下簡稱“新冠病毒”)自2019年底發(fā)現(xiàn)以來,截至2022年6月已導(dǎo)致全球超過5.41億例確診病例和630多萬例死亡病例[1]。隨著新冠病毒的不斷變異,奧密克戎(Omicron)變異株已成為全球優(yōu)勢毒株,GISAID平臺報告的所有病毒基因序列幾乎都屬于該變異株,過去流行的Alpha、Beta、Gamma和Delta株所占的比例非常低[2-3]。相較于其他變異株,Omicron株在物體表面的存活時間更久,環(huán)境穩(wěn)定性更高,這些均為Omicron株通過受污染貨物傳播給人創(chuàng)造了有利條件[4]。2022年1月,杭州市出現(xiàn)由Omicron株引起的本土聚集性疫情,感染來源于濱江區(qū)H餐飲公司進(jìn)口生產(chǎn)物料,并以“物傳人再人傳人”的方式進(jìn)行傳播,波及全市6個區(qū)縣,累計報告COVID-19確診病例114例。本研究旨在對杭州市本輪疫情進(jìn)行分析,為疫情防控工作提供參考依據(jù)。
來源于2022年1月26日至2月3日中國疾病預(yù)防控制信息系統(tǒng)傳染病監(jiān)測報告管理系統(tǒng)中杭州市COVID-19本土病例的個案報告卡、相關(guān)個案流行病學(xué)調(diào)查報告和現(xiàn)場流行病學(xué)調(diào)查。
1.病例定義
COVID-19確診病例、無癥狀感染者、密切接觸者(密接)、密接的密接(次密接)的判定參照《新型冠狀病毒肺炎防控方案(第八版)》,并根據(jù)《新型冠狀病毒肺炎診療方案(試行第八版)》將臨床嚴(yán)重程度分為輕型、普通型、重型和危重型[5-6]。
2.流行病學(xué)調(diào)查
按照《新型冠狀病毒肺炎防控方案(第八版)》[6],由公衛(wèi)、公安、工信等多部門人員共同組成的流調(diào)溯源隊伍對所有涉及本輪疫情的COVID-19病例進(jìn)行流行病學(xué)調(diào)查,收集病例的基本信息、發(fā)病及就診經(jīng)過、流行病學(xué)史等,排查相應(yīng)的密接和次密接,并對所有風(fēng)險人員和環(huán)境進(jìn)行核酸采樣檢測。
3.潛伏期和代間距
潛伏期為單次暴露病例的發(fā)病日期與暴露日期的時間間隔。代間距為原發(fā)病例的發(fā)病日期與其感染導(dǎo)致的續(xù)發(fā)病例發(fā)病日期的時間間隔。
4.實(shí)驗(yàn)室檢測
采集病例及其相關(guān)重點(diǎn)人員的口咽/鼻咽拭子,應(yīng)用實(shí)時熒光定量RT-PCR法進(jìn)行新冠病毒核酸檢測。采用全基因組測序技術(shù)對COVID-19病例和環(huán)境樣本進(jìn)行測序,并將結(jié)果與近期輸入病例和本土病例序列進(jìn)行比對分析。
使用Excel 2019軟件建立數(shù)據(jù)庫,描述本輪聚集性疫情相關(guān)COVID-19病例的流行病學(xué)特征。使用Office 2019 visio軟件繪制傳播鏈?zhǔn)疽鈭D;利用SPSS 20.0對數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。計量資料以中位數(shù)M(Q1,Q3)、最大值或最小值表示,并采用Mann-Whitney U檢驗(yàn)比較家庭傳播和非家庭傳播病例的代間距差異。計數(shù)資料以頻數(shù)、率或構(gòu)成比表示,并使用χ2檢驗(yàn)或Fisher確切概率法進(jìn)行組間比較。
2022年1月25日22時,杭州市濱江區(qū)某醫(yī)院報告1例發(fā)熱門診主動就診患者新冠病毒核酸初篩陽性。1月26日凌晨,杭州市CDC復(fù)核確認(rèn),經(jīng)醫(yī)院專家組會診,診斷為新冠肺炎病例(輕型),該病例為濱江區(qū)H餐飲公司員工。至2月3日杭州市報告最后1例感染者,本輪疫情持續(xù)10 d,累計網(wǎng)絡(luò)報告本地新冠病毒感染者114例,均為確診病例,涉及密接20 173人、次密接48 370人。114例新冠病毒感染者中,97例(85.09%)已接種過COVID-19疫苗,其中93例接種過至少2劑。此次疫情以集中隔離點(diǎn)篩查發(fā)現(xiàn)為主(103例,90.35%),5例(4.39%)為 封控區(qū)或管控區(qū)核酸篩查發(fā)現(xiàn),3例(2.63%)在居家隔離期間發(fā)現(xiàn),其余3例(2.63%)通過主動就診發(fā)現(xiàn)。
1.人群分布
114例感染者中,男性52例(45.61%),女性62例(54.39%);年齡最小者僅5月齡,最大者85歲,中位 年 齡33歲;34例 為 工 人(29.82%),24例 無 業(yè)(21.05%),19例為商業(yè)服務(wù)(16.67%),18例為學(xué)生或兒童(15.79%),17例為干部職員(14.91%),1例 為教師(0.88%),1例為醫(yī)務(wù)人員(0.88%)。
2.時間分布
1月27日報告的病例13(病例1同事)發(fā)病時間最早,1月19日即出現(xiàn)肌肉酸痛。疫情最早發(fā)現(xiàn)為病例1初篩陽性的1月25日,距離病例13發(fā)病已有6 d,2月4日及之后未再檢測出核酸陽性人員。病例發(fā)病時間集中在1月28—31日(70例,61.40%)。具體發(fā)病及報告時間如圖1所示。
圖1 2022年1月杭州市COVID-19聚集性疫情相關(guān)感染者發(fā)病和報告時間分布
3.地區(qū)分布
本輪疫情波及杭州市內(nèi)6個行政區(qū),分別為濱江區(qū)(49例,42.98%)、富陽區(qū)(45例,39.47%)、蕭山區(qū)(15例,13.16%)、上城區(qū)(2例,1.75%)、拱墅區(qū)(2例,1.75%)和西湖區(qū)(1例,0.88%)。
114例感染者以咽部不適、咳嗽和發(fā)熱為主要癥狀,其中咽部不適45例(39.47%)、咳嗽43例(37.72%)、發(fā)熱27例(23.68%)、乏力15例(13.16%)、頭痛14例(12.28%)、流涕13例(11.40%)、頭暈12例(10.53%)、肌肉酸痛9例(7.89%)、鼻塞6例(5.26%)、咳痰6例(5.26%),惡心、腹瀉、畏寒和胃納減退各有1例(0.88%)。確診病例的臨床分型以輕型為主(100例,87.71%),普通型14例(12.28%),無重型、危重型和死亡病例。病例出現(xiàn)臨床癥狀到核酸檢測陽性的時間間隔為-4~7 d,中位時間間隔為0 d。復(fù)核陽性的ORF1ab基因Ct值為16~40,中位數(shù)為27(22,32);N基 因Ct值 為12~39,中 位 數(shù) 為26(20,30)。
對本次疫情首發(fā)病例發(fā)病日期(1月19日)至指示病例報告(1月26日)的發(fā)病數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,在自由傳播的情況下,本次杭州Omicron株本土疫情基本再生數(shù)R0=2.18,95%CI:1.21~3.56。截至2月4日0時,利用傳染病動態(tài)傳播模型對本次疫情實(shí)時再生數(shù)Rt進(jìn)行估計,1月26日最高為2.02,隨著管控措施的落實(shí),Rt快速降低,2月1日降至0.77。
選擇本次疫情中與病例有明確接觸史的單次暴露人員共38人,潛伏期中位數(shù)為4.0(3.0,5.0)d,范圍為2~8 d。選擇能夠明確代際傳播的病例共22例,其中家庭續(xù)發(fā)病例為12例,非家庭續(xù)發(fā)病例為10例。代間距分布范圍為1~6 d,中位數(shù)為2.5(2.0,3.3)d;家庭傳播的代間距中位數(shù)為2.5(2.0,3.8)d,非家庭傳播的代間距中位數(shù)為2.5(2.0,3.3)d,兩組差異無統(tǒng)計學(xué)意義(Z=0.17,P=0.863)。
本次聚集性疫情包括5起公司/單位、1起婚宴、1起公共場所和23起家庭聚集。指示病例所在公司出現(xiàn)疫情后,通過與之相鄰的B小區(qū)底層商鋪S店傳入B小區(qū),并在小區(qū)部分家庭內(nèi)傳播,后續(xù)通過家庭續(xù)發(fā)人員傳播至多個工作和生活場所,通過參加婚宴的人員傳播至富陽區(qū),在富陽區(qū)進(jìn)一步引起家庭內(nèi)傳播,并通過公共場所聚集傳播。所有報告的病例均在已知的傳播鏈上和管控人群中,具體傳播關(guān)系見圖2。
圖2 2022年1月杭州市COVID-19聚集性疫情傳播鏈
1.公司/單位聚集性疫情
本次疫情共發(fā)生5起公司/單位聚集性疫情,涉及病例40例,其中H餐飲公司、Y公司、Z公司、S店和G店分別為25、7、2、3和3例。指示病例(病例1)和首發(fā)病例(病例13)所屬H餐飲公司共有297名員工,罹患率為8.42%。首發(fā)病例與病例30為夫妻,與病例22為合租室友,通過共同生活接觸導(dǎo)致病例30所在的Y公司以及病例22所在Z公司發(fā)生聚集性疫情。病例48經(jīng)營S店,與H公司員工病例8為夫妻,排除其他感染來源,推斷S店聚集性疫情由H公司續(xù)發(fā)引起。因本次疫情發(fā)現(xiàn)較晚,B小區(qū)內(nèi)已出現(xiàn)社區(qū)傳播,小區(qū)居民病例19通過工作接觸共造成2名續(xù)發(fā)病例。
2.婚宴聚集性疫情
114名感染者中,14例與1月22日舉辦的婚宴相關(guān)。婚禮當(dāng)天共涉及244人,罹患率為5.74%。244人中有55人為B小區(qū)居民,其中8人先后確診COVID-19,因此判斷婚宴續(xù)發(fā)病例通過與B小區(qū)確診病例接觸或同環(huán)境暴露而導(dǎo)致感染的可能性較大。
3.公共場所聚集性疫情
該公共場所為富陽區(qū)的母嬰生活館,涉及病例32例,暴露時間分別為1月25日和1月27日,其中以1月27日暴露為主。病例25和病例28(祖孫)1月22日參加婚宴后,于1月25日前往母嬰館洗澡并引起場所聚集性疫情。經(jīng)流行病學(xué)調(diào)查,排查并管控1月25—27日母嬰館相關(guān)風(fēng)險人員251人,罹患率為12.75%,顯著高于婚宴罹患率(χ2=7.22,P=0.007)。
4.家庭聚集性疫情
114名感染者共涉及67戶家庭,其中濱江區(qū)、蕭山區(qū)和富陽區(qū)共23戶家庭發(fā)生續(xù)發(fā)感染,涉及病例70例,規(guī)模2~6例。
指示病例及首發(fā)病例發(fā)病前14天均無中高風(fēng)險及境內(nèi)外地區(qū)旅居史,且無境外人員及中高風(fēng)險人員接觸史。本研究對85例病例的樣本病毒序列進(jìn)行基因測序?yàn)閂OC/Omicron株(BA.1.1分支),全部共享58個突變位點(diǎn),存在1~2個特異性突變位點(diǎn),與浙江省近期發(fā)生的本土或境外輸入病例病毒基因組同源性低;經(jīng)中國CDC與國內(nèi)其他省份近期暴發(fā)的Omicron疫情進(jìn)行比對,病毒基因組同源性低;與全球公開數(shù)據(jù)庫GISAID比對,發(fā)現(xiàn)與美國采樣日期為2021年12月11日的毒株序列高度同源。
為進(jìn)一步明確感染來源,從H公司未啟用的進(jìn)口物料中采集樣本,按照六混一合并1個采樣管,共11管,其中共檢出4份陽性樣本。根據(jù)流行病學(xué)調(diào)查及基因測序結(jié)果,判斷本次疫情的傳播方式為“物→人→人”。
Omicron變異株首次在南非發(fā)現(xiàn)并迅速取代Delta株成為全球COVID-19流行的優(yōu)勢毒株[7]。杭州市本次聚集性疫情由Omicron株引起,中位潛伏期和中位代間距分別為4.0 d和2.5 d,均少于以往國內(nèi)發(fā)生的由Delta株引起的本土聚集性疫情,提示Omicron變異株引起的疫情傳播能力強(qiáng)、傳播速度快[8-9]。
本次疫情持續(xù)共10 d,累計報告114例COVID-19確診病例,以輕型、普通型為主,無重型、危重型和死亡病例,發(fā)病時間集中在1月28—31日。所有病例均出現(xiàn)臨床癥狀,主要表現(xiàn)為咽部不適、咳嗽和發(fā)熱。病例年齡范圍跨度大,中位年齡為33歲,女性感染者比例略高于男性。職業(yè)分布中,工人和無業(yè)的比例約為總病例數(shù)的50%,兒童感染者的比例較高可能與其在母嬰館相對聚集有關(guān)?;檠缋m(xù)發(fā)病例流動至母嬰館后,由于高溫、蒸汽等存在,且多數(shù)人員洗澡時未佩戴口罩,人員在相對封閉的環(huán)境中長時間暴露于高濃度氣溶膠導(dǎo)致病毒易通過氣溶膠等方式進(jìn)行傳播。本研究表明母嬰館罹患率顯著高于婚宴罹患率,提示場所內(nèi)部環(huán)境對新冠病毒氣溶膠的傳播能力具有重要影響,江蘇淮安報道的一起洗浴中心聚集性疫情證明新冠病毒在高溫高濕的條件下仍能存活,且密閉環(huán)境有利于病毒氣溶膠的持續(xù)存在[10]。本次疫情實(shí)時再生數(shù)Rt值最高出現(xiàn)在1月26日,為2.02,隨著管控措施落實(shí)后迅速降低,至2月1日降至0.77。綜合病例發(fā)現(xiàn)方式、傳播鏈、潛伏期和疫情態(tài)勢分析,研判認(rèn)為疫情上升趨勢和社區(qū)傳播已經(jīng)得到遏制,疫情“拐點(diǎn)”已經(jīng)出現(xiàn),管控措施效果顯著,實(shí)現(xiàn)社會面清零,進(jìn)入到隔離點(diǎn)清零狀態(tài),本次疫情可控。
本研究對符合測序條件的病例病毒基因進(jìn)行測序,結(jié)果顯示為VOC/Omicron株(BA.1.1進(jìn)化分支),與全球公共數(shù)據(jù)庫GISAID對比,發(fā)現(xiàn)與國內(nèi)及境外輸入病例均不同源,提示本次疫情是一起新發(fā)的獨(dú)立疫情,且病例均在一條傳播鏈上,絕大多數(shù)病例均為流行病學(xué)調(diào)查時判定的密接,傳播關(guān)系清晰明確。與Delta株相比,Omicron株具有顯著的增長優(yōu)勢,容易在社區(qū)中迅速傳播,其家庭續(xù)發(fā)率是Delta毒株的1.52倍[11]。盡管感染Omicron株后的臨床嚴(yán)重程度和病死率低于Delta株,但極高的傳播水平仍然導(dǎo)致住院人數(shù)激增,可能會對大多數(shù)國家的醫(yī)療保健體系造成巨大壓力,并且全球Omicron變異株感染相關(guān)的死亡病例數(shù)仍維持較高水平,特別是在弱勢群體中[12-13]。
根據(jù)流行病學(xué)調(diào)查、環(huán)境衛(wèi)生學(xué)調(diào)查、病毒全基因組測序結(jié)果,在H公司未啟用的進(jìn)口物料中,有4份樣本檢測出Omicron陽性,提示本次疫情的感染來源較大概率是H公司進(jìn)口生產(chǎn)物料,以“物傳人”的形式造成早期傳播,之后因工作接觸等造成公司內(nèi)傳播,進(jìn)而通過生活接觸等方式引起后續(xù)的家庭傳播,并引發(fā)一定范圍的社區(qū)傳播。研究表明新冠病毒在氣溶膠中可存活3 h,在塑料、不銹鋼等物體表面可存活長達(dá)72 h[14],2020年9月青海以及2021年12月寧波發(fā)生的聚集性疫情均證實(shí)了人員接觸陽性物品可感染病毒[15-16]。最近的研究顯示Omicron株(BA.1分支)在塑料表面可以存活193.5 h,是武漢株和Delta株的3.5和1.7倍[4]。針對上述情況,我國持續(xù)堅持“人物同防”的原則,加強(qiáng)對進(jìn)口貨物及其包裝的采樣檢測和消毒工作。杭州市于2022年4月底正式啟動常態(tài)化核酸檢測工作,對于傳染源的及時發(fā)現(xiàn)、控制疫情擴(kuò)散具有重要作用。此外,加強(qiáng)新冠疫苗接種并做好個人防護(hù)仍是預(yù)防新冠病毒感染的主要措施。
利益沖突所有作者均聲明不存在利益沖突
作者貢獻(xiàn)聲明陶焱煬:數(shù)據(jù)收集、數(shù)據(jù)分析和文章撰寫;王哲:數(shù)據(jù)收集、數(shù)據(jù)分析和指導(dǎo),經(jīng)費(fèi)支持;孫晝、考慶君:對文章的知識性內(nèi)容作批評性審閱;馮爽、賀兆鍇:數(shù)據(jù)收集和分析;孔慶鑫:論文審閱和指導(dǎo),經(jīng)費(fèi)支持