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        威海區(qū)域性大數(shù)據(jù)管理肺癌隊(duì)列的臨床特征和生存情況

        2022-11-03 08:01:44張藍(lán)方王麗潔張明娟劉愛(ài)玲郭曉雷于進(jìn)超孫珊珊曹樹偉季懷君馮虎姜軼男李靜宜楊柳于鑫齊越薛付忠楊福俊
        關(guān)鍵詞:肺癌醫(yī)院

        張藍(lán)方 王麗潔 張明娟 劉愛(ài)玲 郭曉雷 于進(jìn)超 孫珊珊 曹樹偉 季懷君 馮虎 姜軼男 李靜宜 楊柳 于鑫 齊越 薛付忠 楊???/p>

        1威海市立醫(yī)院腫瘤科,威海 264200;2山東大學(xué)齊魯醫(yī)學(xué)院公共衛(wèi)生學(xué)院生物統(tǒng)計(jì)系,濟(jì)南 250000;3山東省疾病預(yù)防控制中心慢病防治所,濟(jì)南 250000

        既往研究顯示,我國(guó)肺癌發(fā)病率居高不下,是死亡率最高的腫瘤[1]。近年來(lái),針對(duì)肺癌的專病隊(duì)列研究為肺癌的機(jī)制學(xué)研究及精準(zhǔn)化診治提供了真實(shí)世界證據(jù)[2-3]?;卺t(yī)院的專病隊(duì)列收集了患者診斷時(shí)的數(shù)據(jù),通常被稱為“初始隊(duì)列”。本文描述了一個(gè)以威海地區(qū)醫(yī)院為基礎(chǔ)的肺癌隊(duì)列,即威海市立醫(yī)院肺癌隊(duì)列(SET SAIL隊(duì)列),主要介紹其構(gòu)建目的、數(shù)據(jù)收集、主要基線指標(biāo)、實(shí)際應(yīng)用及隊(duì)列構(gòu)建意義。

        對(duì)象與方法

        一、SET SAIL隊(duì)列的構(gòu)建目的

        威海市立醫(yī)院依托山東大學(xué)信息大數(shù)據(jù)平臺(tái),建立了SET SAIL隊(duì)列,同步構(gòu)建醫(yī)院在線肺癌病例數(shù)據(jù)庫(kù),其信息高度集中,可供專業(yè)臨床科研工作者以臨床實(shí)際問(wèn)題為導(dǎo)向進(jìn)行相關(guān)研究。

        二、SET SAIL隊(duì)列的研究設(shè)計(jì)和內(nèi)容

        研究團(tuán)隊(duì)基于數(shù)據(jù)采集融匯通用數(shù)據(jù)模型,利用電子病歷(RCDM-4)標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)集,按照隊(duì)列通用數(shù)據(jù)模型標(biāo)準(zhǔn),由專業(yè)技術(shù)人員完成數(shù)據(jù)采集,構(gòu)建SET SAIL隊(duì)列。

        1.調(diào)查對(duì)象

        將2016年1月至2021年5月間在威海市立醫(yī)院首次病理確診的肺癌患者共5 246例納入隊(duì)列。

        隊(duì)列納入標(biāo)準(zhǔn):①在威海市立醫(yī)院做手術(shù)或者活檢(支氣管鏡活檢,肺活檢或者淋巴結(jié)活檢)首次病理確診為肺癌的病例,ICD-10編碼為C34;②診斷日期為2016年以來(lái)的肺癌病例。排除標(biāo)準(zhǔn):①繼發(fā)性肺癌;②系統(tǒng)中身份證號(hào)格式異常者;③既往或目前合并有其它惡性腫瘤。隊(duì)列終點(diǎn)事件為研究對(duì)象是否死亡以及死亡時(shí)間(匹配山東省疾病預(yù)防控制中心的死因登記數(shù)據(jù))。

        2.基線數(shù)據(jù)采集內(nèi)容

        SET SAIL隊(duì)列中涵蓋人口學(xué)信息(年齡、性別、職業(yè)等)、腫瘤相關(guān)特征(病理類型、TNM分期等)、疾病(103個(gè)ICD-10編碼對(duì)應(yīng)28 868個(gè)別名)、行為生活方式(吸煙、飲酒)、手術(shù)(有無(wú)手術(shù),以及手術(shù)方式等)、藥品(主要指肺癌化療、靶向、免疫用藥,64個(gè)YPID標(biāo)碼)、實(shí)驗(yàn)室檢查(875個(gè)CNAS-AL09)等上千個(gè)標(biāo)準(zhǔn)指標(biāo)變量(具體見(jiàn)表1)。采集醫(yī)院業(yè)務(wù)系統(tǒng)(HIS、EMR、LIS等)數(shù)據(jù),匯總到科研平臺(tái),再通過(guò)非線性規(guī)劃(NLP)模型完成文本結(jié)構(gòu)化及指標(biāo)標(biāo)準(zhǔn)化治理。

        表1 SET SAIL隊(duì)列數(shù)據(jù)采集內(nèi)容

        3.隨訪調(diào)查

        參考《大型人群隊(duì)列終點(diǎn)事件長(zhǎng)期隨訪技術(shù)規(guī)范(T/CPMA002-2019)》[4],在隨訪調(diào)查中,采用常規(guī)監(jiān)測(cè)方式對(duì)隊(duì)列終點(diǎn)事件進(jìn)行長(zhǎng)期隨訪,包括死亡監(jiān)測(cè)、發(fā)病監(jiān)測(cè)、住院事件監(jiān)測(cè)、遷移和失訪監(jiān)測(cè)。與山東省疾病預(yù)防控制中心合作,可獲取發(fā)病及死因登記數(shù)據(jù)。利用醫(yī)院病案首頁(yè)系統(tǒng)、醫(yī)保住院系統(tǒng)及醫(yī)院信息系統(tǒng),可以收集隨訪期內(nèi)因病住院治療的所有疾病診療信息。醫(yī)院隨訪系統(tǒng)可用于患者出院后的信息收集,院內(nèi)系統(tǒng)失聯(lián)者可聯(lián)系公安戶籍管理部門進(jìn)行信息收集。

        三、質(zhì)量控制

        1.技術(shù)安全

        首先,將云存儲(chǔ)技術(shù)運(yùn)用于肺癌大數(shù)據(jù)平臺(tái),結(jié)合加密技術(shù)有效保障醫(yī)院醫(yī)療大數(shù)據(jù)集群數(shù)據(jù)的安全。其次,在處理數(shù)據(jù)時(shí),降低數(shù)據(jù)敏感度,保護(hù)患者的識(shí)別信息,采用加密技術(shù)對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)一步保護(hù)。另外,從網(wǎng)絡(luò)層面設(shè)置訪問(wèn)權(quán)限,控制技術(shù)人員對(duì)數(shù)據(jù)的訪問(wèn),限制非法分子對(duì)平臺(tái)數(shù)據(jù)的非法訪問(wèn)和導(dǎo)出。最后,科研平臺(tái)軟件及數(shù)據(jù)庫(kù)完成第三方數(shù)據(jù)安全測(cè)評(píng),并出具數(shù)據(jù)安全測(cè)評(píng)報(bào)告。由威海市立醫(yī)院大數(shù)據(jù)團(tuán)隊(duì)技術(shù)人員定期對(duì)大數(shù)據(jù)平臺(tái)進(jìn)行監(jiān)控和檢查。

        2.管理安全

        醫(yī)院建立并落實(shí)《數(shù)據(jù)安全管理辦法》,作為制度建設(shè)管理數(shù)據(jù)安全。平臺(tái)組成員需簽署保密協(xié)議。山東大學(xué)健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)研究院定期對(duì)工作人員進(jìn)行數(shù)據(jù)平臺(tái)應(yīng)用培訓(xùn),規(guī)范操作流程。

        四、統(tǒng)計(jì)學(xué)分析

        結(jié) 果

        一、人口學(xué)特征

        本研究5 246例患者中,年齡最小為22歲,最大92歲,中位年齡63歲。男性2 725人,占51.94%;女性2 521人,占比48.06%。不吸煙者3 312例(65.38%),目前吸煙者926例(18.28%),既往吸煙者828例(16.34%),吸煙狀態(tài)不詳180例(3.43%)。部分人口學(xué)特征的K-M曲線分析結(jié)果顯示低齡、女性、不吸煙人群往往有更高的生存率,詳見(jiàn)圖1。

        圖1 肺癌隊(duì)列不同年齡(A)、不同性別(B)、不同吸煙狀態(tài)(C)的生存曲線圖

        二、隊(duì)列特征

        1.隊(duì)列總體生存時(shí)間

        以肺癌確診時(shí)間為起點(diǎn),死亡時(shí)間或最后隨訪時(shí)間(2021年5月26日)為終點(diǎn),總生存期(OS)分布見(jiàn)圖2。死亡1 573例,存活3 673例,死亡比例29.98%。平均隨訪時(shí)間1.74年,中位隨訪時(shí)間1.38年,最長(zhǎng)隨訪時(shí)間5.63年。肺癌總生存期的K-M生存曲線見(jiàn)圖3,根據(jù)該曲線估算5年生存率為52.77%,中位生存時(shí)間為5.37年。

        圖2 肺癌隊(duì)列總生存期分布圖

        圖3 肺癌隊(duì)列總生存期的生存曲線圖

        2.腫瘤特征描述

        SET SAIL隊(duì)列中,病理類型包含腺癌、鱗癌、小細(xì)胞癌、未特指類型(NOS)、唾液腺腫瘤、大細(xì)胞神經(jīng)內(nèi)分泌癌、類癌、肉瘤樣癌、腺鱗癌、神經(jīng)內(nèi)分泌癌、大細(xì)胞肺癌等。非小細(xì)胞肺癌4 715例,占比89.88%,其中肺腺癌3 908例,肺鱗癌659例。小細(xì)胞肺癌418例,占比7.97%。肺癌未特指病理類型113例(2.15%)。K-M曲線中,肺腺癌預(yù)后最好(5年生存率65.53%),小細(xì)胞肺癌預(yù)后最差(5年生存率15.51%),肺鱗癌居中(5年生存率26.19%)(圖4)。

        圖4 不同病理類型肺癌生存期的生存曲線圖

        SET SAIL隊(duì)列的TNM分期按照第8版TNM分期標(biāo)準(zhǔn)劃定,Ⅰ期病例2 497例(47.60%,ⅠA期2 177例,ⅠB期298例),Ⅱ期294例(5.60%),Ⅲ期781例(14.89%),Ⅳ期1 450例(27.64%),分期未知224例(4.27%)。不同TNM分期的K-M曲線見(jiàn)圖5。

        圖5 肺癌隊(duì)列TNM分期的生存曲線圖

        討 論

        醫(yī)療大數(shù)據(jù)具有數(shù)量多、規(guī)模大、數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)多樣化、數(shù)據(jù)呈幾何增長(zhǎng)、信息價(jià)值高等特點(diǎn)[5-6]。由單一機(jī)構(gòu)經(jīng)驗(yàn)形成的隊(duì)列(如SET SAIL隊(duì)列)便于從固定機(jī)構(gòu)獲取組織、細(xì)胞和血清樣本信息,開展比基于人群登記更復(fù)雜的研究。當(dāng)然,隊(duì)列研究中沒(méi)有對(duì)不同類型的治療進(jìn)行隨機(jī)分組,因此關(guān)于治療的結(jié)論只能產(chǎn)生假設(shè)。

        一、SET SAIL隊(duì)列信息反映了威海區(qū)域性肺癌發(fā)病情況、發(fā)病特點(diǎn)以及診療情況

        SET SAIL隊(duì)列作為一個(gè)區(qū)域性專病隊(duì)列,包含了2016年1月至2021年5月間在威海市立醫(yī)院就診的肺癌患者,其中大多來(lái)自威海地區(qū),納入病例數(shù)充足、提取信息量大,具有可靠的有效性和區(qū)域特性。病例死亡時(shí)間匹配山東省疾病預(yù)防控制中心的死因登記數(shù)據(jù),失訪率低。從SET SAIL隊(duì)列的初期統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)來(lái)看,威海地區(qū)肺癌患者性別比例中仍以男性居多,病理類型以非小細(xì)胞肺癌為主,其中肺腺癌占比高,這與大多地區(qū)統(tǒng)計(jì)結(jié)果一致[7]。SET SAIL隊(duì)列中的肺癌分期統(tǒng)計(jì)結(jié)果提示Ⅰ期患者占比47.6%,高于部分一線城市數(shù)據(jù)[7],這可能與患者來(lái)源有關(guān)。SET SAIL隊(duì)列的患者群中當(dāng)?shù)爻踉\患者占比高,而一線大城市數(shù)據(jù)中包含了很多外地晚期患者,另外,這也與近年來(lái)民眾肺癌篩查意識(shí)提高、就醫(yī)可及性提升有關(guān)。

        二、SET SAIL隊(duì)列的構(gòu)建應(yīng)用有助于推動(dòng)區(qū)域肺癌科研水平的提升

        SET SAIL隊(duì)列為臨床醫(yī)師提供了便利安全的院內(nèi)科研數(shù)據(jù)平臺(tái),自開發(fā)以來(lái)已開展了多項(xiàng)研究,其中以SET SAIL隊(duì)列中的非小細(xì)胞肺癌隊(duì)列子集為研究對(duì)象,利用填補(bǔ)后的完全數(shù)據(jù)集建立和驗(yàn)證非小細(xì)胞肺癌預(yù)后的預(yù)測(cè)模型已取得初步研究結(jié)果。另外,基于醫(yī)院數(shù)據(jù)庫(kù)關(guān)于威海地區(qū)肺癌外科手術(shù)現(xiàn)狀的研究、晚期肺癌伴間質(zhì)性肺炎患者住院死亡率危險(xiǎn)因素回顧性觀察等研究已經(jīng)啟動(dòng)。

        未來(lái),我們可以利用成熟的經(jīng)驗(yàn)開發(fā)更具疾病特異性的機(jī)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù),并將其中幾個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)連接,形成共建共享機(jī)制,讓數(shù)據(jù)匯集、流動(dòng)、應(yīng)用起來(lái),提高研究的樣本量和統(tǒng)計(jì)能力,更好地造福于全國(guó)患者[8]。

        利益沖突所有作者均聲明不存在利益沖突

        作者貢獻(xiàn)聲明張藍(lán)方、王麗潔:直接參與、文章撰寫、數(shù)據(jù)分析;張明娟、薛付忠、楊福?。簲?shù)據(jù)平臺(tái)建設(shè)指導(dǎo)、專病隊(duì)列建設(shè)指導(dǎo)、工作支持;劉愛(ài)玲、郭曉雷、于進(jìn)超、孫珊珊、曹樹偉、季懷君、馮虎、姜軼男、李靜宜、楊柳、于鑫、齊越:直接參與、數(shù)據(jù)校正、隊(duì)列建設(shè)、工作支持

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